cDNA序列

摘要： 用生物信息学方法对GenBank中的23种高等植物的类黄酮3?5?-羟化酶基因(F3′5′H)的cDNA序列及其编码氨基酸序列的结构、理化性质、信号肽、疏水性/亲水性、亚细胞定位、跨膜结构域、功能域和进化关系进行了初步预测分析;结果表明:不同植物F3′5′H基因cDNA序列起始密码子均为ATG,终止密码子均为TAA、TAG或TGA,包括5',3'非翻译区和一个开放阅读框;不同植物F3′5′H基因cDNA序列编码的氨基酸序列的理化性质基本一致,有3段保守序列"PPGP""AGTDT""FGAGRRICAG",不同植物F3′5′H具有三个跨膜结构域,定位于细胞质上,并有一段与细胞色素P450功能区相匹配的功能域;类黄酮3?5?-羟化酶属具转运肽的亲水性稳定分泌蛋白,α-螺旋和无规卷曲为最主要的二级结构元件,延伸链和β-转角散布于整个结构.

摘要： 目的分析高良姜黄酮类生物合成第一步反应的关键酶——苯丙氨酸解氨酶(Phenylalanine ammonia-lyase,PAL)编码基因的序列特征,并明确该基因在高良姜中的表达模式。方法在高良姜转录组测序数据中挖掘PAL基因,采用生物信息学方法分析其编码蛋白的理化特征、组成、结构和细胞亚定位,并采用实时定量PCR分析该基因在高良姜不同组织中表达差异。结果获得的AoPAL cDNA序列长度为2261 bp,包含2130 bp编码区,编码710个氨基酸。AoPAL含有苯丙氨酸解氨酶保守功能域,归属苯丙氨酸解氨酶超级家族,且为不含跨膜结构域、信号肽和转运肽的亲水性混合结构型蛋白质。AoPAL表达在高良姜不同组织中呈现特异性,相对表达量为叶<茎<根茎。结论为AoPAL的功能鉴定奠定了研究基础,为阐明高良姜黄酮类物质生物合成途径研究提供理论参考。

摘要： 采用生物信息学方法对GenBank中甘蓝、葡萄、普通小麦、西洋梨等的花青素合成酶基因的cDNA序列及其编码氨基酸序列的结构、理化性质、信号肽、疏水性/亲水性、亚细胞定位、跨膜结构域、功能域和进化关系进行预测和分析。结果表明:不同植物ANS cDNA序列的起始密码子ATG,终止密码子均为TAG、TGA或TAA。氨基酸残基数及分子量均基本一致。氨基酸序列中含量最高的氨基酸均为Glu和Leu。植物ANS cDNA序列编码的氨基酸序列的理论等电点、酸性和碱性氨基酸的比例、半衰期、摩尔消化系数、带点氨基酸比例均基本一致。植物在肽链中的分布均是亲水性氨基酸数量多于疏水性氨基酸。整个多肽链表现为亲水性,无明显疏水区域,属于亲水蛋白。所有植物的ANS整条肽链均在膜外,所有ANS都不存在跨膜区域。

摘要： 主要组织相容性Ⅰ(MHC Ⅰ)类抗原分子重链基因是目前所有蛋白分子中多态性最高的分子.MHC Ⅰ分子重链有5个功能结构域,包括α1、oα2、oα3跨膜和胞浆区,其中α1和α2又是Ⅰ类分子中多态性最高的区域.总的来讲,α1和α 2结构域与等位基群或等位基因族系相关,而oα3和跨膜及胞浆域与MHC Ⅰ类分子基因座相关.人们对MHC Ⅰ认识和知识主要来自人和鼠MHC Ⅰ研究,人和鼠MHC Ⅰ不存在基因座重叠现象,但最近研究发现灵长类MHC Ⅰ基因座存在重叠现象.生物学方法克服血清学方法不能定义或确定Ⅰ类分子的基因座的缺点.本项目选择2只来自不同品系的绵羊,通过对它们的MHC Ⅰ类分子oα1和α2 cDNA的克隆、测序和分析,研究绵羊MHC Ⅰ类分子多态性,并探索该基因在绵羊中是否存在基因座重叠现象.对来自2只绵羊20个α1和oα2区域cDNA序列分析,2只绵羊9个或11个α1和α2 cDNA分子表明它们至少有5或6个MHC Ⅰ类分子等位基因.比较目前所有绵羊MHC Ⅰ类分子α 1和α2 cDNA序列,结合分析α3跨膜区和胞浆区cDNA序列,参照目前单位片分析确定的绵羊MHC Ⅰ类分子基因座分布,我们发现绵羊MHCI分子基因存在基因重叠现象.

摘要： 以莲藕品种‘美人红’叶片为试材，利用RACE结合RT～PCR技术克隆得到全长4080bp的莲藕可溶性淀粉合成酶基因（LrSSS）cDNA序列（Gen Bank 登录号：KP201636），其中开放阅读框3696bp，

摘要： 目的：研究双团棘胸蛙( Nanorana yunnanensis)皮肤胸腺肽-β4的基因和促进血管生成作用。方法通过基因扩增的方法克隆出双团棘胸蛙的2个皮肤胸腺肽-β4( pTβ4-1和pTβ4-2)的cDNA；根据推导蛋白序列合成多肽在鸡胚尿囊膜和内皮细胞实验系统进行血管生成活性分析。结果 pTβ4-1和pTβ4-2的cDNA长度分别为662 bp和673 bp,开放阅读框都为135 bp,编码44个氨基酸残基。成熟蛋白拥有四足动物胸腺肽β4的典型特征。 pTβ4-1和pTβ4-2的cDNA序列及成熟蛋白与来源于人类、家鼠、家鸡、爪蟾、斑马鱼、大比目鱼和棕点湍蛙的胸腺肽-β4高度相似；合成的 pTβ4-1和pTβ4-2都能促进鸡胚尿囊膜血管生长和内皮细胞小管形成。结论双团棘胸蛙皮肤含有两个具有促血管生成的胸腺肽-β4。%Aim To investigate the gene sequences and pro-angiogenic activities of thymosin-β4 from skin of Nanorana yunnanensis. Methods Two cDNA se-quences of thymosin-β4 from Nanorana yunnanensis designated as pTβ4-1 and pTβ4-2 were obtained by PCR. The tube formation and proliferation of human umbilical vein endothelial cells ( HUVEC ) and chick-en chorioallantoic membrane ( CAM) model were used to observe the pro-angiogenic effects of synthetic pep-tides according to the reduced amino acid sequences of pTβ4-1 and pTβ4-2 in vitro and in vivo, respectively. Results The cDNA sequences of Tβ4-1 and pTβ4-2 were composed of 662 bp and 673 bp, respectively, and their deduced amino acid sequences contained 44 residues which shared highly similarity with those from human , mouse , chicken , claw frog , zebra fish , turbot and Amolops loloensis. Furthermore, the mature amino acid sequences of pTβ4-1 and pTβ4-2 had highly con-served structural regions when compared with other thy-mosin-β4 previously reported. Synthetic peptides could significantly promote proliferation and tube formation of HUVEC and angiogenesis of CAM. Conclusion There are two thymosin-β4 peptides in skins of Nanorana yunnanensis which have pro-angiogenic ac-tivities.

摘要： 目的:分离并鉴定石头鱼粗毒液毒性成分,克隆其序列并进行原核表达.方法:利用SDS-PAGE及凝胶过滤HPLC分离石头鱼粗毒液,质谱鉴定其序列;利用RACE技术钓取毒素基因;将获得的毒素cDNA连入pET-22b(+)载体,转化宿主细胞大肠杆菌,经IPTG诱导表达,用亲和层析纯化目的蛋白.结果:从石头鱼粗毒液中分离到NeoVTX等多种蛋白质,克隆了NeoVTXα和β亚基的cDNA序列,获得了纯度为95％以上的重组α亚基蛋白.结论:中国南海石头鱼粗毒液的主要成分为NeoVTX,其α、β亚基序列与日本冲绳海域石头鱼NeoVTX的α和β亚基具有很高的同源性;大肠杆菌菌株可稳定表达α亚基.该工作为NeoVTX抗体制备奠定了基础.

摘要： 近年来，随着基因组和后基因组的迅速发展以及基因分离技术的不断进步，产生了大批核酸序列数据，而为了获得更多有效的生物学信息，需要进行大量的序列分析。然而，在日常工作中，序列分析软件功能较为单一，有些软件则是价格较昂贵，无法很好满足实际科研工作需求，所以利用当前流行的语言进行基于WWW和UNIX核酸序列分析实用软件的开发势在必行。%In recent years, with the development of the rapid development of genome and post genome and gene isolation tech-nology, produced a large number of nucleic acid sequence data, and in order to get more biological information effectively, the need for analysis of large amounts of sequence. However, in our daily work, sequence analysis software has single function, some software is expensive, cannot satisfy the needs of scientific research, so using the popular language development potential WWW and UNIX nucleic acid sequence analysis software based on need.

摘要： Myosin is a major component of muscle fibers in animal, and plays an important role in the growth and contraction of muscle. RT-PCR and rapid-amplification cDNA ends (RACE) were used to obtain a full-length of MYL1 cDNA. A full-length of 1 542 bp MYL1 cDNA included a 582- bp open reading frame en-coding a polypeptide of 193 amino acids, with a calculated relative molecular mass of 21.75 KD and pI of 5.12. The putative protein encoded by goose MYL1 gene had the conservative domains EFh and FRQ1. Real-time PCR was performed to analyze the expression of MYL1 gene during embryonic period, and the results showed that MYL1 gene was expressed at an early stage of embryogenesis, after that gradually increased, reached the peak at E18, and then decreased. The current study first provided the complete sequence information and molec-ular structural of goose MYL1 gene, and revealed its function in goose myogenesis and development.%肌球蛋白是肌纤维的主要组成成分，在肌肉生长和收缩过程中具有重要作用.本研究以鹅（Anser anser）肌肉总RNA为模板，采用RACE的方法，克隆肌球蛋白轻链1（MYL1）基因全长cDNA序列，并进行生物信息学分析.运用实时荧光定量PCR检测MYL1基因在鹅胚胎期的表达特征.结果表明，鹅MYL1基因全长cDNA为1542 bp，编码193个氨基酸残基的肽链.预测鹅MYL1蛋白等电点5.12，分子量21.75 KD，具有典型的EFh和FRQ1结构域，且不同物种间EFh氨基酸序列高度同源.荧光定量PCR结果显示鹅胚胎期MYL1基因mRNA表达量总体呈现上升后下降的趋势，该基因在胚胎期E7就有表达，E7以后表达量逐渐上升，在E18表达量达到高峰后下降.研究结果首次提供了鹅肌肉组织主要结构基因MYL1的全序列和蛋白特征信息，并揭示该基因在鹅肌肉组织发生和发育的功能.

摘要： MEF2(肌细胞增强因子)家族转录因子在骨骼肌生长发育过程中起着决定性的调控作用。猪mef2a基因是MEF2家族的一员，通过介导MRFs(肌肉调节因子)家族蛋白结合在肌肉特异性基因调控序列中富含A/T的保守区，促进肌肉特异性基因的表达。这些肌肉特异性基因的表达产物对于肌肉组织的分化、维持和再生等有重要作用。

摘要： MEF2(肌细胞增强因子)家族转录因子在骨骼肌生长发育过程中起着决定性的调控作用。猪mef2a基因是MEF2家族的一员，通过介导MRFs(肌肉调节因子)家族蛋白结合在肌肉特异性基因调控序列中富含A/T的保守区，促进肌肉特异性基因的表达。这些肌肉特异性基因的表达产物对于肌肉组织的分化、维持和再生等有重要作用。

摘要： MEF2(肌细胞增强因子)家族转录因子在骨骼肌生长发育过程中起着决定性的调控作用。猪mef2a基因是MEF2家族的一员，通过介导MRFs(肌肉调节因子)家族蛋白结合在肌肉特异性基因调控序列中富含A/T的保守区，促进肌肉特异性基因的表达。这些肌肉特异性基因的表达产物对于肌肉组织的分化、维持和再生等有重要作用。

摘要： 根据GenBank上登录的苹果(L24497、X65494)、白桦(Y07779)、莴苣(D14001)、大豆(AF303941)和人参(AB236868)等植物的1,5-二磷酸核酮糖羧化酶/加氧酶(RuBisCO)的小亚基rbcS基因氨基酸的高度保守序列,设计一对简并引物,进行RT-PCR.250bp的PCR产物经测序分析及氨基酸序列同源性比对,表明克隆的序列为砂梨rbcS基因的cDNA片段.根据该序列信息,采用RACE (rapid amplification of eDNA ends)的方法扩增其5 ′上游未知区和3′下游未知区.5 ′ RACE得到的cDNA长度约530bp,3′RACE得到的长度约430bp.三段序列拼接后,eDNA全长为840bp,该序列包括一个549bp的开放阅读框、41bp5 ′非编码区和251bp 3 ′非编码区,推测其编码一个由183个氨基酸组成的蛋白.砂梨PprbcS与其他植物的rbcS蛋白同源性分别为:苹果MarbcS (X65494)98.36％、蔷薇科杂交种MdrbcS(L24497) 95.08％、白桦BprbcS(Y07779)83.70％、人参PgrbcS(AB236868)80％、大豆GmrbcS(AF303941)77.60％、莴苣LsrbcS(D14001)67.57％.据此可推断所克隆的序列为砂梨RuBisCO的小亚基cDNA序列.

摘要： 根据GenBank上登录的苹果(L24497、X65494)、白桦(Y07779)、莴苣(D14001)、大豆(AF303941)和人参(AB236868)等植物的1,5-二磷酸核酮糖羧化酶/加氧酶(RuBisCO)的小亚基rbcS基因氨基酸的高度保守序列,设计一对简并引物,进行RT-PCR.250bp的PCR产物经测序分析及氨基酸序列同源性比对,表明克隆的序列为砂梨rbcS基因的cDNA片段.根据该序列信息,采用RACE (rapid amplification of eDNA ends)的方法扩增其5 ′上游未知区和3′下游未知区.5 ′ RACE得到的cDNA长度约530bp,3′RACE得到的长度约430bp.三段序列拼接后,eDNA全长为840bp,该序列包括一个549bp的开放阅读框、41bp5 ′非编码区和251bp 3 ′非编码区,推测其编码一个由183个氨基酸组成的蛋白.砂梨PprbcS与其他植物的rbcS蛋白同源性分别为:苹果MarbcS (X65494)98.36％、蔷薇科杂交种MdrbcS(L24497) 95.08％、白桦BprbcS(Y07779)83.70％、人参PgrbcS(AB236868)80％、大豆GmrbcS(AF303941)77.60％、莴苣LsrbcS(D14001)67.57％.据此可推断所克隆的序列为砂梨RuBisCO的小亚基cDNA序列.

摘要： 根据GenBank上登录的苹果(L24497、X65494)、白桦(Y07779)、莴苣(D14001)、大豆(AF303941)和人参(AB236868)等植物的1,5-二磷酸核酮糖羧化酶/加氧酶(RuBisCO)的小亚基rbcS基因氨基酸的高度保守序列,设计一对简并引物,进行RT-PCR.250bp的PCR产物经测序分析及氨基酸序列同源性比对,表明克隆的序列为砂梨rbcS基因的cDNA片段.根据该序列信息,采用RACE (rapid amplification of eDNA ends)的方法扩增其5 ′上游未知区和3′下游未知区.5 ′ RACE得到的cDNA长度约530bp,3′RACE得到的长度约430bp.三段序列拼接后,eDNA全长为840bp,该序列包括一个549bp的开放阅读框、41bp5 ′非编码区和251bp 3 ′非编码区,推测其编码一个由183个氨基酸组成的蛋白.砂梨PprbcS与其他植物的rbcS蛋白同源性分别为:苹果MarbcS (X65494)98.36％、蔷薇科杂交种MdrbcS(L24497) 95.08％、白桦BprbcS(Y07779)83.70％、人参PgrbcS(AB236868)80％、大豆GmrbcS(AF303941)77.60％、莴苣LsrbcS(D14001)67.57％.据此可推断所克隆的序列为砂梨RuBisCO的小亚基cDNA序列.

摘要： 根据三角帆蚌消减杂交cDNA文库获得的EST序列，运用cDNA末端快速扩增(rapidamplification of cDNA ends，RACE)的方法获得三角帆蚌细胞色素P450(cytochrome P450，CYP)基因的全长cDNA。生物信息学方法分析三角帆蚌CYP基因cDNA序列的结构特征表明。所得CYP基因cDNA全长为1 978 bp，包含5’端非编码区194 bp，3’端非编码区251 bp，开放阅读框1 533 bp，可编码510个氨基酸，预测该蛋白分子量为58 kDa。半定量RT-PCR法分析该基因在7种组织中的表达差异，CYP450在三角帆蚌的肝脏、胃和肠中的表达高，其次是心脏、鳃和斧足，在外套膜中表达最低。

摘要： 根据三角帆蚌消减杂交cDNA文库获得的EST序列，运用cDNA末端快速扩增(rapidamplification of cDNA ends，RACE)的方法获得三角帆蚌细胞色素P450(cytochrome P450，CYP)基因的全长cDNA。生物信息学方法分析三角帆蚌CYP基因cDNA序列的结构特征表明。所得CYP基因cDNA全长为1 978 bp，包含5’端非编码区194 bp，3’端非编码区251 bp，开放阅读框1 533 bp，可编码510个氨基酸，预测该蛋白分子量为58 kDa。半定量RT-PCR法分析该基因在7种组织中的表达差异，CYP450在三角帆蚌的肝脏、胃和肠中的表达高，其次是心脏、鳃和斧足，在外套膜中表达最低。

摘要： 根据三角帆蚌消减杂交cDNA文库获得的EST序列，运用cDNA末端快速扩增(rapidamplification of cDNA ends，RACE)的方法获得三角帆蚌细胞色素P450(cytochrome P450，CYP)基因的全长cDNA。生物信息学方法分析三角帆蚌CYP基因cDNA序列的结构特征表明。所得CYP基因cDNA全长为1 978 bp，包含5’端非编码区194 bp，3’端非编码区251 bp，开放阅读框1 533 bp，可编码510个氨基酸，预测该蛋白分子量为58 kDa。半定量RT-PCR法分析该基因在7种组织中的表达差异，CYP450在三角帆蚌的肝脏、胃和肠中的表达高，其次是心脏、鳃和斧足，在外套膜中表达最低。

摘要： 根据三角帆蚌消减杂交cDNA文库获得的EST序列，运用cDNA末端快速扩增(rapidamplification of cDNA ends，RACE)的方法获得三角帆蚌细胞色素P450(cytochrome P450，CYP)基因的全长cDNA。生物信息学方法分析三角帆蚌CYP基因cDNA序列的结构特征表明。所得CYP基因cDNA全长为1 978 bp，包含5’端非编码区194 bp，3’端非编码区251 bp，开放阅读框1 533 bp，可编码510个氨基酸，预测该蛋白分子量为58 kDa。半定量RT-PCR法分析该基因在7种组织中的表达差异，CYP450在三角帆蚌的肝脏、胃和肠中的表达高，其次是心脏、鳃和斧足，在外套膜中表达最低。

摘要： 本发明公开了一种具有抗肿瘤活性的海蚯蚓蛋白酶的cDNA序列及其氨基酸序列，属于医药生物工程领域。根据本发明的海蚯蚓蛋白酶的cDNA序列，可以从海蚯蚓的消化道组织中克隆该蛋白酶的编码基因。该编码基因通过基因重组技术，可以在原核表达系统中获得表达。本发明的重组海蚯蚓蛋白酶能够明显抑制肿瘤细胞增殖，具有研究开发前景。

摘要： 本发明公开了一种编码海蚯蚓纤溶酶的cDNA序列及其氨基酸序列，分别如序列表中SEQIDNo.1和SEQIDNo.2所示，属于医药生物工程领域。本发明的有益效果是：根据本发明的海蚯蚓纤溶酶的cDNA序列，可以从海蚯蚓的消化道组织中克隆该纤溶酶的编码基因。该编码基因通过基因重组技术，可以在原核表达系统或真核表达系统中获得表达。重组海蚯蚓纤溶酶具有纤维蛋白酶原激活活性，可作为新的基因工程溶栓药物。

摘要： 本发明提供一种蝴蝶兰

摘要： 以单环刺螠总RNA为模板，克隆得到了单环刺螠纤维蛋白溶解酶基因全长cDNA序列，该序列的开放阅读框(ORF)共792个碱基，起始于起始密码子ATG，终止于终止密码子TAA。由该纤维蛋白溶解酶基因的cDNA原始编码序列，翻译得到单环刺螠纤维蛋白溶解酶的氨基酸序列，该氨基酸序列共263个氨基酸。单环刺螠纤维蛋白溶解酶基因的cDNA序列，可以通过构建不同的重组质粒载体，构建如大肠杆菌或酵母菌等不同受体的纤维蛋白溶解酶基因工程菌，使之在基因工程菌中进行表达，从而制备纤维蛋白溶解酶。制备的纤维蛋白溶解酶可应用于制备治疗心脑血管疾病的抗凝血药物或溶解血栓药物，具有很好的研究开发前景。

摘要： 本发明公开了一类从沙生植物胡杨(Populus euphratica)中所分离、克隆的与抗逆性紧密相关的DREB转录因子cDNA序列(PeDREB2a基因)，本发明还公开了含有该cDNA序列的高效植物表达载体，以及它们在提高植物抗逆性中的应用。本发明将PeDREB2a基因构建到植物高效表达载体p2MDK-PeDREB2a中，利用农杆菌介导转化烟草，通过Kan抗性、基因组PCR及RT-PCR筛选鉴定阳性苗，对转基因烟草苗进行干旱、高盐及低温等抗逆性分析并且对其相关生理生化指标进行测定。试验结果表明，转PeDREB2a基因植株的可溶性糖、胞质总蛋白和脯氨酸含量明显高于对照，说明过表达PeDREB2a基因可显著提高转基因烟草的抗旱性和渗透胁迫抗性。

摘要： 本发明涉及一种编码裙带菜ζ‑胡萝卜素脱氢酶的cDNA序列及其氨基酸序列与应用。裙带菜ζ‑胡萝卜素脱氢酶基因的全长cDNA序列通过快速扩增cDNA末端途径从裙带菜中分离得到并命名为UPZDS，全长cDNA序列为2804bp，含有1821bp的开放阅读框ORF，编码606个氨基酸，其分子量为65.82717kDa。该裙带菜ζ‑胡萝卜素脱氢酶(ZDS)基因的克隆为研究岩藻黄素在褐藻中的生物合成途径奠定了基础，对于褐藻中类胡萝卜素的医药保健以及工业化生产具有重要意义。

摘要： 本发明公开了一种具有抗肿瘤活性的海蚯蚓蛋白酶的cDNA序列及其氨基酸序列，属于医药生物工程领域。根据本发明的海蚯蚓蛋白酶的cDNA序列，可以从海蚯蚓的消化道组织中克隆该蛋白酶的编码基因。该编码基因通过基因重组技术，可以在原核表达系统中获得表达。本发明的重组海蚯蚓蛋白酶能够明显抑制肿瘤细胞增殖，具有研究开发前景。

摘要： 本发明公开了一种编码海蚯蚓纤溶酶的cDNA序列及其氨基酸序列，分别如序列表中SEQIDNo.1和SEQIDNo.2所示，属于医药生物工程领域。本发明的有益效果是：根据本发明的海蚯蚓纤溶酶的cDNA序列，可以从海蚯蚓的消化道组织中克隆该纤溶酶的编码基因。该编码基因通过基因重组技术，可以在原核表达系统或真核表达系统中获得表达。重组海蚯蚓纤溶酶具有纤维蛋白酶原激活活性，可作为新的基因工程溶栓药物。

摘要： 本发明提供一种蝴蝶兰

摘要： 以单环刺螠总RNA为模板，克隆得到了单环刺螠纤维蛋白溶解酶基因全长cDNA序列，该序列的开放阅读框(ORF)共792个碱基，起始于起始密码子ATG，终止于终止密码子TAA。由该纤维蛋白溶解酶基因的cDNA原始编码序列，翻译得到单环刺螠纤维蛋白溶解酶的氨基酸序列，该氨基酸序列共263个氨基酸。单环刺螠纤维蛋白溶解酶基因的cDNA序列，可以通过构建不同的重组质粒载体，构建如大肠杆菌或酵母菌等不同受体的纤维蛋白溶解酶基因工程菌，使之在基因工程菌中进行表达，从而制备纤维蛋白溶解酶。制备的纤维蛋白溶解酶可应用于制备治疗心脑血管疾病的抗凝血药物或溶解血栓药物，具有很好的研究开发前景。