组蛋白修饰

摘要： 背景:1,25(OH)2D3缺乏会加剧骨关节炎.前期研究显示,1,25(OH)2D3调控关节炎滑膜成纤维细胞增殖和凋亡,但是其对滑膜成纤维细胞中炎症小体信号通路的调控作用尚不明确.目的:明确含NOD样受体家族Pyrin域蛋白3(pyrin domain containing protein 3,NLRP3)通路分子在滑膜成纤维细胞中的表达水平,探讨1,25(OH)2D3调控NLRP3信号通路的作用及具体机制.方法:通过对临床收集的关节炎和非关节炎患者滑膜组织进行原代细胞培养,检测NLRP3、Caspase招募域和半胱天冬氨酸蛋白酶1等分子的蛋白及mRNA表达水平,体外1,25(OH)2D3刺激原代细胞24 h后,检测上述指标的蛋白表达水平,并通过染色质免疫共沉淀技术检测NLRP3启动子区域的H3K4me3、H2AK119Ub、H3K27me3等组蛋白修饰水平.利用小干扰技术敲低细胞内维生素D受体的表达水平,体外1,25(OH)2D3刺激原代细胞24 h后,检测NLRP3、半胱天冬氨酸蛋白酶招募域和半胱天冬氨酸蛋白酶1等分子的蛋白表达水平.结果 与结论:①NLRP3信号通路相关分子(NLRP3、半胱天冬氨酸蛋白酶招募域和半胱天冬氨酸蛋白酶1)在关节炎滑膜细胞中过表达,NLRP3在骨关节炎患者滑膜成纤维细胞内转录水平明显较健康人组增高,差异有显著性意义(P<0.05);②与对照组相比,体外1,25(OH)2D3可以明显抑制关节炎患者滑膜细胞中NLRP3转录表达及NLRP3信号通路活化,差异有显著性意义(P<0.05);③敲低维生素D受体可减弱1,25(OH)2D3对NLRP3转录的抑制作用,并减弱其抑制NLRP3信号通路活化的作用,提示1,25(OH)2D3对NLRP3的作用主要依赖于维生素D受体;④1,25(OH)2D3抑制NLRP3转录表达主要是通过提高NLRP3启动子区域H3K27me3和H2AK119Ub水平,抑制H3K4me3水平.

摘要： 表观遗传指不涉及DNA序列改变,却导致可遗传表型变化的现象。表观遗传学调控机制主要包括以下四种形式:DNA甲基化、组蛋白翻译后修饰、染色体结构调控以及非编码RNA调控(noncoding RNA)[1]。染色质修饰(DNA甲基化,组蛋白翻译后修饰)与染色质结构调控经常协同发挥功能,同属于染色质相关的表观调控机制。

摘要： 作为表观遗传学研究的重要内容,组蛋白修饰在维持真核生物基因组稳定性、基因表达调控和染色质结构等方面发挥重要作用。水稻是重要的粮食作物,也是科学研究的模式植物。近年来研究发现,组蛋白修饰参与了水稻生长发育、胁迫应答、产量以及品质形成等重要生物学性状的调控。因此,明确组蛋白修饰在水稻中的遗传和调控机制对于水稻遗传改良具有重要意义。对组蛋白修饰的作用机制以及在水稻中的研究进展进行了综述,并进一步展望了水稻中组蛋白修饰的研究前景,以期为水稻育种提供参考。

摘要： 组蛋白修饰是表观遗传调控的一种重要方式,它通过相关修饰酶发生翻译后修饰从而改变染色质的结构和功能。肿瘤血管生成是肿瘤发生、发展、转移、复发过程中至关重要的一个环节。已有大量研究发现,组蛋白修饰和肿瘤血管生成有着密切联系,组蛋白修饰酶可以改变自身表达量或者直接作用于癌基因,也可以与热休克蛋白等相互作用促进或抑制肿瘤血管生成并在一定程度上影响肿瘤的预后。本文就组蛋白修饰在肿瘤血管生成方面的最新研究展开综述,以期揭示组蛋白修饰在其中的具体作用机制、分子机理并为肿瘤预防、诊断、治疗、预后提供新方向。

摘要： 组蛋白修饰在前列腺癌的发生和发展中发挥极其重要的作用。组蛋白修饰通过多种途径调控基因的表达,其在癌症中发挥的作用已在多种肿瘤细胞中得到证实。随着对前列腺癌组蛋白修饰的进一步研究,可以进一步发掘前列腺癌的发病机制,为前列腺癌的诊断和治疗提供新的方法。

摘要： 组蛋白修饰为表观遗传学的重要内容之一,对神经发育有重要影响,如对神经细胞分化及记忆的形成有重要作用。组蛋白修饰异常可改变正常表观遗传的平衡,造成一系列神经发育障碍疾病。组蛋白乙酰化及甲基化是最常见的两种修饰,前者由组蛋白乙酰转移酶与组蛋白去乙酰化酶共同调控,后者由组蛋白甲基转移酶和组蛋白脱甲基化酶调控。组蛋白乙酰化和甲基化调控基因表达异常可影响神经发育。组蛋白乙酰化酶相关基因异常导致疾病包括Rubinstein-Taybi综合征、KAT6A综合征、Genitopatellar综合征、SBBYSS综合征等;组蛋白去乙酰化酶相关基因异常导致疾病主要有2q37缺失综合征。组蛋白甲基化酶相关基因异常导致疾病主要有歌舞伎综合征、Sotos综合征、Wiedemann-Steiner综合征等。目前对组蛋白修饰与神经发育之间的相互作用机制知之甚少,进一步研究相关机制,可为神经发育障碍性疾病的治疗提供新的理论依据并为药物研究、开发提供新的思路。

摘要： 表观遗传学研究基因的核苷酸序列不发生改变的情况下,基因表达的可遗传的变化。组蛋白修饰是表观遗传修饰的重要的方式,对组蛋白修饰机制和调控的研究有助我们了解表观遗传机制,进而指导疾病的治疗和新药的研制。本文综述了组蛋白甲基化、乙酰化、磷酸化等修饰的研究进展。

摘要： 在哺乳动物幼年和青年期,骨骼肌卫星细胞受到组织中环境因子的刺激介导其不断增殖和分化,促进肌肉有效的发育。骨骼肌卫星细胞命运的变化是由于来自肌肉环境的细胞信号传导通过表观遗传机制导致基因表达改变的结果,这种机制包括组蛋白修饰、转录因子的共价结合以及染色质重塑。其中,组蛋白修饰可以通过调控转录机制对特定位点进行修饰实现差异基因表达,进而调控骨骼肌卫星细胞的命运及不同状态肌细胞之间的准确转换。本文概述了骨骼肌再生过程中肌卫星细胞命运转变的发生机理,讨论了组蛋白修饰调控骨骼肌卫星细胞从静息到激活再到增殖和分化的肌源性过程。组蛋白修饰在调控骨骼肌卫星细胞状态的重要性有望成为疾病干预的靶点,以期为促进哺乳动物个体生长、改善肌肉再生和促进病理状态下肌肉平衡提供参考。

摘要： 冠状动脉粥样硬化性心脏病(CHD)是多基因遗传及环境等因素相互作用的复杂性疾病,血瘀证是其常见证型之一。表观遗传学是在基因序列不变基础上,研究基因表达受环境、疾病等影响的可遗传变化的学科,与中医证候本质具有一定相关性,是目前CHD血瘀证研究极具前景的一个领域。本文从表观遗传学在CHD血瘀证治疗、诊断等方面的作用,概述CHD发生的表观遗传学机制,包括DNA甲基化、组蛋白修饰、非编码RNA及染色质重构等,展望其在CHD血瘀证中能作为一种新的诊断指标,为相关基础研究和临床应用提供参考。

摘要： 肺动脉高压(PAH)是一种预后不良的进展性疾病,可导致右心功能不全,从而引起一系列临床症状,甚至导致死亡,目前尚缺乏有效的治疗方法。表观遗传改变在PAH的发病中起着重要作用。组蛋白乙酰化修饰是目前研究最为广泛和深入的表观遗传修饰之一。组蛋白乙酰化水平主要由组蛋白乙酰基转移酶(HATs)和组蛋白去乙酰化酶(HDACs)调节,在染色质和基因调控中发挥关键作用,与PAH的发生密切相关,且靶向组蛋白乙酰化途径对PAH有一定的治疗潜力。本文就HDACs在PAH中的作用研究进展进行综述,以期加深对PAH发病机制的了解,并为其治疗提供新的方向。

摘要： 流行病学以及动物学实验为PM2.5引起不良健康影响的潜在机制提供了大量研究数据[1,2].然而,关于雾霾过后肺损伤恢复过程还鲜有报道.因此,本研究目的在于探究PM2.5暴露结束后肺部损伤的恢复过程及其机制.

摘要： 男性不育不是一个独立的疾病，它是由不同因素造成的共同的病理结果，其中遗传因素是导致男性不育的重要因素之一。对表观遗传学的研究发展为男性不育的诊治提供了新的思路，DNA的表观遗传修饰在精子生成过程中发挥着重要作用。表观遗传修饰异常将会对精子数量和质量产生影响，导致男性生殖障碍。LncRNA可以通过多种途径调节DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质重构，在男性不育的发生和发展中起着重要的作用。

摘要： 早在1986年,Barker首次提出,成年后心脑血管疾病的发生源于胎儿期宫内发育不良.近30年来,国内外学者开展了大量有关孕期不良环境、胎儿出生体重与成年慢性疾病(如代谢综合征、神经精神性疾病、肿瘤等)之间的相关性研究.目前认为,许多成人慢性病是在多基因遗传易感性的基础上,由不良生活方式等环境因素所诱发;并提出提出人类疾病起源的新概念——"健康与疾病的发育起源"(Developmental Origins of Health and Disease,DOHaD).研究表明,除遗传因素外,母体身体状况(如母体疾病、营养状况和子宫功能等)和所暴露的外源环境因素(如环境毒物、药物、不良饮食等)皆是宫内发育不良及出生后慢性疾病易感的诱因.在正常的胚胎发育过程中，DNA甲基化和组蛋白修饰在胚胎发育中扮演着重要的角色，异常的DNA甲基化和组蛋白修饰模式会导致胚胎发育障碍。

摘要： 表观遗传学是一种不改变基因组DNA序列的基因表达调控方式,其主要涉及DNA甲基化、组蛋白修饰及RNA分子干扰.药食植物提取物来源于天然植物,一般无毒,在防癌抗癌方面有独特的优势和广阔的应用前景.研究表明,多种癌细胞中存在药食植物提取物的表观调控靶点,药食植物提取物可通过表观遗传机制来发挥预防和治疗肿瘤的作用.这些成分包括茶多酚、白藜芦醇、染料木黄酮、姜黄素和烯丙硫醇等,它们通过改变DNA甲基化和(或)组蛋白修饰等可导致基因的激活或沉默,从而调控肿瘤抑制基因和(或)癌基因的表达.对肿瘤表观遗传学的进一步研究,将有利于从临床的角度阐明肿瘤的表观遗传学机制,指导抗肿瘤新药的研制和开发,从而更好的预防和治疗肿瘤.

摘要： 本文阐述了DNA甲基化与心血管疾病之间的关系，分析了心血管疾病的组蛋白修饰。且研究证实miRNAs在心血管疾病、心肌梗死、心力衰竭和卒中过程中的重要作用。同时，心血管疾病包括冠心病、高血压、心力衰竭和卒中，它们是西方国家人们发病和致死最主要的原因。这些疾病复杂的发病机制归因于大量的遗传和环境因素相互作用，其中表观遗传机制是一项很重要的方面。DNA甲基化是哺乳动物DNA主要的表观遗传特征，全基因组和特异基因的DNA甲基化揭示了多种基因调节和蛋白功能调控的方式。

摘要： mRNA可变剪接对蛋白质的多样性有很大的贡献.但可变剪接的调控机制目前并不完全清楚.最近研究发现DNA甲基化及一些组蛋白修饰可能与可变剪接有关,表明表观遗传调控有可能参与了mRNA的可变剪接.为更好地了解表观遗传与可变剪接之间的关系,下载了六个细胞系的各种表观遗传ChIP-seq数据,并进行了系统的分析.发现,一些表观遗传学特征,包括DNA甲基化,核小体占有率,组蛋白修饰和其他相关蛋白质的结合,与可变剪接的类型有很强的相关性.进一步分析表明,H3K36me3,EGR1,GABP,SRF,SIN3A和RNA聚合酶Ⅱ与可变剪接的关系最大.并且,发现可变剪接可以分为外显子跳接和可变剪切位点选择这两个不同的大类.这些发现为更加深入研究表观遗传调控在mRNA可变剪接中的作用打下了基础.

摘要： 蛋白酶3(PR3)和髓过氧化物酶(MPO)是抗中性粒细胞胞浆抗体(ANCA)的二个主要靶抗原.发现在ANCA相关性疾病患者的末梢血中,中性粒细胞和单核细胞的PR3和MPO转录异常地高于正常人,并与疾病的活动度呈显著正相关(JASN 2004,15:2103).组蛋白的修饰对基因转录的影响已成为热门话题,组蛋白氨基末端的赖氨酸,精氨酸和丝氨酸可以被修饰,如甲基化、乙酰化和磷酸化.这些修饰有些与基因激活有关,另一些与基因静止有关.提出组蛋白的甲基化和乙酰化均参与ANCA相关疾病的PR3和MPO抗原基因转录的调节，组蛋白的修饰可能在PR3-ANCA和MPO-ANCA患者中是有区别的。

摘要： 蛋白酶3(PR3)和髓过氧化物酶(MPO)是抗中性粒细胞胞浆抗体(ANCA)的二个主要靶抗原.发现在ANCA相关性疾病患者的末梢血中,中性粒细胞和单核细胞的PR3和MPO转录异常地高于正常人,并与疾病的活动度呈显著正相关(JASN 2004,15:2103).组蛋白的修饰对基因转录的影响已成为热门话题,组蛋白氨基末端的赖氨酸,精氨酸和丝氨酸可以被修饰,如甲基化、乙酰化和磷酸化.这些修饰有些与基因激活有关,另一些与基因静止有关.提出组蛋白的甲基化和乙酰化均参与ANCA相关疾病的PR3和MPO抗原基因转录的调节，组蛋白的修饰可能在PR3-ANCA和MPO-ANCA患者中是有区别的。

摘要： 蛋白酶3(PR3)和髓过氧化物酶(MPO)是抗中性粒细胞胞浆抗体(ANCA)的二个主要靶抗原.发现在ANCA相关性疾病患者的末梢血中,中性粒细胞和单核细胞的PR3和MPO转录异常地高于正常人,并与疾病的活动度呈显著正相关(JASN 2004,15:2103).组蛋白的修饰对基因转录的影响已成为热门话题,组蛋白氨基末端的赖氨酸,精氨酸和丝氨酸可以被修饰,如甲基化、乙酰化和磷酸化.这些修饰有些与基因激活有关,另一些与基因静止有关.提出组蛋白的甲基化和乙酰化均参与ANCA相关疾病的PR3和MPO抗原基因转录的调节，组蛋白的修饰可能在PR3-ANCA和MPO-ANCA患者中是有区别的。

摘要： 蛋白酶3(PR3)和髓过氧化物酶(MPO)是抗中性粒细胞胞浆抗体(ANCA)的二个主要靶抗原.发现在ANCA相关性疾病患者的末梢血中,中性粒细胞和单核细胞的PR3和MPO转录异常地高于正常人,并与疾病的活动度呈显著正相关(JASN 2004,15:2103).组蛋白的修饰对基因转录的影响已成为热门话题,组蛋白氨基末端的赖氨酸,精氨酸和丝氨酸可以被修饰,如甲基化、乙酰化和磷酸化.这些修饰有些与基因激活有关,另一些与基因静止有关.提出组蛋白的甲基化和乙酰化均参与ANCA相关疾病的PR3和MPO抗原基因转录的调节，组蛋白的修饰可能在PR3-ANCA和MPO-ANCA患者中是有区别的。

摘要： 本发明提供一种用于检测组蛋白豆蔻酰化修饰的重组蛋白及其应用。本发明的重组蛋白的氨基酸序列包括优化PHD结构域序列，其中，优化PHD结构域序列为：a)SEQ ID No.1所示的氨基酸序列；或b)SEQ ID No.1所示的氨基酸序列经替换、缺失和/或添加一个或几个氨基酸残基形成的具有同等功能的氨基酸序列。本发明的重组蛋白可以特异性识别H3K14cr，用于替代商业化抗体来进行Western Blot实验，预期成本低，批次质量十分稳定，可以快速实现批量化生产。

摘要： 本发明提供用于检测组蛋白位点三甲基化修饰的重组蛋白及其应用。本发明重组蛋白的氨基酸序列中包括串联的N端GST融合蛋白序列和C端Tudor结构域序列。本发明的重组蛋白对H3K4和H4K20的亲和力强，可用于替代商业化抗体来进行Western Blot实验，灵敏度高，没有交叉结合发生，且生产成本显著降低，批次质量十分稳定，可以快速实现批量化生产。

摘要： 本发明属于生物基因工程技术领域，具体为一种水稻组蛋白赖氨酸修饰识别蛋白及其编码基因与应用。该识别蛋白是下述氨基酸残基序列之一：1）序列表中的SEQ ID No：1；2）将序列表中的SEQ ID No:1的氨基酸残基序列经过一至五十个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且对植物的生长发育具有调控作用的蛋白质。本发明还包括含有本发明基因的重组表达载体、转基因细胞系和工程菌以及扩增该基因中任一片段的引物对。该水稻组蛋白赖氨酸修饰识别蛋白的编码基因的反义转基因株系生长矮小。本发明为植物品种改良提供了一个优质基因，具有较高的实际应用价值，应用前景广阔。

摘要： 本发明提供用于检测组蛋白位点三甲基化修饰的重组蛋白及其应用。本发明重组蛋白的氨基酸序列中包括串联的N端GST融合蛋白序列和C端Tudor结构域序列。本发明的重组蛋白对H3K4和H4K20的亲和力强，可用于替代商业化抗体来进行Western Blot实验，灵敏度高，没有交叉结合发生，且生产成本显著降低，批次质量十分稳定，可以快速实现批量化生产。

摘要： 本发明提供一种用于检测组蛋白豆蔻酰化修饰的重组蛋白及其应用。本发明的重组蛋白的氨基酸序列包括优化PHD结构域序列，其中，优化PHD结构域序列为：a)SEQ ID No.1所示的氨基酸序列；或b)SEQ ID No.1所示的氨基酸序列经替换、缺失和/或添加一个或几个氨基酸残基形成的具有同等功能的氨基酸序列。本发明的重组蛋白可以特异性识别H3K14cr，用于替代商业化抗体来进行Western Blot实验，预期成本低，批次质量十分稳定，可以快速实现批量化生产。

摘要： 本发明属于生物基因工程技术领域，具体为一种水稻组蛋白赖氨酸修饰识别蛋白及其编码基因与应用。该识别蛋白是下述氨基酸残基序列之一：1）序列表中的SEQ ID No：1；2）将序列表中的SEQ ID No:1的氨基酸残基序列经过一至五十个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且对植物的生长发育具有调控作用的蛋白质。本发明还包括含有本发明基因的重组表达载体、转基因细胞系和工程菌以及扩增该基因中任一片段的引物对。该水稻组蛋白赖氨酸修饰识别蛋白的编码基因的反义转基因株系生长矮小。本发明为植物品种改良提供了一个优质基因，具有较高的实际应用价值，应用前景广阔。

摘要： 本发明属于生物化学、分子生物学、遗传学、药学和药物化学领域，与生物化学和代谢过程有关。更具体地，本发明提供了在蜱的唾液腺的转录组学分析中鉴定出的抑制凝血酶的一类新型蛋白，具体地是来自sculptin的修饰的直接的凝血酶抑制剂，以及其片段和重组蛋白，其可以用作抗凝剂和用于预防和/或治疗血栓栓塞性疾病。

摘要： 本发明为一种基于无修饰抗体介导纳米金分析检测组蛋白修饰酶的活性以及筛选其抑制剂的比色生物传感方法，包括组蛋白修饰酶底物肽的设计；组蛋白修饰酶底物肽与控制肽混合自组装的比例；基于无标记抗体介导修饰组蛋白修饰酶底物肽的纳米金组装的比色定量方法进行组蛋白修饰酶活性的定量检测以及相应抑制剂的筛选。它利用检测组蛋白修饰酶和其底物肽特异性相互作用，基于纳米金上修饰的底物肽被组蛋白修饰酶修饰后能与相应的单克隆抗体特异性结合，使纳米金组装，通过对修饰组蛋白修饰酶底物肽的纳米金进行紫外定量分析来检测组蛋白修饰酶的活性以及筛选其抑制剂。该方法灵敏度高、操作简便、特异性强，可用于生物学研究、医学研究、药物筛选等。

摘要： 本发明属于表观遗传生物学技术领域，公开了一种高通量大规模筛选组蛋白修饰结合蛋白质的方法，所述高通量大规模筛选组蛋白修饰结合蛋白质的方法包括：进行组蛋白修饰结合蛋白质筛选前的预处理工作；对组蛋白进行快速提取及翻译处理；进行组蛋白修饰芯片的制备；进行组蛋白修饰与蛋白质结合复合物的制备；进行组蛋白修饰结合蛋白质的筛选。本发明操作方法清晰，设定了明确的用酸法组蛋白提取方法，保证了在后续的操作中组蛋白的操作不会受其他分子的影响，提高了组蛋白的通过的规模以及筛选的准确率，使用LS‑MS检测方法检测蛋白质复合物中的蛋白质种类，使得在后续的修饰操作中有更明确的修饰目标以及提高整体方法的效果。

摘要： 本发明公开了一种高通量大规模筛选组蛋白修饰结合蛋白质的方法，筛选方法包括制备一种固定有溶胶‑凝胶材料与组蛋白质修饰多肽混合物的位点的组蛋白修饰芯片，然后将待筛选蛋白质混合物与组蛋白修饰芯片上固定的多肽发生反应，再通过LC‑MS/MS液质联用方式分析确定能与特定组蛋白修饰结合的蛋白质种类。根据本发明，组蛋白修饰芯片可以用溶胶‑凝胶材料在任意大小的孔板、尼龙膜、硝酸纤维素膜、醋酸纤维素膜、玻璃板或硅板上制备，再使用LC‑MS/MS液质联用方式高通量大规模鉴定与组蛋白修饰结合的蛋白质。本发明操作方法清晰，一次鉴定数量多，通量高，规模大，鉴定结果准确。