遗传距离

摘要： 以201份西伯利亚杏种质为试材,根据枝、叶、果实、果核和果仁的45个表型性状,研究西伯利亚杏核心种质的最佳构建策略,筛选出核心种质。基于逐步聚类法,在25%取样比例下,通过3种取样方法,结合2种遗传距离和6种聚类方法筛选出36份核心种质,以筛选出的最佳构建策略进一步比较7种总体取样比例(15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%)的构建效果以确定最适宜的总体取样比例。根据最佳构建策略和最适宜总体取样比例进行分组取样,比较分组取样与不分组整体取样的优劣。结果表明:在西伯利亚杏核心种质构建中,3种取样方法中优先取样法最优;2种遗传距离中欧式距离优于马氏距离;6种聚类方法比较表明,最长距离法优于UPGMA、WPGMA、可变类平均法、离差平方和法、最短距离法;20%是最适宜的总体取样比例;评价参数表明分组取样效果不如整体取样,不予采纳;核心种质样品分布图与原种质具有相似的分布结构,具有很好的代表性。“优先取样法+欧式距离+最长距离法+20%取样比例”进行整体取样是西伯利亚杏核心种质构建的最佳策略,构建的核心种质经过优化补充后共44份,为西伯利亚杏良种选育及高效利用奠定了基础。

摘要： 【目的】李(Prunus salicina L.)是我国东北地区极具经济开发前景的树种,具有重要的社会、经济价值。通过分子标记技术对李进行遗传连锁图谱构建,为李新品种选育提供理论基础。【方法】以吉林6号和龙园秋李为作图亲本,利用SSR引物对F_(1)子代进行真实性鉴定,经多态性筛选,选出14条ISSR引物和16对SRAP引物用于遗传连锁图谱的构建,应用Join Map 4.0软件,结合“双假测交”理论构建李遗传连锁图谱。【结果】试验获得72个真实性F_(1)子代,ISSR引物和SRAP引物在F_(1)群体产生5种分离类型、120个标记位点,经软件分析获得1张拥有16个连锁群的遗传连锁图谱,该图谱总长度为528.5 cM,包含38个分子标记位点,连锁群平均长度为13.9 cM,最长的连锁群为71.1 cM、最短的连锁群为9.6 cM,多态性标记间最大遗传距离为52.8 cM、最小遗传距离为1.4 cM。【结论】研究获得的李遗传连锁图谱丰富了寒地李的遗传研究基础,有助于李QTL定位、分子标记辅助育种和基因定位研究。

摘要： 为揭示江西及周边地区地方鸡的遗传多样性信息,本研究采集了江西省5个地方鸡品种,广东省、浙江省以及江苏省各1个地方鸡品种共125个血样,利用全基因组SNP芯片分析地方鸡品种的群体结构、网络关系及系统进化情况。结果表明,8个地方鸡品种45647个位点的多态信息含量大多为0.25遗传距离在0.2549~0.3609,修水黄羽乌鸡和泰和乌鸡的遗传距离为0.2549,东乡绿壳蛋鸡和崇仁麻鸡的遗传距离为0.3069。安义瓦灰鸡与其它品种的遗传距离在0.2747和0.3408之间,其中安义瓦灰鸡和修水黄羽乌鸡遗传距离最近,和崇仁麻鸡遗传距离最远。结果表明,8个地方鸡品种有较丰富的遗传多样性,为以后品种开发利用提供遗传素材;不同地区的地方鸡没有明显的地域差异,品种间没有显著的遗传分化,两个乌鸡品种(泰和乌鸡和修水黄羽乌鸡)和安义瓦灰鸡品种有相对较近的遗传关系。

摘要： 中国已经成为全球鲜食玉米最主要生产和消费国家之一,解析我国鲜食玉米品种之间的遗传多样性和亲缘关系,对品种鉴定和品种培育具有重要的指导意义。本研究利用Illumina Maize 6K芯片对全国范围内的385个鲜食玉米品种进行全基因组扫描,了解群体结构,划分种质类群,估算品种间的遗传距离,揭示其遗传多样性。结果表明,5067个SNP标记在385个鲜食玉米品种中基因多样性平均0.406,变幅为0.097~0.500;多态信息含量(polymorphism information content, PIC)平均0.319,变幅为0.092~0.375。通过PCA分析和群体遗传结构分析一致表明,本研究所收集的品种主要划分为3个类群,分别为糯玉米类群(糯玉米和甜糯玉米,共185个品种)、温带甜玉米类群(123个品种)和热带甜玉米类群(77个品种)。两两品种间的遗传距离在0.132~0.472之间,平均值为0.37。通过FST分析检测到不同类群间有160个区域受到强烈选择,其中包括4个玉米籽粒淀粉合成途径的关键基因(sh2、su1、su2和wx1),进一步利用分子标记验证了sh2和DGAT1-2两个位点在鲜食玉米群体不同选择模式。本研究为我国鲜食玉米品种选育和改良提供了重要的理论指导。

摘要： 文章以基因重组形式为主线,将三种典型微生物(粗糙脉孢霉、噬菌体、枯草杆菌)的遗传分析实质进行剖析,变换了粗糙脉孢霉重组率计算公式,提出了枯草杆菌遗传分析新方式,归纳了不同微生物间基因重组及遗传分析的两个相同点、两个相异点,帮助生物学专业学生掌握微生物遗传分析的方法,提高学习效果.

摘要： 为鉴定斑地锦(Euphorbia maculata L.)及其混淆品,以广西采集的41份斑地锦及其混淆品为研究对象,提取其基因组DNA,对各个样品的条形码rbcL和psbA-trnH序列进行扩增并测序,与GenBank下载的13份斑地锦及其混淆品rbcL和psbA-trnH序列进行了分析比对,计算了斑地锦及其混淆品的种内、种间遗传距离并采用邻接法构建了系统发育树。结果发现,斑地锦种内遗传距离明显小于其与混淆品的遗传距离,系统发育树中斑地锦样品聚为单系并能够与其混淆品明显区分开,这表明rbcL和psbAtrnH序列可用于斑地锦及其常见的混淆品的鉴别。

摘要： 【目的】如何保护生物多样性是当今生命科学中一个亟需解决的热点问题。从定量研究角度来看,物种的均匀性测度是构成物种多样性测度的重要组成部分,物种均匀性已成为表征生态系统稳定性的重要指标。种的多度均匀分布是衡量现实群落物种均匀性的客观尺度,测度现实群落物种多度分布与其均匀分布的差异是表征物种分布均匀性的有效途径。【方法】本研究利用吉林省蛟河和甘肃省小陇山林区固定试验地数据,在修正经典的遗传绝对距离公式的基础上提出了物种多度分布均匀性测试方法(SE)。【结果】物种均匀性体现了各物种的数量与群落内所有物种数量的对比关系,反映了群落内各物种株数比率(多度)的均衡性。理论数据与实际调查数据分析均表明,修正的遗传绝对距离公式能有效地区分种多度分布的细微差异,提高了遗传距离公式在比较种群或群落的差异应用中的可信度和说服力。【结论】基于修正的遗传绝对距离公式的物种均匀性测度方法(SE)能够表达群落中种的多度分布的均匀性,具有很好的解析性;在进行生物多样性分析时,可结合SE的对比分析,解析造成群落多样性高低的原因,这为制定有的放矢的生物多样性保护策略提供了理论依据。

摘要： 线粒体COI基因在物种鉴定及系统进化研究中有着广泛的应用。本研究测定了德汉劳绵蟹和阿特拉斯平壳蟹的线粒体COI序列,并从GenBank数据库中下载了15种绵蟹科种类的COI基因序列。对这17种绵蟹种类的COI序列进行比较分析发现遗传密码具有简并性。遗传距离及序列相似性分析显示4个德汉劳绵蟹个体中的德汉劳绵蟹2和3鉴定有误;本研究中所有物种都能被区分开,表明COI基因可以作为绵蟹科物种鉴定的分子标记。基于COI序列构建的最大似然树、贝叶斯树和最大简约树在属间水平差异较大,且支持率均较低,暗示COI片段有限的信息位点不适用于绵蟹科的系统发育分析;但是3种方法构建的系统树均表明绵蟹科未定种1和6以及德汉劳绵蟹1和4分别为同一物种,与遗传距离及序列相似性结果吻合。本研究在识别隐种及发现新种方面具有十分重要的潜在价值,同时也为生物多样性保护管理提供决策参考。

摘要： 对茶树品种紫娟及其诱变后代进行生化成分分析和聚类分析。结果表明,春季、夏季紫娟及其诱变后代的生化成分含量各有差异,其中两季变异系数最大的是花青素含量,都达70%以上。通过微卫星标记进行遗传多样性分析,结果表明,紫娟与诱变后代相比,其遗传距离都大于0.7,其中亚群诱变后代ZJ07和ZJ15之间的遗传距离最大达0.9以上。生化成分分析和聚类分析都表明,紫娟及其诱变后代遗传多样性较丰富,特别是茶多酚的含量及变异系数,其中春茶的变异系数为13.99%,夏茶的变异系数较低,为6.57%,因此可以得出,样本间的遗传距离越大,茶多酚的含量越高。

摘要： 为探明贵州省东方蜜蜂Apis cerana遗传多样性及遗传分化现状,对贵州省9个地级市79个样点采集的东方蜜蜂样本线粒体DNA(mt DNA)COI-COII序列进行扩增与测序,分析其遗传多样性、遗传结构及亲缘关系。序列结果显示扩增后COI-COII序列长度约为760 bp,A+T平均含量(82.3%)明显高于C+G(17.7%),碱基偏移性明显。单倍型分析共发现33个单倍型,其中主体单倍型H1为9个地理群体共有。单倍型多样度分析表明平均单倍型多样度为0.802,其中黔南地区最高,遵义地区最低;平均核苷酸多样度为0.014,其中六盘水地区最高,黔西南及安顺地区最低。中性检验结果表明贵州省部分地区东方蜜蜂可能经历过群体扩张。9个地区样点的平均遗传距离介于0.0012~0.0044之间,其中毕节与黔东南地区间最大,为0.0044,安顺与黔南、遵义地区间最小,均为0.0012。在单倍型系统进化树中,79个样点东方蜜蜂可分为两个类群。研究结果为贵州省东方蜜蜂遗传分化研究、种质资源保护与开发利用提供参考依据。

摘要： 实验采用8个陆地棉材料按照NCⅡ设计配制15个F1,测定亲本及F1的油分和蛋白质含量及铃重、衣分和纤维品质,并分析了F1代的中亲和超亲优势.利用SSR分子标记,用118对多态性引物对亲本及其F1进行扩增,按Nei和Li公式计算亲本间的遗传相似系数(GS)和遗传距离(GD),结果显示:8个亲本间的遗传相似系数变幅为0.612～0.992,平均值为0.68208个亲本可分为3类.分子标记聚类结果与材料的遗传来源背景及系谱关系基本一致.亲本SSR遗传距离与Fi断裂比强度的高亲优势呈显著负相关;与铃重和马克隆值的高亲优势都达到了显著的正相关,与纤维长度的中亲优势、高亲优势都达到了显著和极显著的正相关;与F,的衣分呈极显著的负相关,和衣分高亲优势呈极显著的正相关,与其中亲优势相关不显著.

摘要： 利用SSR分子标记技术对云南8个甘蓝型油菜品种进行遗传多样性研究,并分析了它们之间遗传距离与杂种优势相关关系.结果表明杂交亲本间遗传距离与杂种优势存在一定的相关性,但并不显著.所以,分子标记技术难以用于预测油菜杂种优势.

摘要： 以紫花苜蓿(Medicago sativa)不育系MS-GN-1A为母本,恢复系MS178为父本组合构建BSA分离群体,获得的F1代均表现为雄性可育,在大田种植了221株F2代群体单株,盛花期将花粉颗粒染色后,显微镜下观察统计出,不育的F2代株数为57,可育F2代株数164,并没有观察到半不育植株.将所有植株划分为可育和不育两组,并构建可育和不育DNA混池,混池DNA从可育和不育植株组DNA中各随机抽取20个样品,以此对恢复基因定位.随机挑选160对已知的四倍体苜蓿SSR引物扩增基因池DNA,获得2个具有多态性的分子标记,分别是Mt2c12、AW166,初步定位Rf基因在类群Composite5上.将类群Composite5上的所有引物进行合成,进一步进行引物筛选,最终获得4个具有多态性的标记BI68、Mt2c12、BG267和AW776153,遗传距离分别为19.0、20.9、44.6和72.1cM.

摘要： 目的：以大头金蝇为例探讨DNA条形码在蝇类的种级鉴定水平上适用性,从而为国境口岸截获的蝇类提供一种高效、便捷的鉴定方法. 方法：2012年5月-2013年8月,在全国23个省市52个地点采集642头蝇类,其中208头大头金蝇,以及434头其他蝇类,共计14种,包括大头金蝇的近缘种肥躯金蝇.获取这些个体的DNA条形码序列,另外结合国际DNA条形码专用数据库(BOLD)中公开发布的98条大头金蝇的DNA条形码数据,分析其序列差异度及种内和种间的遗传距离. 结果：中国208头大头金蝇个体的和国际上公开的98条大头金蝇的DNA条形码序列差异度小于1％,与同属近缘种的差异约在2％左右,与同科不同属的种类间的差异在5-8％,不同科的种类之间的差异大于或者约等于10％.种内和种间存在着明显的遗传间隔(Gap). 结论：大头金蝇的DNA条形码种级鉴定结果可靠,其他蝇类种类的鉴定可以借鉴,该技术可以用于口岸截获蝇类的种级鉴定.

摘要： 目的：鉴定上海口岸鼠类,并研究大鼠属和小鼠属的进化关系.方法：扩增捕获鼠类的COⅠ、16S rRNA序列片段,比对确定鼠种,并构建进化树.结果：经比对,上海口岸捕获鼠类为褐家鼠和小家鼠2种.褐家鼠与大足鼠亲缘关系最近,黄胸鼠与黑家鼠亲缘关系最近.结论：根据遗传距离,并结合进化树拓扑结构能更好的鉴别不同物种.

摘要： 文中试验选取了金华猪、嵊县花猪、嘉兴黑猪、兰溪花猪、岔路黑猪、碧湖猪、淳安花猪等7个浙江省地方猪种和大白、长白、杜洛克3个外来猪种共491头,采用第二代测序技术,得到SNP座位53860个,并使用最大似然法计算遗传距离,结果表明:7个浙江省地方猪种之间的平均遗传距离为1.073,3个外来猪种之间的平均遗传距离为0.60,金华猪与长白猪之间的遗传距离最远,为2.031.构建的N-J系统进化树表明3个外来猪种首先归为一类,淳安花猪和嘉兴黑猪也较早归为一类,而岔路黑猪、金华猪和嵊县花猪相对其他猪种较远.这一研究结果为浙江省地方猪种的种质特性和进一步的开发利用提供了参考.

摘要： 本研究利用Illumina Bovine(26K)和Illumina Bovine(19K)低密度基因分型芯片,检测了6个本地黄牛品种、6个杂交品种和2个培育品种共计848个样本.通过主成分分析(PCA),研究样本大致分为三类:Ⅰ.浙江黄牛,Ⅱ.晋南黄牛,Ⅲ.西门塔尔血统牛.基于Nei’s遗传距离分析,14个中外牛品种的亲缘关系结果与主成分分析结果一致.为进一步证明分析结果的可靠性,本研究中又采用基于模型的群体分析方法,发现在K=3时样本明显分成三类群体,这与主成分分析的结果很好吻合.研究结果通过监控品种间分子遗传标记,准确的评定了种质遗传特性和相互间的关系,为我国地方黄牛品种种质资源评价、种质鉴定和培育品种的利用提供了科学依据.

摘要： 本研究对野外采集获得的l株野生侧耳属真菌进行rDNA-ITS序列扩增测序,通过序列分析初步确定其为肺形侧耳(Pleurotus pulmonarius),与本实验室中现有的秀珍菇菌株序列进行多态性分析后进一步确定该野生菌株与其他菌株间具有一定的遗传距离.以福建省认定的秀珍菇品种秀迪1号为对照菌株,对该菌株进行生物学特性进行研究,结果表明,其菌丝可在温度为5°C-45°C的范围内生长,最是生长温度为30°C;菌丝可生长的pH范围为pH3-pH10,最适pH值为7;在以可溶性淀粉、酵母粉为碳氮源的培养基中,菌丝生长速度快,长势好.本实验对该肺形侧耳菌株的初步研究,为秀珍菇新品种的开发、鉴定及驯化育种提供一定的理论基础.

摘要： 本研究分析青天葵及其混伪品matK序列,以期在分子水平建立青天葵及其混伪品的鉴别方法.采用一对通用引物对matK基因进行PCR扩增并测序,所得序列用DNAMAN、MEGA等软件进行分析.获得青天葵及其混伪品的matK基因序列长度为587 bp,平均GC含量为32.8％.青天葵种内遗传距离为0.000,与混伪品种间遗传距离范围为0.016至0.375.基于matK基因序列构建的NJ聚类树能明显地区别青天葵及其混伪品,因此应用matK基因序列可以有效鉴别青天葵及其混伪品.

摘要： 目的：研究不同当归栽培品种(系)的遗传关系. 方法：对17个样本基因组DNA进行ISSR-PCR分析,用Popgen1.32软件分析其遗传多样性及遗传距离,应用NTSYS软件构建Nefs遗传距离UPGM A聚类. 结果：用8条引物共扩增出45个位点,其中多态性位点39个,Popgen32软件分析结果表明,17个品种(系)的多态位点百分率为86.7％,Nei's基因多样性指数为0.2085,Shannon多样性指数为0.3402,总的遗传多样性水平较高.17个种源在遗传距离0.69处被聚为2类,品种DG yxl2008-081和品种DGyx12008-082为一类群,其余品种(系)为一类群. 结论：栽培当归在物种水平上遗传多样性较高,而不同当归栽培品种(系)间的遗传差异性较大.

摘要： 本发明公开了一种可保证安全距离的基于遗传算法的风电场风力发电机排布优化方法。对风力发电机进行选型；把风电场区域作为搜索域，在搜索域内随机生成风机的初始位置矩阵，作为算法的初始解，矩阵的每一行代表一种风机位置排布方案，矩阵的行数代表遗传算法每代的种群的个体数，对矩阵进行二进制编码；计算当前代每个个体的适应度，适应度函数设定为保持风机间安全距离且度电成本最低；根据每个个体的适应度值，求出当代最优，结合历史最优值记录，求出全局最优值及其对应的个体；本发明方法无须将风电场划分成正方形网格并进行选择，可以更有效的利用风电场范围内的土地资源和风资源，位置方案更加精确，实用性更强。

摘要： 一种蓝光下调控染色质长距离相互作用的光遗传学工具，涉及光遗传学领域。为蓝光诱导蓝光受体CRY2和CIB1形成蛋白复合体，调控染色质长距离相互作用的光遗传学工具，可实现在真核生物体内调控染色质长距离相互作用。在蓝光诱导蓝光受体CRY2和CIB1形成蛋白复合体，调控染色质长距离相互作用的光遗传学工具中，所述蓝光光受体CRY2和CIB1可以在酵母体内形成复合体，也可在动物实验中通过转基因动物模型实现光受体CRY2和CIB1的相互作用形成复合体。通过蓝光诱导的光受体CRY2和CIB1的相互作用形成复合体来实现调控染色体的长距离相互作用，从而证明此工具具有调控染色体高级结构的应用潜力。

摘要： UV‑B光下调控染色质长距离相互作用的光遗传学工具，涉及光遗传学领域。为UV‑B光诱导UV‑B光受体UVR8和COP1C340形成蛋白复合体，调控染色质长距离相互作用的光遗传学工具，实现在真核生物体内调控染色质长距离相互作用。在UV‑B光诱导UV‑B光受体UVR8和COP1C340形成蛋白复合体，调控染色质长距离相互作用的光遗传学工具中，所述UV‑B光受体UVR8和COP1C340可以在酵母体内形成复合体，或在动物实验中通过转基因动物模型实现光受体UVR8和COP1C340的相互作用形成复合体。

摘要： 本发明公开了一种不同安全约束下基于距离的车联网雾节点分簇方法，属于无线通信与计算技术领域。通过将道路安全类任务划分为制动类、平稳类以及加速类等具有不同时延要求的子类并设置相应的优先权，从而提高系统的安全系数；在满足一定安全约束下，通过量化雾节点计算服务能力来确定各雾节点分簇的最小规模；在系统总计算能力一定的情况下，确定最优的雾节点分簇个数。在上述确定的条件下，进一步利用基于距离的遗传算法对雾节点进行分簇。本发明可以提高系统安全系数，增强系统资源的可调配性，由该方法所得的分簇结果在欧几里德距离空间内具有很好的空间特性，并且该方法具有很好的普适性。

摘要： 本发明公开了一种基于遗传算法的长距离调水工程输水渠道糙率辨识方法，涉及水工设计参数测定。所述方法包括：确定目标函数和问题的解；进行初始化，得初始种群；采用一维水力学仿真模型计算初始种群中每个糙率值对应的多组工况下的上节制闸闸后水位，然后计算适应度；进行终止条件判别，如果符合终止条件，则该糙率值为最优解；如果不符合终止条件，对初始种群依次进行选择运算、交叉运算后，计算适应度，再进行终止条件判别，如果符合终止条件，则糙率值为最优解；如果不符合终止条件，则对交叉后的种群进行变异运算，计算适应度，再进行终止条件判别，直至得到糙率值的最优解为止。本发明将水力学模型与遗传算法相结合，辨识出各渠池糙率的最优值。

摘要： 本发明属于雷达技术领域，具体的说是涉及一种基于遗传算法优化的神经网络雷达一维距离像目标识别方法。本发明的方法首先通过对原始一维距离像进行选择和截断等预处理操作；其次，采用时段原则对数据集进行划分，同时对训练集中各目标进行二次等量随机抽取，获得两个同构训练子集；接着，本发明提出了神经网络与遗传算法双向优化的方法，利用训练网络在不同迭代次数时所产生的网络参数，初始化一定数目的染色体；然后，采用遗传算法对染色体进行交叉变异等操作；随后，根据所选最优染色体对新的神经网络识别系统赋初值，选择新的训练子集作为网络输入，采用随机梯度下降法对网络进行训练，加快了训练网络的收敛速度，同时提升了一定的识别率。

摘要： 本发明公开了一种基于遗传算法的正交相位编码信号抑制距离模糊的方法，包括：获取正交相位编码信号参数；基于正交相位编码信号参数，利用改进型遗传算法生成正交相位编码信号；该正交相位编码信号包括相互正交的L个相位编码信号；改进型遗传算法中的种群是以L个相位编码信号的子脉冲的相位为染色体的种群；染色体采用多进制实数编码；在L个连续的脉冲重复周期内依次间隔发射L个相位编码信号；接收回波信号，并使用目标区对应的目标相位编码信号对回波信号进行匹配滤波，得到目标区解模糊后的回波信号。本发明能够适应机载高速运动平台SAR高分辨、宽距离测绘带的需求，且计算量小，复杂度低，运算速度快。

摘要： 一种蓝光下调控染色质长距离相互作用的光遗传学工具，涉及光遗传学领域。为蓝光诱导蓝光受体CRY2和CIB1形成蛋白复合体，调控染色质长距离相互作用的光遗传学工具，可实现在真核生物体内调控染色质长距离相互作用。在蓝光诱导蓝光受体CRY2和CIB1形成蛋白复合体，调控染色质长距离相互作用的光遗传学工具中，所述蓝光光受体CRY2和CIB1可以在酵母体内形成复合体，也可在动物实验中通过转基因动物模型实现光受体CRY2和CIB1的相互作用形成复合体。通过蓝光诱导的光受体CRY2和CIB1的相互作用形成复合体来实现调控染色体的长距离相互作用，从而证明此工具具有调控染色体高级结构的应用潜力。

摘要： UV‑B光下调控染色质长距离相互作用的光遗传学工具，涉及光遗传学领域。为UV‑B光诱导UV‑B光受体UVR8和COP1

摘要： 本发明属于雷达技术领域，具体的说是涉及一种基于遗传算法优化的神经网络雷达一维距离像目标识别方法。本发明的方法首先通过对原始一维距离像进行选择和截断等预处理操作；其次，采用时段原则对数据集进行划分，同时对训练集中各目标进行二次等量随机抽取，获得两个同构训练子集；接着，本发明提出了神经网络与遗传算法双向优化的方法，利用训练网络在不同迭代次数时所产生的网络参数，初始化一定数目的染色体；然后，采用遗传算法对染色体进行交叉变异等操作；随后，根据所选最优染色体对新的神经网络识别系统赋初值，选择新的训练子集作为网络输入，采用随机梯度下降法对网络进行训练，加快了训练网络的收敛速度，同时提升了一定的识别率。