RAPD

摘要： 为探讨太子参 RAPD-PCR 的最佳反应体系条件,通过单因子试验对影响太子参 RAPD-PCR 扩增效果的因素,如模板 DNA 浓度、Taq DNA 聚合酶浓度、d NTPs浓度、引物浓度、延伸时间和循环数进行优化 .确立可用于太子参 RAPD-PCR 分析最适宜的反应体系,即 20 μL 反应体系中含 28 ng 模板 DNA,0.7 U Taq 酶,0.8μmol·L;引物,0.22 mmol·L;d NTPs;PCR 扩增延伸时间为 100 s,循环数 40 次 . 稳定性试验表明,该体系能在不同太子参品种间扩增出清晰明亮、稳定性、多态性好的条带.优化后的体系可用于太子参种质资源的鉴定.

摘要： 为了分析玉溪市典型烟区烟草黑胫病的发生动态与烟草疫霉遗传分化的关系,选用6条具有多态性的RAPD随机引物对玉溪市新平县和澄江市不同地理来源、海拔高度、寄主品种的164株烟草疫霉菌进行PCR扩增,利用NTSYS软件以UPGMA对扩增结果进行聚类分析,构建遗传系统树状图谱。结果表明:在0.84相似水平上,这些菌株可分为6组,其中146个菌株聚集在Ⅰ组,占89.02%,其他5组总和仅占10.98%,这说明新平县和澄江市的烟草疫霉在遗传上具有高度同源性,分化差异较小;供试菌株的群体基因型划分与地理来源没有直接关系,但与海拔高度、烟草品种有一定的关联。因此,通过种苗或其他工具使内部病菌频繁交流可能是导致少数病菌分化差异较大的原因之一。

摘要： 为揭示中国橄榄(Canarium album)种质资源的遗传多样性,采用ISSR和RAPD标记对橄榄主要分布区的86份种质资源进行遗传多样性分析并构建核心种质。结果表明,基于UPGMA遗传相似系数,86份种质资源可分为3个大类;基于STRUCTURE模型聚类,可分为4个类群,这基本符合橄榄的地域性分布规律。采用ISSR和RAPD获得的中国橄榄种质资源的整体遗传多样性水平分别为0.284±0.169和0.244±0.163,多态性位点百分率分别为92.56%和100%,总遗传分化系数分别为0.127和0.142,基因流分别为3.423和3.025,群体间遗传相似系数分别为0.930和0.939,个体间遗传相似系数分别为0.736和0.732。因此,中国橄榄种质资源丰富的遗传多样性主要来源于个体间的遗传分化或变异,且这种遗传多样性存在明显的地域性差异。

摘要： 藜麦蛋白含量高,营养价值丰富,受到国内外学者的广泛关注。为进一步研究藜麦种质资源的遗传特性,本实验以9个藜麦品种为材料,采用46个随机引物对不同藜麦品种的基因组DNA进行RAPD分析。实验结果表明:通过PCR扩增,一共获得了372条扩增条带,其中多态性条带134条,多态性比例为36%。由聚类分析发现9个藜麦品种之间的遗传相似系数在0.530~0.804之间。同时,9个藜麦品种可以划分为4类。第一类为QA13-8和SCL;第二类为QA13-13-1-23,它与其他品种的遗传距离较远;第三类为黄藜1号和土黄藜;第四类为红藜、黄藜、YY-6-6-Z、QA13-8-1-15。

摘要： 对收集到的10株大球盖菇进行聚类并进行亲缘关系的分析。方法:应用同工酶和RAPD技术对从美国、波兰和中国收集的10株大球盖菇菌株的遗传多样性进行了分析。结果:同工酶分析结果表明,大球盖菇菌株间遗传差异较大,最大的两类之间相似系数仅为0.0096,有5株相似系数在0.5000以下,St2、St4、St5间相似系数在0.5以上,特别是St4和St5相似系数为1.0000。RAPD分析结果显示,20个随机引物中有16个随机引物的扩增效果较好,分别扩增出8~21个条带,共扩增出241条条带,片段大小在200~4000 bp之间。结论:这些菌株之间的相似系数用UPGMA进行聚类分析可以看出,St2、St4、St5相似系数为0.8248聚为一类,说明它们之间的遗传关系较近,进一步从核酸水平验证了同工酶实验结果。本研究说明大球盖菇菌株间具有丰富的遗传多样性。

摘要： 【目的】玉米孢囊线虫(Heterodera zeae)为孢囊线虫属定居型半内寄生线虫,可侵染多种禾本科作物的根部,玉米孢囊线虫的发生和传播扩散将会对我国玉米生产造成严重威胁。本研究旨在建立玉米孢囊线虫的快速分子检测体系,以期从近缘属种可以准确地检测出玉米孢囊线虫,为玉米孢囊线虫的监测预警和防控打下技术基础。【方法】从我国河南、河北、甘肃、山东、湖南、广西和北京共收集20个玉米孢囊线虫近缘属种群体作为供试线虫;选取13条含有10个碱基的随机引物,采用RPAD技术对供试孢囊线虫进行多态性分析,筛出玉米孢囊线虫特异性RPAD片段,并将其转化为玉米孢囊线虫SCAR-PCR引物;采用PCR方法测试玉米孢囊线虫特异性引物的准确性以及检测技术体系的稳定性、灵敏度和实效性。【结果】通过RAPD比对分析,发现随机引物OPA03能在玉米孢囊线虫基因组DNA中扩增出一条468 bp的特异性片段;将该片段回收测序,根据片段序列信息,利用Primer 5.0设计一对特异性引物HzF1/HzR1;特异性检测结果表明,HzF1/HzR1仅在玉米孢囊线虫群体中扩增出大小为393 bp的特异性片段,其他5种16个孢囊群体(禾谷孢囊线虫、菲利普孢囊线虫、大豆孢囊线虫、旱稻孢囊线虫和甜菜孢囊线虫)和4个其他种群(水稻干尖线虫、马铃薯腐烂茎线虫、落选短体线虫和咖啡短体线虫)均没有扩增出目的条带;以含有玉米孢囊线虫的混合种群孢囊DNA为模板时,特异性引物HzF1/HzR1也能扩增出来单一明亮的393 bp的特异片段,而不含玉米孢囊线虫的混合种群不能扩增出该片段;该体系实现了玉米孢囊线虫准确、稳定的检测目的;对建立的玉米孢囊线虫快速检测技术体系灵敏度和实用范围测试,表明该检测体系对玉米孢囊线虫单个孢囊和单条幼虫均有灵敏的检测能力,检出值不低于1/2000个孢囊和1/80条2龄幼虫。【结论】本研究建立的玉米孢囊线虫SCAR-PCR快速分子检测技术,可用于玉米孢囊线虫单一样本和混合种群的快速检测,对玉米孢囊线虫的孢囊和2龄幼虫均有灵敏的检测能力,检测引物特异性强,检测方法便捷稳定,灵敏度高。

摘要： 采用20个随机引物对7个马铃薯品种的基因组DNA经过PCR扩增后进行RAPD检测,通过琼脂糖凝胶电泳进行了分析,得到88条扩增片段,其中具有遗传多态性的谱带有16条,多态性比率为18.18%。通过分析遗传相似系数,构建聚类分析图发现:丽薯6与冀张薯12之间的遗传相似系数最大(0.757),荷14与黑玫瑰之间的相似系数最小(0.480),由此可见7个不同马铃薯品种间具有一定的遗传多态性。

摘要： 为探究太子参种质资源的遗传多样性及亲缘关系,采用简单重复序列区间多态性(ISSR)和随机扩增多态性(RAPD)标记对来自不同产地的10个太子参种质进行遗传多样性分析。结果表明,13条ISSR引物和16条RAPD引物在10个太子参种质中分别获得101、89个扩增位点。其中多态性位点数(NPL)分别为58、63个,多态性位点频率(PPL)分别为57.37%、70.32%。基于ISSR标记的太子参种质间的观测等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Nei’s遗传多样性指数(H)和Shannon’s多态性指数(I)的平均值分别为1.5737、1.3443、0.3532、0.5297。基于RAPD标记的太子参种质间的Na、Ne、H和I的平均值分别为1.7032、1.4181、0.3549、0.5321。综合2种标记的GS为0.668~0.911。综合2种标记的聚类结果表明,当GS为0.780时,10个太子参种质可聚为4组,聚类分析结果与太子参种质的地理分布有明显的相关性。

摘要： 采用RAPD分子标记对16份柑橘材料其中包括11份琯溪蜜柚及其芽变种质进行遗传多样性分析,旨在为琯溪蜜柚芽变种质收集保护和合理开发利用提供参考。结果表明,15条引物总计扩增出117条条带,其中多态性条带为106条,多态性条带比例为90.48%;16份供试材料间的遗传距离为0.021~0.980;UPGMA聚类分析结果表明,RAPD分子标记能够将琯溪蜜柚及其芽变种质区分开,遗传距离为0.50时,16份材料分为2大类,一类由果实形状为卵形的琯溪蜜柚及其芽变种质和葡萄柚组成,另一类由果实形状为球形的琯溪蜜柚芽变种质和桔柚、长泰芦柑、酸桔组成。

摘要： 目的:通过鉴定27份番茄种质资源的亲缘关系,以提高番茄育种效率。方法:利用RAPD子标记技术和SPSS 16.0软件对番茄种质材料进行遗传多样性及亲缘关系聚类分析。结果:60条随机引物的有效率为63.3%,27份番茄种质材料PCR共扩增出196条带,多态性条带190条,多态性比率96.93%;当欧氏距离D值在17.5时,可将27份番茄分为4类。结论:RAPD分子标记技术可从分子视角给予番茄种质材料较全面、客观的评价与分析,为番茄优质品种的选育提供参考依据。

摘要： 西藏作为我国牦牛的主产区之一，因其特有的地理位置和生态环境条件形成了不同的品种或类群，丰富的遗传资源对于研究、保存和利用牦牛这一物种提供了素材。迄今对西藏牦牛的研究仅限于嘉黎牦牛、帕里牦牛、斯布牦牛、工布江达牦牛、类乌齐牦牛等少数品种或类群，其他较多品种(类群)并没有得到相应的研究，且很少从DNA水平上对其遗传分化、遗传结构进行系统的研究分析，利用RAPD标记研究西藏多个牦牛品种或类群的遗传多样性、亲缘关系及其分类尚属空白。

摘要： 西藏作为我国牦牛的主产区之一，因其特有的地理位置和生态环境条件形成了不同的品种或类群，丰富的遗传资源对于研究、保存和利用牦牛这一物种提供了素材。迄今对西藏牦牛的研究仅限于嘉黎牦牛、帕里牦牛、斯布牦牛、工布江达牦牛、类乌齐牦牛等少数品种或类群，其他较多品种(类群)并没有得到相应的研究，且很少从DNA水平上对其遗传分化、遗传结构进行系统的研究分析，利用RAPD标记研究西藏多个牦牛品种或类群的遗传多样性、亲缘关系及其分类尚属空白。

摘要： 西藏作为我国牦牛的主产区之一，因其特有的地理位置和生态环境条件形成了不同的品种或类群，丰富的遗传资源对于研究、保存和利用牦牛这一物种提供了素材。迄今对西藏牦牛的研究仅限于嘉黎牦牛、帕里牦牛、斯布牦牛、工布江达牦牛、类乌齐牦牛等少数品种或类群，其他较多品种(类群)并没有得到相应的研究，且很少从DNA水平上对其遗传分化、遗传结构进行系统的研究分析，利用RAPD标记研究西藏多个牦牛品种或类群的遗传多样性、亲缘关系及其分类尚属空白。

摘要： 西藏作为我国牦牛的主产区之一，因其特有的地理位置和生态环境条件形成了不同的品种或类群，丰富的遗传资源对于研究、保存和利用牦牛这一物种提供了素材。迄今对西藏牦牛的研究仅限于嘉黎牦牛、帕里牦牛、斯布牦牛、工布江达牦牛、类乌齐牦牛等少数品种或类群，其他较多品种(类群)并没有得到相应的研究，且很少从DNA水平上对其遗传分化、遗传结构进行系统的研究分析，利用RAPD标记研究西藏多个牦牛品种或类群的遗传多样性、亲缘关系及其分类尚属空白。

摘要： 利用随机引物AP-7，建立引物随机多态性扩增(RAPD)体系对71株引起内蒙古和贵州两地区奶牛乳房炎的金黄色葡萄球菌分离株进行基因分型研究.结果表明，71株金黄色葡萄球菌均得到清晰的RAPD指纹图谱，扩增产物在2-9条带之间，产物大小在240-4500 bp之问.菌株共分为6个基因型，其中I型17株(23.9%)，Ⅱ型3株(4.2%)、Ⅲ型33株(46.5%)Ⅳ型15株(21.1%)，V型2株(2.8%)、Ⅵ型2株(2.8%).I型为内蒙古地区的流行优势菌群，Ⅲ型为贵州地区的流行优势菌群.两地区各基因型菌株比例有明显差异，这可能与奶牛养殖业水平和环境差异有关。

摘要： 利用随机引物AP-7，建立引物随机多态性扩增(RAPD)体系对71株引起内蒙古和贵州两地区奶牛乳房炎的金黄色葡萄球菌分离株进行基因分型研究.结果表明，71株金黄色葡萄球菌均得到清晰的RAPD指纹图谱，扩增产物在2-9条带之间，产物大小在240-4500 bp之问.菌株共分为6个基因型，其中I型17株(23.9%)，Ⅱ型3株(4.2%)、Ⅲ型33株(46.5%)Ⅳ型15株(21.1%)，V型2株(2.8%)、Ⅵ型2株(2.8%).I型为内蒙古地区的流行优势菌群，Ⅲ型为贵州地区的流行优势菌群.两地区各基因型菌株比例有明显差异，这可能与奶牛养殖业水平和环境差异有关。

摘要： 利用随机引物AP-7，建立引物随机多态性扩增(RAPD)体系对71株引起内蒙古和贵州两地区奶牛乳房炎的金黄色葡萄球菌分离株进行基因分型研究.结果表明，71株金黄色葡萄球菌均得到清晰的RAPD指纹图谱，扩增产物在2-9条带之间，产物大小在240-4500 bp之问.菌株共分为6个基因型，其中I型17株(23.9%)，Ⅱ型3株(4.2%)、Ⅲ型33株(46.5%)Ⅳ型15株(21.1%)，V型2株(2.8%)、Ⅵ型2株(2.8%).I型为内蒙古地区的流行优势菌群，Ⅲ型为贵州地区的流行优势菌群.两地区各基因型菌株比例有明显差异，这可能与奶牛养殖业水平和环境差异有关。

摘要： 利用随机引物AP-7，建立引物随机多态性扩增(RAPD)体系对71株引起内蒙古和贵州两地区奶牛乳房炎的金黄色葡萄球菌分离株进行基因分型研究.结果表明，71株金黄色葡萄球菌均得到清晰的RAPD指纹图谱，扩增产物在2-9条带之间，产物大小在240-4500 bp之问.菌株共分为6个基因型，其中I型17株(23.9%)，Ⅱ型3株(4.2%)、Ⅲ型33株(46.5%)Ⅳ型15株(21.1%)，V型2株(2.8%)、Ⅵ型2株(2.8%).I型为内蒙古地区的流行优势菌群，Ⅲ型为贵州地区的流行优势菌群.两地区各基因型菌株比例有明显差异，这可能与奶牛养殖业水平和环境差异有关。

摘要： 家蚕（Bombyx mori. L)既是鳞翅目昆虫的模式昆虫,又是重要的经济动物，其品种资源丰富，品种间的遗传关系复杂，传统的家蚕分类方法一直是以形态学标记为依据的，对于基因型的准确鉴定较为困难。本文介绍了分子标记对现行家蚕品种亲缘关系及其多态性分析结果，浅谈了不同标记数及标记类型对亲缘关系及遗传距离分析的影响，阐述了分子标记对家蚕杂种优势的研究。

摘要： 家蚕（Bombyx mori. L)既是鳞翅目昆虫的模式昆虫,又是重要的经济动物，其品种资源丰富，品种间的遗传关系复杂，传统的家蚕分类方法一直是以形态学标记为依据的，对于基因型的准确鉴定较为困难。本文介绍了分子标记对现行家蚕品种亲缘关系及其多态性分析结果，浅谈了不同标记数及标记类型对亲缘关系及遗传距离分析的影响，阐述了分子标记对家蚕杂种优势的研究。

摘要： 本发明提供了一种桃叶卫矛的RAPD反应体系，属于生物学分子标记技术领域，所述RAPD反应体系总量为20μL，包括如下含量组分：模板DNA25～30ng，引物0.15～0.25μmol/L，MgCl22.50～2.70mmol/L，dNTP 0.10～0.15mmol/L，Taq DNA聚合酶1.75～2.50U，余量为ddH2O。本发明建立的桃叶卫矛的RAPD反应体系扩增出的条带清晰、完整，稳定性高，弥补了国内对桃叶卫矛遗传多样性研究的空白。

摘要： 本发明公开了一种用于区分丝瓜品种的RAPD引物，属于分子生物学分子标记领域。该方法通过设计筛选出的4个RAPD随机引物，其核苷酸序列如SEQ ID NO:1～4所示，用于扩增未知丝瓜品种的DNA，通过统计凝胶电泳后的谱带，区分出具有唯一特异性谱带的品种，并建立被区分品种的树形鉴别图。本发明的引物提高了RAPD反应的稳定性，操作简便，高效准确，节省引物，仅通过4次PCR就可轻松的将“长香玉”等20个丝瓜品种在分子水平上进行快速区分，所得到的品种鉴定图比聚类树更具有直观性，即根据品种鉴定图就可以快速找出能区分任意两个品种的引物，该方法可以实现丝瓜种苗早期鉴定，在其他物种上也具有广泛的通用性。

摘要： 本发明公开了一种用于鉴定西瓜品种苏蜜6号种子纯度的RAPD引物，包括引物JAASRP1059和JAASCR1036，引物JAASRP1059的序列为5'‑GTTGCCAGCC‑3'；引物JAASCR1036的序列为5'‑GTGACGTAGG‑3'。利用该RAPD引物能鉴定苏蜜6号种子纯度，首先提取苏蜜6号DNA，采用RAPD引物JAASRP1059和JAASCR1036，以西瓜杂交种苏蜜6号种子基因组DNA为模板进行PCR扩增；将扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳检测。通过比较DNA片段序列差异形成的多态性扩增片段及电泳图谱的位置差异，可以鉴定苏蜜6号遗传纯度，鉴定结果快速稳定可靠，而且操作简单方便。

摘要： 本发明涉及螺旋藻生产技术，旨在提供一种通过RAPD检测鉴别螺旋藻藻丝沥水性能优劣的方法。该方法包括：从培植池取钝顶螺旋藻藻液，用毛细吸管显微分离法挑取长度≥300μm的藻丝单体，培养成藻丝群体；对所得藻丝群体取样，然后进行随机扩增多态性DNA分析与检测；如果最终无法用引物S90扩增出590bp的条带，表明被鉴别藻丝具有良好沥水性能；反之，则表明被鉴别藻丝沥水性能差。本发明的方法基于RAPA技术鉴别螺旋藻藻丝沥水性优劣，与常规方法相比不仅简便、高效，而且成本低，并适合高通量筛检。

摘要： 本发明提供了一种桃叶卫矛的RAPD反应体系，属于生物学分子标记技术领域，所述RAPD反应体系总量为20μL，包括如下含量组分：模板DNA25～30ng，引物0.15～0.25μmol/L，MgCl22.50～2.70mmol/L，dNTP 0.10～0.15mmol/L，Taq DNA聚合酶1.75～2.50U，余量为ddH2O。本发明建立的桃叶卫矛的RAPD反应体系扩增出的条带清晰、完整，稳定性高，弥补了国内对桃叶卫矛遗传多样性研究的空白。

摘要： 本发明公开了一种用于猕猴桃的RAPD分子标记多态性选育方法及引物和试剂盒，该方法包含：以待测猕猴桃的基因组DNA为模板，以如SEQ ID.NO1所示的核苷酸序列或如SEQ ID.NO2所示的核苷酸序列为引物，进行PCR反应，根据PCR扩增产物的琼脂糖凝胶电泳条带判断待测猕猴桃的变异多态性：若PCR扩增产物与对照相比特异条带大于或等于1条，同时扩增条带大于或等于7条，则该枝条、种苗或果实为具有丰富变异多态性；如果PCR扩增产物与对照相比无特异条带，且小于7条扩增条带，则枝条、种苗或果实为非变异多态性枝条。本发明的方法提高了猕猴桃育种和筛选效率，缩短育种年限。

摘要： 本发明公开了一种用于区分大蒜品种的RAPD引物，属于分子生物学分子标记领域。该方法通过设计筛选出的3个RAPD随机引物，其核苷酸序列如SEQ ID NO:1～3所示，用于扩增未知大蒜品种的DNA，通过统计凝胶电泳后的谱带，区分出具有唯一特异性谱带的品种，并建立被区分品种的树形鉴别图。本发明的引物提高了RAPD反应的稳定性，操作简便，高效准确，节省引物，仅通过3次PCR就可轻松的将‘中蒜3号’等16个大蒜品种在分子水平上进行快速区分，所得到的品种鉴定图比聚类树更具有直观性，即根据品种鉴定图就可以快速找出能区分任意两个品种的引物，该方法可以实现大蒜种苗早期鉴定，在其他物种上也具有广泛的通用性。

摘要： 本发明公开了一种用于区分丝瓜品种的RAPD引物，属于分子生物学分子标记领域。该方法通过设计筛选出的4个RAPD随机引物，其核苷酸序列如SEQ ID NO:1～4所示，用于扩增未知丝瓜品种的DNA，通过统计凝胶电泳后的谱带，区分出具有唯一特异性谱带的品种，并建立被区分品种的树形鉴别图。本发明的引物提高了RAPD反应的稳定性，操作简便，高效准确，节省引物，仅通过4次PCR就可轻松的将“长香玉”等20个丝瓜品种在分子水平上进行快速区分，所得到的品种鉴定图比聚类树更具有直观性，即根据品种鉴定图就可以快速找出能区分任意两个品种的引物，该方法可以实现丝瓜种苗早期鉴定，在其他物种上也具有广泛的通用性。

摘要： 本发明公开了一种高精度RAPD检测系统，包括高速高分辨率图像采集模块、红外照明光源、瞳孔对光反射组件、视觉通道、反射镜、眼罩、主控板及内嵌于计算机中的高速高精度瞳孔追踪模块和数据处理控制模块。本发明可实时显示双侧瞳孔跟踪状态，并提供测量控制按钮，方便医师使用，一个医师即可完成所有操作；通过主控板、瞳孔对光反射组件及数据处理控制模块可实现多模式测试模式，客服了单一模式的劣势；通过双相机高速高分辨率图像采集模块实现了双相机双目同步成像，解决了单相机双目成像瞳孔成像畸变的问题；通过高速高精度瞳孔追踪模块和数据处理控制模块提高了测量精度。

摘要： 本发明公开了一种特异性鉴别和尚菱的RAPD‑SCAR标记及其鉴别方法。一条能够在和尚菱中扩增到的特异性DNA片段，该片段的核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示。根据此特异性片段的核苷酸序列，设计序列如SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4所示的一对引物，能够在和尚菱中扩增出特定长度的片段，而在其它欧菱品种或细果野菱中则不能扩增出该片段，从而实现对和尚菱的特异性鉴别。本发明操作简便、稳定可靠，是第一个应用于和尚菱品种的分子鉴定方法，可用于该品种的选种、育种、种植、采收和品种贸易等各环节中的快速鉴定，同时对保护苏州市优良地方品种的种质资源具有重要的意义。