功能基因

摘要： 大丽轮枝菌为典型的土传维管束病原真菌,针对其致病相关基因的挖掘与功能解析一直是植物病理学研究的热点。大丽轮枝菌具有定殖维管束、"毒素"致萎、形成微菌核、种群分化多元化等特征,这些性状最终支撑或决定了病原对寄主的致病性基础。从进化角度来说,功能基因决定生物学性状。截至目前,在大丽轮枝菌中已鉴定出上百个功能基因;但针对其与病原的重要生物学性状和致病性之间的关系尚未系统阐述。为此,本文概述了大丽轮枝菌功能基因鉴定的发展历程,并以功能基因决定生物学性状为逻辑线条,重点梳理了功能基因与大丽轮枝菌重要生物学性状形成的关系,厘清了大丽轮枝菌致病性与决定重要生物学性状功能基因的关系。这些观点将为系统建立大丽轮枝菌重要生物学性状形成的功能基因网络,以及从功能基因决定生物学性状角度阐明大丽轮枝菌致病形成的分子基础提供理论支撑。

摘要： 生物质炭孔隙发达,比表面积大,稳定性高,吸附性能强,表面微量元素及官能团丰富,对污水处理及土壤氮转化过程及功能微生物的演变起着重要作用。本文在分析氮循环途径的基础上,从废水、土壤2个主要环境探讨了生物质炭对氮转化过程及效率的影响,综述了生物质炭添加对环境中氮转化微生物群落结构及其功能基因影响的最新研究进展,认为生物质炭的施用可改变微生物参与的氮循环过程,并在一定程度上提升脱氮功能基因的表达水平。本文旨在为生物质炭强化氮转化和氮循环研究提供参考,认为在生物质炭的改性和负载强化氮转化等方面还需要进一步开展研究。

摘要： 玉米(Zea mays)是我国种植面积最大的作物之一,在粮食安全和经济发展中占有重要地位,产量是玉米生产和育种的首要目标。目前,关于控制玉米穗长和行粒数等重要产量性状的QTL位点多有报道,但已克隆的功能基因较少,而其中已报道的关于重要小分子代谢物调控穗发育过程的研究更是少之又少。

摘要： 本试验旨在探究多肽添加水平对刺参生长性能、免疫及肠道功能基因表达的影响。试验选择300头刺参[体重(34.40±0.23)g)],根据不同多肽添加水平(0、5%、10%、15%、20%),分为5组(D1、D2、D3、D4、D5组),每组3个重复,每个重复20头刺参,探讨多肽对生长性能及肠道功能基因(腱生蛋白、胶原蛋白α2、整合素αV、整合素βL、p105、p50、rel和lys)表达的影响。试验期60 d。结果表明:D4组的刺参特定生长率(SGR)显著高于其他组(P0.05),较D1组降低了25%。体腔液中总抗氧化能力(T-AOC)、超氧化物歧化酶(SOD)、酸性磷酸酶(ACP)和碱性磷酸酶(AKP)活性随着多肽添加水平的增加呈现升高趋势。D2、D3、D4组腱生胶原蛋白、胶原蛋白α2、整合素αV、整合素βL基因在刺参肠道内相对表达量均显著高于D1组(P<0.05),在D4组达到表达高峰。p105、p50、lys基因相对表达量随着多肽添加水平的增加呈现持续升高趋势。由此可见,饲粮中添加10%~15%多肽能显著提高刺参的SGR,降低饵料FR,同时上调刺参肠道内生长类基因(腱生蛋白、胶原蛋白α2、整合素αV和整合素βL)的表达以及免疫类基因(p105、p50和lys)的表达,从而促进刺参生长,提高刺参自身免疫力。

摘要： 【目的】探究绿肥混播对稻田土壤N_(2)O的减排效果和机制,筛选既高产稳产,又减排的适合南方双季稻区发展应用的绿肥混播种植模式。【方法】比较不同紫云英与油菜混播比例(单播紫云英(CK1)、单播油菜(CK2))、3/4紫云英+1/4油菜(3/4M+1/4R)、1/2紫云英+1/2油菜(1/2M+1/2R)、1/4紫云英+3/4油菜(1/4M+3/4R)对稻田N_(2)O排放规律及相关功能基因的影响。【结果】(1)作物种类影响N_(2)O排放。各处理的N_(2)O排放规律基本一致,其中冬作季N_(2)O排放主要集中在冬季绿肥的盛花期,早晚稻季主要集中在水稻的分蘖、灌浆和成熟期。总体来看,稻田N_(2)O排放主要集中在水稻季,早稻季的N_(2)O排放量低于晚稻季;2018年稻田N_(2)O排放通量总体比2019年高。(2)各处理的早稻N_(2)O累积排放量差异均不显著。连续两年单播处理的N_(2)O累积排放量低于混播各处理,其中2019年处理CK1最低,处理3/4M+1/4R的N_(2)O周年累积排放量在各混播处理中最低。(3)整体来看,晚稻土壤的amo A-AOA和amoA-AOB基因拷贝数比早稻要高,amo A-AOA基因拷贝数比amo A-AOB高1—2个数量级。晚稻的土壤nirS、nirK、nosZ基因拷贝数比早稻要高,其中nir S基因拷贝数比nir K和nosZ高1—2个数量级。紫云英与油菜混播提高了土壤amo A-AOA和amoA-AOB基因丰度,amoA-AOA基因为优势功能基因,而且提高了土壤nirS、nirK、nosZ基因丰度,nirS基因占主导地位。反硝化基因拷贝数比硝化基因拷贝数高1—3个数量级,反硝化作用对N_(2)O排放贡献更大。【结论】"3/4紫云英+1/4油菜-早稻-晚稻"种植模式在保证高产和高肥力的情况下,N_(2)O排放量相对较低,是较理想的种植模式。

摘要： 目的基于宏基因组学测序探究健康成人唾液和龈上菌斑微生态的物种组成及功能基因代谢途径,为口腔疾病的生物学防治提供参考。方法采集健康成人唾液和龈上菌斑样本,分别提取样本总DNA,构建宏基因组文库,对合格的文库进行宏基因组学测序,并对测序数据进行生物信息学及统计学分析。结果健康口腔样本主要菌门为变形菌门(32.51%)、拟杆菌门(30.81%)、放线菌门(16.23%)等,主要菌种为马氏棒状杆菌(3.84%)、副流感嗜血菌(2.91%)、产黑色素普雷沃菌(2.76%)等;龈上菌斑组的Alpha多样性高于唾液组,且两组间微生物群落构成存在明显差异(P<0.05)。在种水平上,唾液样本中产黑色素普雷沃菌、牙周梭杆菌、中间普雷沃菌等较龈上菌斑样本丰富,而龈上菌斑样本中马氏棒状杆菌、产酸丙酸杆菌、龋齿罗氏菌等比唾液样本丰富(P<0.05)。基于宏基因组学测序构建了健康成人唾液及龈上菌斑的高质量基因集。KEGG通路功能代谢差异结果显示唾液微生物中淀粉与蔗糖代谢、亮氨酸和异亮氨酸降解、精氨酸生物合成等较龈上菌斑丰富,而龈上菌斑中糖酵解/糖合成、碳代谢等较唾液丰富。结论健康成人唾液和龈上菌斑微生态的物种组成及功能基因代谢途径存在明显差异,不同微生态区的优势物种对识别口腔疾病的敏感性可能不同,在口腔疾病微生物研究中,应根据研究疾病的不同选择合适的样本。

摘要： 为探究强污泥流失对厌氧氨氧化(anammox)反应器系统脱氮性能、颗粒污泥特性及功能菌群的影响,试验以模拟废水为处理对象构建了上流式厌氧污泥床(UASB)反应器.试验结果表明,损失近一半反应器有效体积的污泥未明显破坏anammox工艺脱氮性能.反应器在4d后总氮(TN)的去除率(RE)达到89.18%污泥EPS含量较高且其PN/PS值(0.12)较低有利于anammox颗粒污泥的形成和集聚.Anammox颗粒污泥粒径>2mm的污泥占到系统总污泥的44.9%,粒径大于0.5mm的污泥占总污泥的84.3%,能够有效持留污泥.厌氧氨氧化菌的优势门为变形菌门(28.03%)、浮霉菌门(15.57%)和绿弯菌门(8.63%),优势属为anammox菌属Candidatus Jettenia(9.63%)和Candidatus Brocadia(3.54%),参与anammox反应的功能基因包括nirS(1.27%)、hzs(1.28%)、hzo(1.29%)、hao(7.04%)和hdh(0.81%),但反硝化菌及其功能基因的存在使得化学计量比Rs(ΔNO_(2)^(-)-N/ΔNH_(4)^(+)-N)和Rp(ΔNO_(3)^(-)-N/ΔNH_(4)^(+)-N)低于理论值.

摘要： 探讨根际与非根际土壤氮素形态变化,以阐明农田防护林地对土壤氮循环的影响,为农田防护林的建设管理提供依据。该研究选取黑龙江省拜泉县樟子松纯林、落叶松纯林、樟子松×落叶松混交林3种典型农田防护林型的土壤,测定土壤理化指标、氮素形态指标及氮转化功能基因拷贝数的变化。结果表明,混交林根际土壤的酸性程度高于纯林,其中,樟子松纯林根际土壤pH显著高于其他林型,落叶松纯林土壤电导率最高,其根际电导率值高达(53.33±2.54)μS/cm,混交林土壤容重显著大于纯林(P<0.05);混交林两树种的根际土壤全氮、铵态氮、硝态氮含量均显著高于各自纯林(P<0.05),表明混交林土壤氮素成分在3种林型中最优;与其他林型相比,樟子松纯林根际土壤功能基因拷贝数(amoA-AOA、amoA-AOB、nirS、nosZ、narG、nifH)都处于较低的水平,表明其影响了土壤氮转化速率,降低了土壤铵态氮、硝态氮的含量;冗余分析(RDA)结果表明,农田防护林氮素形态变化与土壤理化指标和氮转化功能基因密切相关,amoA-AOA基因与amoA-AOB基因分别为研究区根际与非根际土壤影响最大的因子,说明硝化作用在土壤氮转化中占主导位置。综上,防护林型的适宜建设程度由大到小为:混交林、落叶松纯林、樟子松纯林。

摘要： 对2021年国内外与辣椒功能基因、病虫害防治、抗逆生理、栽培生理、种质资源等相关研究进行了回顾与总结,以期为以辣椒为研究对象的科研工作者在梳理研究方向、解决研究问题、展望辣椒产业前沿等方面提供参考。

摘要： 研究了单质硫颗粒自养反硝化柱中表面和间隙生物膜的微生物群落结构、功能基因和代谢途径等生物信息学特征.结果表明,硫颗粒表面生物膜的微生物菌群多样性低于间隙生物膜.氮代谢功能基因丰度差异较为显著,间隙生物膜中硝酸盐和亚硝酸盐的胞外转运蛋白基因丰度远高于表面生物膜,分别为0.0792%、0.109%与0.0157%、0.0314%.对于还原性反硝化代谢,表面生物膜的总基因丰度却明显低于间隙生物膜,分别为0.367%、0.406%.此外,参与反硝化过程的基因丰度明显不同,特别是将NO_(3)^(-)还原成NO_(2)^(-)以及将N_(2)O还原成N_(2)过程中的基因.对于硫代谢,没有观察到明显的差异.APS(硫酸腺苷)氧化是将SO_(3)^(2-)氧化为SO_(4)^(2-)的主要途径,其基因丰度远远高于直接氧化途径,分别为0.137%与0.0005%(表面)、0.138%与0.0007%(间隙).结果表明,在单质硫自养反硝化过程中,间隙生物膜与表面生物膜中的微生物存在合作关系,协同促进硫自养反硝化脱氮过程.

摘要： 烃类渗漏是地球化学循环中的自然垂直运移现象.油气微生物勘探技术就是通过检测油气微生物在烃类渗漏条件下形成的异常特征进而预测下伏油气藏.然而,上浮烃类比重小,使得油气微生物丰度小,缺乏对油气藏地表烃类与油气微生物的深入认识.本研究在人工模拟环境下,采用培养法和定量PCR对油气微生物数量和油气功能基因的变化特征进行研究.人工模拟的不同渗漏环境,在一定的驯化培养周期下分别考察甲烷氧化菌和丁烷氧化茵数量变化特征,甲烷氧化菌与丁烷氧化菌在不同烃源中呈现不同的发育情况;同时,在气态烃高浓度阳性对照和微渗漏条件下,油气指示基因pmoA与bmoX基因丰度呈现增长现象,然而经过吹脱实验基因丰度仍能指示出曾经发育的油气微生物,在油气微生物勘探检测分析时间尺度上精度高于数量水平的检测.本研究考察了土壤中油气微生物的数量和功能基因变化特征,为烃类渗漏与油气微生物之间的相关性研究奠定了基础,为油气微生物勘探提供了直接实验依据.

摘要： 硝化菌是完成氮循环的关键细菌,硝化菌包括氨氧化菌和亚硝酸盐氧化菌.氨氧化菌将氨氮(NH4+N)转化为亚硝酸盐氮(NO2--N),亚硝酸盐氧化菌再将NO2--N转化成硝酸盐氮(NO3--N).由于硝化菌较低的增长速率及对pH、溶解氧浓度、温度、有毒化学品等极高的敏感性,硝化作用一直被视为脱氮过程中的限速步骤1.重金属铜(Cu)是一种重要工业原材料,被广泛用于制革、电镀、金属加工等行业.Cu对硝化菌的毒性作用有很多报道,Cu的抑制浓度范围很宽(5-50mg/L).然而这些研究多数都是根据硝化效率、呼吸速率活性来研究Cu的毒性效果.在有大量其他类细菌(例如异养菌)共存的混合系统中,硝化效率、呼吸速率活性的检测分析可能受到其它微生物的影响,其准确性值得探讨,而且这些表观参数很难深入反应Cu的毒性机理.本文针对典型的混合菌系统，即耗氧活性污泥系统，检测了Cu对硝化菌的代谢活性、微生物多样性、功能基因转率水平的毒性影响，并且分析了代谢活性和功能基因转率水平的相关性，进一步探索了Cu的毒性机理。硝化菌的呼吸速率活性和功能基因对Cu的投加都很敏感，而且二者之间具有相关性。混合菌系统中硝化效率不能真实反应硝化菌的活性。Cu对氨氧化菌和亚硝酸盐氧化菌的影响程度不同。在Cu的暴露下，氨氧化菌的功能基因amoA和亚硝酸盐氧化菌功能基因nxrB的各自转录特点表明氨氧化菌比亚硝酸盐氧化菌对Cu更敏感。Cu的投加改变了混合菌系统的微生物多样性和菌群结构。随着铜浓度的增加这种改变越加剧烈。

摘要： 本文对驴遗传育种研究进展进行综述,从传统育种和现代分子育种两方面对不同驴主要经济性状、分子标记及功能基因的挖掘研究进行梳理,同时探讨同期发情、人工授精、体外胚胎生产等现代繁育技术在驴产业中的应用,并展望驴遗传育种未来发展趋势.

摘要： 药用植物有效成分是中药发挥药效的物质基础,随着分子生物学技术和生物工程技术的快速发展,多学科,多领域方法和技术的联合应用加快了活性成分生物合成的研究,为中药资源的深入挖掘和可持续利用提供了新技术和新策略.依托药用植物的生物合成途径解析.通过药用植物代谢工程改良、合成生物学与发酵工程等手段生产有效成分对缓解中药资源的压力具有非常重要的意义.其中,功能基因的筛选、克隆及研究是进行遗传资源挖掘和可持续利用的基础.文章将从药用植物功能基因研究方法、技术以及应用方面总结目前国内外药用植物功能基因研究思路和进展.

摘要： 金荞麦具有很高的药用价值和营养价值,是一种开发潜力巨大,经济附加值较高的资源植物.本文从栽培技术、遗传多样性、功能基因、组织培养、育种等方面综述了金荞麦研究进展,为今后对该植物进行进一步的开发利用提供参考.随着对金荞麦的科学研究和新产品开发的不断深入,金荞麦的市场需求必然不断增加,具有广阔的市场开发前景.

摘要： 目的：探索药用植物雷公藤悬浮细胞原生质体提取的最优条件,并建立雷公藤原生质体瞬时转化体系. 方法：以雷公藤悬浮细胞为材料,对酶解液配比、酶解时间、甘露醇浓度、处理转速等因素进行考察.用PEG介导瞬时转化法将外源基因转化到雷公藤原生质体中. 结果：雷公藤悬浮细胞为材料提取原生质体的最佳条件是：酶液配比为2.0％纤维素酶+0.5％果胶酶+0.5％离析酶,甘露醇浓度0.6mol/L,酶解时间10h,处理转速67×g;PEG介导含有编码GFP的植物表达载体转化雷公藤悬浮细胞原生质体,激光共聚焦扫描显微镜下细胞显示绿色荧光. 结论：筛选得到了雷公藤悬浮细胞原生质体的最佳提取条件,建立了雷公藤悬浮细胞原生质体的瞬时转化体系,为进一步开展雷公藤功能基因及合成生物学等研究奠定了基础.

摘要： 由于小麦基因组比较复杂,并且遗传转化相对困难,限制了小麦功能基因组学的发展.为了探索小麦基因功能研究的新途径,筛选小麦的重要功能基因,构建了适合小麦的Ac/Ds转座子激活标签载体,载体上带有经过密码子优化的转座酶Ac基因元件,和带有激活标签的Ds转座子元件.Ac基因表达的转座酶,随机将Ds元件转座插入到小麦基因组的任意位置,并激活附近基因的过表达,使小麦的性状发生改变.因此,在后代中,通过观察小麦的表型变化,并通过Tail-PCR等技术手段,既可以找到决定小麦性状的重要功能基因.并且,随机的Ds转座插入可以通过少量的初始转化个体,得到大量的不同插入位置的突变体后代.目前,已将Ac/Ds载体转入小麦,并初步在后代中检测到Ac元件和Ds元件的切离.

摘要： 干旱是影响葡萄正常生长发育、产量和品质的一个重要逆境因子.随着分子生物学的应用与发展,葡萄对干旱胁迫相关基因的响应这一领域备受国内外广大学者的关注与重视.干旱胁迫诱导葡萄表达的基因主要分为2类,一类是能够增强葡萄抗旱能力的功能基因;另一类是调控基因.该文综述了葡萄响应干旱胁迫相关基因的克隆、转录、表达调控、功能验证及抗旱转录因子方面的研究进展,并对葡萄响应干旱胁迫相关基因研究存在的问题和未来的研究方向进行了分析和讨论.

摘要： 马铃薯块茎成熟收获后在一定时间内即使生长条件适宜,也不发芽生长的生理状态称为块茎休眠.马铃薯块茎的休眠和发芽对于马铃薯栽培、块茎生产和加工都极为重要.文中介绍了近年来在马铃薯块茎休眠和发芽性状调控的分子基础方面取得的部分研究结果,主要列举了马铃薯块茎休眠与发芽性状相关基因的克隆和功能鉴定，马铃薯块茎休眠解除过程茎端和芽端的代谢差异，马铃薯块茎休眠解除过程的蛋白质组分析以及马铃薯块茎休眠解除过程的转录组分析等，以期为调控马铃薯块茎休眠与发芽性状提供理论基础.

摘要： 马铃薯块茎成熟收获后在一定时间内即使生长条件适宜,也不发芽生长的生理状态称为块茎休眠.马铃薯块茎的休眠和发芽对于马铃薯栽培、块茎生产和加工都极为重要.文中介绍了近年来在马铃薯块茎休眠和发芽性状调控的分子基础方面取得的部分研究结果,主要列举了马铃薯块茎休眠与发芽性状相关基因的克隆和功能鉴定，马铃薯块茎休眠解除过程茎端和芽端的代谢差异，马铃薯块茎休眠解除过程的蛋白质组分析以及马铃薯块茎休眠解除过程的转录组分析等，以期为调控马铃薯块茎休眠与发芽性状提供理论基础.

摘要： 本发明属于生物医药技术领域，设计一种多功能化的石墨烯基因载体和基于该载体的基因转染试剂及其制备方法。该多功能化的石墨烯，由三部分组成，包括石墨烯，阳离子聚合物，和活性试剂，其中活性试剂包括表面活性剂、或细胞穿透肽(Cell‑penetrating peptide)、或细胞核定位信号肽(Nuclear localization signal peptide)中的一种或几种，阳离子聚合物和活性试剂连接到石墨烯上。本发明通过多功能化方式，增加该基因载体在基因转染过程中的稳定性、分散性、生物相容性，减小毒性，并采取多个基因转染促进机制，增加转染效率。经基因转染实验，结果表明，在多种细胞株中具有较高的转染效率，较低的毒性。本发明的主要用途为基因转染，可用于细胞生物学研究、生产基因制品、以及基因疗法。

摘要： 目前，全基因组范围内的功能缺失高通量筛选已普遍应用于各个生物过程中基因功能的研究。然而，普遍存在的基因功能冗余现象对于全面深入研究基因功能造成了很大的干扰。为此，本发明人基于基因家族建立了siRNA组合文库，该基因家族siRNA组合文库对功能相似基因的表达同时进行干扰。以检测Wnt3a诱导的β‑catenin蛋白质的稳定性为出发点，证明了相比于常规的单基因siRNA文库，基于基因家族siRNA组合文库的筛选能克服同一家族基因间的代偿效应所引起的假阴性现象。

摘要： 本发明公开了一种具有催化功能的蛋白、其编码基因、以此基因为目的基因制备的重组蛋白及应用。本发明在灰毡毛忍冬中发现了一种一个具有催化糖基转移功能的蛋白LmRha‑UGT，蛋白LmRha‑UGT以及以该蛋白编码基因为目的基因制备的重组蛋白可以将底物cauloside A催化加上一分子鼠李糖生成皂苷α‑hederin。因此，蛋白LmRha‑UGT、含有蛋白LmRha‑UGT编码基因的表达载体以及以该蛋白编码基因为目的基因制备的重组蛋白可以用于制备α‑hederin。

摘要： 本发明属于生物医药技术领域，设计一种多功能化的石墨烯基因载体和基于该载体的基因转染试剂及其制备方法。该多功能化的石墨烯，由三部分组成，包括石墨烯，阳离子聚合物，和活性试剂，其中活性试剂包括表面活性剂、或细胞穿透肽(Cell-penetrating peptide)、或细胞核定位信号肽(Nuclear localization signal peptide)中的一种或几种，阳离子聚合物和活性试剂连接到石墨烯上。本发明通过多功能化方式，增加该基因载体在基因转染过程中的稳定性、分散性、生物相容性，减小毒性，并采取多个基因转染促进机制，增加转染效率。经基因转染实验，结果表明，在多种细胞株中具有较高的转染效率，较低的毒性。本发明的主要用途为基因转染，可用于细胞生物学研究、生产基因制品、以及基因疗法。

摘要： 本发明属于基础研究技术领域，公开了一种病毒诱导的基因沉默介导的藜麦基因功能验证的方法，所述病毒诱导的基因沉默介导的藜麦基因功能验证的方法包括：准备相关病毒的载体；进行目的基因和指示基因的克隆；进行VIGS重组载体的构建；进行病毒诱导的基因沉默的实验。本发明的病毒诱导的基因沉默介导的藜麦基因功能验证的方法，利用烟草脆裂病毒(TRV，Tobravirus)介导进行藜麦基因功能验证，涉及利用TRV(Tobravirus，烟草脆裂病毒)病毒载体，以藜麦PDS(phytoene desaturase，八氢番茄红素脱氢酶)基因为标记基因，在藜麦中通过TRV病毒介导的VIGS体系进行基因的功能分析方法。

摘要： 本发明公开了一种检测高血压相关基因及基因功能分析的系统。包括：基因预处理单元，用于对高血压基因表达数据进行预处理获得基因表达矩阵；基因样本分析单元，基于基因表达矩阵分析样本分布情况；基因差异分析单元，基于基因表达矩阵筛选发生显著变化的差异基因，获得基因差异矩阵；基因模块分析单元，基于基因表达矩阵通过加权基因共表达网络方法确定基因模块并筛选关键模块；Hub基因分析单元，用于筛选关键基因中的Hub基因；基因功能分析单元，用于对差异表达基因或基因模块进行功能富集分析及通路与基因关系的网络分析。本发明可以辅助不熟悉高血压基因相关数据库和分析流程的科研人员准确有效的发现与高血压等复杂疾病相关的基因与通路。

摘要： 本发明公开了一种基于基因组稀有突变负荷变化和基因功能关联发现分子标志物的方法及系统，该方法包括：公共稀有突变数据、拷贝数变异数据和感兴趣的基因集的收集和整理；突变贡献度分析；突变负荷分析；基因贡献度分析；正向贡献基因筛选与分析；候选标志物筛选。本发明充分考虑了多种遗传突变类型对疾病的贡献强度，并利用了脑表达及蛋白互作基因之间的内在关联，标志物发现的过程经历了多种不同类型数据的相互支持，鉴定的标志物更加全面。

摘要： 本发明公开了一种萝卜功能基因组研究及基因功能验证的方法，该方法以萝卜(Raphanus sativus)与甘蓝(Brassica oleracea)远缘杂种加倍后稳定遗传的异源四倍体(RRCC基因组)为受体材料，通过遗传转化，超表达或敲除萝卜的目标基因以研究其功能，在全基因组范围内敲除萝卜基因来进行功能基因组研究。利用甘蓝基因组中的调控体细胞胚发生的关键基因驱动杂种植物的再生和遗传转化。通过转基因超表达、敲除或编辑远缘杂种中萝卜基因组中的基因，以研究萝卜基因功能。由于本体系遗传转化效率很高，利用该系统大批量敲除萝卜基因，可以进行萝卜功能基因组研究。

摘要： 本发明涉及生物信息技术领域，具体涉及一种联合基因组三维结构差异鉴定和转录组基因表达水平差异分析挖掘功能基因的方法。本发明提供一种基因组三维结构差异的鉴定方法，包括在Hi‑C数据的基础上进行差异AB Compartment的鉴定、差异TAD的鉴定和差异Loop的鉴定，利用该方法可实现利用原位Hi‑C数据对动植物进行不同层级的基因组三维结构差异的高效鉴定。本发明提供利用该基因组三维结构差异鉴定方法联合转录组基因表达水平差异分析挖掘功能基因的方法，利用该联合分析方法可实现从基因组三维结构与转录组两个层面进行差异分析，进而实现对动植物功能基因的高效挖掘。

摘要： 本发明涉及从无基因组参考序列物种获得基因信息及功能基因的方法。本发明还公开了获得亚洲玉米螟的基因表达谱的方法。本发明还公开了获得亚洲玉米螟的转录组信息及功能基因的方法。本发明首次将DGE-tag技术与RNA-seq技术相结合，用于从无基因组参考序列的物种中获得基因的表达时期、表达量、对应的代谢通路及基因功能信息，所述方法方便、快捷、准确且成本低廉。