比较基因组杂交

摘要： 蕈样肉芽肿是原发皮肤T细胞淋巴瘤中最常见的类型,其发病机制仍然不清楚.研究显示,蕈样肉芽肿存在高频染色体片段拷贝数变异,如染色体7q、1q、17q的扩增和9p21、10q、17p的缺失,导致相应区域上原癌基因扩增和抑癌基因丢失,从而促进肿瘤的发生发展.同时蕈样肉芽肿中存在低频单核苷酸变异,这些变异基因主要集中在细胞周期调控、细胞凋亡、染色质重塑以及T细胞活化相关的通路上.蕈样肉芽肿很少有发生基因融合变异的报道.另外,部分蕈样肉芽肿病例会发生大细胞转化,往往预示疾病进展及药物抵抗等不良预后.总之,蕈样肉芽肿是一种具有高度分子遗传学异质性的复杂疾病,未来还需要更广泛深入的机制研究.

摘要： 目的 探讨微阵列比较基因组杂交(array comparative genomic hybridization,aCGH)技术对于产前诊断意外检出Duchenne肌营养不良(Duchenne muscular dystrophy,DMD)基因重复/缺失的准确性.方法 回顾性分析2018年7月至2019年12月在河南省人民医院5 025份无DMD家族史产前诊断样本中,经aCGH检出的31例DMD基因重复/缺失病例.同时使用多重连接探针扩增(multiplex ligation-dependent probe amplification,MLPA)技术对胎儿及孕妇进行验证,并参考美国医学遗传学与基因组学学会(American College of Medical Genetics and Genomics,ACMG)指南对检出DMD基因重复/缺失进行致病性分析.采用描述性方法进行分析.结果 31例(0.62％,31/5 025)DMD基因重复/缺失中,25例≤200 kb,6例＞200 kb;缺失24例,重复7例;外显子重复/缺失19例,内含子重复/缺失12例.对31例变异按照ACMG五分类评分,致病性变异17例,致病不明/可能良性/良性变异14例.检出的19例外显子变异中,17例为DMD基因内部变异,2例涉及DMD基因内部及以外区域变异,经MLPA技术验证,均获得阳性结果.结论 aCGH技术检出的DMD基因外显子区域重复/缺失真实可信,对DMD诊断具有重要提示作用.对于同时涉及DMD基因内部及以外区域变异的病例,aCGH能够明确DMD基因上下游断裂点区域,为ACMG分级提供依据.

摘要： Objective To investigate the detection rate,clinical indications and pregnancy outcomes of pregnancies with prenatally diagnosed small supernumerary marker chromosome (sSMC) to provide a theoretical foundation for prenatal diagnosis and genetic counseling of sSMC.Methods This study retrospectively analyzed the clinical data of 20541 cases who underwent prenatal diagnosis at the Prenatal Diagnostic Center in the Department of Obstetrics and Gynecology in Peking University First Hospital from January 2007 to May 2018.The detection rate,diagnostic indications and pregnancy outcomes of the cases with sSMC were analyzed after cell culture and karyotyping.Array comparative genomic hybridization (aCGH) was used to analyze the origin of fetal abnormal chromosome in some cases.Results Prenatal diagnostic samples of 20486 cases were successfully cultured,among which 20 (sSMC) were detected giving an detection rate of 0.98‰,while the figures in samples obtained through chorionic villus sampling,amniocentesis and umbilical cord blood sampling were 2.20 ‰ (2/910),0.74 ‰ (14/18824) and 5.32 ‰ (4/752),respectively.Twelve cases of mosaic karyotype were also found.In gravidas for prenatal diagnosis indicated by maternal or paternal chromosomal abnormality,fetal structural anomalies on ultrasonography,adverse pregnant history,advanced maternal age and high risk of Down's syndrome,the detection rates of sSMC were 10.42 ‰ (1/96),2.65 ‰ (4/1507),1.89 ‰ (5/2 643),0.83‰ (8/9 624) and 0.49‰ (2/4013),respectively.Eleven cases were further analyzed with aCGH,four of which showed pathogenic copy number variants involving 2q11.1-q12.1,2p12-p11.1 and 2q11.1-q12.1,7q 11.21-q 11.23 and 15q11.1-q 13.3 dup1ications and terminated the pregnancies.Seven cases carried nonpathogenic marker chromosomes,of which one terminated the pregnancy,while the other six continued to fullterm with uneventful outcomes until follow-ups.Conclusions sSMC is hard to detect in prenatal diagnosis,but maternal or paternal chromosomal abnormalities,fetal structural anomalies on ultrasonography and adverse pregnancy and childbirth history are strong indications.Cytogenetics and molecular diagnosis combined can clarify the character,origin and pathogenicity of sSMC,and is of great clinical importance in prenatal genetic counseling and maternal decision making.%目的 探讨额外小标记染色体(small supernumerary marker chromosome,sSMC)在行产前诊断病例中的检出率、产前诊断指征及妊娠结局,为临床工作中sSMC的产前诊断和遗传咨询提供理论依据. 方法 回顾性分析2007年1月至2018年5月在北京大学第一医院妇产科产前诊断中心20541例行产前诊断的病例资料,统计胎儿绒毛、羊水和脐带血标本经细胞培养和染色体G显带核型分析sSMC的检出率、产前诊断指征和妊娠结局.采用微阵列比较基因组杂交技术分析部分胎儿染色体异常来源.结果 在培养成功的20486例产前诊断样本中,共检出sSMC 20例,总检出率为0.98‰;其中,绒毛膜活检、羊膜腔穿刺和经腹脐静脉穿刺标本中,sSMC检出率分别为2.20‰(2/910)、0.74‰(14/18824)和5.32‰(4/752);嵌合性核型12例.以夫妻一方染色体异常、胎儿超声结构异常、不良孕产史、孕妇高龄和唐氏综合征筛查高危为产前诊断指征的孕妇中,sSMC检出率分别为10.42‰(1/96)、2.65‰(4/ 1507)、1.89‰(5/2 643)、0.83‰(8/9 624)和0.49‰(2/4 013).11例孕妇进一步行微阵列比较基因组杂交分析,其中4例发现含有致病性基因拷贝数变异改变,分别由2q11.1-q12.1、2p12-p11.1和2q11.1-q12.1、7q11.21-q11.23、15q11.1-q13.3重复突变组成,后期均终止妊娠;7例检测为非致病性sSMC,其中1例引产,6例继续妊娠至足月分娩且妊娠结局良好,后期电话随访自述子代均未见异常. 结论sSMC在行产前诊断病例中检出率较低,但夫妻一方染色体异常、胎儿超声结构异常和不良孕产史是发生sSMC最重要的指征.细胞遗传学与分子诊断技术相结合,可以对sSMC的性质、来源和致病性进行明确诊断,在产前遗传咨询和妊娠结局选择中具有非常重要的临床意义.

摘要： 目的 产前诊断1例超声异常的3q部分三体胎儿,分析其染色体异常来源及表型特征.方法 联合应用胎儿羊水细胞染色体核型分析及比较基因组杂交分析方法对胎儿进行产前诊断.抽取胎儿父母外周血行染色体核型分析.结果 产前染色体核型分析示胎儿Y染色体长臂携带未知来源的额外片段,比较基因组杂交分析提示胎儿3q22.1q29部分三体.母亲染色体核型正常,父亲染色体核型分析提示46,X,t(Y;3) (q12;q23),与外院46,XY,Y≥18结果不符.结论 3q部分三体患者可表现出多系统器官的畸形.染色体核型分析及比较基因组杂交技术联合方法可为超声异常的胎儿提供可靠产前诊断.

摘要： Array-comparative genomic hybridization (a-CGH) technology has significant advantages in detecting abnormal gene copy number alteration (CNA),especially for prenatal diagnosis of mental retardation and multiple congenital malformations,and diagnosis of pancreatic cancer,cervical cancer,gastric cancer,lung cancer and other tumors.What's more,it also has a good application prospect in adult acute leukemia (AL).This review focuses on the application of a-CGH technology in the diagnosis,treatment and prognosis of acute lymphocytic leukemia (ALL),acute myeloid leukemia (AML),mixed phenotype acute leukemia (MPAL),and exploring drug resistance mechanisms.It will provide a new direction for further understanding of the occurrence and development of AL,as well as further research on gene targeting therapy of AL.%微阵列比较基因组杂交(a-CGH)技术在检测基因拷贝数异常(CNA)方面具有显著优势,在针对智力低下、多发性先天畸形等的产前遗传学诊断,以及胰腺肿瘤、宫颈癌、胃癌、肺癌等多种实体肿瘤的诊断中均有广泛应用,并且在成年人急性白血病(AL)中亦有着良好应用前景.笔者拟就a-CGH技术应用于急性淋巴细胞白血病(ALL)、急性髓细胞白血病(AML)及混合表型急性白血病(MPAL)的诊断、治疗、预后及耐药机制研究的进展进行综述,旨在为进一步认识AL的发生、发展过程,以及为更深入研究AL的基因靶向治疗提供新方向.

摘要： 目的 对一例5q35缺失综合征胎儿进行产前诊断,探讨G显带联合微阵列比较基因组杂交技术(array comparative genomic hybridization,aCGH)在产前诊断超声异常胎儿中的应用价值.方法 应用常规G显带分析胎儿及其父母的染色体核型,应用aCGH技术分析胎儿及其父母的DNA拷贝数变异(copy number variations,CNVs)并对核型分析结果进行精确定位.结果 胎儿父母外周血染色体核型分析及aCGH分析结果均未见异常,胎儿核型为46,XY,t(5;10)(q35;p13);aCGH检测发现胎儿5号染色体存在1.68 Mb的新发缺失,缺失区位于5q35.2q35.3,为5号染色体长臂缺失综合征,10号染色体存在1.44 Mb的染色体重复,重复区位于10p14p13.结论 aCGH技术具有更高的分辨率和准确性,是G显带核型分析的有益补充,可应用于临床分子细胞遗传诊断,特别是对缺失或者重复片段较小的非平衡易位患者的诊断中.%Objective To use combined G-banding and array-comparative genomic hybridization (aCGH) for the prenatal diagnosis of a fetus with 5q35 deletion syndrome.Methods Chromosomal karotypes of the fetus and parents were analyzed with C-banding analysis.aCGH was performed to detect minor chromosomal structural abnormalities.Results The karyotype of the fetus was ascertained as 46,XY,t(5;10) (q35;p13),and the karyotypes of the parents were normal.aCGH has identified a de novo 1.68 Mb deletion at 5q35.2q35.3 and a 1.44 Mb duplication at 10p14p13.Conclusion aCGH has a higher resolution and greater accuracy for mapping chromosomal aberrations and is a useful supplement for G banding karyptyping analysis.

摘要： Objective To evaluate the efficiency of the application of array comparative genomic hybridization (array-CGH) in preimplantation genetic diagnosis or screening (PGD/PGS), and compare the clinical outcomes of different stage embryo biopsy. Methods The outcomes of 381 PGD/PGS cycles referred in the First Affiliated Hospital of Nanjing Medical University from July 2011 to August 2015 were retrospectively analyzed. There were 320 PGD cycles with 156 cleavage-stage-biopsy cycles and 164 trophectoderm-biopsy cycles, 61 PGS cycles with 23 cleavage-stage-biopsy cycles and 38 trophectoderm-biopsy cycles.Chromosomal analysis was performed by array-CGH technology combined with whole genome amplification.Single embryo transfer was performed in all transfer cycles.Live birth rate was calculated as the main clinical outcomes. Results The embryo diagnosis rate of PGD/PGS by array-CGH were 96.9%-99.1%. In PGD biopsy cycles, the live birth rate per embryo transfer cycle and live birth rate per embryo biopsy cycle were 50.0%(58/116) and 37.2%(58/156) in cleavage-stage-biopsy group, 67.5%(85/126) and 51.8%(85/164) in trophectoderm-biopsy group (both P0.05). Conclusions High diagnosis rate and idea live birth rate are achieved in PGD/PGS cycles based on array-CGH technology.The live birth rate of trophectoderm-biopsy group is significantly higher than that of cleavage-stage-biopsy group in PGD cycles;the efficiency of trophectoderm-biopsy is better.%目的 探讨微阵列比较基因组杂交(array-CGH)技术在胚胎植入前遗传学诊断或胚胎植入前遗传学筛查(PGD/PGS)中的应用效果及不同胚胎阶段活检的临床结局的差异.方法 回顾性分析2011年7月至2015年8月在南京医科大学第一附属医院进行PGD/PGS治疗的381个周期,其中, PGD 320个周期,采用卵裂期活检156个周期、囊胚期活检164个周期;PGS 61个周期,采用卵裂期活检23个周期、囊胚期活检38个周期.活检标本采用单细胞全基因组扩增结合array-CGH技术行染色体拷贝数分析.所有移植周期均采用单胚胎移植,以活产率作为主要临床结局的评价指标.结果array-CGH技术在PGD/PGS中的明确诊断胚胎比例达96.9%~99.1%.PGD活检周期中,卵裂期活检的每移植周期活产率和每活检周期活产率分别为50.0%(58/116)、37.2%(58/156),而囊胚期活检者分别为67.5%(85/126)、51.8%(85/164),分别比较,差异均有统计学意义(P均0.05).结论 array-CGH技术在PGD/PGS中的应用具有高诊断率,基于array-CGH技术的PGD/PGS可获得理想的临床活产率.在PGD周期中,囊胚期活检比卵裂期活检具有更高的活产率.

摘要： 安捷伦科技公司于3月9日宣布推出首款用于诊断的比较基因组杂交（CGH）微阵列芯片——GenetiSure Dx产后微阵列芯片。采用这一微阵列芯片能比用传统方法更早、更准确地检测出与儿童和成人发育迟缓、智力障碍、自闭症、先天性畸形和畸形体征有关的遗传异常，从而将医学研究的重心由寻找病因快速转换到给予适当医疗与家庭支持。

摘要： 人类正常细胞核中有22对常染色体与1对性染色体,但一些人细胞核内另有多余的常染色体片段,被称为编外标记染色体(small supernumerary marker chromosome,sSMC).sSMC属于染色体结构异常,因其片段太小,并缺少明显的显带模式,无法通过传统的细胞遗传学显带技术进行识别,需要采用芯片比较基因组杂交或荧光原位杂交等多种分子生物学诊断方法才能确诊.由sSMC导致的染色体异常综合征较多,常见为Pallister-Killian综合征、等臂18p染色体综合征、猫眼综合征、Emanuel综合征.智力障碍人群中sSMC中发生率较高,临床缺乏特异性表现,随着分子细胞遗传学分析技术的提高,sSMC的识别率逐步提高.遗传咨询及产前诊断是减少sSMC发生的重要措施,分子生物学技术是明确sSMC的必要方法.现就sSMC相关18p染色体异常综合征的核型特点、发病机制、临床表现等进行综述.%Humans typically have 22 pairs of autosomal chromosomes in cells,and a pair of sex chromosomes.Some individuals have an extra,autosomal chromosome called a small supernumerary marker chromosome (sSMC).sSMC is a structurally abnormal chromosome fragment.The fragments are too small and no-specific banding pattern to be identified by conventional banding cytogenetic analysis.Array-based comparative genomic hybridization (aCGH),fluorescence in situ hybridization (FISH) or other molecular biological methods are necessary for the diagnosis.This article summarized the karyotype,pathogenesis,and the clinical manifestations of the sSMC-related chromosome 18p abnormalities.The patients with sSMC usually presented with abnormal chromosome syndrome.Some syndromes are relative common,such as Pallister-Killian syndrome,isochromosome 18p syndrome,Cat eye syndromes or Emanuel syndrome.sSMC is considered to be the frequent cause of mental retardation.The patients have no specific symptoms.With the progress of molecular cytogenetics,more sSMC has been identified.Genetic counseling and prenatal diagnosis are important to prevent sSMC.Molecular cytogenetic techniques are necessary to the diagnosis.

摘要： 目的:对喉癌全基因组各部分DNA序列拷贝数进行分析、筛查,结合临床与病理资料分析,探索相关染色体改变与喉癌恶变进程的关系. 方法:应用比较基因组杂交技术并结合临床病理学资料对33例原发喉鳞状细胞癌的染色体改变进行研究. 结果:33例肿瘤染色体样本共有189个扩增和163个缺失,平均每例患者分别为5.7个扩增和4.9处缺失.数据表明,染色体DNA非随机拷贝数的改变是扩增多于缺失.常见扩增有:3q(23/33),8q(16/33),11q13(13/33),5p(11/33),2q(8/33),12p(8/33),13q(8/33),9p(7/33).常见缺失有1p32-ter(24/33),3p(12/33),9q(10/33),17p(10/33),19(10/33),20(9/33),2q(9/33)等.在发生3号染色体短臂缺失的10例患者中同时存在整个3号染色体长臂或者部分的扩增.喉癌临床三、四期患者的染色体拷贝数异常均数明显高于临床一、二期的患者(P＜0.05). 结论:研究结果表明在喉癌的发生发展过程中,基因组发生了一系列变化,特别是3q,5p,8q、11q13的扩增和1p32-ter的缺失是喉癌的特征性改变.结合临床资料表明,肿瘤发生所引起的染色体异常可随肿瘤的进展而增加.这些结果为为进一步寻找喉癌发生和进展相关的癌基因和抑癌基因提供线索.针对这些候选区域可进行进一步的分子生物学研究.

摘要： 基因组DNA拷贝数异常(Copy number variations，CNVs)在人类疾病如肿痛、遗传性疾病的发生中起重要作用。传统的细胞遗传技术在鉴定CNVs上无法令人满意，也难以准确判断具体断裂点。我们采用微阵列比较基因组杂交)技术分析临床表型非常相似的一组法洛四联症(Tetralogy ofFallot，TOF)患者的基因组拷贝数变化情况，分析其特异性的病理性CNVs。

摘要： 目的:探讨原发惟胃癌分子细胞遗传学的变化。rn 方法:用比较基因组杂交(comparative genomiehybridazion,CGH)检测原发性胃癌DNA拷贝数变化;用六个微卫星位点分析胃癌18q21杂合性丢失(loss ofheterozygosity,LOH),用单链构象多态性(PCR-SSCP)和直接测序检测18q上SMAD2、DPCA和DCC三个抑癌基因的突变;用半定量和实时荧光定量PCR检测20q上ZNF217、BTAK和CAS三个癌基因扩增情况。rn 结果:CGH发现胃癌常见扩增区域(>20%)有8q,20q,17q,3q,7q,11q,13q,1q和20p,高水平扩增区域有8q,1q21-25,3q26-29和16q11-13。常见丢失区域(>20%)有17p,18q,5q,8p和9p。18q21上六个位点中至少一个位点出现LOH的频率为78%(39/50)。D18S450LOH发生率最高,达48.9%,最小共同丢失区位于D18S450和D18474问。18q21 LOH多见于淋巴结转移和TNMⅢ期和Ⅳ期胃癌病人。胃癌中SMAD2和DPCA无突变,DCC突变率为24.49%(12/49)。胃窦部癌DCC突变率高于胃体和贲门部癌,TNMⅢ期和Ⅳ期胃癌突变率高于TNM Ⅰ期和Ⅱ期。ZNF217扩增率为11.36%,多见于直径≥5 cm和肠型胃癌。胃癌中BTAK和CAS基因相对拷贝数显著高于正常胃粘膜,扩增率分别为16.67%和29.73%。CAS扩增多见于淋巴结转移者。rn 结论:原发性胃癌中有多处染色体区域发生DNA拷贝数畸变,这些区域中可能存在与胃癌发生发展相关的癌基因和抑癌基因,是定位克隆胃癌相关基因的候选区域。胃癌中18q21存在高频LOH,在D18S450和D18S474间有一最小共同丢失区;胃癌中SMAD2和DPCA很少发生突变;DCC可通过突变而失活。20q上ZNF217、BTAK和CAS癌基因可能在部分胃癌中发挥作用。

摘要： 本发明公开了一种基于多个基因组比较和二代测序数据的全基因组关联分析方法，步骤一：使用比对软件将参考基因组和从头组装基因组文件进行比对，步骤二：根据插入片段大小及插入到参考基因组的位置，更新参考基因组中的注释基因位置或结构，步骤三：如果有多个从头组装基因组，依次迭代更新参考基因组；步骤四：利用比对软件将样品的二代测序数据比对到更新后的参考基因组上，步骤五，收集所有样品全部结构变异的分界点位置信息至一个集合中，构建群体基因型，步骤六：根据关联位点和更新后的参考基因组注释文件进行功能基因的候选，本发明实现了利用结构变异基因型数据进行全基因组关联分析。

摘要： 提供了测试样品基因组DNA中存在拷贝数不均衡的确定方法。所述方法可以分别测量单一测试样品与第一杂交阵列的杂交和多个参照样品与多个其他各自测试阵列的杂交。基于最佳拟合参照阵列，可以相对于待测阵列来确定拷贝数。所述最佳拟合可以在最接近或最相似的测得信号信噪比的基础上予以确定。

摘要： 本文公开的内容涉及评价基因组DNA的方法，所述方法包括：a)提供基因组DNA样品；b)提供粒子混合物，所述混合物包含来自不同粒子集的粒子，其中每个粒子集包含大量编码的粒子和用于特定基因组基因座的核酸杂交探针，使得混合物共同地包括用于大量不同基因组基因座的探针；c)在杂交条件下将样品与一部分粒子混合物接触；和d)在混合物的各个部分中，通过监测可测定的标记评价样品与粒子的杂交，其中监测信号表示每个需要测定的基因组基因座的拷贝数。本发明还涉及粒子混合物，其包含来自其不同粒子集的粒子。

摘要： 本发明涉及一种将具有第一核型的细胞的至少一条染色体或其一部分与具有第二核型的细胞的对应染色体或其一部分进行比较的方法。所述方法包括以下步骤：(a)从分离的染色体或分离染色体的一部分扩增DNA；(b)将扩增的DNA与固体基质相连；(c)从具有第一核型的一个或多个细胞扩增DNA和从具有第二核型的一个或多个细胞扩增DNA；(d)用第一标记来标记具有第一核型的一个或多个细胞的扩增DNA以及用第二标记来标记具有第二核型的一个或多个细胞的扩增DNA，其中第一种和第二标记有可检测的不同；(e)将来自具有第一核型的一个或多个细胞的扩增且标记的DNA与连接在固体基质上的扩增DNA杂交，并将来自具有第二核型的一个或多个细胞的扩增且标记的DNA与连接在固体基质上的扩增DNA杂交；和(f)比较与连接在固体基质上的扩增DNA杂交的第一种和第二标记的相对量。

摘要： 本发明公开了一种基于多个基因组比较和二代测序数据的全基因组关联分析方法，步骤一：使用比对软件将参考基因组和从头组装基因组文件进行比对，步骤二：根据插入片段大小及插入到参考基因组的位置，更新参考基因组中的注释基因位置或结构，步骤三：如果有多个从头组装基因组，依次迭代更新参考基因组；步骤四：利用比对软件将样品的二代测序数据比对到更新后的参考基因组上，步骤五，收集所有样品全部结构变异的分界点位置信息至一个集合中，构建群体基因型，步骤六：根据关联位点和更新后的参考基因组注释文件进行功能基因的候选，本发明实现了利用结构变异基因型数据进行全基因组关联分析。

摘要： 提供了测试样品基因组DNA中存在拷贝数不均衡的确定方法。所述方法可以分别测量单一测试样品与第一杂交阵列的杂交和多个参照样品与多个其他各自测试阵列的杂交。基于最佳拟合参照阵列，可以相对于待测阵列来确定拷贝数。所述最佳拟合可以在最接近或最相似的测得信号信噪比的基础上予以确定。

摘要： 提供了测试样品基因组DNA中存在拷贝数不均衡的确定方法。所述方法可以分别测量单一测试样品与第一杂交阵列的杂交和多个参照样品与多个其他各自测试阵列的杂交。基于最佳拟合参照阵列，可以相对于待测阵列来确定拷贝数。所述最佳拟合可以在最接近或最相似的测得信号信噪比的基础上予以确定。

摘要： 本发明提供了使用阵列比较基因组杂交技术分析核酸突变的方法，所述方法减少了假阳性和假阴性并且改善了分析结果的可靠性。使用阵列比较基因组杂交技术分析核酸突变的方法包括：[步骤(a)：使多个标记的样品核酸逐个与多个相同的探针核酸组接触以实现杂交]，[步骤(b)：获得已经杂交到样点X1至Xn的每个样点中的样品核酸的标记强度F1至Fn，所述样点已经杂交有相同的探针核酸]，[步骤(c)：确定从F1与F2的比较值至F1与Fn的比较值的n-1个比较值中的每个是否落入指定的数值范围]，以及[步骤(d)：比较已经确定为未落入指定的数值范围内的比较值的数目是否超过指定数目并且，在超过指定数目的情况中，判断样点X1为阳性]。n是3以上的整数。

摘要： 本发明提供了使用阵列比较基因组杂交技术分析核酸突变的方法，所述方法减少了假阳性和假阴性并且改善了分析结果的可靠性。使用阵列比较基因组杂交技术分析核酸突变的方法包括：[步骤(a)：使多个标记的样品核酸逐个与多个相同的探针核酸组接触以实现杂交]，[步骤(b)：获得已经杂交到样点X1至Xn的每个样点中的样品核酸的标记强度F1至Fn，所述样点已经杂交有相同的探针核酸]，[步骤(c)：确定从F1与F2的比较值至F1与Fn的比较值的n-1个比较值中的每个是否落入指定的数值范围]，以及[步骤(d)：比较已经确定为未落入指定的数值范围内的比较值的数目是否超过指定数目并且，在超过指定数目的情况中，判断样点X1为阳性]。n是3以上的整数。

摘要： 本发明涉及诊断试剂领域，提供了一种出生缺陷靶向寡核苷酸微阵列比较基因组杂交芯片的制备方法。由本发明所述方法制备的出生缺陷靶向寡核苷酸微阵列比较基因组杂交芯片是由靶向特定的染色体或染色体区域的探针构建而成，既能保证病理性CNVs的检出又可以大大减少临床意义不明的CNVs的检出。