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差异表达

差异表达的相关文献在1992年到2022年内共计1037篇,主要集中在肿瘤学、畜牧、动物医学、狩猎、蚕、蜂、分子生物学 等领域,其中期刊论文796篇、会议论文76篇、专利文献30035篇;相关期刊406种,包括生物技术通报、遗传、中国学术期刊文摘等; 相关会议68种,包括2015年中国观赏园艺学术研讨会、中国棉花学会2015年年会、2015年中国生物医学工程联合学术年会等;差异表达的相关文献由4114位作者贡献,包括戴勇、李杨瑞、束婧婷等。

差异表达—发文量

期刊论文>

论文:796 占比:2.58%

会议论文>

论文:76 占比:0.25%

专利文献>

论文:30035 占比:97.18%

总计:30907篇

差异表达—发文趋势图

差异表达

-研究学者

  • 戴勇
  • 李杨瑞
  • 束婧婷
  • 单艳菊
  • 杨丽涛
  • M·柯斯勒司克
  • M·科斯洛斯基
  • O·图里斯
  • O·图雷茨
  • U·萨因
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  • 会议论文
  • 专利文献

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    • 王海龙; 李龙; 伊力哈木·托合提; 刘旭; 那次克道尔吉; 陈洪涛; 崔泳
    • 摘要: 背景:骨质疏松性骨折是与年龄有关的疾病,由于人口老龄化,其发病率和患病率不断上升。目的:鉴定miRNA与老年骨质疏松性骨折有关。方法:通过limma包分析GSE93883中骨质疏松性骨折相关的差异表达miRNA;通过RAID数据库预测差异表达miRNA的靶标基因,并通过PPI(蛋白质-蛋白质相互作用)网络识别关键miRNA及靶标基因;富集分析识别靶标基因参与的生物功能和信号通路。最后,收集5例老年骨质疏松性骨折和5例老年非骨质疏松性骨折患者的骨组织,利用qPCR和Western blot验证关键miRNA及信号通路。结果与结论:①共获得21个骨质疏松性骨折相关的差异表达miRNA并预测得到530个靶标基因;通过PPI网络鉴定miR-106b-5p为关键调控基因,其靶标基因主要与MAPK活性的激活等生物功能以及PI3K-Akt和转化生长因子β信号通路相关;②qPCR结果验证了miR-106b-5p在老年骨质疏松性骨折骨组织中的表达较对照骨组织显著下调(P<0.05);Western blot结果显示PI3K-Akt和转化生长因子β信号通路在老年骨质疏松性骨折中被激活;③提示:miRNA参与老年骨质疏松性骨折,并与PI3K-Akt和转化生长因子β信号通路相关。miR-106b-5p可能抑制骨质疏松性骨折的发生,并成为潜在的标志物和治疗靶标。
    • 王海龙; 李龙; 伊力哈木·托合提; 刘旭; 那次克道尔吉; 陈洪涛; 崔泳
    • 摘要: 背景:骨质疏松性骨折是与年龄有关的疾病,由于人口老龄化,其发病率和患病率不断上升.目的:鉴定miRNA与老年骨质疏松性骨折有关.方法:通过limma包分析GSE93883中骨质疏松性骨折相关的差异表达miRNA;通过RAID数据库预测差异表达miRNA的靶标基因,并通过PPI(蛋白质-蛋白质相互作用)网络识别关键miRNA及靶标基因;富集分析识别靶标基因参与的生物功能和信号通路.最后,收集5例老年骨质疏松性骨折和5例老年非骨质疏松性骨折患者的骨组织,利用qPCR和Western blot验证关键miRNA及信号通路.结果 与结论:①共获得21个骨质疏松性骨折相关的差异表达miRNA并预测得到530个靶标基因;通过PPI网络鉴定miR-106b-5p为关键调控基因,其靶标基因主要与MAPK活性的激活等生物功能以及PI3K-Akt和转化生长因子β信号通路相关;②qPCR结果验证了miR-106b-5p在老年骨质疏松性骨折骨组织中的表达较对照骨组织显著下调(P<0.05);Western blot结果显示PI3K-Akt和转化生长因子β信号通路在老年骨质疏松性骨折中被激活;③提示:miRNA参与老年骨质疏松性骨折,并与PI3K-Akt和转化生长因子β信号通路相关.miR-106b-5p可能抑制骨质疏松性骨折的发生,并成为潜在的标志物和治疗靶标.
    • 赵倩; 吐鲁洪·沙列尔
    • 摘要: 目的 通过乳腺癌差异表达长链非编码RNA(lncRNA)的筛选,探讨其在乳腺癌发生、发展中的作用及潜在功能。方法 收集2018年9月—11月新疆医科大学附属肿瘤医院5对女性乳腺癌组织标本及其癌旁正常组织(距肿瘤大于5 cm)标本,通过RNA提取、标记和杂交、芯片实验,以差异倍数(FC)≥2倍,t检验的P值1)lncRNA共有1 150条,其中上调lncRNA 551条,下调lncRNA 599条。下调lncRNA差异最显著的为XR_159043.1(FC=26.878,P<0.05),上调lncRNA差异最为显著的是ENST00000427451.1(FC=11.478,P<0.05)。通过GO富集分析发现,lncRNA广泛参与了包括RNA加工、DNA剪接、基因表达、含核碱基的化合物代谢、核酸转运mRNA剪接等生物学进程。KEGG信号通路富集分析发现,lncRNA参与了PI3K-AKT、RIG-I样受体信号通路,参与了癌症中的转录失调、病毒感染、雌激素信号通路等进程,并测出差异表达lncRNA有119种靶基因。结论 本研究是乳腺癌相关的lncRNA谱的补充,研究发现了一定数量差异表达的lncRNA,并预测其功能靶向基因和途径,有望为乳腺癌的靶向治疗和预后评估提供新的参考依据。
    • 肖调义; 龙哲; 李彬; 张秋实; 秦玲; 熊舒婷
    • 摘要: 为探索基于高通量筛选抗性主效miRNA功能分子的方法应用于抗性草鱼(Ctenopharyngodon idellus)的选育,研究借助高通量测序鉴定分析感染GCRV前后的草鱼头肾组织中miRNAs。测序结果共鉴定出821个成熟miRNAs,其中118个在GCRV攻毒组特异表达,82个为未攻毒组特有;差异分析结果显示,GCRV处理后有88个miRNA显著下调表达、46个miRNA显著上调表达;qPCR结果显示miR-21在GCRV感染组中的头肾中表达量最高,miR-194a在两个比较组中的差异倍数最大,达到48倍之高;组织表达结果发现部分差异表达miRNA在脾脏、肾脏、头肾、皮肤和鳃等免疫相关器官中高表达;这些结果提示不同的miRNAs在草鱼的GCRV应答过程中发挥着不同的功能,为抗病草鱼的选育提供可参考的分子资源。
    • 翟亚莹; 施巧婷; 楚秋霞; 朱肖亭; 滑留帅; 张子敬; 陈付英; 祁兴磊; 王二耀; 吕世杰
    • 摘要: 【目的】探索胚胎移植前供体牛与受体牛血浆外泌体miRNA的表达差异,以明确血浆外泌体miRNA在牛早期妊娠中的作用及其调控机制。【方法】以3~6岁、体重480~600 kg的夏南牛作为研究对象,选取10头供体牛进行同期发情、超数排卵和人工授精,23头受体牛只做同期发情处理。在人工授精后第7天,冲洗供体牛子宫以获取囊胚,选取3头囊胚数相近的供体牛及3头与供体牛体重和年龄均相近的受体牛,颈静脉采血,进行血浆外泌体的分离与鉴定;然后提取血浆外泌体miRNA,并检测其表达量;采用R语言中的DESeq差异算法计算P值,并筛选出P<0.05的miRNA,对差异表达的miRNA进行靶基因预测、GO功能富集分析和KEGG信号通路分析。【结果】6个样本的囊泡粒径均在135 nm左右,符合外泌体的特征。与供体牛相比,受体牛中有9个miRNAs表达显著上调(P<0.05),13个miRNAs显著下调(P<0.05);22个差异表达的miRNAs中,有15个miRNAs预测出无重复的靶基因2990个。GO功能富集分析和KEGG信号通路分析的结果表明,这些靶基因主要富集在与生物黏附(biological adhesion)、定位(localization)、细胞连接(cell junction)功能有关的通路上,显著富集的信号通路与黏着斑(focal adhesion)、黏着连接(adherens junction)有关,提示血浆外泌体miRNA可能参与调控胚胎着床。【结论】研究结果可为筛选和探究影响胚胎着床的血浆外泌体miRNA提供参考,并为进一步阐明血浆外泌体miRNA在母牛早期妊娠调控中的作用提供依据。
    • 赵俊玉; 祝倩; 尚曼; 李烨仪; 刘淼; 王艺璐; 吴艳娜; 刘艳霞; 宋君秋
    • 摘要: 目的:分离提取心肌缺血预适应(IPC)模型大鼠循环血中的细胞微囊泡(MVs),探究IPC处理对循环血MVs中microRNAs(miRNAs)表达的影响。方法:健康雄性Wistar大鼠8只,随机分为IPC-MVs组和假手术对照(Sham-MVs)组,每组4只。建立大鼠心肌IPC模型,提取循环血IPC-MVs,采用Microarray分析两组循环血MVs中的miRNAs,利用生物信息学进行靶基因预测及功能分析。结果:与Sham-MVs组比较,IPC-MVs组中循环血差异表达显著上调的miRNAs共3个(P<0.01,FER<0.05):miR-1-3p、miR-133a-3p和miR-133b-3p(t=3.194、3.002、3.389,均P<0.05)。基因本体研究会数据库(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析显示,这些miRNAs可能通过调节心肌细胞中丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路和Ras信号通路,发挥抗心肌缺血/再灌注(I/R)损伤的保护作用,可能参与调控的核心靶基因包括Ntrk2、Igf1、Gnai3和Bcl2l1。结论:IPC处理可使大鼠循环血MVs中miR-1-3p、miR-133a-3p和miR-133b-3p表达显著上调。
    • 杨兴云; 乔丹丹; 张雅洁; 王少青; 任俊才; 李明阳; 屈明好; 尚盼盼; 杨成; 黄琳凯; 曾兵
    • 摘要: 水淹胁迫是限制我国西南地区鸭茅产量和品质提升的主要环境因子,已经成为一种不容忽视的非生物胁迫。鉴定鸭茅耐涝相关的功能基因,并探究其调控机制是鸭茅种质创新,提高鸭茅耐涝能力的必要途径。以鸭茅耐涝品种“滇北”为试验材料,分别经水淹胁迫处理0、8和24 h后,利用Illumina Hiseq测序平台对鸭茅叶片进行小RNA测序。结果表明,在水淹胁迫处理下共鉴定得到208个差异表达基因(DEGs),经过筛选后有38个基因上调表达,34个基因下调表达,共占差异表达基因的34.62%。“滇北”鸭茅在水淹胁迫下差异表达基因主要属于miR166、miR167、miR159、miR396和miR156这5个miRNA基因家族。基于对差异miRNA进行靶基因预测及靶基因的GO和KEGG功能分析,发现这些靶基因主要参与细胞生理过程、代谢过程、IL-17信号通路、Th17细胞分化等植物逆境响应过程,为进一步揭示鸭茅在水淹胁迫下的分子调控机制提供了研究线索。
    • 呼芳娣; 刘丽君; 马骊; 牛早霞; 孙柏林; 徐佳; 杨雯昕; 刘博; 蒲媛媛; 武军艳; 方彦; 李学才; 沈金雄; 孙万仓
    • 摘要: 甘蓝型冬油菜下胚轴长短与其抗寒性强弱呈负相关关系。为研究下胚轴伸长相关的BnYUCCA8基因对低温胁迫的响应,采用同源克隆技术从甘蓝型冬油菜中克隆了BnYUCCA8基因,其CDS全长1281 bp,编码426个氨基酸。生物信息学分析表明,BnYUCCA8蛋白是一个不稳定的疏水性蛋白,与埃塞俄比亚芥和甘蓝中YUCCA8蛋白的亲缘关系最近。荧光定量PCR结果表明,BnYUCCA8在叶和根中表达量最高,花和角果中表达量相对较低,且苗期表达量高于花期。随低温胁迫加剧,BnYUCCA8表达量总体呈降低趋势,且‘天油2288’(下胚轴伸长较长的弱抗寒品种)较‘16VHNTS158’(下胚轴伸长较短的强抗寒品种)基因表达量高。内源IAA含量的测定结果表明,在低温处理24 h时,‘16VHNTS158’中IAA含量在4°C、0°C、-4°C较常温(22°C)分别降低68%、92%、97%,‘天油2288’中分别降低了77%、89%、94%,且‘16VHNTS158’较‘天油2288’IAA含量在常温、4°C、0°C、-4°C分别低19%、14%、40%、39%。对BnYUCCA8相对表达量、内源IAA含量和下胚轴长度进行相关性分析,结果表明,‘16VHNTS158’和‘天油2288’的BnYUCCA8相对表达量和生长素含量之间的相关系数分别为0.682和0.812,存在显著和极显著正相关关系,下胚轴长度与基因相对表达量之间的相关系数分别为0.54和0.41,与生长素含量之间的相关系数分别为0.427和0.591,为正相关关系。由此说明甘蓝型冬油菜BnYUCCA8可能在下胚轴长度和内源IAA含量中发挥重要调节作用。
    • 王炜烨; 王云菲; 陆宝燕; 马勋; 张艳艳; 孟季蒙; 王正荣; 薄新文
    • 摘要: 为研究细粒棘球绦虫(Echinococcus granulosus,E.g)TSP8基因的分子特性以及其在虫体不同发育阶段的差异表达,根据NCBI GenBank数据库中的TSP8基因设计1对特异性引物,对TSP8基因进行PCR扩增,将PCR产物克隆到pMD19-T载体后测序,通过生物信息学软件分析预测TSP8基因的结构与功能,并通过SYBR GreenⅠqRT-PCR方法分析TSP8基因在虫体原头蚴、包囊壁以及成虫mRNA相对转录情况。结果显示:成功克隆到细粒棘球绦虫TSP8基因序列,与细粒棘球绦虫跨膜蛋白(GenBank登录号:CDS17460.1)同源性为100%;进一步生物信息学分析显示,TSP8基因全长669个核苷酸,编码222个氨基酸,理论等电点为5.06,为稳定蛋白分子;TSP8基因编码的氨基酸序列共含有5个跨膜区域,含有4个优势B抗原表位;qRT-PCR结果显示TSP8基因在原头蚴及成虫阶段均有表达,差异显著,具有统计学意义(P<0.05)。本研究对细粒棘球绦虫TSP8基因的分子特性进行了初步研究,为进一步揭示其生物学功能奠定了基础。
    • 牛海文; 崔浩波; 李宏; 曹国磊; 何丽丽; 曹嘉芮; 张迪; 罗琴
    • 摘要: 目的研究肺腺癌患者外周血中非编码RNA的表达差异。方法收集新疆医科大学附属肿瘤医院2019年1月—2019年12月呼吸神经内科收治的肺腺癌患者与健康对照组的外周血各4例,利用TRIZOL试剂盒提取两组患者外周血中RNA,采用RNA-Seq高通量测序检测lncRNA表达谱,利用lncTar软件对差异表达的lncRNA和mRNA行共表达分析,进而采用KOBAS软件对mRNA行基因本体论(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)分析。结果与对照组相比,肺腺癌患者外周血中有804个差异表达的lncRNA(其中425个表达上调,379个表达下调,P≤0.05),对存在差异的lncRNA靶向的mRNA行GO分析发现,肺腺癌对比健康人主要与翻译起始、mRNA分解过程相关,KEGG主要与核糖体、代谢途径等通路相关。结论LINC02193、SNHG17、TUG1、LINC01503可作为肺腺癌发生发展的标志物,肺腺癌的发生可能与核糖体、代谢途径等通路有关。
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