遗传进化分析

摘要： 为了解湖南省猪圆环病毒2型(PCV2)的遗传变异情况,以PCV2检测阳性样本DNA为模板进行全基因组测序和遗传特征分析.共获得的15株PCV2全基因组,其中10株为PCV2d基因亚型,3株为PCV2b基因亚型,2株为PCV2a基因亚型;15株PCV2全基因组同源性为94.7％～99.9％,与国内外其他PCV2全基因组同源性为93.1％～100％.PCV2a的第77、86～91、151、206和222位,PCV2b的第57、89及210位,PCV2d的第53、68、121、134、215和234位氨基酸与其他亚型存在差异.结果表明,2017—2020年湖南省主要流行PCV2d亚型,不同亚型之间ORF2氨基酸序列差异较大,但同亚型之间氨基酸序列无明显变异.本研究为湖南省PCV2研究及该病防治提供了数据支撑.

摘要： 为了解黑龙江省犬细小病毒(CPV)的流行情况,本研究从黑龙江省哈尔滨市、双城市、鹤岗市和大庆市的宠物医院共收集了10份经胶体金拭子检测为CPV阳性的犬粪便样品,利用F81细胞进行病毒的分离,并对分离的病毒进行PCR、血凝性试验、病毒分型鉴定和VP2基因的遗传进化分析。结果显示,有8份处理后的病料样品接种猫肾细胞F81细胞后出现明显的CPE,其中有3株病毒的血凝(HA)效价可达1:512;经PCR鉴定结果表明分离出8株CPV,分别命名为CPV-CX-1(简写为CX-1)~CX-3、CX-5~CX-8、CX-10;病毒的分型鉴定结果显示,8个分离株中有1株为CPV-2b型、3株为CPV-2c型、4株为CPV-2a型;VP2基因的遗传进化分析结果显示,8株CPV分属于两大不同的分支,其中CX-2、CX-3株与CX-8株处于一大分支,亲缘关系较近,CX-1、CX-7株与CX-5、CX-6、CX-10株处于另一大分支,亲缘关系也较近。其中仅CX-8株与国内外分离株的亲缘关系相对较近,CX-1、CX-5、CX-6、CX-7、CX-10株均与CPV参考株亲缘关系较远。选取HA效价较高的4株CPV感染杂交幼犬进行动物回归试验,每天观察各犬的临床症状、测量体温并于攻毒后第7 d采肛门拭子,根据发病犬临床症状的严重程度确定迫杀各组犬的时间,并分别经PCR检测CPV在各组犬各脏器中的分布及粪便的排毒情况;根据动物回归试验结果,选取2株致病力较强的CX-3株和CX-5株感染犬的十二指肠和空肠组织病料样品,再次接种杂交幼犬,按照动物回归试验方法进行强毒鉴定试验。动物回归试验结果显示,4株CPV感染幼犬后,CX-3株和CX-5株感染的幼犬出现犬细小病毒病发病症状,且CPV在感染犬的心、肝脏、脾脏、肺脏、肠淋巴、十二指肠和空肠均能够复制且有通过粪便排毒的现象;强毒鉴定结果显示,接种CX-3、CX-5株的感染犬出现典型的CPV感染症状,表明这2株CPV为强毒。本研究为监测黑龙江地区CPV的遗传变异趋势及其疫苗的研制具有重要意义。

摘要： 猪繁殖与呼吸综合征(PRRS),俗称“猪蓝耳病”,是由猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)引起的一种急性、具有高度传染性疾病,其主要临床症状表现为持续高热、母猪繁殖障碍以及仔猪呼吸困难和高死亡率[1-2]。PRRS最早发现于美国的北卡罗来纳州,随后世界各国陆续报道,中国于1996年首次报道该病。2006年出现了由高致病性PRRSV引起的“猪无名高热症”疫情的大面积暴发和流行,导致猪群高发病率及高死亡率,给养猪业造成了巨大的经济损失[3]。

摘要： 本研究对泰安某规模化猪场12日龄病死仔猪进行剖检观察、病理组织学观察和病原学检测。结果发现,感染猪以呕吐、腹泻为主要临床特征,剖检病死猪可见肠壁变薄透明并在肠腔内聚集大量黄色液体,肠系膜血管充血,且肠系膜淋巴结水肿;结肠绒毛萎缩变性、充血出血。PCR检测显示猪流行性腹泻病毒阳性,对其S基因测序并进化分析显示,该猪场感染的病原属于猪流行性腹泻病毒GII群。

摘要： 对2017年-2018年采自中国集中生猪养殖区的疑似猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)感染的309份猪肺脏组织样品的ORF5基因序列进行测定和遗传进化分析,结果表明,PRRSV阳性数119份,占检测样品数的38.51%,其中HP-PRRSV毒株91份,占总阳性样品数的76.5%;类NADC30毒株28份,占阳性样品总数的23.5%。阳性样品中有53株GP5的氨基酸相似性为87.1%~100%,与北美型毒株VR-2332氨基酸的相似性为79.9%~96.6%,与HP-PRRSV代表株JXA1的氨基酸相似性在79.9%~96.6%,与类NADC30代表株HENAN-XINX的氨基酸相似性为80.5%~93.3%。多序列在诱骗表位(27-30aa)存在氨基酸突变,由A^(29)突变为V^(29)。主要中和表位PNE(37-45aa)处也存在氨基酸突变,HP-PRRSV毒株L^(39)全部突变为I^(39),2018HZAU-FJNP-419等多毒株的PNE处L^(39)全部突变为S^(39)、H^(38)全部突变为Y^(38)。说明PRRSV在2017年-2018年仍在我国广泛流行并不断变异。

摘要： 用PCR/RT-PCR方法对新疆6个地区449份猪全血或组织样品进行病毒核酸检测,在PCV3检测为阳性的样品中选取2株克隆测序验证并分析其基因序列。结果各地区均检测到PCV3,阳性率为8.1%~16.0%,平均阳性率为14.5%(65/449),其中PCV3单独感染率为33.8%(22/65);PCV3+PRRSV感染、PCV3+PCV2的感染率较高,分别为16.9%(11/65)和15.4%(10/65);PCV3+PCV2+PRRSV感染率为15.4%(10/65);PCV3与PCV2、PRV和PRRSV的四重感染率为1.5%(1/65);对日龄记录完整的石河子地区不同生长阶段猪群感染PCV3的情况进行分析,发现平均阳性率为16.0%(26/163),其中保育猪的阳性率为30.0%(12/40);所选的2株PCV3核苷酸序列同源性为100%,与国内外参考毒株的同源性为97.9%~100.0%;遗传进化分析表明基因序列属于3a亚群。表明PCV3在新疆6地市规模化养猪场中以单独感染或与其他病原混合感染情况普遍存在,不同生长阶段猪群均有感染PCV3。

摘要： 为调查2020年黑河市某规模化奶牛养殖场中牛星状病毒(bovine astrovirus,BAstV)的感染及遗传进化情况,应用RT-PCR方法对该牛场的腹泻样品进行检测,并对BAstV ORF1a基因进行扩增、测序以及遗传进化分析。结果表明,15份腹泻粪便样品中,BAstV的检测阳性率为20%(3/15),对测序成功的2株BAstV毒株进行序列分析显示,鉴定的2株BAstV毒株的核苷酸与氨基酸同源性分别为99.3%和99.4%。2株毒株都与我国BAstV四川流行毒株,登录号NC_037655.1核苷酸同源性较高,分别为96.6%和97.3%,而其与嗜神经型BAstV欧洲毒株,KX266908.1差异较大,核苷酸同源性分别为36.7%和37.4%。系统发育进化树结果显示,试验鉴定的2株BAstV与已报道的其他中国BAstV流行参考毒株关系密切。

摘要： 本研究旨在从临床仔猪腹泻样品中分离猪流行性腹泻病毒(PEDV),并对其S基因进行测序分析。对腹泻仔猪小肠样品进行RT-PCR检测、病毒的分离培养、RT-PCR和间接免疫荧光鉴定、S基因测序及遗传演化分析。结果显示:仔猪腹泻由流行性腹泻病毒引起;在Vero细胞上成功分离流行性腹泻病毒,命名为XP2018,该毒株细胞病变明显,并且连续传代细胞病变稳定;该毒株S基因全长为4161 bp,与中国经典毒株CV777 S基因核苷酸同源性为92.6%,氨基酸同源性为91.0%;与近年来中国分离的其他毒株S基因核苷酸同源性为96.9%~97.6%,氨基酸同源性为96.9%~98.0%;与美国参考毒株S基因核苷酸同源性为96.9%~97.6%,氨基酸同源性为96.6%~98.3%;遗传进化分析显示XP2018毒株与与目前中国流行毒株在同一分支,与经典毒株CV777不在一个分支上。本研究成功分离1株猪流行性腹泻病毒流行毒株,为PEDV疫苗研发奠定了基础。

摘要： 为了解山东省猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)基因组遗传演化特征,将山东省滨州市某猪场的PEDV阳性样品接种Vero E6细胞,结果成功分离到1株PEDV,将其命名为SD20BZ01株。通过RT-PCR分段扩增病毒基因组,经测序、拼接获得SD20BZ01株全基因组序列,并将其与GenBank收录的参考毒株序列进行同源性比对和遗传进化分析。全基因组序列分析结果显示,SD20BZ01株与我国2010年以来流行的GII-b亚群变异株序列同源性为97.8%~98.7%,明显高于CV777、DR13、SM98、SD-M等早期经典毒株,因此SD20BZ01属于GII-b亚群变异株。基于S基因的遗传进化关系与基于全基因组序列的遗传进化关系基本一致。与CV777株相比,SD20BZ01株S蛋白在中和抗原表位COE处有10个氨基酸突变,与近年来变异株S蛋白的氨基酸序列基本一致,说明GII-b亚群PEDV的变异规律逐渐趋于稳定。本研究为山东省PEDV流行病学研究及其流行控制策略的制定提供了理论依据。

摘要： 试验旨在确定辽宁西部地区绵羊住肉孢子虫的虫体种类和遗传进化关系,采集绵羊膈肌样品23份,采用压片镜检法检测分离虫体并进行初步鉴定,对分离虫体的线粒体细胞色素C氧化酶第一亚基(cox1)基因部分序列(pcox1)进行PCR扩增,将测序结果与GenBank登录的其他绵羊住肉孢子虫进行序列同源性分析并构建系统发育进化树。结果显示,从23份绵羊膈肌样品中分离到11株住肉孢子虫,11株住肉孢子虫的pcox1序列长度基本一致,约为397 bp;与GenBank登录的2株柔嫩住肉孢子虫(Sarcocystis tenella)的同源性最高,分别为96.2%~99.7%和94.4%~97.9%;系统进化树分析显示,全部样品与柔嫩住肉孢子虫属同一分支,种内差异(0~5.8%)远小于种间差异(11.3%~35.5%)。研究表明,从辽宁西部地区分离到的绵羊住肉孢子虫均为柔嫩住肉孢子虫。

摘要： 为了解目前国内猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)的流行现状,本研究对上海和江苏地区猪场进行了PEDV流行株的分离鉴定.根据GenBank中PEDV的基因序列,对其M基因设计检测引物.检测临床采集的猪腹泻样品,2份临床样品能扩增出特异性目的条带,测序结果证实为PEDV M基因片段.将检测为PEDV阳性的样品接种Vero细胞,并添加不同浓度的胰酶进行病毒传代培养,在添加适量胰酶的Vero细胞上分离到两株病毒并能稳定传代、增殖.选择第22代病毒饲喂新生仔猪,进行回归试验,结果两株细胞毒均能使1日龄仔猪出现典型腹泻症状,进一步证实成功分离到PEDV,命名为JSLS/PEDV/1/2014和JS/PEDV/2/2014株.遗传进化分析,JS/PEDV/2/2014和JSLS/PEDV/1/2014分离株的M基因分别与中国毒株HLJ-2012、BJ-2012-1亲缘性最近;S基因与Ⅰ群PEDV流行毒株亲缘性最近;两个毒株的ORF3基因均存在51个碱基缺失,与DR13处于同一大分支,与CV777亲缘性较远.

摘要： 1966年H9N2亚型禽流感病毒最早从火鸡体内被分离到[1],之后该亚型病毒广泛传播,1994年在我国鸡群中被首次发现并报道[2].H9N2亚型禽流感病毒具低致病性,易引起宿主的继发感染,降低鸡群产蛋量,严重威胁养禽业的健康发展.同时,H9亚型禽流感病毒可以感染人、猪等哺乳动物,在公共卫生上具有重要意义[3].因此加强对该亚型病毒的监测工作显得尤为重要.在2013～2015年,本实验室在华东部分地区采样,对分离到H9N2亚型禽流感病毒进行遗传进化分析,以探究在这一地区H9N2亚型禽流感的流行趋势.rn 遗传进化分析结果表明，62个毒株HA基因的开放性阅读框(ORF)全长均为1683bp，共编码560个氨基酸，相比于华东地区H9N2经典毒株A/Chicken/Shanghai/F/98，无任何核苷酸的插入和缺失。62个毒株HA基因核苷酸序列的同源率在88.6%-94.0%，氨基酸序列同源率在91.5%~100%。根据HA基因遗传进化树可以看出，62个分离株的HA基因都属于Dk/HK/Y280/97-Iike病毒亚系中的h9.4.2.5分支，说明在2013-2015年间，华东地区的H9N2亚型禽流感病毒并未发生大的遗传变异。62个毒株HA基因裂解位点326~329位氨基酸中大部分为RSSR（有2株为KSSR），均仅有2个不连续的碱性氨基酸，为典型的低致病性禽流感病毒特征性序列。本研究中的所有H9N2亚型禽流感病毒的226位氨基酸均为Leu(L)，与人流感病毒的一致。这表明该地区流行的H9N2 AIVs具有与NeuAc2，6 Gal受体结合的可能，对哺乳动物的致病可能大大增加。62个毒株的中大部分HA基因含有7个潜在的糖基化位点，值得注意的是，随着时间推移，大部分毒株202位出现T→I的变化，导致200位糖基化位点逐渐缺失，这与古小兵等人的研究一致，该糖基化位点的缺失对病毒毒力是否有影响还有待实验进一步验证。

摘要： 为了解广州地区GII.4型诺如病毒流行株的基因组特征,本研究对两株广州株的全基因组序列进行了遗传进化分析.通过三段克隆法扩增并拼接获得毒株G22010-L88及L91的全基因组序列,两毒株基因组全长均为7556bp,编码3个开放阅读框,大小分别为5lOObp、1623bp及807bp.多重比对结果显示,两毒株与不同基因型人源诺如病毒基因组的同源性为53.0％-97.5％,其中与GU991354ISH5株同源性最高.根据病毒基因组及各ORF区核苷酸序列构建系统发育树,结果表明两毒株均属于GII.4-2006b亚型,且未发生基因重组现象.此外,针对报道的GIL.4-2006b型诺如病毒衣壳蛋白序列进行遗传多样性分析发现,病毒衣壳上中存在易变异氨基酸位点15处,关键表位A、D、E的氨基酸序列为ASRNSE,GTT/STT、SNV/SDV.本文对两株广州株G22010-L88及L91进行了全面的基因组序列分析,诺如病毒基因组信息的积累不但有助于加深对病毒流行规律的认识,同时也为病毒进化机理研究提供重要参考数据.

摘要： 为了研究羊口疮病毒(ORFv)新疆野毒株的遗传进化情况,参照GenBank公布的ORFv B2L和F1L基因序列,设计特异性引物,对ORFv SHZ1新疆野毒株B2L和F1L基因进行PCR扩增,克隆、测序后进行遗传进化分析。结果:新疆野毒株SHZ1与GenBank公布的其他17个毒株相比,B2L基因核苷酸同源性为97.28％～98.86％,推导氨基酸同源性为88.65％～90.50％;F1L基因核苷酸同源性为94.56～97.07％,推导氨基酸同源性为93.82％～95.88％。基于B2L基因的遗传进化树分析发现,SHZ1株B2L基因与我国现用疫苗株B2L基因亲缘关系较近;而基于F1L基因的遗传进化树显示,SHZ1株与意大利分离株的亲缘关系最近,推测ORFv SHZ1株可能是国外流行株与疫苗株重组后产生的一个变异株。

摘要： 2010年，猪流行性腹泻(Porcine epidemic diarrhea，PED)再次在中国出现严重暴发。为探明该病再次流行的原因，对2010年10月至2011年12月之间收集的15份来自中国中部不同地区猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus，PEDV)流行毒株M和ORF3基因进行RT-PCR扩增、克隆、测序及分析。序列分析显示，与参考毒株相比，15株PEDV毒株M和ORF3基因部分核苷酸及氨基酸位点发生改变。基于M和ORF3基因的遗传进化分析显示，这些流行毒株和参考株可以分为3个群(G1、G2、G3)，15株中国中部毒株均属于第3群，与2007年韩国株、2007—2008年泰国株、2010年越南株及2010—2011年中国其它地区流行毒株亲缘关系密切，而与欧洲株(CV777、Brl／87)及中国现用疫苗株亲缘关系较远。另外，15株中国中部毒株与2003-2007年中国分离株(LJB-03、JS-2004-2、DX、QH、LZC)不在同一亚群，推测PEDV在近年呈现快速变异和进化的趋势，最近在华中地区广泛流行的PEDV是一个新的基因型。

摘要： 应用特异性引物从山东某发病鸡场病鸡体内分离到的命名为JN09的新城疫病毒(Newcastle Disease Virus，NDV)中扩增其F基因，预计扩增片段大小为1700bp。RT-PCR扩增出的目的片段大小与预计扩增片段大小相符合，测序结果表明扩增片段与新城疫病毒F基因序列相符。对其F基因进行遗传进化分析，并结合山东地区近几年来的分离毒株的相关信息，着重分析该地区近年来新城疫病毒F基因的变异情况。

摘要： 为确诊山西省某獭兔养殖场病死獭兔的病原菌,本研究从病死獭兔肺脏中分离得到一株细菌,经16s分子鉴定为葡萄球菌,动物试验证实该菌株具有很强的致病性;为了确定该病原菌的来源,在该兔舍进行气溶胶样品采集,通过对气溶胶中葡萄球菌与脏器中分离出的葡萄球菌进行16s遗传进化分析,构建进化树.结果显示,病死獭兔体内的葡萄球菌与空气中的葡萄球菌在进化树的同一支上,其中獭兔体内的葡萄球菌与标准金黄色葡萄球菌的同源性达95％以上,空气中的葡萄球菌与标准金黄色葡萄球菌的同源性达94％以上,进一步揭示了环境空气中微生物对疾病的影响.

摘要： 本研究对自1994—2009年从我国5省区免疫鸡群中分离到的37株传染性支气管炎病毒(IBV)的S蛋白基因序列进行分析，发现S1基因序列存在广泛的氨基酸替换、缺失和插入现象，大部分IBV分离株S1基因的推导氨基酸序列变异主要集中在60-63位、73-74位、97位、128位、282-299位等。S2基因较为保守，主要在裂解位点后的2-47位、122-152位发生氨基酸的替换，可见IBV S基因的不断变异可能是造成本研究所调查的5省区免疫鸡群IB频发的重要原因。遗传进化分析发现本研究所调查地区近十多年来肾型毒株仍是主要流行株，没有或少有4/91型毒株流行。所调研地区鸡的腺胃炎持续广泛地发生，但是从临床腺胃病料中很少分离到IBV，可见IBV不太可能是引起腺胃炎的主要病原。

摘要： 2014年4月安徽A1地和A2地发生不明羊疫情,根据临床症状和剖检变化怀疑为小反刍兽疫感染.利用特异性引物进行PPRV N基因片段RT-PCR反应,从A2地病羊组织中检测到PPRV核酸.针对样本病原核酸N基因片段进行结果该毒株与西藏流行株片段序列片段相似性为96％.遗传发生分析,该病原属于谱系Ⅳ,与巴基斯坦流行毒株遗传关系最近.

摘要： 2014年4月安徽A1地和A2地发生不明羊疫情,根据临床症状和剖检变化怀疑为小反刍兽疫感染.利用特异性引物进行PPRV N基因片段RT-PCR反应,从A2地病羊组织中检测到PPRV核酸.针对样本病原核酸N基因片段进行结果该毒株与西藏流行株片段序列片段相似性为96％.遗传发生分析,该病原属于谱系Ⅳ,与巴基斯坦流行毒株遗传关系最近.

摘要： 本发明涉及一种区分禽流感病毒NA基因不同遗传进化分支的PCR‑RFLP引物及其检测方法和应用，所述引物的序列为：上游引物N6F：5’‑ACAGATGGTCCGGCAAACAAC‑3’；下游引物N6R：5’‑CATTCCTTGTTTGCCCAGTAGT‑3’，利用该引物建立PCR‑RFLP检测方法，该引物对亚分支1神经氨酸酶N6基因以及亚分支2神经氨酸酶N6基因均可扩增，对扩增的PCR产物进行限制性内切酶EcoRⅠ酶切并根据琼脂糖凝胶电泳观察酶切产物有1条带还是2条带，特异性地对两个亚分支神经氨酸酶N6基因进行鉴别诊断；本发明鉴定方法简单、准确率较高，可应用于两种亚分支神经氨酸酶N6基因的鉴别。

摘要： 本发明涉及分子生物技术领域，尤其涉及一种多鱗鯔鰕虎魚线粒体基因组全序列引物及设计、系统进化分析全序列扩增方法，包括如SEQ ID NO.1~24所示的十二对引物。本发明解决了目前没有能够对多鱗鯔鰕虎魚进行线粒体基因组全序列扩增的问题，具有（1）一次性扩增出其线粒体基因组，通过测序拼接能够快速获得其基因组全序列，便捷高效的优点；（2）提供一种多鱗鯔鰕虎魚线粒体基因组全序列引物，省时省力，且节约试剂成本；（3）提供的多鱗鯔鰕虎魚线粒体基因组全序列引物的系统分析方法为多鱗鯔鰕虎魚群体遗传、种质资源保护和可持续开发利用以及鰕虎魚类的系统发育研究提供了重要的分子手段及数据积累等优点。

摘要： 本发明涉及一种区分禽流感病毒NA基因不同遗传进化分支的PCR‑RFLP引物及其检测方法和应用，所述引物的序列为：上游引物N6F：5’‑ACAGATGGTCCGGCAAACAAC‑3’；下游引物N6R：5’‑CATTCCTTGTTTGCCCAGTAGT‑3’，利用该引物建立PCR‑RFLP检测方法，该引物对亚分支1神经氨酸酶N6基因以及亚分支2神经氨酸酶N6基因均可扩增，对扩增的PCR产物进行限制性内切酶EcoRⅠ酶切并根据琼脂糖凝胶电泳观察酶切产物有1条带还是2条带，特异性地对两个亚分支神经氨酸酶N6基因进行鉴别诊断；本发明鉴定方法简单、准确率较高，可应用于两种亚分支神经氨酸酶N6基因的鉴别。

摘要： 本发明涉及一类酶活显著提高的持续性内切葡聚糖酶突变体及其应用。本发明所述突变体包含氨基酸序列的第51位和/或第93位氨基酸突变，所述内切纤维素酶的氨基酸序列如SEQ ID NO：1。本发明采用迭代饱和突变技术，基于进化耦合分析，通过选择具有高耦合强度的氨基酸残基对作为关键突变位点优化持续性内切葡聚糖酶的分子结构、提高酶活。与野生型酶相比，本发明所述持续性内切葡聚糖酶突变体的外切酶和内切酶活性显著增强，对纤维素底物的高效降解和降低生成成本具有重要的意义。

摘要： 本发明公开了一种基于2d‑RAD测序后无参考基因组的群体进化分析方法，通过将样本进行数据拆分后过滤聚类得到群体SNP，并基于样本分组和群体SNP信息进行群体遗传参数分析后构建系统发育树，确定最佳K值后利用所述R自写脚本，根据群体SNP信息和指定的群体信息来寻找两大Group之间的共有和特有SNP信息进行无参考基因组的群体进化分析。本发明的整个数据分析比较自动化，节省了人力成本，提高了分析效率，避免了可能的人为失误且分析的数据图表更加美观。

摘要： 本发明提供一种多基因家族鉴定及进化分析的方法，是针对目标物种以及同源物种的独立分析技术或者联合分析技术，其中独立分析方法包括：蛋白基因家族鉴定、蛋白基因家族结构信息分析、家族基因成员染色体分布分析、预测复制基因事件、Motif分析、蛋白基因家族进化树分析这几个分析过程。联合分析方法包括：蛋白基因家族鉴定、蛋白基因家族进化树分析、Ka/Ks分析、基因选择进化分析、共线性分析这几个分析过程。本发明的方法无需设计引物、进行PCR扩增、构建基因组文库，分析流程成熟，周期短，产出快，分析结果用Pfam和SMART两个数据库进行确认，准确率较高，且对DNA测序数据或蛋白质序列都适用。

摘要： 本发明涉及分子生物技术领域，尤其涉及一种多鱗鯔鰕虎魚线粒体基因组全序列引物及设计、系统进化分析全序列扩增方法，包括如SEQ ID NO.1~24所示的十二对引物。本发明解决了目前没有能够对多鱗鯔鰕虎魚进行线粒体基因组全序列扩增的问题，具有（1）一次性扩增出其线粒体基因组，通过测序拼接能够快速获得其基因组全序列，便捷高效的优点；（2）提供一种多鱗鯔鰕虎魚线粒体基因组全序列引物，省时省力，且节约试剂成本；（3）提供的多鱗鯔鰕虎魚线粒体基因组全序列引物的系统分析方法为多鱗鯔鰕虎魚群体遗传、种质资源保护和可持续开发利用以及鰕虎魚类的系统发育研究提供了重要的分子手段及数据积累等优点。

摘要： 本发明涉及一种能够一次性扩增出其线粒体基因组、通过测序拼接能够快速获得其基因组全序列、具有简便、快捷、高效特点的弯斑蛸线粒体基因组全序列引物及设计、系统进化分析和扩增方法，能够一次性扩增出其线粒体基因组，通过测序拼接能够快速获得其基因组全序列，具有便捷高效的优点，所提供的弯斑蛸线粒体基因组全序列引物的系统分析方法为弯斑蛸群体遗传、种质资源保护和可持续开发利用以及蛸科动物乃至整个头足类的系统发育研究提供了重要的分子手段及数据积累。

摘要： 本发明公开了一种埃博拉病毒GP基因的分子进化分析方法，该方法包括数据准备、分子进化分析、正向选择位点分析和进化速率分析；所述数据准备是从NCBI基因库中获取所有埃博拉病毒的全基因组，通过Perl编程获得各个基因的编码序列。本发明能够通过对不同分型的正向选择位点和进化分析以更好的了解埃博拉病毒在不同地区的进化以及传播特征。

摘要： 本发明设计了一套通用的猪的线粒体全基因组扩增的引物组，采用多引物重叠式方法测定了黑龙江省野猪的线粒体全基因组序列，对其所包括的2个rRNA、22个tRNA和13个蛋白质编码基因以及1个非编码控制区(D-loop区)进行了定位分析；并利用该序列和NCBI上所提交的线粒体基因组序列构建了现有猪科动物的分子进化树。