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抑制消减杂交

抑制消减杂交的相关文献在1998年到2020年内共计280篇,主要集中在分子生物学、基础医学、肿瘤学 等领域,其中期刊论文258篇、会议论文22篇、专利文献100762篇;相关期刊168种,包括生物化学与生物物理进展、生物技术通讯、西北植物学报等; 相关会议19种,包括2010年全国养羊生产与学术研讨会、第14届全国农业生态学研讨会、第十五次全国动物遗传育种学术讨论会等;抑制消减杂交的相关文献由1069位作者贡献,包括王升启、范保星、刘德团等。

抑制消减杂交—发文量

期刊论文>

论文:258 占比:0.26%

会议论文>

论文:22 占比:0.02%

专利文献>

论文:100762 占比:99.72%

总计:101042篇

抑制消减杂交—发文趋势图

抑制消减杂交

-研究学者

  • 王升启
  • 范保星
  • 刘德团
  • 吴德昌
  • 朱兴全
  • 李婉莎
  • 杨永平
  • 梁自文
  • 罗向东
  • 胡向阳
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利文献

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    • 孟顺龙; 刘涛; 宋超; 张聪; 裘丽萍; 陈家长; 徐跑
    • 摘要: [目的]应用抑制消减杂交(SSH)技术,建立灭多威胁迫下罗非鱼精巢SSH正反向文库.[方法]以雄性罗非鱼为试验动物,采用抑制性消减杂交技术构建罗非鱼精巢组织在灭多威胁迫下的正反向SSH文库.试验共获得45条EST,成功注释25条,其中正向文库13条,反向文库12条.功能明确基因按功能可分为5类,其中催化活性、细胞相关基因表达上调,细胞过程、结构分子活性相关基因表达下调.整合素β1表达量上调,丝/苏氨酸蛋白激酶pim-3、Ca2+-ATPase、Na+-K+-ATPase、核糖体蛋白L22表达下调.[结论]研究结果可为揭示灭多威对罗非鱼生殖毒性的分子机制奠定基础.
    • 李长龙; 杜小燕; 王冬平; 陈振文
    • 摘要: 长爪沙鼠具有脑血管变异缺失的特性,是脑缺血研究良好的模型动物.普通长爪沙鼠群体中模型成功率低,影响研究结果稳定性,不符合实验动物福利要求.我们团队在证实脑血管Willis环(circle of Willis,COW)变异缺失具有遗传性的基础上,首先通过定向选育建立了脑缺血高发群体,进而通过全同胞近亲繁殖的方式,建立了脑缺血模型近交系,其COW缺失率达76.62%,模型成功率达到88.89%.此外,建立了近交系微卫星DNA和生化位点遗传检测方法,分析了长爪沙鼠脑缺血模型近交系动物的生长发育和血液生理生化等指标,为该模型的推广应用奠定了基础.我们还发现,VEGFA基因、AKT/PI3K和Notch信号通路在长爪沙鼠脑血管发育中发挥重要作用.通过抑制消减杂交方法筛选获得4个与长爪沙鼠脑血管发育相关的基因.长爪沙鼠脑缺血模型近交系的培育成功解决了模型发生率低的问题,减少了动物使用量,提高了研究结果可信度和稳定性,促进了相关机制研究.
    • 晏云涛; 吕瑞青; 石莲琴; 杨建发; 段纲; 邹丰才; 项勋
    • 摘要: 为获得紫茎泽兰处理鸡柔嫩艾美耳球虫后差异基因,将0.5%紫茎泽兰提取液作用于鸡柔嫩艾美耳球虫卵囊孢子化过程,采用抑制消减杂交技术(SSH)筛选处理后卵囊的差异表达基因,通过GO和COG功能预测分析,并采用实时荧光定量PCR验证差异表达的基因.结果显示,采用SSH成功构建了紫茎泽兰处理前后鸡柔嫩艾美耳球虫卵囊的cDNA消减文库,获得86条ESTs序列,经拼接和聚类后得到31条独立基因(Unigenes),其中有23个基因有功能注释,8个基因没有功能注释,另外有4个基因没有同源性匹配.为进一步验证文库的特异性,从中随机选取3个差异表达基因,运用实时荧光定量PCR技术验证表面抗原13、3-羟酰辅酶A脱氢酶和细胞色素P450基因在紫茎泽兰处理前后的表达差异,结果显示,3个基因在经紫茎泽兰处理的鸡球虫孢子化卵囊中的表达量明显低于未处理组,说明紫茎泽兰对柔嫩艾美耳球虫卵囊具有一定的活性抑制作用.本试验获取了紫茎泽兰作用柔嫩艾美耳球虫卵囊的主要调控基因,为将紫茎泽兰研发成环境杀虫剂奠定了良好的理论基础,也可为球虫致弱疫苗或基因缺失疫苗的靶标筛选研究提供参考.
    • 李忠旺; 陈玉梁; 欧巧明; 叶春雷; 裴怀弟; 刘新星; 王红梅; 罗俊杰
    • 摘要: Potato virus accumulation is one of the important reasons for the decline of yield and quality in potato production.In order to screen and clone the potato virus induced response gene,we constructed a suppression subtractive hybridization (SSH) library using cDNAs from potato virus disease carrying plant leaf as the tester,and those cDNAs from a virus-free seedling leaf as the driver.To verify the effect of library,98 randomly selected positive clones were identified by PCR from the library and sequenced,and 45 high quality non repeat sequences were obtained.By blast analysis in GenBank,we found that 14 of them were sequences belonging to the potato virus gene,22 of them had high homology with known genes,and 9 of them had no homologous reference gene.Two frequently found ESTs in the library were analyzed using quantitative real time PCR,and their expression was induced by potato virus.The results therefore showed that the SSH library was constructed successfully.This work has thus laid a foundation for further screening for potato virus related pathogenicity,and induction of corresponding defense response genes.This may lead to analysis of the molecular mechanisms of interaction between the potato plant and the virus,and use of biotechnology to cultivate virus resistant potato varieties.%马铃薯病毒积累引起的种薯退化是马铃薯生产中造成产量和品质下降的重要原因之一.本研究以马铃薯病毒病携带植株叶片cDNA为试验组(Tester)、脱毒种苗叶片eDNA为驱动组(Driver),采用抑制消减杂交(suppression subtractive hybridization,SSH)技术构建了马铃薯病毒诱导应答基因的cDNA文库;为验证文库构建效果,从文库中随机挑取了98个阳性克隆经PCR验证后测序,获得了45条高质量的有效非重复序列;经与GenBank进行同源比对后发现,其中14条非重复序列属于马铃薯病毒基因序列,22条与已知基因序列同源性较高,9条无同源参考基因;选取文库中出现频率较高的2个ESTs(expressed sequence tag,表达序列标签)用qRT-PCR技术分析发现,其表达量受马铃薯病毒侵染的诱导.结果表明,该SSH文库构建较为成功,为进一步筛选与马铃薯病毒致病、防御相关的应答基因,解析马铃薯与病毒互作的分子机理,利用生物技术手段培育抗病毒马铃薯奠定了基础.
    • 杨荣; 熊海科; 尚丽娜; 马桂; 宋丽娟; 杨春霞; 刘玮; 何欣; 康雅琼; 罗雁
    • 摘要: Purpose To investigate the role of CHMP4A and TSPYL-2 in early pathogenesis of esophageal cancer.Methods Through comparison of the four subtractive libraries,early esophageal squamous cell carcinoma genes CHMP4A and TSPYL-2 were chosen for further study.Through RT-PCR and immunohistochemistry methods,CHMP4A and TSPYL-2's expression was detected in esophageal squamous cell carcinoma tissue,cancerous tissue and normal esophageal mucosa.Results CHMP4A and TSPYL-2 expression between esophageal squamous cell carcinoma and normal esophageal epithelium tissue had significant differences (P < 0.05),and the CHMP4A gene expression in esophageal mucosa,field cancerization areas,esophageal squamous cell carcinoma tissue increased,while TSPYL-2 gene expression in esophageal mucosa,field cancerization areas,esophageal squamous cell carcinoma tissue decreased,which were consistent with the protein expression of CHMP4A and TSPYL-2.Conclusion CHMP4A and TSPYL-2 genes are differentially expressed in esophageal squamous cell carcinoma,which can be used as alternative genetic markers for further research.%目的 探讨染色质重塑蛋白4A(CHMP4A)及睾丸特定蛋白-2(TSPYL-2)基因在食管癌早期癌变中的作用.方法 采用RT-PCR、免疫组化法从RNA及蛋白水平检测CHMP4A及TSPYL-2在食管鳞状细胞癌组织、癌化区域组织及正常食管黏膜组织中的表达.结果 CHMP4A及TSPYL-2基因在食管鳞状细胞癌组织和正常食管黏膜组织中的表达差异有统计学意义(P<0.05),在癌化区域组织和正常食管黏膜组织中的表达差异有统计学意义(P<0.05),且CHMP4A在正常食管黏膜、癌化区域组织、食管鳞状细胞癌组织中的表达依次增高,TSPYL-2基因在正常食管黏膜、癌化区域组织、食管鳞状细胞癌组织中的表达依次降低,CHMP4A及TSPYL-2蛋白表达的变化趋势与CHMP4A及TSPYL-2基因一致.结论 差异表达基因CHMP4A及TSPYL-2可作为食管鳞状细胞癌早期基因备选基因进行后续实验.
    • 王杰; 贾月慧; 张克中; 崔金腾
    • 摘要: 东方百合与卷瓣组野生百合杂交(简称OS组合),属于亲缘关系最远的组间杂交,杂交障碍最大。挖掘雌蕊中杂交亲和性与不亲和性差异表达基因,有可能解释不亲和性杂交中引起花粉管定向生长异常的机理,进而阐明不亲和性杂交的分子机理,为实施克服杂交不亲和障碍技术措施提供依据。本研究采用抑制消减杂交技术(SSH技术),分别以不亲和性杂交和亲和性杂交的东方百合雌蕊为试验组(tester)和驱动组(driver),建立正向抑制消减杂交文库,随机挑选180个阳性克隆,经过测序、去劣、去冗余、序列比对,有113个EST与数据库中的已知序列具有同源性,最终获得10个差异表达基因。采用RT-PCR技术对10个差异表达基因进行验证,其中有1个基因在不亲和性杂交的雌蕊中表达上调、7个基因表达下调、2个基因无明显变化。对差异表达基因进行功能注释及分类,差异表达基因主要集中于信号转导(包括丝氨酸/苏氨酸蛋白磷酸酶PP2A-3、钙依赖蛋白激酶CDPK、小G结合蛋白)、抗逆防御(包括分子伴侣(clp B)、过氧化氢酶CAT2)、转运(包括质膜ATPase、焦磷酸酶质子泵)、蛋白命运(包括60S核糖体蛋白)等功能类别。据此推测,在东方百合×山丹组(系)间不亲合性杂交育种过程中,可能引起雌蕊与花粉管信号交流异常、物质转运能力减弱和雌蕊耐受逆境能力降低,从而导致杂交不亲和性。
    • 王春伶; 张富铁; 曹文宣; 王剑伟
    • 摘要: 重金属包括镉和铅等污染严重威胁人类健康.为从基因水平研究鱼类应答重金属胁迫的分子机理,本研究利用抑制消减杂交技术构建稀有(鮈)鲫Gobiocypris rarus对镉处理反应的正、反向抑制消减文库.文库质量检测表明消减效率达210倍,通过对正、反向文库中部分表达序列标签进行序列测定,获得9条表达丰度较高的表达序列标签,平均长度为438 bp.利用快速扩增cDNA末端技术克隆获得核糖体蛋白s18(Rps18)基因的完整编码区,序列长度为525 bp,其中编码区459 bp,编码152个氨基酸,3'非翻译区38 bp,5'非翻译区28 bp.并利用实时荧光定量技术对Rps18基因在铅胁迫下的表达谱进行了研究,结果表明稀有(鮈)鲫肝组织中Rps18基因的表达量变化较明显.
    • 魏琦琦; 段经华; 冯延芝; 李芳东; 张琳
    • 摘要: Z. jujube shows some special characters of flowering and fruit bearing. In order to obtain genes involved in blossom development, two suppression subtractive cDNA libraries were constructed using developing blossoms of‘Jinsi No.4’ as tester and leaves as driver. The recombination rates of the SSH libraries from Z. jujube’s flowers and leaves were 92.05% and 90.26%, with the length of inserted fragments ranged from 200 to 2 000 bp, and mainly focusing on 1 000 bp. A total of 1 000 positive clones were randomly selected from the SSH libraries ofZ. jujube’s flowers and leaves respectively for DNA sequencing and assembled. Consequently, 43 contigs, 53 singletons, 73 ORFs, 96 unigenes and 20 annotated sequences were obtained from SSH library ofZ. jujube’s flowers. Forty-ifve contigs, 41 singletons, 70 ORFs, 86 unigenes and 23 annotated sequences were obtained from SSH library ofZ. jujube’s leaves, and the annotated sequences could be divided into six groups.%枣树具有独特的开花结果特性,为获得枣花发育基因,以金丝4号枣不同发育时期的花蕾和同时期的叶片cDNA互为试验方和驱动方,利用抑制消减杂交技术分别构建了枣花和枣叶抑制消减杂交cDNA文库(SSH文库)。枣花和枣叶SSH文库重组率分别是92.05%和90.26%,插入片段长度均介于200~2000 bp之间,主要集中于1000 bp左右。分别从枣花和枣叶SSH文库中随机挑选1000个阳性克隆进行DNA测序、组装拼接,结果显示枣花SSH文库中获得96条unigene,其中contigs 43个,singletons 53个,96条unigene预测得到73个ORF,经过同源比对分析获得有注释的序列20条,按功能分为7类;枣叶SSH文库中获得86条unigene,其中contigs 45个,singletons 41个,86条unigene预测得到70个ORF,经过同源比对分析获得有23条注释的序列,按功能分为6类。
    • 薛浩; 张志宏; 傅俊范; 王丰; 马跃
    • 摘要: 寒富苹果是沈阳农业大学育成的二倍体、抗寒大苹果品种,通过秋水仙素诱导获得寒富苹果同源四倍体在田间表现明显矮化等特性.为了探寻苹果同源四倍化后表型差异的分子机理,采用抑制消减杂交(suppression subtractive hybridization,SSH)技术,分别建立寒富四倍体上调和下调表达cDNA文库.分别从这两个cDNA文库中各随机挑取200个阳性克隆测序,发现其中有211条序列与已知植物基因同源性大于80%,定量RT-PCR验证了部分uniESTs的表达趋势和表达水平.初步筛选获得了与植株矮化相关的BKI1和DWF4基因,与植物光合特性相关的光系统Ⅱ中的关键基因PsbZ;发现了四倍体中表达显著上调的Chitinase基因,推测四倍体可能在真菌病害的胁迫中表现更为优良的抗性.本研究为探究同源多倍体差异表型的分子机理奠定基础.
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