筛选鉴定

摘要： 以健康德州驴肠道内容物为样品,筛选驴源乳酸细菌.经形态学观察、分子生物学手段对菌种进行鉴定,并对筛选菌种的安全性能、生长特性、产酸性能、产酶性能、耐受性能及抑菌特性等进行初步研究.结果显示,本研究成功分离获得一株驴源乳酸细菌,经鉴定为屎肠球菌,编号HR-03;安全性试验表明,屎肠球菌HR-03不产生溶血圈,无潜在致病性;该菌株还表现出良好的耐酸和耐胆盐性能,且能够抑制致病性大肠杆菌生长.结果提示,屎肠球菌HR-03具有优良的生物学特性,可作为后续开发驴源益生菌制剂的候选菌种.

摘要： 目的:霉菌是常见的有害菌,常引起食品腐败和一些农业疾病,极不利于农产品储存。方法:本文以黑曲霉为病原菌,从深海中取海泥为样品,利用平板对峙法从中筛选出一株抗黑曲霉效果最明显的菌株。结果:经形态学、生理生化、16S rDNA测序鉴定,该菌为贝莱斯芽孢杆菌(Bacillus velezensis)。对其生长曲线进行测定,发现该菌株的生存能力较强,很难进入衰亡期。随后利用毛霉、青霉、根霉、曲霉、大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、棉花枯萎病、稻瘟病、玉米腐烂病为病原指示菌对其进行了广谱抑菌性研究,根据结果推断该菌对革兰氏阴性菌与霉菌有着显著抑制作用。并且研究发现该菌产抑菌物质部位在胞外,在工业生产与应用时可直接利用其发酵液进行防治节约成本。

摘要： 从台山惰性拆建物料处置区海域沉积物中筛选分离出一株六价铬Cr(VI)抗性菌株Y1,经形态、生理生化分析及16S rRNA序列比对研究,鉴定该菌株为芽孢杆菌属;该菌株的最佳生长温度为35°C,最佳生长pH为7.5;在Cr(VI)初始质量浓度为25 mg/L时,该菌株的去除效果最佳,对Cr(VI)的去除效率可达88.0%。对反应过程中的pH、温度、盐度以及Cr(VI)初始质量浓度进行调节,对于改善Cr(Ⅵ)抗性菌株去除Cr(Ⅵ)污染效果具有重要意义。

摘要： 为获得产β-甘露聚糖酶菌株,取常年种植魔芋的土壤,通过富集培养与筛选鉴定获得目标菌株,并对其产酶条件进行优化。结果表明,分离到6株可以降解魔芋粉的菌株,其中菌株HKS018产生的降解圈最明显,且酶活最高。对菌株HKS018的16S rDNA基因序列和gyrB基因序列进行扩增,通过序列比对及构建系统发育树,结合形态特征、生理生化特征鉴定菌株HKS018为枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)。其最优发酵条件为:发酵温度30°C、发酵时间48 h、初始pH值为7.0、接种量1.0%、装液量50 mL/250 mL、转速180 r/min。在此优化条件下,β-甘露聚糖酶酶活为68.28 U/mL,比优化前酶活力提高了5.29倍。

摘要： 为了从自然界中筛选获得产木聚糖酶微生物,并分析土壤和山羊消化道内容物中筛选所获得产酶微生物之间的关系,该试验以土壤、山羊瘤胃内容物、肠道内容物和粪便为样本,使用自制木聚糖作为唯一碳源,筛选产木聚糖酶微生物,并对其进行鉴定,分析其所产木聚糖酶的酶学特性以及不同来源样品产木聚糖酶微生物的关系。结果表明:从土壤、山羊瘤胃内容物和山羊粪便中各筛选出一株产木聚糖酶微生物(T2-2-1,YL3-2-1,YF-2-1),经形态学和分子生物学方法分别将其鉴定为贝莱斯芽孢杆菌(Bacillus velezensis)、高地芽孢杆菌(Bacillus altitudinis)和贝莱斯芽孢杆菌(Bacillus velezensis);构建系统发育树对3株菌进行分析后发现土壤微生物多样性可能影响山羊消化道微生物多样性;酶学特性分析发现,菌株T2-2-1、YL3-2-1和YF-2-1所产木聚糖酶的最适反应条件分别为50°C、pH 5.0,60°C、pH 7.0和60°C、pH 5.0。产木聚糖酶微生物的获取可为新型饲料添加剂和生物饲料的制备提供材料,来自土壤和山羊消化道产木聚糖酶微生物的遗传学分析揭示了环境微生物多样性与动物消化道微生物多样性的相互影响,也为筛菌样品的选择提供理论依据。

摘要： 为了筛选出可作为微生态制剂及用于发酵饲料的优良菌株,试验以蜂蜜及水果酵素为原料,进行菌株的分离鉴定,并对分离出的酵母菌进行抗逆性研究。结果显示:从蜂蜜中分离出7株菌(A、H、I、J、K、L、M),从苹果酵素中分离出2株菌(DM和DS),从葡萄酵素中分离出2株菌(E1和E3),通过细菌形态学及26S rDNA序列鉴定,确定A是假丝酵母,DM、DS是毕赤酵母,E1是假鲁氏接合酵母,E3是鲁氏接合酵母,H、I、J、K、L和M是酿酒酵母。6株酿酒酵母菌中K的产气能力最强,发酵15 h后产气达到满管,其次是I、J和L;在葡萄糖含量为100~500 g·L^(-1)条件下,6株菌均可以生长,其中J的耐糖性最好;当pH值为1~5时,6株菌均可生长,耐低pH性由高到低为J>L>I>H>M>K;H的高温耐受性最好,I、J和L较好,K和M略差;胆盐浓度为0.03%~0.3%时,I、J和M完全耐受且存活率可达100%。本研究为发酵饲料生产提供具备耐高糖、耐低pH、耐高温、耐胆盐等应用潜力的菌株。

摘要： 农作物秸秆是一类重要的生物质能源,其主要成分为纤维素,由于其结构复杂难以被有效降解利用.从寒地黑土腐殖质中筛选出一株具有高效降解纤维素能力的放线菌CPA-3-4.对其进行形态学和分子生物学鉴定,表明其为链霉菌属.通过单因素及响应面法确定了其发酵玉米秸秆的最佳条件,并对发酵前后的玉米秸秆的表面组织结构进行扫描电镜及红外光谱表征.结果显示,当培养基初始pH为7,发酵转速180 r/min,发酵温度28°C,接菌量4%时,重复试验得到玉米秸秆降解率为28.36%.扫描电镜及红外光谱结果均表明放线菌CPA-3-4具有较好的秸秆纤维素降解结果.

摘要： 以洋河中高温大曲为原料,采用热处理平板涂布法分离、纯化出耐高温细菌,通过液体发酵筛选出产香细菌,选择产香效果最佳菌株进行生理生化分析与16SrDNA同源性分析,并对其固体培养条件进行优化。结果表明:从洋河中高温大曲中分离筛选出8株产香细菌,其中编号B4菌株产香最浓郁。经鉴定B4菌株为枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis),其最佳固体培养条件为:小麦培养基水分50%,培养时间6d,培养温度37°C。

摘要： 对17株来自长寿老人粪便的菌株进行酸、胆盐和H_(2)O_(2)耐受性分析,初筛获得5株高耐受性菌株,通过体外抗氧化实验,进一步复筛高抗氧化活性的乳酸菌。研究发现,5株乳酸菌的DPPH清除能力、羟基自由基清除能力、超氧阴离子清除能力和总还原力分别为10.47%~89.73%、22.65%~66.17%、22.22%~88.95%和11.03%~51.86%;相对于其它组分,无细胞提取物具有更强的羟基自由基清除能力,而菌株发酵上清液的显示出更高DPPH自由基、超氧阴离子清除能力和总还原力。XM-LS01与XM-BL01菌株的抗氧化活性高于其它菌株,经形态学、生理生化和16 Sr DNA鉴定,其分别为清酒乳杆菌和动物双歧杆菌。

摘要： 以我国云南、贵州、陕西、湖南4个不同产地的豆豉为材料,分离出30株具有不同纳豆激酶酶活的纳豆菌。经复筛获得4株纳豆激酶活性较高的菌株,分别为N2、G1、S3和H3,其纳豆激酶酶活力分别为1926.41U·mL-1、1791.41U·mL-1、2079.65U·mL-1和1616.28U·mL-1,对上述菌株的温度和pH耐受性进行研究,结果显示,N2和S3菌株对温度、pH具有良好的耐受性。

摘要： 宿主与病原的互作关系是目前生物学研究的焦点之一.在揭示包括人类病原微生物侵染宿主的过程及其机制中,哺乳动物宿主模型仍然是最主要的研究手段.但哺乳动物宿主模型也具有花费高、不易操作、存在众多复杂影响因素等局限性.在本研究中，借助解淀粉芽孢杆菌FZB42菌株全基因组测序完成并己成功构建其全基因组的随机突变文库的有利背景，采用秀丽隐杆线虫宿主模型，通过筛选解淀粉芽孢杆菌FZB42随机突变文库中侵染能力降低的突变子，然后再通过反向PCR技术、巢式PCR技术、抑制剂拮抗、基因敲除、回复突变等功能实验，证明与分选酶作用相关的yhcT基因、编码假想蛋白的yneK基因以及参与编码大环内酯抗生素的mlnD基因参与解淀粉芽孢杆菌FZB42侵染线虫过程。该研究进一步丰富了食线虫细菌侵染线虫的分子机制。

摘要： 指数式富集的配体系统进化(SELEX)技术是近年来发展起来的研究核酸结构、功能及进化的一种新的组合化学技术。利用以完整细胞为靶的SELEX技术，可以筛选到大鼠成骨细胞ROS1728的aptamers，此类aptamers对ROS1728有较高特异性和亲和力，对与成骨细胞具有一定同源性的大鼠骨肉瘤细胞没有明显亲和力。

摘要： Erns、E1和E2是猪瘟病毒(CSFV)的三种结构蛋白，与病毒的吸附和侵入靶细胞有关。为确定CSFV与靶细胞结合的配体表位信息，本研究利用生物信息学技术分析CSFV Ems、E1和E2三种结构蛋白一级结构的氨基酸序列，设计合成10条多肽，以PK-15细胞为靶细胞，进行多肽与靶细胞结合试验和病毒阻断结合试验，筛选鉴定CSFV的配体表位，通过多肽抑制CSFV感染PK-15细胞试验测定其感染抑制功能。多肽SE24能有效结合PK-15细胞，病毒阻断试验证实，CSFV可以阻断多肽SE24结合PK-15细胞，多肽抑制CSFV感染试验表明，多肽SE24可以抑制CSFV感染PK-15细胞。通过上述试验成功筛选出一条CSFV配体表位多肽SE24，位于E2蛋白上，配体表位SE24能够抑制CSFV感染PK-15细胞，随着多肽浓度的增加感染率降低，具有剂量依赖性.

摘要： 从刺参养殖环境中分离出17株低温饵料降解细菌,通过COD去除率和氨氮去除率来验证菌株的饵料降解效果,筛选出三株优良双功能菌DR7、DR8和DR11,它们对刺参饵料中的有机物和氨氮同时具有高效绛解作用,在低温(15°C)、pH 8.0、160r/rain的条件下振荡培养5d,COD去除率分别为37.7%、50.0%和21.0%,氨氮去除率分别为95.0%、98.0%和99.8%。根据其形态特征、生理生化特性以及16s rDNA序列分析,初步鉴定DR7、DR11两株为假单胞菌属细菌(Pseudomonas spp.),DR8为副球菌属细菌(Paracoccus sp.),并对它们的生长曲线进行了测定。rn 通过考察菌株培养时间与饵料中COD和氨氮浓度的关系,研究了三菌株对有机物和氨氮的降解动态曲线;进一步研究菌株之间的组合优化,确定了饵料降解最佳组合菌为DR8-DR11,为复合微生态制剂的研制工作创造条件。

摘要： 从内蒙古传统乳制品发酵稀奶油中分离出一株产细菌素的乳杆菌KLDS1.0364，初步鉴定为布氏乳杆菌。优化乳杆菌产细菌素的条件，确定了有最大抑菌活力时的培养时间、培养温度和培养基成分，即30°C培养24h；最佳培养基氮源为1％胰蛋白胨、0.5％蛋白胨、0.5％牛肉膏、0.5％酵母提取物，最佳碳源为葡萄糖。

摘要： 从沈抚污灌区石油污染土壤和实验室高浓度石油烃胁迫土壤中筛选出了4株总石油烃(Totalpetroleumhydrocarbon/TPH),生物降解率在65％以上的高效石油烃降解菌SF-422、SF-428、SF-433和SYS-1.经过16项生理生化特性实验和16SrDNA序列分析鉴定,这4株菌分别为施氏假单胞菌(Pseudomonasstutzeri),木糖氧化无色杆菌(Achro-mobacterxylosoxidans),蜡状芽孢杆菌(Bacilluscereus)和洋葱伯克霍尔德氏菌(Burkholderiacepacia).纯烃降解定性实验表明,所筛选出的4株高效降解菌均能够利用正构烷烃、单环和多环芳烃及环烷烃生长,其中菌株SF-428和SYS-1显示了对芳烃及环烷烃较强的代谢能力.

摘要： 从沈抚污灌区石油污染土壤和实验室高浓度石油烃胁迫土壤中筛选出了4株总石油烃(Totalpetroleumhydrocarbon/TPH),生物降解率在65％以上的高效石油烃降解菌SF-422、SF-428、SF-433和SYS-1.经过16项生理生化特性实验和16SrDNA序列分析鉴定,这4株菌分别为施氏假单胞菌(Pseudomonasstutzeri),木糖氧化无色杆菌(Achro-mobacterxylosoxidans),蜡状芽孢杆菌(Bacilluscereus)和洋葱伯克霍尔德氏菌(Burkholderiacepacia).纯烃降解定性实验表明,所筛选出的4株高效降解菌均能够利用正构烷烃、单环和多环芳烃及环烷烃生长,其中菌株SF-428和SYS-1显示了对芳烃及环烷烃较强的代谢能力.

摘要： 从沈抚污灌区石油污染土壤和实验室高浓度石油烃胁迫土壤中筛选出了4株总石油烃(Totalpetroleumhydrocarbon/TPH),生物降解率在65％以上的高效石油烃降解菌SF-422、SF-428、SF-433和SYS-1.经过16项生理生化特性实验和16SrDNA序列分析鉴定,这4株菌分别为施氏假单胞菌(Pseudomonasstutzeri),木糖氧化无色杆菌(Achro-mobacterxylosoxidans),蜡状芽孢杆菌(Bacilluscereus)和洋葱伯克霍尔德氏菌(Burkholderiacepacia).纯烃降解定性实验表明,所筛选出的4株高效降解菌均能够利用正构烷烃、单环和多环芳烃及环烷烃生长,其中菌株SF-428和SYS-1显示了对芳烃及环烷烃较强的代谢能力.

摘要： 从沈抚污灌区石油污染土壤和实验室高浓度石油烃胁迫土壤中筛选出了4株总石油烃(Totalpetroleumhydrocarbon/TPH),生物降解率在65％以上的高效石油烃降解菌SF-422、SF-428、SF-433和SYS-1.经过16项生理生化特性实验和16SrDNA序列分析鉴定,这4株菌分别为施氏假单胞菌(Pseudomonasstutzeri),木糖氧化无色杆菌(Achro-mobacterxylosoxidans),蜡状芽孢杆菌(Bacilluscereus)和洋葱伯克霍尔德氏菌(Burkholderiacepacia).纯烃降解定性实验表明,所筛选出的4株高效降解菌均能够利用正构烷烃、单环和多环芳烃及环烷烃生长,其中菌株SF-428和SYS-1显示了对芳烃及环烷烃较强的代谢能力.

摘要： 从沈抚污灌区石油污染土壤和实验室高浓度石油烃胁迫土壤中筛选出了4株总石油烃(Totalpetroleumhydrocarbon/TPH),生物降解率在65％以上的高效石油烃降解菌SF-422、SF-428、SF-433和SYS-1.经过16项生理生化特性实验和16SrDNA序列分析鉴定,这4株菌分别为施氏假单胞菌(Pseudomonasstutzeri),木糖氧化无色杆菌(Achro-mobacterxylosoxidans),蜡状芽孢杆菌(Bacilluscereus)和洋葱伯克霍尔德氏菌(Burkholderiacepacia).纯烃降解定性实验表明,所筛选出的4株高效降解菌均能够利用正构烷烃、单环和多环芳烃及环烷烃生长,其中菌株SF-428和SYS-1显示了对芳烃及环烷烃较强的代谢能力.

摘要： 本发明提供了一种快速筛选和鉴定有效shRNA真核表达载体，将如下结构构建至同一个真核表达载体上：1)由polIII型启动子调控的shRNA表达框结构，即polIII型启动子+shRNA插入位点；2)由CMV启动子调控的荧光蛋白表达框，并在荧光蛋白基因后面紧跟一个多克隆位点(MCS)；3)由SV40启动子调控的荧光蛋白表达框，该荧光蛋白的荧光颜色与第2)中的荧光蛋白的荧光颜色不同。本发明还提供了用上述载体筛选或验证有效shRNA的方案，利用此载体和方法筛选和鉴定有效shRNA，不需做RT-PCR或Western-blot检测，快速、简单、方便、成本低廉，特别适合于从多个预先设计的备选shRNA中筛选有效shRNA。

摘要： 本发明公开基于SNP位点的油橄榄品种鉴定的扩增引物、筛选方法及鉴定方法，8对油橄榄扩增引物。本发明通过对油橄榄品种叶片DNA，经限制性内切酶酶切、克隆测序、基因组比对分析，挑选高度可靠性和可重复性单拷贝片段，选单拷贝片段设计扩增引物；再以选单拷贝片段设计扩增引物，对油橄榄品种叶片DNA进行PCR扩增，筛选出扩增效率高、变异丰富的8对单拷贝核基因标记物，8对油橄榄扩增产物相对较纯，峰形清晰，不需要荧光引物，检测价格低廉；可利用8对油橄榄单拷贝核基因标记物进行油橄榄品种鉴定。

摘要： 本发明提供了一种快速筛选和鉴定有效shRNA真核表达载体，将如下结构构建至同一个真核表达载体上：1)由polIII型启动子调控的shRNA表达框结构，即polIII型启动子+shRNA插入位点；2)由CMV启动子调控的荧光蛋白表达框，并在荧光蛋白基因后面紧跟一个多克隆位点(MCS)；3)由SV40启动子调控的荧光蛋白表达框，该荧光蛋白的荧光颜色与第2)中的荧光蛋白的荧光颜色不同。本发明还提供了用上述载体筛选或验证有效shRNA的方案，利用此载体和方法筛选和鉴定有效shRNA，不需做RT-PCR或Western-blot检测，快速、简单、方便、成本低廉，特别适合于从多个预先设计的备选shRNA中筛选有效shRNA。

摘要： 本发明提供一种可断裂交联肽段鉴定方法，针对可断裂交联肽段的每一张二级谱图，所述方法包括如下步骤：S1、提取谱图中质量差为交联剂对应固定质量差的特征双峰，以特征双峰对应的质量为α肽段质量，基于可断裂交联肽段对应的母离子质量获取与α肽段质量互补的β肽段质量得到α肽段质量和β肽段质量组成的候选质量对；其中，所述母离子质量通过可断裂交联肽段的一级谱图校准获得；S2、根据步骤S1得到的候选质量对，分别以候选质量对中的α肽段质量和β肽段质量为依据，从蛋白质数据库中筛选出多条分别与α肽段质量和β肽段质量相等的候选肽段，并将α肽段质量的所有候选肽段与β肽段质量的所有候选肽段分别组成成对的候选交联肽段形成候选交联肽段集合，根据预设的碎片离子对候选交联肽段集合中的交联肽段进行匹配打分，选取其中打分最高的交联肽段。

摘要： 本发明涉及稻瘟病抗性鉴定领域，具体涉及一种稻瘟病穗颈瘟抗性鉴定菌系筛选方法及鉴定方法。上述方法通过分子测定某一地区的稻瘟病菌群致病基因与无毒基因情况，根据测定结果进行聚类划分成不同的遗传宗谱，从不同的宗谱中筛选一定的菌株组成代表该地区稻瘟病菌群的抗性鉴定菌系，可以很好的为该地区的水稻抗病育种与抗病品种筛选提供有效的助力。该方法具有高效、准确、省时省力的特点，对水稻稻瘟病特别是穗颈瘟的抗性鉴定有很要的应用潜力。

摘要： 本发明公开基于SNP位点的油橄榄品种鉴定的扩增引物、筛选方法及鉴定方法，8对油橄榄扩增引物。本发明通过对油橄榄品种叶片DNA，经限制性内切酶酶切、克隆测序、基因组比对分析，挑选高度可靠性和可重复性单拷贝片段，选单拷贝片段设计扩增引物；再以选单拷贝片段设计扩增引物，对油橄榄品种叶片DNA进行PCR扩增，筛选出扩增效率高、变异丰富的8对单拷贝核基因标记物，8对油橄榄扩增产物相对较纯，峰形清晰，不需要荧光引物，检测价格低廉；可利用8对油橄榄单拷贝核基因标记物进行油橄榄品种鉴定。

摘要： 一种反硝化细菌筛选鉴定试剂盒及反销化细菌筛选鉴定方法，试剂盒包括反硝化鉴定预制管；菌株富集管；菌种保藏液；筛选鉴定方法是将待检测菌株经菌株富集管富集后接种到反硝化鉴定预制管培养，同时用菌株保藏液将富集菌液保存；反硝化鉴定管经静止培养后，根据培养基颜色变化和产气情况判断菌种反硝化能力。本发明的优点是实现反硝化细菌便捷、定量的鉴定效果，实现菌株培养、鉴定、保藏一站式操作。

摘要： 一种氨氧化细菌筛选鉴定试剂盒、筛选鉴定及菌样分离方法，试剂盒包括菌株富集管；氨氧化鉴定管1，2，3；菌株保藏液；显色剂A，B；筛选鉴定方法是将待检测菌种经菌株富集管富集后接种到氨氧化鉴定管1、2、3培养，同时用菌株保藏液将富集菌液保存；氨氧化鉴定管经培养后加入显色剂A、B，根据显色状态判断菌株氨氧化能力，菌样分离方法是将培养菌样稀释涂布分离。本发明的优点是实现氨氧化细菌快速、高通量筛选鉴定的效果，实现菌种培养、鉴定、保藏一站式操作。

摘要： 一种氨氧化细菌筛选鉴定试剂盒、筛选鉴定及菌样分离方法，试剂盒包括菌株富集管；氨氧化鉴定管1、2、3；菌株保藏液；显色剂A、B；筛选鉴定方法是将待检测菌种经菌株富集管富集后接种到氨氧化鉴定管1、2、3培养，同时用菌株保藏液将富集菌液保存；氨氧化鉴定管经培养后加入显色剂A、B，根据显色状态判断菌株氨氧化能力，菌样分离方法是将培养菌样稀释涂布分离。本发明的优点是实现氨氧化细菌快速、高通量筛选鉴定的效果，实现菌种培养、鉴定、保藏一站式操作。

摘要： 一种反硝化细菌筛选鉴定试剂盒及反销化细菌筛选鉴定方法，试剂盒包括反硝化鉴定预制管；菌株富集管；菌种保藏液；筛选鉴定方法是将待检测菌株经菌株富集管富集后接种到反硝化鉴定预制管培养，同时用菌株保藏液将富集菌液保存；反硝化鉴定管经静止培养后，根据培养基颜色变化和产气情况判断菌种反硝化能力。本发明的优点是实现反硝化细菌便捷、定量的鉴定效果，实现菌株培养、鉴定、保藏一站式操作。