分子遗传标记

摘要： 分子标记技术以其共显性、多态性和准确性等优点已广泛应用于动植物的遗传学研究,常用的分子标记包括以分子杂交为基础的RFLP标记和ISH标记,以简单重复序列为基础的SSR标记、ISSR标记,以PCR为基础的RAPD标记、AFLP标记和InDel标记,以单核苷酸多态性为基础的SNP标记等。这里简单介绍几种常用的分子标记技术。

摘要： 高通量测序技术是研究物种复杂生物性状遗传机制的基础,随着高通量测序技术的不断优化提升,一些与生物表型性状密切相关的基因组变异被精准地挖掘出来,其中包括单核苷酸多态位点(SNP)、小片段的插入或缺失(Indel)、拷贝数变异(CNV)以及结构变异(SV)为代表的分子标记。与传统遗传标记相比较,分子遗传标记具有多态性高、遍布整个基因组、检测手段简单快捷以及成本低廉的特点。通过检测覆盖全基因组范围内的分子标记,利用基因组水平的遗传信息对个体或群体遗传资源进行评估,能够缩短世代间隔、提高选种的准确性,进而在短期内取得较大的遗传进展。作者从高通量测序技术挖掘分子遗传标记角度入手,综述了三代测序技术发展历程和应用领域以及三代分子遗传标记检测技术在蛋鸡种业创新中的应用,并详细阐述了高通量测序技术与分子遗传标记相结合在蛋鸡群体遗传多样性及进化分类、群体遗传图谱的构建和功能基因定位、数量性状形成的遗传机制解析和质量性状形成的遗传机制解析等4个方面的精准应用,以期为蛋鸡基因组选择进入实质应用阶段提供科学依据和指导。

摘要： 本研究旨在应用"中芯一号"家猪分子育种基因芯片了解试验猪群重要经济性状功能基因遗传变异,为选留优秀育种个体提供有效信息.选择影响猪脂肪沉积、肉质、生长、抗病和被毛表型等性状功能基因有效突变位点作为分子遗传选育标记,以野猪、松辽黑母猪及其杂交一代共计106头个体作为实验动物模型,通过"中芯一号"猪分子育种芯片检测,对试验猪不同性状功能基因有效突变位点进行统计分析.结果表明,猪脂肪沉积性状功能基因(SCD和MYH4)有效突变位点在试验猪群中全部是肌内脂肪沉积有利基因型(CC、TT);肉质性状功能基因(PHKG1、PRKAG3和RYR1)有效突变位点,除了21头猪携带有RYR1功能基因有效突变位点对肉质性状不利的等位基因T外(杂合基因型CT),其他个体全部为肉质性状有利基因型(CC、GG、CC);抗病性状功能基因MUC13有效突变位点的抗病有利等位基因纯合基因型(GG)所占比例高于杂合(GA)和不利等位基因纯合基因型(AA);生长性状功能基因(HMGA1、VRTN和CCKAR)有效突变位点检测发现,猪群中没有增加体长趋势的HMGA1突变位点的TT基因型个体,仅有1个杂合体;肋骨数功能基因VRTN有效突变位点T等位基因频率高,对个体的胸椎数有增加趋势;功能基因CCKAR有效突变位点全部是有利于增加采食及日增重的C等位基因纯合基因型;被毛表型性状K IT功能基因有效突变位点在所有检测猪个体呈现出GG基因型,说明研究猪群中不存在影响白色被毛表型的基因突变位点,与试验猪群被毛表型结果一致.以上结果为猪群进一步育种规划提供了有益信息.

摘要： 本试验旨在筛选绵羊高度多态性四碱基微卫星遗传标记,建立适用于绵羊亲子关系鉴定的实验体系.试验以小尾寒羊为主要研究对象,从已有的绵羊参考基因组序列出发,基于全基因组序列筛选法共筛选出53个(ATAG)n四碱基重复微卫星位点,然后通过基因分型数据共筛选出30个扩增效果好、多态信息含量(PIC)丰富的四碱基重复微卫星位点;30个位点的基因分型结果表明,共扩增出253个等位基因,平均等位基因数为8.433,等位基因数均>5,多态信息含量在0.566～0.898,观测杂合度(H o)范围在0.548～0.903,期望杂合度(H e)范围在0.631～0.921,平均期望杂合度为0.776;哈代-温伯格平衡检验30个位点均处于遗传平衡状态.随后根据PCR的扩增效率从获得的30个多态性位点中筛选出22个微卫星位点用于亲权排除概率的计算,根据多态信息含量的大小由高到低依次增加位点数进行组合.结果表明,在两个亲本的基因型均未知的情况下,标记位点数为15个时,累积排除概率可达到99.99％,其中单个位点的第一非亲排除率(non-exclusion probability of the first parent,NE-1P)介于0.321～0.663之间.利用建立的亲子鉴定体系对16只具有系谱记录的小尾寒羊样本进行检测,结果共鉴定出4个具有高置信度的绵羊家系,鉴定结果与系谱记录完全一致.本试验为绵羊分子系谱的构建、亲子鉴定以及保障绵羊育种工作的正常开展奠定重要基础.

摘要： 分子遗传标记技术是以物种突变造成DNA片段长度多态性为基础的,可以直接探测DNA水平差异,不受时间和空间限制,具有标记数量丰富、多态性高的优点.它突破了形态和细胞水平上遗传标记的局限性,发挥着独特的优势,可大大提高育种的效率和准确性.大量研究表明分子遗传标记技术可应用于家畜生长性状相关基因的筛选并进行群体的育种工作.水貂作为一种珍贵的特种经济动物,具有重要的经济价值,当前应用分子遗传标记技术对水貂进行分子育种已成为热点.本文综述了水貂生长性状相关基因的分子遗传标记研究进展,可为分子遗传标记技术在水貂育种中的应用提供参考.

摘要： [目的]本研究建立了林麝标记辅助选择技术体系,为林麝的品系选育提供理论依据.[方法]通过基因克隆研究林麝胰岛素样生长因子(IGF-1)的基本功能和蛋白质结构,采用PCR-SSCP技术检测IGF-1基因在林麝中的多态性,分析其与产仔数的关联效应.[结果]①IGF-1基因序列全长465 bp,编码153个氨基酸残基,经生物信息学分析,发现该蛋白含有15个磷酸化位点,是一个分泌性蛋白,大部分位于细胞膜上,含有Insulin家族典型的保守结构功能域;②本试验设计IGF-1基因的PCR-SSCP扩增片段长度均为300 bp左右,引物扩增片段用10％的聚丙烯酰胺凝胶进行检测,发现扩增片段没有特异性条带.为证明PCR-SSCP扩增结果,选择其中一条引物对所得的毛发样品进行扩增,测序发现所有PCR产物的序列完全一致,没有多态性.[结论]研究表明不能选择1GF-1基因作为林麝的分子遗传标记,但为林麝产香性能的分子遗传标记选育提供了基本思路.

摘要： 背景:人的有氧耐力具有很高的遗传度,随着分子生物技术的发展,通过分子遗传标记的筛选,对基因诊断和预测有氧耐力具有重要的价值.目的:分析耐力运动者白细胞介素6基因单核苷酸多态性位点的分布特征,探讨其是否可以作为分子遗传标记?以及白细胞介素6基因多态性是否与血清白细胞介素6水平存在关联?方法:选取两组研究对象:①耐力组:从事耐力性项目(中、长跑,马拉松,竞走等)至少2年,且运动等级至少二级的北方平原汉族运动员,共78人;②对照组:北京市城区某中学学生(非肥胖或低体质量,12-15岁),共142人,父母及其本人均为北方平原汉族人.运用PCR-RFLP方法对白细胞介素6基因rs1800796(-572C/G)、rs2066992(1430T/G)、rs13306436(4477G/A)3个单核苷酸多态性位点进行等位基因分型;用ELISA法检测血清白细胞介素6水平.结果与结论:①耐力组-572C/G位点基因型分布存在性别差异(P<0.05),但女子耐力组与女子对照组基因型分布相比,P=0.095.其中,女子耐力组CC基因型占61.1％,CG+GG基因型占38.9％;女子对照组CC基因型占43.0％,CG+GG基因型占57.0％;②女子耐力组-572C/G位点CC基因型运动员血清白细胞介素6水平低于女子对照组(P<0.05).另外,耐力组-572C/G位点CC基因型运动员血清白细胞介素6水平有低于对照组的趋势,P=0.070;③结果说明,白细胞介素6基因rs1800796多态性位点是女子耐力运动员的分子遗传标记.白细胞介素6基因rs1800796多态性位点CC基因型女子运动员血清白细胞介素6水平低于女子对照组.白细胞介素6基因rs1800796、rs2066992、rs13306436位点不能作为男性运动员的遗传分子标记,可能与样本量不够大有关,尚需进一步的研究.

摘要： 根结线虫是大豆上的主要病原之一,能够导致严重的经济损失.常见的4种根结线虫(南方根结线虫、北方根结线虫、爪哇根结线虫和花生根结线虫)都能侵染大豆.寄主抗性是最经济有效的防治方法,而利用分子遗传标记是加速培育多抗品种的重要策略,因此本综述详细介绍了目前大豆根结线虫的分子遗传标记研究进展.

摘要： 随着分子生物学技术的迅猛发展，涌现出一批高效、可靠的DNA分子标记技术。DNA分子标记是指能够反映生物个体或种群间基因组中某种差异的特异性DNA片段，是DNA水平上遗传多态性的直接反映，是生物分类学、育种学、遗传学和物种起源与进化等研究的重要技术指标之一。本文论述了限制性片段长度多态性、随机扩增多态性、扩增片段长度多态性、微卫星DNA和单核苷酸多态性等技术的基本原理及技术特点，介绍了常用的分子遗传标记在畜禽遗传图谱的构建、数量性状座位的定位、标记辅助选择、群体遗传多样性评估、品种鉴定等研究领域的应用情况。这些分子遗传标记的发展，为畜禽遗传育种以及品种改良过程中的一系列传统技术方法所无法解决的问题，提供了新思路，开创了新途径，大大提高了育种工作效率。本文还对这些标记在峪口禽业公司蛋鸡育种中的实际应用进行分析并探讨了今后分子育种主要研究和应用前景。

摘要： 本文概述了当前几种重要的分子遗传标记在书虱研究中的应用。这些分子遗传标记的应用，极大地提高了书虱分类鉴定的精确性，使得书虱的系统发育建立在了坚实的分子数据基础之上。同时，这些分子遗传标记的应用也促进了书虱种群遗传结构的研究，使得更精细地分析不同种群以及同一种群不同个体之间的遗传多样性成为可能。而DNA分子遗传标记由于研究成本较高、数据统计分析不完善以及书虱个体小等因素的限制，目前，在书虱研究中应用的还不是很多。当然，这些分子遗传标记并非十全十美，每一种研究方法在应用时都不可避免地会出现其技术本身的不足之处。因此，在书虱研究中，可根据所针对的问题，本着简单、经济、可靠的原则，合理选择合适的分子遗传标记。

摘要： 急性髓系白血病是成人最常见的急性白血病,大多数病人死于疾病复发.尽管过去的40年来已经找到多个与AML相关的发病基因,但是近来在基因组范围及候补基因领域的研究已经证明在AML患者的生物学特性、临床以及治疗重要性方面有重复出现的体细胞突变存在.鉴于此,我们回顾了当前对于AML的分子机制的研究进展,讨论了突变分析如何对AML预后产生影响并提示治疗方式的选择.我们也回顾了当前临床模式下转基因研究面临的巨大挑战和紧迫任务.

摘要： 本文旨在论述狮棘球绦虫的分子遗传标记特征,种地位的确立,种系发生,鉴定方法,宿主范围,地理分布,流行病学特征及未来研究方向等,为从事该领域研究的学者和临床工作者提供背景知识,并对棘球蚴病的临床流行病学调查和防治工作提供依据和指导.

摘要： 蜜蜂白垩病(chalkbrood disease)是由蜜蜂球囊菌(Ascosphaera apis)引起的蜜蜂幼虫死亡的真菌性疾病,该病已蔓延至世界各地并且发生率仍在上升.因此,抗白垩病机制的研究和抗白垩病蜂种的培育显得十分紧迫,而掌握蜜蜂抗白垩病的机制是成功培育抗白垩病蜂种的前提条件.本文综述了国内外白垩病研究和蜜蜂抗白垩病机制研究的最新进展,尤其对从分子水平研究蜜蜂的抗白垩病机制的重大意义进行了阐述,为利用分子遗传标记辅助选育和生物工程技术并结合传统的育种手段培育具有抗白垩病性能的优良蜜蜂品种(系)奠定基础.

摘要： 滞育期蚕卵取样方便，不需前期处理，直接提取DNA的方法未见相关报道。本研究利用改良SDS法快速高效地从处于滞育期的家蚕蚕卵中获得到较为完整、纯度较高的DNA。适合满足分子遗传标记分析要求，也为其他物种昆虫卵基因组DNA的提取摸索出了一条方法。

摘要： 目的:为了建立小尾寒羊高繁品系，检测BMPR-I B基因的多态性，分析FecB基因基因型频率和产羔数的关系，rn 方法:本文选取小尾寒羊为研究对象，运用PCR-RFLP方法，分析BMPR-IB基因突变位点。rn 结果:样品群中BB、B+和++基因型比例分别为25.45％，54.46％和20.09％;每胎次平均产羔数分别为3.01只，2.81只和2.16只。rn 结论:FecB基因可以作为小尾寒羊多胎性选育的分子遗传标记，FecB基因能够有效的提高小尾寒羊个体平均产羔数，对产羔数影响呈加性作用。

摘要： 在天府肉羊育种过程中，通过采用传统育种方法和分子标记辅助选择育种技术有机结合，利用分子标记与生产性能的关联分析进行早期选择，缩短了世代间隔，加快了遗传进展，取得了良好的效果。本文对微卫星标记在种群鉴定中的应用进行介绍，简述了经济性状的分子遗传标记研究情况。随着分子遗传育种学的发展，第3代高通量DNA测序技术已将逐步普及，这将大大提高SNP位点的检出率，并有利于准确地找出控制生产性状的SNPs位点，这对促进天府肉羊的进一步育种具有重要价值。

摘要： 目的:建立太子参的SCAR标记,为太子参分子鉴定提供科学依据.方法:用随机引物进行RAPD筛选,获取特异的RAPD标记条带,分离提取RAPD标记条带,进行测序,根据测定RAPD标记条带的两端序列设计1对特异引物进行常规PCR反应,获得SCA标记.结果:根据RAPD标记条带的序列设计筛选了1对特异引物,分别对15个来自不同产地的太子参样本和7个混伪品的DNA进行SCAR扩增,太子参均能扩增出1条相应于RAPD标记的特异性条带,而混伪品均不能扩增出此条带.结论:建立RAPD-SCAR标记,可作为太子参与混伪品分子鉴定的依据.

摘要： 本发明公开了一组高效能常染色体微单倍型遗传标记以及用于检测该组遗传标记的引物组。本发明提供了一种引物组，由398种引物组成；引物为单链DNA分子；398种引物的核苷酸序列依次如序列表的序列1至序列398所示。本发明还保护所述引物组在制备法医鉴定试剂盒中的应用。本发明还保护所述引物组在制备亲缘关系鉴定试剂盒中的应用。本发明中，发明人筛选得到了301个在千人基因组数据中Ae达到4以上的候选微单倍型。针对这301个候选基因座设计特异性引物，复合成了一套高分辨率微单倍型基因座多重检测体系。该体系共包含199个常染色体微单倍型。利用Miseq FGx平台检测得到两个样本的199个基因座均具有良好的均衡性。本发明对于法医鉴定和亲缘关系鉴定具有重大的应用推广价值。

摘要： 本发明属于分子生物学和遗传学领域，具体公开了一种群体区分和鉴定的遗传标记参照系的构建方法及遗传标记参照系。所述构建方法包括对遗传标记数据进行数据分割和遗传标记挑选，或视情况对分割后的数据进行过滤，或对挑选后的遗传标记进行整合优化。采用本发明所述的方法可成功地使计算的复杂度从O(2

摘要： 本发明公开了用于开发遗传标记的成套试剂和高通量测序开发遗传标记的方法。本发明所提供的用于开发遗传标记的成套试剂，由接头A、接头B和限制性内切酶BcoDI组成，所述接头A由序列1所示的单链DNA和序列2所示的单链DNA组成，所述接头B由序列3所示的单链DNA和序列4所示的单链DNA组成。实验证明，本发明提供的用于高通量测序的成套试剂中的接头A和接头B，能够连接到DNA片段的两端，运用本发明的用于高通量测序的成套试剂以及建库方法，成功的构建了DNA文库，并成功的运用在Illumina公司的二代测序的测序平台进行测序，获得大量的遗传标记位点。

摘要： 一种利用核苷酸多态性分子遗传标记对鹅羽色进行选择的方法，属于家禽育种技术领域，利用提供的试剂盒进行聚合酶链式反应(PCR)并检测产物，将PCR产物测序并判定基因型，利用对育种鹅群体每个个体在标记基因多态性位点的测定，依据多态性位点的基因型，挑选出合格的个体用于组建育种群，从而使育种鹅群在羽色上几乎一致，根据该位点基因型判别羽色的准确率达到100%，在该位点完全纯合而不含有另一等位基因，排除了在繁育后代中再出现该位点等位基因杂合的现象，相对于传统的表型选择方法，本发明在鹅羽色选择时准确率显著提高，明显加快了育种进程，显著减少育种成本，极大提高育种公司在鹅育种方面的竞争力和经济效益。

摘要： 本发明公开了一种鸡步行数性状的分子遗传标记，所述分子遗传标记为皖南三黄鸡的ANKRD2基因外显子8的2477位点SNP，本发明利用现代生物技术，通过转录组、候选基因分析，发现ANKRD2基因外显子8的2477位点SNP与皖南三黄鸡步行数显著关联，可作为鸡运动量的分子遗传标记，用于运动量性状分子标记辅助选择，可大大提高对鸡运动量性状的选择效率。

摘要： 本发明涉及分子标记技术领域，特别涉及一种与公猪精子活力相关的分子遗传标记及其应用和获取方法，本发明提的与公猪精子活力相关分子遗传标记位于猪的17号染色体8482542bp位置，为一个CT突变；本申请的分子标记通过一步法全基因组关联分析(wssGWAS)获得；该方法简单、高效、快速。

摘要： 本发明涉及分子标记技术领域，特别涉及与公猪精子畸形率相关的分子遗传标记及其应用和获取方法，本发明的公猪精子畸形率相关分子遗传标记位于猪的第3号染色体的第8647231bp位置，为一个TC突变；本申请的分子标记通过一步法全基因组关联分析(wssGWAS)获得；该方法简单、高效、快速。

摘要： 本发明涉及分子标记技术领域，特别涉及与公猪精子直线运动相关的分子遗传标记及其应用和获取方法，本发明通过全基因组关联分析(wssGWAS)分析法对公猪精子的直线运动性状进行分析，获得关于公猪精子直线运动相关分子遗传标记3个，分别位于猪的15号染色体136112947bp位置，为一个TC突变；猪第3号染色体的第18505448bp位置，为一个AG突变；猪第11号染色体的第63272581bp位置，为一个CT突变；利用本方法分析与公猪精子直线运动能力简单、高效、快速。

摘要： 本发明属于法医学新技术创新研究应用领域，具体涉及公开一种基于二代测序平台检测多种分子遗传标记的复合扩增体系。本发明基于HGDP‑CPEH数据库筛选用于不同洲际和国内群体法医学始祖推断分析的48个AISNP位点；基于千人基因组计划筛选在国内群体中具有较高多态性分布的18个多等位基因InDel位点；基于既往的研究报道筛选在国内群体中具有较高应用价值的27个微单倍型；选择用于男性个体单倍群分布研究的34个Y‑SNP位点和2个Y‑InDel；基于二代测序平台，采用多重PCR的方法实现以上多种遗传标记的同步扩增检测分析。本发明可针对一份现场物证检材，同时实现法医学的个体识别、亲缘关系鉴识、混合样本解晰、法医学始祖分析以及男性个体单倍群分布研究，可为法医学应用研究提供更全面、更有价值的生物信息。

摘要： 本发明涉及一种猪分子遗传标记用的采集装置，包括取样台和刀片容纳槽，所述取样台的上方设有第二套筒，所述第二套筒内设有纵向移动的切割机构，所述切割机构包括第二纵向移动组件和第二滑块，所述第二滑块通过第二纵向移动组件实现纵向移动，所述第二滑块的下方设有连接块，所述连接块的下端设有切割组件，所述切割组件包括环形刀片，且环形刀片与刀片容纳槽同轴心设置。本发明通过在连接块上设置可拆卸的环形刀片以及环形海绵体，并对环形海绵体的中下部浸上聚维硐碘杀菌消毒液，在环形海绵体的中上部浸上明胶复方止血液，从而能够保证环形刀片在进行取样后，环形海绵体能够先后对猪耳朵切割伤口处进行杀菌消毒、止血上药。