致病基因

摘要： 肥厚型心肌病(hypertrophic cardiomyopathy,HCM)是一种以左心室肥厚为突出特征的常染色体显性遗传病,其发病率为1/500~1/200。目前已发现超过30个基因的1500种突变与该疾病的发生发展相关,致病基因变异连同修饰基因多态性、环境因素等影响因素发挥作用,使得疾病表型极具异质性,临床表现上从无任何症状到心源性猝死均可发生,病理表型主要包括心肌细胞肥大、排列紊乱及纤维化、心肌缺血等。近年来,许多研究致力于探究HCM基因型对表型的影响,并基于遗传背景对HCM的治疗方法进行研发。本文以HCM基因型–表型的关联为重点,从HCM的致病基因、关联影响因素和最新治疗手段等多方面综述了HCM的研究进展,以期为研究HCM的发生发展及治疗方向提供遗传学方面的思路。

摘要： 罕见病是一大类特殊病症的总称,绝大多数罕见病都是遗传病,具有发病早、病情重、预后差等临床特征,给家庭和社会带来巨大负担。以个人基因组为基础的精准医学策略是研究罕见病的有效手段,近年来在疾病遗传机制、临床分型和治疗手段上不断突破,成效斐然。在为既往所取得进步鼓舞的同时,罕见病精准医疗存在的问题亦不容忽视:超过40%罕见病尚未发现致病基因;很多疾病基因型和临床表型关系不明;超过90%的罕见病缺少靶向药物等。本研究重点讨论罕见病精准医疗的现状和挑战,呼吁采取更多行动,响应“生命至上”国策,携起手来形成合力,加强罕见病基础研究,加快罕见病药物研发,为罕见病患者和家庭带来更多温暖和希望。

摘要： 目前已发现与非综合征型聋相关的致病基因有120余个(http://hereditaryhearingloss.org),其中群体凝血因子C同源物(coagulation factor C homology,COCH)基因是首个被报道伴有前庭功能障碍的常染色体显性遗传性非综合征型聋,即DFNA9(deafness autosomal dominant 9)型聋致病基因。迄今为止文献共报道了27个与DFNA9相关的COCH基因突变致病位点,并发现其突变位点与听力和前庭表型密切相关[1~4]。

摘要： 目的:通过对南京市江宁区两个汉族家族性扩张型心肌病(DCM)家系进行致病基因筛查,探讨家族性DCM的致病基因突变位点,并分析基因型与临床表型的关系。方法:对入选的2个患有家族性DCM的汉族家系的先证者及家系成员进行询问病史、家族史,并进行体格检查、常规心电图、超声心动图检查及3.0T心脏磁共振。同时为先证者及每个家系成员抽取5mL外周血,应用芯片捕获测序技术进行全基因组二代测序检测基因的突变情况,初步确定突变位点,对高通量测序中出现的疑似致病位点,均通过一代测序验证以最终确定突变位点。并对先证者及家系成员进行定期门诊和电话随访。另选取性别、年龄、种族与上述家系成员相匹配的健康人群120名作为对照。结果:其中一个家系(家系1)的先证者携带SCN5A-E6、TTN-E54、TTN-E43、TTN-E275两种基因的四种变异,3种预测软件预测这4种突变均为有害突变,而其弟弟、弟弟的儿子及孙女则均携带SCN5A-E6基因变异,且先证者及弟弟、弟弟的儿子均存在不同程度的心律失常;另一个家系(家系2)的先证者携带TTN-E288、DSP-E2两种基因的变异,3种预测软件预测这2种突变均为有害突变,而其父亲和儿子均携带TTN-E288基因的变异。两个家系的其余家系成员及120例健康对照人群均未检出上述基因变异位点。结论:两个家系中发现的基因突变位点目前国内外尚未有相关报道,其可能与我国汉族家族性DCM发病有关,且携带同一种致病基因的患者可能呈现相似的临床表型,携带多致病基因的患者临床症状较重,但其确切发病机制仍需进一步研究。

摘要： 家族性渗出性玻璃体视网膜病变(FEVR)是一种严重的临床和遗传异质性视网膜疾病,以周边视网膜血管发育异常为特征。FEVR的临床表型较多,典型的特征是视网膜皱褶;FEVR的遗传方式也较多,具有很高的遗传异质性,包含常染色体隐性遗传,X染色体隐性遗传,常染色体显性遗传以及其他的散在遗传方式。迄今为止已经证实9个FEVR致病基因:NDP、FZD4、LRP5、CTNNA1、TSPAN12、ZNF408、KIF11、CTNNB1、JAG1基因。这些基因主要参与Wnt、Notch和Norrin-β-catenin等信号通路。本文从上述9个FEVR致病基因及其信号通路等方面进行综述。

摘要： 通过分析基因突变过程,提出利用强化学习对癌症患者由正常状态至患病状态的过程进行推断,发现导致患者死亡的关键基因突变.首先,将基因视为智能体,基于乳腺癌突变数据设计多智能体强化学习环境;其次,为保证智能体探索到与专家策略相同的策略和满足更多智能体快速学习,根据演示学习理论,分别提出两种多智能体深度Q网络:基于行为克隆的多智能体深度Q网络和基于预训练记忆的多智能体深度Q网络;最后,根据训练得到的多智能体深度Q网络进行基因排序,实现致病基因预测.实验结果表明,提出的多智能体强化学习方法能够挖掘出与乳腺癌发生、发展过程密切相关的致病基因.

摘要： 近日,北大-清华生命科学联合中心、北京大学尹玉新教授团队和山东第一医科大学附属省立医院宋勇峰教授团队合作,在《Cell》子刊《Cell Metabolism》上发表了一篇研究,揭示了去泛素化酶OTUD3感知葡萄糖和脂肪酸等代谢信号,调控能量代谢的机制,由此为肥胖和糖尿病发病机理研究提供了方向性指导,也为制定有效预防和治疗糖尿病的措施提供了理论依据。

摘要： 血友病是一类以出血表现为主的罕见遗传病,遗传方式为X连锁隐性遗传,其致病基因位于X染色体上,由于女性拥有两条X性染色体,而男性为一条X染色体和一条Y染色体,所以杂合子(一条X染色体上的基因异常,另一条X染色体上的基因正常)的女性通常不患病,为携带者;只有当女性为纯合子(两条X染色体上基因均异常)时才患病,而半合子(X染色体上基因异常)的男性即可患病。

摘要： 牙本质发育不良Ⅰ型(DD-Ⅰ)是一种罕见的遗传性牙本质形成障碍疾病,乳恒牙均可受累。该病在临床上表现为牙冠外形色泽正常,牙齿松动明显,可伴有自发性牙槽脓肿或囊肿等。影像学检查则可见牙髓腔消失或呈“新月形”牙髓残余,根短钝或无牙根等表现。关于DD-Ⅰ的发病机制已为大多数学者所研究,其临床治疗通常具有挑战性,本文对近年来DD-Ⅰ的临床分型及表现、致病基因、组织学特点、治疗相关研究进行综述,以期为临床诊治该病提供一定的指导。

摘要： 【目的】为明确江西不同生态地区稻瘟病自然病圃菌群的无毒基因与致病基因分布以及遗传结构。【方法】利用已克隆的8个稻瘟病菌无毒基因与8个致病基因特异性引物对来源于江西5个不同地区稻瘟病自然病圃的189个单孢菌株的基因组DNA进行PCR扩增检测,计算检测基因在不同地区菌株中的分布频率,并根据扩增结果进行聚类,分析稻瘟病菌群体遗传结构。【结果】8个无毒基因Avr-pia、Avr-pizt、ACE1、Avr-pit、Avr-pita、Avr-co39、Avr-pik、PRE1在江西5个稻瘟病自然病圃稻瘟病菌的检测频率存在较大差异,其中都昌菌株中Avr-pik检测频率最高,井冈山、丰城、万安菌株中Avr-pizt检测频率均最高,婺源菌株中Avr-pik、Avr-co39、PRE1检测频率最高均为100%,而Avr-pit在所有地区菌株中检出频率都是最低。8个致病基因MNH1、MgATG5、MPG1、MgYCA1、MgS11、MagB、MPS1、CPKA在江西5个地区稻瘟病自然病圃菌株中只检测到7个,MNH1未检测到,且存在较大的分布差异。MPG1在5个地区病圃稻瘟病菌的检测频率均为最高在90%以上。此外,江西5个稻瘟病病圃菌株被划分为11个遗传宗谱,3个优势宗谱JX1、JX2、JX3占总菌株数的75.66%,其他8个小宗谱或稀有宗谱只占总菌株数的24.34%。【结论】对不同地区稻瘟病菌致病基因和无毒基因动态监测,是指导当地水稻抗瘟品种合理布局与防控稻瘟病流行的有效手段。

摘要： 帕金森病(Parkinson's disease,PD)是中老年最常见的运动障碍性疾病,其发病原因和发病机制至今仍未完全明了.众多研究表明,其发病可能与环境、遗传、神经系统老化等多因素相关.近些年来,PD相关基因学研究已成为国内外热点,并取得了重要进展,研究显示有二十多种基因与PD发病有关,这为进一步明确PD病因及发病机制进而更好的治疗PD带来了希望.本文就现阶段已发现的帕金森病部分相关致病基因的研究进展做一综述.

摘要： 报道儿童Simpson-Golabi-Behmel综合征1例,收集患儿临床信息,总结其临床特征.采集患儿及其姐姐,父母的静脉血进行二代测序分析,确定致病基因及遗传方式..

摘要： Aicardi-Goutieres综合征是一种罕见的幼年发病的以进行性脑病、冻疮样皮疹、基底节区钙化及脑脊液中IFN-α升高为临床表现的综合征.报道一例以皮疹起病Aicardi—Goutieres综合征(AGS)患儿的临床特点,并检测其致病基因.报道一例AGS患儿的临床资料，并采用DNA测序对致病基因行突变检测。

摘要： 目的：明确岭南地区一汉族遗传性易栓症家系的分子学诊断. 方法：采集该家系中3人血液(2名患者,1名正常人)进行凝血功能、PC活性、PS活性、AT-Ⅲ活性、HC-Ⅱ浓度等检测,并进行全基因组测序,试图寻找其发病的分子遗传学位点. 结果：结合家系图谱和所有检查结果分析,此遗传性易栓症家系属于常染色体显性遗传;根据金基因测序结果,找出3个与此病有关的突变基因,即①FⅡ(c.C1504T:p.R502W、c.C1573T:p.R525W、c.C1621T:p.R541W)、②MASP1(c.C1609G:p.H537D)的点突变,可能通过激活凝血酶原,加速凝血过程而导致血栓形成;此家系患者病情反复,使用华法林效果欠佳,可能与③CALU(c.383-387del:p.N128fs、c.386-390del:p.N129fs、c.839-843del:p.N280fs、c.617-621del:p.N206fs、c.863-867del:p.N288fs)的移码删除突变有关. 结论：通过全基因测序结果,寻找出此家系可能的致病基因为FⅡ、MASP1,此家系使用华法林效果欠佳可能与CALU基因突变有关.

摘要： 目的：探索一个先天性白内障家系的致病基因和致病突变.方法：收集家系内患者的临床资料,采集家系内患者及正常人对照的外周血并提取基因组DNA,PCR扩增常见的CRYAA、CRYAB、CRYGD、CRYGC、CRYBB2、CJA8共6个基因,用Sanger双向测序和BLAST比对进行突变分析.结果：PCR扩增的先证者基因中检测到3个已知的单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphisms,SNP),并未发现致病突变.结论：排除这6个基因为该家系的致病原因,有待通过外显子组测序等更先进的方法筛选致病基因.

摘要： 探讨常规超声及超声造影对乳腺癌患者前哨淋巴结的诊断价值及与乳腺癌组织HER-2基因表达关系的相关性.以本院住院手术的50例女性乳腺癌病人为研究对象,术前对乳腺病灶及腋下淋巴结进行常规超声检查并进行超声造影,记录前哨腋窝淋巴结的皮质最大厚度、长短径之比、皮髓质之比和淋巴结血流特征及造影的增强模式,观察手术切除的前哨淋巴结病理组织学特征及乳腺癌组织ER、PR及HER-2基因表达.结果表明：HER-2是乳腺癌腋窝淋巴结转移的危险因素。乳腺癌腋窝前哨淋巴结声像图表现联合超声造影及免疫组织化学评价腋窝前哨淋巴结转移,对乳腺癌的临床诊疗方法选择具有重要价值。

摘要： 探讨常规超声及超声造影对乳腺癌患者前哨淋巴结的诊断价值及与乳腺癌组织HER-2基因表达关系的相关性.以本院住院手术的50例女性乳腺癌病人为研究对象,术前对乳腺病灶及腋下淋巴结进行常规超声检查并进行超声造影,记录前哨腋窝淋巴结的皮质最大厚度、长短径之比、皮髓质之比和淋巴结血流特征及造影的增强模式,观察手术切除的前哨淋巴结病理组织学特征及乳腺癌组织ER、PR及HER-2基因表达.结果表明：HER-2是乳腺癌腋窝淋巴结转移的危险因素。乳腺癌腋窝前哨淋巴结声像图表现联合超声造影及免疫组织化学评价腋窝前哨淋巴结转移,对乳腺癌的临床诊疗方法选择具有重要价值。

摘要： 探讨常规超声及超声造影对乳腺癌患者前哨淋巴结的诊断价值及与乳腺癌组织HER-2基因表达关系的相关性.以本院住院手术的50例女性乳腺癌病人为研究对象,术前对乳腺病灶及腋下淋巴结进行常规超声检查并进行超声造影,记录前哨腋窝淋巴结的皮质最大厚度、长短径之比、皮髓质之比和淋巴结血流特征及造影的增强模式,观察手术切除的前哨淋巴结病理组织学特征及乳腺癌组织ER、PR及HER-2基因表达.结果表明：HER-2是乳腺癌腋窝淋巴结转移的危险因素。乳腺癌腋窝前哨淋巴结声像图表现联合超声造影及免疫组织化学评价腋窝前哨淋巴结转移,对乳腺癌的临床诊疗方法选择具有重要价值。

摘要： 探讨常规超声及超声造影对乳腺癌患者前哨淋巴结的诊断价值及与乳腺癌组织HER-2基因表达关系的相关性.以本院住院手术的50例女性乳腺癌病人为研究对象,术前对乳腺病灶及腋下淋巴结进行常规超声检查并进行超声造影,记录前哨腋窝淋巴结的皮质最大厚度、长短径之比、皮髓质之比和淋巴结血流特征及造影的增强模式,观察手术切除的前哨淋巴结病理组织学特征及乳腺癌组织ER、PR及HER-2基因表达.结果表明：HER-2是乳腺癌腋窝淋巴结转移的危险因素。乳腺癌腋窝前哨淋巴结声像图表现联合超声造影及免疫组织化学评价腋窝前哨淋巴结转移,对乳腺癌的临床诊疗方法选择具有重要价值。

摘要： 探讨常规超声及超声造影对乳腺癌患者前哨淋巴结的诊断价值及与乳腺癌组织HER-2基因表达关系的相关性.以本院住院手术的50例女性乳腺癌病人为研究对象,术前对乳腺病灶及腋下淋巴结进行常规超声检查并进行超声造影,记录前哨腋窝淋巴结的皮质最大厚度、长短径之比、皮髓质之比和淋巴结血流特征及造影的增强模式,观察手术切除的前哨淋巴结病理组织学特征及乳腺癌组织ER、PR及HER-2基因表达.结果表明：HER-2是乳腺癌腋窝淋巴结转移的危险因素。乳腺癌腋窝前哨淋巴结声像图表现联合超声造影及免疫组织化学评价腋窝前哨淋巴结转移,对乳腺癌的临床诊疗方法选择具有重要价值。

摘要： 本发明公开了一种基于宏基因组的临床重要致病菌毒力基因检测的方法和系统。该方法包括：S10，建立临床致病菌毒力基因数据库；S20，获取临床样本宏基因组测序原始数据，对其预处理获得目标数据；S30，利用预设宏基因组测序数据多重比对注释系统分析目标数据，鉴定毒力基因；S40，建立重要毒力基因‑毒力因子‑表征(功能/临床表型)关联数据库；S50，利用预设临床自动化报告系统，基于毒力基因鉴定结果和关联数据库，生成毒力基因鉴定报告。该系统能够对不同类型(脑脊液等)的临床感染样本的宏基因组测序数据进行毒力基因鉴定，一次性鉴定样本中多种病原菌的多个重要毒力基因，具有较好的灵敏性和准确性，帮助医生及时进行诊断、治疗和预后。

摘要： 本发明公开了一种奶牛乳房炎致病菌三联表位基因与石斑鱼c型溶菌酶基因重组腺病毒的构建方法和应用。试验中选取奶牛乳房炎主要致病菌特异性蛋白，通过ABCpred方案与BepiPred方案预测获得每种蛋白的2个B细胞优势表位将所得优势表位进行连接获得TRE序列，GeneBank上得到cLYZ序列并进行哺乳动物细胞偏好性密码子优化。在TRE序列与cLYZ序列之间插入高剪切效率的Thoseaasigna virus 2A(T2A)自剪切肽，合成后得到含有目的基因片段的pMD‑19T载体。将TRE基因、T2A基因、cLYZ基因亚克隆到穿梭载体pDC315‑MCS‑EGFP上；利用LipoFiterTM脂质体转染法将重组穿梭载体与腺病毒大骨架pBHGlox(delta)E1,3cre共转染HEK293细胞，实现同源重组，获得重组腺病毒Ad‑TRE‑T2A‑cLYZ‑EGFP。

摘要： 本申请涉及可以检测24种肺炎致病菌耐药基因的基因芯片。这24种肺炎致病菌耐药基因来自氨基糖苷类、喹诺酮类、超广谱β内酰胺酶类(ESBLs)、头孢菌素类(AmpC)、碳青霉烯类、耐万古霉素、耐甲氧西林和导致膜通透性改变的基因，与临床关系最为密切。该基因芯片是通过反复设计和筛选，最终将灵敏度好，特异度高的探针固定在芯片上，不需要进行临床培养和药敏试验，操作简单快捷，在很大程度上为抗生素的合理使用争取了宝贵的时间，值得临床推广应用。

摘要： 本发明公开了一种稻瘟病菌的致病因子或编码所述致病因子的基因的应用。本发明通过基因敲除的方法获得了稻瘟病菌铁硫蛋白亚基MoRIP1的敲除突变体，揭示了稻瘟病菌铁硫蛋白亚基MoRIP1在稻瘟病菌菌丝生长产孢和致病中的重要生物学功能。本发明发现MoRIP1是一个新的潜在的药物靶点，为开发以线粒体复合体III为作用靶标的新型杀菌剂提供理论基础和重要参考。

摘要： 本发明公开了利用目标基因测序检测TRPC6基因致病突变的方法，应用二代测序技术对表现原发性肾病综合征的患儿进行TRPC6基因的基因测序，并进行相关的生物信息学分析。设计TRPC6的13个外显子区域特异性捕获探针，与基因组DNA文库进行杂交，将目标基因组区域的DNA片段进行富集后，再利用illumina Nextseq第二代测序仪进行测序，并与正常壮族儿童进行对比，通过数据分析确定突变位点。经过数据分析，发现2号外显子上的c.172C>T(p.R58W)杂合突变，可导致相关蛋白表达和功能异常，考虑为中国广西壮族儿童致病突变。

摘要： 本发明公开了一种基于宏基因组的临床重要致病菌毒力基因检测的方法和系统。该方法包括：S10，建立临床致病菌毒力基因数据库；S20，获取临床样本宏基因组测序原始数据，对其预处理获得目标数据；S30，利用预设宏基因组测序数据多重比对注释系统分析目标数据，鉴定毒力基因；S40，建立重要毒力基因‑毒力因子‑表征(功能/临床表型)关联数据库；S50，利用预设临床自动化报告系统，基于毒力基因鉴定结果和关联数据库，生成毒力基因鉴定报告。该系统能够对不同类型(脑脊液等)的临床感染样本的宏基因组测序数据进行毒力基因鉴定，一次性鉴定样本中多种病原菌的多个重要毒力基因，具有较好的灵敏性和准确性，帮助医生及时进行诊断、治疗和预后。

摘要： 一种自闭症的致病基因、易感基因和可能相关基因变异检测试剂盒，其特征在于，包括以下部分：RNA探针组，引物，封闭缓冲液，RNA酶封闭液，杂交缓冲液，结合缓冲液，1倍浓度的SSC的漂洗液，0.1倍浓度的SSC的漂洗液，PCR反应液和TE缓冲液；所述的RNA探针组包括282条RNA探针，所述的RNA探针序列如Seq ID No1～Seq ID No282。本发明提供的一种用于检测自闭症的致病基因、易感基因和可能相关基因的试剂盒，可同时检测6个疾病相关的致病/易感基因，可以为自闭症患病个体进行分子遗传学诊断，也可以对自闭症患者的父母亲再生育时进行新生儿的自闭症患病风险评估。

摘要： 本发明涉及一种单基因隐性遗传疾病候选致病基因的筛选装置，该装置包括：家系信息分析模块、变异信息获取模块、变异信息比对模块、遗传模式判定模块、候选位点注释模块及结果筛选模块。

摘要： 一种自闭症的致病基因、易感基因和可能相关基因变异检测试剂盒，其特征在于，包括以下部分：RNA探针组，引物，封闭缓冲液，RNA酶封闭液，杂交缓冲液，结合缓冲液，1倍浓度的SSC的漂洗液，0.1倍浓度的SSC的漂洗液，PCR反应液和TE缓冲液；所述的RNA探针组包括282条RNA探针，所述的RNA探针序列如Seq ID No1～Seq ID No282。本发明提供的一种用于检测自闭症的致病基因、易感基因和可能相关基因的试剂盒，可同时检测6个疾病相关的致病/易感基因，可以为自闭症患病个体进行分子遗传学诊断，也可以对自闭症患者的父母亲再生育时进行新生儿的自闭症患病风险评估。

摘要： 本发明公开一种在人类细胞中具有高活性的FnCpf1突变体构成的eaFnCpf1基因编辑工具及其制备方法以及用于修复X连锁先天性视网膜劈裂症致病基因的方法，其特点是利用人类细胞进行体外定向进化筛选获得具有高活性的FnCpf1突变体Q125R，其表达载体为Addgene plasmids#69976；切割目标DNA的向导为crRNA，其表达载体pJET‑U6‑crRNAs；基因编辑用报告细胞系为293‑SC1和293‑RS1；mRS1基因同源重组修复模板为合成单链脱氧核糖核苷酸。该高活性FnCpf1突变体的获得包括建立FnCpf1突变体库、筛选具有高编辑活性低脱靶特点的突变体eaFnCpf1和利用eaFnCpf1对内源性基因进行编辑。该高活性突变体eaFnCpf1不仅具有较高的编辑活性，而且其可以识别更广范围的PAM，使得其在一定程度上丰富了基因编辑工具的“技能”，有助于扩大基因编辑在生物医学领域的应用。