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微卫星

微卫星的相关文献在1994年到2022年内共计3039篇,主要集中在畜牧、动物医学、狩猎、蚕、蜂、水产、渔业、动物学 等领域,其中期刊论文2042篇、会议论文73篇、专利文献35612篇;相关期刊540种,包括海洋与湖沼、四川动物、水生生物学报等; 相关会议48种,包括中国动物学会·中国海洋湖沼学会贝类学分会第九次会员代表大会暨第十五次学术讨论会、2010年全国养羊生产与学术研讨会、中国动物学会、中国海洋湖沼学会贝类学会分会第十四次学会研讨会等;微卫星的相关文献由7408位作者贡献,包括孙效文、刘萍、陈国宏等。

微卫星—发文量

期刊论文>

论文:2042 占比:5.41%

会议论文>

论文:73 占比:0.19%

专利文献>

论文:35612 占比:94.39%

总计:37727篇

微卫星—发文趋势图

微卫星

-研究学者

  • 孙效文
  • 刘萍
  • 陈国宏
  • 李慧芳
  • 陈宽维
  • 李健
  • 鲁翠云
  • 梁利群
  • 刘云国
  • 汤青萍
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利文献

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排序:

年份

作者

    • 杨哲; 陈凌; 王海岗; 王瑞云; 乔治军
    • 摘要: 通过鉴定糜子种质资源,构建分子身份证,旨在为其保护遗传多样性提供理论依据,以来源于山西黄土高原生态区的21份糜子资源为材料,利用12个SSR标记(六碱基、五碱基和四碱基核苷酸重复序列分别为1、4、7对)筛选出9个遗传稳定性高、重复性好的标记,进行遗传多样性分析,利用相关软件构建材料的DNA二维码。结果表明,21份材料在12个位点的遗传多样性参数的观测等位基因平均为3.0000;有效等位基因介于2.5412~2.9959,平均为2.8412;多态性信息含量介于0.6010~0.7720,平均为0.7076;多样性指数介于0.9958~1.0979,平均为1.0661;观测杂合度介于0.5294~0.8883,平均为0.7058;期望杂合度介于0.6238~0.6842,平均为0.6646;Nei′s期望杂合度介于0.6065~0.6662,平均为0.6469。3个核心标记(RYW5、RYW8、RYW11)与其他标记相比相似系数过高,进行剔除处理;基于9个标记(RYW1、RYW2、RYW3、RYW4、RYW6、RYW7、RYW9、RYW10和RYW12)可以将21份材料全部区分。利用条形码在线软件与在线二维码技术分别构建了21份糜子资源的条形码和二维码。
    • 蔡颖; 段继煜; 朱思奇; 任明迅; 唐亮
    • 摘要: 为了解无翼坡垒(Hopea reticulate Tardieu)的遗传多样性和不同龄级间的遗传结构,利用11对微卫星标记评估海南省甘什岭保护区的无翼坡垒的遗传多样性,并根据胸径将无翼坡垒划分为幼龄、中龄和成熟龄3个龄级,明确不同龄级间的遗传差异,探究其濒危机制,并从遗传角度提出保护策略。结果表明:无翼坡垒的等位基因数(N_(a)=3.636)和期望杂合度(H_(e)=0.599)低于同属的非濒危种H.dryobalanoides(N_(a)=5.600,H_(e)=0.678),明显高于同属且同域分布的另一濒危种坡垒(N_(a)=2.417,H_(e)=0.432),但不同龄级的遗传多样性没有明显差异。无翼坡垒低频等位基因的比例明显低于龙脑香科的非濒危种,揭示种群很可能经历了瓶颈,种群规模缩小导致大量低频等位基因丢失。由于本种在甘什岭集中分布,现存个体数量比零星分布的坡垒更多,因此,遗传多样性较坡垒略高。基于微卫星变异研究的结果,建议在维持无翼坡垒现有变异的基础上,通过人工抚育,促进种群更新,恢复遗传多样性和进化潜力,实现无翼坡垒的稳定续存。
    • 乌日娜; 徐舶; 石凤翎
    • 摘要: 【目的】对直立型扁蓿豆转录组简单重复序列(SSR)特征进行分析,为开发扁蓿豆新的分子标记奠定基础。【方法】以直立型扁蓿豆叶片为材料,通过Illumina HiSeq X Ten测序平台进行高通量测序,利用MISA软件对转录组数据进行SSR位点搜索,并对SSR位点的分布及其序列特征进行分析。【结果】在直立型扁蓿豆中得到308449条参考序列(Unigene),从中挖掘到89688个SSR位点,SSR出现频率为29.08%,平均分布距离3.17 kb。SSR重复基元数量以单核苷酸为主(53710个SSR,占比59.89%),三核苷酸(18586个SSR,占比20.72%)、二核苷酸(15446个SSR,占比17.22%)次之。在159种重复基元中,单核苷酸A/T类型占比最高(58.50%),其次为二核苷酸AG/CT基元(8.29%)。直立型扁蓿豆转录组SSR以6~15次重复为主,6种核苷酸重复类型数量总体表现为随着基元重复次数的增加而减少。SSR长度主要集中在12~120 bp,此长度范围SSR数量占SSR总数的41.62%,具有较高多态性潜能的SSR(长度>20 bp)位点数为20557,占比22.92%。【结论】直立型扁蓿豆SSR位点出现频率高、基元重复类型丰富、多态性潜能高,在扁蓿豆遗传多样性与品种分子鉴定及新的分子标记开发等方面具有较大的应用价值。
    • 金武; 曹静越; 马骋; 马学艳; 吕国华; 闻海波; 顾若波
    • 摘要: 为了解国内梨形环棱螺(Bellamya purificata)群体的遗传特征,利用7对微卫星引物对山东微山湖、江苏高邮湖、上海明珠湖、浙江淳安、安徽黄陂湖、湖北长湖、江西仙女湖、湖南耒水、贵州夜郎湖、广西千亩湖、广东榕江11个群体的遗传多样性和遗传结构进行了分析。结果显示:观察杂合度(Ho)为0.434~0.674,期望杂合度(He)为0.772~0.905,多态性信息含量(PIC)为0.756~0.885,这11个群体的遗传多样性均较高。遗传变异中有94.84%来自群体内,5.16%的遗传变异来自群体间,群体间的遗传分化程度较低(F_(st)=0.052)。浙江淳安群体和江苏高邮湖遗传距离最远。
    • 唐荣叶; 苏孟园; 杨汶珊; 徐杰杰; 王涛; 尹绍武
    • 摘要: 为了解斑点叉尾鮰(Ictalurus punctatus)全基因组中完整型微卫星的分布特征,本研究使用生物信息学软件MISA对其全基因组微卫星进行了搜索并分析。结果显示,在斑点叉尾鮰29条染色体中,筛选到完整型微卫星共510256个,总长度达11036941 bp。其中,微卫星数量最多的是2号染色体(25284个),其次分别是3号、1号和5号染色体,29号染色体的微卫星数量最少,只有11591个。每条染色体长度与位于其上的微卫星的数量均显著相关(SPSS,r=0.98,P<0.01)。27号染色体的微卫星相对丰度最大(785.03个/Mb),11号染色体的微卫星相对丰度最小(615.89个/Mb)。6种重复拷贝类型的微卫星中,单碱基的数量最多,占总数的45.31%,随后依次是二碱基(38.53%)、三碱基(8.73%)、四碱基(6.93%)、五碱基(0.46%)和六碱基(0.04%)。斑点叉尾鮰全基因组微卫星中,前10种优势重复拷贝类别为A、AC、AG、AT、AAT、AAAT、C、AAC、AAAC和AAG,表现出明显的A、T碱基优势。本研究结果可为进一步研究斑点叉尾鮰全基因组特征提供参考,并为今后进行斑点叉尾鮰分子标记辅助育种及遗传信息评估等工作提供基础资料。
    • 李宝玉; 郑国栋; 崔文涛; 陈杰; 邹曙明
    • 摘要: 为研究团头鲂三倍体育种,对团头鲂三倍体和二倍体2个群体进行微卫星遗传结构特征分析和生长性能比较。利用筛选得到的20个微卫星标记对团头鲂三倍体和二倍体进行遗传多样性分析。试验结果表明,团头鲂三倍体、二倍体的平均等位基因数分别为2.75、3.05,平均期望杂合度分别为0.5061、0.5412,平均多态信息含量分别为0.4249、0.4378。团头鲂2种倍性群体的大多数位点均表现为偏离哈迪—温伯格平衡,多数位点的遗传偏离指数显示杂合子过量。筛选出2个群体特异性标记TTF1和Mam-EST110,可区分二倍体和三倍体2个群体。同时通过2个群体的生长对比试验,对团头鲂三倍体的生长性能进行评价。试验结果显示,团头鲂三倍体相对于二倍体出现了等位基因缺失、杂合度下降的现象。此外,三倍体与二倍体在1龄阶段生长速度无显著差异(P>0.05),而在2龄阶段三倍体的平均体质量和绝对质量增加率均显著高于二倍体(P<0.05),表现出明显的生长优势。研究结果对团头鲂三倍体遗传结构研究、倍性鉴定以及三倍体育种工作的进一步开展具有参考意义。
    • 田新民; 杨孟平; 宋雅祺; 刘小慧; 廉明栋; 陈红
    • 摘要: 小飞鼠(Pteromys volans)为树栖夜行滑行类啮齿动物(Rodentia),在森林种子传播和维持生态系统平衡等方面发挥着重要的生态学作用。过去不合理的森林采伐,已导致其生存受到一定威胁,为了给小飞鼠东北亚种(P.v.arsenjevi)群体遗传学研究与管理提供重要的分子标记,从鼯鼠科(Pteromyidae)的小飞鼠指名亚种(P.v.volans)、北美飞鼠(Glaucomys sabrinus)、海南小飞鼠(Hylopetes phayrei)、赤颊林飞鼠(H.sagitta)和松鼠科(Sciuridae)的北松鼠(Sciurus vulgaris)5个物种中,选择34个具有多态性的微卫星位点,基于交叉扩增测试在小飞鼠东北亚种的可用性。结果显示:共有14个位点能够成功扩增,其中2个位点(Hlep26和GLSA48)不具多态性,12个位点(Pvol10、Pvol41、PvolE1、PvolE5、PvolE6、PvolE10、Scv3、Hlep59、Hlep72、Hlep80、Hph17和ScnFO35)显示出较高的多态性,等位基因为8~16个,多态信息含量为0.757~0.902,不存在位点间的连锁不平衡。12个位点的累计个体识别力很高,全同胞的错误判别概率仅为1.44×10^(-6)。系统关系越近的物种之间,多态性位点的成功交叉扩增率越高。研究表明,筛选的12个多态性位点,可作为非损伤性遗传取样个体识别的参考位点,可用于小飞鼠东北亚种的群体遗传学分析和遗传管理。
    • 罗相忠; 覃维敏; 梁宏伟; 沙航; 邹桂伟
    • 摘要: 长丰鲢(CF)为我国人工培育的鱼类新品种,自推广应用以来取得了良好的效果。开展长丰鲢种质资源遗传监测,对其优良性状保持具重要作用。研究采用18对微卫星引物分析了鲢(L)和长丰鲢世代间(CF_(1)、CF_(2)和CF_(3))的遗传多样性和遗传结构。结果表明:鲢遗传多样性指数高于长丰鲢,遗传多样性也较长丰鲢丰富。而长丰鲢子代间CF_(1)到CF_(3)平均等位基因数(N_(a))从5.7222下降到5.0556;平均有效等位基因数(N_(e))从3.2551下降到3.1461;平均观测杂合度(H_(o))从0.6975下降到0.5407;平均期望杂合度(H_(e))从0.6422下降到0.6235;多态信息含量(PIC)从0.5784下降到0.5609。CF_(1)到CF_(3)的遗传参数是逐渐下降,遗传多样性逐渐降低,但群体间遗传多样性仍较高。长丰鲢子代间F_(st)在0.0160—0.0315,表明其群体已出现了遗传分化,但分化程度较低。长丰鲢各世代间遗传距离逐渐增加,遗传相似度逐渐减小。研究表明经过连续3代利用,长丰鲢CF_(1)到CF_(3)的遗传结构发生了改变,遗传多样性呈下降趋势,但遗传多样性水平仍较高。研究结果为长丰鲢进一步优良性状的维持提供了依据。
    • 彭冶; 李杰; 王涛; 张凯; 宁先会; 暨杰; 尹绍武
    • 摘要: 文章探究了瓦氏黄颡鱼(Pelteobagrus vachelli)全基因组微卫星的分布特征及其规律,旨在为相关功能性微卫星分子标记的筛选提供依据。利用MISA (MIcroSAtellite identification tool)软件对其全基因组微卫星进行筛查和分析,并对外显子中含有微卫星的基因进行了GO (Gene Ontology)注释和KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)富集分析。在瓦氏黄颡鱼全基因组(约663.53 Mb)中筛查到6种完整型微卫星共417 724个,相对丰度为630个·Mb-1,在全基因组总长度中占比1.48%。其中二碱基重复类型的微卫星个数最多,占微卫星总数的43.36%,其他依次分别是单碱基(39.02%)、四碱基(9.05%)、三碱基(7.34%)、五碱基(1.12%)和六碱基(0.12%)。对筛选得到的完整型微卫星进行初步定位,发现其中10 924个微卫星分布在外显子区,共定位到5 788个基因上。GO分析表明注释到生物过程的基因数量最多,GO富集较为显著的条目为结合活性和细胞大分子代谢过程。KEGG富集表明这些基因共富集到273条通路,其中黄酮与黄酮醇生物合成等通路最为显著(P=0)。联合分析预测瓦氏黄颡鱼定位到外显子上的微卫星和其体内的生物代谢过程密切相关。
    • 张振祥; 陈艳霞; 习向玉; 肖荣荣; 张琪
    • 摘要: 目的:开展种群遗传学方面研究,了解圈养甘肃马鹿种群的遗传多样性水平,为该种群的饲养、管理和繁育提供依据。方法:采集53份圈养甘肃马鹿血液样本,提取基因组DNA后应用26对SSR位点引物对其扩增,通过琼脂糖凝胶电泳和聚丙烯酰胺凝胶电泳技术检测SSR引物扩增情况和多态性,进而应用生物信息学方法对山丹军马场甘肃马鹿遗传多样性进行评价。结果:26个SSR位点共检测到96个等位基因,各位点Na为2~6,平均Ne、Ho、He、PIC和I分别为2.4502、0.4299、0.5315、0.4760和0.9666,其中5个位点为低度多态位点(PIC0.5);26个位点中只有5个位点符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05);除了5个位点属于非中性位点外,其余21个位点属于中性位点;此外,F-固定系数分析中位点的平均Fis和Fit均为正值。山丹军马场和肃南鹿场两个甘肃马鹿种群比较结果表明,两个种群均为中度遗传多样性,有13个位点在两个甘肃马鹿种群多态性较稳定,可用于其他圈养和野生甘肃马鹿遗传多样性的研究。结论:说明山丹军马场圈养甘肃马鹿种群的遗传多样比较丰富,但也存在一定程度的近交。
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