杂合度
杂合度的相关文献在1989年到2022年内共计172篇,主要集中在畜牧、动物医学、狩猎、蚕、蜂、动物学、遗传学
等领域,其中期刊论文157篇、会议论文11篇、专利文献2481篇;相关期刊91种,包括动物学研究、生物多样性、遗传等;
相关会议10种,包括第八届中国优质禽育种与生产研究会学术讨论会暨代表大会、北方遗传资源的保护与利用研讨会、第二届京津冀畜牧兽医科技创新论坛暨第六届新思想、新方法、新观点“首农杯”论坛等;杂合度的相关文献由593位作者贡献,包括苗永旺、霍金龙、刘丽仙等。
杂合度
-研究学者
- 苗永旺
- 霍金龙
- 刘丽仙
- 陈涛
- 张学余
- 李大林
- 熊远著
- 王克华
- 刘博
- 周群兰
- 徐孝平
- 赵伟春
- 陈国宏
- 陈宽维
- 陈民利
- 霍海龙
- 高玉时
- 代蓉
- 任航行
- 刘国庆
- 刘建平
- 刘楚吾
- 叶朗惠
- 吴信生
- 常洪
- 张兴国
- 张才骏
- 徐琪
- 成荣
- 李慧芳
- 王得前
- 王德军
- 田应华
- 邓昌彦
- 郑嵘
- 郭昱嵩
- 余海鹰
- 冯书堂
- 屈彦纯
- 巴华杰
- 张书友
- 张喜昌
- 张建新
- 张沅
- 张雨
- 李凤娥
- 李莉
- 杨春
- 杨泽宇
- 杨章平
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许晨霞;
王德刚;
张艳芳;
郑国兵;
彭建明
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摘要:
目的使用QF-PCR技术对产前样本进行快速诊断,分析多重短串联重复序列(STR)标记杂合度以及三体峰型,为QF-PCR试剂盒STR位点的设计提供研究基础。方法选取2020年9月至2021年7月在中山市博爱医院产前诊断中心进行介入性产前诊断的525例样本作为研究对象,运用QF-PCR技术对13、18、21及性染色体非整倍体进行快速诊断,使用GeneMapper 5.0软件查看并记录STR分型结果图。结果13、18、21及X染色体的STR标记中杂合度最高分别为D13S742、D18S386、D21S1414、DXS8377;杂合度最低的分别为D13S628、D18S391、D21S1433、DXS981。QF-PCR技术发现异常样本共计31例(5.9%),其中三体型27例(21三体19例,18三体6例,13三体2例),X单体1例,染色体其他异常3例;检测到18和21三体中均有4例STR标记为2∶1或者1∶2的双峰;STR位点均为单峰2例,STR位点仅一个双峰23例。结论与传统染色体核型分析比较,QF-PCR技术能更快速诊断常见染色体非整倍体的数目异常,具有简便快速、特异性高的优点。在设计QF-PCR试剂盒时需要选择D13S742、D18S386、D21S1414等杂合度高的STR位点。
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乔娇灵;
朱绪伟;
段竹君;
李莹;
杨新峰;
段建平
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摘要:
目前,一化性柞蚕基因组图谱不完整,缺W染色体未被组装,而W染色体是柞蚕雌性个体最重要的一条性染色体。为辅助柞蚕雌性个体基因组组装策略的制定,基于二代高通量测序,结合划动窗口统计、k-mer曲线拟合及基因组从头组装等手段,对柞蚕雌性个体基因组的GC含量、杂合度、基因组大小等特征进行了分析。结果发现一化性柞蚕雌性个体基因组GC含量约为36%,杂合度约为1.25%,从头组装获得的基因组由852 519条scaffold组成,总大小约为760 Mb。说明一化性柞蚕雌性个体基因组属于高复杂度基因组,单纯二代数据组装的基因组质量较差,需要利用三代测序及染色体构象捕获技术,保证将来雌性个体基因组组装质量。
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李歆毓;
丁梦莹;
冯尔辉;
张源源;
章可兰;
万迎朗
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摘要:
为揭示白边侧足海天牛基因组的信息,以便为后续构建全基因组精细图谱提供基础,利用流式细胞术与高通量测序技术对白边侧足海天牛全基因组进行了Survey分析。结果表明,流式细胞术预测白边侧足海天牛基因组是84K杨的1.69倍,约为794.6 Mb。白边侧足海天牛高通量测序得到25 Gb的过滤数据,总测序深度约为30 x,根据17-mer分析,预测海天牛基因组大小约为724.8 Mb,基因组重复率为52.8%,杂合度为1.55%,模型拟合值为99.38%;根据19-mer分析,预测海天牛基因组大小约为730.8 Mb,基因组重复率为35.1%,杂合度为1.68%,模型拟合值为99.72%。最后,对白边侧足海天牛尝试初步组装后得到总长为628Mb的基因组。研究结果显示,白边侧足海天牛是一个高度杂合的物种,且其基因组大小超过700 Mb。
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吴亚姗;
杨平贵;
付华龙;
阿龙呷;
陈明华;
毛进彬;
庞倩;
周明亮
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摘要:
为了评价四川省得荣县玛格绵羊资源群体的遗传多样性,选择位于绵羊染色体上的30个微卫星标记,采用毛细管电泳进行等位基因分型,分析并评价玛格绵羊群体的遗传多样性。结果显示:玛格绵羊群体30个微卫星标记具有4~14个等位基因,平均为8.37个等位基因;观察杂合度(Ho)为0.217~0.850,平均为0.6055,期望杂合度(He)为0.333~0.897,平均为0.7018;多态信息含量(PIC)为0.310~0.879,平均为0.664。揭示玛格绵羊资源群体的遗传多样性丰富,为下一步开发利用奠定了基础。
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王桂瑶;
常延斌;
郭建华;
郭超;
奚家勤;
胡利伟;
蔡宪杰;
宋纪真
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摘要:
为研究烟草粉螟基因组信息,基于低深度高通量测序,利用Illumina测序平台对烟草粉螟基因组进行了分析,采用K-mer法预测烟草粉螟基因组大小、杂合度和重复序列等基因组特征,并使用SOAP de novo软件对烟草粉螟基因组进行了初步组装.研究表明:①烟草粉螟预估基因组大小为546.4 Mb,杂合度为1.93%,重复序列比例为48.59%,GC含量为36.9%,属于复杂昆虫基因组.②基因组初步组装后,得到3192823条Contigs,Contig N50为244 bp,组装质量较低.对烟草粉螟基因组的初步研究为后续获得高质量烟草粉螟全基因组信息提供了必要参考.
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杨杰芳;
甘然;
曾庆南;
程平;
王海霞
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摘要:
为研究雷竹基因组信息,基于高通量测序,利用Illumina测序平台对雷竹基因组进行了分析,采用K-mer法预测雷竹基因组大、杂合度和重复序列等基因组特征,结果表明:雷竹基因组大小约为1913 Mb,修正后为1897 Mb,杂合率为1.7%,重复序列比例为69.38%。
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范征宇;
郑立;
毛世豪;
王亮;
张溢满;
任旭鸽;
郭泊瑶;
胡琦杭;
黄高想;
邵俊红;
时坤鹏;
张佳庆;
胡陆星;
白俊艳;
赵淑娟
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摘要:
本研究利用PCR-SSCP与测序相结合的方法,分析了小尾寒羊GH基因第2外显子的多态性.为河南小尾寒羊分子标记辅助育种的开展和生产性能、生产效益和经济效益的提高提供基础资料和科学依据.结果表明,GH外显子2在小尾寒羊群体中检测到的3种基因型分别为AA、AB、BB,3种基因型频率分别为:0.2813、0.1875和0.5312,A、B等位基因频率分别为0.5469和0.4531.GH外显子2的杂合度为0.5312,有效等位基因数为2.1331,多态性信息含量为0.3728,该位点表现为中度多态.AA和BB基因型测序结果发现,在第101位点和第145位点上,AA基因型为G和R(AG套峰),BB基因型为S(GC套峰)和A.
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王硕;
葛秀秀;
孔维一;
陈洪伟;
刘克锋;
王红利
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摘要:
[目的]为了制定更好的一串红全基因组denovo测序策略及筛选SSR标记.[方法]利用Illumina测序平台对一串红基因组大小进行测定,通过生物信息学分析对一串红基因组的重复序列、杂合度等基本信息进行了预估,并进行了初步组装,在此基础上对一串红全基因组进行了SSR查找.[结果](1)一串红全基因组大小预估为841Mbp;(2)一串红基因组杂合度较低,有一定的重复序列;(3)共获得95 982个重复单元长度为1~6碱基及复合型的SSR重复序列,其中单碱基重复的SSR单元最为丰富,共39 903个,占41.6%;其次是二碱基重复类型(24 820个)和复合型(13 281个),所占比例分别为25.9%和13.8%.[结论]为一串红全基因组denovo测序和SSR标记的筛选提供了依据,对于一串红后续的分子水平上的研究及遗传多样性、遗传图谱构建、品种鉴定等提供了应用价值.%[Obsjective]In order to develop a better sequence strategy of S.splendens genome denovo and screening SSR makers,the survey of whole genome and the search for SSR were carried out.[Methods]This is the first study on the genome size of S.splendens and that were measured using next-generation sequencing technology (Illumina).The basic information of S.splendens including repeat sequence and heterogeneity percentage were estimated by bioinformatics.Then,preliminary genome assembly was conducted and SSR was detected.[Results](1) the genome size was about 841 Mbp,(2) the homozygosity of the genome was good and there is a certain repeat sequence,(3) there were 95 982 microsatellites (SSRs) repeat sequence which ranged from 1 to 6 bp and compound SSR.Among them,the most were mononucleotide repeats (39 903) and it accounted for 41.6% of the total;secondly,dinucleotide repeats were 24 820 and compound repeats were 13 281,and they accounted for 25.9% and 13.8%,respectively.[Conclusion]This study provides a basis for genome denove of S.splendens and the selection of SSR makers.It is also valuable for the study of molecular level,genetic diversity,genetic map construction,variety identification and so on.
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孙瑞萍;
魏立民;
晁哲;
刘海隆;
郑心力;
刘圈炜;
黄丽丽;
邢漫萍;
王峰
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摘要:
依据北京市地方标准DB11/T828.3—2011《实验用小型猪第3部分:遗传质量控制》,在DNA水平上对封闭群五指山小型猪进行种群遗传分析.通过利用多重PCR和基因扫描技术对封闭群五指山猪33微卫星位点进行遗传检测,统计各个基因座的杂合度及期望杂合度、有效等位基因数、多态信息含量、固定指数和Shannon信息熵.结果表明,33个微卫星位点在WZSP封闭群中平均等位基因数为6.42,平均杂合度为0.66,期望杂合度平均值为0.69.此外,总群体在33个位点多态信息含量的平均值为0.65,平均固定指数为0.05.说明封闭群五指山小型猪群体具有一定的遗传稳定性,符合封闭群动物的遗传结构特征,所选微卫星位点可用于五指山小型猪遗传多样性评估.
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周明亮;
陈明华;
庞倩;
杨平贵;
李燕
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摘要:
本文旨在研究布拖黑绵羊群体的遗传特性,选择了位于绵羊染色体上的30个微卫星标记,统计等位基因、多态信息含量、杂合度等,分析布拖黑绵羊群体的遗传多样性.结果表明,布拖黑绵羊群体30个微卫星标记具有4 ~13个等位基因,平均为7.27个等位基因;30个微卫星标记的观察杂合度为0.3269~0.8846,平均为0.6269;期望杂合度为0.3620 ~0.8865,平均为0.6769;多态信息含量为0.3338~0.8660,平均为0.6257,显示布拖黑绵羊群体具有丰富的遗传多样性.
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杨清芳;
李祥龙;
周荣艳;
李兰会
- 《第二届京津冀畜牧兽医科技创新论坛暨第六届新思想、新方法、新观点“首农杯”论坛》
| 2010年
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摘要:
利用8个微卫星标记(ILSTS087、BMS1248、BMS574、BMS1678、BMS2508、BM6526、BM1329、GC101)分析了雷州黑山羊、南江黄羊和唐山奶山羊三个山羊群体的分子水平上的遗传多样性;结果表明:8个微卫星位点均为高度多态位点,可以用于山羊群体遗传多样性的评估;平均多态信息含量(PIC)达0.6686~0.8225;平均杂合度(H)达0.6158~0.8225;证明5个山羊种群具有丰富的遗传多样性和广泛的遗传基础。以Nei氏标准遗传距离为基础的UPGMA聚类结果表明:南江黄羊与唐山奶山羊首先聚到一起,而没和雷州黑山羊先聚;说明雷州黑山羊与它们的亲缘关系较远,且群体间的遗传变异较大。
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龚道清;
张红;
张军;
赵旭庭;
段修军;
杨廷桂;
陈章言;
高玉时
- 《第十三次全国动物遗传育种学术讨论会》
| 2005年
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摘要:
本研究利用9个微卫星标记对11个鸭品种的平均基因杂合度、平均多态信息含量以及群体间的遗传距离进行分析,并根据遗传距离对这11个鸭品种进行了聚类分析,分析了它们之间的亲缘关系.结果表明:11个鸭种的平均基因杂合度为0.6599;平均多态信息含量为0.5966.其中,黑羽番鸭(白头)平均基因杂合度最高,为0.6948,遗传多样性最丰富;荆江麻鸭平均遗传杂合度最低,为0.5757.以基因频率为基础计算了Nei氏标准遗传距离Ds,根据遗传距离构建NJ系统发生树时,结果苏牧白羽鸭、苏牧黑羽鸭、龙白鸭、苏牧麻鸭、荆江麻鸭位于树的一侧;黑羽番鸭(纯黑)、黑羽番鸭(白头)、白羽番鸭、山麻鸭、金定鸭、高邮鸭位于一致树的另一侧.
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蒋思文;
黄金书;
乔云芳;
郑嵘;
李凤娥;
熊远著
- 《中国畜牧兽医学会第十二次全国动物遗传育种学术讨论会》
| 2003年
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摘要:
微卫星标记是20世纪80年代发展起来的一种能有效区别不同物种、不同群体及不同基因型个体,建立在聚合酶链式反应基础上的分子标记.它具有在基因组中数量大,在各真核生物基因组随机分布,多态信息含量等特点,因而被广泛应用.本文用猪的1号染色体上的3个微卫星标记对40头梅山猪、15头大白猪和70头大梅猪的F代个体DNA样本进行遗传多样性分析,通过试验获得了3个微卫星位点在各个群体中的遗传数据,研究结果表明:SW1970位点在3个群体中的杂合度和多态信息含量相对较低,而SW1301与SW974两个位点在3个群体中的杂合度和多态信息含量都较高.
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陈国宏;
王得前;
吴信生;
张学余;
王克华;
成荣;
刘博;
徐琪;
周群兰
- 《中国畜牧兽医学会第十二次全国动物遗传育种学术讨论会》
| 2003年
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摘要:
利用7个微卫星标记对12个地方鸡品种的等位基因频率、平均基因杂合度、平均多态信息含量以及群体间的亲缘关系进行分析.结果表明:鹿苑鸡平均基因杂合度最高,为0.5929,遗传多样性最丰富;茶花鸡平均遗传杂合度最低,为0.3514.各地方鸡品种模糊聚类结果显示:乌骨鸡与斗鸡先聚在一起,然后依次与狼山鸡、大骨鸡、萧山鸡、油鸡、鹿苑鸡5个兼用型地方鸡品种聚为一类;茶花鸡与藏鸡先聚在一起,然后与仙居鸡、白耳鸡2个蛋用型鸡品种聚为另一类;固始鸡自成一类.