摘要:
由尖孢镰刀菌(Fusarium oxysporum)引起的豆科、葫芦科、茄科等100多种植物根腐病、茎腐病、茎基腐病等,严重影响着上述植物的健康生长,给生产生活造成了重大经济损失.F.oxysporum属于半知菌类真菌,是一种以土壤习居为主要特征的植物病原真菌,广泛分布于世界各地.前人研究发现,F.oxysporum的主要致病机制在于侵染并破坏寄主植物的维管束组织,从而导致植物不能实现正常的营养和水分运输功能,引起植物根腐、茎腐、茎基腐等症状,严重时甚至造成植株萎蔫死亡,严重影响着植物的产量和品质.同时,前人研究表明,植物病原真菌、卵菌以及细菌中存在着大量的分泌蛋白,其在侵染植物的过程中发挥着重要的作用,不仅有助于实现其对植物的侵染、定殖和扩散,而且有助于形成对抗植物免疫防卫反应的效应分子、信号分子和诱饵蛋白.然而,对于尖孢镰刀菌的分泌蛋白尚未明确,因此本研究以全基因组序列中已经公布的尖孢镰刀菌菌株(F.oxysporum f.sp.lycopersici4287)中的蛋白序列为基础数据,以真菌分泌蛋白所具有的特征(N-端含有信号肽、不含有跨膜结构域、没有GPI锚定位点、将蛋白分泌在胞外)为依据,利用SignalP v3.0、ProtCompB v9.0、TMHMM v2.0、big-PI Fungal predictor、TargetP v1.1等生物信息学分析程序筛选、获得分泌蛋白,同时,对其氨基酸组成及分布、信号肽长度大小、信号肽切割位点等特征进行分析,结果表明:尖孢镰刀菌中分泌蛋白数量为778个,其氨基酸长度多集中于101~400AA,所占比例为57.07%,氨基酸组成中以G(甘氨酸)最多,所占比例为9.20%;信号肽长度以16~21aa最多,所占比例为81.49%,信号肽氨基酸残基中以P(脯氨酸)最多,所占比例为9.12%;信号肽切割位点-3~3氨基酸组成中最多的分别是T(苏氨酸)、S(丝氨酸)、T、A(丙氨酸)、S、S,信号肽切割位点属于T-X-A类型,属于SPⅠ型信号肽识别位点,具有相对保守性特点.