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测序分析

测序分析的相关文献在1998年到2022年内共计193篇,主要集中在基础医学、畜牧、动物医学、狩猎、蚕、蜂、农作物 等领域,其中期刊论文104篇、会议论文20篇、专利文献182377篇;相关期刊80种,包括生物学教学、中国实验血液学杂志、中华微生物学和免疫学杂志等; 相关会议18种,包括华东六省一市生物化学与分子生物学学会2014年学术交流大会暨浙江省第十一届学会会员代表大会、上海市畜牧兽医学会2013年学术年会、第十五届中国科协年会等;测序分析的相关文献由675位作者贡献,包括肖鹏峰、潘荣芳、严力行等。

测序分析—发文量

期刊论文>

论文:104 占比:0.06%

会议论文>

论文:20 占比:0.01%

专利文献>

论文:182377 占比:99.93%

总计:182501篇

测序分析—发文趋势图

测序分析

-研究学者

  • 肖鹏峰
  • 潘荣芳
  • 严力行
  • 何俊俊
  • 朱发明
  • 王炜
  • 章伟
  • 浦丹
  • 韩浙东
  • 余凤云
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利文献

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排序:

年份

    • 宋婕; 张一炜; 孔永奎; 王书亚; 吕先萍
    • 摘要: 目的:对一B(A)04亚型家系进行血清学及分子遗传学分析。方法:通过标准血清学方法对先证者及其家庭成员进行ABO血型鉴定,通过PCR技术对先证者及其家庭成员ABO基因的第6、7外显子进行测序分析,同时对BA.04等位基因携带者进行单倍型分析,调查其遗传方式。结果:血清学显示先证者及祖父正反定型不符,正定型为AwB或者B(A)亚型,反定型为B型。其祖母、父亲及弟弟均为B型,母亲为O型。测序结果显示,先证者、父亲及祖父ABO基因第7外显子在B.01基因的基础上发生c.640A>G杂合突变,符合BA.04等位基因特征;结合单倍型分析,先证者及祖父基因型均为BA.04/O.01.01,其父亲为BA.04/B.01,祖母及弟弟为B.01/O.01.01,母亲为O.01.01/O.01.01。家系分析显示BA.04等位基因从祖父遗传至父亲再到先证者,而非自然突变。结论:BA.04等位基因的分子遗传基础来源于ABO基因第7外显子c.640A>G突变。
    • 胡坚; 张舒煜; 张文革; 闫紫恒; 李厚敏
    • 摘要: 目的研究甲真菌病患者甲微生物群的构成,为进一步阐明甲真菌病的发病机制提供线索。方法本研究共纳入47例甲真菌病患者及7例健康志愿者。取患者病甲的甲屑进行真菌镜检及培养鉴定;提取患者病甲、患者对侧健甲及健康人甲的DNA,对真菌rDNA ITS区及细菌16S rDNA V3-V4区PCR扩增,分析微生物群构成,并进行α多样性、β多样性、Simper分析及Spearman相关性分析。结果甲真菌病患者病甲的微生物群构成与对侧健甲及健康人甲存在差异。患者病甲的真菌菌群的丰富度高于对侧健甲。患者对侧健甲细菌菌群的多样性高于病甲及健康人甲,且患者对侧健甲细菌菌群的构成与患甲和健康人甲均有部分重叠。结论患者对侧健甲的细菌菌群构成具有由健康人甲向患者病甲转变的趋势。且在患者病甲的微生物群中,某些真菌和细菌菌属可能具有相关性。
    • 宋发军; 杨瑞霜; 吕昕芮; 刘祖懿; 王红莹; 孟艳艳
    • 摘要: 以根状茎、茎、叶、花、果荚及种子6个部位为样品,利用PacBio技术对七叶一枝花进行了全长转录组测序,并对测序数据进行了生物信息学分析.研究共获得52537个平均长度为2607 bp的高质量isoforms,其中40725条isoforms得到注释.GO注释中,4596个isoforms分为生物学过程、细胞组成和分子功能三大类的49个功能组;COG注释到了17848个isoforms,其中参与复制,重组和修复相关的isoforms最多,达5094个;此外,31934个isoforms被注释到KEGG数据库中的134个代谢通路,分布于碳水化合物代谢、翻译、折叠、分类和降解、脂质代谢等分类中.基因结构分析中,共得到39342个CDS,其平均长度达到759 bp.此外,SSR分析表明,52537个isoforms中的双核苷酸重复数最多,达到9925个.研究获得了七叶一枝花的全长转录组数据库,为该属植物的后续分子研究提供了数据支撑和基因资源.
    • 李相钊; 李宝杰; 朱绍伟; 李秀娟; 周忠涛; 张广; 陈方园
    • 摘要: 齐鲁动物保健品有限公司实验室2021年猪瘟病毒(CSFV)抗原检出率为7.8%,平均抗体合格率为82.9%。测序分析临床以2.1d基因亚群为主导,以CSFV+猪蓝耳病病毒(PRRV)与CSFV+猪圆环病毒2型(PCV2)混合感染模式最常见。CSFV疫苗的猪场免疫率能够达到100%,各猪群间抗体差异较大,尤其30~60日龄阶段抗体相对较低,猪瘟是当下中国猪场最有希望净化的疾病之一。
    • 刘爱萍; 宋婕; 王书亚; 孔永奎; 吕先萍
    • 摘要: 目的:分析罕见的B(A)亚型一家系的血清学及分子遗传学特征,探讨其发生机制及输血策略。方法:通过标准血清学方法对先证者及其家庭成员进行ABO血型血清学检测,通过PCR技术对先证者及其家庭成员的ABO基因第6、7外显子进行测序分析,同时对BA.02等位基因携带者进行单倍型分析,通过家系分析调查其遗传方式。结果:血型血清学显示先证者正反定型不符,正定型与AwB或者B(A)亚型血清学正定型表现相符,反定型为B型。ABO基因测序结果显示,先证者第7外显子在B.01基因的基础上发生c.700C>G杂合突变,符合BA.02等位基因特征,单倍型分析确认先证者基因型为BA.02/O.01.02。家系分析显示BA.02等位基因从父亲遗传至先证者再到女儿而非自然突变。结论:该B(A)亚型家系中共发现5例BA.02等位基因携带者,其血清学表现存在一定差异,BA.02等位基因的分子遗传基础来源于ABO基因第7外显子c.700C>G突变,在该家系中表现为稳定的顺式遗传。
    • 赵文君; 律凤霞; 艾鑫
    • 摘要: 采用Illumina测序平台对灰树花菌(Griflola frondosa)原基进行转录组测序,获得了大量转录组信息.结显示果,测序得到38189个非冗余Unigene,在Nr数据库中有31454个Unigene被注释;与KEGG数据库比对,共有1832个Unigene被注释,分属20条生物通路;在COG数据库中注释可划分为25类;与GO数据库进行注释可分为分子功能、细胞组分和生物过程3个主类和60个二级亚类.
    • 郑庆伟
    • 摘要: 曰前,云南农业大学盛军教授团队通过lllumina、PacBio和Hi-C等多组学技术的整合,完成了草地贪夜蛾染色体水平基因组的测序分析,成功破译草地贪夜蛾的耐药基因。近日,该成果的研究论文在细胞生物学权威期刊《Protein&Cell》上在线发表。盛军教授团队通过23种农药处理草地贪夜蛾来研究其耐药的分子机理。
    • 高杰; 缪丽梅; 宗振东; 罗旭光; 王哲奇; 红海
    • 摘要: 文中对捕获于内蒙古居延海东西湖水域的大鳍鼓鳔鳅(Hedinichthys yarkandensis macroptera)鱼体线粒体细胞色素氧化酶亚基I(COI)基因序列及遗传多样性进行了初步研究.研究表明,东湖和西湖各26个样本总计52个个体中COI序列长度为626~645 bp,GC碱基含量为41.37%~42.01%,均值为41.70%;在检测到的52个多态位点中,突变总数7个,存在多态性位点/突变位点7个,单倍型数目为6,单倍型多样性(HD)为0.622,核苷酸的多样性(PI)为0.00147.52个标本的COI基因遗传距离彼此之间相差不大,平均遗传距离都低于0.006,说明52个标本的COI基因彼此之间亲缘关系较近,遗传距离与系统进化树的结果一致.居延海东西湖大鳍鼓鳔鳅的COI序列变异很小,其遗传多样性较低.
    • 李君; 薛天琳; 李蓓; 陈振萍; 邢天禹; 陈慧; 高超
    • 摘要: 目的 探讨JAK2 V617F基因突变呈阴性原发性血小板增多症(ET)患儿的临床、实验室检查及基因突变特征.方法 选择2017年2月至2019年2月于首都医科大学附属北京儿童医院血液肿瘤中心接受诊治的10例JAK2 V617F基因突变呈阴性ET患儿作为研究对象,纳入ET组(n=10).患儿中位年龄为6.8岁;男性患儿为5例,女性为5例.选择同期于本院接受诊治的4例继发性血小板增多症(ST)患儿作为对照,纳入ST组(n=4).患儿中位年龄为1.8岁,均为女性.采用病例对照的研究方法,分析2组患儿的血常规、凝血功能检查、骨髓涂片、骨髓活组织检查及相关基因突变检查结果.2组患儿年龄、血常规和凝血功能检测结果、巨核细胞总数及其比例的比较,采用Mann-Whitney U检验.性别、临床表现构成比比较,采用Fisher确切概率法.本研究遵循的程序符合2013年修订的《世界医学协会赫尔辛基宣言》要求.所有患儿临床资料收集均已获得患儿监护人知情同意.结果 ①ET组10例患儿中,伴神经系统症状者为6例,包括头痛者4例、头晕2例;其中1例同时伴肝大;其余4例无明显临床症状.4例ST组患儿中,伴发热症状或者前驱感染者为2例,其余2例无明显临床症状.②2组患儿外周血血小板计数、血小板压积(PCT)均较正常参考值范围增高,ET组患儿中位血小板计数为1 451×109/L[(1 193~1 831)×109/L],高于ST组患儿的966×109/L[(677~989)X109/L],并且差异有统计学意义(Z=-2.404,P = 0.014);中位 PCT 为1.28%(1.12%~1.63%),亦显著高于ST组患儿的0.85%(0.62%~1.05%),并且差异有统计学意义(Z=-2.256,P=0.024).2组患儿的血小板分布宽度(PDW)均低于正常参考值范围.凝血功能相关指标中,ET组患儿中分别有4、4、4例出现凝血酶原时间(PT)、部分凝血活酶时间(APTT)延长及纤维蛋白原(FIB)值低于正常参考值范围,而ST组患儿中分别为1、2、2例.2组患儿其余检查指标均正常.③2组患儿骨髓涂片结果均表现为中度增生活跃,粒、红系细胞比例正常.此外,4例ST组患儿的骨髓涂片中亦可见中性粒细胞核左移和感染相关细胞.2组患儿的骨髓活组织检查结果均表现为中度增生活跃,粒、红系细胞比例正常且巨核细胞多见,以分叶核巨核细胞为主.巨核细胞免疫组织化学染色结果示,ET组患儿骨髓中位正常巨核细胞比例显著低于ST组患儿[49.5%(44.3%~61.0%)比71.1%(61.3%~85.0%),Z=-2.404,P=0.014].④基因测序结果显示,ET组10例患儿均不伴MPL及JAK2基因突变,其中有2例检测到CALR基因突变,并且这2种CALR 基因突变均为明确与ET相关的基因突变位点.此外,筛选出4种可能与儿童ET相关的基因突变,包括KMT2A、ASXL1、CSF3R及NF1基因突变.结论 JAK2 V617F基因突变呈阴性ET患儿具有独特的临床和实验室特征,二代基因测序法发现可能与ET发生、发展相关的KMT2A、ASXL1、CSF3R及NF1基因突变,可为JAK2 V617F基因突变呈阴性ET的临床诊断提供参考.但是本研究纳入患儿例数较少,并且缺乏ST男性患儿作为对照,存在一定局限性.ET患儿的临床特点、相关实验室检查结果,及其与ST患儿的鉴别要点,有待大样本临床研究进一步证实.
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