基因变异

摘要： 目的通过对一个房间隔缺损先证者的四代家系进行致病突变筛查,利用全外显子测序及Sanger测序等分析基因型和表型之间的关系。方法回顾性分析在云南省第一人民医院心脏大血管外科就诊的1例房间隔缺损患儿的临床资料,并采用全外显子测序技术对患儿及其弟弟、母亲进行遗传学检测,结合生物信息学分析,寻找导致该家系致病的遗传学病因。同时,对在该家系中发现的尾型同源盒基因4(Caudal Homebox Gene,CDX4)基因变异,进行散发ASD患者及健康人群的筛查。结果患儿心脏超声结果及术中所见符合ASD诊断。基因检测提示患儿存在CDX4基因c.C233T纯合变异,其母亲携带该基因的杂合变异,其弟弟携带该基因纯合变异。CDX4基因第1外显子第233号密码子由C突变为T(c.C233T),导致第78号氨基酸由脯氨酸变为亮氨酸(p.P78L)。在198例散发性房间隔缺损患者中,5例患者存在该基因变异,而265例健康人群中未发现该基因变异。采用Fischer精确检验分析发现CDX4基因c.C233T纯合变异与先天性心脏病相关(P=0.014)。结论CDX4基因c.C233T(p.P78L)纯合突变很可能是该家系的致病变异。

摘要： 近日,瑞典卡罗琳斯卡学院主导的一个国际科研团队撰文称,他们发现了一个特殊的基因变异,能有效保护个体免于新冠病毒严重感染。研究人员通过研究不同祖先的人群成功查明了这种变异,其具有很重要的临床价值,有助科学家们开发出新冠病毒新疗法。

摘要： 高IgM综合征(Hyper-IgM syndrome,HIGM)是一种抗体类别转换障碍导致的原发性免疫缺陷病,以反复感染、中性粒细胞减少、自身免疫性疾病、恶性肿瘤为主要临床表现,免疫学特征为IgM水平升高或正常,IgA、IgE、IgG降低。临床发病率低,反复呼吸道感染可使患儿发生不可逆肺损伤,重者危及生命。现分析我院收治的1例HIGM患儿的临床资料及基因变异数据,并进行文献复习,以期提高对该病的认识,早期诊断及治疗。

摘要： 猪繁殖与呼吸综合征(PRRS),俗称猪蓝耳病,是由猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)引起的一种严重危害养猪行业的高度接触性传染病。PRRSV可分为欧洲型和美洲型两个基因型,前者主要流行于欧洲地区,后者主要流行于美洲和亚太地区。PRRSV型间差异显著,型内各毒株变异大。分子生物学研究表明欧洲和美洲两地区的分离株存在广泛的基因变异,美洲型毒株之间的差异性较大,而欧洲型毒株之间则相对保守。目前,PRRSV在我国的流行特点总体上来说是以美洲型毒株为主,但是欧洲型毒株在我国也有感染个例,有学者认为,欧洲型和美洲型毒株在我国已经并存多年。

摘要： 基因支持着我们生命的基本构造,记录和传递着有关生、长、衰、病、老、死等生命的重要信息。对基因的探索一直在进行,在生物学意义上,是发现和解释普遍意义上的生命现象及其内在的演变规律;在医学应用角度,是希望以其为桥梁去推测、瞄准人与基因变异相关的疾病风险,从而实现预防性的、精准的医疗效果;甚至在哲学意义上,它有助于我们解释自己是谁、从哪里来的问题,对基因的研究是人对自我的深层认识和追问,是人对生命起源的探究,如何看待基因的作用力大小更可以体现出一个人对自由意志和决定论的看法。

摘要： Lesch-Nyhan综合征是一种罕见的X连锁隐性遗传病,在自伤行为出现前,易被误诊为脑瘫,延误诊治。先证者,男,8岁7个月,因发育落后8年余,肌张力异常就诊。多次血生化均提示尿酸增高,遗传学分析结果证实患儿为HPRT1基因c.200_201delTG变异,经ACMG评级为疑似致病性变异,Sanger测序验证发现该变异遗传自患儿母亲,为未报道的新变异,从而确诊为HPRT1基因相关Lesch-Nyhan综合征,口服别嘌醇片、碳酸氢钠片6月后尿酸水平较前明显下降,仍无自伤行为。临床上遇到不明原因脑瘫表现者,应及早行遗传学检查,以帮助早期诊断和遗传咨询。

摘要： 背景与目的:儿童及青少年分化型甲状腺癌(differentiated thyroid cancer,DTC)的分子生物学特征及其临床指导意义尚不明确。本研究拟初步探讨局部晚期或转移性DTC患儿的基因特征分布及其与临床特征及^(131)I疗效的关系。方法:采用甲状腺癌相关基因panel(ThyroLead®)对2020年12月—2021年7月就诊于中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院的儿童及青少年侵袭性DTC的原发灶进行测序,并回顾性收集患儿的临床病理学特征及^(131)I治疗相关资料,分析其基因特征与其临床病理学特征及^(131)I疗效的关系。结果:本队列纳入39例局部晚期或转移性患儿,可及数据中所有患儿均存在淋巴结转移,侧方区受累率达91.4%(32/35),远处转移率达61.5%(24/39)。61.5%(24/39)的患儿检出甲状腺癌相关基因变异,其中以RET融合(38.5%,15/39)和BRAF V600E点突变(12.8%,5/39)最为常见。突变组与非突变组的临床特征差异无统计学意义(P>0.05)。远处转移中,91.7%(22/24)的患儿在^(131)I治疗后仍呈结构性疗效不佳(structural incomplete response,SIR)状态,其中9例患儿呈放射性碘难治(radioactive iodine-refractory,RAIR)状态。RAIR状态患儿中88.9%(8/9)检出相关基因变异,其中NCOA4/RET融合占62.5%(5/8)。进一步将RET变异组患儿细化分组显示,与其他形式的RET融合相比,NCOA4/RET融合阳性者远处转移率更高(33.3%vs 88.9%,P=0.089),提示其具有更高的远处侵犯倾向。结论:局部晚期或转移性DTC患儿的基因突变以融合突变尤其是RET融合为主,其中NCOA4/RET融合阳性者似乎显示出更强的侵袭性,更易呈RAIR状态。

摘要： 目的对1例疑诊德朗热综合征(Cd LS)患儿进行致病基因变异检测,明确其发病原因。方法提取患儿及其父母外周血,使用全血DNA提取试剂盒提取DNA,应用高通量测序法检测相关基因突变,使用GATK软件进行多态性位点检测,查找变异位点在各基因数据库中的频率和致病性,筛选数据库中频率 A(p.R154Q)杂合错义变异,该变异为新发变异,且为未报道过的新变异。经家系验证分析,患儿父亲该位点为杂合突变,患儿母亲该位点无变异。生物信息学蛋白功能综合性预测软件REVEL预测结果为潜在有害,SIFT、Poly Phen2、Mutation Taster、GERP预测结果均为有害。经Sanger测序验证,该变异存在于患儿及患儿父亲,c.461G> A可导致编码蛋白第154位精氨酸替代为谷氨酰胺(p.R154Q)。结论 NIPBL基因c461G> A(p.R154Q)错义变异可能是该例Cd LS患儿的发病原因,新变异的检出丰富了NIPBL基因变异谱。

摘要： 脊髓性肌萎缩症是一种常染色体隐性遗传病,常规基因诊断方法无法检出隐性遗传病携带者,易造成诊断延误,加重家庭及社会负担。先证者,男性,2月龄,生后哭声低弱、四肢无力,肌电图示脊髓前角细胞病变。采取多重连接探针扩增技术、长片段PCR扩增、连锁分析诊断患儿SMN 1基因为“1^(d)+0”型复合杂合变异(1 d:c.22_23insA)。家系遗传学分析提示母亲为“1+1^(d)”型、父亲为“2+0”型隐性遗传病携带者,目前此种遗传模式未见报道。随访先证者并予遗传咨询后指导其母顺利生育1名健康女婴。隐性遗传病携带者的存在将增加脊髓性肌萎缩症患儿的漏诊率,排查隐性遗传病携带者有利于疾病早期精准诊断,避免出生缺陷。

摘要： 目的探讨由基因或结构异常所致慢性胰腺炎患儿的临床特点,及其经内镜逆行胰胆管造影术(ERCP)诊治的临床疗效。方法回顾分析2020年7-10月采用ERCP治疗的3例慢性胰腺炎患儿的临床资料。结果3例慢性胰腺炎患儿,2例男性、1例女性,年龄为11岁1例,12岁2例,主要临床症状均为慢性腹痛,无胰腺内外分泌功能不全的表现。2例患儿由基因变异所致,分别为SPINK1、LPL基因变异;1例由结构异常所致,为胰管先天发育异常,胰体部胰管呈分支状。3例患儿常规治疗无效,实施ERCP治疗,通过取出结石、清理胰管、放置支架,以改善引流,缓解胰管压力。术后2例患儿的胰酶均恢复正常,腹痛缓解;1例术后胰酶增高,3天后恢复正常。结论由基因或结构异常所致儿童慢性胰腺炎行ERCP诊治安全有效。

摘要： 寻求窖蛋白基因(CAV)变异位点,探讨其与不明原因猝死(SUD)的相关性.研究表明：部分不明原因碎死可能与CAV1/CAV3基因变异存在一定相关性。

摘要： ACMG适用范围是所有孟德尔基因变异，临床报告应包含参考序列以确保该变异在DNA水平上的明确命名，并提供编码和蛋自白质命名法来协助功能注释，变异不等于致病性，变异影响蛋白的结构、剂量、造成蛋白功能的丧失、改变或获得，可以造成疾病。

摘要： X-连锁无丙种球蛋白血症(X-linked agammaglobulinemia,XLA)是由人类B淋巴细胞系列发育障碍引起的原发性免疫缺陷病,发病率大约是1：200000,其病因是B细胞胞质内Bruton酪氨酸激酶(Bruton tyrosine kinase,BTK)缺陷,导致外周血成熟B细胞明显减少、低丙种球蛋白血症、早期发生反复严重的细菌感染.本文分析XLA的临床表现、诊断和治疗特点.分析家系3例XLA患儿临床特点,采用基因测序分析患儿及家系成员BTK基因变异,总结其临床特征.

摘要： 炎症性小体病在自身炎症性疾病中是较为常见的一种,组成炎症小体的受体蛋白大部分来自NLR家族,包括NLRP1、NLRP3、NLRC4、NLRP6、NLRP7和NLRP12等.本文通过基因检测诊断了三种不同的NLR家族蛋白变异导致的炎症性小体病,介绍其基因变异及临床特点.对于2013年至今在我院儿科就诊的可疑患者,应用一代测序及原发性免疫缺陷(PID)基因捕获高通量测序模型对患儿进行基因检测,对可疑突变位点进行生物信息学分析并进行父母一代验证.对于确诊患儿收集整理其临床资料.

摘要： 观察司替戊醇(stiripentol,STP)治疗SCN1A基因变异相关的Dravet综合征(Dravet syndrome,DS)患儿的临床疗效.对来自2017年6月于北京大学人民医院门诊就诊的DS患儿添加STP治疗.

摘要： 研究一例粘多糖病Ⅱ型患儿的临床特征和分子遗传学特点.收集该例患儿的临床资料,患儿携外院全外显子家系报告提示GM2A基因致病可能性较高,对其进行眼科、视频脑电图及影像学检查,并针对次要变异中IDS基因进行Sanger一代测序及溶酶体总筛.

摘要： 为了解广东省猪伪狂犬病病毒(pseudorabies virus,PRV)野毒株的基因变异及遗传演化的情况,本试验对广东佛山疑似暴发伪狂犬病的猪场采集的病料(脑、肺脏、扁桃体、肝脏、脾脏)进行了PCR鉴定,初步鉴定为PRV毒株后,将阳性病料接种非洲绿猴肾细胞(Vero),进行毒株传代培养,对分离毒株进行PCR检测及小鼠感染试验,证实该病毒为PRV,并命名为PRV FS-2015株;并对该毒株进行细胞病变观察、病毒TCID50测定、毒株TK基因扩增及序列分析,结果显示,测定PRV FS-2015株TCID50为10-75/0.1mL.PRV FS-2015株的TK基因序列与国内外PRV参考毒株进行同源性比对分析发现,其核酸同源性为99.4％～100.0％,氨基酸同源性为99.1％～100.0％.遗传进化分析表明,PRV FS-2015株与国内近几年分离的PRV变异株属于同一分支,同源性较高,亲缘关系更近;与PRV经典株的同源性较低,基因变异较大,表明PRV FS-2015毒株属于近几年流行的变异株.本研究结果可为广东省伪狂犬病的防控工作和疫苗株的选择提供科学依据.

摘要： 猪圆环病毒2型(PCV2)是猪圆环病毒相关疾病的主要病原体,给世界养猪业造成了巨大的经济损失.随着分子生物学的发展,PCV2的研究取得了显著进展.本文综述了PCV2的遗传变异和病毒进化的研究进展,旨在为业界更好地了解PCV2的分子流行病学、控制策略,更能为新型疫苗的设计研发提供参考.

摘要： 猪圆环病毒2型(PCV2)是猪圆环病毒相关疾病的主要病原体,给世界养猪业造成了巨大的经济损失.随着分子生物学的发展,PCV2的研究取得了显著进展.本文综述了PCV2的遗传变异和病毒进化的研究进展,旨在为业界更好地了解PCV2的分子流行病学、控制策略,更能为新型疫苗的设计研发提供参考.

摘要： 猪圆环病毒2型(PCV2)是猪圆环病毒相关疾病的主要病原体,给世界养猪业造成了巨大的经济损失.随着分子生物学的发展,PCV2的研究取得了显著进展.本文综述了PCV2的遗传变异和病毒进化的研究进展,旨在为业界更好地了解PCV2的分子流行病学、控制策略,更能为新型疫苗的设计研发提供参考.

摘要： 本发明提供了一种CDKN2B基因变异率的定量检测方法，具体的，本发明通过采用通过在一个反应体系内完成CDKN2B表达水平和突变率两个指标的检测，来定量检测CDKN2B的变异率，与现有技术中常规定量PCR技术必须分为两步或更多步骤，才能获得该基因的变异率相比，本发明的技术方案，操作更简便，节省时间，花费更低，数据更加具有可比性。

摘要： 一种自闭症的致病基因、易感基因和可能相关基因变异检测试剂盒，其特征在于，包括以下部分：RNA探针组，引物，封闭缓冲液，RNA酶封闭液，杂交缓冲液，结合缓冲液，1倍浓度的SSC的漂洗液，0.1倍浓度的SSC的漂洗液，PCR反应液和TE缓冲液；所述的RNA探针组包括282条RNA探针，所述的RNA探针序列如Seq ID No1～Seq ID No282。本发明提供的一种用于检测自闭症的致病基因、易感基因和可能相关基因的试剂盒，可同时检测6个疾病相关的致病/易感基因，可以为自闭症患病个体进行分子遗传学诊断，也可以对自闭症患者的父母亲再生育时进行新生儿的自闭症患病风险评估。

摘要： 本发明公开了一种同步使用信使RNA与基因组DNA模板进行高通量测序的文库构建，以检测对应的基因变异类型的方法，该方法包括对总核酸样本进行反转录、接头连接、靶标特异性线性扩增，然后使用巢式靶标特异性引物对靶序列进行扩增。本发明的检测方法基于基因组DNA与信使RNA序列的差别，设计对应的引物，从而达到在一个反应体系中同时检测出两种核酸模板中融合与突变的目的。

摘要： 本发明提供基因融合体、基因变异体和与疾病病况的新颖相关性以及使用其的试剂盒、探针和方法。

摘要： 作为本发明的一个方式，进行以下的分析，使对每个碱基种类进行了标记的分析对象的核酸样本进行电泳，检测每个碱基种类的标记信号，生成检测强度的波形数据，对每个碱基种类的上述波形数据的各峰值位置选择其他的峰值位置，计算各峰值位置的信号强度相对于选择出的其他峰值位置的信号强度的相对信号强度，在各峰值位置对分析对象的核酸样本的相对信号强度和已知的核酸样本的相对信号强度进行比较，进行与核酸样本的碱基排列坐标位置的各碱基种类的存在相关的分析。由此，实现高灵敏度、高精度地取得与作为目标的基因区域中存在的微量的基因变异相关的信息。

摘要： 本发明提供了一种CDKN2B基因变异率的定量检测方法，具体的，本发明通过采用通过在一个反应体系内完成CDKN2B表达水平和突变率两个指标的检测，来定量检测CDKN2B的变异率，与现有技术中常规定量PCR技术必须分为两步或更多步骤，才能获得该基因的变异率相比，本发明的技术方案，操作更简便，节省时间，花费更低，数据更加具有可比性。

摘要： 一种自闭症的致病基因、易感基因和可能相关基因变异检测试剂盒，其特征在于，包括以下部分：RNA探针组，引物，封闭缓冲液，RNA酶封闭液，杂交缓冲液，结合缓冲液，1倍浓度的SSC的漂洗液，0.1倍浓度的SSC的漂洗液，PCR反应液和TE缓冲液；所述的RNA探针组包括282条RNA探针，所述的RNA探针序列如Seq ID No1～Seq ID No282。本发明提供的一种用于检测自闭症的致病基因、易感基因和可能相关基因的试剂盒，可同时检测6个疾病相关的致病/易感基因，可以为自闭症患病个体进行分子遗传学诊断，也可以对自闭症患者的父母亲再生育时进行新生儿的自闭症患病风险评估。

摘要： 本发明实施例提供了一种基因组数据的无损压缩方法、基因变异的预测方法及设备。无损压缩方法包括：获取待压缩的基因片段，基因片段为基因组数据中的一部分；确定基因片段的片段编码信息、基因片段中碱基在基因片段中的局部位置以及碱基在基因组数据中的全局位置；基于片段编码信息、局部位置和全局位置对基因片段之后的下一个碱基进行预测，获得碱基预测信息；基于碱基预测信息对基因片段之后的下一个碱基进行无损压缩，获得压缩后数据。结合片段编码信息、碱基的局部位置和全局位置获得准确率较高的碱基预测信息，这样在基于碱基预测信息对基因片段之后的下一个碱基进行无损压缩时，可以实现较高压缩率的基因数据压缩操作。

摘要： 本发明提供人工基因，其至少一部分DNA碱基中的15N的丰度比超过了天然丰度比。另外，本发明提供基因变异方法，该方法包括：步骤1，制作15N在生物细胞内的特定DNA中偏颇的状况；以及步骤2，以15N产生共振核反应的能量照射质子束。

摘要： 本发明涉及一种基因突变在结肠癌、肺癌易感基因变异检测中的应用。提供了一种基因突变或核酸在制备试剂盒或设备中的应用，所述试剂盒或者设备用于检测结肠癌或肺癌；所述基因突变为位于BRD2基因上的突变位点rs778675391；所述核酸为与野生型BRD2基因相比，具有c.2455A>T突变。该基因突变是结肠癌或者肺癌相关性强，通过检测该突变在生物样品中是否存在，可以有效地检测生物样品是否患结肠癌或者肺癌或者易患结肠癌或者肺癌。该基因突变进一步扩展和完善了结肠癌或肺癌疾病的检测和研究，为该疾病的诊断和治疗提供了新的检测位点，以及新的检测方法和途径。