关于表观遗传特征与mRNA可变剪接之间关系的探究

摘要

mRNA可变剪接对蛋白质的多样性有很大的贡献.但可变剪接的调控机制目前并不完全清楚.最近研究发现DNA甲基化及一些组蛋白修饰可能与可变剪接有关,表明表观遗传调控有可能参与了mRNA的可变剪接.为更好地了解表观遗传与可变剪接之间的关系,下载了六个细胞系的各种表观遗传ChIP-seq数据,并进行了系统的分析.发现,一些表观遗传学特征,包括DNA甲基化,核小体占有率,组蛋白修饰和其他相关蛋白质的结合,与可变剪接的类型有很强的相关性.进一步分析表明,H3K36me3,EGR1,GABP,SRF,SIN3A和RNA聚合酶Ⅱ与可变剪接的关系最大.并且,发现可变剪接可以分为外显子跳接和可变剪切位点选择这两个不同的大类.这些发现为更加深入研究表观遗传调控在mRNA可变剪接中的作用打下了基础.