基因表达谱

摘要： 背景:目前没有监测骨关节炎发生或进展的敏感标志物,检测骨关节炎活动期外周血基因表达谱变化,有助于探寻血液中精确的诊疗靶点及阐释发病机制.目的:通过生物信息学方法分析骨关节炎患者与正常人外周血淋巴细胞基因表达谱差异,从分子层面探索血液中骨关节炎的诊疗靶点,为研究骨关节炎提供新思路.方法:从GEO和ArrayExpress数据库中查找骨关节炎血液相关的芯片数据,并下载GSE63359数据集.筛选样本包括46例骨关节炎患者血液和26例健康人血液,其中女性患者32例(健康女性19例).用R语言limma包分别筛选出男/女性骨关节炎和男/女性健康人之间的差异表达基因,用ggplot2包绘制火山图,ComplexHeatmap包绘制热图.设定阈值为P0.5获取差异表达基因,然后制作韦恩图,得到8个差异表达基因:MAP2K7、CREBZF、CLK4、TRIM37、IL18RAP、LRRN3、BLNK和MS4A1;通过DAVID对差异表达基因进行GO和KEGG通路分析,并用R语言ggplot2包绘制气泡图.用STRING和Cytoscape软件构件PPI网络,Mcode和centiscape插件进行模块分析,Cytohubba筛选出关键基因.结果 与结论:共筛选出差异表达基因115个,其中上调基因16个,下调基因99个,对所有差异表达基因进行GO富集分析主要集中在"淋巴细胞介导的免疫""体液免疫反应""抗原受体介导的信号通路""B细胞受体信号通路""免疫球蛋白介导的免疫反应"和"吞噬作用的正调控"等生物功能上;KEGG主要富集在5条与骨关节炎相关的通路上:造血细胞谱系、Th1和Th2细胞分化、Th17细胞分化、破骨细胞分化和TNF信号通路.利用PPI网络及相关插件筛选出10个与骨关节炎高度相关的关键基因,其中瘤坏死因子、CD19、转铁蛋白受体、配对框5、丝裂原活化蛋白激酶7、CD24、CD20和B细胞连接器8个核心基因与骨关节炎炎症和细胞凋亡高度相关.提示:通过生物信息学分析发现骨关节炎和健康人的外周血淋巴细胞基因表达差异集中在炎症反应和细胞凋亡,从而使血液表达谱成为监测骨关节炎靶点标记物和研究其潜在分子机制的有效突破口.

摘要： 目的应用转录组测序技术分析PM_(2.5)处理后小鼠肺泡Ⅱ型上皮细胞的基因表达谱变化及其功能与信号通路。方法小鼠肺泡Ⅱ型上皮细胞MLE-12分为对照组(无处理)和PM_(2.5)组(100μg/mL PM_(2.5)处理),分别处理24 h后提取两组细胞RNA进行转录组测序。所得序列经质控后,利用差异分析软件edgeR筛选出差异表达基因,使用clusterProfile软件进行差异表达基因的GO功能富集和KEGG通路富集分析。选择KEGG富集分析中化学致癌通路的10个较感兴趣的差异表达基因,采用q-PCR法检测其mRNA表达,分别计算各差异表达基因通过q-PCR法、转录组测序得到的PM_(2.5)组/对照组比值,对比q-PCR法测出的基因表达变化是否与转录组测序测出的基因表达变化一致,以验证测序的准确性。结果共筛选到1151个差异表达基因,其中下调基因688个,上调基因483个。GO功能与KEGG信号通路富集分析结果显示,差异基因主要富集在胆固醇代谢、调节趋化作用、细胞黏附、谷胱甘肽转移酶活性等功能及化学致癌性、细胞外基质—受体交互、类固醇生物合成、谷胱甘肽代谢等通路上。选择Gstt1、Gsta1、Gstm1、Gstm7、Gsta3、Gstp2、Ptgs2、Gsta4、Aldh3b1、Aldh3b2进行差异表达基因验证,其中Gsta1、Gsta3、Gsta4、Gstm1、Gstm7、Gstt1、Gstp2属于谷胱甘肽S-转移酶(GST)家族;q-PCR法检测结果与转录组测序结果均显示,Gsta1、Gsta3、Ptgs2、Gsta4、Aldh3b1、Aldh3b2表达上调,Gstt1、Gstm1、Gstm7、Gstp2表达下调,q-PCR法测得各基因表达变化均与转录组测序的趋势一致(P均<0.05)。结论PM_(2.5)可导致MLE-12细胞基因表达谱发生变化,差异基因主要富集在胆固醇代谢、谷胱甘肽转移酶活性等功能及化学致癌性、谷胱甘肽代谢等信号通路,PM_(2.5)导致细胞毒性的机制可能为通过减弱GST的解毒功能而影响化学致癌通路。

摘要： 根据临床收录的肿瘤基因表达谱数据,可以利用分类器进行肿瘤亚型分类.由于基因表达谱数据样本小、维度高,难以提取有效特征,分类效果往往不好,而且很容易过拟合.针对这些问题,研究利用自编码器对特征基因进行降维,并构建多尺度的神经网络进行学习分类,综合考虑不同尺度的特征,提出A-CNNs网络,不仅解决了高维样本难以处理的问题,且有效避免了纵向加深神经网络带来的过拟合,得到了较高的平均分类精度,并与其他机器学习方法进行对比实验,实验证明所构建的分类模型可以取得较佳的分类效果.

摘要： 目的明确循环外泌体对高血压的影响,筛选出其中发挥关键作用的miRNA,探索其功能。方法提取自发性高血压大鼠(spontaneously hypertensive rats,SHR)血浆外泌体注射入正常血压大鼠体内检测大鼠血压的变化;提取高血压患者及SHR血浆外泌体及外泌体RNA,RT-PCR验证挑选的8个miRNAs的表达变化;Western blot的方法检测人脐静结果SHR血浆外泌体可使SD大鼠的血压显著升高。miR-17-5p与miR-218-5p在高血压患者及SHR血浆外泌体(SHR-exos)中的表达明显升高。miR-17-5p抑制剂可以明显减弱SHR-exos升高血压的作用。在体外培养的HUVEC中,miR-17-5p可以下调LKB1和PTEN的表达。结论SHR血浆外泌体可使正常大鼠血压显著升高,miR-17-5p可能是其中发挥关键作用的miRNA。exo-miR-17-5p可能是通过对LKB1/PTEN信号的调控实现促进高血压发生发展作用的。

摘要： 弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)是最常见的非霍奇金淋巴瘤(NHL),约占所有NHL的40%。DLBCL在临床和病理中具有高度异质性。尽管一线R-CHOP方案能够使约60%的患者实现治愈,但仍有30%-40%的患者面临复发难治。未来DLBCL治疗疗效提高的希望需要寄托在我们对DLBCL临床和病理异质性更深认识的基础上。唯有更精确的分型,才能使不同的DLBCL患者得到精准化和个体化的治疗,从而获得超越R-CHOP方案的疗效。近年来,医学界在DLBCL的分型方面做出大量探索,且取得较大突破。本文旨在对DLBCL的临床及分子分型进展进行综述。

摘要： 【目的】通过转录组测序(RNA-Seq)方法分析持续感染口蹄疫病毒结构蛋白VP1诱导的PK-15细胞基因表达谱的变化,探索VP1蛋白对宿主细胞信号通路的影响。为后续开展VP1影响FMDV持续感染相关机制研究提供基础数据和理论支持。【方法】PK-15细胞分别转染pCAGGS-HA(对照载体)、pCAGGS-HA-Pi-VP1质粒,转染36 h后,Western blot检测VP1蛋白表达,同时提取两组细胞总RNA进行转录组测序(每组3个重复,2组6个样本)。将测序所得的序列进行过滤比对,获得差异表达基因后,对差异表达基因进行了生物信息学分析。采用qRT-PCR验证关键差异表达基因的表达。【结果】RNA-Seq共鉴定出3376个差异表达基因(DEGs)|log2(Fold Change)|>0和padj<0.05,其中上调基因1744个,下调基因1632个。许多参与免疫反应和炎症的效应基因差异表达。GO和KEGG富集分析显示,差异基因GO条目绝大部分与核糖体有关,而KEGG富集中涉及了与天然免疫相关的信号通路,如TNF信号通路、Toll受体信号通路。【结论】pCAGGS-HA-Pi-VP1转染PK-15细胞之后,改变了细胞的表达谱,获得的DEGs及其功能注释信息有助于理解其对宿主细胞的影响,为后续开展VP1影响FMDV持续感染相关机制研究提供基础数据和理论支持。

摘要： 目的通过自然杀伤(NK)细胞体外培养和转录组学测序(RNA-seq)技术研究人NK细胞体外扩增情况及其功能活化的信号通路。方法分离健康志愿者外周血单个核细胞(PBMC),应用NK细胞培养法进行培养。采用流式细胞术、ELISA法和磁性细胞分选技术分析体外培养扩增不同阶段的NK细胞。获得纯化后的NK细胞进行RNA-seq检测,分析人NK细胞体外扩增情况及其功能活化的信号通路。结果体外培养14 d后,NK细胞(CD3-CD56+)的比例达到90%以上。第10、14天NK细胞的杀伤活性均较第0天明显增强,且随着效靶比从5∶1、10∶1到20∶1,各组NK细胞对K562细胞的杀伤活性均逐步提高(F=124.40~5512.00,P<0.05)。培养至第14天的NK细胞IFN-γ的分泌量显著高于第0、10天(q=67.17、7.75,P<0.05)。RNA-seq分析结果显示,第10、14天NK细胞与第0天NK细胞相比差异表达基因(DEGs)均较多,且第10天DEGs多于第14天。GO功能和KEGG通路富集分析显示这些DEGs主要与炎症反应、免疫反应、细胞分裂和增殖相关,而且显著富集在细胞周期、成骨细胞分化、造血细胞调控、NF-Kappa B等信号通路。结论本研究发现CD16抗体联合5种细胞因子的培养方法可以有效诱导PBMC成为NK细胞,为NK细胞免疫治疗提供了理论基础和实验依据。

摘要： 目的利用高通量基因芯片技术检测老年心力衰竭患者血浆中环状RNA(cirRNAs)的表达谱,进行生物信息学分析,探究血浆环状RNA在老年心力衰竭发生发展中的作用。方法选取安徽省立医院确诊为老年心力衰竭患者4例(研究组)和无心血管疾病的老年人4例(对照组)作为研究对象,运用基因芯片技术检测2组对象血浆中环状RNA表达谱,筛选出2组间差异表达的环状RNA,对差异表达的环状RNA进行分析以及对其可能结合的微小RNA(miRNA)进行预测。结果与对照组比较,研究组血浆中差异表达的环状RNA共190种(变化倍数>1.5,P<0.05),其中表达上调的有116种,下调的有74种。其中可能与差异性表达的环状RNA结合的miR-764、miR-410-3p、miR-483-3p、miR-148b-3p、miR-204-5、miR-17-3p、miR-134-5p可能参与心力衰竭的病理过程。结论研究组与对照组血浆间存在差异表达的环状RNA,这些环状RNA可能参与老年心力衰竭的发生发展过程。

摘要： 目的:分析环状RNA(circRNA)在宫颈癌组织及癌旁正常组织中的差异表达谱,探讨circRNA与宫颈癌发病机制及预后的关系。方法:收集我院2014年7-10月确诊为宫颈癌并行手术治疗的10例患者的癌组织及对应癌旁正常组织,采用基因芯片技术筛选两组样本间差异表达circRNA,随机选择差异表达circRNAs行实时荧光定量PCR检测(RT-qPCR)验证测序结果,选择RT-qPCR验证结果中表达差异最大的circRNA,结合癌症基因组图谱(TCGA)数据库分析其相对表达量与宫颈癌患者术后生存时间的关系,通过生物信息学方法分析差异表达circRNA宿主基因的生物学功能及信号通路。结果:宫颈癌组织及配对癌旁正常组织中发现DE circRNA有25749个(差异倍数≥2,P<0.05),其中表达上调的有12806个,表达下调有12943个;选取14个显著差异表达的circRNA(差异倍数≥3,P<0.05),RT-qPCR验证显示78.6%(11/14)与芯片结果一致;RT-qPCR验证结果显示hsa_circ_0008517在宫颈癌组织中显著低表达,且hsa_circ_0008517低表达组的中位生存时间低于高表达组,差异有统计学意义(P<0.05);GO富集分析显示异常表达circRNA参与细胞增殖、分化、信号转导等多种生物学过程和信号通路。结论:circRNA在宫颈癌组织中差异表达,与宫颈癌患者的预后密切相关,为宫颈癌的临床诊疗及评估预后提供新方向。

摘要： 【目的】系统鉴定和分析小麦纤维素合成酶(CesA)基因家族成员,为进一步阐明小麦CesA基因家族的生物学功能奠定理论基础。【方法】利用生物信息学方法在小麦全基因组上系统鉴定小麦CesA (TaCesA)基因家族的成员。对小麦CesA基因的系统发育、染色体位置和转录组进行分析。预测TaCesAs基因结构、保守基序、顺式元件、蛋白质特征和亚细胞定位,并对小麦及其亚基因组供体中CesAs同源基因进行比对。【结果】共鉴定出21个TaCesA基因,分为3组(a、b和c)。基因结构分析发现TaCesA含有多个内含子,但部分基因非翻译区(UTR)结构存在缺失。TaCesA基因与其亚基因组供体关系保守。TaCesAs的上游包含45个与生物胁迫/非生物胁迫、生长发育和植物激素相关的元件,预示这些基因可能参与响应小麦的生物学功能。表达谱结果显示:TaCesA基因在缺磷、高温、低温、干旱、条锈病、白粉病和赤霉病等逆境胁迫中均有响应。【结论】小麦CesA基因具有保守的基因结构和蛋白结构,且在小麦抵御非生物和生物胁迫中起着重要作用。

摘要： 目的：研究中药温化蠲痹方对胶原诱导性关节炎(collagen-inducing arthritis,CIA)大鼠滑膜基因表达谱的影响,探讨其治疗CIA的作用机制. 方法：选用健康雄性Wistar大鼠40只,采用牛Ⅱ型胶原乳剂于大鼠尾根部注射,建立CIA模型.随机选取造模成功大鼠16只随机分为模型组(n=8)、温化蠲痹方组(n=8,简称中药组).中药组按22.9g/kg·d剂量灌胃温化蠲痹方,模型组按22.9g/kg·d剂量灌胃生理盐水,每日1次.给药30天后,提取两组大鼠滑膜总RNA,运用Illumina基因表达谱芯片分析每个样本基因变化. 结果：温化蠲痹方干预后大鼠滑膜差异表达基因有222条,其中上调基因76条,下调基因146条,差异表达基因主要涉及细胞凋亡、血管生成素、防御素基因、细胞因子、信号转导、癌基因等. 结论：中药温化蠲痹方可能通过对多基因表达进行调控,诸如下调Ankept12、Muc1、Bcl-2等基因表达,上调RatNP-3b等基因表达,发挥多靶点治疗CIA作用.

摘要： 文章介绍了精准医学的定义，阐述了基因表达谱技术方法及临床应用，同时探讨了乳腺癌21基因检测及临床实践，并论述了肿瘤组织起源基因检测及临床实践。

摘要： 王浆酸是蜂王浆中独有的活性功能组分,王浆酸生理作用研究对于蜂王浆的开发利用具有重要意义.肝损伤是多种致病因素所造成的肝脏病理过程,是肝纤维化和肝硬化的起始动因.本文通过建立大鼠刀豆蛋白诱导肝损伤模型,分别给大鼠饲喂不同浓度的王浆酸和蜂王浆提取物,检测大鼠血清中肝损伤相关组分含量、肝脏基因表达以及GO富集分析情况,以探讨王浆酸对肝损伤的影响.结果表明,王浆酸可以通过影响有机体的代谢、小分子代谢等代谢过程,对炎性肝组织具有极显著的治疗效果.

摘要： 近年来,人工光源的广泛使用,给人们带来便利的同时,也正在成为一种新的污染源—光污染.光污染对环境造成了明显的不良影响,同时也影响到了人们的正常生活[1-2].轮班、熬夜以及作息不规律的人群日益增多,打乱了传统的日出而作日落而息的生活习惯,对人体在不同程度上有着一定的伤害,从而使一系列疾病的患病机率增加,表现在女性生殖系统方面的疾病如月经不调、排卵障碍性疾病、不孕症、自然流产、痛经等[3-4].MicroRNA是一类长度约为22nt的非编码RNA，广泛存在于哺乳动物等真核生物中，microRNA能通过与靶mRNA特异性的碱基互补配对引起靶mRNA的降解或遏制其翻译，从而对基因进行转录后调控作为一种重要的转录后调控方式，在多种疾病的发生发展中起到了重要的调节作用，包括细胞增殖与凋亡、内分泌、新陈代谢、脂肪代谢、神经分化等过程。研究表明，许多重要的生物学进程研究发现多种疾病中均存在microRNA的差异表达。本实验采用持续光照的方法建立大鼠光照节律紊乱模型模拟光污染的环境，通过对大鼠卵巢microRNA测序表达谱的分析，从而探讨这种环境影响因素对大鼠卵巢microRNA的影响以及滋阴补阳方序贯法的干预作用，为临床治疗和预防提供一定的实验依据。

摘要： 近年来,人工光源的广泛使用,给人们带来便利的同时,也正在成为一种新的污染源—光污染.光污染对环境造成了明显的不良影响,同时也影响到了人们的正常生活[1-2].轮班、熬夜以及作息不规律的人群日益增多,打乱了传统的日出而作日落而息的生活习惯,对人体在不同程度上有着一定的伤害,从而使一系列疾病的患病机率增加,表现在女性生殖系统方面的疾病如月经不调、排卵障碍性疾病、不孕症、自然流产、痛经等[3-4].MicroRNA是一类长度约为22nt的非编码RNA，广泛存在于哺乳动物等真核生物中，microRNA能通过与靶mRNA特异性的碱基互补配对引起靶mRNA的降解或遏制其翻译，从而对基因进行转录后调控作为一种重要的转录后调控方式，在多种疾病的发生发展中起到了重要的调节作用，包括细胞增殖与凋亡、内分泌、新陈代谢、脂肪代谢、神经分化等过程。研究表明，许多重要的生物学进程研究发现多种疾病中均存在microRNA的差异表达。本实验采用持续光照的方法建立大鼠光照节律紊乱模型模拟光污染的环境，通过对大鼠卵巢microRNA测序表达谱的分析，从而探讨这种环境影响因素对大鼠卵巢microRNA的影响以及滋阴补阳方序贯法的干预作用，为临床治疗和预防提供一定的实验依据。

摘要： 近年来,人工光源的广泛使用,给人们带来便利的同时,也正在成为一种新的污染源—光污染.光污染对环境造成了明显的不良影响,同时也影响到了人们的正常生活[1-2].轮班、熬夜以及作息不规律的人群日益增多,打乱了传统的日出而作日落而息的生活习惯,对人体在不同程度上有着一定的伤害,从而使一系列疾病的患病机率增加,表现在女性生殖系统方面的疾病如月经不调、排卵障碍性疾病、不孕症、自然流产、痛经等[3-4].MicroRNA是一类长度约为22nt的非编码RNA，广泛存在于哺乳动物等真核生物中，microRNA能通过与靶mRNA特异性的碱基互补配对引起靶mRNA的降解或遏制其翻译，从而对基因进行转录后调控作为一种重要的转录后调控方式，在多种疾病的发生发展中起到了重要的调节作用，包括细胞增殖与凋亡、内分泌、新陈代谢、脂肪代谢、神经分化等过程。研究表明，许多重要的生物学进程研究发现多种疾病中均存在microRNA的差异表达。本实验采用持续光照的方法建立大鼠光照节律紊乱模型模拟光污染的环境，通过对大鼠卵巢microRNA测序表达谱的分析，从而探讨这种环境影响因素对大鼠卵巢microRNA的影响以及滋阴补阳方序贯法的干预作用，为临床治疗和预防提供一定的实验依据。

摘要： 近年来,人工光源的广泛使用,给人们带来便利的同时,也正在成为一种新的污染源—光污染.光污染对环境造成了明显的不良影响,同时也影响到了人们的正常生活[1-2].轮班、熬夜以及作息不规律的人群日益增多,打乱了传统的日出而作日落而息的生活习惯,对人体在不同程度上有着一定的伤害,从而使一系列疾病的患病机率增加,表现在女性生殖系统方面的疾病如月经不调、排卵障碍性疾病、不孕症、自然流产、痛经等[3-4].MicroRNA是一类长度约为22nt的非编码RNA，广泛存在于哺乳动物等真核生物中，microRNA能通过与靶mRNA特异性的碱基互补配对引起靶mRNA的降解或遏制其翻译，从而对基因进行转录后调控作为一种重要的转录后调控方式，在多种疾病的发生发展中起到了重要的调节作用，包括细胞增殖与凋亡、内分泌、新陈代谢、脂肪代谢、神经分化等过程。研究表明，许多重要的生物学进程研究发现多种疾病中均存在microRNA的差异表达。本实验采用持续光照的方法建立大鼠光照节律紊乱模型模拟光污染的环境，通过对大鼠卵巢microRNA测序表达谱的分析，从而探讨这种环境影响因素对大鼠卵巢microRNA的影响以及滋阴补阳方序贯法的干预作用，为临床治疗和预防提供一定的实验依据。

摘要： 近年来,人工光源的广泛使用,给人们带来便利的同时,也正在成为一种新的污染源—光污染.光污染对环境造成了明显的不良影响,同时也影响到了人们的正常生活[1-2].轮班、熬夜以及作息不规律的人群日益增多,打乱了传统的日出而作日落而息的生活习惯,对人体在不同程度上有着一定的伤害,从而使一系列疾病的患病机率增加,表现在女性生殖系统方面的疾病如月经不调、排卵障碍性疾病、不孕症、自然流产、痛经等[3-4].MicroRNA是一类长度约为22nt的非编码RNA，广泛存在于哺乳动物等真核生物中，microRNA能通过与靶mRNA特异性的碱基互补配对引起靶mRNA的降解或遏制其翻译，从而对基因进行转录后调控作为一种重要的转录后调控方式，在多种疾病的发生发展中起到了重要的调节作用，包括细胞增殖与凋亡、内分泌、新陈代谢、脂肪代谢、神经分化等过程。研究表明，许多重要的生物学进程研究发现多种疾病中均存在microRNA的差异表达。本实验采用持续光照的方法建立大鼠光照节律紊乱模型模拟光污染的环境，通过对大鼠卵巢microRNA测序表达谱的分析，从而探讨这种环境影响因素对大鼠卵巢microRNA的影响以及滋阴补阳方序贯法的干预作用，为临床治疗和预防提供一定的实验依据。

摘要： 近年来,人工光源的广泛使用,给人们带来便利的同时,也正在成为一种新的污染源—光污染.光污染对环境造成了明显的不良影响,同时也影响到了人们的正常生活[1-2].轮班、熬夜以及作息不规律的人群日益增多,打乱了传统的日出而作日落而息的生活习惯,对人体在不同程度上有着一定的伤害,从而使一系列疾病的患病机率增加,表现在女性生殖系统方面的疾病如月经不调、排卵障碍性疾病、不孕症、自然流产、痛经等[3-4].MicroRNA是一类长度约为22nt的非编码RNA，广泛存在于哺乳动物等真核生物中，microRNA能通过与靶mRNA特异性的碱基互补配对引起靶mRNA的降解或遏制其翻译，从而对基因进行转录后调控作为一种重要的转录后调控方式，在多种疾病的发生发展中起到了重要的调节作用，包括细胞增殖与凋亡、内分泌、新陈代谢、脂肪代谢、神经分化等过程。研究表明，许多重要的生物学进程研究发现多种疾病中均存在microRNA的差异表达。本实验采用持续光照的方法建立大鼠光照节律紊乱模型模拟光污染的环境，通过对大鼠卵巢microRNA测序表达谱的分析，从而探讨这种环境影响因素对大鼠卵巢microRNA的影响以及滋阴补阳方序贯法的干预作用，为临床治疗和预防提供一定的实验依据。

摘要： 目的：筛选慢性乙型病毒性肝炎(CHB)脾虚湿热证的潜在microRNA表达谱,探讨CHB脾虚湿热证的生物学标志物. 方法：运用基因芯片技术检测CHB脾虚湿热证组、隐证组及健康对照组的microRNA,通过数据分析,选择脾虚湿热证组中与隐证组和健康对照组比较具有显著差异的microRNA作为其潜在的microRNA表达谱.并通过靶基因预测及富集分析等进行功能分析,探讨差异microRNA表达谱影响证候形成的可能路径. 结果：研究获得miR-378a-3p等17条microRNA在脾虚湿热证组与隐证组、健康对照组间存在显著差异,可作为CHB脾虚湿热证的潜在microRNA表达谱. 结论：CHB脾虚湿热证的潜在mkroRNA表达谱为：miR-378a-3p、miR-4745-5p、miR-1275、miR-423-5p、miR-3188、miR-4800-5p、miR-4455、miR-939、miR-3676-5p、miR-3135b、miR-3141、miR-1587、miR-494、miR-4707-5p、miR-4739、miR-197-3p、miR-320a,其调控机制可能与核心启动子、MAPK、PI3K/Akt信号通路等有关.

摘要： 本发明涉及一种利用mRNA表达谱与circRNA表达谱联合筛选脊髓损伤时间基因的方法，属于医学技术领域。本发明提供的方法利用mRNA表达谱与circRNA表达谱联合筛选脊髓损伤时间基因，进而能够指导患者在脊髓损伤后能够在最合适的治疗时间用药，提高治愈效果。

摘要： 本发明涉及一种利用mRNA表达谱与竞争性内源RNA表达谱联合筛选蒽环类药物心脏毒性基因的方法，包括步骤：通过mRNA和竞争性内源RNA表达谱芯片检测到大量基因的表达值，对所有基因的相关性进行排序；将获取的mRNA和竞争性内源RNA特征基因进行合并；通过遗传算法，对基因池进一步选择基因；通过比较乳腺癌患者、乳腺癌AIC患者及正常人mRNA与竞争性内源RNA联合表达谱不同，样本间的数据从而选出差异表达的基因；对差异表达基因预测，挑选score大于140，自由能小于‑20的作为可靠的靶基因；再从靶基因中挑选有显著差异的，用剩余部分RNA对构建的乳腺癌蒽环类药物心脏毒性发病目的靶基因进行验证。本发明可以候选出更为可靠的与蒽环类药物心脏毒性相关的潜在基因标志物。

摘要： 本发明涉及将细胞中基因和蛋白表达相关联的方法。

摘要： 本发明提供一种利用基因芯片检测小檗碱诱导RMMVECs基因表达谱的方法，包括以下步骤：(1)制备并纯化大鼠心肌膜微血管内皮细胞RMMVECs；(2)培养二代RMMVECs，将小檗碱溶解于维持培养基中，浓度为10μg/ml，在37°C、5％CO2的条件下，将RMMVECs继续培养9h；等九步步骤；本发明成功培养了RMMVECs，并且利用基因芯片技术从基因表达水平充分验证了，提高微血管舒缩活动振幅的中药有效成分Ast和Ber能双向调节RMMVECs相关细胞因子的表达，维持细胞因子分泌的平衡，维持MVECs的正常生理功能，从而阻断了致病因子对微血管内皮细胞的伤害，发挥治疗疾病的作用。

摘要： 本发明提供一种利用基因芯片检测黄芪甲苷诱导RMMVECs基因表达谱的方法，包括以下步骤：(1)制备并纯化大鼠心肌膜微血管内皮细胞RMMVECs；(2)培养二代RMMVECs，将黄芪甲苷溶解于维持培养基中，浓度为10μg/ml，在37°C、5％CO2的条件下，将RMMVECs继续培养9h；等九个步骤；本发明成功培养了RMMVECs，并且利用基因芯片技术从基因表达水平充分验证了，提高微血管舒缩活动振幅的中药有效成分Ast或Ber能双向调节RMMVECs相关细胞因子的表达，维持细胞因子分泌的平衡，维持MVECs的正常生理功能，从而阻断了致病因子对微血管内皮细胞的伤害，发挥治疗疾病的作用。

摘要： 本发明公开了一种基于基因表达谱的药物毒性个体易感性基因标志物的筛选方法，包括：根据个体对某药物毒性易感性的差异，挑选对药物毒性易感和耐受的个体分别组成易感亚集和耐受亚集；根据两个亚集给药前的基因表达谱，挑选给药前的差异表达基因；结合药物给药后两个亚集的基因表达谱，进一步筛选给药前的差异表达基因，筛选出能够指示所述某药物毒性的个体易感性的潜在基因标志物；对所述的潜在基因标志物进行验证，筛选得到能够指示所述某药物毒性的个体易感性的基因标志物。本发明基于基因表达谱研究药物毒性的个体易感性，方法可靠，可操作性强。

摘要： 本发明公开了一种基于基因表达谱的药物毒性个体易感性基因标志物的筛选方法，包括：根据个体对某药物毒性易感性的差异，挑选对药物毒性易感和耐受的个体分别组成易感亚集和耐受亚集；根据两个亚集给药前的基因表达谱，挑选给药前的差异表达基因；结合药物给药后两个亚集的基因表达谱，进一步筛选给药前的差异表达基因，筛选出能够指示所述某药物毒性的个体易感性的潜在基因标志物；对所述的潜在基因标志物进行验证，筛选得到能够指示所述某药物毒性的个体易感性的基因标志物。本发明基于基因表达谱研究药物毒性的个体易感性，方法可靠，可操作性强。

摘要： 本发明公开了一种利用基因表达谱筛选动物不同组织差异基因的方法，采用全基因组表达谱芯片技术多通量筛选动物各组织差异基因和调控通路。本发明采用全基因组表达谱芯片结合生物信息学技术对动物不同组织样品转录谱进行比对分析，筛选到了影响动物不同组织的一些重要基因和调控通路，得到不同组织间的差异表达基因、相应的基因功能注释、信号通路和代谢通路，为从转录水平揭示动物不同组织间差异形成的分子机制提供依据。

摘要： 本发明提供一种利用基因芯片检测小檗碱诱导RMMVECs基因表达谱的方法，包括以下步骤：(1)制备并纯化大鼠心肌膜微血管内皮细胞RMMVECs；(2)培养二代RMMVECs，将小檗碱溶解于维持培养基中，浓度为10μg/ml，在37°C、5％CO2的条件下，将RMMVECs继续培养9h；等九步步骤；本发明成功培养了RMMVECs，并且利用基因芯片技术从基因表达水平充分验证了，提高微血管舒缩活动振幅的中药有效成分Ast和Ber能双向调节RMMVECs相关细胞因子的表达，维持细胞因子分泌的平衡，维持MVECs的正常生理功能，从而阻断了致病因子对微血管内皮细胞的伤害，发挥治疗疾病的作用。

摘要： 本发明提供一种利用基因芯片检测黄芪甲苷诱导RMMVECs基因表达谱的方法，包括以下步骤：(1)制备并纯化大鼠心肌膜微血管内皮细胞RMMVECs；(2)培养二代RMMVECs，将黄芪甲苷溶解于维持培养基中，浓度为10μg/ml，在37°C、5％CO2的条件下，将RMMVECs继续培养9h；等九个步骤；本发明成功培养了RMMVECs，并且利用基因芯片技术从基因表达水平充分验证了，提高微血管舒缩活动振幅的中药有效成分Ast或Ber能双向调节RMMVECs相关细胞因子的表达，维持细胞因子分泌的平衡，维持MVECs的正常生理功能，从而阻断了致病因子对微血管内皮细胞的伤害，发挥治疗疾病的作用。