表观遗传调控

摘要： 心肌肥厚是多种心血管疾病发展的病理表现之一,可加速各类心血管疾病进展,导致恶性心律失常或心力衰竭的发生。现有的心肌肥厚防治手段尚不能完全解决临床问题,亟须发掘更有效的心肌肥厚干预靶点。组蛋白赖氨酸甲基化修饰是表观遗传调控的重要方式之一,其在心肌肥厚的病理生理过程中发挥关键作用。因此,本文概述组蛋白赖氨酸甲基化修饰与病理性心肌肥厚的关系,并分析其在临床心肌肥厚防治中的潜在价值。

摘要： 温度是决定植物生长发育、地理分布和季节性行为的关键因素,植物可以精准的感知外界环境温度的细微变化并做出生长发育方面的相应改变以确保生命的延续。植物为响应不利的外界高温环境(较高的外界环境温度,但未达到高温胁迫)会进行适应性生长并引起植株形态学上的变化,如:下胚轴伸长、叶柄变长以及叶柄和叶片的偏向上性生长和提早开花等,这些形态学上的改变被称作热形态建成。

摘要： 目的·利用负染电镜技术分析人源核小体重塑及组蛋白去乙酰化酶复合物(nucleosome remodeling and deacetylase complex,NuRD复合物)结构,获得人源NuRD复合物的轮廓信息。方法·将C端带有3×Flag标签的MBD3(methyl-CpG binding domain protein 3)和N端带有10×His标签的GATAD2A(GATA zinc finger domain containing 2A)克隆至pMLink表达载体中,采用聚乙烯亚胺瞬时转染过表达的方式在人源Expi293F悬浮细胞里表达NuRD复合物中的蛋白质组分;依次通过Ni-NTA亲和层析、Flag(DYKDDDDK)标签亲和层析和Superose 6 Increase 5/150凝胶过滤层析分离纯化NuRD复合物;利用蛋白质印迹法(Western blotting)和液相色谱-串联质谱法(liquid chromatography-tandem mass spectrometry,LC-MS/MS)对复合物进行组分鉴定;利用负染电镜技术结合单颗粒重构技术研究NuRD复合物的空间结构;通过UCSF Chimera软件将蛋白质数据库(Protein Data Bank,PDB)中已有亚复合物的原子结构模型(7AO9,5FXY)与生成的结构模型进行自动匹配及比对,预测多个蛋白组分在负染结构模型中的定位。结果·利用两步亲和层析,成功富集了带有纯化标签的MBD3、GATAD2A蛋白及其他内源蛋白组分,通过进一步的凝胶过滤层析分离得到了均一性良好的复合物;通过Western blotting和LC-MS/MS鉴定,确认纯化得到的复合物为组分完整的人源NuRD复合物。利用负染电镜技术及单颗粒重构技术初步解析了NuRD复合物的空间结构,其整体轮廓特征明显,呈现为不对称的长条形;通过进一步的三维优化处理,最终获得了人源NuRD复合物分辨率约为17A(1A=0.1 nm)的初步三维结构模型;已有的亚复合物原子结构模型(PDB:7AO9,5FXY)与NuRD复合物的初步三维结构模型自动匹配后,初步确定了MTA1/2/3(metastasis-associated protein 1/2/3)、HDAC1/2(histone deacetylase 1/2)、RBBP4/7(retinoblastoma-binding protein 4/7)及MBD2/3(methyl-CpG-binding domain protein 2/3)蛋白亚基在NuRD复合物负染结构模型中的定位。结论·利用单颗粒重构技术搭建了人源NuRD复合物的低分辨率负染结构模型。

摘要： 目的探讨细胞色素P450家族成员CYP2D6基因在结直肠癌(CRC)细胞侵袭和迁移中的作用及其调控机制。方法选取2018年6月至2019年7月杭州市肿瘤医院接受手术CRC患者的CRC组织及其配对的正常组织28对;以HT29和SW480 CRC细胞系作为研究对象,利用DNA甲基化酶抑制剂5-Aza-2'-deoxycytidine(DAC)和组蛋白去乙酰化酶抑制剂Vorinostat(SAHA)分别抑制胞内DNA甲基化和组蛋白去乙酰化,采用荧光定量PCR检测CYP2D6基因的表达水平变化,Western blot法检测细胞CYP2D6蛋白表达水平的差异,Transwell细胞侵袭实验和划痕实验检测CYP2D6基因表达水平的变化对CRC细胞侵袭和迁移能力的影响。结果DAC可有效促进HT29和SW480细胞中CYP2D6基因表达水平,而SAHA对CYP2D6基因表达水平无明显影响,两者联合使用时可协同增强HT29和SW480细胞CYP2D6基因的表达水平。Transwell细胞侵袭实验和划痕实验表明,CYP2D6基因的过表达可显著降低HT29细胞的侵袭能力和迁移能力。结论CYP2D6基因表达受表观遗传修饰的调控,相较于抑制组蛋白去乙酰化,抑制DNA的甲基化可显著上调CYP2D6转录,抑制组蛋白去乙酰化则可以发挥协同效应,共同增强细胞内CYP2D6的表达水平,CYP2D6为抑癌基因,可降低结直肠癌细胞的侵袭力和迁移力。

摘要： 有氧代谢有机体细胞无法避免活性氧(reactive oxygen species,ROS)的伤害。ROS会造成多种形式的DNA损伤,其中鸟嘌呤G的氧化产物8-羟鸟嘌呤(8-oxoG)是频度最高的一种DNA氧化损伤,由特异性的糖苷酶OGG1识别并开启碱基切除修复通路完成修复。8-oxoG如果没有及时修复,可能会在复制的过程中引入G:C配对到T:A配对的碱基颠换突变。因此8-oxoG的积累或OGG1修复功能异常被认为会影响基因功能,进而导致肿瘤或衰老相关疾病的发生,然而直接实验证据却极为有限。近年来一系列研究表明,8-oxoG倾向于产生在基因的调控区,在这种情形下,8-oxoG可视为一种表观遗传学修饰,而OGG1则是这一信息的特异性读取者,OGG1对底物的识别、结合或切除会引发DNA构象或组蛋白修饰的改变,进而引起基因表达的上调或下调。因此,除了潜在的遗传毒性,鸟嘌呤氧化损伤与肿瘤的关联与其通过表观遗传学机制引发基因表达的异常密切相关。本文对8-oxoG及修复酶OGG1与肿瘤发生发展的关联机制进行了分析与总结,旨在提示研究人员从新的视角解读DNA氧化损伤与肿瘤的关系,并为肿瘤的治疗提供新的思路和靶点。

摘要： 胶质瘤是儿童最常见的颅内肿瘤,与成人胶质瘤相比有其独特的发病机制。儿童组蛋白H3第27位赖氨酸(H3K27M)突变型胶质瘤恶性程度极高,目前尚无有效的治疗手段,手术切除联合常规放化疗难以改善其预后。儿童H3K27M突变型胶质瘤的发生发展与肿瘤细胞表观遗传调控紊乱导致的基因表达谱改变密切相关。H3K27M突变对细胞基因表达谱具有全局性的影响,然而其影响胶质瘤发生发展的分子机制尚未完全阐明。此外,表观遗传药物、细胞周期抑制剂等靶向药物对H3K27M突变型胶质瘤具有潜在的治疗效果,但目前均尚未应用于临床。因此,需进一步深入研究H3K27M突变型胶质瘤的病理机制和靶向药物,以为有效治疗该疾病提供理论基础。

摘要： 表观遗传修饰通过改变染色质空间构象和基因表达调控胚胎发育、细胞分化、器官发生和癌症形成,其调控形式包括组蛋白甲基化、组蛋白乙酰化、DNA甲基化、基因印迹和X染色体失活等。缺失的、小的、同源异形2(absent,small,homologous 2,ASH2)是组蛋白赖氨酸甲基转移酶复合物的核心成分,其属于三胸腔结构蛋白家族;在哺乳动物中ASH2可特异性甲基化H3K4,激活基因转录。在介绍组蛋白甲基化和三胸腔结构蛋白的基础上,综述了ASH2甲基酶对基因转录、HOX基因表达、癌症发生发展和细胞分化的调控功能,以期为其在动物繁育和人类疾病治疗中的应用提供思路。

摘要： 目的通过对胶质母细胞瘤(glioblastoma,GBM)的DNA甲基化数据和表达数据进行整合和分析,识别表达水平可能受差异甲基化增强子区域(differential methylation enhancer regions,DMERs)调控的蛋白编码基因(protein-coding genes,PCGs),预测其中受DMERs调控的PCGs在GBM中执行的功能,挖掘潜在的GBM预后相关的生物标志物。方法基于公共疾病数据库中的甲基化数据和表达数据,运用一种计算策略构建全基因组增强子区域,筛选GBM中DMERs,识别表达可能受DMERs调控的PCGs并对其进行富集分析。基于患者的临床信息与对应样本的表达数据,对鉴别出的PCGs进行Kaplan-Meier预后分析。结果筛选出16287个DMERs,本研究鉴别出795对DMER-PCGs,其中包含有593个低甲基化增强子区域,82个高甲基化增强子区域和642个PCGs,挖掘出45个与GBM整体存活相关的PCGs。结论本研究进一步加深了对GBM中增强子甲基化调控模式的理解,并为开发用于GBM诊疗的新型生物标志物和靶标提供帮助。

摘要： 目的结合肝细胞癌公共数据分析与生物实验,初步探索肝细胞癌中EZH2基因的表观遗传调控机制。方法使用TCGA公共数据分析EZH2基因表达与肝细胞癌进展和预后之间的关系。随后,使用ATP细胞活性检测法、结晶紫法分析EZH2抑制剂GSK343对肝细胞癌细胞系HepG2细胞活性和增殖的影响。之后,分析TCGA公共数据样本中EZH2高表达组和低表达组之间的差异表达基因。其后,使用ENCODE中的ChIP-seq公共数据分析EZH2下游靶基因转录起始位点上的组蛋白修饰特征。最后,用RT-qPCR检测受到EZH2调控的下游靶基因的基因表达。结果EZH2基因表达与肝细胞癌1~3期的病程进展显著相关(P<0.05);生存分析表明EZH2基因高表达与肝细胞癌预后不良显著相关(P<0.05);EZH2抑制剂能够显著抑制肝细胞癌细胞系HepG2的体外细胞活力和增殖能力(P<0.05);EZH2结合的基因转录起始位点上富集组蛋白修饰H3K27me3;163个基因在其转录起始位点附近存在EZH2结合信号,同时这些基因也在EZH2高表达组和低表达组之间显著差异表达;实验验证ADRA1A是EZH2的下游靶基因。结论在肝细胞癌中EZH2基因可以通过表观遗传调控影响其下游靶基因的表达。

摘要： 天然活性成分白藜芦醇具有多种生物活性,其抗肿瘤作用显著,是继紫杉醇后的第二大天然抗癌药物。白藜芦醇抗胰腺癌作用与多种信号通路以及表观遗传修饰相关,通过调节信号通路或表观遗传物质的表达,可以抑制胰腺癌的发生、发展。现就白藜芦醇治疗胰腺癌的作用机制研究进展进行综述,以期为抗胰腺癌药物的研发与利用提供新的思路和借鉴。

摘要： The article introduced from the both side Mechanism of neuropathic pain，Epigenetics in pain，Methylation CpG site，Function of DNA methylation，andHow does methylation happen? Difference between DNMTs，Target Genes in Neuropathic Pain，Opiod receptors: μ,K,δreceptors，SNL incrcased DNMT3a eaprcasion in rats' DRG，SNL changed miR-143 DNMT3a and opioid receptor expression in rats' DRG，DRG DNMT3a regulate opioid receptor expression.

摘要： 本文对长非编码RNA的研究背景、基本概念、在基因转录中可能的作用和表观遗传调控的基本概念、主要调控方式作了简单总结,并且简要介绍了几类lncRNA的基本情况以及通过何种方式介导基因沉默.

摘要： 肿瘤是危害人类健康最主要的疾病之一.根据《2012中国肿瘤登记年报》数据,全国每年新发肿瘤病例估计约为312万例,每分钟有6人被诊断为恶性肿瘤.尽管新型靶向药物的临床应用使肿瘤治疗的有效率有所提升,但肿瘤患者的长期生存率并没有得到有效的改善,超过90％的肿瘤患者最终死于肿瘤的转移和复发. 西达本胺是亚型选择性的HDAC抑制剂，是新一代的表观遗传药物，西达本胺的作用不仅仅针对肿瘤细胞本身，还表现在对免疫反应、细胞增敏、抑制转移及微环境等一系列生物学行为的调控上。因此，除了单药应用外，西达本胺还更有希望应用于肿瘤的综合治疗，比如联合化疗、放疗和细胞免疫治疗等，期待改善肿瘤治疗的疗效，最终延长患者的生存。

摘要： 本发明属于抗肿瘤制药技术领域，公开了一种用于调控表观遗传与免疫检查点的药物组合物脂质体制剂，包括药物组合物和负载该药物组合物的脂质体，所述药物组合物包括表观遗传调节剂和免疫检查点抑制剂，该药物组合物脂质体制剂能够调控肿瘤免疫原性和/或抑制肿瘤生长和/或抑制肿瘤转移。本发明利用脂质体负载表观遗传调节剂和免疫检查点抑制剂，相应得到的脂质体制剂能高效包封表观遗传调节剂和免疫检查点抑制剂，靶向肿瘤，缓控释释放，尤其可用于肿瘤免疫联合治疗。

摘要： 本发明提供了一种运用表观遗传修饰调控发酵微生物的方法，即通过添加组蛋白去乙酰化酶抑制剂TSA（曲古抑菌素A）进行表观遗传修饰调控发酵。有益效果为：运用表观遗传修饰调控后的发酵微生物，由于激活沉默基因表达，代谢产物抑制鳗弧菌活性显著提高、次生代谢产物明显丰富。

摘要： 本发明属于生物制药领域，涉及着中药野菊花活性成分的应用，具体涉及具有调控表观遗传表达平衡抗肝癌作用的野菊花活性部位及其制备方法和应用。所述野菊花活性部位中总倍半萜含量≥50%，总黄酮含量≥30%；指标成分为豚草素A含量≥4.0%，野菊花内酯含量≥3.0%，芹菜素含量≥0.5%，刺槐素含量≥0.7%。本发明首次从野菊花中提取分离得到一个具有抗肝癌、保肝作用的活性部位（YJH‑B），并首次发现该活性部位作用的分子机制是通过调控DNMTs/TET2平衡关系而实现，显示了中药“祛邪扶正”的治疗癌症的理念，为基于表观遗传靶标抗癌创新药物研究开发提供了新思路、新策略。

摘要： 本文公开了包含双生物响应水凝胶的组合物及其使用方法。

摘要： 本发明涉及能调控巨噬细胞表观遗传的制剂用于制备治疗噬血细胞综合征药物的应用，属于生物技术领域。本发明能调控巨噬细胞表观遗传的制剂用于制备治疗噬血细胞综合征药物的应用，能调控巨噬细胞表观遗传的制剂为DNA甲基转移酶抑制剂、组蛋白乙酰化酶抑制剂或下调DNA甲基转移酶表达的基因药物。能降低炎症因子的表达水平，并且提高血细胞计数、缓解肝脾肿大以及减少脾脏细胞中活化巨噬细胞的比值和数目。噬血细胞综合征为原发性噬血细胞综合征或继发性噬血细胞综合征。

摘要： 本发明属于抗肿瘤制药技术领域，公开了一种用于调控表观遗传与免疫检查点的药物组合物脂质体制剂，包括药物组合物和负载该药物组合物的脂质体，所述药物组合物包括表观遗传调节剂和免疫检查点抑制剂，该药物组合物脂质体制剂能够调控肿瘤免疫原性和/或抑制肿瘤生长和/或抑制肿瘤转移。本发明利用脂质体负载表观遗传调节剂和免疫检查点抑制剂，相应得到的脂质体制剂能高效包封表观遗传调节剂和免疫检查点抑制剂，靶向肿瘤，缓控释释放，尤其可用于肿瘤免疫联合治疗。

摘要： 用于改进基因组编辑核酸酶(例如RNA指导的CRISPR‑Cas核酸酶或工程化锌指核酸酶)和可定制的DNA结合结构域融合蛋白(例如与转录调控结构域融合的RNA指导的死Cas9、RNA指导的死Cpf1、或工程化锌指阵列)的特异性的方法和组合物，用作研究试剂、用于基因驱动或用作治疗剂。

摘要： 一种经表观遗传修饰调控后沉默基因显著激活的海洋真菌，所述的表观遗传修饰调控的方法包括如下步骤：（a）扩大培养，将海洋真菌接种在培养基中扩大培养；（b）表观遗传修饰调控，在真菌液体培养基中添加溶有TSA的甲醇溶液，并将扩大培养后的海洋真菌接种到配置好的真菌液体培养基中进行发酵；得到沉默基因显著激活的海洋真菌；所述扩大培养基的成分及其重量份为：10—20份甘露醇，2—6份酵母膏，0.2—1.0份硫酸镁，10—15份味精，10—20份葡萄糖，0.2—1.0份磷酸二氢钾，15—25份麦芽糖，1.0—1.5份玉米浆，30—40份海水素；所述海洋真菌为海洋真菌ZS—HT—13，将其接种到真菌液体培养基中的接种量为1—5%；将海洋真菌ZS‑HT‑13经TSA表观遗传修饰调控后沉默基因显著激活，代谢产物显著丰富活性显著提升，Nrf2抑制活性显著提高。

摘要： 本发明属于生物技术领域，具体涉及一种海洋微拟球藻靶向表观基因组遗传调控方法。将含有用海洋微拟球藻密码子优化的Cas9失活蛋白、表观遗传修饰效应蛋白M3M14和靶基因引导序列的载体导入微拟球藻获得突变体，突变株经培养后实现对靶基因的表观基因组编辑，从而定向提高靶基因的转录水平。本发明为海洋微拟球藻基因表观遗传调控功能研究和表观维度的遗传改良提供了一种新的模型和可行性方法，将为其它模式藻株的分子育种提供借鉴。

摘要： 本发明涉及一种基于表观遗传调控的金纳米团簇放疗增敏组装体及其制备和应用，该制备方法包括以下步骤：(1)取以谷胱甘肽为巯基配体的金纳米团簇，加入水与DMSO的混合溶液，充分重悬形成金纳米团簇溶液；(2)将聚烯丙基胺盐酸盐溶于水中，配成PAH溶液；(3)将SAHA溶于DMSO中，得到SAHA溶液；(4)将SAHA溶液加入金纳米团簇溶液，充分混合，再滴加PAH溶液，搅拌反应，所得反应溶液透析纯化，即得到目的产物。本发明的制备方法操作简便，条件温和，所制备的组装体可以利用金纳米团簇和表观遗传抑制剂的协同放疗增敏效应增加肿瘤细胞对辐照的敏感性，在肿瘤的放射治疗中具有广阔的应用前景。