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基因组数据的无损压缩方法、基因变异的预测方法及设备

摘要

本发明实施例提供了一种基因组数据的无损压缩方法、基因变异的预测方法及设备。无损压缩方法包括:获取待压缩的基因片段,基因片段为基因组数据中的一部分;确定基因片段的片段编码信息、基因片段中碱基在基因片段中的局部位置以及碱基在基因组数据中的全局位置;基于片段编码信息、局部位置和全局位置对基因片段之后的下一个碱基进行预测,获得碱基预测信息;基于碱基预测信息对基因片段之后的下一个碱基进行无损压缩,获得压缩后数据。结合片段编码信息、碱基的局部位置和全局位置获得准确率较高的碱基预测信息,这样在基于碱基预测信息对基因片段之后的下一个碱基进行无损压缩时,可以实现较高压缩率的基因数据压缩操作。

著录项

  • 公开/公告号CN115579058A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2023-01-06

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 阿里巴巴(中国)有限公司;

    申请/专利号CN202211357422.5

  • 发明设计人 杨晗;顾斐;

    申请日2022-11-01

  • 分类号G16B20/20;G16B30/00;G16B40/00;G06N3/04;G06N3/08;

  • 代理机构北京太合九思知识产权代理有限公司;

  • 代理人孙明子;刘戈

  • 地址 311121 浙江省杭州市余杭区五常街道文一西路969号3幢5层554室

  • 入库时间 2023-06-19 18:14:35

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