群体遗传结构

摘要： 旨在对几个中国地方猪品种进行群体遗传结构分析,并筛选与中国地方猪产仔数相关的基因组选择信号及候选基因。本研究下载了6个中国地方品种猪共计102头个体的Illumina PorcineSNP60芯片数据,构建了包括19头迪庆藏猪、16头明光小耳猪、16头五指山猪在内的低产仔数组和包括11头姜曲海猪、20头蓝塘猪、20头梅山猪在内的高产仔数组,经质控和基因型填充后,使用软件进行亲缘关系分析、主成分分析、连锁不平衡衰减分析、群体遗传结构分析、进化树构建和选择信号分析,并对受选择位点进行基因定位和功能富集分析。对数据进行质控和基因型填充后共获得33285个SNPs位点,6个中国地方猪品种间个体的亲缘关系较远,品种内个体亲缘关系较近;6个群体的LD衰减速度都非常快,依次为梅山猪<蓝塘猪<姜曲海猪<明光小耳猪<五指山猪或迪庆藏猪;梅山猪群体内存在3个亲缘关系较高的小群体,明光小耳猪有部分个体与迪庆藏猪聚集在一起,各个猪种在进化树的距离与其地理距离较为一致。选择信号分析共筛选到176个受选择的SNPs位点,在其上、下游12.68 kb范围内共检测到66个候选基因,富集到6条信号通路。通过文献查阅发现5个可能与繁殖性状相关的基因,其中CHD7与生长发育迟缓和生殖器异常相关,FBXO43与繁殖力相关并且影响呈圆周运动的精子数量,RUNX1控制雌激素、雄激素和前列腺素的分泌,STRBP与卵巢发育有关,TEDDM1在附睾中特异性表达。CHD7、FBXO43、RUNX1、STRBP和TEDDM1基因可能作为中国地方猪产仔数性状的候选基因。

摘要： 旨在对广灵县优种驴场保种群体进行调查的基础上构建分子系谱,并对其种群的遗传结构进行分析。本研究采集保种群成年、体况良好的广灵驴(体重350~400 kg)颈静脉血10 mL(n=107),其中公驴13份,母驴94份,抗凝处理后提取全血DNA。采用12个微卫星标记进行荧光PCR扩增后,用ABI3730测序仪进行分型。分型结果采用Cervus 2.0和Pedigraph 2.4软件构建分子系谱,同时采用STRUCTURE2.3和Fstat软件计算群体遗传参数,采用R语言的hclust函数绘制7头公驴及其后代的系统发生NJ树(邻接树)。结果,对107头种驴进行了分子系谱构建,找到了30头子代的父亲和7头子代的母亲,系谱可靠性>90%;微卫星标记的平均观测杂合度(H_(Obs))和多态信息含量(PIC)分别为0.6765和0.5939,标记遗传多样性较高;NJ树对7个公驴家系进行了聚类;群体分化系数(F_(ST))为0.184,群体平均近交系数(F_(IT))为0.033,群体内近交系数(F_(IS))为-0.238,且群体处于哈代-温伯格平衡状态,存在很弱的近交。本研究建立了广灵驴保种群可靠性较高的分子系谱并对其遗传结构进行了分析,证明该群体遗传多态性较高,群体近交系数较低,处于较好的保种状态,具有较大的品种资源开发潜力。

摘要： 为揭示江西及周边地区地方鸡的遗传多样性信息,本研究采集了江西省5个地方鸡品种,广东省、浙江省以及江苏省各1个地方鸡品种共125个血样,利用全基因组SNP芯片分析地方鸡品种的群体结构、网络关系及系统进化情况。结果表明,8个地方鸡品种45647个位点的多态信息含量大多为0.25

摘要： 基于SSR标记对蓝莓品种‘蓝美1号’(Vaccinium corymbosum‘Lanmei 1’)217个自由授粉子代和26个现有蓝莓(Vaccinium spp.)栽培品种的遗传多样性和群体遗传结构进行了分析。结果显示:243个供试材料中,23对引物共检测出113个等位基因。多态性信息含量指数(PIC)为0.5075~0.8330,均值为0.6866;所有引物的PIC值均在0.5以上,表明SSR引物的多态性较高。217个自由授粉子代的Nei’s遗传多样性指数和Shannon’s多态性信息指数的均值分别为0.7334和1.4394,自由授粉子代较现有栽培品种具有较高的遗传多样性水平。UPGMA聚类分析中,26个品种聚为一类;217个自由授粉子代的遗传相似系数为0.70~0.99,除少数自由授粉子代外,其余子代划分为3个类群。STRUCTURE分析将217个自由授粉子代划分为4个亚群,亚群内子代遗传背景相对单一。比较UPGMA聚类分析和STRUCTURE分析的结果,STRUCTURE分析的分群效果更佳,亚群内子代间遗传相似性高。综合分析结果表明:筛选出的23对引物具有高度多态性;‘蓝美1号’自由授粉子代的遗传多样性较高,同现有栽培品种亲缘关系较远,可为蓝莓品种的改良提供丰富的遗传资源。

摘要： 目的探究27个Y-STR基因座在贵州苗族群体中的遗传多样性分布。方法采集贵州苗族418名无关健康男性个体的血液样本,采用Y filer TM Plus试剂盒对27个Y-STR基因座进行复合扩增检测,根据基因型结果计算27个Y-STR基因座的等位基因频率、基因多态性、单倍型多态性等群体遗传学参数,分析贵州苗族和其他几个不同地区的少数民族群体的遗传关系。结果在418名贵州苗族个体中,一共观察到240个等位基因,等位基因频率为0.0024~0.8923,27个Y-STR基因座的GD值为0.1950~0.9128;群体遗传学分析结果表明,贵州苗族与其他民族之间具有相对较远的遗传关系。结论该27个Y-STR基因座在贵州苗族人群中具有丰富的遗传多态性。

摘要： 【目的】分析高原粳稻主栽品种的遗传状况,寻找与农艺性状相关联的分子标记,为水稻新品种选育提供参考。【方法】在2种海拔条件下调查81份高原粳稻主栽品种的农艺性状,并利用48个SSR标记对供试品种进行多态性扫描和群体遗传结构分析,在此基础上采用Tassel 2.1 MLM(MixedLinear Model)方法进行SSR标记与农艺性状的关联分析。【结果】37个SSR标记在供试品种间具有多态性,共检测出139个等位变异,变异范围为2~10个,平均3.76个。群体遗传结构分析将供试品种分为2个亚群,关联分析表明,在P<0.05水平,2种环境下均检测出RM1195和RM209分别与株高和千粒重相关联,RM267、RM332、RM490、RM583和RM590与结实率相关联,各标记对表型变异的解释率在0.074~0.352。而在P<0.001水平,只有RM332与结实率相关联,该分子标记位于11号染色体上。【结论】检测出的7个标记可以为高原粳稻杂交配组及分子标记辅助育种提供理论依据。

摘要： 伴随着中国水产养殖业的快速发展,原产美国的旧金山卤虫(Artemia franciscana)被引入至我国渤海湾地区。为研究旧金山卤虫被引入中国后其基因组遗传多样性改变情况,本研究利用COI线粒体分子标记,评估旧金山卤虫在非原生栖息地,即唐山曹妃甸南堡镇(渤海湾,河北省)定殖的旧金山卤虫的遗传多样性现状。研究分析发现:相比于美国原产地区的旧金山卤虫种群(大盐湖种群和旧金山湾种群),旧金山卤虫南堡种群表现出较为丰富的遗传多样性。而且,旧金山卤虫南堡种群与美国原产地区种群(大盐湖种群和旧金山湾种群)存在显著的遗传分化,表明旧金山卤虫南堡种群并非是从美国大盐湖虫种群和旧金山湾种群直接引入。

摘要： 【目的】研究玉米杂种优势类群划分高多态SSR引物筛选。【方法】遴选均匀分布在玉米10个连锁群上160对SSR引物,在104份玉米自交系DNA中扩增,根据引物的染色体分布和PIC值,分别取40、30、20和10对高多态引物建立4套新引物体系,检测104份自交系的分类效果。【结果】(1)160对引物中的63对引物带型稳定,多态性高,最高PIC值0.7623,高于过去常用核心SSR引物,63对引物中过去常用核心SSR引物仅保留40%左右;(2)4套引物体系中,40和30对引物体系的分类结果与已知自交系类群高度吻合,20对体系与40对体系比较具90.5%一致性,10对体系与40对体系比较的一致性81.0%;(3)40对体系分类104份材料为5大类群,分别是瑞德、改良瑞德、兰卡斯特、黄改和和旅大红骨,与目前国内利用的优势群划分结果一致,也能鉴别出每个群中亲缘关系最远的亚群是相近群间二环系来源的混合基因型;(4)各群的代表自交系是单一遗传结构成分,亚群是多遗传结构成分。【结论】部分SSR引物的多态性在新自交系中会出现下降,建立的新的40对引物体系有精确的分类功能,可应用于类群划分,20对体系的分类精确性稍低,但检测工作量减半,在批量材料分类中有利用价值。

摘要： [目的]解析控制栗属农艺性状的自然等位变异并获得与其相关联的SSR位点,为分子标记辅助选择和高效育种奠定基础。[方法]以涵盖9个杂交组合的235份栗杂交子代混合群体为材料,采用SSR标记对其进行群体遗传结构和连锁不平衡(LD)分析,并将32个高多态性SSR标记与25个农艺性状进行关联分析。[结果]统计概率P<0.05时,32对SSR标记组成496个位点中存在一定的连锁不平衡,其中,74个位点的连锁不平衡水平较高,占总标记对的14.92%;而P<0.01时,32个SSR位点间LD总体水平较低。群体遗传结构分析结果显示,当K=4时,Delta K值接近最大。据此,F_(1)代混合群体被划分为4个亚群,且每个亚群中子代分布呈现出一定的遗传分化,平均混合度为0.120。GLM模型中,高达28个SSR标记位点与树高等24个农艺性状呈极显著关联,每个性状可检测到关联的SSR位点数1~22个不等,解释率范围为4.65%~24.02%;MLM模型中,得出26个SSR位点与树高等23个性状呈极显著关联,解释率范围为5.04%~24.02%。综合两种模型关联分析结果,发现15个SSR标记与树高等3个生长性状关联,14个SSR标记与1年生枝条长度等3个枝条性状关联,26个SSR标记与叶片长度等18个叶片表型及其光合生理性状关联。[结论]ICMA017s等15个SSR标记分别与树高等13个农艺性状高度关联,标记对性状的解释率均在10.00%以上,且存在同一标记与多个性状、同一性状与多个标记高度关联的现象。

摘要： 【目的】试验旨在对肃南牦牛进行群体遗传结构、选择信号分析和连续纯合片段(ROH)检测,挖掘肃南牦牛的种质特性相关基因。【方法】选择肃南牦牛、巴州牦牛、斯布牦牛、九龙牦牛和天祝白牦牛5个牦牛品种共计48头牦牛进行全基因组重测序,采用基因组变异检测流程(GATK)获得高质量的单核苷酸多态性(SNP)标记进行下游分析;对5个牦牛品种的基因型数据进行主成分分析、祖先成分分析和系统进化树分析以确定其群体结构;对5个牦牛群体进行ROH检测以及近交系数计算;采用综合单倍型评分(iHS)方法筛选共有高频ROH区域内受选择位点。【结果】5个牦牛品种共鉴定出15092883个SNPs,主要分布于内含子区域。亲缘关系计算结果显示,所有个体均不存在三代以内亲缘关系,满足后续分析要求。主成分分析表明,5个牦牛品种可以显著地分为5个类群,其中肃南牦牛群体内遗传变异较小。群体结构分析显示,肃南牦牛包含其他4种牦牛祖先成分,其中天祝白牦牛祖先成分所占的比例最大。ROH分析显示,5个牦牛品种共检测到8426个ROHs片段,其中高频ROH区域421个。相比于其他4个牦牛品种,肃南牦牛的ROH片段总长度和数目最多,具有较高的连锁程度,其近交系数远大于其他牦牛群体。在肃南牦牛高频ROH区域上注释得到465个候选基因,主要富集到与机体发育、大脑形态形成、脂肪氧化相关的通路,包括胚胎骨骼系统形态发生、前后模式规范、甲状腺发育通路和Hippo通路,其中与胚胎发育及组织分化过程相关的基因有同源框A3(HOXA3)、HOXA5、HOXD3,与肉品质相关的基因有花生四烯酸12B(ALOX12B)、ALOX15B、ALOXE3,与中脑发育相关的基因为成纤维细胞生长因子8(FGF8)。在7号染色体1个高频ROH区域中(Chr7:12661870-13045935)鉴定到3个共享基因(核内不均一性核糖核蛋白K(HNRNPK)、驱动蛋白27(KIF27)、G激酶锚定蛋白1(GKAP1))与牦牛共有的高原适应性有关。对共有高频ROH区域内的位点进行iHS分析,鉴定到的受选择基因主要与抗病性、内质网分泌蛋白加工及细胞周期调节相关,包括N-α乙酰转移酶25(NAA25)、内质网分子伴侣29(ERP29)、跨膜蛋白16(TMEM116)、TRAF型锌指结构域蛋白1(TRAFD1)、HECT结构域E3泛素连接酶4(HECTD4)基因。【结论】本研究从全基因组水平系统评估肃南牦牛的遗传多样性和遗传背景,鉴定了肃南牦牛ROH区域内与表型相关的基因,并重点挖掘了与其他牦牛品种共享高频ROH区域内的受选择基因,为肃南牦牛种质资源开发、利用提供了重要理论依据。

摘要： 目的:揭示灰毡毛忍冬品种的遗传多样性水平及品种群体遗传结构特点.rn 方法:采用新型分子标记SCoT对对中国5个灰毡毛忍冬品种(常规种、白云、渝蕾1号、金萃蕾及湘蕾1号)群体的遗传多样性、遗传结构进行分析.运用POPGENE软件计算相关遗传参数,UPGMA方法聚类,结合MEGA5软件生成树状图. 结果:物种水平上,PPB=85.34％、有效等位基因数Ne=1.3479、Nei's基因多样度H=0.2075和Shannon's多样性信息指数Hsp=0.3198,表明灰毡毛忍冬5个品种的遗传多样性较高.在品种群体水平上,各遗传参数据的平均值为PPB=19.74％,Ne=1.0946,H=0.0561,Shannon's多样性信息指数Hpop=0.0850,表明品种内遗传多样性较低.Nei's基因多样性指数计算的品种间遗传分化系数(Gst=0.7319)与Shannon's品种间分化系数(0.7324)是一致,均说明大部分遗传变异存在于品种间.品种间的遗传分化可能是由人为选择、繁殖方式和基因流障碍(Nm=0.1831)引起的.两两品种间的Nei's遗传一致度(Ⅰ)的范围为0.7222～0.9419.根据Nei's遗传距离进行各品种间的UPGMA聚类,5个品种聚为两个大类.rn 结论:在品种选育中应加强育成品种的交流、增加优异基因相互渗透,从而拓宽灰毡毛忍科的遗传基础。

摘要： 微卫星分析由于其众多优点,已经成为群体遗传结构、遗传多样性研究中常用的方法.微卫星分析在蜜蜂群体遗传结构研究中也得到了大量应用.本文介绍了一种基于工蜂父本雄蜂基因型的新的微卫星研究策略.新研究策略可以大大减少采样的工作量,尤其适合对采样难度较大的野生蜂种进行相关研究.

摘要： 目的：了解西藏小型猪的群体遗传结构。rn 方法：针对所优选出的40个微卫星位点设计引物,对35头南方医科大学饲养的西藏小型猪样本进行PCR扩增,扩增产物采用STR扫描技术进行测定,分析西藏小型猪的群体遗传结构。rn 结果：西藏小型猪群体平均有效等位基因数为4.6187,平均杂合度为0.7576,平均多态性信息含量0.7463。rn 结论：西藏小型猪群体具有丰富的遗传多样性,符合封闭群动物遗传特性。

摘要： 应用微卫星标记和最新遗传算法软件，对山东省内4个绵羊品种和1个参照群体进行了群体遗传结构分析。结果表明，所研究的绵羊品种有较为复杂的底层遗传结构。小尾寒羊、大尾寒羊和洼地绵羊品种的个体分别有独立的推测群体，说明他们有独特的遗传背景；大尾寒羊和小尾寒羊、山地绵羊与洼地绵羊的个体分别组成两个推测群体，说明这两组品种具有清晰的地理类群特征。造成这种结构特征的原因是两组品种地理位置邻近，存在明显的近期基因渗透现象(20%～30%)，尤其是洼地绵羊与山地绵羊的第一世代迁移率达到10.53%。所有绵羊品种中都可能存在较高的近交效应(F≥0.4)，WILCOXON TEST表明，除大尾寒羊以外，小尾寒羊、山地绵羊和洼地绵羊都经历过近期的瓶颈效应(He>Heq，P<0.05或P<0.01)。研究还解释了一些现象，可用于确定绵羊品种的遗传管理策略。

摘要： 本文首次通过对COI基因序列进行分析，研究了中国沿海及泰国普吉岛8个里氏拟石磺群体的种群遗传结构，结果显示，该群体平均T、C、A、G碱基含量分别为38.0%、15.3%、25.3%和21.3%，分子方差分析表明，50.99%的变异存在于种群间，49.01%的变异发生在种群内。进一步的SAMOVA显示，群体分为3组时，遗传分化固定指数(FcT)最大，为0.601，即泰国普吉岛群体为一类群，中国沿海的北海和东兴群体分化为一类群，其余5个群体为一类群。遗传距离模式(IBD)检测显示出，里氏拟石磺群体的遗传距离与地理距离之间不存在明显的线性关系。为此推断，在不受地理环境阻隔条件下，里氏拟石磺群体虽具有浮游幼虫阶段，只在小尺度范围内基因交流明显，而在大范围下仍具有显著的基因差异。历史动态检验推断，湛江(ZJ)、苍南(CN)、东寨港(HN)、文昌(WC)及普吉岛(TH)种群可能经历过历史上的种群扩张事件。中国沿海群体扩张时间推测大约为0.725MaBP～0.781MaBP，泰国普吉岛群体约为0.035MaBP，两者可能伴随更新世间冰期的气候变暖、冰川消融、海平面上升发生。

摘要： 野牦牛属高寒地区的特有物种,是我国最珍贵的野生动物遗传资源之一,动物线粒体基因组(mtDNA)具有进化速率快、多态性丰富、无重组等特点,被广泛应用于动物起源、演化和分类,以及群体遗传结构、亲缘关系等研究.本研究对野牦牛mtDNA进行全序列测定和结构分析，并结合GenBank中家牦牛、普通牛、瘤牛、美洲野牛等的相应序列分析研究了其分类学地位。结果表明:(1)野牦牛线粒体基因组全序列的大小为16322bp，整个基因组由37个编码基因和D-loop区组成，分别位于L链和H链;22个tRNA基因序列长度为1524bp、2个rRNA基因序列长度为2528bp、13个编码蛋白基因序列长度为11420bp、D-loop区长度为892bp将野牦牛与家牦牛、普通牛、水牛、美洲野牛、羚羊、白犀牛、印度犀牛、绵羊线粒体基因组全序列进行比对和聚类分析，构建系统进化树，结果牦牛与野牦牛首先聚为一类，接着与美洲野牛相聚成一大类;普通牛与瘤牛聚为一类，再与水牛聚为一大类。牦牛为牛亚科中的一个独立属，即牦牛属(Poephagus)，牦牛属包括家牦牛(Poephagusgrunniens)和野牦牛(Poephagus mutus)2个种。野牦牛线粒体基因组全序列的获得和结构解析对研究牦牛的起源、演化和分类，以及野牦牛遗传资源的保护、开发和利用均具有重要的理论和实际意义。

摘要： 实验材料分别采自西藏自治区拉萨市、日喀则、林芝和昌都地区，按生态和形态多样性原则于2009年5-6月选取健康植株叶片，单株为1个样品，硅胶干燥，DNA提取采用改良CTAB法，PCR产物用6%的变性聚丙烯酞胺凝胶电泳分离，Promega银染法。应用PopGen Version 1.31进行聚类分析，NTSYS-pc2.1生成聚类图。通过SRAP标记对来自西藏境内4个光核桃自然居群的遗传多样性和群体遗传结构分析结果表明:西藏光核桃遗传多样性水平较高，居群间遗传分化较小，居群间的基因交流程度较高。

摘要： 目的:旨在分析欧拉型藏羊的微卫星DNA多态性，以期了解该品种的遗传多样性，为该品种保种选育和品质的进一步提高提供一些有益资料。rn 方法:利用15对微卫星引物，以欧拉型藏羊为研究对象，通过计算基因频率、多态性信息含量、有效等位基因数和杂合度，评估其品种内的遗传变异。rn 结果:结果表明：在15个座位中。共检测到175个等住基因，每个座位平均为11.67个等位基因;座位平均杂合度为0.885 4：平均有效等位基因数为9.042;平均多态性信息含量为0.865 7。rn 结论:结果提示，欧拉型藏羊群体存在丰富的遗传多样性。所选微卫星标记可用于绵羊遗传多样性评估。

摘要： 新疆野苹果(Malussieversii(Lebed．)Roem．)可能是栽培苹果(MalusdomesticaBorkh．)的祖先,属珍稀的第三纪孑遗物种,不但变异丰富,而且环境适应能力强,是栽培苹果品种改良的优异资源,且有园林应用价值.本文对新疆野苹果的发生、分类学地位、群体遗传结构、遗传多样性、生存现状及核心种质构建与新疆野苹果的保护保存等作一综述,旨在为新疆野苹果这一珍贵资源的科学保护与有效利用提供参考.

摘要： 由致病疫霉Phytophthora infestans(Mont)de Bary引起的晚疫病是严重为害马铃薯和番茄生产的真菌性病害之一。据报道晚疫病近几年再度流行与病菌群体结构的组成与变异有密切关系。为明确我国致病疫霉的群体结构及变异特点,本文对1998-2006年来自福建、黑龙江、河北、内蒙古、甘肃、吉林六省(市)的160个致病疫霉菌株进行了表现型(交配型和抗药性)和基因型(同工酶基因型和线粒体DNA单倍型)结构研究,系统地揭示了我国致病疫霉群体的遗传多样性,为晚疫病抗病育种及综合防治提供了理论依据。

摘要： 本发明提供一种用于检测萱草属(Hemerocallis L.)植物遗传多态性的引物组，属于分子生物学领域。所述引物组选自由34对引物对构成的群组：所述34对引物对的核苷酸序列如SEQ ID No.1至SEQ ID No.68所示。上述引物组还可用于萱草属植物遗传群体结构的鉴定。采用本发明所提供的引物组和鉴定方法，可在萱草属植物的任一生长阶段采样，并进行遗传分类鉴定，具有周期短、限制少、准确性高等优点。

摘要： 本发明提供了一种使转座因子移动的方法。所述方法包括以下步骤：a)提供DNA甲基化抑制剂和/或转录抑制剂，和b)使所述抑制剂与包含失活的转座因子的细胞接触，从而产生具有移动的转座因子的细胞。在本发明的第二方面，提供了一种增加多个真核细胞生物体中的遗传变异和/或表观遗传变异性的方法。所述方法包括以下步骤：i.提供DNA甲基化抑制剂和/或转录抑制剂，ii.使所述生物体与所述抑制剂接触，和iii.使所述生物体繁殖。

摘要： 本发明实施例公开一种遗传分离群体的遗传图谱构建方法及装置，能提高遗传分离群体的遗传图谱构建的准确性以及遗传信息的利用率。方法包括：S1、通过对遗传分离群体的全基因组进行标记开发和分型，得到所述遗传分离群体的分子标记和所述分子标记所属的分型类型，并对所述分子标记进行连锁群划分；S2、对于每一个连锁群，根据分子标记之间的重组率和所述分型类型对该连锁群内的分子标记重新分型，对重新分型得到的结果中的分型错误和缺失进行纠错，基于纠错的结果对该连锁群内的分子标记进行排序，基于排序结果构建所述遗传分离群体的遗传图谱。

摘要： 本发明提供一种用于检测萱草属(Hemerocallis L.)植物遗传多态性的引物组，属于分子生物学领域。所述引物组选自由34对引物对构成的群组：所述34对引物对的核苷酸序列如SEQ ID No.1至SEQ ID No.68所示。上述引物组还可用于萱草属植物遗传群体结构的鉴定。采用本发明所提供的引物组和鉴定方法，可在萱草属植物的任一生长阶段采样，并进行遗传分类鉴定，具有周期短、限制少、准确性高等优点。

摘要： 本发明属于分子生物学和遗传学领域，具体公开了一种群体区分和鉴定的遗传标记参照系的构建方法及遗传标记参照系。所述构建方法包括对遗传标记数据进行数据分割和遗传标记挑选，或视情况对分割后的数据进行过滤，或对挑选后的遗传标记进行整合优化。采用本发明所述的方法可成功地使计算的复杂度从O(2

摘要： 本发明公开了一种用于橡胶树白粉菌群体遗传结构分析的SSR引物组及其应用。所述用于橡胶树白粉菌群体遗传结构分析的SSR引物组包括16对引物，引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.17～48所示。本发明还提供了所述引物组在橡胶树白粉菌群体遗传结构分析中的应用。所述引物组具有特异性好、扩增稳定、多态性丰富、重复性好、便于统计等特点，为橡胶树白粉菌群体遗传结构的研究提供了新的技术和手段。

摘要： 本发明提供一种利用cpDNA序列YCF1–RPS15分析野生丹参群体遗传结构的方法，具体步骤如下：（1）选取不同的野生丹参种群，对每株野生丹参幼嫩茎叶进行基因组总DNA的提取；采用引物YCF1–RPS15对野生丹参种群个体进行PCR扩增，获得YCF1–RPS15序列的扩增产物；引物序列为：YCF1：5´CTTGTATGRATCGTTATTGKTTTG 3´；RPS15：5´CAATTYCAAATGTGAAGTAAGTCTCC 3´；根据序列比对和生物信息学分析，获得野生丹参不同地理种群的遗传多样性水平和群体遗传结构。本发明提供的方法能分析野生丹参种群的遗传变异，了解河南省野生丹参群体的遗传多样性和遗传结构情况，结果可为野生丹参资源的合理利用和保护提供科学依据。

摘要： 本发明提供了一种野生斑鳜遗传多样性和群体遗传结构的检测方法，包括以下步骤：a)、分别提取不同群体野生斑鳜的DNA；b)分别对步骤a)获得的各野生斑鳜DNA进行第一PCR扩增和第二PCR扩增，获得各野生斑鳜DNA的第一扩增产物和第二扩增产物；c)分别对各野生斑鳜DNA的第一扩增产物和第二扩增产物进行双向测序，将第一扩增产物的Cyt b基因序列和第二扩增产物的D‑loop基因序列拼接组合，获得各野生斑鳜目的序列；d)对所述不同群体各野生斑鳜目的序列进行遗传多样性和群体遗传结构分析。本发明采用双基因序列拼接的组合分析，弥补了单基因序列信息量不足的缺点，更客观真实反映了物种遗传多样性的状况。

摘要： 本发明公开了一种用于橡胶树白粉菌群体遗传结构分析的SSR引物组及其应用。所述用于橡胶树白粉菌群体遗传结构分析的SSR引物组包括16对引物，引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.17～48所示。本发明还提供了所述引物组在橡胶树白粉菌群体遗传结构分析中的应用。所述引物组具有特异性好、扩增稳定、多态性丰富、重复性好、便于统计等特点，为橡胶树白粉菌群体遗传结构的研究提供了新的技术和手段。

摘要： 本发明提供一种利用cpDNA序列YCF1–RPS15分析野生丹参群体遗传结构的方法，具体步骤如下：（1）选取不同的野生丹参种群，对每株野生丹参幼嫩茎叶进行基因组总DNA的提取；采用引物YCF1–RPS15对野生丹参种群个体进行PCR扩增，获得YCF1–RPS15序列的扩增产物；引物序列为：YCF1：5´CTTGTATGRATCGTTATTGKTTTG 3´；RPS15：5´CAATTYCAAATGTGAAGTAAGTCTCC 3´；根据序列比对和生物信息学分析，获得野生丹参不同地理种群的遗传多样性水平和群体遗传结构。本发明提供的方法能分析野生丹参种群的遗传变异，了解河南省野生丹参群体的遗传多样性和遗传结构情况，结果可为野生丹参资源的合理利用和保护提供科学依据。