遗传关系

摘要： 滇黄精Polygonatum kingianum是我国传统名贵中药材,也是最具云南特色的药用植物资源。在大理州大理市挖色镇进行滇黄精资源收集和扩繁过程中,发现滇黄精资源在花被颜色上存在紫红花、白花和白花带紫斑3种类型,其中花被白花带紫斑为新发现类型。为明确3种花色滇黄精的遗传关系,对3种花色滇黄精的48个植株进行ISSR分子标记分析。结果表明,11条ISSR引物对48个植株样品进行扩增,共获得103条清晰条带,其中多态性条带有99条,多态性比率为96.1%,遗传一致度为0.89~0.91。遗传差异和UPGMA聚类分析显示,白花类型(P1)、白花带紫斑类型(P2)与紫红花类型(P3)的滇黄精均各自独立聚为一组,遗传距离上白花带紫斑类型(P2)与紫红花类型(P3)的亲缘关系较近,可知白花带紫斑类型(P2)是紫红花类型(P3)和白花类型(P1)的过渡类型或是白花类型与紫红花类型自然授粉所产生子代的一种杂合状态。本研究结果为滇黄精资源的遗传关系研究及分类鉴别奠定了一定基础。

摘要： 具有脂蛋白信号肽的蛋白参与细胞膜结构构建、细胞膜稳定性维护、信号转导和转运等过程,在维持细菌生理功能、致病性和耐药性等方面发挥重要作用.树生黄单胞杆菌是杧果生产中的重要病原之一,目前尚缺乏有关该菌脂蛋白信号肽蛋白的研究.本研究基于树生黄单胞杆菌的全基因组序列,通过LipoP v1.0在线程序分析,获取了175条具有脂蛋白信号肽的蛋白序列,并对这些蛋白开展了包括保守结构域、信号肽、跨膜区结构域、亚细胞定位和理化性质等的生物信息学分析.结果表明:144个脂蛋白氨基酸序列长度集中于100~500个之间;163条蛋白序列具有信号肽,仅有13条蛋白序列具有明显的保守结构域;90个蛋白定位在线粒体;这些蛋白在亲(疏)水性最强氨基酸残基及其位置方面存在较大的差异.此外,通过遗传关系分析进一步明确了与树生黄单胞杆菌中脂蛋白信号肽蛋白具有较高同源性和较近亲缘关系的其他物种,而大部分脂蛋白信号肽间的同源性并不高.

摘要： 从台湾含笑〔Michelia compressa(Maxim.)Sarg.〕自然授粉子代中发现18株表型明显变异单株,命名为‘中山含笑’(Michelia‘Zhongshanhanxiao’)。为明确‘中山含笑’的表型变异及遗传变异状况,弄清其遗传背景和亲缘关系,以‘中山含笑’18株单株、台湾含笑母树及其表型无变异子代单株为样本,在表型特征观察基础上,采用荧光毛细管电泳技术,利用5对SSR引物进行扩增和分析。结果显示:与母树相比,‘中山含笑’的整株、叶片和花的形状均无明显变化,但叶片和花的大小却变化明显;4年生‘中山含笑’的株高、地径、胸径、冠幅、叶长和叶宽分别是同龄表型无变异子代的1.41~1.55、2.49~2.97、2.79~3.16、2.38~2.74、1.40~2.04和1.50~2.17倍,且‘中山含笑’的叶长和叶宽以及花被片的长度和宽度均大于母树,花被片的长度和宽度分别是母树的3.50~4.53和4.33~7.00倍。SSR标记分析结果表明:母树与表型无变异子代的扩增结果完全一致,但与‘中山含笑’18株单株的扩增结果存在明显差异。5个SSR位点中,有4个在母树与表型无变异子代中为纯合位点,而这5个位点在‘中山含笑’大部分单株中为杂合位点。‘中山含笑’供试单株的观测等位基因数、有效等位基因数、观测杂合度、期望杂合度、Shannon’s多样性指数和Nei’s基因多样性指数分别为表型无变异子代的2.50、1.67、3.44、4.06、5.73和4.74倍。母树与表型无变异子代单株的遗传距离均为0.000,表明二者间无遗传差异;‘中山含笑’单株间的遗传距离为0.000~0.539,‘中山含笑’与母树的遗传距离为0.192~0.399,说明‘中山含笑’单株之间、‘中山含笑’与母树之间均存在遗传分化。通过聚类分析,在遗传一致度0.50处,可将供试样本分成2组,其中母树与表型无变异子代单株聚为Ⅰ组,‘中山含笑’18株单株聚为Ⅱ组;在遗传一致度0.64处,‘中山含笑’18株单株还可进一步分为4个亚组。综合分析结果表明:‘中山含笑’供试单株在表型性状上具有明显的超亲特征,且较表型无变异子代具有更高的遗传多样性;除含有台湾含笑母树的遗传信息外,‘中山含笑’供试单株还含有来源于母树之外的遗传信息,据此推测‘中山含笑’为台湾含笑与其他木兰科植物的种间杂交后代。

摘要： 代谢综合征是20世纪80年代末期国外学者列文提出的一个概念,该疾病尚未有明确的病因,是由于多种基因、环境共同、互相作用而成,与免疫、遗传关系密切,临床多表现为:腹部肥胖、超重、高血压、糖尿病、脂代谢异常等。脂肪肝主要是因为体内肝细胞内脂肪由于各种原因导致其堆积过多而发生病变,属于常见的肝脏病理改变,而非一种独立疾病。

摘要： 以花楸树〔Sorbus pohuashanensis(Hance)Hedl.〕为母本、少叶花楸〔S.hupehensis var.paucijuga(D.K.Zang et P.C.Huang)L.T.Lu〕为父本进行种间杂交,利用筛选出的9对扩增结果稳定且具多态性的EST-SSR引物,对杂交F_(1)代群体进行杂种鉴定,并对亲本和杂交F_(1)代群体的基因分离规律以及遗传多样性和遗传关系进行分析。结果显示:共获得184株杂交F_(1)代,其中175株在9个EST-SSR位点上均扩增出双亲条带,说明这些单株为真杂种,杂种率达95.1%;另9株在3~7个位点上呈现异常基因型,即缺失双亲条带或出现新条带。9对EST-SSR引物中,仅sorsd29在亲本中的扩增结果为aa×bb型(纯合互补型),其他8对引物在亲本中的扩增结果为aa×bc型(父本型)、ab×cd型(双亲互补型)或ab×ac型(杂合互补型),因而,在175株真杂种中,仅sorsd29位点未出现基因分离,另8个位点均出现了基因分离,经χ^(2)检验,F_(1)代分离比与期望分离比均无显著(P>0.05)差异。用9对EST-SSR引物从175株F_(1)代真杂种中共扩增出28个等位基因,观测等位基因数、有效等位基因数、多态性信息含量、Shannon s信息指数、观测杂合度和期望杂合度的均值分别为3.1、2.9、0.566、1.076、0.920和0.640。基于Nei s遗传距离,采用UPGMA法构建系统聚类图,结果显示:在Nei s遗传距离0.28处,少叶花楸单独成组Ⅰ,花楸树和175株F_(1)代单株聚为组Ⅱ;在Nei s遗传距离0.24处,组Ⅱ可进一步分为2个亚组,其中81株F_(1)代单株聚为亚组Ⅱ_(1),另94株F_(1)代单株与花楸树聚为亚组Ⅱ_(2)。综合分析结果表明:采用EST-SSR分子标记法可对花楸树和少叶花楸的杂交F_(1)代群体进行有效的杂种鉴定;获得的杂交F_(1)代单株的基因分离情况符合孟德尔分离定律,且与母本花楸树有较近的遗传关系;总体上看,杂交F_(1)代群体中175株真杂种的遗传多样性较为丰富。

摘要： 小麦种质烟农74(11)是20世纪70年代烟台农业科学院选育的小麦育种中间材料,衍生了鲁麦14、鲁麦13、烟农19等多个大面积推广品种,并以这些品种为育种亲本,选育出多个国审小麦品种,是近期山东省小麦育种的基础。选用烟农74(11)种质衍生品种(系)62份、非烟农74(11)种质衍生品种(系)58份,共计120份实验材料,采用小麦90K芯片,分析了供试材料的遗传关系。共获得26 026个有效SNP位点,其中A、B、D基因组各占32.17%、40.69%和7.64%。供试群体多态性信息含量(PIC)为0.18~0.31,平均为0.25,低于SSR标记揭示的遗传多样性。分析了全部材料组(组Ⅰ)和烟农74(11)衍生材料组(组Ⅱ)遗传相似性系数,发现组Ⅰ材料间的遗传相似性系数在0.61~0.70的占59.44%、0.71~0.80的占32.98%、≥0.91的占0.80%;组Ⅱ的遗传相似性系数在0.61~0.70的占26.77%、0.71~0.80的占53.22%、0.81~0.90的占17.26%,≥0.91的占2.75%,这表明烟农74(11)种质衍生后代间的遗传关系比较狭窄,需要拓宽遗传基础。此外,对几个经典小麦杂交组合进行了遗传相似性系数分析,发现子代和上缘亲本间的遗传相似性系数为0.68~0.87,平均为0.79;姊妹系间为0.84~0.87,父母本间为0.65~0.71。通过经典组合分析并结合当前小麦遗传关系狭窄的现实,建议在中短期育种目标中,双亲遗传相似性系数最好控制在0.8以下;在中长期育种目标中,双亲遗传相似性系数最好控制在0.7以下。

摘要： 环曲病毒(Torovirus)是有包膜的正链RNA病毒,可引起动物和人类肠道、呼吸道甚至全身感染。人类认识环曲病毒的历史较为简短:第一株马的环曲病毒(EToV)是于1972年在瑞士从一匹腹泻的马死亡前一周的直肠拭子中分离出来。在发现EToV 7年后,研究者在爱荷华州的一个奶牛群中通过电子显微镜(EM)在患有严重腹泻的小牛粪便样本中发现了形态相似的颗粒,将其定义为牛环曲病毒(BToV)。

摘要： 中国水仙Narcissus tazetta var.chinensis为多年生球根花卉,主要栽培品种有‘金盏银台’和‘玉玲珑’。通过正交试验建立适合中国水仙的SRAP-PCR体系:dNTPs 0.1 mmol/L,模板DNA 80 ng,Mg2+1.875 mmol/L,引物各0.15 mmol/L,Taq pol 2.5 U。100对引物对中有20对引物扩增出35条多态性条带,多态性比率为16.06%。二者亲缘关系分析结果遗传距离为0.185,遗传相似系数为0.835。说明SRAP分子标记技术可以用于近缘种的遗传关系分析。

摘要： 为探究晚熟桃新品种‘韦端蜜红’与‘颐红’间的亲缘关系,采用简单重复序列间扩增(ISSR)、相关序列扩增多态性(SRAP)两种分子标记技术对‘韦端蜜红’和‘颐红’等6份不同产地的桃材料进行分析.17条ISSR引物共检测到18条多态性条带,占比19.78%;非加权组平均法(UPGMA)聚类分析表明,当以相似系数0.92为阈值时,可将‘韦端蜜红’与‘颐红’区分.17对SRAP引物共检测到21条多态性条带,占比24.71%;UPGMA聚类分析表明,当以相似系数0.89为阈值时,‘韦端蜜红’与‘颐红’被分为两个不同类.ISSR、SRAP联合分析表明,UPGMA聚类分析以相似系数0.90为阈值时,可将‘韦端蜜红’与‘颐红’区分.SRAP、ISSR及其联合分析均显示,‘韦端蜜红’与‘颐红’间有相似的遗传背景,同时在DNA水平上存在差异,说明‘韦端蜜红’是由‘颐红’芽变而来.

摘要： 线粒体DNA遗传变异丰富,是研究群体遗传多样性重要手段.文章以伏牛山区伏牛白山羊、尧山白山羊和槐山羊3个地方山羊品种为研究对象,分析线粒体DNA D-loop区全序列遗传多态性,评估伏牛山区山羊遗传资源现状.遗传多态性研究结果表明,槐山羊(Hd=0.975,Pi=0.01092)与尧山白山羊(Hd=0.895,Pi=0.00832)遗传多态性丰富,伏牛白山羊(Hd=0.456,Pi=0.01234)为中度遗传多态性;系统发育树聚类为五小支(CladeⅠ～Ⅴ),伏牛白山羊存在独立分支,槐山羊和尧山白山羊未形成独立分支,3个品种间未达到种间遗传距离;单倍型分析共鉴定56个单倍型(Hap 1～56)和2个单倍群,且槐山羊和尧山白山羊存在共享单倍型(Hap 3、8和33).网络图结果表明伏牛山区3个山羊品种存在两个母系起源;中性检验结果表明伏牛白山羊经历瓶颈效应和平衡选择(P0.1).研究对国家山羊品种资源保护、开发和利用以及河南省区域生态和产业发展提供理论基础和生产指导.

摘要： 为了检测广西7个地方猪种的遗传多样性,遗传关系和群体的遗传结构,本研究利用4对微卫星引物(SW2415、SW2623、SW742、SW1118)对7个广西地方猪种群体(巴马香猪、东山猪、桂中花猪、陆川猪、环江香猪、隆林猪、德保黑猪)的等位基因频率、群体多态信息含量、有效等位基因数、杂合度和遗传距离进行了检测.4个微卫星位点共检测出49个等位基因,每个位点平均等基因数12.25个.广西7个地方猪种的观测杂合度和预期杂合度的范围分别是0.5473(BM)-0.7039(DS)和0.6294(BM)-0.7653(LC),结合群体内近交系数Fis＞0,表明种群处于杂合度缺失状态.F统计量的三个固定指数Fis为0.1142,Fit为0.2042,Fst为0.1016,总群体属中度分化,总群体近交系数平均值为20.42％,10.16％的遗传变异是由于群体间的遗传变异引起的,而89.84％的遗传变异是由于种群内个体间的差异引起的.基于Nei氏标准遗传距离构建了UPGMA和NJ系统发生树,将广西7个地方猪种群体分为两大类,第Ⅰ大类是陆川猪(LC)、隆林猪(LL)和东山猪聚为一小类,再与桂中花猪(GZ)和徳保猪(DS)聚成的一小类聚合成一大类,第Ⅱ类是环江香猪和巴马香猪聚为一大类.Structure分析进一步验证了系统发生树的构建结果.该结果可为制定科学的保种策略提供具有指导意义的遗传信息资料,如:通过有计划、合理的选配方案控制近交,防止遗传资源的丢失.

摘要： 利用CDDP分子标记技术对不用花色的64份牡丹种质资源的基因组DNA进行遗传多样性和遗传关系分析.16条引物中,有13条产生了清晰可重复的条带.设计的13条引物共检测到152条扩增带,其中多态性条带149条,占总条带的98.03％,表明受试牡丹种质资源之间富含遗传多态性.其中8个受试牡丹种质资源产生特异性遗传标记.每条引物的分辨能力与分辨品种数目呈明显正相关(r=0.96,**P＜0.01).将扩增图谱利用UPGMA方法构建遗传聚类树状图,相似性指数0.69将64个牡丹种质资源划分为5个遗传聚类组,牡丹种质资源的聚类基本上按照地理起源,而中原牡丹品种群的聚类大体是按照花色.结果表明,CDDP标记系统和设计引物能够有效进行遗传关系分析.本研究首次利用基因靶向花色引物进行CDDP标记并将牡丹种质资源成功按照花色聚类,结果对基因靶向分子标记在品种鉴定中的利用及植物的遗传关系分析提供有用信息.

摘要： 了解百合种质资源的亲缘关系是完善切花百合分子育种体系的重要基础,本研究选用SRAP(sequence-related amplified polymorphism)标记对部分切花百合(Lilium)品种基因组DNA进行遗传多样性及遗传关系分析;应用NTSYS-pc2.10e数据处理软件分析数据.共得到清晰条带119条,多态性条带77条,多态性条带比率为64.7％,平均每对引物产生9条条带,其中6条为多态性条带;通过NTSYS-pc2.10e软件计算得到的样品间SM相似系数介于0.57～0.96,平均值为0.733,显示百合资源间存在一定的遗传差异;根据SRAP扩增结果,利用UPGMA法构建树状聚类图,聚类分析将48份样品分为4组,聚类分析结果与百合种的形态分类系统基本相符.

摘要： 运用RAPD和ISSR对栎叶枇杷、大渡河枇杷和普通枇杷的遗传关系进行研究,结果表明:栎叶枇杷与普通枇杷的相似系数最小,比栎叶枇杷与大渡河枇杷的相似系数小,而大渡河枇杷与普通枇杷的相似系数处于二者之间;以大渡河枇杷作为待定杂种获得了最高的叠加性(44.9％和45.8％);通过DNA指纹图谱分析发现,栎叶枇杷和普通枇杷的特异性谱带在大渡河枇杷上均存在。因此,支持大渡河枇杷为栎叶枇杷和普通枇杷种间杂种的结论。

摘要： 利用RAD-seq技术对枇杷属植物遗传关系进行了研究.23个枇杷属植物和2个近缘属植物共获得了221million clean reads,1,983,332SNPs.通过邻接法和最大似然法对枇杷属及近缘属植物的遗传关系进行了分析,结果表明:所有的枇杷属植物聚成一个大类,而近缘属植物则聚成一类或单独聚成一类.来自中国和越南的枇杷属植物随机分布在系统树中,表明聚类与地理起源关系不明显.然而,枇杷属植物的聚类与叶片的大小有一定的关系,所有枇杷属植物可以分成三类:A类和B类主要由叶片小于10cm的种类组成,而C类可进一步分成2个亚类,其中一个亚类由叶片大小介于10-20cm之间的种类组成,另一类由叶片大于20cm的种类组成.

摘要： 本文选取吉林省蚕业科学研究院品种保育圃内的26份柞蚕种质资源材料,利用ISSR标记分析了它们之间亲缘关系.在15个供试ISSR引物中,筛选出10个有扩增产物并且能够很好重复的引物.10个引物共扩增出76条带,其中多态性条带数为63条,多态性比率为82.89％,品种间遗传相似性系数范围在0.066-0.474之间,主要集中在0.250-0.350.根据ISSR标记的结果,采用UPGMA聚类分析方法,将供试材料分为2个大类4个亚类.

摘要： 水稻农艺性状的表现受土壤水分状况的影响较大，通过分析水、旱条件下农艺性状的表现可以剖析抗旱相关的农艺性状及其与抗旱相关的遗传位点，为通过对抗旱相关次级性状的辅助选择来培育抗旱品种提供依据。

摘要： CNR2基因位于人类染色体lp36，其编码的CB2受体主要参与调节成骨细胞及脂肪细胞的分化、破骨细胞的形成和骨的重吸收。结果提示CNR2基因可能是影响骨量的易感基因之一，这一结论也己被全基因组关联分析所证实，全基因组关联分析发现覆盖CNR2基因的染色体lp36区包括决定股骨颈骨密度的位点。然而，CNR2影响骨量的分子机制仍需进一步研究阐明，结果进一步证实CNR2基因与骨密度相关，CNR2基因可能是中国汉族绝经后女性群体中低骨密度的易感基因。CNR2基因中2个SNP位点rs4237和rs2501431可能参与汉族绝经后女性骨质疏松的发生，对于骨密度降低的遗传风险评估具有重要意义。然而，考虑到多变异的微小效应及关联性的分子学基础与骨重建及骨密度复杂网络之间的关系，仍需进行深入研究，包括对不同种族群体进行高密度图谱绘制及深入测序以找到可能的具有因果关系的变异。

摘要： CNR2基因位于人类染色体lp36，其编码的CB2受体主要参与调节成骨细胞及脂肪细胞的分化、破骨细胞的形成和骨的重吸收。结果提示CNR2基因可能是影响骨量的易感基因之一，这一结论也己被全基因组关联分析所证实，全基因组关联分析发现覆盖CNR2基因的染色体lp36区包括决定股骨颈骨密度的位点。然而，CNR2影响骨量的分子机制仍需进一步研究阐明，结果进一步证实CNR2基因与骨密度相关，CNR2基因可能是中国汉族绝经后女性群体中低骨密度的易感基因。CNR2基因中2个SNP位点rs4237和rs2501431可能参与汉族绝经后女性骨质疏松的发生，对于骨密度降低的遗传风险评估具有重要意义。然而，考虑到多变异的微小效应及关联性的分子学基础与骨重建及骨密度复杂网络之间的关系，仍需进行深入研究，包括对不同种族群体进行高密度图谱绘制及深入测序以找到可能的具有因果关系的变异。

摘要： CNR2基因位于人类染色体lp36，其编码的CB2受体主要参与调节成骨细胞及脂肪细胞的分化、破骨细胞的形成和骨的重吸收。结果提示CNR2基因可能是影响骨量的易感基因之一，这一结论也己被全基因组关联分析所证实，全基因组关联分析发现覆盖CNR2基因的染色体lp36区包括决定股骨颈骨密度的位点。然而，CNR2影响骨量的分子机制仍需进一步研究阐明，结果进一步证实CNR2基因与骨密度相关，CNR2基因可能是中国汉族绝经后女性群体中低骨密度的易感基因。CNR2基因中2个SNP位点rs4237和rs2501431可能参与汉族绝经后女性骨质疏松的发生，对于骨密度降低的遗传风险评估具有重要意义。然而，考虑到多变异的微小效应及关联性的分子学基础与骨重建及骨密度复杂网络之间的关系，仍需进行深入研究，包括对不同种族群体进行高密度图谱绘制及深入测序以找到可能的具有因果关系的变异。

摘要： 一种用于无创产前亲权关系判定的微单倍型遗传标记组合及方法。本发明首先提供了一组用于无创产前亲权关系判定的微单倍型遗传标记组合；利用该均匀分布在常染色体的微单倍型作为遗传标记，结合高通量测序技术，根据测序结果，基于贝叶斯原理建立胎儿父权指数(PI)的计算模型进行双胎妊娠产前亲权关系的判定。本方法只需提供母亲外周血10ml，在母亲外周血浆中提取的游离DNA已经包含了胎儿的游离DNA，所以母亲和胎儿只需要一份样品即可。由于只需抽取孕妇的静脉血，操作简便，因此不会对孕妇和胎儿造成创伤，且孕7周后即可鉴定，检测结果与常规STR分型方法一致，具有较大的应用前景。

摘要： 本发明属于生物技术领域，具体涉及一种用于新月弯孢菌遗传多样性和亲缘关系分析的SSR引物及应用。所述的用于新月弯孢菌遗传多样性和亲缘关系分析的SSR引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.1～40所示。本发明还提供了一种用于新月弯孢菌遗传多样性和亲缘关系分析的试剂盒，该引物和试剂盒的开发为研究月弯孢菌遗传多样性和亲缘关系分析提供了新的技术方法和手段。

摘要： 本申请提供了一种具有共价连接的化合物和共价连接的DNA条形码的珠粒以及使用这种珠粒的方法。所述珠粒具有所述化合物的许多基本上相同的拷贝和所述DNA条形码的许多基本上相同的拷贝。所述化合物由一个或多个化学单体组成，其中所述DNA条形码采取条形码模块的形式，其中每个模块对应于对应的化学单体并允许标识对应的化学单体。所述核酸条形码可以具有级联结构或正交结构。提供了一种用于对珠粒结合的核酸条形码进行测序、用于从珠粒切割化合物以及用于评估所释放化合物的生物学活性的方法。

摘要： 本发明涉及亲缘关系鉴定方法技术领域，且公开了以SNP为遗传标记物的亲缘关系鉴定方法，包括亲缘关系判定模型的建立、SNP位点的分型检测和根据分型结果和判定模型确认个体间亲缘关系三大步骤。该以SNP为遗传标记物的亲缘关系鉴定方法，检测方式上采用SNP代替STR作为遗传标记物，充分避免了使用STR为遗传标记检测时稳定性差、分型难度高、对样本质量要求高、成本高的缺点；通过新模型算法可直接判定出两样本间直系、一级亲缘关系、二级亲缘关系、三级亲缘关系和陌生人；引入概率密度模型，充分避免各种误差带来的影响；采用程序化判定，操作简单方便，采用SNP分型检测技术，使分型结果准确直观；算法使用的SNP位点多、重复次数多，结果更加准确。

摘要： 一种用于无创产前亲权关系判定的微单倍型遗传标记组合及方法。本发明首先提供了一组用于无创产前亲权关系判定的微单倍型遗传标记组合；利用该均匀分布在常染色体的微单倍型作为遗传标记，结合高通量测序技术，根据测序结果，基于贝叶斯原理建立胎儿父权指数(PI)的计算模型进行双胎妊娠产前亲权关系的判定。本方法只需提供母亲外周血10ml，在母亲外周血浆中提取的游离DNA已经包含了胎儿的游离DNA，所以母亲和胎儿只需要一份样品即可。由于只需抽取孕妇的静脉血，操作简便，因此不会对孕妇和胎儿造成创伤，且孕7周后即可鉴定，检测结果与常规STR分型方法一致，具有较大的应用前景。

摘要： 本发明公开了一种解释复杂疾病遗传关系的深度关联核学习技术，包括：途径分组模块、基因编码模块、卷积层模块、内核机器回归模块和梯度回传算法模块；途径分组模块将同一生物学途经中的变体归为一组；基因编码模块通过对每组变体中的等位基因以一热编码的方式进行编码并建模；卷积层模块用于识别等位基因中的因果区域，将因果位点编码为深层特征；内核机器回归模块通过深度学习的方法进行回归，提取路径层次的特征，统计特征的显著性；梯度回传算法模块对深度网络参数进行优化更新，并反馈给卷积层模块。本发明解决了传统技术中的局限性，实现了对基因间复杂关联的检测，增强了GWAS的可解释性。

摘要： 本发明涉及生物技术领域，特别涉及一种解析花生属种间遗传关系有效简易的方法。具体的，利用花生属叶绿体基因组筛选得到一个高突变区通过简单扩增和测序来解析花生属种间遗传关系。包括如下步骤：(1)根据已有数据库获取栽培种花生及其近缘物种叶绿体全基因组基因序列；(2)将多个物种叶绿体全基因组基因序列进行对比分析，锚定叶绿体全基因组范围内的高突变区域并进行注释；(3)对选定高突变区域进行引物设计，PCR扩增和一代测序后，构建系统发生树。本发明利用花生属的高突变区psbE‑petL，通过简单的扩增和构树，可以有效地解析花生属种间遗传关系，省时，省力和省费用，是有效解析花生属种间遗传关系上的一项重大突破，具有突出的现实意义。

摘要： 本发明提供了一种用于确定受孕体与精子和卵母细胞提供者的遗传关系的方法，包括接收受孕体、精子提供者和卵母细胞提供者的序列数据；将接收到的序列数据与参考基因组进行比对；识别精子提供者、卵母细胞提供者和受孕体序列数据中的单核苷酸多态性(SNP)；使用填充参考来填充精子提供者序列数据和卵母细胞提供者序列数据中的缺失间隙；计算精子提供者和受孕体之间的父本一致性分数；计算卵母细胞提供者和受孕体之间的母本一致性分数；以及如果父本一致性分数和/或母本一致性分数超过预定阈值，则将精子提供者和/或卵母细胞提供者分类为与受孕体相关。

摘要： 本发明涉及分子生物学及遗传育种技术领域，具体涉及地黄品种遗传关系、种类鉴别用分子标记SSR引物、试剂盒、应用。采用本发明提供的50对SSR引物分别对黄淮地区17份种植资源的DNA进行扩增，通过聚类分析和遗传相似度分析，明确不同品种之间的衍生关系、遗传差异、演进关系等，能够为育种选育提供科学的依据。同时，采用本发明提供的15对SSR引物，能够通过不同引物对之间扩增产物的差异组合精确区不同的地黄品种，能够实现DNA水平上对17个黄淮产区地黄品种的区分鉴别，构成了其SSR指纹图谱。

摘要： 本发明公开一种用于食蟹猴遗传关系鉴定的方法及其应用，该方法包括以下步骤：1)利用核酸提取试剂盒提取食蟹猴全血DNA；2)靶向文库的构建：针对食蟹猴中至少400个STR位点及SNP位点，根据每个位点设计特异性扩增引物，将合成的全部特异性扩增引物混成引物池，进行靶向文库的构建；3)利用二代测序仪以及测序试剂进行基因测序获得食蟹猴基因型信息。本发明的方法适合对大批量的食蟹猴进行基因分型检测，具有快速且高通量的优点，可应用于食蟹猴的起源鉴定及家族亲缘鉴定。