病原鉴定

摘要： 水稻细菌性褐条病是世界性的水稻重要病害之一,在我国常见于南方稻区,发病严重时会导致水稻整株枯死,严重威胁了水稻的高产稳产.在鉴于目前国内外对该病的研究主要集中在病原鉴定、病原菌致病机理及病害防治、而对其分子生物学水平上的研究尚不深入的前提下,介绍了水稻细菌性褐条病研究的新进展,通过查阅国内外水稻细菌性褐条病研究进展的相关文献,并分析、归纳后,综述了病原菌的特性及发病机理、病害侵染循环和农业、化学、生物方面的防治措施等,以期更好地为农业防治褐条病提供参考.

摘要： 由国家蚕桑产业技术体系蚕蛹加工岗位科学家廖森泰研究员主持完成的科研成果“家蚕微粒子病新病原鉴定和理化防控新技术研发与应用”获2020-2021年度神农中华农业科技奖二等奖。该成果针对蚕业生产上家蚕微粒子病病原来源复杂、污染严重、防治难度增大、治疗手段缺乏等问题,取得了多项理论和技术突破:率先研发出国内唯一获兽药生产批文的家蚕微粒子病治疗药物防微灵,创制了阻断病原垂直传播的蚕种高温处理新技术.

摘要： 炭疽病是枣生产中的一类重要的真菌性植物病害,近以来,在山东省枣园内发生危害,造成严重损失。本文利用ITS、GAPDH、CHS-1、ACT、CAL、TUB2等6个保守基因序列进行多基因系统分析并结合形态学特征及致病性试验,确定了引起枣炭疽病的病原菌为暹罗炭疽菌(Colletotrichum siamense)。这是暹罗炭疽菌侵染枣引起枣炭疽病的首次报道。

摘要： 为明确黑松枯萎病病原菌种类及其生物学特性,采用组织分离法和单孢分离法对其分离纯化,通过形态学、多基因系统发育分析对其鉴定,利用活体接种法测定其致病性,并探讨不同培养基类型、温度、pH、光照等处理条件下菌丝生长速率,确定其适宜生长条件。结果表明,引起黑松萎病的病原菌为尖孢镰刀菌(Fusarium oxysporum)。该病原菌适宜生长温度为25°C~30°C,25°C为最适温度;最适pH为5.0-10.0;PDA培养基和PSA培养基最适菌丝生长,持续光照、持续黑暗以及光照12 h:黑暗12 h处理对菌丝生长无显著性影响。

摘要： 【目的】研究甜菜黄萎病病原及病名,为有效防治该病害奠定基础。【方法】采用常规组织分离法对病株叶柄组织进行分离、纯化;通过牙签接种法对纯培养菌株进行致病性测定;结合形态学特征与多基因序列分析方法对病原菌进行鉴定。【结果】分离菌株的菌落形态、分生孢子梗、分生孢子以及厚垣孢子的形态与变黑轮枝菌(Gibellulopsis nigrescens)基本一致;基于ITS、LSU及ACT基因构建的系统进化树显示,菌株BV4均与经G.nigrescens聚为一支,且同源性分别为99%、99%、100%。【结论】G.nigrescens可侵染甜菜并引起甜菜黄萎症状,所致病害可定名为甜菜黄萎病。

摘要： 目的:明确导致药用金莲花Trollius chinensis Bge.白粉病发生的病原种类及其分类学地位。方法:田间调查观察病害发生及为害特征;借助光学显微镜观察白粉菌闭囊壳、子囊、子囊孢子、附属丝等的显微形态特征;核糖体脱氧核糖核酸(rDNA)-内转录间隔区(ITS)扩增引物ITS1/PM6用于白粉菌分子鉴定,扩增序列用MegaX软件中的邻接法(NJ)构建系统发育树。结果:白粉病每年7月中旬至9月上旬在成株期金莲花茎秆、叶柄及叶片上发生,造成金莲花及种子严重减产,甚至植株早衰死亡。金莲花白粉菌闭囊壳聚生,暗褐色,近球形,直径60~100μm,壁细胞不规则多角形,有凸起;闭囊壳内子囊单个,内含8个浅褐色、卵圆形的子囊孢子;附属丝多根,聚生于闭囊壳一侧,菌丝状,浅褐色,有隔膜,近等粗,直径4~6μm。金莲花白粉菌rDNA-ITS序列与叉丝单囊壳属白粉菌Podosphaera fuliginea(MF543026、AB046986)同源性最高,分别为98.88%、98.73%,与叉丝单囊壳属其他多个种的序列也有较高的同源性(96.00%~98.03%)。根据上述同源菌株的rDNA-ITS序列构建系统发育树,供试金莲花白粉菌与叉丝单囊壳白粉菌P.fuliginea聚为一支。结论:结合田间病害发生、为害特征及病菌闭囊壳、子囊、附属丝等的显微形态特征,将金莲花白粉病菌鉴定为叉丝单囊壳P.fuliginea。

摘要： 采用形态学与分子生物学技术对草莓根腐病病原菌进行鉴定。对草莓育苗圃内发病草莓根部进行组织培养、病原菌分离纯化,通过传统的形态学观察初步判断该病原菌菌株为土赤壳属病原菌。利用通用引物ITS1/ITS4初步鉴定该病原菌菌株ZJ16属于土赤壳属,但不能鉴定到种,又选择土赤壳属特异基因EF-1α和Histone H3基因引物序列进行PCR扩增分析,并将待测菌株测序结果与GenBank中相关菌株EF-1α和Histone H3序列进行同源性比较,待测菌株与Ilyonectria novozelandica(GenBank收录号:CBS 112593)的同源性均达到了100%。确定新疆地区草莓根腐病病原菌为Ilyonectria novozelandica,该菌种是1个中国新记录种。

摘要： 为有效控制喀什地区核桃腐烂病的发生与发展,采用形态学结合多基因分子鉴定技术,对新疆喀什地区核桃腐烂病病原进行了鉴定。2020年,从喀什地区采集到核桃腐烂病病害样本,通过常规组织分离法分离后,获得17株真菌菌株,基于病原菌形态学鉴定,采用ITS、TUB、ACT 3个基因片段对菌株基因组进行PCR扩增。经过序列比对,结合菌株形态特征,将喀什地区核桃腐烂病病原鉴定为Cytospora chrysosperma。

摘要： 为探究引起天津某养殖场线纹海马发病死亡的病因,从患病线纹海马肝胰脏分离得到一株优势菌Par-1,经细菌形态学观察、生理生化特征检测、16S rRNA测序及系统进化树分析等方法确定其种。形态学观察及生理生化检测结果表明,Par-1为短小、弯曲呈弧状的革兰氏阴性菌,发酵葡萄糖产酸不产气,赖氨酸脱羧酶、硝酸盐还原等为阳性;菌株所扩增的16S rRNA基因序列长度为1418 bp,与副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)的同源性达99%~100%,从而鉴定该菌株为副溶血弧菌。人工感染试验结果表明,其对线纹海马的半数致死量(LD_(50))为5.01×10^(6)CFU/mL。药敏试验结果显示,该菌株对亚胺培南、美罗培南、头孢噻肟、阿齐霉素、诺氟沙星、链霉素、四环素等22种药物敏感。本研究为防治天津地区线纹海马细菌性病害提供参考。

摘要： 为明确贵州省施秉县过路黄叶斑病的病原种类,探索该病害的生物防治方法,本试验利用组织分离法、致病性测定法获得致病菌株GLHYB,并结合形态学特征和基于内转录间隔(ITS)、β-微管蛋白(β-tubulin)、延伸因子(EF-1α)3个基因构建系统发育树,将该菌株鉴定为腐皮镰刀菌(Fusarium solani)。利用组织块培养法、平板对峙法从太子参(Pseudostellaria heterophylla)健康块根内分离筛选出1株对F.solani抑菌率达50%以上的拮抗细菌X14,根据生理生化特性及16S rDNA、促旋酶(gyrAse)A亚单位基因序列分析,将X14鉴定为枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)。该菌株能引起F.solani菌丝畸形和膨大,且具有广谱抑菌性,对4种供试病原真菌的抑菌率为50%~70%。本研究为防治镰刀菌属引起的过路黄叶斑类病害提供了生物材料及理论参考。

摘要： 从海南省临高县东英村采集火龙果细菌性病害样本,分离纯化病原菌,通过致病力测定及分子鉴定,将引起该细菌性病害的病原鉴定为泛菌属细菌.对该病害进行大田药效试验.结果表明:53.8％氢氧化铜WG1000倍液处理的防效最好,为71.05％,与47％春雷·王酮WP600倍液处理的防效相当,差异不显著,而与另外两个处理的防效相比差异显著;72％农用链霉素SP5000倍液处理的防效一般,在供试浓度下防效为65.14％,而2％春雷霉素AS600倍液处理对该细菌病害的防效最差,只为63.31％,与其他药剂相比,差异显著.

摘要： 采用形态学和分子生物学鉴定方法,研究了天津地区番茄灰叶斑病的病原菌种类;采用生长速率法测定了几种常用杀菌剂对番茄灰叶斑病菌的抑菌效果,以期为该病害的防治提供参考依据.结果表明,3株代表性菌株均鉴定为茄匍柄霉(Stemphylium solani).室内抑菌活性较好的药剂为氟唑菌酰胺、咪鲜胺及啶酰菌胺等.

摘要： 本研究对采自浙江省桐乡市的杭白菊叶枯病的病原菌进行了分离、鉴定,并对病原菌对多菌灵的抗性进行了研究.结果表明,从病样中分离到的菌株回接试验中出现的症状与田间自然感病症状一致,证明分离物为杭白菊叶枯病的致病菌.该病原菌菌丝初为淡黄色,后为灰白色;培养25天后菌落上的黑色球形分生孢子器产生大量液体状的淡粉色分生孢子堆;分生孢子为单胞、无色、长椭圆形,大小(2.8～4.9)μm×(1.2～3.0)μm,其培养和形态特征与Phoma bellidis一致.根据该菌的核糖体内部转录间隔区(ITS)、nrDNA大亚基(LSU)和β-微管蛋白(TUB2)进行联合系统发育分析,分子鉴定结果与形态学鉴定结果一致,表明引起该病害的病原菌为P.bellidis.进一步的研究表明桐乡市的杭白菊叶枯病菌对多菌灵的抗性频率为94.3％,且全部为高水平抗药性(HR)菌株,抗药性机制为其β-tubulin基因的第198位密码子从GAG突变为GCG,导致第198位氨基酸从谷氨酸(Glu)突变为丙氨酸(Ala),即E198A突变.

摘要： 甘肃省西和县是中国半夏的重要产区,半夏种植过程中病害发生严重.本文对西和半夏地上部病害病原进行分离,共分离到11个菌株,经柯赫氏法则进行致病性验证,结合形态学和分子生物学技术鉴定出病原菌为Alternaria sp.,Rhizoctonia solani等,其中Rhizoctonia solani引起半夏茎基部立枯病,Alternaria denida、Alternaria bumsil引起半夏叶部发病;致病性测定结果发现Alternaria sp.不同菌株的致病性及致病力表现出明显差异.

摘要： 为探明繁蜂棚中蚜霉病的病原种类及防治技术,采集繁蜂棚中感病蚜虫和空气中的真菌,通过显微形态学和转录间隔区(ITS)扩增证实繁蜂棚内寄生蚜虫的病原真菌为蚜虫枝孢霉(Cladosporium aphidis);密封试验箱内的消毒试验结果表明:在0.5g/m3和1g/m3剂量下,三氯异氰尿酸的总杀菌率可达92.31％和92.31％,对蚜虫枝孢霉的杀灭率分别达80.00％和83.33％;二氧化氯的总杀菌率可达97.88％和83.35％,对蚜虫枝孢霉的杀灭率分别达100％和93.33％;利用含三氯异氰尿酸钠的熏蒸剂熏蒸繁蜂棚,对蚜霉病的防治效率达69.65％.

摘要： 对安徽省长丰县随机采集的20个草莓根腐病病样进行病原鉴定,结果分离获得12个菌株,根据培养特征和形态学鉴定,确定分离到的菌株均为尖孢镰刀菌(Fusari-um oxys porum);选取真菌通用引物ITS1/ITS4对菌株基因组DNA进行PCR扩增并进行克隆和测序,通过与NCBI数据库序列比对,分子鉴定结果与形态学一致.将分离到的菌株回接到健康草莓幼苗上,2～3周后植株表现出与田间发病相似的症状,重新分离能够得到相同的病原物.基于形态学、分子生物学鉴定及致病性检测,最终确定安徽省长丰县草莓根腐病的病原菌为Fusarium oxysporum.

摘要： 对采自河南省焦作铁棍山药茎腐病样本进行了研究,对其症状进行了描述,其茎部腐烂部有大量的短体线虫,通过形态学及分子生物学鉴定,确定其种类为咖啡短体线虫(Pratylenchus coffeae).

摘要： 自2007年以来,贵州省六盘水市猕猴桃产业蓬勃发展.但2014年以来,该市猕猴桃病害问题日益严重.中国科学院武汉植物园联合六盘水市农委分别于2015年10月及2016年4月对六盘水市11个乡镇23个代表性栽培园区进行猕猴桃秋冬季及春季病害调查.基于感病症状采集大量典型病害样本,运用生物学特征分析及分子鉴定对分离得到的病原菌进行分析,研究结果表明六盘水市猕猴桃秋冬季主要病害为细菌性溃疡病和真菌性灰斑病、褐斑病、果实软腐病、黑腐病,春季病害相对轻微,部分园区感染了细菌性溃疡病,个别园区存在的病原菌可能会导致果实软腐病,黑腐病和褐斑病.该分析结果为六盘水市后期开展有效、有针对性的检疫、预测预报及病害综合防治提供了理论依据.

摘要： 目的：分析2016年郑州市手足口病流行病学特征,明确手足口病病原体主要型别,为该病的防制提供科学依据. 方法：采用描述流行病学方法分析流行特征;应用RT-PCR方法检测手足口病标本,进行病毒型别鉴定. 结果：2016年郑州市共报告手足口病26130例,发病率为321.30/10万,其中重症病例118例,死亡病例3例.发病时间主要集中在5～7月份,病例以0～3岁散居儿童为主,男性多于女性(性别比1.50∶1).疫情以散发为主,局部地区高发.病原学监测提示,2016年郑州市手足口病肠道病毒检出阳性率为44.71％,其中EV71阳性率为45.11％,CoxA16阳性率为15.77％,其他肠道病毒阳性率为39.12％.轻症病例与重症病例肠道病毒检出阳性率、EV71型病毒检出阳性率差异均有统计学意义. 结论：手足口病的发病存在明显季节、地区、性别、年龄差异,5岁以内婴幼儿是郑州市手足口病防控工作重点,病原体主要为EV71型,易导致重症,EV71病毒感染可能与手足口病的流行强度有关.

摘要： 目的：分析2016年郑州市手足口病流行病学特征,明确手足口病病原体主要型别,为该病的防制提供科学依据. 方法：采用描述流行病学方法分析流行特征;应用RT-PCR方法检测手足口病标本,进行病毒型别鉴定. 结果：2016年郑州市共报告手足口病26130例,发病率为321.30/10万,其中重症病例118例,死亡病例3例.发病时间主要集中在5～7月份,病例以0～3岁散居儿童为主,男性多于女性(性别比1.50∶1).疫情以散发为主,局部地区高发.病原学监测提示,2016年郑州市手足口病肠道病毒检出阳性率为44.71％,其中EV71阳性率为45.11％,CoxA16阳性率为15.77％,其他肠道病毒阳性率为39.12％.轻症病例与重症病例肠道病毒检出阳性率、EV71型病毒检出阳性率差异均有统计学意义. 结论：手足口病的发病存在明显季节、地区、性别、年龄差异,5岁以内婴幼儿是郑州市手足口病防控工作重点,病原体主要为EV71型,易导致重症,EV71病毒感染可能与手足口病的流行强度有关.

摘要： 一种奶牛乳房炎病原菌试剂盒，包括一区培养基、二区培养基、三区培养基、四区培养基；所述一区培养基为生长控制培养基，奶牛乳房炎病原菌均可在一区培养基生长；所述二区培养基为阳性球菌培养基，只生长葡萄球菌和链球菌；所述三区培养基为链球菌培养基，只生长链球菌；所述四区培养基为阴性杆菌培养基，只生长革兰氏阴性杆菌。本发明根据常见乳房炎致病菌的代谢特性，将复杂的细菌实验室微缩至的四个培养基上，普通牧场员工只需一步操作，等待16‑24小时，即可完成整个分离和鉴定工作。本发明根据四个培养基中病原菌的生长模式即可将病原菌进行分类，方便快捷，且可准确快速的判断奶牛乳房炎病原菌的具体种类。

摘要： 本发明属于分子生物学检测领域；具体地，属于引起呼吸道感染的病原体的检测领域；更具体地，本发明能够同时检测甲型流感病毒、乙型流感病毒、鼻病毒、呼吸道腺病毒、呼吸道合胞病毒和肺炎支原体。使用本发明的组合物，能够同时检测6种引起呼吸道感染的病原体并进行鉴定具体是某种或某几种病原体感染。与此同时，其检出率相比已有的组合物的检出率更高，检测更为准确。

摘要： 本发明涉及病原微生物的快速鉴定仪器及鉴定方法，属于微生物鉴定技术领域。病原微生物的快速鉴定仪器包括白光成像单元与拉曼单元，白光成像单元用于拍摄样品白光像，实现细胞自动识别和定位，拉曼单元用于测量病原微生物细胞拉曼光谱，得到病原微生物细胞的指纹特征，当拍摄白光像识别细胞时，白光成像单元移入光路，拉曼单元移出光路，当测量拉曼信号时，白光成像单元移出光路，拉曼单元移入光路。与现有技术相比，本发明由于不需要增菌和分离培养，大大缩短了微生物鉴定的时间。在使用本发明的仪器与方法进行测试中，最快只需要几分钟即可得到原有1‑3天才能得到的结果。

摘要： 本发明属于生信分析领域，具体涉及一种病原微生物测序数据快速比对鉴定方法及其应用，所述方法基于自研分类算法分组快速比对，通过复分类算法统计分析获得病原微生物鉴定和相对定量。

摘要： 本发明涉及基因组检测技术领域，具体而言，本发明涉及一种广谱病原微生物分析鉴定方法及系统。本发明提供的病原微生物鉴定方法，以背景微生物库比对去除背景污染信息，覆盖区域数、RPM值筛选、与阴性对照样本及同批次样本比较，去除冗余信息筛选出可能的病原菌，再与病原临床微生物数据库进行比较，最后通过属内菌种排名选取得出报告菌种，自动生成报告。本发明可以将人工解读的过程自动化，加快解读的速度和准确率。

摘要： 本发明涉及一种红花花叶病病原检测与鉴定方法，包括以下步骤：(1)扩增，使用引物从红花样品中获得重组酶聚合酶扩增(RPA)的扩增产物；(2)分析RPA的扩增产物；(3)对分析完的扩增结果进行结果判断，出现相应的bp特征条带说明所述红花样品感染了相应病毒；未出现相应的bp特征条带说明所述样品未感染花叶病毒。本发明能科学地、有针对性地进行病原检测与鉴定，快速准确，检测的稳定性好，特异性强，可为红花的健康检测提供有效的监控手段，确保生产安全，还对其它病原的检测具有一定的参考价值。

摘要： 本发明提供一种微生物鉴定方法，所述方法通过对测序数据进行数据获取、数据过滤、数据聚类、序列选取、数据比对、物种比对和多重比对结果分析等步骤，实现缩短微生物鉴定分析时间，同时保证鉴定准确性。

摘要： 本发明公开了一种利用拉曼光谱快速鉴定多重感染病原菌的方法，包括以下步骤：1)样品预处理；2)对预处理后的样品进行拉曼光谱采集；3)对采集的拉曼光谱进行预处理；4)构建基于机器学习算法的多重感染病原菌鉴定模型；5)对待测样品进行多重感染病原菌的鉴定，输出待测样品所含的病原菌类型及各菌种的比例。本发明还进一步提供了利用拉曼光谱对多重感染病原菌进行药敏试验的方法。本发明操作简单，在进行拉曼测试前不需要进行复杂的样品前处理，仅需离心清洗和点样；且本发明的方法在检测临床样本时，无需培养，可将鉴定时间由几天缩短为几小时，且与传统方法相比较，本发明在多重感染的鉴定上有更高的准确率。

摘要： 本公开内容的实施方案涉及用于鉴定来自特定病原体的抗原是否是免疫原性的(包括其免疫原性的级别)的方法。其他实施方案涉及T细胞的属性与其临床效力之间的相关性，例如其数学表示。

摘要： 本发明公开了一种烟草细菌性黑斑病病原菌的分离和鉴定方法，该方法包括以下步骤：S1：病样采集；S2：病原菌分离；S3：病原菌培养和筛选；S4：菌落PCR菌悬液制备；S5：PCR扩增与鉴定；S6：16S rRNA基因扩增与验证。本发明能快速而准确地获得烟草黑斑病病原菌，有效排除其他杂菌，提高分离纯化效率，分离纯化率在87％以上；通过采用细菌性黑斑病病原菌的特异引物对灰色菌落进行PCR扩增确认，增强了目标菌株的选择性，可以快速鉴别病原菌。