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代谢组

代谢组的相关文献在2004年到2022年内共计664篇,主要集中在园艺、植物学、农作物 等领域,其中期刊论文185篇、会议论文4篇、专利文献126406篇;相关期刊136种,包括生物工程学报、西北植物学报、中华实用儿科临床杂志等; 相关会议4种,包括中国医学科学院/北京协和医学院医学信息研究所/图书馆2014年学术年会、第十届全国生物医药色谱及相关技术学术交流会、中国植物病理学会化学防治专业委员会第九届中国植物病害化学防治学术研讨会等;代谢组的相关文献由2094位作者贡献,包括许国旺、路鑫、周会娜等。

代谢组—发文量

期刊论文>

论文:185 占比:0.15%

会议论文>

论文:4 占比:0.00%

专利文献>

论文:126406 占比:99.85%

总计:126595篇

代谢组—发文趋势图

代谢组

-研究学者

  • 许国旺
  • 路鑫
  • 周会娜
  • 金立锋
  • 陈霞
  • 刘萍萍
  • 翟妞
  • 赵春霞
  • 赵燕妮
  • 陈千思
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利文献

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作者

    • 陈赛娟
    • 摘要: 信息化时代,各类信息数据海量增长,对医学来说也不例外。当今世界正处在以海量真实世界数据为基础的循证医学时代,医院诊疗数据和病理及影像等数据正在以惊人的速度增长。此外,包括基因组、表观基因组、蛋白组和代谢组在内的组学技术迅猛发展,促使生物医学领域快速进入“大数据”时代。
    • 何炎森; 李瑞美; 李和平
    • 摘要: 为了解乙烯诱导水仙(Narcissus tazetta var.chinensis)成花的生理和分子机制,利用代谢组和转录组测序技术,筛选乙烯诱导水仙成花的差异表达代谢物和基因。结果表明,乙烯处理的侧芽检测到12个差异表达代谢物(DEM),包括7个上调,5个下调,其中,(±)7-表茉莉酸、多巴胺、亚精胺可能与乙烯诱导水仙成花正相关,而吲哚及其衍生物呈负相关。转录组共获得1021个差异表达基因(DEG),包括615个上调,406个下调,在DEG中鉴定筛选了45个与乙烯信号传导和开花相关的差异表达基因。乙烯诱导水仙成花启动可能先激活水仙鳞茎内源植物激素(尤其乙烯)信号通路的变化,与开花促进基因FPF1和MADS15的上调表达密切相关。9个基因的qRT-PCR结果验证了RNA-Seq的正确性。这些差异表达的代谢物和基因在水仙成花启动过程中可能具有重要作用。
    • 贾宇尧; 王超; 石倩倩; 韩刚
    • 摘要: 为了解陕北3个主栽枣品种(清涧木枣、佳县油枣和延川狗头枣)果实的代谢物质差异,以期为枣果品质分析及功能研究提供参考。采用超高效液相色谱-串联质谱的广泛靶向代谢组学技术结合多元统计分析,测定并比较3个枣品种果实的代谢物。结果表明,3个枣品种中共鉴定出15类462种代谢物,各品种间代谢物的含量差异显著。佳县油枣相比清涧木枣存在36种差异代谢物,而延川狗头枣相比清涧木枣、佳县油枣分别存在193、204种差异代谢物。差异代谢物KEGG通路富集分析发现,氨基酸代谢途径与苯丙素类生物合成途径在延川狗头枣中更活跃,但类黄酮生物合成途径则在清涧木枣、佳县油枣中更旺盛,从而使延川狗头枣积累更多的色氨酸、苯丙氨酸、酪氨酸、组氨酸、缬氨酸、苏氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、芥子酸、对香豆酸、肉桂酸及紫丁香苷等氨基酸及酚酸类物质,而清涧木枣和佳县油枣则积累了更多的杨梅苷、黄芪苷、香橙素、柚皮素查耳酮及紫铆素等黄酮类代谢物。从代谢层面发现清涧木枣与佳县油枣具有更近的亲缘关系,而与延川狗头枣关系更远;清涧木枣与佳县油枣药用价值更高,而延川狗头枣营养与口味更突出。
    • 吕馨宁; 王玥; 贾润普; 王胜男; 姚玉新
    • 摘要: 【目的】冷藏是提高葡萄耐储性、延长货架期的有效方法,但低温会降低糖酸和香气含量等果实品质。本研究旨在测定不同温度条件下褪黑素处理对‘阳光玫瑰’葡萄储藏期品质的影响,并探讨其调控储藏品质的代谢基础。【方法】设置室温和1°C两个储藏温度,葡萄采后利用5和50μmol·L^(-1)褪黑素浸果,于不同储藏期取样测定果实品质指标。利用HPLC-MS测定褪黑素含量,利用GC-MS测定香气组分及含量,利用毛细管电泳测定可溶性糖和有机酸含量,利用质构仪测定果实质地,利用广靶代谢组学分析褪黑素处理导致的差异代谢物。【结果】外源褪黑素处理能显著提高葡萄果实褪黑素含量;50μmol·L^(-1)处理效果显著高于5μmol·L^(-1),并且低温能大幅提高褪黑素处理效果,低温、50 mol·L^(-1)褪黑素处理的果实中褪黑素含量为室温同浓度处理的2.6倍。低温下,果实失水率降低;在室温和低温储藏下,褪黑素对果实失水率、果皮硬度和果肉硬度未产生显著影响。室温条件下,5μmol·L^(-1)褪黑素处理显著提高了葡萄糖和果糖含量,而50μmol·L^(-1)褪黑素产生了相反的结果。与室温储藏相比,低温储藏显著降低了果实糖含量;低温条件下,与对照相比,5μmol·L^(-1)和50μmol·L^(-1)褪黑素处理均显著提高了可溶性糖含量,储藏40 d时增幅在19.2%以上。与室温相比,低温提高了可滴定酸尤其是苹果酸含量。低温条件下,两种浓度褪黑素处理较对照显著降低了可滴定酸尤其是苹果酸含量,苹果酸含量降幅超过53.5%,对酒石酸含量影响较小。与室温储藏相比,低温储藏大幅度降低了未经褪黑素处理的果实香气含量。但是,褪黑素处理能有效增加低温条件下果实香气总量及香气组分含量,且以5μmol·L^(-1)褪黑素处理效果较好,在处理后30和40 d,较低温对照香气总量增幅分别达2.12和1.6倍;同时显著增加了反式-2-己烯醛、里那醇、2,4-二叔丁基苯酚等特征香气含量。低温下对照和5μmol·L^(-1)褪黑素处理的果实代谢组学分析表明,232种代谢物含量存在差异,涉及的主要代谢途径包括氨基酸生化合成、氨酰基-tRNA生化合成、精氨酸生化合成、丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢及苯丙胺代谢。【结论】与室温储藏相比,低温冷藏降低了部分糖和绝大多数香气物质的含量。褪黑素处理能够显著提高冷藏果实的可溶性糖含量,降低有机酸水平,大幅提高香气水平,能有效提高果实品质,其中5μmol·L^(-1)褪黑素处理效果更明显。褪黑素主要通过影响氨基酸代谢提高香气含量。
    • 李武峰; 关家伟; 邱丽霞; 孙瑜彤; 杜敏
    • 摘要: 旨在基于转录组与代谢组联合分析,探究驴肉嫩度的分子调控机制。本研究以30头生长环境和饲养条件相同、33~36月龄的雌性广灵驴为研究对象,进行剪切力和肌内脂肪含量的测定。依据剪切力和肌内脂肪含量选择出8头驴并将其分为高嫩度组(HT,n=4)与低嫩度组(LT,n=4),通过转录组和代谢组分析筛选差异表达基因和差异代谢物,之后联合KEGG富集分析,构建相关网络互作图。转录组结果表明,在HT组和LT组中共发现有1253个差异表达基因,其中832个基因上调,421个基因下调。KEGG分析表明,差异表达基因主要富集在碳水化合物代谢、脂质代谢、内分泌系统、信号转导以及细胞过程等多种途径;代谢组结果表明,在HT组和LT组中鉴定出225个差异代谢物,其中上调的有154个,下调的有71个。KEGG通路分析表明,差异代谢物主要富集到碳水化合物代谢、脂质代谢、氨基酸代谢、核苷酸代谢以及信号转导等多个途径;联合分析表明,差异表达基因与差异代谢物显著富集在甘油磷脂代谢,磷酸戊糖途径,丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢,精氨酸和脯氨酸代谢以及胰高血糖素信号通路中。显著差异表达基因和代谢物在上述代谢通路中起到了关键调控作用,可作为驴肉嫩度的潜在候选基因及代谢物,为今后探究驴肉嫩度的分子调控机制和驴肉分子育种提供理论基础。
    • 胡媛; 吴蓓; 易达; 陈鸿平; 杨放晴; 王福; 刘友平
    • 摘要: 采用广泛靶向代谢组学技术与高通量测序技术探究广陈皮共存微生物对次生代谢产物的影响规律,为广陈皮的陈化机制提供科学依据。运用Waters ACQUITY UPLC HSS T3 C_(18)色谱柱(1.8μm,2.1 mm×100 mm),流动相0.04%乙酸水溶液-乙腈梯度洗脱,流速0.4 mL/min,选择电喷雾离子源在正、负离子模式下进行采集检测;采用CTAB法对口腔拭子样品进行DNA提取,建库试剂盒进行文库构建,构建好的文库经Qubit和Q-PCR定量,使用HiSeq 2500 PE250进行上机测序;对代谢组检测出的差异代谢物和高通量测序比对出的差异微生物进行相关性分析。结果表明共鉴定出386种次生代谢产物,包括酚酸类79种,黄酮类143种,蒽醌类4种,木脂素与香豆素17种,鞣质3种,生物碱47种,萜类6种,其他类87种。主成分分析(PCA)与热图分析(Heatmap)结果表明贮藏1年与贮藏3年样品次生代谢物含量存在明显差异,可明显区分,共筛选出79种差异代谢物;高通量测序基因序列与微生物参考数据库进行比对可得到共58个属,贮藏1年与贮藏3年样品微生物菌落结构相似,但相对丰度与优势菌属不同。差异代谢物与差异微生物关联分析表明,青霉属、曲霉属、耐干霉菌等优势真菌可显著影响广陈皮中黄酮类成分以及有香味化合物含量。广陈皮在陈化过程中优势微生物菌落结构的改变导致药材活性成分以及香气成分含量的变化可能是其陈化机制之一。
    • 陈睿; 杜国英; 管晓伟; 陈念慈; 曹敏; 茅云翔; 王冬梅
    • 摘要: 为探究坛紫菜响应失水胁迫的机制,以坛紫菜(Pyropia haitanensis)为研究对象,采用超高效液相色谱-串联四级杆质谱(UPLC-MS/MS)技术分析了坛紫菜叶状体在失水/复水胁迫下的代谢组学变化。在坛紫菜提取物中检测和鉴定到了大量代谢物(已知的有206种)。利用Analyst 1.6.1软件对原始质谱数据进行采集,通过偏最小二乘判别分析法(PLS-DA)分析主成分,寻找差异代谢物。本研究发现坛紫菜失水组与正常对照组的代谢组间共有58种差异代谢物,失水条件下有38种上调,20种下调,主要包括一些氨基酸类及氨基酸衍生物、苯丙素类、甘油磷脂、核苷酸及其衍生物、黄酮类及类黄酮类、还有植物激素;富集到3条代谢通路,分别是氨酰-tRNA生物合成、嘌呤代谢以及半胱氨酸和蛋氨酸代谢通路。具有抗氧化能力的黄酮类物质、渗透保护因子脯氨酸和甜菜碱在叶状体失水时含量均升高,这表明它们在坛紫菜响应失水逆境中起重要的作用。坛紫菜失水组与复水组组间也存在较大代谢物差异,共筛选出50种差异代谢物,复水后有30种上调,20种下调,主要包括儿茶素及其衍生物、甘油磷脂、黄酮类、脂肪酸、萜类、氨基酸衍生物、苯丙素类以及植物激素类;富集到5条代谢通路,包括:半胱氨酸/蛋氨酸代谢、甘氨酸/丝氨酸/苏氨酸的代谢、D-丙氨酸代谢、氨酰-tRNA生物合成和ABC转运通路。坛紫菜复水组与对照组的组间有42种差异代谢物。与对照组相比,复水组有31种代谢物上调和11种下调,主要包括氨基酸类及氨基酸衍生物、儿茶素衍生物、黄酮类、苯丙素类、萜类和脂肪酸等,仅富集到半胱氨酸和蛋氨酸代谢这一条代谢通路。多种代谢物的变化说明坛紫菜中有多种响应胁迫的策略来使其适应生存环境。
    • 魏睿元; 赵一萍; 白东义; 韩海格; 王希生; 阿娜尔; 乌英嘎; 芒来; 李旭东
    • 摘要: 旨在应用核磁共振(^(1)H-NMR)技术研究蒙古马耐力训练前后血浆代谢组变化特征。本研究选取6匹去势蒙古马:年龄(5.33±0.82)岁、体高(136.83±0.75)cm、体长(143.33±2.58)cm、胸围(157.17±2.04)cm、管围(18.45±0.27)cm,进行15及30 km步法为快步的耐力运动训练,采集其训练前后共计24份血液样本。采用氢质子共振频率600.13 MHz的Bruker AV III核磁共振谱仪测定血浆代谢物谱图信息。通过R语言偏最小二乘判别(PLS-DA)程序包及SPSS 20.0软件一维方差分析检验,鉴别组间代谢模式及差异代谢标志物。结果表明,在蒙古马15和30 km两次运动前后血浆代谢物中共发现47种差异代谢物,其中15 km运动前后鉴定出21个差异代谢物,运动后发现乙醇、甘露糖下降,葡萄糖、乙酰乙酸、丙酮酸、乳酸、肌酐、甘油、缬氨酸、丙氨酸、亮氨酸、酪氨酸、苯丙氨酸、苏氨酸、异丁酸、蛋氨酸、2-羟基异丁酸、O-乙酰肉碱、3-羟基异丁酸、3-甲基-2-氧代戊酸、3-羟基异戊酸升高。30 km运动前后鉴定出10个差异代谢物,运动后发现乙醇、葡萄糖、赖氨酸、甘氨酸、脯氨酸、谷氨酰胺、τ-甲基组氨酸、缬氨酸下降,甲醇、肌酸升高。对15与30 km运动后进行比较发现,丙氨酸、柠檬酸、乙酸、赖氨酸、丙二酸、丙酮、2-羟基异戊酸、2-羟基异丁酸、泛酸、甜菜碱、异丁酸下降,乳酸、二甲基砜、丙酮酸、N-苯乙酰甘氨酸、马尿酸盐、甲醇、3-羟基异戊酸升高。在蒙古马15和30 km两次运动前后血浆代谢物中共发现47种差异代谢物,且两次运动前后的差异代谢物类别存在明显不同。蒙古马30 km负荷以脂肪酸有氧代谢为主方式供能,而15 km负荷以糖酵解无氧代谢为主的方式供能,酮体代谢是能量供应模式转换的过渡性阶段。本研究结果为我国耐力型运动马的训练及选育工作提供了理论依据。
    • 陈宇红; 蒋学飞; 苏滢; 王茂林
    • 摘要: 为了探究寄主根系分泌物中对根肿菌休眠孢子萌发具有重要作用的代谢物,本研究首先测试了甘蓝型油菜不同根肿病抗性材料的根系分泌物对休眠孢子萌发的诱导能力,发现易感材料根系分泌物处理组的萌发率显著高于抗性材料处理组.进一步采用非靶向液相色谱-质谱联用代谢物分析法检测了抗病材料和易感材料的根系分泌物,在负离子(ESI-)模式下鉴定出次级代谢产物1079个,在正离子(ESI+)模式下鉴定出次级代谢产物1257个,其中差异代谢物分别为662和722个.选取部分差异较大的代谢物进行验证,结果表明,胸腺嘧啶,2′-脱氧尿苷,L-异亮氨酸,葫芦巴碱,磷酸吡哆醛,香豆素,D-来苏糖和穗花杉双黄酮等对休眠孢子萌发具有显著促进作用,继而影响根肿病的发生.
    • 赵玮; 赵利; 张建平; 齐燕妮; 王利民; 谢亚萍; 李闻娟; 党照; 袁明璐; 张艳萍
    • 摘要: 通过“广靶代谢组+转录组”联合分析方法,对NaCl胁迫下胡麻(Linure usitatissmum)耐盐种质资源R40和敏感资源R24根部差异表达基因与差异积累代谢物进行共表达分析,以探明代谢物与关键基因的协同变化情况,阐明胡麻的耐盐代谢过程和变化规律,发掘胡麻中可能调控抗盐代谢途径的重要基因。共鉴定出具有显著差异的代谢物741个,其中下调409个,上调332个,鉴定出差异表达基因30233条,其中上调15827条,下调14406条,有注释结果的转录因子13015个。富集前十的代谢物几乎都有相对应的功能转录因子富集,如黄酮和黄酮醇的生物合成、苯丙素的生物合成、氨基糖和核苷酸糖的代谢、花青素生物合成、类黄酮生物合成等通路均有对应的转录因子参与其中。胡麻根部在盐胁迫下调控抗盐代谢途径的重要基因主要以参与调控糖类代谢为主,增强细胞的渗透压,从而有效降低盐碱胁迫的伤害;筛选出的8个候选基因与5个代谢物具有明显的相关性,每一个代谢物与一个或多个基因相关联,色氨酸–生长素通路发现,GH3基因是一种典型的与植物生长素原初反应相关的基因,在植物的抗逆防卫反应中起重要作用。
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