选择性剪接

摘要： 营养代谢、氧化剂等各种内外环境因素都可能破坏机体氧化还原平衡,引发氧化应激,影响脂肪细胞功能及代谢;PPARγΔ5是PPARγmRNA前体选择性剪接产物,可能调控脂肪细胞分化。本研究通过分离培养猪前体脂肪细胞,用H_(2)O_(2)处理构建氧化应激细胞模型,采用油红O染色提取法检测细胞分化,实时荧光PCR检测成脂分化相关基因和PPARγΔ5 mRNA表达,研究氧化应激对猪脂肪细胞分化及PPARγ选择性剪接的影响。结果表明,H_(2)O_(2)诱导的氧化应激显著抑制猪前体脂肪细胞分化(P<0.05),极显著下调C/EBPα和PPARγ及其下游生脂基因FABP4和SCD的表达(P<0.01),极显著上调Txnip和LPL表达(P<0.01)。此外,H_(2)O_(2)处理极显著降低剪接因子SRSF 1及PPARγΔ5表达(P<0.01)。综上所述,氧化应激可通过抑制转录因子C/EBPα和PPARγ表达及促进Txnip表达减弱猪前体脂肪细胞分化,并抑制PPARγ基因选择性剪接。研究结果可为进一步探讨猪脂肪形成的调控机制提供新的线索。

摘要： 目的深入剖析选择性剪接(AS)事件与急性髓系白血病(AML)患者预后、肿瘤微环境的关系,对AML的机制研究、临床诊断、预后评估和免疫治疗具有重要意义。方法Cox回归分析用于筛选AML患者预后显著相关的AS事件;最小收缩与选择算子(LASSO)回归分析过滤掉冗余AS事件防止模型的过度拟合来构建风险评分模型;受试者工作特征曲线(ROC)对模型预后预测效能进行评估;独立预后分析判断风险评分的独立预测能力;单样本基因集富集分析(ssGSEA)量化高低风险评分组的免疫微环境特征。结果18099个AS事件被确认为预后相关AS事件;AS模型中高风险评分患者预后更差;1年、3年、5年预后预测AUC值分别为0.822、0.852、0.838;独立预后分析表明风险评分可作为独立预后因子;高风险评分组免疫细胞浸润水平和免疫评分更低。结论AS预后模型能准确预测患者预后并评估免疫微环境特征,我们鉴定的几个核心分子,可能成为AML潜在的诊断和预后生物标志物,并为进一步的验证提供靶点。

摘要： 选择性剪接是转录后基因表达调控的关键步骤,它的异常与肿瘤发生密切相关。本文系统阐述了口腔鳞状细胞癌中选择性剪接的调控、具体事件及预后模型的开发,为探索口腔鳞状细胞癌靶向治疗提供新的思路。

摘要： 核不均一核糖核蛋白(hnRNP)家族的重要成员hnRNP L,是一类主要位于细胞核的RNA结合蛋白。近年来发现,hnRNP L除了在免疫系统形成中发挥重要作用外,还在多种肿瘤中异常表达。进一步研究发现,hnRNP L促进肿瘤细胞的各种生物学过程,包括增殖、迁移和侵袭,并与预后相关,提示其在肿瘤发生、发展中发挥重要作用。本文通过总结hnRNP L在各种癌症中的作用机制,探讨hnRNP L的临床意义。

摘要： 本文采用RT-PCR技术克隆获得了拟果蝇Drosophila simulans电压门控钠离子通道基因序列,明确其典型特征,分析了进化关系,为拟果蝇抗性分子机理研究奠定基础。克隆得到拟果蝇钠离子通道开放阅读框(GenBank登录号为MT113357),长为6270 bp,编码2090个氨基酸。通过生物信息学分析,发现拟果蝇与黑腹果蝇Drosophila melanogaster钠离子通道基因相似度高达96.86%,与家蝇Musca domestica钠离子通道基因相似度达88.75%,在进化起源上与双翅目果蝇属昆虫有极高的相似度。所克隆出的序列符合昆虫钠离子通道的基本特征,具有DEKA模块和疏水性失活闸门MFM。获得三个选择性剪接(i、a、b)和17个RNA编辑。本文成功克隆拟果蝇钠离子通道基因,对拟果蝇钠离子通道基因进行分析,为研究其抗性机理奠定基础,为农业生产新型药剂的开发提供了新思路。

摘要： 利用CGGA与TCGA数据库,挖掘胶质瘤预后标志相关基因,结合差异分析、生存分析、共表达分析、临床相关性分析和ROC曲线评估预测能力,并通过TCGA验证,得到PLAT、IGFBP2、BCAT1和SERPINH1等4个可以作为独立预后标志因子的基因.分析表明,这4个基因不仅是独立的预后因子,还在不同人群中都具有较好的预后预测能力,说明找到的预后基因具有潜在的应用价值.对SERPINH1剪接事件进行分析,揭示可变剪接事件是影响患者预后的重要因素,这为进一步理解胶质瘤预后基因的特征提供了依据.

摘要： RNA剪接过程受到多种调节因子作用,以保证前体mRNA剪接的准确性.但是大量研究发现,在人类肿瘤中经常发生选择性剪接的异常或者来自特定癌症基因的剪接调控元件的突变.因此,RN A剪接调节剂作为一类新的癌蛋白和肿瘤抑制因子而逐渐受到关注,并有望通过调节参与致癌基因的RN A而达到治疗肿瘤的效果.改变RN A的异常剪接是治疗相关癌症的基础,这也为靶向治疗提供了更加丰富的靶点.本文综述了新发现的和预测的不同的剪接事件导致癌症的相关基因,并且对它们如何促成疾病的发病机制进行讨论.最后,我们总结了最新的针对可变剪接而发展的癌症诊断和治疗方法,包括使用小分子的剪接抑制剂来阻断剪接体或转录因子修饰酶,以调节特异性剪接导致的癌症.

摘要： 目的 揭示不同类型癌症中富含丝氨酸/精氨酸剪接因子?(SRSF)?的整体表达及其对预后的作用.方法 从癌症基因组图谱数据库?(TCGA)?中下载患者SRSF表达和临床信息,分析33种癌症类型中SRSF基因家族的表达差异及预后价值.利用R语言分析SRSF基因表达、突变及其相关细胞信号通路.结果 SRSF在多种癌症中异常表达,并与G2/M检查点、DNA修复、IL-2/STAT5信号转导、缺氧和KRAS多种信号转导通路以及免疫细胞浸润密切相关.SRSF的异常表达与癌症患者的预后显著相关.结论 SRSF基因异常表达可以预测癌症的预后,其可能作为癌症潜在标志物.

摘要： 为了观察人SMAD4全长及剪接体在HEK-293T中的亚细胞定位,并分析它们在HEK-293T细胞中的转录活性差异,将SMAD4全长及剪接体的pEGFP-C1重组质粒转染至HEK-293T细胞中,在荧光显微镜下观察含GFP标签的SMAD4全长及其剪接体蛋白的亚细胞定位,并通过双荧光素报告酶实验在HEK-293T细胞中对SMAD4全长及其剪接体激活SBE报告基因的情况进行比较.亚细胞定位观察显示,与pEGFP-C1空载组中GFP在HEK-293T中呈现核质均匀分布不同,GFP-SMAD4和GFP-SMAD4△4、GFP-SMAD4△6、GFP-SMAD4△5-6、GFP-SMAD4△4-6、GFP-SMAD4△4-7五种剪接体均分布于 HEK-293T 的细胞质中;而GFP-SMAD4△3则主要分布于HEK-293T的细胞核中.双荧光素酶实验结果显示,与空载组相比,在6种剪接体过表达组中,只有SMAD4△3过表达组能对SBE报告基因的荧光素酶活性起到一定的上调作用;但与SMAD4△3过表达组比较,SMAD4全长过表达组能对SBE报告基因的荧光素酶活性起到更明显的上调作用.本文观察了人SMAD4全长及剪接体在HEK-293T中的亚细胞定位,并分析了其对下游信号通路的转录激活情况,可为后续SMAD4剪接体蛋白的功能研究提供一定的基础.

摘要： 核内不均一核糖核蛋白(heterogeneous nuclear ribonucleoprotein,hnRNPs)是一大类RNA结合蛋白,在结构上具有类似性,其大多包含2个RNA结合区域和一个核定位区域,它们参与核酸代谢的多个方面,包括选择性剪接、mRNA稳定、转录和翻译调控等生理过程.近年来对hnRNPs的深入研究表明,其与癌症的发生发展密切相关,可通过选择性剪接来调节细胞癌基因和抑癌基因或凋亡基因的表达,影响肿瘤能量代谢,维持端粒酶高活性,促进上皮间质转化以及促进血管形成等多种机制参与癌症的发生发展.本文对hnRNPs家族及其生理功能,其与肺癌、宫颈癌、乳腺癌、各消化道肿瘤的关系,以及其参与肿瘤形成的相关途径做一综述,旨在探讨肿瘤治疗新靶点.

摘要： 本文阐述了通过分析转录如何影响选择性剪接，可以得出转录与前体mRNA加工之间功能性偶联的证据。这些作用不是不同的启动子造成mRNA水平差异所产生的，而是取决于转录、RNA加工结构启动子的性质。同时，本文还分析了延伸率控制选择性剪接及染色质和组蛋白的修饰可调节选择性剪接。

摘要： 本文将就N型钙通道及其C末端选择性剪接方面的研究进行总结.N型钙通道是疼痛治疗的一个重要的药理学作用靶点，对其功能性亚基中存在的选择性剪接的认识和了解也在逐步加深，而在这其中尤为突出的是对位于Cav2.2亚基C末端一对选择性剪接外显子e37a和e37b的研究。探讨抑制Cav2.2e[37a]基因的表达或研究针对该亚型的特异性阻断剂，有望得到能产生良好的镇痛效应，而副作用相对较小，这是目前慢性疼痛治疗研究中备受关注的热点之一。rn 在哺乳动物神经系统中存在多种电压依赖性钙通道(voltage-dependent calcium channels,VDCCs),其中有一类VDCCs主要分布于神经元,N(neuronal)型由此命名.N型钙通道可以控制递质释放,也可以参与突触的发生和基因表达调控.由于其在疼痛传递和调控中的重要作用,是目前研究疼痛治疗的一个重要药理学靶点.N型钙通道在不同的细胞和不同的细胞内间隔中会表现出不同的功能,这说明有其分子和结构的不同形式存在,存在选择性剪接(alternative splicing)的异构体(isoforms).

摘要： 人和鼠的CMYA2(心肌症相关蛋白2)基因编码一个包含2 324个氨基酸的蛋白-myomegalin。利用免疫细胞化学及共转染实验发现，myomegalin与PDE4D蛋白共区域化于高尔基体或中心体上以及骨骼肌的肌原纤维中，而myomegalin可能定位于z盘和肌小节之间，同时几种转导cAMP信号的蛋白，如腺苷环化酶、L通道和PKA的调节亚基都定位于肌小节，因此，myomegalin将可能作为锚定蛋白将PDE4D锚定于这些部位。另有研究表明，在人体中，促血小板生长因子受体β(PDGFRB)与myomegalin的卷曲螺旋区域融合时会导致骨骼增生异常的疾病发生。人CMYA2基因存在五个主要的转录本，其中第一个转录本最大，长度为8373bp，且在各组织广泛表达，在心脏和骨骼肌中高表达。

摘要： 选择性剪接与人类疾病密切相关，在急性早幼粒白血病中，L型PML-RARα融合基因也经历了这一过程，分别形成E5(+)E6(+)（第5外显子和第6外显子均存在），E5(—)E6(+)（第5外显子缺失）和E5(-)E6(—)（第5外显子和第6外显子均缺失）三种不同的剪接异构体。本研究从PML-RAR仅融合基因不同剪接体与急性早幼粒白血病( APL)患者预后关系这一临床探讨入手，进而在具有此三种剪接体的NB4细胞水平验证临床实验结论，再通过外源基因转入实验证实PML-RARαL型融合基因不同选择性剪接体可影响细胞对维甲酸诱导分化的敏感性，并从亚细胞定位及分化的角度探讨其分子机理。

摘要： 抗菌肽是昆虫抵御外界微生物侵染的主要物质。研究了家蚕经3种外源微生物大肠杆菌（JM109）、农杆菌（LBA4404）和家蚕核型多角体病毒（BmNPV）诱导后，抗菌肽enbocin基因在蚕脂肪体的表达。结果表明：3种外源微生物诱导前、后，蚕脂肪体中抗菌肽enbocin基因的表达在BmNPV诱导前后差异不大，而JM109、LBA4404菌株诱导后则均出现特异性表达，且特异表达形式的表达量与正常表达具有补偿作用。克隆测序正常转录和诱导后特异转录的条带，发现特异转录形式是由于正常表达形式的外显子/内含子的剪接位点发生变化，2个外显子的序列均包括了中间内含子的部分序列所致，序列的改变也使得特异转录的抗菌肽enbocin基因的翻译发生提取终止，缺失了基因N末端的Cecropin结构的序列。

摘要： CBP是家蚕茧着色的一个关键蛋白。在像N4类的Y 显性品种中，至少存在CBP的两个拷贝，分别命名为A 型和B型，并且可能形成功能性mRNA的转录本。在家蚕多种品系的表达分析中，一簇CBP相似的转录本与完整的CBP形式同时转录。5′UTR在新型转录本中存在。通过序列比对发现这些CBP基因序列存在单核苷酸多态现象（SNP），大多数发生在5′UTR。新型CBP转录本主要起源于A型CBP基因。新型的内含子1也被鉴定是新型的A型CBP基因序列的一部分。

摘要： CBP是家蚕茧着色的一个关键蛋白。在像N4类的Y 显性品种中，至少存在CBP的两个拷贝，分别命名为A 型和B型，并且可能形成功能性mRNA的转录本。在家蚕多种品系的表达分析中，一簇CBP相似的转录本与完整的CBP形式同时转录。5′UTR在新型转录本中存在。通过序列比对发现这些CBP基因序列存在单核苷酸多态现象（SNP），大多数发生在5′UTR。新型CBP转录本主要起源于A型CBP基因。新型的内含子1也被鉴定是新型的A型CBP基因序列的一部分。

摘要： CBP是家蚕茧着色的一个关键蛋白。在像N4类的Y 显性品种中，至少存在CBP的两个拷贝，分别命名为A 型和B型，并且可能形成功能性mRNA的转录本。在家蚕多种品系的表达分析中，一簇CBP相似的转录本与完整的CBP形式同时转录。5′UTR在新型转录本中存在。通过序列比对发现这些CBP基因序列存在单核苷酸多态现象（SNP），大多数发生在5′UTR。新型CBP转录本主要起源于A型CBP基因。新型的内含子1也被鉴定是新型的A型CBP基因序列的一部分。

摘要： CBP是家蚕茧着色的一个关键蛋白。在像N4类的Y 显性品种中，至少存在CBP的两个拷贝，分别命名为A 型和B型，并且可能形成功能性mRNA的转录本。在家蚕多种品系的表达分析中，一簇CBP相似的转录本与完整的CBP形式同时转录。5′UTR在新型转录本中存在。通过序列比对发现这些CBP基因序列存在单核苷酸多态现象（SNP），大多数发生在5′UTR。新型CBP转录本主要起源于A型CBP基因。新型的内含子1也被鉴定是新型的A型CBP基因序列的一部分。

摘要： 本发明提供一种用于利用暴露于适体配体(例如小分子)来调控靶基因的表达的平台和使用所述平台的方法。所述平台以多核苷酸基因调控盒为特色，所述多核苷酸基因调控盒被放置于所述靶基因中，并且包括在5′内含子‑选择性外显子‑3′内含子背景下安置的合成核糖开关。所述核糖开关包含效应区和感应区(例如结合小分子配体的适体)，使得当所述配体不存在时所述选择性外显子被剪接至靶基因mRNA中，从而阻止所述靶基因的表达。当所述配体存在时，所述选择性外显子不被剪接至所述靶基因mRNA中，从而提供所述靶基因的表达。

摘要： 本发明提供一种能够高效地转换热与电磁波的最适当形状的热‑电磁波转换结构、热‑电磁波转换构件、波长选择性散热设备、波长选择性加热设备、波长选择性散热方法、波长选择性加热方法以及热‑电磁波转换结构的制造方法。具体而言，是一种互相转换热与规定波长(λ)的电磁波的结构，是具有波导路的热‑电磁波转换结构以及将此排列多个的热‑电磁波转换构件(10)、利用这些的波长选择性散热设备、波长选择性加热设备、波长选择性散热方法、波长选择性加热方法以及热‑电磁波转换结构的制造方法，波导路由透过电磁波的芯部(2)与由金属构成且围住芯部(2)的包层部(3)所构成。

摘要： 本文提供了用于通过调节剪接前体mRNA来调节靶蛋白质或靶RNA的表达以及用于治疗与所述靶蛋白质或所述靶RNA的表达水平相关的疾病或疾患的方法和组合物。

摘要： 本发明提供一种用于利用暴露于适体配体(例如小分子)来调控靶基因的表达的平台和使用所述平台的方法。所述平台以多核苷酸基因调控盒为特色，所述多核苷酸基因调控盒被放置于所述靶基因中，并且包括在5′内含子选择性外显子3′内含子背景下安置的合成核糖开关。所述核糖开关包含效应区和感应区(例如结合小分子配体的适体)，使得当所述配体不存在时所述选择性外显子被剪接至靶基因mRNA中，从而阻止所述靶基因的表达。当所述配体存在时，所述选择性外显子不被剪接至所述靶基因mRNA中，从而提供所述靶基因的表达。

摘要： 本发明属于生物工程技术领域，涉及利用养血清脑颗粒调控BACE1选择性剪接机制及应用。养血清脑颗粒有很好的改善脑缺血和神经细胞营养作用，基于其具有显著清除AD模型小鼠大脑β‑淀粉样斑块的作用，显著改善AD小鼠的记忆和认知能力，本发明通过细胞学和分子学方法研究养血清脑颗粒具有调控BACE1的选择性剪接的重要功能，产生一种短型47KD(432个氨基酸)的BACE1亚型分子，为养血清脑颗粒药物的研发以及阿尔茨海默症的治疗提供新型的分子靶点。

摘要： 本发明公开了一种调控Bcl‑x基因选择性剪接的反义寡核苷酸及其应用，所述核苷酸包含如下序列：5′‑GCT TGG TTC TTA CCC AGC CGC CGT T‑3′（SEQ ID NO.1），所述调控Bcl‑x基因选择性剪接的反义寡核苷酸可以用于制备治疗慢性粒细胞白血病或伴Bcl‑x剪接异常肿瘤的药物，尤其用于慢性粒细胞白血病的化疗增敏、阻止慢性粒细胞白血病进展或抑制耐药。

摘要： 用于标识选择性剪接事件的方法和装置。该方法包括接收针对多个生物样本中的每个生物样本的剪接百分比(PSI)值的数据集，其中多个生物样本包括具有第一特性的第一样本群体和具有与第一特性不同的第二特性的第二样本群体。将概率模型拟合到数据集，以标识数据集中的样本的多个簇，计算针对多个簇中的每个簇的簇特性，至少部分地基于簇特性来过滤多个簇以标识簇的子集，簇的子集中的每一个与选择性剪接事件相关联，并且在至少一个存储设备上存储与所标识的选择性剪接事件相关联的信息。

摘要： 本文提供了嵌合反式激活子小基因，其中小基因的选择性剪接决定了反式激活子是否表达。反式激活子的表达导致受设计启动子序列控制下的靶基因转录。或者，本文提供嵌合靶基因小基因，其中小基因的选择性剪接直接决定靶基因是否表达。靶基因可以编码抑制性RNA、CRISPR‑Cas9蛋白或治疗性蛋白。

摘要： 本发明提供了一种编辑绵羊FGF5基因实现选择性剪接的sgRNA、成套核酸分子和应用，属于细胞工程和基因工程技术领域，所述sgRNA由如SEQ ID No.1～6所示的核苷酸序列退火得到；所述SEQ ID No.1和SEQ ID No.2两两退火；所述SEQ ID No.3和SEQ ID No.4两两退火；所述SEQ ID No.5和SEQ ID No.6两两退火。本发明提供的sgRNA能够实现对绵羊FGF5基因选择性剪接的编辑。

摘要： 本发明公开了一种调控Bcl‑x基因选择性剪接的反义寡核苷酸及其应用，所述核苷酸包含如下序列：5′‑GCT TGG TTC TTA CCC AGC CGC CGT T‑3′（SEQ ID NO.1），所述调控Bcl‑x基因选择性剪接的反义寡核苷酸可以用于制备治疗慢性粒细胞白血病或伴Bcl‑x剪接异常肿瘤的药物，尤其用于慢性粒细胞白血病的化疗增敏、阻止慢性粒细胞白血病进展或抑制耐药。