摘要:
海洋环境中拟杆菌类群分布广泛,是海洋生态系统中高分子质量溶解有机质的主要利用者和海洋环境中物质循环的重要成员,其丰度仅次于变形菌门细菌而居于第二位.但由于分离培养手段的限制,已获得培养的海洋拟杆菌较少,使得该类群的生态地位及功能的相关研究难以开展.根据2010年出版的伯杰氏系统细菌学手册第二版第四卷,拟杆菌门分为四个纲,其中拟杆菌类群分布在拟杆菌纲,拟杆菌纲只有一个目即拟杆菌目(Bacteroidales).根据目前的分类学观点,拟杆菌纲共包括27个属,其中23个属分布在拟杆菌目的5个科里,4个属是拟杆菌目位置未定的属.长期以来,研究者对于拟杆菌类群的系统学研究,主要集中在厌氧菌方面,而对非厌氧性拟杆菌类群的关注严重不足.本项研究设计了一种海洋拟杆菌富集培养的培养基,并探讨了不同富集条件下富集培养液中菌群的演替规律,得到了海洋拟杆菌富集分离的最佳富集条件.在此条件下进行了拟杆菌的富集与分离培养工作,已取得了可喜的进展.发现一批拟杆菌纲潜在的新物种,大大丰富了拟杆菌的菌种资源,为该类菌的生物学研究与资源开发奠定了基础.通过对拟杆菌纲拟杆菌目及各科、各属的生理生化特征、化学组分特征以及16S rRNA基因进行系统分析,根据本课题组分离的拟杆菌纲新菌株FH5,建议设立龙菌属和龙菌科(Dracobacteriaceae),并建议在拟杆菌纲增加设立龙菌目(Dracobacteriales).把原属于拟杆菌目的海洋滑动菌科(Marinilabiliaceae)划到新成立的龙菌目,这样龙菌目至少包括两个科.建立龙菌目首要的证据是,从系统发育树上分析,拟杆菌纲的菌株聚为两大类群.其中一个类群为拟杆菌目,包括4各科,即科Ⅰ:Rikenellaceae,科Ⅱ:Prevotellaceae,科Ⅲ:Bacteroidaceae,科Ⅳ:Porphyromonadaceae.另外一个类群建议设立龙菌目,目前看至少包括两个科,其中科Ⅰ:Marinilabiliaceae,科Ⅱ:Dracobacteriaceae.其中科Ⅱ是本课题组通过新物种的分离与分类而建议的新科.随着研究工作的进一步进行,应该会在龙菌目设立更多的科.从生理生化特征方面来看龙菌目和拟杆菌目也有重要区别,可以支持两个目的划分.