氨基酸序列
氨基酸序列的相关文献在1984年到2022年内共计913篇,主要集中在畜牧、动物医学、狩猎、蚕、蜂、生物化学、分子生物学
等领域,其中期刊论文490篇、会议论文104篇、专利文献175402篇;相关期刊291种,包括生物技术通报、生物技术通讯、中华微生物学和免疫学杂志等;
相关会议87种,包括第十一届中国竹业学术大会、四川省畜牧兽医学会2014学术年会、2010广州-东莞首届国际小型猪学术论坛等;氨基酸序列的相关文献由2602位作者贡献,包括孙国凤、孙世龙、罗利军等。
氨基酸序列—发文量
专利文献>
论文:175402篇
占比:99.66%
总计:175996篇
氨基酸序列
-研究学者
- 孙国凤
- 孙世龙
- 罗利军
- 叶水烽
- 高宁宁
- 尉军
- 王威
- 赵伟
- 陶凤云
- 亨德里克斯·雷内瑞斯·雅各布斯·马托伊斯·霍根博姆
- 何文亮
- 安黎哲
- 张华
- 王斌
- 王雷
- 约翰内斯·约瑟夫·威廉姆斯·德哈德
- 迈克尔·约翰·斯科特·桑德斯
- 上出利光
- 今重之
- 刘军
- 吴金红
- 宋渊
- 彼得·万兰德舒特
- 曹仲欣
- 李光辉
- 赵春玲
- 陈尚卫
- 饶春明
- 鹤下直也
- 埃尔斯·拜尔内德
- 戴军
- 李冬梅
- 李成浩
- 李明
- 李晓琴
- 李荣贵
- 杜桂彩
- 杨传平
- 王军志
- 盛红梅
- 约斯特·亚历山大·科尔克曼
- 郝建华
- 钱冬萌
- 陈书燕
- 韩春梅
- A·E·I·普劳德福特
- A·于尼安
- A·维卡里
- D·史密斯
- D·布兰尼克尔
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范三红;
贾槐旺;
李兰;
白宝清
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摘要:
通过单因素和响应面实验对紫苏籽粕蛋白的闪提工艺进行优化,将所获蛋白通过碱性蛋白酶酶解,酶解物经超滤、DEAE-32离子交换色谱和Sephadex G-25凝胶层析色谱进行分离纯化,并将纯化后抗氧化活性最好的多肽进行液质分析。结果表明,紫苏籽粕蛋白提取的最优工艺参数为:料液比1∶20 (g/mL)、闪提pH 10、闪提时间30 s和闪提转速3 000 r/min;酶解物经分离纯化后,得到G1组分的抗氧化活性最好,活性肽G1对DPPH、ABTS、O_(2)^(-),·OH自由基清除率及铁离子还原能力依次为98.97%、85.11%、91.83%、93.40%、0.477;通过LC-MS-MS对活性肽G1进行鉴定,G1主要由15个氨基酸组成,荷质比m/z为672.39,分子质量为1 718.82 u,其氨基酸序列为Glu-Met-Pro-Tur-lle-Ala-Ser-Met-Gly-lle-Tyr-Val-Val-Ser-Lys。
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郑乾明;
王小柯;
马玉华
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摘要:
【目的】分离侵染贵州火龙果的蟹爪兰X病毒(Zygocactus virus X,ZyVX)和火龙果X病毒(Pitaya virus X,PiVX)基因组序列,探讨其序列差异和遗传变异。【方法】利用RT-PCR筛选含有ZyVX和PiVX的火龙果样品,然后通过RNA-seq获得ZyVX和PiVX基因组相关序列,进行序列组装、一致性比较、基因重组和系统进化分析。【结果】获得4条ZyVX贵州分离物和3条PiVX贵州分离物基因组近全长序列,长度分别为6570~6600和6649~6657 bp,分别覆盖参考基因组序列的99.2%~99.6%和99.3%~99.8%。4条ZyVX贵州分离物之间的基因组序列一致性为96.7%~99.5%,与其他已报道分离物的序列一致性为91.4%~96.9%,其ORF编码的氨基酸序列一致性为93.8%~100%。3条PiVX贵州分离物之间基因组序列一致性为98.2%~98.5%,与其他已报道分离物序列一致性为98.0%~99.1%,其ORF编码的氨基酸序列一致性为97.8%~100%。ZyVX和PiVX贵州分离物基因重组分析表明未发现明显的重组事件,系统进化分析表明未发生明显的遗传分化。【结论】当前贵州ZyVX和PiVX群体的基因组序列一致性高,其变异均为单核苷酸变异,未发生基因重组和遗传分化。
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魏连会;
董艳;
石杰;
宋淑敏;
孙兴荣
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摘要:
为开发具有较好抗氧化活性的植物源蛋白肽,采用木瓜蛋白酶和中性蛋白酶复合酶法水解汉麻籽粕获得汉麻籽蛋白水解物,经膜分离技术得到4种不同分子质量的多肽组分。通过DPPH自由基清除率、总还原力的测定,评价不同多肽组分的抗氧化活性,并对抗氧化活性最强的多肽组分进行氨基酸序列分析。结果显示:低分子质量的汉麻籽多肽组分具有更好的抗氧化活性,其中HP-Ⅳ组分(分子质量<1 kDa)的抗氧化活性最强;HP-Ⅳ组分中丰度较高的6个肽段的分子质量分别为364.84、539.77、630.30、662.33、718.90、827.41 Da,氨基酸序列分别为NRDDMRER、ANQLDQFSR、NPEDEFEQLRREGGRG、NHNNQLDLTPR、TVNSYNLPILRF、VSLLDTSNVNNQLDDNPRRFY。汉麻籽蛋白水解物,尤其是分子质量小于1 kDa的多肽组分可作为功能性成分用于抗氧化相关功能食品和保健品的开发。
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黄迪海;
盛晓丹;
刘霞;
黄兵;
亓丽红;
张再辉;
秦卓明
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摘要:
为探明兽用鸡脾和猪脾转移因子(Transfer factor,TF)与免疫活性相关的多肽种类及其氨基酸组成,采用液相色谱-质谱联用法(LC-MS)对其进行多肽测序,并与蛋白质比对。结果发现,由鸡脾和猪脾制备的TF分别检测到免疫相关多肽45条和102条,多肽的氨基酸数量为5~24个,分子量为599.2784~2507.8258 Da;这些多肽对应于免疫活性蛋白质64种,以细胞免疫和先天免疫活性为主。该研究揭示了兽用鸡脾和猪脾TF的免疫活性多肽的组成及其氨基酸序列,有助于进一步研究其有效成分和作用机理。
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张家昌;
史玲玉;
郭兆铖;
赵元;
徐鹏程;
张俊丽
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摘要:
法尼基焦磷酸合酶(Farnesyl Pyrophosphate Synthase,FPPS)是萜类化合物合成途径的关键酶,本文运用生物信息学方法分析FPPS的核苷酸及氨基酸序列,探讨该酶在不同物种间的亲缘关系及进化率。结果表明,所选物种中FPPS氨基酸序列相对保守,存在5个保守结构域,富含DDXXD序列的位点为其活性位点。在系统进化方面,细菌等原核生物聚成一支,植物、动物、真菌等真核生物聚在一起,说明FPPS的功能结构域在进化过程中有较高的稳定性,不同物种间FPPS的进化率不同,具有较为显著的种族特异性。
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郑乾明;
王小柯;
马玉华
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摘要:
【目的】检测果实甜菜红素含量,克隆HpCYP76AD1基因并分析其表达模式,分析基因表达与甜菜红素含量之间的关系,为研究红肉火龙果果实甜菜红素积累的分子机制和改良果实营养价值提供理论依据。【方法】利用比色法测量果实成熟期间甜菜红素的相对含量,基于果实转录组测序数据结合RT-PCR克隆获得HpCYP76AD1基因,分析该基因编码蛋白质的理化性质和系统进化关系,通过qRT-PCR检测HpCYP76AD1基因在果实成熟期间的表达模式。【结果】红肉火龙果果实成熟期间甜菜红素快速积累,成熟果实(授粉30 d)中的含量约是授粉20 d的150倍。HpCYP76AD1基因的开放读码框长度为1521 bp,编码长度为506个氨基酸的蛋白质序列。HpCYP76AD1蛋白的相对分子量为57.5 kDa,预测等电点为8.86。HpCYP76AD1氨基酸序列与梨果仙人掌OfCYP76AD8相似度最高,达89.96%。HpCYP76AD1与甜菜BvCYP76AD1、紫茉莉MjCYP76AD3和紫色苋菜花AcCYP76AD2属于CYP76AD1家族α类,HpCYP76AD1在果实甜菜红素积累的两个羟基化反应中均具有催化活性。HpCYP76AD1基因在果实成熟期间显著上调表达,与果实甜菜红素的积累模式正相关。【结论】红肉火龙果细胞色素P450家族成员HpCYP76AD1基因属于α类,可能在甜菜红素积累的两步羟基化反应中均具有催化活性;在果实成熟期间大幅上调表达,参与果实甜菜红素积累。
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高晗;
赵贝
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摘要:
目的 利用生物信息学方法分析GLUT8蛋白的结构和功能。方法 从NCBI数据库中获取GLUT8的基因序列和氨基酸序列,通过ProtParam和ProtScale分析GLUT8的理化性质和亲疏水性;通过TMHMM、SignalP和ProtCrop-Version分析GLUT8的跨膜结构域、信号肽和亚细胞定位;通过YinOYang 1.2 Server和NecNGlyc 1.0 Server分析GLUT8的糖基化情况;通过NetPho3.1分析GLUT8的磷酸化位点;通过SOPMA、SWISS-MEDOL分析GLUT8的二级和三级结构;通过Uiprot中的Inertation数据库分析GLUT8的二元相互作用;通过STRING分析GLUT8的蛋白相互作用分析。结果 GLUT8蛋白由SLC2A8编码,位于9q33.3,全长10 759 bp,包含11个外显子,共477个氨基酸,其中丙氨酸(Ala)占12.8%,亮氨酸(Leu)占13.8%,其他氨基酸的占比均小于10%。GLUT8蛋白共有12个跨膜结构域,其主要定位于细胞膜和细胞质内。GLUT8蛋白共有5个O-糖基化位点,分别在47、333、350、356、360位;有1个N-糖基化位点,在349位。GLUT8蛋白共有24个磷酸位点,其中丝氨酸(Ser)磷酸化位点12个,苏氨酸(Thr)磷酸化位点10个,酪氨酸(Tyr)磷酸化位点2个。GLUT8蛋白二级结构以α-螺旋为主,三级结构中GEMQ评分为0.63分,平均QMEAN评分为(0.66±0.05)分。GLUT8蛋白共与46个蛋白有二元相互作用,与10个蛋白有相互作用。结论GLUT8为12次跨膜蛋白,有多个糖基化位点和磷酸化位点,与多个蛋白相互作用,参与多条信号通路。
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詹苏泓;
吉宏武;
张迪;
韦柳益;
彭烁;
陈铭;
宋文奎;
瞿瑜杉;
刘书成
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摘要:
为了从远东拟沙丁鱼肉酶解物中制备黄嘌呤氧化酶(xanthine oxidase,XO)抑制肽并研究其降尿酸活性,该研究以远东拟沙丁鱼肉为原料,XO抑制率为考察指标,采用碱性蛋白酶水解远东拟沙丁鱼肉,产生的酶解物通过超滤与凝胶色谱、反相高效液相色谱(reversed phase high performance liquid chromatography,RP-HPLC)分离纯化,从中分离出2个XO抑制肽,它们的氨基酸序列采用超高效液相四级杆飞行时间串联质谱(ultra-high performance liquid chromatography quadrupole time of flight tandem mass spectrometry,UPLC-MS/MS)鉴定为苯丙氨酸-亮氨酸-精氨酸(Phe-Leu-Arg,FLR)与精氨酸-脯氨酸-赖氨酸(Arg-Pro-Lys,RPK)。采用腺苷及XO联合诱导人肾皮质近曲小管上皮细胞(HK-2)构建高尿酸细胞模型,对2个肽的降尿酸功效进行评价,结果显示FLR、RPK具有显著降尿酸作用。
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Payal Dhar
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摘要:
人工智能(AI)能否实施,取决于是否以正确的方式提出恰当的问题。英国人工智能公司DeepMind(Alphabet公司的子公司)在这方面颇有心得,如今,该公司使用神经网络来解决现今重要的生物学计算问题一-蛋白质折叠。该公司的神经网络AlphaFold能够根据蛋白质的氨基酸序列,以前所未有的准确性预测蛋白质的3 D结构。
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万晓耕
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摘要:
蛋白质的序列、结构和功能多种多样.大量研究表明蛋白质的结构与其氨基酸序列的排序有关,并且局部的氨基酸序列环境对蛋白质的结构具有一定的影响.本文提出一种新的基于5-mer氨基酸扭转角统计偏好的蛋白质结构类型预测方法,在该方法通过PDB数据库中5-mer中间氨基酸的扭转角统计偏好来进行结构类型的预测.新方法可以通过计算机仿真实现对新蛋白质序列结构类型的快速预测,并通过两组随机抽取的CATH数据验证了新方法的有效性.
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杨扬;
钟东明;
舒琥;
侯丽萍;
蓝昭军;
谷平华
- 《广东水产学会首届青年科技论坛》
| 2018年
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摘要:
黑色素皮质素受体-4(Melanocortin reporter-4,MC4R)是G蛋白偶联受体超家族成员,在能量调控中发挥重要作用.本实验采用同源克隆以及染色体步移对缩骨鲫(Carassius auratus sogu var.)MC4R基因进行克隆,对其核苷酸序列和推测的氨基酸序列进行生物信息学分析,通过Real-time PCR对其mRNA组织分布进行研究,并对缩骨鲫MC4R编码区潜在的与生长相关的SNPs进行筛选.本实验克隆MC4R基因组基因长度为2854bp,只包含一个外显子,长度为981bp,共编码326个氨基酸,MC4R共有七个跨膜结构,是较为稳定的疏水蛋白.缩骨鲫MC4R与鲫鱼的MC4R氨基酸序列的同源度最高达到99.3%,与MC3R和MC5R同源度相对其他MCRs成员较高.缩骨鲫MC4RmRNA在脑中表达量最为显著,眼中次之,肌肉,卵巢和肾脏中表达较少,在鳃、肠、心脏和肝胰腺中微量表达.在MC4R的CDs区内检测到6个与生长潜在相关的SNPs:两个错义突变(A199G和A881C),4个同义突变(A123G,C231T,A444G和C480T).本实验可为缩骨鲫生长和发育的分子机制研究以及遗传育种提供基础资料.
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查艳;
唐顺明;
陈加佳;
刘龙山;
沈兴家
- 《全国农业生物化学与分子生物学第十四届学术研讨会》
| 2015年
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摘要:
昆虫在当代动物分类种群中占据了重要位置,是探讨进化生物学理想的实验材料.孵化酶广泛存在于各物种胚胎发育过程中,并在个体发育中扮演重要角色.最近在鱼类基于昆虫孵化酶基因及其内含子缺失角度探讨了进化分析,获得了有意义的结果.本文通过包括19种昆虫和7种代表性的脊椎动物的成熟孵化酶氨基酸序列比对与进化树构建,调查11种代表性昆虫的孵化酶同源序列的基因结构与其保守区对应的内含子,分析昆虫纲孵化酶基因内含子缺失的状态及相互间的亲缘关系.结果发现成熟孵化酶均存在18-氨基酸特征序列和"Met-转角"基序两个保守序列;8种鳞翅目昆虫分枝的昆虫孵化酶基因均为6-外显子-5-内含子结构,双翅目昆虫分枝中的两种孵化酶基因均为3-外显子-2内含子结构,这基本符合基于氨基酸序列构建的进化树和经典形态学物种分类的结果.上述结果暗示昆虫孵化酶基因结构的内含子缺失可以作为一个候选基因来研究昆虫进化关系.另外有趣的是,在调查的昆虫中仅有小菜蛾的孵化酶基因是单外显子结构,推测其与硬骨鱼孵化酶基因HCE类似,存在内含子全部丢失的现象.
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刘建奎;
魏春华;
戴爱玲;
李晓华;
杨小燕
- 《中国畜牧兽医学会动物传染病学分会第十六次学术研讨会》
| 2015年
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摘要:
猪生殖与呼吸综合征病毒(porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)是引起猪繁殖与呼吸综合征(Porcine reproductive and respiratory syndrome,PRRS)的主要病原.根据PRRSV的不同来源地及其核昔酸序列的差异,将其分为欧洲型与美洲型,虽然两个基因型的基因组核苷酸一致性仅60%左右,但其形态结构、复制特点、细胞嗜性、流行传播方式及其引发的疾病特征等生物学特性均相同。GP5蛋白是PRRSV的主要结构蛋白,能诱导抗体产生中和抗体,虽然美、欧洲型毒株的ORES基因大不同,但两者编码的GPS蛋白疏水侧翼却很相似,可能起锚定作用。本实验主要对欧洲型毒株进行研究,将病毒分离培养,并对ORF5基因及其推导的氨基酸序列进行分析。
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吴霏霏;
卜庆忠;
陈昕晟;
周春华
- 《第七届全国枇杷学术研讨会》
| 2015年
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摘要:
醇酰基转移酶类(Alcohol Acyltransferases,AATs)是酯类化合物合成过程中的关键酶,催化酯类合成的最后一步,可将酰基CoA中的酰基转移到醇类底物形成酯.本研究以'丰玉'枇杷为研究材料,采川CTAB法提取枇杷果实总RNA,根据Genbank中其它蔷薇科植物的AAT1基因序列,运用DNAMAN、Primer5.0等软件设计用于3'端和5'端扩增的引物,采用RACE方法进行AAT1基因3'和5'端cDNA片段的扩增,3'端扩增得到一条约为900bp的条带,5'端扩增得到一条约为1100bp的条带.利用DNAman生物分析软件对批把、苹果、番茄、甜橙、薰衣草、草莓、灯笼草AAT1基因的氨基酸序列进行分子系统进化分析以进一步研究枇杷AAT1基因与其他物种的亲缘关系。结果表明:基因的分子进化关系与其植物的亲缘关系基本一致;枇杷AAT1与苹果AAT1亲源最近,其次是甜橙,与草莓和灯笼草的亲源关系较远。
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黄嘉丰;
邓海涛;
刘民霁;
王彦鹏;
胡乾
- 《第八届全国大学生创新创业年会》
| 2015年
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摘要:
PPC(Pre-Peptidase C-terminal)结构域广泛存在于分泌型海洋细菌蛋白酶的C末端,对蛋白酶的分泌,锚定及与底物相互吸附起到重要作用.为了进一步对不同来源的PPC结构域的进化关系进行系统研究,选取61条来自于39个细菌所分泌的不同蛋白酶的PPC的氨基酸序列进行系统发育分析.发现PPC结构域在生物进化过程中序列变异性大,保守性弱.其中,有些细菌PPC结构域可能来源于自身基因重复产生,有些细菌PPC结构域则可能由水平基因转移产生.
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杨艳红;
汤定钦;
周明兵
- 《第十一届中国竹业学术大会》
| 2015年
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摘要:
本研究根据Ty3-gypsy反转录转座子反转录酶的保守序列设计简并性引物,从毛竹、绿竹、菲白竹、龟甲竹中扩增出了430bp左右的目标片段.目的条带经克隆、回收、测序及相关生物信息学软件进行序列分析后,获得了160条Ty3-gypsy反转录转座子反转录酶序列.这些核苷酸序列具有一定的异质性,长度变化范围为366~438bp,同源性范围为65.4%~84.5%.翻译成氨基酸后,将其氨基酸序列与不同物种Ty3-gypsy反转录转座子反转录酶的氨基酸序列进行聚类分析,可将其序列归属于植物Ty3-gypsy反转录转座子六大亚群中的Del亚群,亚群又可分为Del1、Del2、Del3、Del4和Del55个家族.此外,系统进化分析结果表明在某些家族中,来源于不同种或变种的转座子比来源于同一种的转座子的亲缘关系近,而来源同一种的转座子的转座子反而比来源不同种或变种的转座子亲缘关系远,表明在进化历史上这几个物种间的反转录转座子可能存在横向传递的现象.
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潘飞翔;
汤定钦;
周明兵
- 《第十一届中国竹业学术大会》
| 2015年
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摘要:
本研究根据竹亚科En/Spm转座酶保守区域设计一对简并性引物,从毛竹、梨竹、孝顺竹、龟甲竹中扩增出了650bp左右的目标片段.目的条带经克隆、回收、测序等试验过程及相关生物信息学软件进行序列分析后,获得了206条En/Spm转座子DNA转座酶序列.这些核氨酸序列的长度变化范围为195~226bp,同源性变化范围为52.9%~100%.将这些核苷酸序列翻译成氨基酸序列后,将其与不同物种En/Spm类转座子转座酶的氨基酸序列进行比对及聚类分析并构建进化树,可将其序列分类为Ba_Enspm1、Ba_Enspm2、Ba_Enspm3、Ba_Enspm4、Ba_Enspm5一共5大类.除此之外,系统进化分析结果显示En/Spm类转座子虽起源相同,但在竹亚科不同竹种中却产生了分化,具体表现为来源于同一竹种的亲缘关系近且近乎集中分布.
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WANG Yu-jue;
王玉珏;
YUE Min;
岳敏;
TIAN Yu-guang;
田雨光;
GU Wei-wang;
顾为望
- 《第十六届中南实验动物学会科技交流会》
| 2016年
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摘要:
目的:克隆西藏小型猪的肝脏组织中的GHR基因的cDNA序列,并与Pubmed中查询到的版纳微型猪、五指山小型猪的cDNA进行比对分析. 方法:提取了西藏小型猪肝脏组织的总RNA,应用RT-PCR技术扩增GHR基因的cDNA序列,将这个基因克隆到pMD18-T载体上,构建重组质粒pMD18-T-GHR,进行测序分析. 结果:克隆得到了西藏小型猪GHR基因的cDNA序列,发现西藏小型猪GHR基因的片段长1912bp,包含编码区1721bp,该编码区编码了572个氨基酸,与版纳微型猪、五指山小型猪的GHR基因高度同源达99%.将西藏小型猪GHR基因的编码区与GenBank中搜索到猪的GHR基因的cDNA序列进行比对分析发现,在1225pb处发生了T→G的突变,该位点的突变引起相应编码氨基酸的变化,由丝氨酸变成了丙氨酸. 结论:为西藏小型猪的生长发育机制研究提供分子理论依据,位点的突变引起相应氨基酸的变化是否是导致西藏小型猪矮小的原因需要进一步论证.