单基因病

摘要： 近日,中国初级卫生保健基金会(以下简称“初保基金会”)爱无限健康公益基金收到了三封患者来信。他们分别由甲型血友病FVIII基因杂合突变、进行性假肥大性肌营养不良DMD和脊髓肌萎缩症单基因病患者家庭书写。字里行间,有一些正能量使我们深受触动,信中提及的事迹让我们温暖满怀。

摘要： 目的探讨基因二代测序在儿童呼吸系统疑难疾病中的诊断应用。方法回顾性分析2016—2021年采用二代测序对以呼吸系统症状为主要表现的疑难疾病的诊断情况,总结患儿的临床特征及基因二代测序结果。结果进行基因二代测序的患儿共97例,均以呼吸系统症状为首发或主要表现,中位年龄1.9(7.6)岁,男57例、女40例。确诊单基因病31例(诊断率32.0%),中位年龄4.0(7.6)岁;主要表现为慢性湿性咳嗽,部分患儿进展到后期有不同程度的营养不良、杵状指。其中原发性纤毛运动障碍20例,18例为复合杂合变异(HYDIN 7例、CCNO 3例、CCDC402例、DNAH12例、DNAAF31例、DNAI21例、DNAH111例、RSPH4A 1例);1例为DNAI2基因纯合变异;1例存在X连锁PIH1D3基因半合子缺失。囊性纤维化4例,其中3例为CFTR基因复合杂合变异,1例为CFTR基因c.4056G>C纯合变异。肺表面活性物质代谢障碍3例,均为SFTPC基因杂合变异。原发性免疫缺陷病2例,分别为PIK3CD基因变异致PI3Kδ过度活化综合征1例、CXCR4基因变异致WHIM综合征1例。神经肌肉疾病2例,为MTM1基因变异致中央核肌病1例、SMN1基因纯合缺失致进行性脊肌萎缩症1例。66例基因检测阴性患儿以反复呼吸道感染和慢性咳嗽表现为主,伴或不伴支气管扩张;部分患儿表现为不明原因气促、呼吸窘迫,伴或不伴肺部广泛间质改变。结论以呼吸系统症状为首发或主要表现的儿童单基因病具有高度的临床和遗传异质性,基因二代测序的应用给诊治带来了新思路,扩展对疾病谱的认识。

摘要： 广州市妇女儿童医疗中心的廖灿教授进行了题为“基于人群数据单倍型分析无创产前检测α和β地中海贫血”的演讲。廖教授首先简述了无创产前检测单基因病的发展历程。指出目前无创检测单病最常用的2种技术分别为Digital PCR和二代测序,并详细介绍了2种技术的优缺点.

摘要： 携带者筛查是识别生育单基因病患儿风险夫妇和指导再生育的有效手段之一。基因检测技术最初作为单一疾病和基于先证者的筛查,其发展使多种疾病同时检测成为可能,形成扩展性携带者筛查。虽然目前越来越多的实验室开展扩展性携带者筛查,但仍面临缺乏公众需求、卫生系统优先次序较低、接受筛查的潜在压力、检测前后咨询、技术局限性等方面挑战。本文总结了国内外单基因病扩展性携带者筛查的发展历史和研究进展。

摘要： 随着分子生物学技术、遗传诊断技术的发展以及相美术语的更新,单基因病胚胎着床前遗传学检测(preimplantation genetic testing for monogenic/single gene disorders,PGT-M)技术不断进步和更新,广泛应用于临床以避免遗传病患儿的出生和阻断致病基因的家族传递.目前,关于PGT-M的共识还很少,为了规范PGT-M的应用,中国医师协会生殖医学专业委员会精准辅助生殖研究学组及中国医师协会医学遗传医师分会部分专家,包括生殖医学、遗传学和心血管医学专家,共同制定了这一共识.共识包括PGT-M的适应证、禁忌证、诊断策略、遗传和生殖咨询、报告形式、结果解释、知情同意和患者随访等.这一共识将使更多相关的临床工作者和研究人员获益,供临床及实验室参考使用.

摘要： 湿疹和血免疫球蛋白E(IgE)水平升高不仅是特应性皮炎的特征,也可能是皮肤相关单基因病以及某些综合征或免疫出生错误的表现之一,如高IgE综合征、Wiskott-Aldrich综合征,X连锁内分泌多腺体病肠病伴免疫调节异常综合征、Omenn综合征、非典型DiGeorge综合征、Comèl-Netherton综合征、皮肤屏障疾病伴消瘦综合征、脯氨酸酶缺乏症等。这些单基因病在儿童期可表现为严重的湿疹或湿疹样皮疹,另外部分疾病从婴儿期就可有IgE升高的表型。这些单基因病除湿疹样皮疹和IgE升高外,还会有其他相关表型,因此熟悉这些疾病的表型特点有助于临床更好地识别。早期识别并且对其进行有效的诊治管理,可改善预后。现从临床角度总结这些疾病的表型,帮助临床医师识别和进一步诊治这些疾病。

摘要： 湿疹和血免疫球蛋白E(IgE)水平升高不仅是特应性皮炎的特征,也可能是皮肤相关单基因病以及某些综合征或免疫出生错误的表现之一,如高IgE综合征、Wiskott-Aldrich综合征,X连锁内分泌多腺体病肠病伴免疫调节异常综合征、Omenn综合征、非典型DiGeorge综合征、Comèl-Netherton综合征、皮肤屏障疾病伴消瘦综合征、脯氨酸酶缺乏症等.这些单基因病在儿童期可表现为严重的湿疹或湿疹样皮疹,另外部分疾病从婴儿期就可有IgE升高的表型.这些单基因病除湿疹样皮疹和IgE升高外,还会有其他相关表型,因此熟悉这些疾病的表型特点有助于临床更好地识别.早期识别并且对其进行有效的诊治管理,可改善预后.现从临床角度总结这些疾病的表型,帮助临床医师识别和进一步诊治这些疾病.

摘要： 携带者筛查是识别生育单基因病患儿风险夫妇和指导再生育的有效手段之一.基因检测技术最初作为单一疾病和基于先证者的筛查,其发展使多种疾病同时检测成为可能,形成扩展性携带者筛查.虽然目前越来越多的实验室开展扩展性携带者筛查,但仍面临缺乏公众需求、卫生系统优先次序较低、接受筛查的潜在压力、检测前后咨询、技术局限性等方面挑战.本文总结了国内外单基因病扩展性携带者筛查的发展历史和研究进展.

摘要： 单基因病种类及患病率的不断增加,给患者家庭造成了沉重的身心压力和经济负担.单基因病植入前遗传学检测(PGT-M)作为单基因病的一级预防手段可有效阻断其垂直传递,避免相关缺陷儿的降生.一系列PGT-M检测技术的发展促使单基因病诊断能力不断提高,同时伴随人口结构及生育意识的改变,其临床应用范围和市场需求不断扩大,也引发了相应的伦理争议.文章对PGT-M检测技术的发展历程、应用范围和现状以及相关伦理问题等进行了综述.

摘要： 单基因肾结石病虽在临床较为少见,但其逐年增加的发病率及对患者身心健康的影响足以引起重视.目前单基因肾结石病的治疗尚停留于药物及手术层面,本文以原发性高草酸尿症基因治疗的进展为切入点,对单基因肾结石病在病因学层面的治疗进行论述,以期推动更多基因治疗层面的研究和尝试,推动基因治疗方式和药物的研发与探索,推动单基因肾结石病精准化及个体的治疗模式的完善,进而提升该病的诊疗水平.

摘要： 目的:探讨多重置换扩增(multiple displacement amplification,MDA)联合单体型分析在单基因病PGD/PGS中的应用.rn 方法:采用多重置换扩增技术对囊胚期胚胎活检细胞进行全基因组扩增,针对致病突变进行直接检测,并选择致病基因内部及两侧的STR位点进行单体型分析.随后对非患病胚胎进行染色体非整倍体筛查.rn 结果:进行了以下6种单基因病植入前遗传学诊断的临床应用:β-地中海贫血、成人型多囊肾、脊髓性肌萎缩症、亨廷顿舞蹈病、杜氏肌营养不良、耳聋.对上述6个家系共35个胚胎进行PGD/PGS,MDA扩增成功率为94.3％(33/35),后续PCR扩增效率为100％,等位基因脱扣率为0～33.3％,非患者胚胎中染色体非整倍体异常率为57.1％(12/21),总体诊断效率为100％(33/33).rn 结论:本研究成功运用多重置换扩增技术对6个不同单基因病家系进行了PGD/PGS检测.多重置换扩增技术提高了胚胎用于检测的核酸量,使联合进行单基因病PGD和PGS成为可能.单基因病PGD和PGS技术的结合可建立高效,准确的植入前遗传学诊断平台,有利于扩大植入前遗传学诊断的适应证.我们的研究提示对非患病胚胎进行染色体非整倍体筛查,可为移植优质胚胎,提高妊娠成功率提供更多依据.

摘要： 本发明提供了一种用于胎儿染色体拷贝数变异、胎儿染色体微缺失/微重复、和/或显性单基因突变的无创产前筛查的检测方法、试剂盒、及其系统。以及本发明还提供了一种靶向捕获探针的设计方法，所述方法用于胎儿无创产前筛查。与现有的无创产前筛查检测方法相比，能够扩大临床基因检测适用范围、提高检测准确性。

摘要： 本发明公开一种基于临床特征和序列变异的单基因病名称推荐方法及系统，能够精准地推荐出与患者情况匹配的单基因病名称。该方法包括：获取患者的病例信息；将基因序列与人类参考基因组进行比对得到每个遗传变异的影响性评分；遍历特征关系数据库中各标准单基因病名称对应的特征集合A，分别计算与每个特征集合A的集合相似度值，将相似的标准单基因病名称及对应的基因降序候选输出，构建标准单基因病名称集合P；从预设的基因列表文件中获取与单基因病名称对应的多个基因，分别计算每个基因的致病性评分，将对应的标准单基因病名称降序候选输出，构建标准单基因病名称集合G；基于集合G和集合P的交集结果输出标准单基因病名称的推荐结果。

摘要： 本发明公开了一种基于液相捕获技术判定单基因病相关拷贝数缺失的方法，该方法首先通过归一化测序深度的方法查看捕获的随机性情况，对于归一化后平均深度均值偏离1，且标准差>0.5的文库通过重复建库的方法来排除随机性，然后对于随机性良好的测序文库利用bootstrap重复取样算法，通过对control区域的归一化之后的深度进行多次放回抽样，得到无缺失情况下和缺失情况下的概率密度函数。进一步利用贝叶斯原理计算该片段是否是缺失。本发明提出的方法可精确检测单基因病中相关的拷贝数缺失，并可确定具体的缺失类型；除了常规的缺失型突变类型，本方法还可以精确判定相关数据库中的所有缺失类型。

摘要： 本发明提供一种可用于无创产前单基因病检测的DNA文库的构建方法。本发明的构建测序用DNA文库的方法将加接头DNA片段进行PCR扩增、得到第一次扩增产物的步骤，将所述第一次扩增产物用所述限制性内切酶进行酶切、得到酶切产物的步骤，以及将所述酶切产物进行自身连接、得到包含双链环化产物的DNA混合物的步骤。

摘要： 本发明公开一种基于多层级结构相似度的单基因病名称推荐方法和系统，能够智能精准的推荐出所匹配的单基因病名称。该方法包括：构建单基因病的标准化临床特征表型树；将用户输入的特征集合I中的临床特征在表型树上的节点标记；遍历特征关系数据库中的第n个单基因病名称，将其对应特征集合A中的标准临床特征在表型树上的节点标记；从特征集合A中匹配出与特征集合I中每个临床特征对应的最佳标准临床特征；计算特征集合I与当前特征集合A的集合相似度值；令n＝n+1重新遍历特征关系数据库，直至特征关系数据库中的单基因病名称遍历完毕，将特征集合I与每个特征集合A对应的集合相似度值汇总排序，输出最高相似度值对应的单基因病名称。

摘要： 一种用于生物医学领域的单基因病全基因组永生基因库的构建，其特征在于，构建含新霉素抗性基因的pLXSN载体，进而构建SV40 LT‑pLXSN载体并转染sp2/0细胞，以G418筛选阳性克隆，获得永生化特性改良和新霉素抗性基因标记的sp2/0细胞，经与基因突变细胞融合，获得具有两亲代细胞遗传特性、对G418和HAT联合筛选不敏感、贮藏了基因突变细胞全基因组、能永久冻存并能在体外无限扩增的杂交瘤细胞株，将突变基因收藏于杂交瘤细胞株，又将杂交瘤细胞株收藏于杂交瘤细胞库，以及以杂交瘤细胞的无限繁殖而复制单基因病基因，由此建立单基因病全基因组永生基因库。

摘要： 本发明属于生物信息学的数据处理技术领域，公开了一种单基因病遗传变异智能解读及报告的方法、系统及服务器，在多种数据样本集上使用单基因病遗传变异芯片显著性分析方法，分别筛选出全基因组上的差异单基因病遗传变异位点；将多个样本集的单基因病遗传变异差异位点取交集，得到共同差异位点集合；计算差异单基因病遗传变异位点的单基因病遗传变异水平与相应基因表达水平间的皮尔森相关系数，识别单基因病遗传变异调控位点。本发明为针对去单基因病遗传变异的药物研制提供参考和借鉴；不同类型的疾病在单基因病遗传变异模式上的确存在共性，从全基因组角度研究单基因病遗传变异模式与疾病的关系具有现实和临床意义。

摘要： 本发明提供了一种不依赖先证者或参照者的单基因病的单体型构建方法，包括：单基因病目标区域扩增并获取基因测序数据；筛选母亲测序数据和父亲测序数据中判断子代胚胎中2条DNA链来源的SNP位点集合N1和SNP位点集合N2；提取各子代胚胎测序数据中的SNP位点集合N1‑1、SNP位点集合N2‑1；依据SNP位点杂合碱基的分布规律，判断各子代胚胎中母亲DNA链来源和父亲DNA链来源并构建子代胚胎单体型；在子代胚胎中寻找含致病突变的胚胎作为“先证者”，依据孟德尔遗传规律并结合子代胚胎单体型，判断各子代胚胎是否携带致病基因链。本发明的单体型构建方法不依赖先证者或参照者，即可准确判断子代胚胎是否携带致病基因。

摘要： 本发明公开一种单基因病名称的推荐方法和系统，能够精准、高效、全面的推荐出用户所患的单基因病名称。该方法包括：将用户输入的特征集合I中的临床特征在标准化临床特征表型树上的节点标记；遍历特征关系数据库中的第n个单基因病名称，将其对应特征集合A中的标准临床特征在标准化临床特征表型树上的节点标记；基于标准化临床特征表型树上的节点标记，从特征集合A中匹配出与特征集合I每个临床特征一一对应的最佳标准临床特征；分别计算每个临床特征与对应最佳标准临床特征链路的离散增量，并累加得到总离散增量；令n＝n+1重新遍历特征关系数据库中的第n个单基因病名称，直至特征关系数据库中的单基因病名称遍历完毕，将特征集合I与每个特征集合A对应的总离散增量汇总排序，输出最小总离散增量对应的单基因病名称。

摘要： 本发明公开一种基于多层级结构相似度的单基因病名称推荐方法和系统，能够智能精准的推荐出所匹配的单基因病名称。该方法包括：构建单基因病的标准化临床特征表型树；将用户输入的特征集合I中的临床特征在表型树上的节点标记；遍历特征关系数据库中的第n个单基因病名称，将其对应特征集合A中的标准临床特征在表型树上的节点标记；从特征集合A中匹配出与特征集合I中每个临床特征对应的最佳标准临床特征；计算特征集合I与当前特征集合A的集合相似度值；令n＝n+1重新遍历特征关系数据库，直至特征关系数据库中的单基因病名称遍历完毕，将特征集合I与每个特征集合A对应的集合相似度值汇总排序，输出最高相似度值对应的单基因病名称。