寡核苷酸芯片

摘要： A new method that combined universal primer-multiplex asymmetric PCR and oligonucleotide microarray technology was developed for the simultaneous detection of seven common foodbome pathogens including Listeria monocytogenes,Salmonella,E.coli O157:H7,Staphylococcus aureus,Yersinia enterocolitica,Vibrio parahaemolyticu and a standard strain of Escherichia coli.The 5'-end of forward or reverse primer specific to each pathogen was linked with a non-homologous common sequence.Target fragments of all seven pathogens were enriched and labeled simultaneously by one-step multiplex asymmetric PCR using the Cy3-1abeled common sequence as the universal primer.The labeled single-stranded amplicons were captured by the specific oligonucleotide probes immobilized on microarrays,followed by microarray scanning and analysis of fluorescence signal intensity.The results for reference strains indicated that the assay could unambiguously discriminate all seven pathogens in single and multiple infections,and it had a detection sensitivity of 0.1-1 pg of genomic DNA.Ninety-five artificially contaminated samples and retail food samples were tested by this assay,and the results agreed with those obtained with traditional culture methods and real-time PCR.This developed oligonucleotide microarray assay can provide a useful method for rapid,specific,sensitive and high-throughput detection of foodbome pathogens.%应用通用多重不对称聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)和寡核酸芯片技术建立一种同时检测7种常见食源性致病菌的方法.每种致病菌上游或下游引物5'端连接一段异源的共有序列.以荧光标记的该共有序列作为通用引物,与限制性特异引物经一步多重不对称PCR同时获得所有目标菌的单链标记靶序列,可被芯片上固定的特异性寡核苷酸探针捕获.通过芯片扫描、分析荧光信号完成检测.标准菌株检测结果证实,该方法可特异地检测单一和混合感染的目标菌,基因组DNA的检测灵敏度为0.1～1 pg.95份模拟污染和零售食品样本芯片检测结果与常规的分离与生化鉴定及荧光定量PCR结果一致.建立的寡核苷酸芯片方法可为快速、特异、灵敏及高通量地鉴定食源性致病菌提供一种有效的检测手段.

摘要： Objective To detect the differentially expressed Wnt signaling pathway genes in hepatocellular carcinoma ( HCC) , and investigate the relationship between HCC and Wnt signaling pathway. Methods The expression levels of 78 genes relat-ed Wnt signaling pathway were measured using Affymetrix GeneChip Human Genome U133 Plus 2. 0 array in 93 cases of HCC tissues and paired non-tumor liver tissues. Results A total of 10 up-regulated genes ( TCF19, MMP-12, DKK1, Bcl-9, SFRP4, MMP-1, PYGO2, FZD6, MMP-9 and Wnt6) , and 5 down-regulated genes ( SFRP1, TCF21, SFRP5, FZD1 and Wnt2) were identified to be significantly differentially expressed in HCC tissues, compared with paired non-tumor liver tissues. The expression level of TCF19, the most over-expressed gene in this series (fold change=9. 61, P=1. 07×10-26), was significantly correlated with FZD1, FZD6, Bcl-9, Wnt6, MMP-1 and MMP-12 ( P<0. 05) . The expression of TCF19 was significantly associated with the number of tumor ( P=0. 017) and Edmondson-Steiner grade ( P=0. 046) . Conclusion Multiple differentially expressed genes in Wnt signaling pathway in HCC are screened. Increased expression of TCF19, a downstream transcription factor, may be the key terminal effect of the Wnt signaling path-way activation, and its biological and pathological significance in HCC merits further investigations.%目的 检测肝细胞癌(HCC)中Wnt信号传导通路相关基因的差异表达情况,探讨HCC与该信号通路的关系.方法 采用Affymetrix U133 Plus2.0基因芯片检测93例HCC及其配对癌旁组织中78个Wnt信号通路相关基因的mRNA表达差异.结果 与癌旁肝组织相比,HCC组织中TCF19、MMP-12、DKK1、Bcl-9、SFRP4、MMP-1、PYGO2、FZD6、MMP-9、Wnt6共10个基因表达上调,而SFRP1、TCF21、SFRP5、FZD1、Wnt2共5个基因表达下调.其中,TCF19表达上调倍数最多,达9.61倍(P=1.07×10-26).TCF19表达与FZD1、FZD6、Bcl-9、Wnt6、MMP-1和MMP-12表达呈正相关(均P<0.05).TCF19表达与肿瘤数目(P=0.017)和分化程度(P=0.046)有关.结论 HCC中存在Wnt信号通路多基因异常表达.下游转录因子TCF19高表达可能是Wnt信号通路激活的关键终末效应,其在HCC中的生物学和病理学意义有待进一步研究.

摘要： 本文对基因芯片包括cDNA芯片和寡核苷酸芯片等在乳腺癌研究中的应用做一综述，包括预测乳腺癌对化疗的敏感性、对单抗联合化疗治疗的敏感性及其他方面的应用。

摘要： 研制人线粒体 DNA（mitochondrial DNA，mtDNA）表达谱芯片，鉴定芯片的特异性和稳定性，完善芯片的制备和使用程序，优化实验参数，为线粒体功能研究提供物质基础及技术保障。以人 mtDNA 剑桥序列为标准，设计 mtDNA 编码的13种 mRNA、2种 rRNA 和9种 tRNA 基因及蛋白产物定位于线粒体的核 DNA （nDNA）编码的5种凋亡相关基因寡核苷酸探针。芯片点样仪点制芯片，进行荧光显示和洗脱，用其检测人宫颈癌上皮 Hela 细胞和人肾小管上皮 Hc1细胞 cDNA 文库 mtDNA 编码基因及 nDNA 编码凋亡相关基因的差异表达情况。所点制的芯片扫描结果显示，样点分布均匀、清晰，规整度好，无漏点、连点。cDNA 文库杂交鉴定结果显示，整张芯片荧光信号均匀一致，背景清晰，各基因重复样点杂交结果一致，各质控点能正常显示。成功制备了人 mtDNA 基因表达谱芯片，完善了该芯片的制备和使用程序，通过初步应用，证明所研制的人 mtDNA 基因表达谱芯片具有特异性高、稳定性好等优点，可用于不同组织或细胞样本 cDNA 文库 mtDNA基因的差异表达分析。%To manufacture and identificate the expressing microarray of human mtDNA genes.In the process of conformation,the specificity and stability of the new microarray were evaluated,the procedure of preparing and applying of the new microarray were con-summated,and the experimental parameter were optimised to provide the substance support and technology guarantee for the function research of mitochondrial genome.Design of the oligonucleotide probes of 13 mRNA、2 rRNA、9 tRNA encoded by mtDNA was based on the mtDNA Cambridge Sequence,and the oligonucleotide probes of 5 apoptosis related genes encoded by nuclear genome was based on the database of Genebank.The microarray was printed with microarray robots.Fluorescence background manifest and deletion were ac-cording to the standard process.The primary microarray was firstly used to detect the differential expressions of mtDNA genes and apop-tosis related genes between cDNA library of human cervix epithelia carcinoma cell line Hela and human renal tubule epithelia cell line Hc1.The printed spots on the primary microarray show distinct and regular on the scanned imagine,and the background of the slides is nearly undetected.The hybridized imagine of cDNA library from cell lines show a good quality in size and color contrast.Twenty mini -blocks are printed in the first round.

摘要： Targeting to DNA, preparation of oligonucleotide microarray for the bacteria to be detected under hybridization conditions were found, and then re-establishment of oligonucleotide microarray, to judge by similarity of the results of sample types. Using universal primers SUA and G07B in the detection after ampliifcation and label involved more than 40 more for different species and genus of blend modes, increase their ability to distinguish between each other, as when there are multiple strains can also be detected in a sample and provide the basis for the clinical diagnosis. The detection technology is a good value.%本文以DNA为靶标，针对待检细菌制备寡核苷酸芯片，根据杂交条件进行摸索，然后重新确立寡核苷酸芯片，通过结果的相似性来判断样本的种类。检测中利用通用引物SUA和GO7B对涉及40多个进行扩增和标记后，针对不同的种、属的混合模式，增加它们相互之间的分辨能力，同样样品中存在多个菌种时也可检测出来，并为临床诊断提供依据。综合比较，该项检测技术具有良好的使用价值。

摘要： 目的:浅析肠杆菌科食源性感染常见致病菌的快速检测方法。方法:采用带有正电荷的尼龙膜作为寡核苷酸芯片的载体,利用寡核苷酸芯片的技术进行肠杆菌刻食源性感染常见致病菌的检验方法进行检测。结果:在同样的条件下,可以检测到多种细菌的的基因突显。结论:寡核苷酸芯片技术可以作为快速检测肠杆菌常见致病菌的有效方法之一,可以快速诊断并预防食源性感染病菌。

摘要： 苹果锈果类病毒属是重要的植物类病毒属,目前尚无有效的筛查方法.通过对该属类病毒的核苷酸序列进行分析筛选,设计了35条用于该属类病毒筛查的属级特异性探针并制备了寡核苷酸芯片.应用苹果锈果类病毒及柑橘矮化类病毒标准样品对该芯片进行验证,结果表明所建立的属级芯片可以获得有效的杂交信号,其灵敏度与RT-PCR电泳法相当.该芯片可用于苹果锈果类病毒属类病毒的筛查,为该属类病毒的检疫与防控提供技术支撑.

摘要： 为建立牛传染性鼻气管炎病毒(IBRV)和赤羽病病毒(AKAV)的双重快速检测方法,本研究根据IBRVgB基因和AKAV S基因序列设计合成了2对特异引物和探针,建立了同时检测这两种病毒的基因芯片检测方法,即以合成探针的5’端添加poly T 10尾并氨基化固定于经处理的玻璃基片表面作为捕捉序列,采用荧光素Cy3标记正向引物的5’端,对样品的PCR扩增产物进行检测,并通过试验确定其适宜杂交温度为38°C.该方法检测IBRV和AKAV重组质粒的灵敏度分别为3.6×103拷贝/25μL和9.26×104拷贝/25 μL,同时通过对牛的腺病毒、牛病毒性腹泻病毒、牛水泡性口炎病毒、口蹄疫病毒及牛白血病病毒等的检测均无交叉反应,表明其特异性强.该检测方法的建立对于加强进出口牛的IBRV和AKAV检验检疫具有十分重要的意义.

摘要： 本文根据文献对基因芯片在乳腺癌组织与正常乳腺组织的差异研究、乳腺癌分型与分期、乳腺癌预后预测、高转移性与低转移性乳腺癌的差异研究、乳腺癌细胞表面ER、Her2表达状况判断方面的应用做一综述.

摘要： Objective: To compare the oligonucleotide chip, real-time PCR and sequencing for genotyping of hepatitis B virus in Chinese patients with chronic hepatitis B. Methods: Clinical serum samples with different hepatitis B virus genotype from 126 chronic hepatitis B patients were tested for hepatitis B virus genotypes by oligonucleotide chip, real-time PCR and sequencing of PCR products, respectively. Then, clinical performances, time required and costs of the three assays were evaluated. Results: Oligonucleotide chips and real-time PCR can detect 1 % and 0.1 % genotypes, respectively, in mixed samples. In the 126 clinical samples from patients with chronic hepatitis B, genotype B was detected in 41 (33 %), 41 (33 %) and 45 (36 %) samples, and genotype C in 76 (60 %), 76 (60 %) and 81 (64 %) samples, by oligonucleotide chip, real-time PCR and sequencing, respectively. Oligonucleotide chip and real-time PCR detected mixed genotypes B and C in 9 samples. Realtime PCR was the rapidest and cheapest method among the three assays. Conclusions: Oligonucleotide Chip and real-time PCR are able to detect mixed genotypes, while sequencing only detects the dominant genotype in clinical samples.%目的:比较寡核苷酸芯片法、实时荧光PCR和测序法在对慢性乙肝患者病毒基因分型的比较和方法学评价.方法:对126例不同基因型的慢性乙肝患者的血清样本分别用寡核苷酸芯片法、实时荧光PCR法和测序法进行基因分型,并评价各种方法的临床表现、所需时间和检测成本.结果:寡核苷酸芯片法、实时荧光PCR分别能检测到1％和0.1％比例的基因型.在126例慢性乙肝患者的临床样本中,寡核苷酸芯片法、实时荧光PCR和测序法分别检测出41(33％)、41(33％)和45(36％)例为B型,76(60％)、76(60％)、81(64％)例为C型.寡核苷酸芯片法、实时荧光PCR均检出9例B、C混合基因型.在三种检测方法中实时荧光PCR是最快速和廉价的.结论:寡核苷酸芯片法、实时荧光PCR能检出B、C混合基因型,而测序法只能检测出样本的主导基因型.

摘要： 根据猪瘟病毒(CSFV)E2基因序列，设计了41条针对CSFV 3个基因群共10个基因亚群各亚群特异性寡核苷酸探针。利用欧盟猪瘟诊断手册中推荐的CSFVE2基因套式RT-PCR方法，在内套PCR过程中进行Cy3-dCTP掺入荧光标记，制备芯片杂交样品。用标记的PCR产物与寡核苷酸探针阵列杂交，置于GenePix 4100A扫描仪中扫描，利用GenePix Pro 6.0软件对杂交图像进行分析。特异性和灵敏度实验显示，芯片方法与本室发表的CSFVReal-time PCR方法的灵敏度相近，芯片探针与猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)、猪2型圆环病毒(PCV2)、猪伪狂犬病毒(PRV)样品无非特异性杂交。以包括1.1、2.1、2.2，2.3亚群的8份CSF阳性样品进行芯片的检测验证，研究结果表明，通过特异性的杂交图谱或杂交信号分析可准确判定样品所属的基因亚群，寡核苷酸芯片的检测结果与测序的分型结果全部符合.本研究为将寡核苷酸芯片技术用于猪瘟病毒的基因分型和分子流行病学研究奠定了基础。

摘要： 目的 研究寡核苷酸芯片的制备,及其检测兽医临床常见病原菌耐氟喹诺酮类药物基因突变的准确性和可行性.方法根据耐药基因型,分别对大肠杆菌gyrA、parC,沙门氏菌、链球菌和鸡毒支原体gyrA基因序列设计通用引物和13条寡核苷酸探针,制备寡核苷酸芯片.采用PCR荧光标记目的基因,与芯片杂交,同时采用PCR-测序法进行耐氟喹诺酮类药物基因突变的检测.结果 PCR反应体系能特异性地扩增目的基因;制备的寡核苷酸芯片能检测病原菌gyrA基因83、87位,parC 80位野生型和突变型,芯片检测结果与测序结果符合率为75％.结论采用寡核苷酸芯片技术检测病原菌基因突变是可行的,随着技术的成熟,可以用于兽医临床耐药性大规模的检测.

摘要： 本研究借助生物信息学手段和分子克隆的方法,对寡核苷酸芯片的研制进行了方法学上的探索,并将基因芯片技术应用于性传播疾病的诊断,以达到可以快速、准确查出所感染病原体的目的.

摘要： 目的及方法: 应用寡核苷酸芯片检测30例肺癌患者手术标本中p53、K-ras、N-ras三种基因的点突变. 结果: (1)杂交温度和时间、探针的长度以及PCR产物的浓度是影响结果的几个关键因素. (2)30例中，p53突变11例，K-ras突变5例，N-ras突变未检出.Ⅲa期以下的病例中，p53突变率为33.3％，K-ras为9.5％；Ⅲb期以上的病例中，p53突变率为44.4％，K-ras为33.3％.K-ras的5例突变全部发生在腺癌(包括腺鳞癌)中，占此型的21.7％. (3)p53芯片检测点突变的结果与测序比较，符合率为76.9％. 结论: 本实验初步建立了较稳定的p53、K-ras、N-ras寡核苷酸芯片检测点突变的方法体系，其在肺癌的临床诊断上有良好的应用前景.

摘要： 本研究选用小鼠、绵羊和山羊作为动物模型,利用比较基因组学方法筛选了1254个直系同源基因,定制了相应的寡核苷酸芯片,对三个物种处于不同毛发周期的体侧部皮肤的表达谱进行了比较分析，探讨哺乳动物的毛发生长机理对于研究和治疗人类的多毛症和脱发,以及提高家畜的绒毛质量和产量具有重要意义.

摘要： 本研究根据口蹄疫病毒基因组序列保守区,设计合成2对引物,通过RT-PCR方法筛选出特异引物,用Cy3标记下游引物5＇端;针对这个基因片段,设计合成4条寡核苷酸探针,开展靶基因扩增和克隆、阳性质粒构建、芯片杂交与反应条件优化、以及芯片灵敏度和特异性分析等实验研究,建立FMDV的基因芯片检测方法,同时应用该芯片检测了现地标本39份,证明该芯片的灵敏度高、特异好,可以准确地检测出猪口蹄疫病毒,为建立猪病基因芯片诊断技术平台奠定基础.

摘要： 以侵染百合3种重要病毒(黄瓜花叶病毒、百合无症病毒、百合斑驳病毒)为研究材料,将寡核苷酸芯片检测技术应用于3种病毒检测及鉴定的研究,针对3种病毒外壳蛋白基因保守序列的3个基因片段设计引物,通过序列比对设计用于检测及鉴定3种病毒的探针并制备寡核苷酸芯片.用制备好的寡核苷酸芯片对病毒的阳性标本及田间百合疑似标本进行芯片检测,结果表明,研究制备的基因芯片能够并行检测侵染百合的3种重要百合病毒,重现性稳定,该技术的建立为百合病毒病的诊断和预防提供了可靠方法.

摘要： 根据牛传染性鼻气管炎病毒gB基因序列和赤羽病病毒(AKAV)的S基因序列,设计了2对针对这2种病毒的特异引物和探针,建立了同时检测两种病的基因芯片方法.设计合成寡核苷酸探针,用荧光素Cy3标记正向引物的5′端.实验确定了适宜杂交温度为38°C.将建立的基因芯片方法用于检测,IBRV的灵敏度为0.013pg/25μL,AKAV的灵敏度为0.104pg/25μL,同时通过对牛的腺病毒、牛病毒性腹泻病毒(BVDV)、牛水泡性口炎病毒(VSV)、口蹄疫病毒(FMDV)、牛白血病病毒(BLV)等的检测,没有交叉反应,说明其特异性强.本试验方法的建立对于加强进出口牛的IBRV和AKAV检验检疫具有十分重要的意义.

摘要： 根据牛传染性鼻气管炎病毒gB基因序列和赤羽病病毒(AKAV)的S基因序列,设计了2对针对这2种病毒的特异引物和探针,建立了同时检测两种病的基因芯片方法.设计合成寡核苷酸探针,用荧光素Cy3标记正向引物的5′端.实验确定了适宜杂交温度为38°C.将建立的基因芯片方法用于检测,IBRV的灵敏度为0.013pg/25μL,AKAV的灵敏度为0.104pg/25μL,同时通过对牛的腺病毒、牛病毒性腹泻病毒(BVDV)、牛水泡性口炎病毒(VSV)、口蹄疫病毒(FMDV)、牛白血病病毒(BLV)等的检测,没有交叉反应,说明其特异性强.本试验方法的建立对于加强进出口牛的IBRV和AKAV检验检疫具有十分重要的意义.

摘要： 根据牛传染性鼻气管炎病毒gB基因序列和赤羽病病毒(AKAV)的S基因序列,设计了2对针对这2种病毒的特异引物和探针,建立了同时检测两种病的基因芯片方法.设计合成寡核苷酸探针,用荧光素Cy3标记正向引物的5′端.实验确定了适宜杂交温度为38°C.将建立的基因芯片方法用于检测,IBRV的灵敏度为0.013pg/25μL,AKAV的灵敏度为0.104pg/25μL,同时通过对牛的腺病毒、牛病毒性腹泻病毒(BVDV)、牛水泡性口炎病毒(VSV)、口蹄疫病毒(FMDV)、牛白血病病毒(BLV)等的检测,没有交叉反应,说明其特异性强.本试验方法的建立对于加强进出口牛的IBRV和AKAV检验检疫具有十分重要的意义.

摘要： 本发明提供寡核苷酸的制备方法，其包括：(1)在非极性溶剂中，使其中5’位羟基未被保护的核苷、核苷酸或寡核苷酸(a)等，与其中5’位羟基被保护的核苷、核苷酸或寡核苷酸(b)缩合，以获得含有亚磷酸三酯产物(c)的反应液的步骤；(3)使亚磷酸三酯产物(c)氧化或硫化，以获得含有其中5’位羟基被保护的寡核苷酸(d)的反应液的步骤；(4)将寡核苷酸(d)脱保护，以获得含有其中5’位羟基未被保护的寡核苷酸(e)的反应液的步骤；和(6)向含有寡核苷酸(e)的反应液中添加极性溶剂，并通过固液分离或萃取来纯化寡核苷酸(e)的步骤。

摘要： 本发明涉及一种针对存在单核苷酸多态性的靶核酸使用的单核苷酸多态性检测用寡核苷酸探针，其包含报告区域、锚固区域和接头区域。报告区域具有由在单核苷酸多态性的核苷酸为第一核苷酸时完全匹配、在为除第一核苷酸以外时不匹配的碱基序列构成的寡核苷酸、和报告区域与靶核酸杂交时发生消光的荧光色素。

摘要： 一种微阵列寡核苷酸合成芯片及其微区调光阵列和寡核苷酸微阵列原位合成方法。所述微阵列寡核苷酸合成芯片包括挡光板，所述挡光板包括透光区和不透光区，所述透光区包括M行×N列个调光单元，每一个所述调光单元均包括至少一个像素电路，所述像素电路配置为能够对所述调光单元独立地、可寻址地进行调控，从而调控透过所述调光单元的光束的性能，所述像素电路由有源薄膜晶体管阵列或无源开关阵列驱动。本申请的微阵列寡核苷酸合成芯片采用有源薄膜晶体管或无源开关阵列驱动的光像素阵列，通过外部寻址和对每个寡核苷酸生长单元的光状态进行精确控制，选择性地在精确位置上切割保护基团，可以高通量、精准地合成寡核苷酸片段或者长链DNA。

摘要： 本发明涉及使用部分立体限定的寡核苷酸子文库，鉴定反义寡核苷酸的改进的立体限定的硫代磷酸酯寡核苷酸变体的方法。这些方法允许高效鉴定具有改进特性的立体限定的变体，如增强的体外或体内活性、增强的功效、增强的比活性、降低的毒性、改变的生物分布、增强的细胞或组织摄取和/或增强的靶特异性(脱靶效应减少)。本文公开了多个平行的文库筛选方案，其中优化立体限定的硫代磷酸酯连接的核苷的多个排他性或重叠性短子区域或基序，以鉴定增强的子文库，并且随后合并来自每个选定(改进的)子文库的立体限定的核苷间键样式，以产生增强的立体限定的化合物。

摘要： 一种寡核苷酸衍生物，由通过下述一般式（一般式中，B表示腺嘌呤、鸟嘌呤、胞嘧啶或尿嘧啶，X表示硫原子或氧原子，n表示6～60的整数。）表示的重复结构单元（所述一般式中，B以及X，在各个重复结构单元中独立表示）构成，且所述一般式表示的重复结构单元中至少有一个其X是硫原子。

摘要： 本发明涉及寡核苷酸引物对、寡核苷酸组合物和包括寡核苷酸组合物的试剂盒及其检测方法，由序列为TGAYGGGCGACAATGTCC的上游引物PRRSVNSP2-F和序列为CGCAGACAAATCCAGAVG的下游引物PRRSVNSP2-R组成。本发明与现有技术相比具有以下优点：1、能够对PRRSV经典株与高致病性变异株进行鉴别诊断，解决了临床样品检测中不能区分PRRSV经典株或高致病性变异株单独感染亦或共同感染的问题；2、特异性好，针对PRRSVNSP2具有高保守区设计引物，特异性强，无假阳性出现；3、灵敏度高，该方法的敏感性可达1TCID50/mL；4、简便快速。

摘要： 本发明提供寡核苷酸的制备方法，其包括：(1)在非极性溶剂中，使其中5’位羟基未被保护的核苷、核苷酸或寡核苷酸(a)等，与其中5’位羟基被保护的核苷、核苷酸或寡核苷酸(b)缩合，以获得含有亚磷酸三酯产物(c)的反应液的步骤；(3)使亚磷酸三酯产物(c)氧化或硫化，以获得含有其中5’位羟基被保护的寡核苷酸(d)的反应液的步骤；(4)将寡核苷酸(d)脱保护，以获得含有其中5’位羟基未被保护的寡核苷酸(e)的反应液的步骤；和(6)向含有寡核苷酸(e)的反应液中添加极性溶剂，并通过固液分离或萃取来纯化寡核苷酸(e)的步骤。

摘要： 本发明涉及一种针对存在单核苷酸多态性的靶核酸使用的单核苷酸多态性检测用寡核苷酸探针，其包含报告区域、锚固区域和接头区域。报告区域具有由在单核苷酸多态性的核苷酸为第一核苷酸时完全匹配、在为除第一核苷酸以外时不匹配的碱基序列构成的寡核苷酸、和报告区域与靶核酸杂交时发生消光的荧光色素。

摘要： 本发明提供以下述式(I)表示的立体控制寡核苷酸合成用光学活性片段及其制造方法、以及使用其的立体控制寡核苷酸的合成方法。式中，B为保护/未保护核苷碱基，R1为取代/未取代脂肪族基团，R2、R3为DMTr基或‑P(R11)(NR12)2，R11为OCH2CH2CN、SCH2CH2CN等，R12为取代/未取代的脂肪族基团或芳香族基团；X为H、烷基、O‑烷基等，Y为H、NHR13、卤素等或酰基类、醚类、硅烷基类保护羟基，或者在与X之间形成X‑Y键，n为0以上且4以下的整数。

摘要： 本发明属于生物技术领域，涉及包含核酸的检测方法，具体涉及一种寡核苷酸探针设计方法。本发明所述的寡核苷酸探针设计方法包括以下步骤：(1)针对靶基因，设计出长度为50mer的靶基因寡核苷酸探针；(2)设计出与靶基因同源性不大于40％的长度为10mer的通用序列；(3)将通用序列分别连接在靶基因寡核苷酸探针的两端构建出寡核苷酸探针。采用本发明所述的设计方法构建的人免疫缺陷病毒寡核苷酸探针，其序列为SEQ ID NO：1。对本发明获得的通用序列的互补序列进行荧光标记得到荧光标记的互补序列。荧光标记的互补序列可以用来检测寡核苷酸芯片质量，具有灵敏度高的优点，尤其适合临床病原体基因的检测芯片设计。