S1基因

摘要： 【目的】调查中国规模化猪场猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)的流行情况。【方法】利用RT-PCR检测方法对2018-2020年采集于全国11个省市318个规模化猪场的2391份样品进行PEDV核酸检测,对30份阳性样品进行S1全基因扩增与测序,并利用MegAlign、Mega 7.0等软件进行分析。【结果】2018-2020年,猪场PEDV核酸阳性率分别为48.57%、10.96%和4.72%,样品PEDV核酸阳性率分别为28.97%、8.27%和7.50%,猪场和样品PEDV核酸阳性率呈现逐年下降的趋势。S1基因相似性分析显示,获得的30株毒株全部为GⅡ基因型,其中17株毒株为GⅡa基因亚型、5株毒株为GⅡb亚型、8株毒株为GⅡc亚型,GⅡa基因亚型毒株为2018-2020年流行的主要毒株类型;30株毒株S1基因序列之间核苷酸相似性为93.0%~99.5%,氨基酸相似性为91.7%~100%,其中22株毒株与2017-2018年流行的GⅡ基因型毒株相比S1氨基酸序列表现出特征性插入和缺失。【结论】本研究结果为监测和分析中国PEDV的变异和演化提供了临床数据,为猪流行性腹泻防控和疫苗研制提供了参考。

摘要： 2021年10月初,大理某规模化猪场仔猪出现严重腹泻、呕吐等症状,且病死率较高。为确定发病原因,采集腹泻死亡仔猪淋巴结、肺脏、肝脏、肾脏和小肠等组织样品,采用real-time PCR法分别检测猪流行性腹泻病毒(PEDV)、猪德塔冠状病毒、猪轮状病毒和猪传染性胃肠炎病毒等核酸,结果仅在肠组织病料中检测到PEDV核酸,未检测到其他病原核酸。进一步对1份PEDV阳性样品的S1基因片段进行RT-PCR扩增、测序与分析,发现该毒株S1基因部分序列与国内流行变异株(JN599150.1)同源性为99.8%,与CV777疫苗株同源性仅92.5%,提示该毒株为变异株。研究结果表明,该猪场仔猪腹泻是由PEDV变异株感染所引起,通过采取系列防制措施后该病得到有效控制。

摘要： 为跟踪鸡传染性支气管炎病毒(IBV)的流行及致病特性,2020年从安徽某蛋鸡场采集的发病鸡气管和肾脏组织中分离到1株病毒,对其进行生物学特性鉴定及致病性分析,确定该毒株为IBV,并命名为CK/CH/LAH/20-6。分离毒株可引起鸡胚发育受阻,呈现侏儒胚、蜷缩胚等特征性病变;S1基因检测及遗传演化分析表明,S1基因大小为1 620 bp,属于QX型毒株,与华南地区CK/CH/SHD/GM17-1分离株S1基因同源性高达99.9%;14日龄SPF雏鸡致病性试验结果表明,分离毒株可致雏鸡100%(20/20)发病,20%(4/20)死亡,同时可致气管和肾脏出现不同程度的病理损伤;排毒检测结果表明,攻毒鸡第3天气管及泄殖腔排毒检测率分别为95%(19/20)和85%(17/20),第21天排毒检测率仍达81.25%(13/16)和75%(12/16)。本研究为鸡传染性支气管炎的防控提供了新的流行病学数据,丰富了IBV的生物信息数据库。

摘要： 为了解乌鲁木齐市鸡传染性支气管炎(IB)的流行特征,本研究利用鸡胚培养、RT-PCR、新城疫病毒(NDV)干扰及鸡胚半数感染量(EID_(50))测定等多种方法分离到一株鸡传染性支气管炎病毒(IBV),将其命名为IBV/CK/CH(XJ)/01/2020。对其S1基因进行序列测定及比对分析发现,该分离株在鸡胚上连传5代出现侏儒胚现象,并且可以抑制NDV在鸡胚中的增殖,经计算其EID_(50)为10^(-4.58)/0.1 mL,为中等毒力毒株,攻毒组与正常组比较,雏鸡气管内有大量黏液且肺脏肿大,表现为呼吸型毒株特征,且其S蛋白裂解位点序列为HRRKR,与TC07-2、GX-NN0903等毒株形成一个独立的发育进化群,均属于TC07-2/GVI-1型IBV;与国内常用的H120、H52、M41等疫苗株的同源性仅为59%-65%。本研究为新疆地区IB的流行病学提供参考,也为当地IB的防控提供了理论依据。

摘要： 鸡传染性支气管炎(IB)是目前对养禽业造成严重危害的疫病之一,其病原为传染性支气管炎病毒(IBV)。IBV由于其基因组的特点而易于发生变异和重组,从而产生新的变异株。为了解山西地区IBV的流行及变异情况,本研究采集山西省晋中市疑似发生呼吸道病毒感染的肉鸡组织病料样品,通过PCR鉴定、鸡胚接种及测序,分离鉴定到1株IBV,命名为CK/Shanxi-01/2021。在该分离株S1基因测序的基础上,与NCBI数据库中不同基因型IBV代表株进行序列比对,并构建系统进化树。遗传演化分析结果显示本研究所分离到的IBV为GI-19基因型。将CK/Shanxi-01/2021株的S1基因序列与IBV常用疫苗株H120、M41、H52、4/91及LDT3-A等进行序列比对分析,结果显示分离株与目前常用疫苗株核苷酸序列的同源性为78.1%~85.2%,氨基酸序列同源性为75.2%~78.4%,与以往GI-19基因型病毒株相比其S1蛋白高变区(HVR)出现了V68I、S120A、A271T、N282T、N291S等突变。由此可见,加强IBV流行病学监测,及时掌握目前流行的IBV基因型及其变异特点,对于IB疫情防控具有重要意义。本研究为山西省地区IB疫情防控提供了参考依据。

摘要： 为了获得猪流行性腹泻病毒(PEDV)分离株,并对其S1基因进行序列分析,本试验从江苏2个猪场发病死亡仔猪的肠道组织分离病毒,接种至Vero细胞培养;通过实时荧光定量PCR方法鉴定PEDV、反转录PCR(RT-PCR)方法对PEDV S1基因进行扩增测序;并将10^(7.0)TCID_(50)/mL的分离毒株口服接种5头哺乳仔猪(2 mL/头),观察临床症状,统计发病率和死亡率。结果显示,经鉴定获得的2株分离株均为PEDV,分别命名为DJCY株和DJYJ株。分离毒株能在Vero上产生典型细胞病变,传代至F10代时病毒滴度分别为10^(7.80)TCID_(50)/mL和10^(8.16)TCID_(50)/mL。RT-PCR鉴别诊断S1基因测序和分析显示,2株PEDV均为变异株。接种分离株的哺乳仔猪发病率为100%,接种DJCY株的死亡率为80%,接种DJYJ株的死亡率为100%。体外和体内试验证实,2株分离毒株均为PEDV变异株,且毒力较强。

摘要： 为确定河北地区鸡传染性支气管炎病毒(IBV)的流行及遗传演化情况,本研究对来自河北主要养鸡地区鸡场的118份疑似IBV感染鸡的病料样品经SPF鸡胚进行病毒分离,并对传至第3代的尿囊液经PCR扩增IBV S1基因并测序后,以GenBank中的IBV疫苗株、国内外部分流行株共53株作为参考病毒,利用DNAStar 7.1软件分析分离株S1基因的同源性。采用MEGA 7.0软件中的Neighbor-Joining方法构建S1基因的遗传进化树,并分析S1基因编码的氨基酸序列。采用RDP4、SimPlot软件分析分离病毒株的重组事件。结果显示,分离到11株IBV,且其S1基因全长1614 bp~1620 bp,编码约540个氨基酸。S1基因的同源性分析结果显示,11株分离株之间的同源性为92.8%~99.9%;11株分离株与国内外53株参考株之间的同源性为73.0%~96.7%,与国内常用疫苗株M41、H120、W93、Ma5和QX的同源性为74.7%~96.1%。遗传进化分析结果显示,11株分离株与GI-19基因型(QX型)IBV属于同一分支。序列分析结果显示,11株分离株S1基因及其编码氨基酸序列与参考株相比均发生了不同程度的突变,主要突变位点在其与血清型特异性和病毒中和表位相关的高变区(aa38~aa67、aa91~aa141和aa274~aa387)内。基因重组结果显示,分离株HB.SJZ.21和HB.XT.1是两株重组病毒,HB.SJZ.21株可能是由HB.XT.9株和HB.SJZ.8株重组而成,HB.XT.1株可能是由HB.SJZ.8株和智利分离株重组而成。上述结果表明,河北地区IBV流行株为GI-19基因型,与疫苗株相比存在不同程度的变异,且分离株之间存在重组现象。本研究为河北地区鸡传染性支气管炎的流行病学调查及免疫防控提供了参考。

摘要： 为深入了解云南省猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)的流行现状及现有疫苗株的保护效果,从2017—2022年云南省PEDV感染临床阳性样品中扩增出9份样品的PEDV S1基因,利用生物信息学方法,对9份样品S1基因进行了遗传进化树构建、同源性分析和氨基酸突变位点分析等。结果显示:2份样品位于G1基因群,其余7份位于G2基因群的G2b基因亚群。7份G2b基因亚群样品的核苷酸和推导氨基酸同源性较高,与G2基因群的AJ1102和L/W/L疫苗株处于不同基因亚群且同源性较低,并在第13、139、289和363位发生了不一致的突变位点;与现有疫苗株相比,在抗原中和位点COE区域以及其他区域,有明显的抗原性变化。结果表明:云南省存在G1基因群和G2b基因亚群PEDV同时流行,但以G2b基因亚群为主;流行株和疫苗株间存在较远的遗传和亲缘关系,以及氨基酸突变和抗原性差异,这很可能是导致目前PED控制不理想的原因,因此需要研发安全有效的疫苗。

摘要： 为了了解四川地区流行的猪流行性腹泻病毒(PEDV)的生物学特征及基因的遗传进化关系,从四川某地采集了发病仔猪小肠,病料处理后在Vero细胞上进行盲传,通过RTPCR、间接免疫荧光鉴定(IFA)验证,成功分离出1株猪流行性腹泻病毒,命名为X-6/2021株。对X-6/2021株S1基因进行RT-PCR扩增,获得的分离株S1序列与国内外PEDV毒株进行序列比对和遗传进化分析。结果显示,PEDV-X-6/2021毒株与Ⅰ型参考毒株的同源性为90.6%~93.2%,与Ⅱ型参考毒株的同源性为97.6%~99.0%。试验成功地从四川省分离鉴定得到1株猪流行性腹泻病毒,为该地区PEDV防控及候选疫苗毒株的筛选提供了物质基础。

摘要： 试验对安徽某蛋鸡场采集的病料进行病毒分离,获得2株鸡传染性支气管炎病毒(IBV),命名为AH01/2020和AH02/2020.对分离的病毒进行鸡胚接种、S1基因测序以及遗传进化分析.结果 显示,AH01/2020为LSC/99 Ⅰ型,AH02/2020为QX型,2株病毒均可导致鸡胚出现不同程度IBV典型病变,表现为发育不良、蜷缩等.AH01/2020、AH02/2020与参考株S1基因的核苷酸相似性分别为76.7％～97.8％和78.1％～90.9％,与常用疫苗株的S1同源性均偏低,仅76.7％～79.4％,试验结果揭示了我国IBV的基因多样性,为IBV进行遗传监测和研发新型疫苗提供了参考.

摘要： 为了解广西某种鸡场部分鸡发病原因并解决问题,采集棉拭子和血清后利用PCR鉴定,初步鉴定为IBV,将病料接种SPF鸡胚进行传代培养,证实该病毒为IBV,命名为GXJLZ6/150707.接种鸡胚后进行鸡胚发育分析,收获尿囊液经PCR和序列测定.S1全基因序列分析发现,分离株GXJLZ6/150707与疫苗株4/91等793/B型毒株为相同的基因来源,与腺胃型毒株LX4型毒株亲缘性较近;与经典肾型疫苗毒株D274、Gray及澳大利亚T株亲缘性相对较远;与Mass型经典呼吸型疫苗毒株H52、H120和W93株等亲缘性较远.考虑到该种鸡场长期使用活疫苗ND+H120+4/91的情况,因此推测,分离毒株GXJLZ6/150707很有可能是一种嵌合病毒,即H120等Mass型疫苗毒株与4/91疫苗毒发生重组后形成的新型病毒.本研究结果可为IBV的防控工作和疫苗株的选择提供科学依据.

摘要： 为了解广西某种鸡场部分鸡发病原因并解决问题,采集棉拭子和血清后利用PCR鉴定,初步鉴定为IBV,将病料接种SPF鸡胚进行传代培养,证实该病毒为IBV,命名为GXJLZ6/150707.接种鸡胚后进行鸡胚发育分析,收获尿囊液经PCR和序列测定.S1全基因序列分析发现,分离株GXJLZ6/150707与疫苗株4/91等793/B型毒株为相同的基因来源,与腺胃型毒株LX4型毒株亲缘性较近;与经典肾型疫苗毒株D274、Gray及澳大利亚T株亲缘性相对较远;与Mass型经典呼吸型疫苗毒株H52、H120和W93株等亲缘性较远.考虑到该种鸡场长期使用活疫苗ND+H120+4/91的情况,因此推测,分离毒株GXJLZ6/150707很有可能是一种嵌合病毒,即H120等Mass型疫苗毒株与4/91疫苗毒发生重组后形成的新型病毒.本研究结果可为IBV的防控工作和疫苗株的选择提供科学依据.

摘要： 为了解广西某种鸡场部分鸡发病原因并解决问题,采集棉拭子和血清后利用PCR鉴定,初步鉴定为IBV,将病料接种SPF鸡胚进行传代培养,证实该病毒为IBV,命名为GXJLZ6/150707.接种鸡胚后进行鸡胚发育分析,收获尿囊液经PCR和序列测定.S1全基因序列分析发现,分离株GXJLZ6/150707与疫苗株4/91等793/B型毒株为相同的基因来源,与腺胃型毒株LX4型毒株亲缘性较近;与经典肾型疫苗毒株D274、Gray及澳大利亚T株亲缘性相对较远;与Mass型经典呼吸型疫苗毒株H52、H120和W93株等亲缘性较远.考虑到该种鸡场长期使用活疫苗ND+H120+4/91的情况,因此推测,分离毒株GXJLZ6/150707很有可能是一种嵌合病毒,即H120等Mass型疫苗毒株与4/91疫苗毒发生重组后形成的新型病毒.本研究结果可为IBV的防控工作和疫苗株的选择提供科学依据.

摘要： 为了解广西某种鸡场部分鸡发病原因并解决问题,采集棉拭子和血清后利用PCR鉴定,初步鉴定为IBV,将病料接种SPF鸡胚进行传代培养,证实该病毒为IBV,命名为GXJLZ6/150707.接种鸡胚后进行鸡胚发育分析,收获尿囊液经PCR和序列测定.S1全基因序列分析发现,分离株GXJLZ6/150707与疫苗株4/91等793/B型毒株为相同的基因来源,与腺胃型毒株LX4型毒株亲缘性较近;与经典肾型疫苗毒株D274、Gray及澳大利亚T株亲缘性相对较远;与Mass型经典呼吸型疫苗毒株H52、H120和W93株等亲缘性较远.考虑到该种鸡场长期使用活疫苗ND+H120+4/91的情况,因此推测,分离毒株GXJLZ6/150707很有可能是一种嵌合病毒,即H120等Mass型疫苗毒株与4/91疫苗毒发生重组后形成的新型病毒.本研究结果可为IBV的防控工作和疫苗株的选择提供科学依据.

摘要： 为分析2015年～2016年广东省猪流行性腹泻病毒(PEDV)流行株的遗传变异情况,本研究对16株来自广东地区的PEDV流行株部分S1基因进行克隆和测序,并将测序结果与GenBank中PEDV参考株S1基因进行同源性分析并构建系统进化树.结果显示,16株PEDV流行株间核苷酸序列同源性为93.8％～100.0％,与国内参考株间核苷酸序列同源性为70.7％～98.1％.PEDVS1基因遗传进化分析显示,16株流行株与国内大部分流行株亲缘关系较近,与疫苗株CV777、中国早期分离株CH/S、韩国流行株DR13、泰国流行株TH/AY/2.7/12、日本株14JM/01、美国株Minnesota/XW001等亲缘关系较远.此外,16株PEDV流行株与华南地区2014年之前分离株CH/GDQY/2011、CH9/FJ、CH/GDGZ/2012、FM/YN/2013等属群不同,亲缘关系较远.试验结果表明广东省当前流行的PEDV存在新基因型,并已经成为优势病毒株.

摘要： 为分析2015年～2016年广东省猪流行性腹泻病毒(PEDV)流行株的遗传变异情况,本研究对16株来自广东地区的PEDV流行株部分S1基因进行克隆和测序,并将测序结果与GenBank中PEDV参考株S1基因进行同源性分析并构建系统进化树.结果显示,16株PEDV流行株间核苷酸序列同源性为93.8％～100.0％,与国内参考株间核苷酸序列同源性为70.7％～98.1％.PEDVS1基因遗传进化分析显示,16株流行株与国内大部分流行株亲缘关系较近,与疫苗株CV777、中国早期分离株CH/S、韩国流行株DR13、泰国流行株TH/AY/2.7/12、日本株14JM/01、美国株Minnesota/XW001等亲缘关系较远.此外,16株PEDV流行株与华南地区2014年之前分离株CH/GDQY/2011、CH9/FJ、CH/GDGZ/2012、FM/YN/2013等属群不同,亲缘关系较远.试验结果表明广东省当前流行的PEDV存在新基因型,并已经成为优势病毒株.

摘要： 为分析2015年～2016年广东省猪流行性腹泻病毒(PEDV)流行株的遗传变异情况,本研究对16株来自广东地区的PEDV流行株部分S1基因进行克隆和测序,并将测序结果与GenBank中PEDV参考株S1基因进行同源性分析并构建系统进化树.结果显示,16株PEDV流行株间核苷酸序列同源性为93.8％～100.0％,与国内参考株间核苷酸序列同源性为70.7％～98.1％.PEDVS1基因遗传进化分析显示,16株流行株与国内大部分流行株亲缘关系较近,与疫苗株CV777、中国早期分离株CH/S、韩国流行株DR13、泰国流行株TH/AY/2.7/12、日本株14JM/01、美国株Minnesota/XW001等亲缘关系较远.此外,16株PEDV流行株与华南地区2014年之前分离株CH/GDQY/2011、CH9/FJ、CH/GDGZ/2012、FM/YN/2013等属群不同,亲缘关系较远.试验结果表明广东省当前流行的PEDV存在新基因型,并已经成为优势病毒株.

摘要： 猪流行性腹泻(Porcine epidemic diarrhea,PED)是由猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)引起的一种高度接触性肠道传染病,为调查中国PEDV的流行现状及遗传进化情况,2015年在中国东北、华北、西北、西南、华中、华东和华南七个地区的41个猪场采集165份PEDV阳性病料.利用RT-PCR方法对PEDV的ORF3和51基因进行扩增，并对其进行遗传进化分析。其中41个ORF3基因和29个51基因测序成功。系统进化树分析显示，本试验鉴定的PEDV毒株属于non S-INDEL型毒株并呈现遗传多样性;与经典毒株CV777相比，HLJ2015/DP1-1毒株的51基因在1130-1141位之间缺失12个核苷酸。尽管，已经明确PEDV5蛋白插入突变、缺失突变和点突变是PEDV致病性改变的主要原因，但仍不能解释PEDV变异毒株与经典毒株差异的共性规律。因此，本研究能更好的诠释中国PEDV遗传变异和致病机制，阐明该问题将有利于PEDV遗传变异和致病机理的深入了解。

摘要： 猪流行性腹泻(Porcine epidemic diarrhea,PED)是由猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)引起的一种高度接触性肠道传染病,为调查中国PEDV的流行现状及遗传进化情况,2015年在中国东北、华北、西北、西南、华中、华东和华南七个地区的41个猪场采集165份PEDV阳性病料.利用RT-PCR方法对PEDV的ORF3和51基因进行扩增，并对其进行遗传进化分析。其中41个ORF3基因和29个51基因测序成功。系统进化树分析显示，本试验鉴定的PEDV毒株属于non S-INDEL型毒株并呈现遗传多样性;与经典毒株CV777相比，HLJ2015/DP1-1毒株的51基因在1130-1141位之间缺失12个核苷酸。尽管，已经明确PEDV5蛋白插入突变、缺失突变和点突变是PEDV致病性改变的主要原因，但仍不能解释PEDV变异毒株与经典毒株差异的共性规律。因此，本研究能更好的诠释中国PEDV遗传变异和致病机制，阐明该问题将有利于PEDV遗传变异和致病机理的深入了解。

摘要： 猪流行性腹泻(Porcine epidemic diarrhea,PED)是由猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)引起的一种高度接触性肠道传染病,为调查中国PEDV的流行现状及遗传进化情况,2015年在中国东北、华北、西北、西南、华中、华东和华南七个地区的41个猪场采集165份PEDV阳性病料.利用RT-PCR方法对PEDV的ORF3和51基因进行扩增，并对其进行遗传进化分析。其中41个ORF3基因和29个51基因测序成功。系统进化树分析显示，本试验鉴定的PEDV毒株属于non S-INDEL型毒株并呈现遗传多样性;与经典毒株CV777相比，HLJ2015/DP1-1毒株的51基因在1130-1141位之间缺失12个核苷酸。尽管，已经明确PEDV5蛋白插入突变、缺失突变和点突变是PEDV致病性改变的主要原因，但仍不能解释PEDV变异毒株与经典毒株差异的共性规律。因此，本研究能更好的诠释中国PEDV遗传变异和致病机制，阐明该问题将有利于PEDV遗传变异和致病机理的深入了解。

摘要： 本发明涉及重组修饰的安卡拉痘苗病毒，其包含插入所述MVA基因组的基因间区内的异源DNA序列，其中，所述的IGR位于该MVA基因组的两个相邻开放阅读框之间或所述的IGR位于该MVA基因组的两个相邻开放阅读框的侧面，并且其中所述ORF对应于保守基因，并且其中所述的两个相邻ORF以示例性方式或其相应方式选自由（使用CDC/阿卡姆贝斯的命名法则）其它痘苗病毒毒株中的044-045、049-050、050-051、058-059、064-065、065-066、069-070、070-071、071-072、072-073、073-074、074-075、075-076、076-077、077-078、078-079、081-082、085-086、086-087、089-090、092-093、093-094、095-096、097-098、100-101、101-102、102-103、104-105、108-109、113-114、114-115、118-119、121-122、122-123、123-124、127-128、128-129、129-130、130-131、131-132、132-133、133-134、134-135、135-136、141-142和142-143所组成的组。

摘要： 本发明属于基因表达分析技术领域，公开了CmEF1α基因和CmRAN基因在分析甜瓜果实的基因表达时作为内参基因的应用，所述CmEF1α基因的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，所述CmRAN基因的核苷酸序列如SEQ ID NO：2所示。本发明还公开了一种采用实时荧光定量PCR分析甜瓜果实基因表达的方法，它是将CmEF1α基因和CmRAN基因组合的几何平均数作为甜瓜果实基因表达分析中的内参基因。CmEF1α基因和CmRAN基因在不同坐果方式的甜瓜果实的不同发育阶段均能稳定表达，是甜瓜果实发育过程中利用实时荧光定量PCR技术检测基因表达分析的可靠内参基因组合。

摘要： 本发明涉及转基因植物检测领域，具体涉及同时鉴定转甘露聚糖酶基因、葡聚糖酶基因、木聚糖酶基因和半乳糖苷酶基因植物的方法。本发明中设计的针对转入的半乳糖苷酶、葡聚糖酶、甘露聚糖酶及木聚糖酶的外源基因的引物可以同时鉴定转基因玉米饲料中的该四种外源基因，这为今后饲用酶转基因玉米原料成分的快速鉴定检测提供了方法。

摘要： 本发明涉及用于整合外源序列至痘苗病毒基因组的基因间区(IGR)内的新插入位点，其中所述的IGR位于该痘苗病毒基因组的两个相邻开放阅读框(ORF)之间或所述的IGR位于该痘苗病毒基因组的两个相邻开放阅读框的侧面，并且其中所述ORF对应于保守基因，并涉及用来插入外源DNA至痘苗病基因组内的相关质粒载体，并且还涉及作为药物或疫苗的含有插入所述新插入位点内的外源序列的重组痘苗病毒。

摘要： 本发明的目的在于能够在加密的状态下进行基因信息的检索。加密装置(200)对存储装置存储的基因信息即对象基因进行加密来生成加密基因，并将作为预定的基因信息的基准基因与对象基因进行比较，生成差异信息，生成嵌入了所生成的差异信息并加密而得到的加密标签。数据中心(400)使加密基因和加密标签相关联地存储在存储装置中。检索装置(300)将差异信息作为检索关键字，生成嵌入差异信息并进行加密而得到的检索查询，将所生成的检索查询发送到数据中心(400)。数据中心(400)确定包含检索查询中指定的差异信息的加密标签，提取相关联的加密基因并发送到检索装置(300)。

摘要： 提供作为副作用的细胞毒性少且MEX3B基因的表达抑制能力提高的核酸、含有上述核酸的MEX3B基因表达抑制剂、抑制MEX3B基因表达的方法及起因于MEX3B基因表达的疾病的预防或治疗剂。核酸为下述(1)～(3)中的任一者：(1)由序列表的序列号1或2中记载的碱基序列组成的寡核苷酸；(2)由在序列表的序列号1或2中记载的碱基序列中缺失、取代及/或添加1个或2个碱基而得的碱基序列组成、且抑制MEX3B基因的表达的反义寡核苷酸；(3)包含序列表的序列号3中记载的碱基序列、且抑制MEX3B基因的表达的反义寡核苷酸。

摘要： 本发明提供作为副作用的细胞毒性低且能够抑制MEX3B基因的表达的核酸、包含上述核酸的MEX3B基因表达抑制试剂、抑制MEX3B基因表达的方法及由MEX3B基因表达所引起的疾病的预防或治疗剂。抑制MEX3B基因的表达的核酸，所述核酸为：反义寡核苷酸，所述反义寡核苷酸具有与MEX3B基因的外显子中的非翻译区中的包含至少10个连续核苷酸的寡核苷酸互补的序列；或者双链RNA或编码上述双链RNA的DNA，所述双链RNA包含上述非翻译区中的至少20个连续核苷酸。

摘要： 本发明属于基因表达分析技术领域，具体涉及ClCAC基因和ClSAND基因在西瓜果实发育过程中用作为基因表达分析的内参基因的应用。本发明为ClCAC和ClSAND基因设计了特异引物，该引物跨基因上相邻的2个外显子的接头位点，以基因组DNA为模板时无扩增产物，以cDNA为模板是可以扩增出目标片段，所述引物的核苷酸序列如SEQ ID No.1-4所示。通过实时荧光定量PCR技术检测表明，ClCAC基因和ClSAND基因在不同基因型、不同坐果方式的西瓜果实的不同发育阶段均能稳定表达，是西瓜果实发育过程中利用实时荧光定量PCR技术检测基因表达分析的可靠内参基因组合。该内参基因组合具有表达稳定性好、不受cDNA样品中是否存在基因组DNA污染影响等优点。

摘要： 本发明属于基因表达分析技术领域，公开了CmEF1α基因和CmRAN基因在分析甜瓜果实的基因表达时作为内参基因的应用，所述CmEF1α基因的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，所述CmRAN基因的核苷酸序列如SEQ ID NO：2所示。本发明还公开了一种采用实时荧光定量PCR分析甜瓜果实基因表达的方法，它是将CmEF1α基因和CmRAN基因组合的几何平均数作为甜瓜果实基因表达分析中的内参基因。CmEF1α基因和CmRAN基因在不同坐果方式的甜瓜果实的不同发育阶段均能稳定表达，是甜瓜果实发育过程中利用实时荧光定量PCR技术检测基因表达分析的可靠内参基因组合。

摘要： 本发明的目的在于，提供一种在癌症中鉴定能够成为预测药剂的治疗有效性的指标的基因、以该基因为目标预测药剂的治疗有效性的新型的方法，并进行了肺腺癌的全转录组测序。其结果，鉴定了KIF5B基因和RET基因的框内融合转录产物。另外，该KIF5B-RET基因融合在日本人肺腺癌的6/319（2%）、美国人肺腺癌的1/80（1%）中被检测出。而且发现，该7例均不显示EGFR、KRAS、ALK癌基因这样的公知的活化突变，因此，判明该基因融合为癌化中的责任突变（驱动突变）。该基因融合被认为是导致RET酪氨酸激酶蛋白的稳定活化的因素，因此，对于检测出该基因融合的患者，以RET酪氨酸激酶抑制剂进行的治疗是有效的。