不同生物来源的法尼基焦磷酸合酶生物信息学分析

摘要

法尼基焦磷酸合酶(Farnesyl Pyrophosphate Synthase,FPPS)是萜类化合物合成途径的关键酶,本文运用生物信息学方法分析FPPS的核苷酸及氨基酸序列,探讨该酶在不同物种间的亲缘关系及进化率。结果表明,所选物种中FPPS氨基酸序列相对保守,存在5个保守结构域,富含DDXXD序列的位点为其活性位点。在系统进化方面,细菌等原核生物聚成一支,植物、动物、真菌等真核生物聚在一起,说明FPPS的功能结构域在进化过程中有较高的稳定性,不同物种间FPPS的进化率不同,具有较为显著的种族特异性。