驱动基因

摘要： 患者男性,58岁,咳嗽、咳痰5个月。既往2型糖尿病病史。2020年6月于我院查胸部CT提示右肺下叶不规则团块影,行CT引导下肺穿刺活检,病理提示腺癌,诊断为右肺腺癌(T4N0M0)IIIA期,驱动基因阴性。术前给予培美曲塞及卡铂联合帕博利珠单抗治疗2个疗程;2020年8月行右肺中下叶切除,术后予上述方案继续治疗6个疗程。

摘要： 目的分析肺腺癌患者基因突变与临床特征的相关性。方法选取87例经病理或细胞学明确诊断为肺腺癌患者,所有患者经二代测序技术(NGS)进行肺癌驱动基因检测。采集所有患者基本资料、临床特征、基因突变情况,分析基因突变与患者临床特征、分子表型的相关性。结果基因突变型61例(70.11%),野生型26例(29.89%),基因突变与患者吸烟情况有相关性(P0.05)。结论肺腺癌患者基因突变率较高,以表皮生长因子受体(EGFR)突变类型为主;与吸烟史呈相关性;NapsinA阳性主要在驱动基因阳性患者中表达。

摘要： 目的:探讨运用基于illumina平台的二代测序技术检测表皮生长因子受体(EGFR)、Kirsten大鼠肉瘤病毒癌基因同源物(KRAS)、间变性淋巴瘤激酶(ALK)、鼠类肉瘤滤过性毒菌(v-raf)致癌同源体B1(BRAF)、酪氨酸激酶受体2(ERBB2)、间质-上皮细胞转化因子(MET)、ROS肉瘤致癌因子1(ROS1)和转染重排原癌基因(RET)8个驱动基因在非小细胞肺癌(NSCLC)中的突变情况,分析其与临床病理特征的关系,探索8个基因突变联合检测的临床价值。方法:在illumina MiseqD^(X)测序仪上对148例NSCLC患者的8个驱动基因进行测序分析,并分析其与临床病理特征的关系。结果:NSCLC的8个基因联合检测的总突变频率为78.4%(116/148),其中EGFR,KRAS,ALK,BRAF,ERBB2,MET,ROS1和RET突变率分别为53.4%(79/148),10.1%(15/148),7.4%(11/148),2.0%(3/148),2.0%(3/148),1.4%(2/148),1.4%(2/148)和0.7%(1/148)。并且,EGFR在女性、不吸烟、肺腺癌患者中的突变率明显高于男性(P<0.001)、吸烟(P<0.001)、肺鳞癌(P=0.008)患者,差异有统计学意义;KRAS在男性、吸烟患者中的突变率显著高于女性、不吸烟患者,差异有统计学意义(P<0.01)。结论:在8个驱动基因突变中,EGFR和KRAS突变与患者性别以及吸烟史密切相关,并且EGFR在肺腺癌患者中突变率较高。采用二代测序技术对NSCLC的8个基因突变联合检测灵敏度高,特异性强,可作为NSCLC理想的基因检测方法,从而精准指导临床治疗。

摘要： 远端转移是晚期非小细胞肺癌(NSCLC)患者难以避免的并发症,脑转移是此类患者最常见的转移部位之一。脑转移患者通常预后较差,自然中位生存期仅有3个月左右。传统上,针对驱动基因阴性NSCLC脑转移的治疗策略有局部干预的外科手术、放疗及系统性干预的化疗等,而有明确基因突变如EGFR、ALK、ROS1等的患者可采用新一代靶向药物治疗,但两类患者颅内治疗疗效均欠佳。

摘要： 目的 探讨非小细胞肺癌中EGFR、ALK、ROS1、RET、KRAS、NRAS、PIK3CA、BRAF、HER-2和MET 10个基因的突变情况,分析其与临床病理的关系,探索10种基因突变联合检测的临床应用价值。方法收集2020年1月至2021年7月在该院确诊为非小细胞肺癌患者83例,提取DNA和RNA后,采用探针扩增阻碍突变系统PCR(ARMS-PCR)法对标本进行基因突变检测。结果 非小细胞肺癌10种基因联合检测的总突变频率为74.70%(62/83),各基因突变分布为EGFR 49.40%(41/83)、KRAS 13.25%(11/83)、ALK融合4.82%(4/83)、ROS1融合4.82%(4/83)、HER-2 3.61%(3/83)、MET 14号外显子跳跃2.41%(2/83)、PIK3CA 1.20%(1/83),RET融合、NRAS及BRAF均未检测出。肺腺癌EGFR突变频率高于肺鳞癌;女性患者EGFR突变频率高于男性,男性患者KRAS突变频率高于女性;年龄≥60岁的患者EGFR和KRAS突变频率高于60岁以下的患者。结论 在10种基因突变中,EGFR突变、KRAS突变与患者性别、年龄及组织学类型密切相关。10种基因联合检测可一次获得更多基因突变信息,对于临床取材量少的标本意义重大,能够为分子靶向用药提供更加全面的指导信息。

摘要： 目的通过对消化系统常见肿瘤的突变基因进行分析,建立抗肿瘤药物新靶点的成药性评估方法。方法搜集Integrative Onco Genomics数据库中5种消化系统常见肿瘤(食管癌、胃癌、结直肠癌、肝癌以及胰腺癌)的突变基因数据,从中筛选出各肿瘤中突变率较高的基因,通过canSAR数据库对这些基因或其编码的蛋白进行成药性评估,找到可用于抗肿瘤新药开发的潜在靶点。结果本研究搜集了5种肿瘤共计35个队列,5445个肿瘤样品。选择每个肿瘤突变率排名前10的基因进一步分析,使用canSAR数据库对未公开研究的突变基因或其编码的蛋白质进行成药性分析,共筛选到17个可成药的潜在药物治疗靶点。结论本研究建立了一种基于突变基因或其编码蛋白的靶点成药性评估方法,该方法的运用能够为寻找新的抗肿瘤药物治疗靶点提供参考,节省新药开发中靶点筛选的成本与时间。

摘要： 肺癌是发病率和病死率最高的肿瘤,非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)占80%~85%,约有1/3的NSCLC患者确诊时已为Ⅲ期[1],且大多数患者已失去了最佳手术时机。Ⅲ期NSCLC是一种高度异质性的疾病,患者预后差异较大,其5年生存率为13%~36%[1]。作为不可切除的Ⅲ期NSCLC领域的“破局者”,根治性同步放化疗(concurrent chemo-radiotherapy,cCRT)后使用度伐利尤单抗巩固治疗的模式(PACIFIC研究)大获成功[2],相继被多个国内外临床实践指南推荐,并在中国获批为适应证。

摘要： 目的安罗替尼联合化疗治疗驱动基因阴性晚期非小细胞肺癌(NSCLC)的疗效及安全性。方法前瞻性选取2018年7月至2020年6月就诊于安徽医科大学附属宿州医院的晚期NSCLC患者60例为研究对象,随机数字表法分为观察组(n=30)和对照组(n=30)。观察组予以安罗替尼联合化疗治疗,对照组予以单纯化疗治疗。比较两组客观缓解率(ORR)、疾病控制率(DCR)、无进展生存期(PFS)、总生存期(OS)及血清血管内皮生长因子(VEGF)、碱性成纤维细胞生长因子(b FGF)、基质金属蛋白酶-9(MMP-9)、肿瘤标志物[癌胚抗原(CEA)、细胞角蛋白19片段(CYFRA21-1)]水平变化,并观察两组不良反应。结果观察组ORR、DCR分别为20.00%、63.33%,均高于对照组的13.33%、50.00%,但组间对比差异无统计学意义(P> 0.05)。观察组中位PFS、OS分别为5.3个月和10.5个月,均优于对照组的4.1个月和8.8个月,差异有统计学意义(P 0.05),以1~2级为主,经对症处理后均可缓解,患者可耐受。结论安罗替尼联合化疗治疗驱动基因阴性晚期NSCLC可提高疗效,延长患者PFS、OS,且安全性较好。

摘要： 肺癌是我国的高发癌症,非小细胞肺癌占肺癌的80%以上。利用基因组测序技术针对非小细胞肺癌的研究发现,一些基因在非小细胞肺癌中频繁发生突变,这些突变调控细胞的生长与分化,是癌症发生的驱动基因。目前,针对非小细胞肺癌的驱动基因临床上已有部分靶点药物,但疗效不显著,靶点药物还有待开发。因此,本研究将对非小细胞肺癌中的驱动基因的作用机制和临床治疗进行综述,以期为靶点药物的开发提供基础。

摘要： 肺癌是生物医学领域亟需攻克的难题之一。近年来,治疗非小细胞肺癌(non-small-cell lung cancer,NSCLC)的药物迅速发展,展现出巨大的临床应用和发展潜力。本文将从围手术期、不可切除局部晚期、驱动基因阳性晚期和驱动基因阴性晚期四个方面,回顾国内外NSCLC药物治疗的进展,同时对NSCLC药物发展中存在的问题与挑战进行总结与展望,以期为临床肿瘤科医师提供参考和指导。

摘要： 在过去的几十年内,肺癌的发病率与死亡率迅速增长,目前在中国及全球都位居癌症之首.非小细胞肺癌(NSCLC)占所有肺癌的80％～85％,近75％的NSCLC患者就诊时已经为中晚期,5年生存率极低.近年来NSCLC治疗手段逐渐增多,如何更好地将各种治疗手段有机结合起来,达到延长患者总生存期、提高生活质量的目的,是科学家们孜孜以求的目标.因此,从确诊肺癌到患者生存期截止过程中全程化管理的重要性日益凸显.通过对肿瘤驱动基因的深入研究，发现了越来越多的肺癌驱动基因。针对这些驱动基因的分子靶向药物，已成为当前肺癌治疗领域的热点。目前，已应用于我国临床实践的分子靶向药物针对的驱动基因有:表皮生长因子受体(EGFR)基因、间变性淋巴瘤激酶(ALK)基因和ROS1基因。本文将对这些驱动基因突变患者的全程管理，分别进行阐述。

摘要： 目的:分析青年非小细胞肺癌(nonsmall cell lung cancer,NSCLC)患者驱动基因突变(EGFR、ALK、ROS1)与临床病理特征、治疗及预后的关系.rn 方法:对新疆医科大学附属肿瘤医院2010年1月至2014年12月收治的病例资料完整的,行肺癌驱动基因检测(至少包括EGFR基因)、规律治疗的青年(≤40岁)NSCLC56例患者进行回顾性研究,分析EGFR、ALK、ROS1基因突变与性别、吸烟、病理类型、分期、治疗及预后之间的关系.rn 结果:青年肺癌患者EGFR基因在不同性别、有无吸烟史及不同病理类型中的表达有差异(P＜0.05),但在不同肿瘤分期之间的差异无统计学意义(P＞0.05).突变组患者靶向治疗的PFS较化疗患者长(P＜0.05).肿瘤分期是独立预后因素(P＜0.05).其他因素如性别、吸烟状态、病理类型与生存期无关.rn 结论:青年肺癌患者应进行驱动基因的检测,对青年肺癌的个体化治疗有重要意义.

摘要： 靶向治疗的基础是驱动基因的检测，目前临床上应用较广泛的驱动基因是EGFR、ALK、ROSl等。对于驱动基因阳性的患者，使用对应的靶向药物可使患者的中位生存时间大大延长。单纯的细胞学诊断仅能够满足诊断的需要，往往无法行进一步的检测。如何寻找创伤性小、有效的替代检测标本是临床中的热点问题。目前国内外学者研究最多的是外周血检测作为组织标本的替代进行相关基因检测。肿瘤患者外周血中存在因瘤细胞凋亡、坏死而释放的游离DNA。这些游离的DNA携带了肿瘤组织中重要的驱动基因的信息。目前已有多项临床研究显示采用胸腔积液作为组织替代品进行检测有较高的可行性。随着新的敏感性更高的方法的临床应用，越来越多的研究采用细胞学样本进行基因检测。组织标本是晚期NSCLC基因检测的金标准，在晚期肺癌无法获取组织标本进行基因检测的情况下，尽可能的获得有价值的替代品进行驱动基因的检测具有重要的临床意义。

摘要： 探讨非小细胞肺癌患者肿瘤组织中驱动基因EGFR、KRAS、ALK、ROS1、c-Met和Her-2基因各亚型改变情况.经分析，非小细胞肺癌患者中EGFR基因19和21外显子突变和ALK融合基因均存在较高的突变率，基因突变亚型分类能指导精准医学的个体化靶向治疗，KRAS , ROS 1, c-Met、Her-2基因改变以及驱动基因双突变共存型基因突变率虽低但不容忽视。

摘要： 以肿瘤分子表达为特征的分子病理分型与个体化治疗密切相关。分型的不断发展，将对胃癌治疗的药物选择更有指导价值。分子分型将指导个体化治疗和靶向药物临床试验。非编码RNA(nc RNA)是不参与蛋白质编码的RNA的总称，非编码RNA在不同物种表达。随着物种的进化，越高级的物种非编码RNA的含量越高。脊椎动物中非编码RNA含量最高。胃癌组织及细胞中TINCR的表达出现明显的上调，且TINCR的表达水平与胃癌病人的临床分期，肿瘤的转移及术后生存期存在明显的相关性，癌组织中TINCR的表达上调与转录因子SPl的激活相关，TINCR能促进胃癌细胞的增殖并抑制凋亡，检测FENDRR的下游FNl的功能。结果显示敲低FNl抑制侵袭转移。同时分析了临床标本检测FNl和FENDRR的相关性。40对组织标本提示癌组织FNl的表达明显高于癌旁组织。胃癌细胞系FNl的表达高于正常胃黏膜细胞系。免疫组织化学提示FNl的表达在癌组织中增高。相关分析发现：FNl表达与FENDRR的表达水平呈负性相关，更证实了lncF对FNl的调控作用。

摘要： 鳞癌占非小细胞肺癌(NSCLC)的比例逐年下降，但仍占新发病例的30％左右。鳞癌具有其独特的流行病学，临床病理学和分子学特征(如和吸烟密切相关，EGFR和KRAS突变率低，ALK的重排率低)。同时，鳞癌患者的治疗方案可选择性非常少，通常一线给予含铂双药，二线给予多西他赛或者厄洛替尼，之后无特别推荐的治疗方案。美国提出晚期肺鳞状细胞癌主要协议，每年将对近千名晚期肺鳞癌患者的组织进行测序获得鳞癌的多种基因改变，这一协议将使许多针对肺鳞癌的新靶向药物的随机Ⅱ期临床研究在这个临床研究的框架内同时进行。Lung-MAP，S1400根据基因检测结果给予二线治疗：PIK3CA突变者，给予化疗联合PIK3抑制剂；CCNDl突变者给予CD4／6抑制剂；FGFR扩增者，予FGFR抑制剂；c-MET扩增者，予厄洛替尼联合HGF抑制剂；PDLI(+)，予MEDl4736(抗PD-1)。这一研究获得与他们肿瘤基因改变相对应的靶向治疗，且使其他临床研究更有效快速地展开，这是全世界医务工作者与肺癌患者的共同期望。同时，也可能发现更多未知的鳞癌潜驱动基因，为肿瘤药物研发提供新的靶点。

摘要： 对驱动基因的认识改变了传统的肺癌治疗模式，使得精准医学成为可能。然而，精准医学的发展很大程度上依赖分子生物学检测手段，因此,NSCLC驱动基因的检测在肺癌的研究和治疗中发挥着重要作用。NSCLC的检测已进入个体化时代，检测技术的发展需要建立标准化的分子检测平台，积极开展以外周血标志严格分层的前瞻性研究，实时动态监测，为临床诊治提供更及时的信息，同时探索新的治疗靶基因及相关药物。未来检测变革的发展方向将进入从单基因到多基因、从定性到定量、从静态到动态、从有创到无创的变革。晚期NSCLC治疗模式未来将会进入实时、精准的靶向治疗时代。

摘要： 小细胞肺癌(SCLC)是侵袭性非常强的恶性肿瘤,近30年来在其治疗及预后上缺乏突破性进展.在非小细胞肺癌上,以驱动基因为基础的靶向治疗取得突破性进展,但SCLC分子病理改变特点目前还不明确,而新一代的测序技术为肿瘤的基因改变分析提供了一个高通量、高性价比的技术手段.采用FFPE样本对SCLC进行分子病理的研究是可行的，中国SCLC患者的基因突变发生率较高，TP53是最常见的基因变异位点，但目前仍然未能明确确切的优势驱动基因。下一步还需要扩大样本量并推行前瞻性的研究，以明确SCLC的驱动基因改变并进行针对性的靶向治疗。

摘要： 近年来，随着检测技术的不断提升以及新一代靶向药物的不断涌现，NSCLC的治疗发展迅速，已经迈入了分子靶向治疗时代。文章对当前NSCLC治疗相关的针对于驱动基因的分子靶向药物，如人表皮生长因子受体(HER)家族抑制剂、间变性淋巴瘤激酶(ALK)抑制剂、MET抑制剂等进行了总结。除以上综述的靶向药物之外，目前尚有多种针对于肿瘤细胞之外靶点的各种靶向药物，如作用于肿瘤微环境的抗血管生成药物；靶向于CTLA4、PD-1，PDL-1的免疫治疗药物等也都显示出了对于NSCLC患者的明显生存改善。此外，众多针对于肿瘤本身其他靶点（如P13K-AKT）的药物也正在研发或者早期临床试验过程中。相信随着这些新药的不断出现，NSCLC患者的生存时间能够不断的被延长。随着肺癌的驱动基因的发现以及相应药物的开发，多个靶向药物联合或高效多靶点药物的抑制剂的出现，肺癌的治疗才是真正的进入基因靶向时代。

摘要： 随着精准医疗时代的到来，胰腺癌的个体化综合治疗是目前研究的热点。胰腺癌的分子发病机制非常复杂，其发生、发展和转移与多种遗传性或获得性基因突变及细胞信号传导通路的异常密切相关。胰腺癌在组织结构上的一大特征就是含有丰富炎症性的纤维间质。在临床前模型中已证实促炎症反应的细胞因子相关的信号传导通路在胰腺癌的发生、发展中起到重要作用。根据患者的基因分型、一些血清标志物(如CRP)和体力状态等选择合适的治疗方案，是今后胰腺癌治疗的趋势。

摘要： 本发明公开一种花生球蛋白Ara 3基因启动子在驱动外源基因在转基因植物种子中特异表达的应用，该启动子为花生球蛋白基因Ara 3上游第1位～第634位共长634bp的序列。本发明的启动子可与外源基因连接插入表达载体中构建重组表达载体，转化宿主细胞或宿主组织及其后代，实现植物的品质改良或生产外源蛋白。本发明的启动子把外源基因的表达局限在种子或胚组织中，避免了外源蛋白在成熟的根茎等器官中的积累所造成的对植物生长的影响和能量物质的浪费。本发明的启动子诱导外源基因在种子中特异表达，且表达产物被贮存在成熟种子中，有利于表达产物的高水平累积，且可在常规条件下长期保存，也有利于表达产物的纯化回收。

摘要： 本发明公开一种花生球蛋白Ara 3基因启动子在驱动外源基因在转基因植物种子中特异表达的应用，该启动子为花生球蛋白基因Ara 3上游第1位～第634位共长634bp的序列。本发明的启动子可与外源基因连接插入表达载体中构建重组表达载体，转化宿主细胞或宿主组织及其后代，实现植物的品质改良或生产外源蛋白。本发明的启动子把外源基因的表达局限在种子或胚组织中，避免了外源蛋白在成熟的根茎等器官中的积累所造成的对植物生长的影响和能量物质的浪费。本发明的启动子诱导外源基因在种子中特异表达，且表达产物被贮存在成熟种子中，有利于表达产物的高水平累积，且可在常规条件下长期保存，也有利于表达产物的纯化回收。

摘要： 本发明公开一种花生油体蛋白Aholeosin17.8基因启动子在驱动外源基因在转基因植物种子中特异表达上的应用，该启动子为花生油体蛋白基因Aholeosin17.8上游第524位～第1576位长1053bp的序列。本发明的启动子可与外源基因连接插入表达载体中构建重组表达载体，转化宿主细胞或宿主组织及其后代，实现植物的品质改良或生产外源蛋白。本发明的启动子诱导外源基因在种子中特异表达，且表达产物被贮存在成熟种子中，有利于表达产物的高水平累积，且可在常规条件下长期保存，也有利于表达产物的纯化回收。

摘要： 本发明公开了SSA4基因启动子及利用该启动子驱动外源基因转录的毕赤酵母表达载体。所述SSA4基因启动子的序列如SEQ ID NO:1所示。利用SSA4基因启动子驱动外源基因转录的毕赤酵母表达载体包括胞内表达和胞外分泌型表达两种。本发明获得的SSA4基因启动子以及所构建的表达载体可以有效的提高外源蛋白在毕赤酵母中的表达，同时可以满足更多启动子的选择。

摘要： 本发明公开了一种基于基因突变频率的癌症驱动基因的筛选方法，属于癌症医学领域。该方法包含如下步骤：(1)肿瘤基因突变数据获取；(2)突变数据预处理；(3)筛选每个基因的邻近基因；(4)计算每种突变的背景突变数据；(5)根据突变分值使用假设检验筛选突变基因。本发明方法不仅利用现代高通量测序技术及DNA数据处理软件，使用经典的聚类算法和统计方法，而且与影响基因突变的生物因素相结合使癌症驱动基因的筛选更加精确，对新型抗癌药物的研发和癌症临床诊疗都具有重要意义。

摘要： 本发明提供了一种肺癌驱动基因的多基因突变测序文库构建方法与试剂盒。用于扩增肺癌驱动基因的引物，其扩增产物覆盖EGFR、ALK、ROS1、KRAS、BRAF、PIK3CA，HER2、RET、MET、NRAS、NTRK1‑3、MAP2K1等多个肺癌驱动基因的热点突变位点与基因融合类型，且针对NTRK1‑3基因融合，目前国内未有二代测序文库覆盖该融合类型。本发明试剂盒的引物可以有效捕获肺癌驱动基因的多基因序列，并使用多重PCR法，只需两步PCR扩增与纯化，即可构建得到肺癌驱动基因的多基因测序文库，首次实现了对NTRK1‑3基因融合的扩增及检测。

摘要： 本发明属于基因检测领域，具体涉及一种用于肺癌驱动基因及易感基因早筛的核酸质谱检测方法。本发明的检测方法考虑了亚洲人与欧美人群肺癌基因谱的差异性，选择了与亚洲人群罹患肺癌风险显著相关的29个肺癌热点突变和20个单核苷酸多态性位点并进行组合，检测的驱动基因和易感基因更前沿，并纳入了多个与肺癌易感和靶向治疗耐药相关的位点，并且彼此独立，不存在连锁不平衡，因此本发明的位点选择具有代表性、独立性和风险值可积累性，可用于评估个体罹患肺癌的风险；本发明的检测技术价格优势明显，在肺癌早筛检测方面的灵敏度更高，通量更大，可实现单个小样本多基因的检测，满足小样本最大化使用，可转化研究应用于临床。

摘要： 本发明公开了一种基于基因突变频率的癌症驱动基因的筛选方法，属于癌症医学领域。该方法包含如下步骤：(1)肿瘤基因突变数据获取；(2)突变数据预处理；(3)筛选每个基因的邻近基因；(4)计算每种突变的背景突变数据；(5)根据突变分值使用假设检验筛选突变基因。本发明方法不仅利用现代高通量测序技术及DNA数据处理软件，使用经典的聚类算法和统计方法，而且与影响基因突变的生物因素相结合使癌症驱动基因的筛选更加精确，对新型抗癌药物的研发和癌症临床诊疗都具有重要意义。

摘要： 本发明提供一种特异性地结合于癌症驱动基因的基因突变部位的新型烷基化剂。本发明还提供使特异性地结合于癌症驱动基因的基因突变部位的聚酰胺与烷基化剂结合而成的复合体、包含该复合体的癌症驱动基因突变特异性烷基化剂、及包含该复合体的医药组合物。

摘要： 治疗驱动基因阳性肺癌的联用药物组合物，其包括抗PD‑L1抗体和安罗替尼，其具有良好的抗驱动基因阳性肺癌活性。