SSR分子标记

摘要： 【目的】明确内蒙古自治区农牧业科学院棉花研究中心早熟棉种质资源的亲缘关系,为杂交组合的选配及定向育种提供亲本材料。【方法】采用SSR分子标记(微卫星DNA),利用31对SSR引物对44份早熟棉种质资源的遗传多样性进行分析鉴定。【结果】31对引物共扩增出多态性条带72条,平均每对引物扩增出2.25条。聚类分析结果显示,各材料间的遗传相似系数为0.35~0.80,平均为0.58。其中,酒棉17号与中716的遗传相似系数最小,为0.35;新陆早41号与中361、中夏05与辽棉15号的遗传相似系数最大,均为0.80。【结论】31对SSR引物在供试材料间的多态性较好,44份早熟棉材料遗传变异类型丰富,初步揭示了早熟棉种质资源间的遗传背景差异及亲缘关系。

摘要： 以浙江省各地种植的32份向日葵种质为材料,利用17对简单重复序列标记引物结合高分辨率熔解曲线技术对32份材料进行遗传多样性分析与DNA指纹图谱构建。聚类分析结果表明,该32份材料遗传多样性相对较低,大部分材料的亲缘关系与其地理来源、所属类型基本一致。本研究创新了向日葵种质资源的鉴定方法,为进一步利用高分辨率熔解曲线技术鉴定向日葵种质资源奠定了基础。

摘要： 为了培育烤烟新品种,提高烟叶产量和质量,满足烟草生产对烤烟新品种的需求,本研究从贵州省石阡县栽种多年的地方烟草品种中系统选育出了优良烤烟新品系‘狮柳烟’。以烤烟主栽品种‘K326’和‘云烟87’作为对照,通过连续三年田间试验和实验室品质测试,对‘狮柳烟’的植物学性状、农艺性状、经济性状、烟叶外观质量、物理指标、化学成分、感官评吸质量进行评价,并建立其SSR分子标记。结果表明,‘狮柳烟’平均单株留叶数24片/株,分别比‘K326’、‘云烟87’多3片/株、5片/株;平均单产2233.4 kg/hm^(2),均价24.47元/kg,产值54434.2元/hm^(2),上等烟率51.11%,上中等烟率94.81%,经济指标优于‘K326’和‘云烟87’;烟叶颜色为柠檬黄,外观品质较好,化学成分协调性好,感官评吸品质优于对照;SSR分子标记引物PT3024、PT40021可以稳定地在‘狮柳烟’与‘K326’和‘云烟87’之间扩增出特异性条带。因此‘,狮柳烟’产量高、质量优,是一个高产优质烤烟新品系。

摘要： 选取6个茎瘤芥品种为试材,在芸薹属SSR公共引物中初筛获得引物的基础上,选择9对条带清晰、表现稳定的多态性引物,利用SSR荧光标记技术开展了茎瘤芥品种SSR分子标记的差异性研究,初步构建了品种的分子身份证。结果表明,共筛选到7对多态性引物,检测到20个等位位点,平均每对引物2.2个;扩增得到20个带型,平均每对引物2.2个,扩增片段长度在126~397 bp;构建了6个茎瘤芥品种的分子身份证,并进行了合理区分;在分子水平上,浙江品种间差异最为显著,浙渝两地品种差异次之,重庆品种间差异最小,但各品种均拥有独立身份代码,研究结果为茎瘤芥品种资源的鉴定、亲缘关系分析、遗传基础研究等各项工作提供了依据。

摘要： 从台湾含笑〔Michelia compressa(Maxim.)Sarg.〕自然授粉子代中发现18株表型明显变异单株,命名为‘中山含笑’(Michelia‘Zhongshanhanxiao’)。为明确‘中山含笑’的表型变异及遗传变异状况,弄清其遗传背景和亲缘关系,以‘中山含笑’18株单株、台湾含笑母树及其表型无变异子代单株为样本,在表型特征观察基础上,采用荧光毛细管电泳技术,利用5对SSR引物进行扩增和分析。结果显示:与母树相比,‘中山含笑’的整株、叶片和花的形状均无明显变化,但叶片和花的大小却变化明显;4年生‘中山含笑’的株高、地径、胸径、冠幅、叶长和叶宽分别是同龄表型无变异子代的1.41~1.55、2.49~2.97、2.79~3.16、2.38~2.74、1.40~2.04和1.50~2.17倍,且‘中山含笑’的叶长和叶宽以及花被片的长度和宽度均大于母树,花被片的长度和宽度分别是母树的3.50~4.53和4.33~7.00倍。SSR标记分析结果表明:母树与表型无变异子代的扩增结果完全一致,但与‘中山含笑’18株单株的扩增结果存在明显差异。5个SSR位点中,有4个在母树与表型无变异子代中为纯合位点,而这5个位点在‘中山含笑’大部分单株中为杂合位点。‘中山含笑’供试单株的观测等位基因数、有效等位基因数、观测杂合度、期望杂合度、Shannon’s多样性指数和Nei’s基因多样性指数分别为表型无变异子代的2.50、1.67、3.44、4.06、5.73和4.74倍。母树与表型无变异子代单株的遗传距离均为0.000,表明二者间无遗传差异;‘中山含笑’单株间的遗传距离为0.000~0.539,‘中山含笑’与母树的遗传距离为0.192~0.399,说明‘中山含笑’单株之间、‘中山含笑’与母树之间均存在遗传分化。通过聚类分析,在遗传一致度0.50处,可将供试样本分成2组,其中母树与表型无变异子代单株聚为Ⅰ组,‘中山含笑’18株单株聚为Ⅱ组;在遗传一致度0.64处,‘中山含笑’18株单株还可进一步分为4个亚组。综合分析结果表明:‘中山含笑’供试单株在表型性状上具有明显的超亲特征,且较表型无变异子代具有更高的遗传多样性;除含有台湾含笑母树的遗传信息外,‘中山含笑’供试单株还含有来源于母树之外的遗传信息,据此推测‘中山含笑’为台湾含笑与其他木兰科植物的种间杂交后代。

摘要： 【目的】了解云南特有的沟谷雨林主要建群种绒毛番龙眼居群的遗传多样性及遗传结构特征,为雨林植被恢复的采种规划和恢复效果评估提供重要参考。【方法】采用SSR分子标记技术,检测分析云南省西双版纳州和普洱市思茅区的绒毛番龙眼3个天然居群和1个人工居群共82个样本的SSR多态性,采用POPGENE v.1.32、GenAlEx 6.501和STRUCTURE 2.3.3等进行遗传多样性及遗传结构分析。【结果】19对SSR引物共检测到88个等位基因,每对引物平均4.632个,19个位点的Shannon’s信息指数(I)变化范围为0.264~1.687,平均为0.879;多态信息指数(PIC)变化范围为0.128~0.729,平均为0.422,期望杂合度(He)的变化范围为0.138~0.765,平均为0.473;4个居群I和He的均值分别为0.785,0.437。19个位点的遗传分化系数(F_(ST))均值为0.069,基因流(Nm)的均值为3.363。STRUCTURE分析将绒毛番龙眼4个居群82个样本分为4个类群,基于遗传距离的UPGMA聚类显示4个居群聚为2个分支,菜阳河天然林居群、普文人工林居群和普文天然林居群聚为一支,勐养镇天然林居群单独为另一支。【结论】绒毛番龙眼的遗传多样性处于中等水平;居群间的遗传分化较低,遗传变异主要来源于居群内;建议特别关注居群内个体的选择和保护,在沟谷雨林植被恢复中设定天然居群多样性水平的恢复目标,并通过科学的采种规划实现这一目标。

摘要： 【目的】基于转录组开发SSR和SNP分子标记用于评价棘胸蛙(Quasipaa spinosa)遗传多样性,为其种质资源的创新利用提供理论支撑。【方法】采用TRIzol试剂盒提取棘胸蛙肝脏、肌肉和肾脏组织总RNA,构建cDNA文库后利用Illumina HiSeq 2500测序平台进行高通量测序,通过MISA对棘胸蛙转录组测序数据进行SSR检索,并以SAMtools和VarScan v.2.2.7进行SNP查找。【结果】棘胸蛙转录组测序共获得93887条非冗余基因(Unigenes),序列总长度达91352712 bp,且所有转录组Q30均超过95.00%。在93887条Unigenes中发现33019个SSRs,其中21966条Unigenes含有SSR,6688条Unigenes含有超过1个SSR;以单核苷酸重复型SSR数最多,达25788个,且出现频率最高(27.47%)。SSR的平均长度以四核苷酸重复型最长,达35.47 bp;棘胸蛙SSR以(A/T)_(n)为绝对优势重复基元,占总SSR的65.51%,然后依次为(C/G)_(n)、(AT/AT)_(n)、(AC/GT)_(n)、(AG/CT)_(n)、(AAT/ATT)_(n)、(AGG/CCT)_(n),分别占总SSR的12.59%、5.66%、5.55%、3.31%、1.55%和1.30%。在33019个SSRs中,核苷酸重复次数主要集中在5~25次,占总SSR的99.91%,且大部分SSR位于非编码区,仅有1633个SSRs位于编码区;长度≥12 bp的SSR共计17244个,占总SSR的58.53%。挑选120对SSR引物进行引物有效性验证,发现有57对引物扩增出单一条带,且条带大小与预期结果一致。对棘胸蛙转录组序列进行SNP检索,共发现87634个SNPs,其中,56300个SNPs属于转换位点、31334个SNPs属于颠换位点,转化/颠换比达1.80,碱基的转换频率明显高于颠换频率。【结论】利用高通量转录组测序开发棘胸蛙SSR和SNP分子标记是一种切实可行的方法,能开发出通用性较高、数量较多、覆盖性较广的分子标记。棘胸蛙具有中度偏高的遗传多样性,可作为种质材料进一步开发利用。

摘要： 通过对多个甘薯种质资源的17个表型性状进行调查和通过SSR分子标记,进行主成分分析和聚类分析,进而对甘薯种质资源遗传多样性进行了全面分析。主成分分析结果显示,有7个主成分的特征值大于1,累计贡献率达72.69%,主成分1和2直观反映了地上部性状,可以解释表型差异的32.84%;聚类分析显示,144份甘薯材料在遗传距离0.198 2处,划分为5个族群,遗传距离0.298 8处将第Ⅴ族群分为两个亚群(V-1、V-2)。其中,瓦尔图努2号和福建武平农家种两个材料表型独特,可以在今后的甘薯育种中作为亲本材料。聚类分析结果显示,144份甘薯材料均可以分为5个类群,两者结果一致,即来源地相近的品种遗传差异较小。

摘要： 观赏海棠种质资源丰富,表型鉴定与分类难度大。本试验以74个观赏海棠品种为材料,利用SSR分子标记以及表型性状测定,分析观赏海棠的遗传多样性并构建指纹图谱。利用20对谱带清晰、多态性好的引物对74个种(品种)进行PCR扩增及遗传多样性分析,共检测到766个等位基因,扩增出的多态位点百分率达100%,每个位点的平均等位基因数为38.3个。遗传多样性信息含量变化幅度为0.86~0.97,基因多样性指数平均值为0.94,表现出丰富的遗传多样性。从分子水平上探讨其亲缘关系,基于SSR的聚类结果可将74个观赏海棠品种分为四大类。最终利用3对SSR引物成功地构建了74个观赏海棠的指纹图谱,为海棠种质资源的保护、开发利用及创新提供参考和依据。

摘要： 采用株系循环法及指纹图谱SSR标记检测种子DNA纯度的方法对桂野丰进行提纯复壮,并连续2年在33.3hm^(2)繁种田进行纯度及农艺性状调查验证。筛选出2对能够有效鉴定桂野丰纯度的SSR标记RM71和RM493。提纯复壮后桂野丰株高、穗长、结实率、有效穗数、长宽比、千粒重等均已达到或超过初审水平,说明SSR分子标记能够快速、有效地进行常规稻提纯复壮,从源头上确保该品种种子纯度,为生产提供优质的种子,同时为常规稻、三系杂交稻保持系和恢复系种子提纯保优提供依据。

摘要： 紫薇是中国的传统名花,在园林中具有广阔应用前景.目前已开发的紫薇SSR分子标记较少,远不能满足分子育种研究需要.利用MISA软件对紫薇转录组测序得到的76405条unigenes序列进行SSR位点搜索与分析,发现有13235个unigenes含有SSR位点,发生概率为17.32％;共搜索到SSR位点16453个,包含SSR的一致序列出现频率为21.53％,SSR位点分布密度为1/5.60kb.二核苷酸和三核苷酸重复为最主要重复类型,分别占比49.40％和35.56％;重复基元中频率最高的前两种重复基元为AG/CT,占总SSR数量的42.28％.以二核苷酸重复序列设计100对SSR引物,并以紫薇回交群体的8个随机子代基因组DNA为模板进行PCR扩增及多态性筛选,得到58对条带清晰、特异性高的引物,其中36对具有多态性.上述结果表明,紫薇转录组数据可作为开发SSR标记的可靠来源,研究结果可为紫薇属植物分子育种研究奠定理论和技术基础.

摘要： 紫薇是中国的传统名花,在园林中具有广阔应用前景.目前已开发的紫薇SSR分子标记较少,远不能满足分子育种研究需要.利用MISA软件对紫薇转录组测序得到的76405条unigenes序列进行SSR位点搜索与分析,发现有13235个unigenes含有SSR位点,发生概率为17.32％;共搜索到SSR位点16453个,包含SSR的一致序列出现频率为21.53％,SSR位点分布密度为1/5.60kb.二核苷酸和三核苷酸重复为最主要重复类型,分别占比49.40％和35.56％;重复基元中频率最高的前两种重复基元为AG/CT,占总SSR数量的42.28％.以二核苷酸重复序列设计100对SSR引物,并以紫薇回交群体的8个随机子代基因组DNA为模板进行PCR扩增及多态性筛选,得到58对条带清晰、特异性高的引物,其中36对具有多态性.上述结果表明,紫薇转录组数据可作为开发SSR标记的可靠来源,研究结果可为紫薇属植物分子育种研究奠定理论和技术基础.

摘要： 紫薇是中国的传统名花,在园林中具有广阔应用前景.目前已开发的紫薇SSR分子标记较少,远不能满足分子育种研究需要.利用MISA软件对紫薇转录组测序得到的76405条unigenes序列进行SSR位点搜索与分析,发现有13235个unigenes含有SSR位点,发生概率为17.32％;共搜索到SSR位点16453个,包含SSR的一致序列出现频率为21.53％,SSR位点分布密度为1/5.60kb.二核苷酸和三核苷酸重复为最主要重复类型,分别占比49.40％和35.56％;重复基元中频率最高的前两种重复基元为AG/CT,占总SSR数量的42.28％.以二核苷酸重复序列设计100对SSR引物,并以紫薇回交群体的8个随机子代基因组DNA为模板进行PCR扩增及多态性筛选,得到58对条带清晰、特异性高的引物,其中36对具有多态性.上述结果表明,紫薇转录组数据可作为开发SSR标记的可靠来源,研究结果可为紫薇属植物分子育种研究奠定理论和技术基础.

摘要： 紫薇是中国的传统名花,在园林中具有广阔应用前景.目前已开发的紫薇SSR分子标记较少,远不能满足分子育种研究需要.利用MISA软件对紫薇转录组测序得到的76405条unigenes序列进行SSR位点搜索与分析,发现有13235个unigenes含有SSR位点,发生概率为17.32％;共搜索到SSR位点16453个,包含SSR的一致序列出现频率为21.53％,SSR位点分布密度为1/5.60kb.二核苷酸和三核苷酸重复为最主要重复类型,分别占比49.40％和35.56％;重复基元中频率最高的前两种重复基元为AG/CT,占总SSR数量的42.28％.以二核苷酸重复序列设计100对SSR引物,并以紫薇回交群体的8个随机子代基因组DNA为模板进行PCR扩增及多态性筛选,得到58对条带清晰、特异性高的引物,其中36对具有多态性.上述结果表明,紫薇转录组数据可作为开发SSR标记的可靠来源,研究结果可为紫薇属植物分子育种研究奠定理论和技术基础.

摘要： 本试验运用SSR分子标记技术结合田间形态学鉴定方法对国内大面推广的三个嫩早南瓜品种嫩早2号、嫩早佳美和嫩早黑妞的种子纯度进行鉴定.电泳结果发现:引物NG05、NG74和NG88均能在嫩早2号双亲本间扩增出差异互补的条带,引物NG05、NG26、NG74、NG80和NG04均能在嫩早佳美双亲本间扩增出差异互补条带,引物NG05能在嫩早黑妞双亲本间扩增出差异互补条带.基于引物筛选结果,利用引物NG05对嫩早2号和嫩早黑妞进行品种鉴定,引物NG26对嫩早佳美进行品种鉴定.嫩早2号、嫩早佳美和嫩早黑妞F1代纯度分别为95.7％、99.4％和96.6％,与田间检测结果(分别为96.5％、99.4％和97.0％)无显著差异.表明,SSR分子标记是一种简单、有效且准确的鉴定嫩早南瓜杂交种纯度的方法.

摘要： 本试验运用SSR分子标记技术结合田间形态学鉴定方法对国内大面推广的三个嫩早南瓜品种嫩早2号、嫩早佳美和嫩早黑妞的种子纯度进行鉴定.电泳结果发现:引物NG05、NG74和NG88均能在嫩早2号双亲本间扩增出差异互补的条带,引物NG05、NG26、NG74、NG80和NG04均能在嫩早佳美双亲本间扩增出差异互补条带,引物NG05能在嫩早黑妞双亲本间扩增出差异互补条带.基于引物筛选结果,利用引物NG05对嫩早2号和嫩早黑妞进行品种鉴定,引物NG26对嫩早佳美进行品种鉴定.嫩早2号、嫩早佳美和嫩早黑妞F1代纯度分别为95.7％、99.4％和96.6％,与田间检测结果(分别为96.5％、99.4％和97.0％)无显著差异.表明,SSR分子标记是一种简单、有效且准确的鉴定嫩早南瓜杂交种纯度的方法.

摘要： 本试验运用SSR分子标记技术结合田间形态学鉴定方法对国内大面推广的三个嫩早南瓜品种嫩早2号、嫩早佳美和嫩早黑妞的种子纯度进行鉴定.电泳结果发现:引物NG05、NG74和NG88均能在嫩早2号双亲本间扩增出差异互补的条带,引物NG05、NG26、NG74、NG80和NG04均能在嫩早佳美双亲本间扩增出差异互补条带,引物NG05能在嫩早黑妞双亲本间扩增出差异互补条带.基于引物筛选结果,利用引物NG05对嫩早2号和嫩早黑妞进行品种鉴定,引物NG26对嫩早佳美进行品种鉴定.嫩早2号、嫩早佳美和嫩早黑妞F1代纯度分别为95.7％、99.4％和96.6％,与田间检测结果(分别为96.5％、99.4％和97.0％)无显著差异.表明,SSR分子标记是一种简单、有效且准确的鉴定嫩早南瓜杂交种纯度的方法.

摘要： 本试验运用SSR分子标记技术结合田间形态学鉴定方法对国内大面推广的三个嫩早南瓜品种嫩早2号、嫩早佳美和嫩早黑妞的种子纯度进行鉴定.电泳结果发现:引物NG05、NG74和NG88均能在嫩早2号双亲本间扩增出差异互补的条带,引物NG05、NG26、NG74、NG80和NG04均能在嫩早佳美双亲本间扩增出差异互补条带,引物NG05能在嫩早黑妞双亲本间扩增出差异互补条带.基于引物筛选结果,利用引物NG05对嫩早2号和嫩早黑妞进行品种鉴定,引物NG26对嫩早佳美进行品种鉴定.嫩早2号、嫩早佳美和嫩早黑妞F1代纯度分别为95.7％、99.4％和96.6％,与田间检测结果(分别为96.5％、99.4％和97.0％)无显著差异.表明,SSR分子标记是一种简单、有效且准确的鉴定嫩早南瓜杂交种纯度的方法.

摘要： 目的：本研究旨在挖掘牛鞭草基因资源,丰富其基因组信息. 方法：本研究采用Illumina HiSeqTM2500高通量测序技术对高牛鞭草和扁穗牛鞭草材料的叶片或根系4个样本(T01、T02、T03和T04)进行转录组测序. 结果：每个RNA样本获得了超过2400万条高质量reads.经过de novo组装后,'雅安'和'1110'材料分别获得了137142条和77150条unigenes,其中86731条unigenes(63.24％)和48645条unigenes(63.05％)被成功地注释功能.合并两个材料的unigenes后进行SSR位点检测,从8330个unigenes中,共检测得到10888个SSR位点.为了验证识别到的SSR位点,为此设计了高质量的SSR引物.从中随机选取了54对SSR引物进行验证,发现大多数这些引物能成功地扩增出期望的PCR产物. 结论：本研究两个材料获得的序列数据极大地丰富了牛鞭草可利用的基因组资源,并开发的SSR标记将进一步促进牛鞭草属植物在遗传育种和分子标记辅助选择等方面的研究进展.

摘要： 目的：本研究旨在挖掘牛鞭草基因资源,丰富其基因组信息. 方法：本研究采用Illumina HiSeqTM2500高通量测序技术对高牛鞭草和扁穗牛鞭草材料的叶片或根系4个样本(T01、T02、T03和T04)进行转录组测序. 结果：每个RNA样本获得了超过2400万条高质量reads.经过de novo组装后,'雅安'和'1110'材料分别获得了137142条和77150条unigenes,其中86731条unigenes(63.24％)和48645条unigenes(63.05％)被成功地注释功能.合并两个材料的unigenes后进行SSR位点检测,从8330个unigenes中,共检测得到10888个SSR位点.为了验证识别到的SSR位点,为此设计了高质量的SSR引物.从中随机选取了54对SSR引物进行验证,发现大多数这些引物能成功地扩增出期望的PCR产物. 结论：本研究两个材料获得的序列数据极大地丰富了牛鞭草可利用的基因组资源,并开发的SSR标记将进一步促进牛鞭草属植物在遗传育种和分子标记辅助选择等方面的研究进展.

摘要： 本发明提供了耐热萝卜EST‑SSR分子标记，包括SSR17和SSR75一种或两种；所述SSR17的核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.1所示；所述SSR75的核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.2所示。本发明通过对耐热萝卜品种‑‑夏抗40天筛选得到2个EST‑SSR分子标记，并且所述SSR17和SSR75具有共显性表达特性，利用具有共显性关系的2个EST‑SSR分子标记对商品种耐热萝卜品种‑‑夏抗40天的群体纯度进行检测，结果显示其纯度高达92％，同田间表型一致，因此，所述2个EST‑SSR分子标记能够用于耐热萝卜品种的纯度检测。

摘要： 本发明提供一种与竹子耐寒性相关的SSR分子标记、SSR引物及其应用，属于分子标记及其检测技术领域。本发明通过转录组测序结果，进一步筛选ICE1‑CBF‑COR通路相关基因，在相关通路里找到了与抗寒标记相关的38条unigene，根据unigene里SSR位点分布特点，合成38对SSR引物，通过引物筛选，最终得到了9对多态性较好的位点，并进一步进行验证，最终证明上述SSR引物扩增获得的SSR分子标记可用于竹子种质资源耐寒鉴定。本发明检测方法在短时间内即可完成耐寒竹子鉴定，具有高效、准确、低成本、操作简便等优势，可应用于竹子种质资源或品种的耐寒鉴定及分子辅助育种，具有良好的实际生产和应用之价值。

摘要： 本发明涉及分子标记技术领域，特别涉及一种普通油茶SSR分子标记引物及标记方法和应用，本发明通过对普通油茶根系进行RNA提取，测序和组装，利用MISA搜索SSR位点，并设计相应引物，以油茶基因组DNA为材料，对设计的SSR引物进行验证，从设计的6738对引物中得到相应的引物，该引物表现出多态性并可以成功区分不同品种来源的油茶材料；为油茶分子标记辅助育种提供新的分子标记，可为今后开展遗传育种、基因组作图、基因定位和物种亲缘关系鉴别等研究提供新的思路。

摘要： 本发明公开了与位于玉米种子耐储性相关主效QTL区段紧密连锁的分子标记及其应用；所述分子标记与位于玉米第10号染色体Bin10.03区域内玉米种子耐储性相关主效QTL区段cQTL‑10紧密连锁，该分子标记为phi050和umc1648。本发明通过定位玉米种子耐储性的1个主效QTL区段，该区段包含包含2个QTL qRVI‑10和qRSVI‑10，分别影响相对活力指数和相对简易活力指数，发现了与玉米种子耐储性紧密连锁的2个SSR分子标记phi050和umc1648，本发明所提供的SSR分子标记可应用于提高玉米种子耐储能力的分子辅助育种。

摘要： 本发明公开了SSR标记、引物对及其应用和陆地棉早熟分子育种相关SSR标记位点的筛选方法。以中晚熟棉花品种鲁棉研37号为母本，以早熟棉花品种鲁棉研19号为父本，杂交1代，再自交1代获得F2，在F2群体中选择1/8的早熟株系和1/8的晚熟株系，种植F3，自交获得F4利用F2群体进行棉花早熟性状相关SSR标记位点的第一次鉴定，卡方分析初步确定受苗蕾期性状选择有效的陆地棉早熟分子育种相关SSR标记。利用F4群体进行早熟相关SSR标记位点的第二次鉴定，卡方分析最终确定受苗蕾期性状选择有效的陆地棉早熟分子育种相关SSR标记。本发明的有益效果是为陆地棉早熟分子育种分子标记位点。

摘要： 本发明公开了一种基于棉花SSR分子标记筛选藏紫草的特异性SSR标记方法，其包括以下步骤：（1）提取藏紫草根皮部基因组DNA；（2）以第（1）步提取的基因组DNA为模板，选用特异性SSR引物进行PCR扩增；（3）对扩增产物进行凝胶电泳；（4）对电泳结果进行分析，其中所述特异性引物的碱基序列为：SHIN‑1494F：TAACGGAGATGGGTTTCGAC；SHIN‑1494R：CACAACCGTCCATTTCCTCT。本发明方法重复性好、多态性高、遗传稳定、不受环境条件影响，而且检测结果稳定可靠、快速准确、操作简单方便、成本低廉，有利于大规模的快速检测。

摘要： 本发明提供了耐热萝卜EST‑SSR分子标记，包括SSR17和SSR75一种或两种；所述SSR17的核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.1所示；所述SSR75的核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.2所示。本发明通过对耐热萝卜品种‑‑夏抗40天筛选得到2个EST‑SSR分子标记，并且所述SSR17和SSR75具有共显性表达特性，利用具有共显性关系的2个EST‑SSR分子标记对商品种耐热萝卜品种‑‑夏抗40天的群体纯度进行检测，结果显示其纯度高达92％，同田间表型一致，因此，所述2个EST‑SSR分子标记能够用于耐热萝卜品种的纯度检测。

摘要： 本发明公开一种用于朱顶红杂交后代鉴定的SSR分子标记组合、SSR引物组合及其应用，本发明基于朱顶红转录组数据开发EST‑SSR标记，以朱顶红亲本和杂交后代基因组DNA为模板，使用SSR引物进行PCR扩增，通过毛细管电泳，进行朱顶红亲本和杂交后代的EST‑SSR分析，可用于朱顶红杂交后代的早期鉴定。本发明的检测方法适用于朱顶红EST‑SSR分子标记开发及其杂交后代的早期鉴定，既提高了朱顶红杂交育种效率，又降低了杂交后代株系的管理成本，具有准确性高、操作简便等优点。

摘要： 本发明提供一种与竹子耐寒性相关的SSR分子标记、SSR引物及其应用，属于分子标记及其检测技术领域。本发明通过转录组测序结果，进一步筛选ICE1‑CBF‑COR通路相关基因，在相关通路里找到了与抗寒标记相关的38条unigene，根据unigene里SSR位点分布特点，合成38对SSR引物，通过引物筛选，最终得到了9对多态性较好的位点，并进一步进行验证，最终证明上述SSR引物扩增获得的SSR分子标记可用于竹子种质资源耐寒鉴定。本发明检测方法在短时间内即可完成耐寒竹子鉴定，具有高效、准确、低成本、操作简便等优势，可应用于竹子种质资源或品种的耐寒鉴定及分子辅助育种，具有良好的实际生产和应用之价值。

摘要： 本发明公开了与位于玉米种子耐储性相关主效QTL区段紧密连锁的分子标记及其应用；所述分子标记与位于玉米第10号染色体Bin10.03区域内玉米种子耐储性相关主效QTL区段cQTL‑10紧密连锁，该分子标记为phi050和umc1648。本发明通过定位玉米种子耐储性的1个主效QTL区段，该区段包含包含2个QTL qRVI‑10和qRSVI‑10，分别影响相对活力指数和相对简易活力指数，发现了与玉米种子耐储性紧密连锁的2个SSR分子标记phi050和umc1648，本发明所提供的SSR分子标记可应用于提高玉米种子耐储能力的分子辅助育种。