微生物群

摘要： 背景 随着高通量测序技术的发展,研究者们发现下呼吸道有大量微生物菌群定植.研究显示,吸烟对下呼吸道微生物菌群结构及组成有显著影响,且其变化可能与肺部疾病有关,但其具体机制尚不清楚.目的 通过痰液微生物高通量测序技术分析吸烟对下呼吸道微生物菌群结构的影响,以预测其对机体生命活动的影响.方法 选取2018年10月至2019年10月于内蒙古自治区人民医院健康体检中心招募的志愿者55例为研究对象.按照吸烟情况,将研究对象分为吸烟组(22例)和不吸烟组(33例).采用高通量测序技术分析痰液微生物,分析吸烟对微生物丰度与菌群结构组成的影响、吸烟对微生物菌群结构的影响、差异微生物间的相关性及预测差异微生物的功能.结果 吸烟组Shannon指数高于不吸烟组,Simpson指数低于不吸烟组(P<0.05).Adonis检验及主成分分析(PCA)结果显示,吸烟组与不吸烟组β多样性指数比较,差异有统计学意义(P<0.05).韦恩图分析结果显示,吸烟组和不吸烟组共有菌群1146个,不吸烟组独有菌群1080个,吸烟组独有菌群841个.在纲水平上,按照菌群相对丰度降序排列,差异菌群前5位分别是芽孢杆菌纲(Bacilli)、拟杆菌纲(Bacteroidia)、梭杆菌纲(Fusobacteria)、β-变形菌纲(Betaproteobacteria)、γ-变形菌纲(Gammaproteobacteria).纲水平微生物在吸烟组中的优势菌群为:Bacilli、Bacteroidia、Fusobacteriia.在属水平上,按照菌群相对丰度降序排列,差异菌群前5位分别是链球菌属(Streptococcus)、普雷沃氏菌属(Prevotella)、卟啉单胞菌属(Porphyromonas)、拟普雷沃氏菌属(Alloprevotella)、奈瑟菌属(Neisseria).属水平微生物在吸烟组中的优势菌群为:Streptococcus、Prevotella、Porphyromonas.吸烟组和不吸烟组下呼吸道共有1纲、2目、1科、8属及8种差异微生物.其中吸烟组增加的菌群为Selenomonadales目、巨球型菌属(Megasphaera)、Faucicola属、Sphaerochaeta属、Shuttleworthia属、Anaeroglobus属、 巨球形菌(Megasphaera micronuciformis)、Spirochaeta canine oral taxon 379、未分类的普氏菌(Uncultured Prevotella)、Prevotella sp.oral clone FW035;不吸烟组增加的菌群为鞘脂杆菌纲(Sphingobacteriia)、鞘脂杆菌目(Sphingobacteriales)、噬几丁质科(Chitinophagaceae)、伯克霍尔德菌(Burkholderia)、弧菌属(Vibrionimonas)、罗尔斯通氏菌属(Ralstonia)、真口腔普雷沃氏菌(Prevotella veroralis)、Catonella sp.oral clone FL037、噬淀粉密螺旋体(Treponema amylovorum)、咽峡炎链球菌(Streptococcus anginosus).吸烟组和不吸烟组的差异微生物(属水平)间均呈正相关(r≥0.6).吸烟组和不吸烟组主要在物质合成、降解和运输相关通路上存在差异.吸烟组功能富集的生命活动包括:安沙霉素类生物合成、赖氨酸生物合成、戊糖和葡萄糖醛酸的相互转化、泛酸盐和辅酶A生物合成、蛋白运输等;不吸烟组主要富集的生命活动包括:甲苯降解、霍乱弧菌致病循环、柠檬烯和蒎烯降解、光合作用、二噁英降解等.结论 吸烟能够增加下呼吸道微生物菌群相对丰度,影响微生物菌群结构组成,改变相关物质合成、降解和运输通路,吸烟暴露下下呼吸道微生物组的功能改变可能会影响宿主的内环境稳态,打破体内免疫系统的平衡,从而引发肺部疾病.

摘要： 如何祛除“老人味”?康医生:我母亲快80岁了,她每次走近我们的身边,我们总能闻到一种特殊的味道,这种味道就是大家常说的“老人味”。请问,“老人味”是如何产生的?能祛除吗?江苏省陈先生陈先生:您好!人体的气味是由多种因素造成的,除了汗腺分泌出汗味,身体表面的微生物群如细菌、真菌等也能分解产生气味。科学研究发现,“老人味”出现的罪魁祸首是一种叫做“2-壬烯醛”的物质,这种物质具有“特殊气味”。从40岁左右起,人们的身体气味开始含有较高浓度的“2-壬烯醛”。“2-壬烯醛”的分泌量会随着人体的衰老而逐渐增加。

摘要： 目的:描述规律成簇的间隔短回文重复(Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats,CRISPR)领域技术演化,揭示微生物群基因编辑技术的演进路线,对其技术发展进行深层分析,以期为相关领域的研究人员提供决策参考。方法:计算机检索PubMed和Embase数据库截至2021年5月30日收录的相关文献,筛选微生物群基因编辑技术相关研究。结果:初步检索902篇文献,最终44篇符合纳入标准;研究显示CRISPR技术演进方向主要包括特异性、适应性和多样性,其中60.81%涉及多样性研究、28.38%涉及适应性研究、10.81%涉及特异性研究;围绕基因编辑技术整体研究重点不一,以辅助系统的多样性技术为主。结论:下一代测序技术及人工智能、大数据的发展助力微生物群基因编辑技术研究趋向多元化与细致化,并为其提供了新方向。

摘要： 肠易激综合征(IBS)是一种功能性疾病,由于社会节奏的增快、生活和工作压力的增加,其发病率也在逐年上升。IBS发病机制尚不清楚,病情易反复,治疗上多属于对症治疗,对人们的生活、心理以及经济都造成了巨大影响。随着人们对肠易激综合征的深入研究,发现肠道菌群失衡中小肠细菌过度生长可能对肠易激综合征尤其是腹泻型肠易激综合征的发病扮演了重要角色。因此检测小肠细菌过度生长为研究肠易激综合征的肠道菌群失衡、以及通过调节肠道菌群来治疗肠易激综合征提供了新的方式。氢呼气试验作为一种无创、方便的检测小肠细菌过度生长的方式受到临床的广泛应用。本文就小肠细菌过度生长和肠易激综合征的关系、小肠细菌过度生长的检测方法氢呼气试验的应用做一综述。

摘要： 征文范围:微生物群与人体健康、微生物感染与免疫、感染控制、新再现传染病病原、微生物鉴定与检测、微生物流行病学、微生物耐药性、机体主动与被动免疫、微生物分类、微生物进化、微生物基因组学与生物信息学、免疫诊断与免疫学技术、教学经验与改革实践等领域内的研究新进展和新技术,以及教学改革方面的内容。

摘要： 卵巢癌致死率极高,但发病机制尚不清楚。近年随着高通量测序技术的发展,女性生殖道和肠道微生物在卵巢癌方面的研究已成为热点。研究发现,在卵巢癌中,上、下生殖道优势菌群厚壁杆菌丰度降低,拟杆菌数量增多,肠道菌群频繁失调。其可能通过自身成分和代谢产物引起致癌反应、升高循环中的雌激素水平、促进卵巢癌发生,介导炎症反应影响免疫调节,在卵巢癌的发生发展中起重要作用。此外,女性生殖道和肠道微生物群还参与卵巢癌的治疗过程,与耐药和疗效密切相关。其中,粪菌移植、益生菌补充及抗生素的应用已得到初步探索。综述女性生殖道和肠道微生物群结构、与卵巢癌的相关性以及临床治疗研究,旨在为卵巢癌的筛查、治疗及预防提供新的方向和策略。

摘要： 既耗氧又能产氧的古菌氨氧化古菌(Ammonia-oxidizing archaea)是海洋中最丰富的一个微生物群,能促进海洋的氮循环。它们主要通过将氨氧化为亚硝酸盐来获得能量,这个过程需要氧气。然而,此前的研究发现,很多氨氧化古菌能生活在缺氧的环境中,其具体的生存方式尚不清楚。

摘要： 目的研究甲真菌病患者甲微生物群的构成,为进一步阐明甲真菌病的发病机制提供线索。方法本研究共纳入47例甲真菌病患者及7例健康志愿者。取患者病甲的甲屑进行真菌镜检及培养鉴定;提取患者病甲、患者对侧健甲及健康人甲的DNA,对真菌rDNA ITS区及细菌16S rDNA V3-V4区PCR扩增,分析微生物群构成,并进行α多样性、β多样性、Simper分析及Spearman相关性分析。结果甲真菌病患者病甲的微生物群构成与对侧健甲及健康人甲存在差异。患者病甲的真菌菌群的丰富度高于对侧健甲。患者对侧健甲细菌菌群的多样性高于病甲及健康人甲,且患者对侧健甲细菌菌群的构成与患甲和健康人甲均有部分重叠。结论患者对侧健甲的细菌菌群构成具有由健康人甲向患者病甲转变的趋势。且在患者病甲的微生物群中,某些真菌和细菌菌属可能具有相关性。

摘要： 尽管全身性抗生素治疗在控制感染、降低发病率和死亡率方面至关重要,但据推测,抗生素的过度使用会导致负面影响,如对抗药性微生物的选择和对共生微生物的附带损害。在一项对4种临床相关抗生素治疗方案[强力霉素(20 mg或100 mg)、头孢氨苄或甲氧苄啶/磺胺甲噁唑(TMP/SMX)]的前瞻性随机研究中,研究人员调查了健康志愿者全身使用抗生素后皮肤上的微生物变化。

摘要： 来自环境的感觉和分子输入的整合塑造了动物的行为。暴露于环境分子的主要场所是胃肠道,在胃肠道中,饮食成分被微生物群化学转化,肠道衍生的代谢物被传播到所有器官,包括大脑。在小鼠中,肠道微生物群影响行为,调节肠道和大脑中的神经递质产生,并影响大脑发育和髓鞘形成模式。

摘要： 青贮作为一种传统的饲料保存方式,近年广泛应用于沼气发酵原料储存领域,但其作用机理并无详尽报道.本实验对青贮各阶段玉米秸秆的物质成分变化、产气潜力和沼气发酵微生物群的影响进行较详细研究,同时与鲜、干玉米秸秆比较,探讨了青贮的C保存能力和沼气发酵的效果.结果显示,玉米秸秆青贮10天便能形成稳定的青贮环境,pH保持在4.0左右,有机酸总量在1.5g/L,青贮10～30天产气效率稳定在207ml/gTS.青贮30天干物质损失率为3.77％,能有效降低新鲜原料保存过程中的碳损失,产气效率比干燥秸秆高12.5％.青贮过程中的微生物群动态为:前10天,乙酸菌占优势,之后数量下降,乳酸菌从青贮开始数量一直在增加,10天之后代替乙酸菌成为新的优势菌,酵母菌在青贮过程中受抑制,数量下降;厌氧发酵中,鲜秸秆与青贮秸秆优势菌相近:为Rikenellaceae(普雷沃氏菌科)(10.18％,10.20％)、Ruminococcaceae(疣微菌科)(9.09％,8.39％)、Synergistaceae(属于梭菌目)(8.97％,8.78％)、Spirochaetaceae(螺旋体科)(6.55％,5.90％);古菌优势菌嗜酸的甲烷鬃毛菌(Methanosaeta)鲜秸秆为(14.11％),青贮为(4.75％),干秸秆优势细菌为Marinilabiaceae (32.48％),优势古菌是嗜氢的甲烷杆菌(Methanobacterium)(7.16％).青贮可作为秸秆储藏方法服务于沼气生产.

摘要： 口腔磷状细胞癌是一种高发的头颈部癌症.目前口腔细菌如Porphyromonas,Fusobacterium等都发现和口腔鳞癌有关.口腔微生物群的成分复杂且会随着部位不同而不断变化.所以，口腔鳞癌患者的口腔不同部位的微生物菌群也可能有很大差异。本项目将探索口腔鳞癌患者口腔不同部位的微生物菌群特征，寻找跟口腔鳞癌有密切联系的菌群，为口腔鳞癌未来的诊断和治疗的发展起到进一步的指导作用。

摘要： 本研究采用HR-CSTR两相共发酵工艺,比较了甜高粱、甘蔗叶及玉米杆同猪粪共发酵的效果,同时检测了不同原料厌氧消化污泥微生物的动态变化.研究结果如下:不同原料经过2天水解酸化,原料中TVFA、SCOD及NH4-N的含量都有提高,表明水解酸化有助于有机物的溶出,以及有机酸的积累,利于后续的厌氧消化。对不同原料厌氧消化污泥微生物的动态变化进行了分析，表明不同原料厌氧消化污泥细菌多样性丰富，相互之间细菌种类的差异较小，其中Firmicutes和Bacteroidetes是主要菌群。

摘要： 研究生物与生物、生物与环境的相互依赖和相互制约的科学称为生态学。研究正常微生物群的结构、功能及其与宿主相互关系的科学则称为微生态学。本文介绍了微生态学的概念和对微生态的认识，阐述了胃肠道微生态的平衡与失调，分析了细菌学涂片和培养方法，浅谈了荧光定量PCR在本研究组临床中的初步应用。

摘要： 感染微生态学的产生微生态学是研究人类、动物和植物与自身定居的正常微生物群相互依赖、相互制约的客观关系的科学。近几十年来,随着医学相关基础学科如悉生生物学,厌氧培养技术,电镜技术,细胞分子生物学等现代科学技术的迅猛发展,人们逐渐认识到人体体表、体腔内存在大量并不致病的微生物群,这些微生物群对其宿主非但无害,而且有益,并有众多的生理效应,并提出了对应于宏观生态平衡的微生态平衡理论。若是内外环境发生重大变化时这种平衡就要遭到破坏,发生微生态失衡,引起宿主各种类型的疾病。微生态失衡引起的疾病来源于内源性和外源性两方面。内源性主要来源于正常微生物群的比例失衡、定位转移和二重感染。外源性主要来自外袭菌的侵入，形成新的感染。

摘要： 为实现城市污泥的资源化利用,以蚯蚓对其进行生物处理,探讨了蚯蚓处理城市污泥对其农化性质的影响.蚯蚓生物(Eisenia foetida)在用物理和农业生态学性质作参比的城市污水污泥制成的培养料中表现出强劲的生长.在蚯蚓生物处理城市污水污泥过程中,有机质、全氮含量表现出下降,速效磷、交换态钾和硝态氮的浓度增加.重金属Mn,zn,Ni,Pb,Cr和Ag的全量减少.Mn,Zn,Cr的浓度降低水平最大分别达到30-40%,1 8-27%和19.22%.可移动态的铜浓度降低达到38.62%,而可移动态的Mn,Zn,Ni,Pb,Cr,C0,Cd达到了17·44%.蚯蚓处理以高灰分城市污泥N旦l为主要成分的培养料时,利用有机氮的微生物群数量与最小值相比增加了10-16倍,.处理以低灰分的城市污泥No2为主要成分的培养料时,微生物群的数量增加了24-41倍.

摘要： 口腔微生学是研究口腔内存在的微生物与机体关系的新兴起的的应用科学。近些年来发展较快，它涉及口腔及全身感染性疾病细菌病因学、诊断和防治研究内容。rn 本文介绍了口腔内微生物与人健康关系包括正常微生物群，口腔内微生物的种类，口腔内微环境的构成及生存特点。研究表明：①细菌的附着有选择性，细菌间结合也有选择性，是分子化学的结合；②有一定结构；③有协调的代谢活动；④受口腔环境的影响；⑤不同部位菌群的内容不同。

摘要： 动物肠道中存在的大量微生物,不仅能够利用和降解来源于食物和内源性蛋白质的一些氨基酸,也能够合成部分氨基酸,可见微生物与宿主之间可进行氨基酸的交换.结肠中微生物的密度很高、内容物通过的时间较长,对肠腔中残留的未消化蛋白质和肽的降解更为彻底.虽然其中的大部分氨基酸不能被结肠上皮吸收,但可作为结肠微生物生成氨、硫化氢、生物胺、一氧化氮、吲哚和酚类化合物、短链/支链脂肪酸和有机酸等多种代谢产物的前体物.在这些代谢产物中,生物胺、短链脂肪酸和有机酸等物质是结肠黏膜和外周组织的能量底物,而氨、硫化氢、吲哚和酚类等物质却可影响结肠上皮细胞的形态与功能.肠道微生物对机体氮代谢的影响以及微生物氮代谢对宿主肠道和机体健康的影响,已成为动物营养学研究的热点问题.文章从结肠中的含氮化合物来源、氨基酸发酵细菌与蛋白酶、微生物对含氮化合物的利用途经、微生物代谢产物及其对宿主的影响等方面对国内外相关研究进展进行了综述,以期对该领域研究有所帮助.

摘要： 动物肠道中存在的大量微生物,不仅能够利用和降解来源于食物和内源性蛋白质的一些氨基酸,也能够合成部分氨基酸,可见微生物与宿主之间可进行氨基酸的交换.结肠中微生物的密度很高、内容物通过的时间较长,对肠腔中残留的未消化蛋白质和肽的降解更为彻底.虽然其中的大部分氨基酸不能被结肠上皮吸收,但可作为结肠微生物生成氨、硫化氢、生物胺、一氧化氮、吲哚和酚类化合物、短链/支链脂肪酸和有机酸等多种代谢产物的前体物.在这些代谢产物中,生物胺、短链脂肪酸和有机酸等物质是结肠黏膜和外周组织的能量底物,而氨、硫化氢、吲哚和酚类等物质却可影响结肠上皮细胞的形态与功能.肠道微生物对机体氮代谢的影响以及微生物氮代谢对宿主肠道和机体健康的影响,已成为动物营养学研究的热点问题.文章从结肠中的含氮化合物来源、氨基酸发酵细菌与蛋白酶、微生物对含氮化合物的利用途经、微生物代谢产物及其对宿主的影响等方面对国内外相关研究进展进行了综述,以期对该领域研究有所帮助.

摘要： 动物肠道中存在的大量微生物,不仅能够利用和降解来源于食物和内源性蛋白质的一些氨基酸,也能够合成部分氨基酸,可见微生物与宿主之间可进行氨基酸的交换.结肠中微生物的密度很高、内容物通过的时间较长,对肠腔中残留的未消化蛋白质和肽的降解更为彻底.虽然其中的大部分氨基酸不能被结肠上皮吸收,但可作为结肠微生物生成氨、硫化氢、生物胺、一氧化氮、吲哚和酚类化合物、短链/支链脂肪酸和有机酸等多种代谢产物的前体物.在这些代谢产物中,生物胺、短链脂肪酸和有机酸等物质是结肠黏膜和外周组织的能量底物,而氨、硫化氢、吲哚和酚类等物质却可影响结肠上皮细胞的形态与功能.肠道微生物对机体氮代谢的影响以及微生物氮代谢对宿主肠道和机体健康的影响,已成为动物营养学研究的热点问题.文章从结肠中的含氮化合物来源、氨基酸发酵细菌与蛋白酶、微生物对含氮化合物的利用途经、微生物代谢产物及其对宿主的影响等方面对国内外相关研究进展进行了综述,以期对该领域研究有所帮助.

摘要： 本发明涉及指导的核酸酶、CRISPR/Cas系统、crRNA、单一gRNA、载体、方法和药物组合物，例如用于靶向孢子形成细菌或用于靶向艰难梭菌、沙门氏菌、大肠杆菌或链球菌。

摘要： 本发明包括用于原位修饰细菌(优选天然存在的细菌)的组合物、试剂盒和方法。这些可用于通过以特异性方式调节微生物组的细菌群体所表达和/或分泌的分子来治疗、预防或治愈微生物组相关疾病或障碍。基因组修饰可以以下方式改变这些群体的部分或全部与宿主之间的相互作用，所述方式减少它们对宿主健康的有害潜力。本发明的组合物、试剂盒和方法不会导致这些群体的直接死亡或对其生长的直接显著抑制。本发明进一步包括筛选细菌中的基因修饰的方法，确定载体诱导这些基因突变的效率的方法，以及确定这些突变对细菌生长的影响的方法。

摘要： 本发明涉及用于抑制细菌种群生长或用于改变细菌混合种群中第一和第二细菌亚群的相对比例的方法、用途、系统、阵列、工程化核苷酸序列和载体。本发明例如对于处理比如用于环境、医疗、食品和饮料应用的微生物是特别有用的。本发明尤其涉及控制工业或家用系统中的基底或流体的微生物影响的腐蚀(MIC)或生物污损的方法。

摘要： 公开用于筛选、分析和选择来自复杂异质群落的微生物、预测并识别其功能关系和相互作用、以及基于其合成微生物群的方法、设备和系统。还公开用于识别和确定微生物类型和菌株的绝对细胞计数连同识别活性微生物与环境参数之间的网络关系的方法。

摘要： 本发明为利用正常型微生物群、发酵型微生物群及合成型微生物群与有机质原料制作有机肥的制作方法以及通过本方法制作而成的有机肥。其在改良土壤、促进作物生长、防治病虫害方面具有显著效果。其特征具有以下步骤：异物去除步骤，去除有机质原料中的杂质及异物；杀菌步骤，将上述有机质原料通过高温高压蒸汽进行杀菌；粉碎步骤，将上述有机质原料进行粉碎；微生物培养步骤，将粉末状有机质原材料及由土壤中分离的正常型微生物群，发酵型微生物群及合成型微生物群，在单独培养、混合培养、组合培养中选择任意一种以上的方法进行培养；微生物培养液制作步骤，将上述微生物培养步骤生成的第一次代谢物、第二次代谢物、分解及合成酶等的复合酶、抗生物质、生物活性物质、诱导物中添加一种以上复合氨基酸制作成微生物培养液；微生物添加液制作步骤，将上述微生物培养液制作步骤中制作的上述微生物培养液与糖浆稀释液进行混合；混合步骤，将上述微生物添加液喷洒在上述粉末状有机质原料中进行混合以生成混合物；发酵步骤，将上述混合步骤中生成的混合物进行发酵；干燥步骤，将经过上述发酵步骤的混合物进行干燥。另外，通过课题的解决手段，生成的肥料其含有第1次代谢物、第2次代谢物、分解及合成酶等的复合酶、抗生物质、生物活性物质、诱导物等，不仅对土壤不会造成污染，还具有恢复生态系统以及通过生产安全的有机农作物，使收入增加的效果。并且，将微生物搭载到有机质原料上提供安置空间和基质，解决了现有技术中微生物材料生存、安置和增殖的难题。另外，有机肥上搭载的微生物维持在10°C以上的温度以及水分饱和率20wt%以上便开始增殖，持续流出有效物质。因此可以在短时间内改善土壤及作物的微生物状况。

摘要： 本发明涉及一种包含至少一种岩藻糖基化低聚糖和至少一种N‑乙酰化低聚糖的营养组合物，其用于扩大或诱导整体肠道微生物群，与用常规营养组合物喂养的婴儿相比，所述整体肠道微生物群更接近只用人类母乳喂养的婴儿的所述整体肠道微生物群。所述组合物可以是婴儿配方食品，并且具体地用于主要用婴儿配方食品喂养的介于0和12月龄之间的婴儿。所述组合物扩大健康的肠内菌群并且具有有益的短期和长期效果。

摘要： 本发明涉及营养组合物，所述营养组合物用于促进或诱导与用常规营养组合物喂养的婴幼儿相比、与仅用人类母乳喂养的婴幼儿更接近的肠道微生物群。所述组合物具体地预期用于主要用婴儿配方食品喂养的介于0和12个月之间的婴幼儿。可在2个月、4个月或6个月期间喂养所述婴幼儿并且所述组合物可以是婴儿配方食品。所述组合物促进健康的肠内菌群并且具有有益的长期效果和短期效果。

摘要： 本发明涉及一种具有低聚果糖和任选地高sn‑2棕榈酸酯甘油三酯的营养组合物，用于诱导在组成和多样性上与母乳喂养的婴儿的微生物群类似的婴儿或幼儿的肠道中的肠道微生物群模式。婴儿可为0月龄至12月龄或0月龄至36月龄，并且所述组合物可为婴儿配方食品。所述组合物促进健康的肠微生物群并且可具有长期效应。

摘要： 公开了用于通过示踪剂分析法对复杂异质群落进行微生物株系分析、确定其功能关系及相互作用以及合成包括给药微生物群集和接种微生物群集的微生物群集的方法、设备和系统。

摘要： 在所公开的方法中提供了用于选择性地提高患有可治疗皮肤状况的受试者的皮肤微生物群的多样性的材料和方法，所述方法使用包含锌化合物、生物相容性表面活性剂和脂质的组合物。可治疗皮肤状况包括健康的皮肤和表现出特应性皮炎(具有或不具有损伤)、皮肤菌群失调和/或痤疮的皮肤。