ISSR

摘要： 以引进的冬种马铃薯品种为研究对象,通过ISSR-PCR分子标记技术对36个马铃薯品种进行分子标记鉴定,分析其遗传多样性,用DNA提取试剂盒提取马铃薯总DNA,筛选合适的引物,建立PCR扩增体系。结果表明:提取的总DNA质量较好,利用筛选出的9个引物经过PCR扩增后共得到81条清晰的条带,平均多态性条带比率达80.25%;聚类分析结果表明,36个马铃薯品种之间的遗传相似系数为0.78~0.91,以遗传相似系数0.80为阈值可以把36个马铃薯品种分为4大类,为冬种马铃薯的选育提供理论依据。

摘要： 为探索浙江省内不同地区野生鼠茅Vulpia myuros的遗传多样性水平及亲缘关系,以采自浙江省不同地区的25份样品及购自于市场的1份日本种源栽培种为试材,采用简单序列重复区间扩增多态性分子标记(intersimple sequence repeat,ISSR)技术分析其遗传多样性。结果表明,从100对ISSR引物中筛选出15对反应体系较稳定､扩增条带较清晰且多态性较多的引物;用15对引物在26份样品中共扩增出87条带,其中多态性条带中有效条带数量为83条,占总条带数的95.40%;26份种质间的遗传距离在0~0.707,其中,遗传距离最近的为来自衢州的7号种质和来自台州的13号种质,其遗传距离为0,这说明这两者亲缘关系非常近。同时,对26份样品进行聚类分析,在相似系数0.63处可划分为2类,第一类为除3号种质外的25份鼠茅种质,第二类仅为采自丽水的3号种质;在遗传相似系数为0.78处,可将第一类的25份样品进一步细分为两类,其中日本种质26号单独为一类,其余24份样品聚为一类。以上研究结果揭示了不同来源地鼠茅的遗传相似度高,为鼠茅的亲缘关系鉴定､规范化种植、资源保护和利用奠定了基础。

摘要： 【目的】研究不同地理种群的豚草和三裂叶豚草的遗传多样性水平和遗传结构。【方法】应用筛选的13条ISSR引物对8个豚草居群和7个三裂叶豚草居群共240个样品进行分子标记。【结果】8个豚草居群128个样品,共扩增出304条带,多态性位点比率为98.68%;Shannon′s信息指数为0.6716,Nei′s基因多样性指数为0.4788。7个三裂叶豚草居群112个样品,共扩增出266条带,多态性位点比率为95.86%;Shannon′s信息指数为0.6593,Nei′s基因多样性指数为0.4670。豚草和三裂叶豚草各居群遗传距离较近。【结论】豚草和三裂叶豚草在居群间具有一定的遗传稳定性;居群内具有丰富的遗传多样性。豚草和三裂叶豚草遗传变异主要来源于居群内部。豚草各居群遗传距离和地理距离有显著相关性,三裂叶豚草各居群遗传距离和地理距离无显著相关性。

摘要： 目的分析福建不同种源枇杷叶的遗传多态性。方法CTAB改进法提取枇杷叶总基因组DNA,采用ISSR分子标记分析遗传多态性,Arlqeuln和NTSYS-pc version 2.10e软件计算遗传距离并进行聚类分析。结果从100对ISSR引物中筛选出14对多态性丰富的引物,共扩增出79条多态性条带,占扩增总带数的52.67%,每个多态性引物多态性比例41.67%~61.53%。24份枇杷叶样本的遗传相似系数在0.1052~0.9473之间,分可为五个分支,遗传分化明显。枇杷叶的亲缘关系与地理分布的相关性不显著。结论不同种源枇杷叶具有显著的遗传多样性,ISSR可作为构建枇杷叶DNA指纹图谱的有效工具之一。

摘要： 【目的】评价甘蔗野生种质资源的遗传多样性,为甘蔗抗逆定向遗传改良挖掘具有育种潜力的种质资源。【方法】对44份甘蔗野生近缘种材料按照割手密种内、斑茅种内以及种间3个层次运用ISSR进行遗传多样性分析。【结果】44个种间材料利用13条ISSR引物扩增,获得261条条带,其中259条为多态性条带、占比为99%;种间多态性依次为甘蔗属割手密种>甘蔗属斑茅种>蔗茅属蔗茅种>芒属五节茅种>金茅属金茅种>河八王属河八王种;44份材料遗传相似系数为0.125~0.710,UPGMA聚类结果基本同形态学分类一致,12个斑茅种样品在0.805处聚合,斑茅和割手密在0.775处聚合,采自西藏察隅的编号A30、A32蔗茅关系密切,芒属、蔗茅属、河八王属的亲缘关系更近,与甘蔗属材料在0.73处聚合。【结论】甘蔗野生种质资源具有较高的遗传多样性,为甘蔗种质资源创新、遗传育种提供了种质材料和理论依据。

摘要： 为分析旱半夏组培苗的遗传稳定性,从100条UBC引物中筛选出6条引物,对野生旱半夏和不同继代数组培苗进行ISSR扩增。结果表明:从电泳条带的带型和强弱来看,野生型植株在继代过程中基本保持一致,野生型和第十一代组培苗之间的多态性位点百分率为0.88%,与继代六十代组培苗之间的多态性位点百分率为1.42%。这说明旱半夏能够在植物组织培养过程中保持较高的遗传稳定性。

摘要： 对204株菲律宾火焰兰(Renanthera philippinensis)组织培养衍生群体的26个主要表型性状和遗传多样性水平进行调查与分析,并利用ISSR分子标记对该群体的遗传多样性进行验证。结果表明:7个外观株型性状的遗传多样性指数为1.85,19个花部数量性状的遗传多样性指数为1.87。通过主成分分析,提取了7个主成分,累积贡献率达67.887%,其中导致菲律宾火焰兰群体中个体存在差异的主要性状有所有花枝是否同面、花瓣厚度等。对基于表型性状的数据进行聚类分析,204株菲律宾火焰兰组织培养群体被分为5大类群:第Ⅰ类群有78株,主要特点表现为叶片数多;第Ⅱ类群包含11株,主要特点为花序有较多的分叉数和花朵数;第Ⅲ类群包含31株,主要特征表现为花序的第一分枝的长度和叶长小于其他类群;第Ⅳ类群包含70株,主要特征是蕊柱的长度和宽度均小于其他类群;第Ⅴ类群有14株,主要特征为花梗直径和中萼宽度均大于其他类群。通过ISSR分子标记对该群体的遗传多样性进行验证,结果显示,2对ISSR分子标记引物在24株群体样本中共扩增出了17条多态性条带,平均每对引物扩增出8.5条多态性条带。该研究结果为火焰兰的品种改良提供了重要的遗传资源信息。

摘要： 为揭示中国橄榄(Canarium album)种质资源的遗传多样性,采用ISSR和RAPD标记对橄榄主要分布区的86份种质资源进行遗传多样性分析并构建核心种质。结果表明,基于UPGMA遗传相似系数,86份种质资源可分为3个大类;基于STRUCTURE模型聚类,可分为4个类群,这基本符合橄榄的地域性分布规律。采用ISSR和RAPD获得的中国橄榄种质资源的整体遗传多样性水平分别为0.284±0.169和0.244±0.163,多态性位点百分率分别为92.56%和100%,总遗传分化系数分别为0.127和0.142,基因流分别为3.423和3.025,群体间遗传相似系数分别为0.930和0.939,个体间遗传相似系数分别为0.736和0.732。因此,中国橄榄种质资源丰富的遗传多样性主要来源于个体间的遗传分化或变异,且这种遗传多样性存在明显的地域性差异。

摘要： 本研究通过ISSR分子标记技术对17份越南、缅甸茶树资源进行遗传多样性分析。5条ISSR引物共扩增出基因位点45个,多态性基因位点38个,多态性百分比88.44%;平均多态性的基因位点7.6个,其Nei’s基因多样性(H)为0.28,Shannon信息指数(I)为0.44;平均遗传相似性为0.704,介于0.489~0.867之间。通过聚类分析,在遗传相似性为0.61处,越南大叶种Y12被单独划分出来,其他资源被聚为一类;在遗传相似性为0.68处,17份茶树资源分为3大类群。本研究认为,17份茶树资源的遗传多样性丰富,个体间变异较大,可以作为茶树育种研究中的优良材料。该研究将为这些种质资源的利用和保护提供理论依据。

摘要： 【目的】明确草莓杂交品种及其亲本遗传背景。【方法】试验筛选出10条可用于草莓杂交品种及其亲本遗传背景分析的ISSR引物,利用该组引物对12份遗传背景复杂的草莓试验材料进行遗传背景分析。【结果】亲本之间、亲本与子代之间及亲本与组培变异株之间平均遗传距离分别为0.3258、0.2607和0.1981,平均遗传相似系数分别为0.6551、0.7478和0.7672,聚类分析和多维尺度分析均表明遗传背景比较狭窄,并证明本试验中的10条ISSR引物可成为草莓遗传背景分析的有力工具。【结论】草莓遗传背景分析将为其种质创新奠定基础。

摘要： 通过对菊黄东方鲀、双斑东方鲍及两者的正反杂交子代的ISSR标记分析，研究了2种子代群体之间以及子代群体与共享亲本个体间的遗传关系．使用10个ISSR引物，得到清晰的扩增位点154个，其中多态位点88个，平均多态位点检出率57．14％．分析结果显示：杂交子代个体中具有来自父母本的扩增位点，表明杂交子代确为杂种；杂交子代群体不仅具有较高的遗传多样性，而且在与亲本个体和其他子代群体间的遗传关系上表现出与种内交配子代的明显差异；另外杂交子代与2种亲本的遗传关系上并不对等，表现出明显的倾向性，更加偏向于母本一方。

摘要： 通过对菊黄东方鲀、双斑东方鲍及两者的正反杂交子代的ISSR标记分析，研究了2种子代群体之间以及子代群体与共享亲本个体间的遗传关系．使用10个ISSR引物，得到清晰的扩增位点154个，其中多态位点88个，平均多态位点检出率57．14％．分析结果显示：杂交子代个体中具有来自父母本的扩增位点，表明杂交子代确为杂种；杂交子代群体不仅具有较高的遗传多样性，而且在与亲本个体和其他子代群体间的遗传关系上表现出与种内交配子代的明显差异；另外杂交子代与2种亲本的遗传关系上并不对等，表现出明显的倾向性，更加偏向于母本一方。

摘要： 通过对菊黄东方鲀、双斑东方鲍及两者的正反杂交子代的ISSR标记分析，研究了2种子代群体之间以及子代群体与共享亲本个体间的遗传关系．使用10个ISSR引物，得到清晰的扩增位点154个，其中多态位点88个，平均多态位点检出率57．14％．分析结果显示：杂交子代个体中具有来自父母本的扩增位点，表明杂交子代确为杂种；杂交子代群体不仅具有较高的遗传多样性，而且在与亲本个体和其他子代群体间的遗传关系上表现出与种内交配子代的明显差异；另外杂交子代与2种亲本的遗传关系上并不对等，表现出明显的倾向性，更加偏向于母本一方。

摘要： 通过对菊黄东方鲀、双斑东方鲍及两者的正反杂交子代的ISSR标记分析，研究了2种子代群体之间以及子代群体与共享亲本个体间的遗传关系．使用10个ISSR引物，得到清晰的扩增位点154个，其中多态位点88个，平均多态位点检出率57．14％．分析结果显示：杂交子代个体中具有来自父母本的扩增位点，表明杂交子代确为杂种；杂交子代群体不仅具有较高的遗传多样性，而且在与亲本个体和其他子代群体间的遗传关系上表现出与种内交配子代的明显差异；另外杂交子代与2种亲本的遗传关系上并不对等，表现出明显的倾向性，更加偏向于母本一方。

摘要： 通过对菊黄东方鲀、双斑东方鲍及两者的正反杂交子代的ISSR标记分析，研究了2种子代群体之间以及子代群体与共享亲本个体间的遗传关系．使用10个ISSR引物，得到清晰的扩增位点154个，其中多态位点88个，平均多态位点检出率57．14％．分析结果显示：杂交子代个体中具有来自父母本的扩增位点，表明杂交子代确为杂种；杂交子代群体不仅具有较高的遗传多样性，而且在与亲本个体和其他子代群体间的遗传关系上表现出与种内交配子代的明显差异；另外杂交子代与2种亲本的遗传关系上并不对等，表现出明显的倾向性，更加偏向于母本一方。

摘要： 为比较云南甘蓝型油菜早熟品种与国内外其它品种间的遗传背景差异，对13份云南早熟材料与34份其它来源的材料进行了ISSR分析。从20个ISSR引物中筛选出13个具有多态性的引物，并利用这13个引物共检测出77个多态性位点，平均每个引物数为5.29个，平均多态性位点率为55.2％。基于47份材料的遗传相似系数矩阵进行的聚类分析显示，其遗传背景差异较大，可划分为4个类群。聚类结果不完全与其来源相一致，未能获得与早熟性状相关的聚类分布。

摘要： 为比较云南甘蓝型油菜早熟品种与国内外其它品种间的遗传背景差异，对13份云南早熟材料与34份其它来源的材料进行了ISSR分析。从20个ISSR引物中筛选出13个具有多态性的引物，并利用这13个引物共检测出77个多态性位点，平均每个引物数为5.29个，平均多态性位点率为55.2％。基于47份材料的遗传相似系数矩阵进行的聚类分析显示，其遗传背景差异较大，可划分为4个类群。聚类结果不完全与其来源相一致，未能获得与早熟性状相关的聚类分布。

摘要： 为比较云南甘蓝型油菜早熟品种与国内外其它品种间的遗传背景差异，对13份云南早熟材料与34份其它来源的材料进行了ISSR分析。从20个ISSR引物中筛选出13个具有多态性的引物，并利用这13个引物共检测出77个多态性位点，平均每个引物数为5.29个，平均多态性位点率为55.2％。基于47份材料的遗传相似系数矩阵进行的聚类分析显示，其遗传背景差异较大，可划分为4个类群。聚类结果不完全与其来源相一致，未能获得与早熟性状相关的聚类分布。

摘要： 为比较云南甘蓝型油菜早熟品种与国内外其它品种间的遗传背景差异，对13份云南早熟材料与34份其它来源的材料进行了ISSR分析。从20个ISSR引物中筛选出13个具有多态性的引物，并利用这13个引物共检测出77个多态性位点，平均每个引物数为5.29个，平均多态性位点率为55.2％。基于47份材料的遗传相似系数矩阵进行的聚类分析显示，其遗传背景差异较大，可划分为4个类群。聚类结果不完全与其来源相一致，未能获得与早熟性状相关的聚类分布。

摘要： 本试验以双环蘑菇Agaricus bitorquis、金针菇 Flammulina velutipes和杏鲍菇 Pleurotus eryngii 3种食用菌菌丝为材料,采用60Coу射线进行了200gy、500gy、800gy 3个不同剂量的辐射处理,并开展了菌丝生长试验、电导率测定和ISSR分析,研究结果表明:随着辐射剂量的增加,食用菌菌丝生长受抑制增强,双环蘑菇茵丝对60Coу辐射最为敏感,当辐射剂量增强到800Gy时,双环蘑菇菌丝失去活力;经非致死剂量辐射的3种食用菌菌丝均随着继代培养次数的增加,其萌发和生长速度加快,生长势增强,活力逐渐恢复.3种食用菌菌落经辐射处理后,其浸出液的电导率均随着辐射剂量的加大而增加,当金针菇和杏鲍菇菌落的辐射剂量为500Gy、双环蘑菇辐射剂量为200Gy以上时电导率显著高于对照.ISSR分析结果表明,3种食用菌菌丝的各辐射处理均与对照存在不同程度的多态性差异,经辐射处理后多态性条带数量发生变化,出现了特异性条带,既有新增的条带,又有缺失的条带.其中双环蘑菇变异最大,200gy和500gy辐射引起的ISSR变异率分别为33.3％和50.5％;金针菇变异最小,200gy、500gy和800gy辐射引起的ISSR变异率分别为2.3％、2.3％和3.1％;200gy、500gy和800gy辐射杏鲍菇菌丝引起的ISSR变异率分别为8.6％、13.4%20.0％.

摘要： 本发明公开了一种甘草ISSR荧光分子标记引物及其应用，本发明利用ISSR荧光分子标记技术对甘草材料进行总DNA提取、PCR反应体系优化及稳定性检测，筛选出带有ISSR荧光分子标记序列，将符合ISSR引物设计要求的序列进行ISSR引物开发，该引物对甘草属不同物种之间的鉴定和聚类分析具有重要意义能对甘草属内药用甘草物种与其近缘种进行区分鉴定，使得药用甘草物种与其近缘种容易被区分，避免了甘草药用情况混乱，确保了甘草临床用药的有效性和安全性。为甘草资源保驾护航。

摘要： 一种利用ISSR体系分析玉米螟种群遗传多样性的方法，它涉及玉米螟种群遗传多样性的方法；本发明是要解决目前没有一种有效的分子标记方法，尤其是ISSR分子标记方法用于鉴别玉米螟，尤其是亚洲玉米螟的不同地理种群的遗传结构及亲缘关系，从而明确玉米螟迁移变化情况的问题；本发明提供了一种利用ISSR体系分析玉米螟种群遗传多样性的方法。该方法是一种简单，易于操作的分子标记技术，该方法所选用的14条ISSR引物序列，在玉米螟中PCR扩增反应稳定，扩增片段清晰，多态性高，可为玉米螟资源鉴定、遗传多样性分析等科学研究提供技术支持。本发明应用于玉米螟领域。

摘要： 本发明公开了一种利用ISSR‑SCAR标记鉴别不育柱花草的方法，本发明提供了一段338bp能够在不育柱花草中扩增得到的特异性DNA片段和该序列的一对引物，可用于鉴别不育柱花草，本发明提供的鉴定不育柱花草的方法具有耗时短，操作简便，特异性强，鉴定准确且省时省力。为建立柱花草稳定的雄性不育系提供新的理论基础，为柱花草杂交育种奠定基础，具有很大的科学价值和应用价值。

摘要： 本发明公开了一种鉴定线纹香茶菜的ISSR‑SCAR引物、试剂盒、鉴定方法及应用，涉及分子标记与药材鉴定技术领域。ISSR‑SCAR引物包括上游引物和下游引物，上游引物的序列如SEQ ID NO.1所示，下游引物的序列如SEQ ID NO.2所示。本发明利用简单重复序列和延伸碱基作为SCAR分子标记。ISSR‑SCAR引物可以特异性的对线纹香茶菜的基因组进行扩增，具有特异性好、稳定性好的优点，可以快速的鉴定线纹香茶菜，可以避免因居群间的多样性而导致假阳性的发生。

摘要： 本发明提供了一种湖北贝母ISSR‑PCR扩增反应体系，每20μL反应体系中含有2×Taq Master Mix 10.5μL，模板DNA 0.8μL，引物2.2μL；将上述反应混合液按如下程序进行扩增：94°C预变性5min，然后94°C变性0.75min，50～60.0°C退火0.75min，延伸1.5min，共40个循环，最后72°C延伸10min，4°C保存。另外，本发明还提供了湖北贝母ISSR‑PCR分子标记方法。该发明所建立的湖北贝母ISSR‑PCR扩增反应体系扩增出的条带清晰度和稳定性高，具有很高的多态性的特点，弥补了现有对湖北贝母遗传多样性研究的不足；而且该湖北贝母ISSR‑PCR分子标记方法操作简单，节约时间和成本，结果稳定可靠，发明的成果对湖北贝母遗传多样性分析、种质资源鉴定及分子育种等方面有较好的应用价值。

摘要： 本发明公开了一种黄精ISSR‑PCR分子标记方法，涉及生物信息技术领域。本发明方法包括以下步骤：(1)提取黄精基因组DNA；(2)利用引物进行ISSR‑PCR扩增。利用本发明提供的黄精ISSR‑PCR反应体系和程序扩增的条带稳定性高，清晰度好，且呈现很高的多态性。该方法能简单、快速的鉴定黄精种质资源，节约成本，能够为黄精的正确开发利用、合理保护保存提供理论依据，为未来黄精的驯化、培育和分类研究提供更多的理论参考。

摘要： 本发明涉及一种利用ISSR引物鉴别黑鲷真鲷杂交子代的分子标记方法，包括利用1个ISSR分子标记对黑鲷及2个杂交子代新品系的个体进行PCR扩增，根据对PCR产物的电泳条带检测，区分来自黑鲷真鲷杂交子代的个体。本发明方法操作简便，费用低，准确度高且通用性好，能快速、有效地鉴别基于黑鲷真鲷亲本组合所得的杂交种新品系，为黑鲷杂交新品种选育研究的新种质鉴别研究提供技术帮助。

摘要： 本发明涉及一种区分黑鲷鱼及其两种杂交子代的ISSR分子标记方法，包括利用2个ISSR分子标记对黑鲷及2个杂交新品系的个体进行PCR扩增，根据对PCR产物的电泳条带检测，区分来自黑鲷、杂交子代及回交子代等3种鲷鱼的个体。本发明方法操作简便，费用低，准确度高且通用性好，能快速、有效地鉴别基于黑鲷的不同亲本组合所得的杂交种新品系，为黑鲷新品种培育研究和杂交新种质的鉴别研究提供技术帮助。

摘要： 本发明公开了一种番石榴ISSR‑PCR分子标记组合及其应用，其主要基于SEQIDNO：1～10组成的ISSR引物组实现鉴别番石榴遗传多样性分析的功能。且本发明中的引物组相对于传统方法，其能够在更大的样本量的情况下实现高精准度的测定工作，可识别的多态性高达89.68％。而且基于该方法，其条带分辨率更高，扩增片段更清晰，反应更加稳定，多态性识别度更高，可在短时间内完成大批量实验材料鉴定，能准确分辨番石榴种质资源间的亲缘关系，对番石榴种质资源的鉴定有重大意义。

摘要： 本发明公开了一种橄榄ISSR‑PCR分子标记组合及其应用，其主要基于SEQIDNO：1～10组成的ISSR引物组实现鉴别橄榄遗传多样性分析的功能。且本发明中的引物组相对于传统方法有效的减少了引物数量，并可以在更大的样本量的情况下实现高精准度的测定工作，可识别的多态性高达99.26％。而且基于该方法，其条带分辨率更高，扩增片段更清晰，反应更加稳定，多态性识别度更高，可在短时间内完成大批量实验材料鉴定，能准确分辨橄榄种质资源间的亲缘关系，对橄榄种质资源的鉴定有重大意义。