遗传标记

摘要： 育种是高考遗传部分的重要命题素材,2017年北京理综第30题以单倍体育种为背景,介绍了一种通过单倍体诱导系诱导玉米结出一定比例的单倍体籽粒,再利用遗传标记筛选出单倍体的方法。本文深入挖掘其命题背景,设计了以“通过单倍体育种技术提高玉米产量”为主题的高三复习课,以促进学生知识的梳理和体系的构建。

摘要： 油莎豆是一种高产、优质,集粮、油、牧、饲于一体,开发潜力大,综合利用价值很高的新兴经济作物.本文综述了油莎豆的生物学特性、主要功能及遗传学研究进展,探讨了油莎豆遗传育种研究过程中存在的主要问题及发展方向,以期为今后油莎豆的研究提供参考.

摘要： 在法医检案过程中,如何从降解生物检材中获得正确的DNA分型是法医学界的一个难题.本文对降解生物检材DNA分析研究取得的新进展进行综述,从检案的各个环节出发对近年来提高DNA分型成功率的方法和技术进行了详细介绍,例如新型遗传标记的开发和二代测序技术的应用等.希望为降解检材的分析提供新的思考和方法.

摘要： 单核苷酸多态性(SNP)属于第三代遗传标记,因其二态性、广泛性、易于自动化检测等特性而成为研究热点.SNP广泛应用于遗传图谱构建、基因定位、进化分析研究以及标记辅助选择和亲缘关系鉴定等方面.本文对SNP的形成、分类、检测方法以及SNP检测技术的发展和在畜禽中的研究与应用进行综述,分析了各类SNP检测方法的优缺点,为推动SNP检测技术的快捷化、精确化、经济化及拓展其应用领域提供参考.

摘要： 为探究寡腺苷酸合成酶1(oligoadenylate synthase 1,OAS1)基因多态性与松辽黑猪繁殖性状的关联性,试验选取130头松辽黑猪母猪为研究对象,利用Sanger直接测序法测序查找OAS1基因外显子1～8的SNP位点,使用SPSS 19.0软件分析OAS1基因SNP位点与松辽黑猪繁殖性状的关联性.结果 显示,在松辽黑猪OAS1基因外显子2、3和6上共检测到33个突变位点;其中在外显子2的110 bp处存在1个SNP位点(G110C),存在3种基因型:GG、GC和CC;在外显子3的176 bp处存在1个SNP位点(C176T),存在3种基因型:CC、CT和TT;在外显子6的145 bp处存在1个SNP位点(C145T),存在3种基因型:CC、CA和AA;在166 bp处存在1个SNP位点(G166A),存在3种基因型:GG、GA和AA;在206 bp处存在1个SNP位点(A206G),存在3种基因型:AA、AG和GG.卡方适合性检验结果显示,松辽黑猪OAS1基因G110C突变位点符合Hardy-Weinberg平衡状态,C176T、C145A、G166A和G206A位点均偏离Hardy-Weinberg平衡状态.群体遗传参数分析结果显示,各SNPs位点遗传杂合度均位于中等水平,为中度多态(0.25＜ PIC＜0.5).关联分析结果发现,G110C位点GC基因型个体总产仔数、产活仔数和断奶仔猪数均显著高于GG基因型个体(P＜0.05);C176T位点CT基因型个体断奶仔猪数显著高于CC基因型个体(P＜0.05);C145T位点CC基因型个体总产仔数和产活仔数均显著高于AA基因型个体(P＜0.05);G166A位点GA基因型个体断奶仔猪数显著高于GG基因型个体(P＜0.05);A206G位点GG基因型个体总产仔数和产活仔数显著高于AA基因型个体(P＜0.05).结果 表明,OAS1基因外显子区存在突变位点,对松辽黑猪部分繁殖性状有显著性影响.

摘要： 试验旨在探究松辽黑猪NR5A2基因多态性及其与繁殖性状的关联性.选取130头松辽黑猪作为研究对象,利用PCR直接测序法查找NR5A2基因6个外显子的SNP位点,通过HRM分型技术分析SNP位点的多态性,使用SPSS 19.0软件分析NR5A2基因SNP位点多态性与母猪总产仔数、产活仔数、仔猪初生重、3周龄重、断奶重及断奶仔猪数、乳头数的关联性.结果显示,松辽黑猪NR5A2基因第6外显子上存在1个SNP位点(C99T),检测到3种基因型:CC、CT和TT.群体遗传参数分析及卡方适合性检验结果显示,该SNP位点在松辽黑猪群体中处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),但C/T突变位点杂合度相对较低,在松辽黑猪群体中的变异较小,属于中度多态(0.250.05).综上所述,NR5A2基因第6外显子存在突变位点C99 T,与松辽黑猪产仔数存在显著关联性,但该突变位点能否作为松辽黑猪产仔数的遗传标记,需要对更大的群体进行进一步研究.

摘要： 目的 探讨多种遗传标记在一起同母异父半同胞关系鉴定中的综合应用.方法 采用常染色体STR遗传标记、Y染色体STR遗传标记、线粒体DNA遗传多态性对甲和乙进行基因分型,根据分型结果,采用IBS法、ITO法和判别函数法进行半同胞关系的判定.结果 依据常染色体STR基因分型结果,IBS法评分结果无法判断甲与乙之间存在全同胞关系;通过ITO法和判别函数法分析计算,提示甲与乙存在半同胞亲缘关系;进一步依据Y染色体STR基因分型结果,排除了甲和乙来源于同一生父,同时线粒体DNA高变I区多态性检测结果提示甲与乙来自同一生母,支持甲与乙为同母异父半同胞关系.结论 综合应用多种遗传标记和判定方法对同母异父半同胞关系的鉴定有着重要的意义.

摘要： 目的：本次研旨在对鸡Myoz3基因的开放阅读框进行克隆,对时空表达特征进行分析,并对遗传标记进行筛选. 方法：利用直接扩增的方式克隆Myoz3基因的开放阅读框(ORF).利用RT-qPCR分析Myoz3基因mRNA在矮脚黄鸡以及艾维茵肉鸡两个品种中的时空表达规律,通过直接测序的方法分析Myoz3基因在不同品种中的多态性,并根据多态性位点筛选出适合的分子标记辅助育种. 结果：在本次研究中发现,Myoz3蛋白的分子质量大约为26KD,序列和火鸡Myoz3蛋白具有97％的相似性,并与野鸭有76％的相似性.Myoz3在胸肌和腿肌中表达量较高,而在心脏和肝脏中表达量较低(P＜0.05),同时性别一个影响Myoz3表达量的重要因素,Myoz3的表达在不同性别之间展现出了不同的时间表达变化趋势(P＜0.05).之后使用了直接测序的方法鉴定了Myoz3基因的多态性,并在矮脚黄鸡种发现了5个SNp位点,而在艾维茵中发现了3个.通过分析这些SNP位点对应的基因型和生产性状之间的关系,发现,c.516C＞T位点对生产性状有影响,拥有基因型AA的个体在胫骨长度以及胸肌的亮度(L*)上具有明显优势(P＜0.05).又根据这些SNp的连锁关系构建了单倍体基因型以及双倍体基因型,并发现具有双倍体基因型H1H3的个体有最长的胫骨围. 结论：在本次研究中鉴定的分子标记可以为育种工作提供帮助.

摘要： 微卫星遗传标记方法的研究,有助于加快动物育种进程.本论文系统阐述了微卫星标记与畜禽育种的应用关系,分析了微卫星标记在动物育种的应用概况,探讨了应用的发展趋势,旨在为微卫星的发展应用提供理论参考.

摘要： 单苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)标记是一种基于基因组水平的遗传标记,其丰富度高、密度大、易于进行基因分型,广泛应用于动植物育种、抗病性基因标记、优势品种筛选和疾病相关基因的鉴定中.本文首先对SNP遗传标记在动物群体遗传结构、遗传图谱构建、标记辅助选择、亲缘关系鉴定以及杂种优势等方面的应用进行介绍,其次简述了在人类疾病动物模型中SNP位点与某些疾病的关联性,以期将SNP分子标记技术更好的应用于人类临床疾病的研究中.

摘要： 目的：用间接ELISA法检测长爪沙鼠肝脏基因组DNA整体甲基化的水平,以用于今后评价沙鼠非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)模型及筛选甲基化水平的遗传标记. 方法：选取新生仔鼠6只(ZS组),3月龄鼠12只(正常对照组6只,标记为3Y组),高脂饮食诱发的模型组6只,标记为4M组),8月龄中老年鼠6只(标记为LN组),均为雄性,按组采集血清(新生鼠除外)用于总胆固醇(TC)、甘油三酯(TG)、高密度脂蛋白(HDL)、低密度脂蛋白(LDL)检测,同时采集肝脏标本二份,一份作常规HE染色的病理学观察,一份提基因组DNA,用ELISA法试剂盒检测肝脏基因组DNA整体甲基化的水平(即5-mc含量). 结果：模型组鼠及8月龄组沙鼠均出现高脂血症,血清TC及TG均不同程度地出现了显著上升,对照组鼠血脂正常.病理学检查发现,模型组与8月龄组肝脏出现较为明显的脂肪变性,而青年组肝脏无异常发现,新生仔鼠肝血窦中可见大量成堆分布有单核细胞和红细胞.肝脏基因组DNA整体甲基化检测结果看出高脂饲料诱导的模型组青年沙鼠＞新生仔鼠＞老龄鼠＞对照组青年鼠. 结论：间接ELISA法检测肝脏基因组DNA整体甲基化水平简便、迅速,成本低,可以作为评价其表观遗传学的一种方法.

摘要： 本研究旨在通过同源重组的方法建立一套有效的适用于布拉氏酵母菌的基因敲除体系.以URA3为目的基因进行敲除,通过两次PCR的方法将遗传标记扩增,然后进行酵母菌的转染将PCR产物导入到酵母菌基因组中,同时利用带有Cre的质粒实现筛选标记的重复利用,通过遗传标记的筛选得到突变株.最后将目的基因重新导入到突变株中,可以使突变株在营养缺陷型的培养基中生长.布拉氏酵母菌基因敲除系统的成功建立,为从分子水平上研究益生菌的作用机理、基因调控通路和机理提供了强有力的手段,以及进行功能基因的敲除、插入及染色体基因的替换,进而可以阻断微生物细胞的代谢旁路,减弱毒/副作用,强化目标产物的产量或质量奠定坚实基础.

摘要： 分子鉴定技术已成为鉴别中药材的常用手段,但普遍认为加工炮制过程会破坏药材DNA,所以不适用于汤剂和成药产品.这项研究,为探讨汤剂中会否存有药材的DNA,并建立多重聚合酶链式反应(Multiplex PCR)及DNA测序法以识别有关中药材.研究对象包括人参汤剂、西洋参汤剂,以及含人参的中药材复方汤剂.比较不同的药材粉末大小,DNA提取法,煮制时间,特异性引物长度,以确立PCR扩增的成功条件.结果表明,经长时间煮制,药汤内仍保留可用于鉴别的特异DNA.此项发现,首次表明DNA鉴定技术适用于中药材汤剂,对推广应用DNA鉴别中药材至为重要。

摘要： 基于第二代转录组测序技术,对采集自河南省新郑市的粗柄羊肚菌(Morchella crassipes)M10菌株进行了深度转录组测序,分析了全转录组简单重复序列SSR(simple sequence repeat)分布和序列特征.结果表明:1)总计检测到13044个SSR位点,分布在8851条Trinity genes中,SSR在转录组序列中的平均密度为2067.77bp/个,远高于其他真菌,其中2858条Trinity genes中包含超过1个SSR位点,复合型SSR位点1925个.2)单碱基重复基元最多,为8600个,其中A/T重复类型远高于C/G重复类型,与多数大型真菌相同;其次是三碱基重复基元,为2497个,其中ACC/GGT,AGC/CTG和AGG/CCT重复类型占60％以上,且明显以GC的高频概率出现,在SSR分子标记或其他重复序列多态性标记的开发上,可优选富含GC的SSR设计引物.

摘要： 基于第二代转录组测序技术,对采集自河南省新郑市的粗柄羊肚菌(Morchella crassipes)M10菌株进行了深度转录组测序,分析了全转录组简单重复序列SSR(simple sequence repeat)分布和序列特征.结果表明:1)总计检测到13044个SSR位点,分布在8851条Trinity genes中,SSR在转录组序列中的平均密度为2067.77bp/个,远高于其他真菌,其中2858条Trinity genes中包含超过1个SSR位点,复合型SSR位点1925个.2)单碱基重复基元最多,为8600个,其中A/T重复类型远高于C/G重复类型,与多数大型真菌相同;其次是三碱基重复基元,为2497个,其中ACC/GGT,AGC/CTG和AGG/CCT重复类型占60％以上,且明显以GC的高频概率出现,在SSR分子标记或其他重复序列多态性标记的开发上,可优选富含GC的SSR设计引物.

摘要： 基于第二代转录组测序技术,对采集自河南省新郑市的粗柄羊肚菌(Morchella crassipes)M10菌株进行了深度转录组测序,分析了全转录组简单重复序列SSR(simple sequence repeat)分布和序列特征.结果表明:1)总计检测到13044个SSR位点,分布在8851条Trinity genes中,SSR在转录组序列中的平均密度为2067.77bp/个,远高于其他真菌,其中2858条Trinity genes中包含超过1个SSR位点,复合型SSR位点1925个.2)单碱基重复基元最多,为8600个,其中A/T重复类型远高于C/G重复类型,与多数大型真菌相同;其次是三碱基重复基元,为2497个,其中ACC/GGT,AGC/CTG和AGG/CCT重复类型占60％以上,且明显以GC的高频概率出现,在SSR分子标记或其他重复序列多态性标记的开发上,可优选富含GC的SSR设计引物.

摘要： 基于第二代转录组测序技术,对采集自河南省新郑市的粗柄羊肚菌(Morchella crassipes)M10菌株进行了深度转录组测序,分析了全转录组简单重复序列SSR(simple sequence repeat)分布和序列特征.结果表明:1)总计检测到13044个SSR位点,分布在8851条Trinity genes中,SSR在转录组序列中的平均密度为2067.77bp/个,远高于其他真菌,其中2858条Trinity genes中包含超过1个SSR位点,复合型SSR位点1925个.2)单碱基重复基元最多,为8600个,其中A/T重复类型远高于C/G重复类型,与多数大型真菌相同;其次是三碱基重复基元,为2497个,其中ACC/GGT,AGC/CTG和AGG/CCT重复类型占60％以上,且明显以GC的高频概率出现,在SSR分子标记或其他重复序列多态性标记的开发上,可优选富含GC的SSR设计引物.

摘要： 本发明涉及一种青藏扁蓿豆EST‑SSR遗传标记位点，该EST‑SSR遗传标记位点是指通过青藏扁蓿豆幼苗转录组测序获得转录本，对转录本中SSR位点检测后，根据转录本上SSR位点侧翼序列设计的如序列表中SEQ ID NO.1~700位所示的引物核苷酸序列。其引物序列在青藏扁蓿豆和扁蓿豆基因组DNA中的扩增产物长度，为相同和接近如序列表中SEQ ID NO.1~700位所示的引物的预期扩增产物碱基序列长度。本发明青藏扁蓿豆EST‑SSR遗传标记位点可应用于青藏扁蓿豆和扁蓿豆种质资源商业性遗传多样性评价方面、青藏扁蓿豆和扁蓿豆商业化品种选育中以及青藏扁蓿豆和扁蓿豆功能基因商业化鉴定开发中。

摘要： 本发明涉及一种荧光标记的多态性遗传标记复合扩增体系及其试剂盒，用于扩增18个非CODIS‑STR基因座，1个CODIS‑STR基因座D2S1338，以及2个性别基因座；该扩增体系及其试剂盒中采用的扩增引物包含SEQ ID NO.1～42所述序列。本发明所述的复合扩增体系可以一次性同时扩增得到19个具有良好多态性和高个体识别力的STR基因座和2个性别基因座信息。本发明所述的试剂盒适用于人类生物样本，具有准确性高、灵敏度高、重复性好及抗抑制性强等特点，其为个体识别、亲缘关系鉴定、突变事件等司法鉴定提供了有效的补充检测手段。

摘要： 本发明涉及水产遗传育种领域，具体说是一种中华绒螯蟹多元高通量遗传标记系统及遗传分析方法。多元高通量遗传标记系统为线粒体序列信息系统和微卫星分子标记系统，其中微卫星分子标记系统为由7个EST-SSR标记的系统1和6个EST-SSR标记的系统2组成；方法：运用线粒体的三对引物扩增COI，Cytb和CR的序列的信息作为分子标记，将混养家系中同一母本和不同母本所产的后代根据遗传结构和遗传多样性分开，再运用EST-SSR微卫星分子标记，将已区分母本的后代根据遗传距离和遗传多样性进行父本的区分，从而完成中华绒螯蟹遗传育种过程中的系谱认证并确认近交系数。本发明在有效利用物种遗传信息的基础上，使用多元高通量遗传标记系统区分子代之间的亲缘关系，同时有效避免近交衰退。

摘要： 本发明涉及水产遗传育种领域，具体说是一种三疣梭子蟹多元高通量遗传标记系统及遗传分析方法。多元高通量遗传标记系统为线粒体序列信息系统和微卫星分子标记系统，其中微卫星分子标记系统为由7个SSR标记的系统1和6个SSR标记的系统2组成；方法：运用线粒体的三对引物扩增COI，16S和CR的序列的信息作为分子标记，将混养家系中同一母本和不同母本所产的后代根据遗传结构和遗传多样性分开，再运用微卫星分子标记，将已区分母本的后代根据遗传距离和遗传多样性进行父本的区分，从而完成三疣梭子蟹遗传育种过程中的系谱认证并确认近交系数。本发明在有效利用物种遗传信息的基础上，使用多元高通量遗传标记系统区分子代之间的亲缘关系，同时有效避免近交衰退。

摘要： 本发明公开了一组高效能常染色体微单倍型遗传标记以及用于检测该组遗传标记的引物组。本发明提供了一种引物组，由398种引物组成；引物为单链DNA分子；398种引物的核苷酸序列依次如序列表的序列1至序列398所示。本发明还保护所述引物组在制备法医鉴定试剂盒中的应用。本发明还保护所述引物组在制备亲缘关系鉴定试剂盒中的应用。本发明中，发明人筛选得到了301个在千人基因组数据中Ae达到4以上的候选微单倍型。针对这301个候选基因座设计特异性引物，复合成了一套高分辨率微单倍型基因座多重检测体系。该体系共包含199个常染色体微单倍型。利用Miseq FGx平台检测得到两个样本的199个基因座均具有良好的均衡性。本发明对于法医鉴定和亲缘关系鉴定具有重大的应用推广价值。

摘要： 本发明属于分子生物学和遗传学领域，具体公开了一种群体区分和鉴定的遗传标记参照系的构建方法及遗传标记参照系。所述构建方法包括对遗传标记数据进行数据分割和遗传标记挑选，或视情况对分割后的数据进行过滤，或对挑选后的遗传标记进行整合优化。采用本发明所述的方法可成功地使计算的复杂度从O(2

摘要： 本发明公开了用于开发遗传标记的成套试剂和高通量测序开发遗传标记的方法。本发明所提供的用于开发遗传标记的成套试剂，由接头A、接头B和限制性内切酶BcoDI组成，所述接头A由序列1所示的单链DNA和序列2所示的单链DNA组成，所述接头B由序列3所示的单链DNA和序列4所示的单链DNA组成。实验证明，本发明提供的用于高通量测序的成套试剂中的接头A和接头B，能够连接到DNA片段的两端，运用本发明的用于高通量测序的成套试剂以及建库方法，成功的构建了DNA文库，并成功的运用在Illumina公司的二代测序的测序平台进行测序，获得大量的遗传标记位点。

摘要： 本发明涉及一种荧光标记的多态性遗传标记复合扩增体系及其试剂盒，用于扩增18个非CODIS‑STR基因座，1个CODIS‑STR基因座D2S1338，以及2个性别基因座；该扩增体系及其试剂盒中采用的扩增引物包含SEQ ID NO.1～42所述序列。本发明所述的复合扩增体系可以一次性同时扩增得到19个具有良好多态性和高个体识别力的STR基因座和2个性别基因座信息。本发明所述的试剂盒适用于人类生物样本，具有准确性高、灵敏度高、重复性好及抗抑制性强等特点，其为个体识别、亲缘关系鉴定、突变事件等司法鉴定提供了有效的补充检测手段。

摘要： 本发明涉及一种青藏扁蓿豆ESR‑SSR遗传标记位点，该ESR‑SSR遗传标记位点是指通过青藏扁蓿豆幼苗转录组测序获得转录本，对转录本中SSR位点检测后，根据转录本上SSR位点侧翼序列设计的如序列表中Man1~Man350所示的引物核苷酸序列。其引物序列在青藏扁蓿豆和扁蓿豆基因组DNA中的扩增产物长度，为相同和接近如序列表中Man1~Man350所示的引物的预期扩增产物碱基序列长度。本发明青藏扁蓿豆ESR‑SSR遗传标记位点可应用于青藏扁蓿豆和扁蓿豆种质资源商业性遗传多样性评价方面、青藏扁蓿豆和扁蓿豆商业化品种选育中以及青藏扁蓿豆和扁蓿豆功能基因商业化鉴定开发中。

摘要： 本发明涉及水产遗传育种领域，具体说是一种中华绒螯蟹多元高通量遗传标记系统及遗传分析方法。多元高通量遗传标记系统为线粒体序列信息系统和微卫星分子标记系统，其中微卫星分子标记系统为由7个EST－SSR标记的系统1和6个EST－SSR标记的系统2组成；方法：运用线粒体的三对引物扩增COI，Cytb和CR的序列的信息作为分子标记，将混养家系中同一母本和不同母本所产的后代根据遗传结构和遗传多样性分开，再运用EST－SSR微卫星分子标记，将已区分母本的后代根据遗传距离和遗传多样性进行父本的区分，从而完成中华绒螯蟹遗传育种过程中的系谱认证并确认近交系数。本发明在有效利用物种遗传信息的基础上，使用多元高通量遗传标记系统区分子代之间的亲缘关系，同时有效避免近交衰退。