cDNA芯片

摘要： [目的]对前期构建的猪流行性腹泻病毒(PEDV)、猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)和A型猪轮状病毒(PoRVA)共检cDNA芯片进行技术创新和关键参数优化.[方法]根据靶基因PEDV(S和M)、TGEV(N和S)以及PoRVA的(V P7和NSP4)分别设计6对特异性引物,扩增探针制备芯片阵列.重点改进了样品标记技术,引物直接标记与不对称PCR扩增结合,确定了不对称PCR扩增体系;并对点样缓冲液、水合时间、探针浓度、杂交时间和温度、清洗和干燥方式等条件进行优化.[结果]当博奥和百傲两种缓冲液比例为1:1,水合时间为4 s,探针浓度为600 ng/μL,不对称PCR上下游引物比为1:40,在48°C杂交3 h,用0.2％SDS清洗,1000 r/min离心,该cDNA芯片效果最佳.[结论]本研究确定了PEDV-TGEV-GAR共检cDNA芯片的关键技术参数,为开展基因芯片的标准化制备和应用奠定了基础.

摘要： 背景：间充质干细胞是体内微环境的重要组成部分且影响肿瘤细胞的多种生物学行为，间充质干细胞的潜在临床价值是近年来的研究热点。目的：通过基因芯片方法分析脐带间充质干细胞对急性早幼粒细胞白血病细胞系NB4细胞基因组表达谱的影响。方法：体外建立脐带间充质干细胞与急性早幼粒细胞白血病细胞系NB4细胞共培养体系，检测脐带间充质干细胞对NB4细胞增殖、凋亡和分化的影响，分别提取了NB4细胞单独培养组和NB4细胞+脐带间充质干细胞共培养组NB4细胞的mRNA并将其反转录为cDNA，两组分别标记荧光，做成探针并与基因芯片杂交，检测其荧光强度，分析两组基因表达谱的差异。结果与结论：①脐带间充质干细胞促进NB4细胞的增殖和分化并抑制其凋亡；②脐带间充质干细胞作用后的NB4细胞的基因表达谱中有530个基因上调和53个基因下调，与基因相关的功能和信号通路也在一定程度上受到了调节；③结果表明，脐带间充质干细胞通过改变肿瘤细胞内大量基因表达、基因功能及多种信号通路影响NB4细胞的生物学行为。

摘要： BACKGROUND: Mesenchymal stem cells (MSCs) are an important component of the in vivo microenvironment and act on multiple biological behaviors of tumor cells. The potential clinical value of MSCs has become an issue of concern in recent years.OBJECTIVE: To investigate the gene expression profiles of acute promyelocytic leukemia (APL) cell line NB4 treated with umbilical cord-derived MSCs (UC-MSCs) using cDNA microarray.METHODS: In vitro co-culture system was constructed, and then cellular proliferation, apoptosis and differentiation status of NB4 cells treated with UC-MSCs were evaluated. Two cDNA probes were prepared through reverse transcription from mRNA of NB4 cells treated with or without UC-MSCs. The probes were labeled with fluorescence dyes individually, hybridized with cDNA microarray, and their fluorescent intensities were scanned. The genes were screened through the analysis of the difference in two gene expression profiles.RESULTS AND CONCLUSION: UC-MSCs promoted the proliferation and differentiation, while reduced the apoptosis of NB4 cells. The analysis of gene expression profiles indicated that after co-culture with UC-MSCs, 530 genes were up-regulated and 53 genes were down-regulated. Accordingly, specific gene function and pathway signaling related were also regulated to some extent. Overall, UC-MSCs influence can major biological behaviors of NB4 cells by changing expression of a large amount of genes, gene-related function and multiple intracellular signaling pathways.%背景:间充质干细胞是体内微环境的重要组成部分且影响肿瘤细胞的多种生物学行为,间充质干细胞的潜在临床价值是近年来的研究热点.目的:通过基因芯片方法分析脐带间充质干细胞对急性早幼粒细胞白血病细胞系NB4细胞基因组表达谱的影响.方法:体外建立脐带间充质干细胞与急性早幼粒细胞白血病细胞系NB4细胞共培养体系,检测脐带间充质干细胞对NB4细胞增殖、凋亡和分化的影响,分别提取了NB4细胞单独培养组和NB4细胞+脐带间充质干细胞共培养组NB4细胞的mRNA并将其反转录为cDNA,两组分别标记荧光,做成探针并与基因芯片杂交,检测其荧光强度,分析两组基因表达谱的差异.结果与结论:①脐带间充质干细胞促进NB4细胞的增殖和分化并抑制其凋亡;②脐带间充质干细胞作用后的NB4细胞的基因表达谱中有530个基因上调和53个基因下调,与基因相关的功能和信号通路也在一定程度上受到了调节;③结果表明,脐带间充质干细胞通过改变肿瘤细胞内大量基因表达、基因功能及多种信号通路影响NB4细胞的生物学行为.

摘要： 目的 比较采用普通RT-PCR和不对称PCR分别进行样品的直接荧光标记,应用于cDNA芯片杂交,分析其对芯片杂交效率的影响.方法 以本实验室建立保存的重组质粒和病毒为模板,进行不对称RT-PCR引物浓度优化,应用普通RT-PCR与不对称RT-PCR进行直接荧光标记,将标记的产物与制备的cDNA芯片杂交,在相同条件下完成杂交后芯片的洗涤与扫描,记录扫描图片与数据.结果 与普通RT-PCR标记方法相比,应用不对称RT-PCR技术标记单链靶基因,能特异有效提高芯片的杂交效率.结论 应用不对称RT-PCR技术对样品进行荧光标记后,与cDNA芯片杂交能提高芯片的杂交效率,有利于cDNA芯片的检测应用.

摘要： 本文对基因芯片包括cDNA芯片和寡核苷酸芯片等在乳腺癌研究中的应用做一综述，包括预测乳腺癌对化疗的敏感性、对单抗联合化疗治疗的敏感性及其他方面的应用。

摘要： 猪流行性腹泻病毒(PEDV)、猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)和猪轮状病毒(PoRV)是三种常见的仔猪病毒性腹泻病原,作者拟构建可同时检测三种病原的cDNA基因芯片.分别根据PEDV基因(S、M)、TGEV基因(S、N)、PoRV基因(VP7、NSP4)的保守区设计引物扩增靶基因,进行PEDV-TGEV-PoRV的cDNA阵列设计,建立了扩增标记探针的多重PCR方法,并对所构建cDNA芯片的特异性、灵敏性、重复性进行了评价.确定了该cDNA芯片的阳性判断标准:SNR大于或等于2.0(或信号强度中位值大于等于1 500).PEDV-TGEV-PoRV诊断cDNA芯片具有良好的特异性,该芯片不与猪繁殖与呼吸综合征病毒、猪瘟病毒、猪乙型脑炎病毒、猪伪狂犬病病毒发生交叉反应;芯片的最低检测质量浓度为20 pg·μL-1;同一张芯片可重复使用至少7次.本研究为鉴别三种仔猪病毒性病的鉴别诊断提供了新的高通量检测技术.

摘要： 目的 探讨低氧对肌腱细胞基因表达谱的影响.方法 酶消化法分离得到的肌腱细胞分别在低氧(2％O2)和常规氧浓度(21％O2)下进行培养,第1代肌腱细胞进行表达谱检测,并用RT-PCR对其中4个差异表达基因进行验证.结果 低氧培养组与常规氧浓度组相比,有40个基因表达差异,且全部在低氧组表达上调.选取的4个差异表达基因的RT-PCR的验证结果与芯片结果一致.结论 低氧促进肌腱细胞增殖涉及多个基因参与.

摘要： 本研究旨在应用cDNA芯片技术筛选福美双诱导的肉鸡胫骨软骨发育不良(TD)相关基因,提取对照组和饲喂福美双组第2、4、8、10、15、20天的AA肉鸡生长板组织总RNA,制备cRNA探针,分别与cDNA芯片杂交,重新筛选肉鸡TD差异表达克隆.结果表明:得到第2、4、8、10、15、20天2.0倍以上差异表达克隆分别为151、90、240、589、718和733个,共计1 398个.基因本体分析表明,上述差异基因分别参与调节、信号转导、转录、RNA加工与修饰、翻译、蛋白折叠和蛋白水解、运输、氧化还原、生物合成、细胞周期、增殖分化、细胞凋亡、细胞粘附、免疫应答与防御反应、应激反应、电子链传递和糖基化等生物学过程;氧化磷酸化、糖酵解与糖异生、黏着斑、细胞骨架调节、ECM-受体相互作用、MAPK、钙信号转导通路、Wnt、胰岛素信号通路、TGF-β信号通路、泛素介导的蛋白水解、神经活性的配体-受体相互作用、VEGF、GnRH、酮体的合成与分解、细胞因子与其受体的相互作用等多条代谢途径与肉鸡TD有关.为从分子水平阐明肉鸡胫骨软骨发育不良发病机制提供可靠的生物信息学依据.

摘要： 目的研究非肌层浸润性膀胱移行细胞癌( BTCC)和正常膀胱黏膜上皮差异表达基因。方法采用高通量cDNA表达谱芯片对3例非浸润性BTCC及3例正常膀胱黏膜上皮进行检测，筛选共同表达差异基因。结果共筛选出274个共同差异基因，其中表达上调2倍以上的基因96个，表达下调2倍以上的基因178个。结论非浸润性BTCC癌变是多基因、多途径、多步骤的复杂过程，高通量的基因芯片技术可以同时定量成千上万基因表达水平，是一种高效、可靠的强大的技术手段。

摘要： 本文根据文献对基因芯片在乳腺癌组织与正常乳腺组织的差异研究、乳腺癌分型与分期、乳腺癌预后预测、高转移性与低转移性乳腺癌的差异研究、乳腺癌细胞表面ER、Her2表达状况判断方面的应用做一综述.

摘要： 肉鸡产业目标是获得最高肉量、最适胴体肌肉脂肪比例及风味等。肌肉组织主要由骨骼肌和脂肪组成，肌内脂肪(IMF)则是影响肉品质的重要因素。而关于胸肌IMF形成的分子调控机制研究较少，本研究应用鸡组织表达芯片检测了快速鸡和慢速鸡胸肌组织在不同发育阶段的表达谱，以期揭示肉鸡发育过程中相关骨骼肌和肌内脂肪(IMF)的差异表达基因并初步构建其分子调控网络，为提高肉鸡IMF沉积和改善肉品质性状的研究提供理论基础。

摘要： 肉鸡产业目标是获得最高肉量、最适胴体肌肉脂肪比例及风味等。肌肉组织主要由骨骼肌和脂肪组成，肌内脂肪(IMF)则是影响肉品质的重要因素。而关于胸肌IMF形成的分子调控机制研究较少，本研究应用鸡组织表达芯片检测了快速鸡和慢速鸡胸肌组织在不同发育阶段的表达谱，以期揭示肉鸡发育过程中相关骨骼肌和肌内脂肪(IMF)的差异表达基因并初步构建其分子调控网络，为提高肉鸡IMF沉积和改善肉品质性状的研究提供理论基础。

摘要： 肉鸡产业目标是获得最高肉量、最适胴体肌肉脂肪比例及风味等。肌肉组织主要由骨骼肌和脂肪组成，肌内脂肪(IMF)则是影响肉品质的重要因素。而关于胸肌IMF形成的分子调控机制研究较少，本研究应用鸡组织表达芯片检测了快速鸡和慢速鸡胸肌组织在不同发育阶段的表达谱，以期揭示肉鸡发育过程中相关骨骼肌和肌内脂肪(IMF)的差异表达基因并初步构建其分子调控网络，为提高肉鸡IMF沉积和改善肉品质性状的研究提供理论基础。

摘要： 目的：Ezrin从属于ERM(ezrin radixin moesin)蛋白家族，其基本功能是将肌动蛋白维系到细胞膜和锚定到膜蛋白的特定部位上，从而参与细胞的移动和粘附。研究表明Ezrin在多种肿瘤中异常表达并可能参与肿瘤的生长和转移。然而．到目前为止，Ezrin参与肿瘤发生发展的直接证据仍然缺乏。食管癌中Ezrin的表达最近才得到初步地阐明。但其功能和相关机制还不清楚。本研究旨在运用RNA干扰等方法探讨Ezrin在食管癌中的功能。方法：我们首先利用免疫蛋白印迹和免疫荧光染色的方法检测了Ezrin在多种食管癌细胞系中的表达情况。然后以其中一种细胞(EC109)为模型，用RNA干扰的方法成功降低了该细胞中Ezrin的表达。然后用克隆形成、MTT生长曲线、裸鼠体内成瘤、Chamber移动实验和细胞侵袭以及细胞粘附等实验检测了Ezrin表达对细胞生物学行为的影响。最后。联合运用cDNA芯片和免疫印迹等方法，初步探讨了Ezrin发挥功能的机制。结果：免疫蛋白印迹的结果提示Ezrin在多种食管癌细胞系中高表达。免疫荧光染色发现，Ezrin不但定位于胞膜下和胞浆中，同时还表达于细胞核内，核内Ezrin主要分布于核浆中。克隆形成和MTT实验表明，Ezrin表达减少后，细胞生长减慢。裸鼠体内成瘤实验也直接证明了Ezrin对细胞生长的影响。移动、侵袭和粘附实验揭示，Ezrin表达的减少，可以导致细胞移动、侵袭以及粘附能力的减弱。接着我们进一步用cDNA芯片的方法揭示，Ezrin表达减少后一系列细胞生长和凋亡相关基因、细胞移动和侵袭相关基因以及细胞粘附相关基因均发生了差异表达，比如TGM2，CTGF和CYR61等。最后，信号通路分析发现，Ezrin表达的减少可以抑制MAPK和TGF-β信号通路。结论：以上结果表明Ezrin参与了食管癌细胞的生长和侵袭过程。其可能的机制是Ezrin通过调节MAPK和TGF-β信号途径影响某些细胞生长与侵袭相关基因的表达，或者是直接参与这些基因的转录调控(国家高技术研究发展计划(2006AA02A403)、国家自然科学基金(30672376和30772485)和广东省自然科学基金(5104541，7118419)资助项目)。

摘要： 目的：Ezrin从属于ERM(ezrin radixin moesin)蛋白家族，其基本功能是将肌动蛋白维系到细胞膜和锚定到膜蛋白的特定部位上，从而参与细胞的移动和粘附。研究表明Ezrin在多种肿瘤中异常表达并可能参与肿瘤的生长和转移。然而．到目前为止，Ezrin参与肿瘤发生发展的直接证据仍然缺乏。食管癌中Ezrin的表达最近才得到初步地阐明。但其功能和相关机制还不清楚。本研究旨在运用RNA干扰等方法探讨Ezrin在食管癌中的功能。方法：我们首先利用免疫蛋白印迹和免疫荧光染色的方法检测了Ezrin在多种食管癌细胞系中的表达情况。然后以其中一种细胞(EC109)为模型，用RNA干扰的方法成功降低了该细胞中Ezrin的表达。然后用克隆形成、MTT生长曲线、裸鼠体内成瘤、Chamber移动实验和细胞侵袭以及细胞粘附等实验检测了Ezrin表达对细胞生物学行为的影响。最后。联合运用cDNA芯片和免疫印迹等方法，初步探讨了Ezrin发挥功能的机制。结果：免疫蛋白印迹的结果提示Ezrin在多种食管癌细胞系中高表达。免疫荧光染色发现，Ezrin不但定位于胞膜下和胞浆中，同时还表达于细胞核内，核内Ezrin主要分布于核浆中。克隆形成和MTT实验表明，Ezrin表达减少后，细胞生长减慢。裸鼠体内成瘤实验也直接证明了Ezrin对细胞生长的影响。移动、侵袭和粘附实验揭示，Ezrin表达的减少，可以导致细胞移动、侵袭以及粘附能力的减弱。接着我们进一步用cDNA芯片的方法揭示，Ezrin表达减少后一系列细胞生长和凋亡相关基因、细胞移动和侵袭相关基因以及细胞粘附相关基因均发生了差异表达，比如TGM2，CTGF和CYR61等。最后，信号通路分析发现，Ezrin表达的减少可以抑制MAPK和TGF-β信号通路。结论：以上结果表明Ezrin参与了食管癌细胞的生长和侵袭过程。其可能的机制是Ezrin通过调节MAPK和TGF-β信号途径影响某些细胞生长与侵袭相关基因的表达，或者是直接参与这些基因的转录调控(国家高技术研究发展计划(2006AA02A403)、国家自然科学基金(30672376和30772485)和广东省自然科学基金(5104541，7118419)资助项目)。

摘要： 目的：Ezrin从属于ERM(ezrin radixin moesin)蛋白家族，其基本功能是将肌动蛋白维系到细胞膜和锚定到膜蛋白的特定部位上，从而参与细胞的移动和粘附。研究表明Ezrin在多种肿瘤中异常表达并可能参与肿瘤的生长和转移。然而．到目前为止，Ezrin参与肿瘤发生发展的直接证据仍然缺乏。食管癌中Ezrin的表达最近才得到初步地阐明。但其功能和相关机制还不清楚。本研究旨在运用RNA干扰等方法探讨Ezrin在食管癌中的功能。方法：我们首先利用免疫蛋白印迹和免疫荧光染色的方法检测了Ezrin在多种食管癌细胞系中的表达情况。然后以其中一种细胞(EC109)为模型，用RNA干扰的方法成功降低了该细胞中Ezrin的表达。然后用克隆形成、MTT生长曲线、裸鼠体内成瘤、Chamber移动实验和细胞侵袭以及细胞粘附等实验检测了Ezrin表达对细胞生物学行为的影响。最后。联合运用cDNA芯片和免疫印迹等方法，初步探讨了Ezrin发挥功能的机制。结果：免疫蛋白印迹的结果提示Ezrin在多种食管癌细胞系中高表达。免疫荧光染色发现，Ezrin不但定位于胞膜下和胞浆中，同时还表达于细胞核内，核内Ezrin主要分布于核浆中。克隆形成和MTT实验表明，Ezrin表达减少后，细胞生长减慢。裸鼠体内成瘤实验也直接证明了Ezrin对细胞生长的影响。移动、侵袭和粘附实验揭示，Ezrin表达的减少，可以导致细胞移动、侵袭以及粘附能力的减弱。接着我们进一步用cDNA芯片的方法揭示，Ezrin表达减少后一系列细胞生长和凋亡相关基因、细胞移动和侵袭相关基因以及细胞粘附相关基因均发生了差异表达，比如TGM2，CTGF和CYR61等。最后，信号通路分析发现，Ezrin表达的减少可以抑制MAPK和TGF-β信号通路。结论：以上结果表明Ezrin参与了食管癌细胞的生长和侵袭过程。其可能的机制是Ezrin通过调节MAPK和TGF-β信号途径影响某些细胞生长与侵袭相关基因的表达，或者是直接参与这些基因的转录调控(国家高技术研究发展计划(2006AA02A403)、国家自然科学基金(30672376和30772485)和广东省自然科学基金(5104541，7118419)资助项目)。

摘要： 目的：Ezrin从属于ERM(ezrin radixin moesin)蛋白家族，其基本功能是将肌动蛋白维系到细胞膜和锚定到膜蛋白的特定部位上，从而参与细胞的移动和粘附。研究表明Ezrin在多种肿瘤中异常表达并可能参与肿瘤的生长和转移。然而．到目前为止，Ezrin参与肿瘤发生发展的直接证据仍然缺乏。食管癌中Ezrin的表达最近才得到初步地阐明。但其功能和相关机制还不清楚。本研究旨在运用RNA干扰等方法探讨Ezrin在食管癌中的功能。方法：我们首先利用免疫蛋白印迹和免疫荧光染色的方法检测了Ezrin在多种食管癌细胞系中的表达情况。然后以其中一种细胞(EC109)为模型，用RNA干扰的方法成功降低了该细胞中Ezrin的表达。然后用克隆形成、MTT生长曲线、裸鼠体内成瘤、Chamber移动实验和细胞侵袭以及细胞粘附等实验检测了Ezrin表达对细胞生物学行为的影响。最后。联合运用cDNA芯片和免疫印迹等方法，初步探讨了Ezrin发挥功能的机制。结果：免疫蛋白印迹的结果提示Ezrin在多种食管癌细胞系中高表达。免疫荧光染色发现，Ezrin不但定位于胞膜下和胞浆中，同时还表达于细胞核内，核内Ezrin主要分布于核浆中。克隆形成和MTT实验表明，Ezrin表达减少后，细胞生长减慢。裸鼠体内成瘤实验也直接证明了Ezrin对细胞生长的影响。移动、侵袭和粘附实验揭示，Ezrin表达的减少，可以导致细胞移动、侵袭以及粘附能力的减弱。接着我们进一步用cDNA芯片的方法揭示，Ezrin表达减少后一系列细胞生长和凋亡相关基因、细胞移动和侵袭相关基因以及细胞粘附相关基因均发生了差异表达，比如TGM2，CTGF和CYR61等。最后，信号通路分析发现，Ezrin表达的减少可以抑制MAPK和TGF-β信号通路。结论：以上结果表明Ezrin参与了食管癌细胞的生长和侵袭过程。其可能的机制是Ezrin通过调节MAPK和TGF-β信号途径影响某些细胞生长与侵袭相关基因的表达，或者是直接参与这些基因的转录调控(国家高技术研究发展计划(2006AA02A403)、国家自然科学基金(30672376和30772485)和广东省自然科学基金(5104541，7118419)资助项目)。

摘要： 目的：Ezrin从属于ERM(ezrin radixin moesin)蛋白家族，其基本功能是将肌动蛋白维系到细胞膜和锚定到膜蛋白的特定部位上，从而参与细胞的移动和粘附。研究表明Ezrin在多种肿瘤中异常表达并可能参与肿瘤的生长和转移。然而．到目前为止，Ezrin参与肿瘤发生发展的直接证据仍然缺乏。食管癌中Ezrin的表达最近才得到初步地阐明。但其功能和相关机制还不清楚。本研究旨在运用RNA干扰等方法探讨Ezrin在食管癌中的功能。方法：我们首先利用免疫蛋白印迹和免疫荧光染色的方法检测了Ezrin在多种食管癌细胞系中的表达情况。然后以其中一种细胞(EC109)为模型，用RNA干扰的方法成功降低了该细胞中Ezrin的表达。然后用克隆形成、MTT生长曲线、裸鼠体内成瘤、Chamber移动实验和细胞侵袭以及细胞粘附等实验检测了Ezrin表达对细胞生物学行为的影响。最后。联合运用cDNA芯片和免疫印迹等方法，初步探讨了Ezrin发挥功能的机制。结果：免疫蛋白印迹的结果提示Ezrin在多种食管癌细胞系中高表达。免疫荧光染色发现，Ezrin不但定位于胞膜下和胞浆中，同时还表达于细胞核内，核内Ezrin主要分布于核浆中。克隆形成和MTT实验表明，Ezrin表达减少后，细胞生长减慢。裸鼠体内成瘤实验也直接证明了Ezrin对细胞生长的影响。移动、侵袭和粘附实验揭示，Ezrin表达的减少，可以导致细胞移动、侵袭以及粘附能力的减弱。接着我们进一步用cDNA芯片的方法揭示，Ezrin表达减少后一系列细胞生长和凋亡相关基因、细胞移动和侵袭相关基因以及细胞粘附相关基因均发生了差异表达，比如TGM2，CTGF和CYR61等。最后，信号通路分析发现，Ezrin表达的减少可以抑制MAPK和TGF-β信号通路。结论：以上结果表明Ezrin参与了食管癌细胞的生长和侵袭过程。其可能的机制是Ezrin通过调节MAPK和TGF-β信号途径影响某些细胞生长与侵袭相关基因的表达，或者是直接参与这些基因的转录调控(国家高技术研究发展计划(2006AA02A403)、国家自然科学基金(30672376和30772485)和广东省自然科学基金(5104541，7118419)资助项目)。

摘要： 目的：Ezrin从属于ERM(ezrin radixin moesin)蛋白家族，其基本功能是将肌动蛋白维系到细胞膜和锚定到膜蛋白的特定部位上，从而参与细胞的移动和粘附。研究表明Ezrin在多种肿瘤中异常表达并可能参与肿瘤的生长和转移。然而．到目前为止，Ezrin参与肿瘤发生发展的直接证据仍然缺乏。食管癌中Ezrin的表达最近才得到初步地阐明。但其功能和相关机制还不清楚。本研究旨在运用RNA干扰等方法探讨Ezrin在食管癌中的功能。方法：我们首先利用免疫蛋白印迹和免疫荧光染色的方法检测了Ezrin在多种食管癌细胞系中的表达情况。然后以其中一种细胞(EC109)为模型，用RNA干扰的方法成功降低了该细胞中Ezrin的表达。然后用克隆形成、MTT生长曲线、裸鼠体内成瘤、Chamber移动实验和细胞侵袭以及细胞粘附等实验检测了Ezrin表达对细胞生物学行为的影响。最后。联合运用cDNA芯片和免疫印迹等方法，初步探讨了Ezrin发挥功能的机制。结果：免疫蛋白印迹的结果提示Ezrin在多种食管癌细胞系中高表达。免疫荧光染色发现，Ezrin不但定位于胞膜下和胞浆中，同时还表达于细胞核内，核内Ezrin主要分布于核浆中。克隆形成和MTT实验表明，Ezrin表达减少后，细胞生长减慢。裸鼠体内成瘤实验也直接证明了Ezrin对细胞生长的影响。移动、侵袭和粘附实验揭示，Ezrin表达的减少，可以导致细胞移动、侵袭以及粘附能力的减弱。接着我们进一步用cDNA芯片的方法揭示，Ezrin表达减少后一系列细胞生长和凋亡相关基因、细胞移动和侵袭相关基因以及细胞粘附相关基因均发生了差异表达，比如TGM2，CTGF和CYR61等。最后，信号通路分析发现，Ezrin表达的减少可以抑制MAPK和TGF-β信号通路。结论：以上结果表明Ezrin参与了食管癌细胞的生长和侵袭过程。其可能的机制是Ezrin通过调节MAPK和TGF-β信号途径影响某些细胞生长与侵袭相关基因的表达，或者是直接参与这些基因的转录调控(国家高技术研究发展计划(2006AA02A403)、国家自然科学基金(30672376和30772485)和广东省自然科学基金(5104541，7118419)资助项目)。

摘要： 目的：用人基因表达谱cDNA芯片研究原发性肝癌(HCC)与癌旁正常肝组织的基因表达差异并进行验证。 方法：利用含有人5075个基因cDNA的人表达谱芯片,将6例原发性肝癌患者分为伴和不伴门静脉癌栓两组(A组和B组,每组n=3),分别取癌组织、癌栓组织和癌旁正常肝组织,分别抽提总mRNA,反转录为cDNA与芯片进行杂交,对比mRNA表达的差异。在差异表达的基因中,选取9个基因在41例肝癌病人癌和癌旁正常肝组织进行RT-PCR实验验证其表达情况。 结果：癌组织及癌栓组织与癌旁正常肝组织比较,伴门脉癌栓组(A组)癌组织与不伴门脉癌栓组(B组)癌组织中上调表达基因分别有169和170个,两组下调表达基因分别有349和364个,其中两组共同上调表达基因中135个,共同下调表达基因305个.两组癌组织分别表达上调和下调的基因之中,表达明显上调的基因(ratio＞3)无癌栓组有3个、癌栓组有5个,而明显下调的(ratio＜0.4)无癌栓组有4个、癌栓组有10个.分别挑选两组癌组织共同高表达基因(ASPH)、共同低表达基因(MT1X)、有癌栓组高表达基因(FACL4、POSTN、MAP4K4、HSF1、UCHL1、DAP3、IARS)共9个,在41例HCC病人组织和四种肝癌细胞系中进行RT-PCR检测,其中ASPH、MT-1X、MAP4K4、FACL4、DAP3、HSF1在癌组织中的表达与癌旁组织比较有显著差异或有差异(P＜0.01或P＜0.05)。 结论：基因表达谱cDNA芯片是检测肝癌差异基因表达的有效方法,其基因变化可以进一步在RT-PCR中证实。ASPH、MAP4K4、FACL4、DAP3、HSF1和MT-1X在癌组织中表达明显高于和低于癌旁组织,在肝癌细胞系中表达亦增高和降低,但在41例标本中表达变化与伴或不伴门静脉癌栓相关性不明显。

摘要： 本发明涉及一种蜕膜和绒毛配对cDNA芯片，所述的cDNA芯片通过如下方法制得：取孕早期流产妇女的蜕膜和绒毛组织，提取其RNA，逆转录成cDNA，预置在PCR反应板内，制作成cDNA芯片。本发明还提供该cDNA芯片的制备方法和应用。其优点表现在：每一位流产妇女分别取其蜕膜和绒毛组织cDNA形成配对，集中在同一芯片上，实现生理结构上的母‑胎界面在体外芯片上功能呈现。高通量，特异性强、敏感性高、操作简单快速、定量准确性高、结果可靠性强、结果分析简单并且样本带有完整的病例临床信息等优势，可用于定量检测目的基因在不同病人的表达情况及进行深入的临床信息相关性分析。

摘要： 本发明公开了一种桔小实蝇抗敌百虫和高效氯氰菊酯抗药性水平检测cDNA芯片及其制作方法和应用。本发明利用正向抑制性消减杂交（suppression subtractive hybridization，SSH）方法分别获得了不同抗性品系桔小实蝇抗药性特异上调表达基因片段，再PCR扩增各抗药性相关特异表达基因，纯化回收得到118个桔小实蝇抗敌百虫抗性相关特异性基因片段，103个桔小实蝇抗高效氯氰菊酯抗性相关特异性基因片段。以上述特异的抗性靶基因片段为DNA探针，构建了桔小实蝇抗敌百虫和高效氯氰菊酯检测cDNA芯片。本发明cDNA芯片能够简单有效地实现对桔小实蝇抗药性水平的实时监测。

摘要： 本发明公开了一种新的检测禽流感病毒不同亚型cDNA的方法，步骤如下：分别制备覆盖禽流感病毒H5、H7、H9亚型及M基因的DNA片段，将所制备的DNA片段点到氨基包被的玻璃载体上制备成基因芯片备用；通过反转录将被检病毒样品的RNA逆转录为cDNA，在这个过程中用荧光染料标记cDNA；将用荧光染料标记的被检样品cDNA片段与基因芯片杂交，根据杂交信号结果即可判定被检禽流感病毒样品的亚型。本发明成功提供了一种在基因芯片上直接检测流感病毒亚型cDNA的方法，该方法中荧光标记的禽流感病毒被检样品cDNA直接与基因芯片杂交，不需要进行PCR扩增，具有步骤简捷、准确率高等优点，可以作为流感病毒亚型鉴别的一种新途径。

摘要： 本发明公开了一种检测十字花科植物生物及非生物胁迫下基因表达信息的cDNA芯片。该基因芯片以逆境下和特殊发育时期大白菜基因的cDNA片段作为探针，由序列表中SEQ ID№：1-221DNA序列的探针，以及3885条GenBank中的探针序列组成。本发明不仅可用于批量检测十字花科植物在生物或非生物胁迫下的基因表达信息、筛选差异基因，还可用于构建十字花科植物不同生长发育阶段、不同组织器官乃至特异细胞中的基因表达谱。应用该芯片可实现基因表达信息的高通量检测，且操作方便、安全，检测结果可靠、有效，可节省大量时间、人力、物力和财力，具有广阔的应用前景。

摘要： 本发明涉及cDNA芯片技术领域，并提出一种用于对银杏基因进行筛选和功能分析的cDNA芯片制备方法，包含以下步骤：S1、银杏叶的选取，选取多个适合制取芯片的银杏叶，留作备用；S2、配置银杏叶消毒液，将上述S1中的银杏叶加入消毒液中进行消毒；S3、将S2中的银杏叶捞出进行洗净备用，然后对洗净的银杏叶进行烘干、切片；S4、从S3中的银杏叶中提取其RNA，然后逆转录成cDNA，预置在PCR反应板内，从而制成cDNA芯片；S5、从S3中选取多个样品进行S4的操作，从而得到多个cDNA芯片。该发明将预制好的cDNA芯片放置于湿盒中水化，然后取出放置在75‑110°C的平台上烘干40‑55秒，最后进行紫外线照射20‑30分钟后进行固定后进行杀毒，提高了银杏叶cDNA芯片的活性。

摘要： 本发明公开一种细胞cDNA芯片，包括基片和固定于基片上的cDNA模板；该cDNA模板是由细胞株或原代细胞抽提的总RNA经过反转录得到的cDNA；该cDNA芯片还具有管家基因引物，所述管家基因引物是管家基因的一对正向及反向引物。本发明的细胞cDNA芯片可直接应用于细胞株筛选，实验准备时间短，只需一次使用一张芯片，节省了实验试剂用量，有效解决了研究人员大量细胞培养和样本提取的困难，各样本的实验条件保持一致，实验误差小，提高了胞株筛选的准确性和筛选效率，可用于细胞株的高通量筛选。本发明还提供所述细胞cDNA芯片的制备方法及其应用。

摘要： 本发明涉及一种蜕膜和绒毛配对cDNA芯片，所述的cDNA芯片通过如下方法制得：取孕早期流产妇女的蜕膜和绒毛组织，提取其RNA，逆转录成cDNA，预置在PCR反应板内，制作成cDNA芯片。本发明还提供该cDNA芯片的制备方法和应用。其优点表现在：每一位流产妇女分别取其蜕膜和绒毛组织cDNA形成配对，集中在同一芯片上，实现生理结构上的母‑胎界面在体外芯片上功能呈现。高通量，特异性强、敏感性高、操作简单快速、定量准确性高、结果可靠性强、结果分析简单并且样本带有完整的病例临床信息等优势，可用于定量检测目的基因在不同病人的表达情况及进行深入的临床信息相关性分析。

摘要： 本发明公开了一种桔小实蝇抗敌百虫和高效氯氰菊酯抗药性水平检测cDNA芯片及其制作方法和应用。本发明利用正向抑制性消减杂交（suppressionsubtractivehybridization，SSH）方法分别获得了不同抗性品系桔小实蝇抗药性特异上调表达基因片段，再PCR扩增各抗药性相关特异表达基因，纯化回收得到118个桔小实蝇抗敌百虫抗性相关特异性基因片段，103个桔小实蝇抗高效氯氰菊酯抗性相关特异性基因片段。以上述特异的抗性靶基因片段为DNA探针，构建了桔小实蝇抗敌百虫和高效氯氰菊酯检测cDNA芯片。本发明cDNA芯片能够简单有效地实现对桔小实蝇抗药性水平的实时监测。

摘要： 本发明公开了一种检测茶树次生代谢相关基因表达信息的cDNA芯片，它以茶树次生代谢相关基因的cDNA片段作为探针，由84条在GenBank登录的探针序列、5条序列表中SEQ ID No.1～SEQ ID No.5所示茶树看家基因序列、8个和已知基因均没有相似性的酵母基因间序列及1个空白点样液组成，每个探针设置3个重复。本发明不仅可用于批量检测不同茶树品种中茶树次生代谢相关基因的表达情况，从而筛选出表现优异的茶树品种，起到辅助育种的作用，还可用于构建特异茶树品种不同生长阶段、不同组织器官乃至特异细胞中的基因表达谱。应用该芯片可实现次生代谢相关基因的高通量检测，且操作方便、安全，检测结果可靠有效，可节省大量时间、人力、物力和财力，具有广阔的应用前景。

摘要： 本发明涉及一种烟草腺毛cDNA表达谱芯片及其制备与应用。本发明通过分离烟草叶面腺毛，提取总RNA，构建烟草腺毛cDNA文库；对cDNA文库进行随机测序，获得烟草腺毛EST数据库，利用PCR扩增EST序列，制备出烟草腺毛cDNA表达谱芯片；该芯片对烟草腺毛和去腺毛叶片基因表达进行分析，获得腺毛中表达上调的ESTs，筛选出特异表达基因。本发明制备出的芯片具有高效、灵敏、高通量、高精确性、特异性强的优势，可一次检测大量基因的表达模式，并在在相同试验条件下，综合分析多个样品的基因表达变化规律，适用于烟草腺毛与栽培措施、环境胁迫等关系方面的研究。