多基因

摘要： [目的]本文旨在明确江苏省句容市葡萄炭疽病菌(Colletotrichum spp.)种类和不同种群葡萄炭疽病菌对多菌灵抗性的发生频率,探索其对苯并咪唑类杀菌剂抗性的遗传变化,为抗药性治理提供理论依据。[方法]从江苏省句容市白兔镇、后白镇、华阳镇和茅山镇等地采集大量葡萄炭疽病害样本,采用单孢纯化的方法获得葡萄炭疽分离株;对供试菌株的CAL(calmodulin)、GAPDH(glyceraldehydes-3-phosphate dehydrogenase)、TUB2(β-tublin)等多基因位点进行扩增、测序并采用MEGA6.06软件以Neighbor-Joining法构建系统发育树,结合病原菌的形态特征确定其分类地位,同时统计各类病原菌的分离率;采用区分计量法对葡萄炭疽分离菌株进行多菌灵的抗性频率测定;对供试菌株的TUB2基因进行抗性位点定点扩增,在NCBI上对抗性位点序列进行比对分析。[结果]共获得51个葡萄炭疽单孢分离株,主要有C.aenigma、C.viniferum和C.fructicola 3个种,分别为27、16和8株,分离率分别为52.94%、31.37%、15.69%;51株葡萄炭疽分离菌株对多菌灵的抗性频率为43.14%;中抗菌株(MR)的突变类型为F200Y,高抗菌株(HR)的突变类型为E198A;C.aenigma全部为敏感菌株(S),C.fructicola全部为高抗菌株(HR),C.viniferum中分别有2株敏感菌株(S)和14株中抗菌株(MR)。[结论]江苏省句容市葡萄炭疽病菌至少有3个种群,分别是C.aenigma、C.viniferum、C.fructicola;葡萄炭疽病菌种群可能与苯并咪唑类杀菌剂抗药性有一定的相关性。

摘要： 为了探究茄子产量相关性状与基因间互作的遗传模型,为茄子高效育种提供理论依据,以绿圆茄“茄27”自交系为母本,紫长茄“茄31”自交系为父本,配制成F_(1)杂交组合,分别进行自交、回交,构建了P_(1)、P_(2)、F_(1)、F_(2)、B_(1)、B_(2)6个世代遗传群体,利用主基因、多基因混合分析法研究了茄子产量相关性状的遗传模型。结果表明:茄子单株产量受1对主基因的加性-显性遗传,单株结果数受2对加性主基因+加性-显性多基因混合遗传,单株最大单果质量受2对加性主基因+加性-显性多基因遗传;单株产量和单株结果数以非加性遗传为主,其中单株结果数以2对主基因加性效应遗传为主;单株最大果质量中B_(1)和F_(2)世代以主基因加性遗传为主,其主基因遗传率分别为50.48%和54.33%,B_(2)世代以多基因遗传为主,多基因遗传率为50.88%。综上可知,茄子产量性状受到加性和显性遗传效应的影响。

摘要： 目的 探讨快速床旁评估(rapid on site evaluation,ROSE)对病理诊断和基因检测优化和提升的作用.方法 通过ROSE法确诊34例肺癌作为ROSE组,即刻收集玻璃涂片中的肿瘤细胞,并行肺癌ARMS法多基因检测.另选取14例细胞量丰富的病例作为常规组,按常规流程行组织学诊断-免疫组化诊断-基因检测,比较两组不同流程下的基因检测周期.结果 34例肺癌中男性21例,女性13例.明确诊断为腺癌18例,鳞状细胞癌3例,转移性腺癌5例,小细胞癌1例;诊断为非小细胞肺癌3例,低分化癌3例,转移性低分化癌1例.ROSE组基因检测周期为0.19～6.22天,平均2.84天,常规组基因检测周期为3.00～15.03天,平均7.89天,ROSE组基因检测周期显著低于常规组(P<0.0001),且ROSE组基因检测的准确性及突变位点与常规组的结果完全一致.结论 结合ROSE技术和ARMS多基因检测法可显著优化肺癌患者病理诊断和基因检测周期,为临床选择最佳治疗方案提供保障.

摘要： 竹黄Shiraia bambusicola是一种重要的药用子囊菌,对其分类归属一直存在不同处理意见,主要原因在于形态分类学难以解释其不同的特征表现.为了对竹黄的分类地位做出更接近自然亲缘关系的解释,本研究以自测的S.bambusicolaS4201菌株基因组为基础,结合Genome Warehouse(GWH)数据库中公布的S.bambusicola GZAAS2.1243菌株和GenBank数据库中公布的Shiraia sp.slf14菌株的基因组数据,选取nrSSU、nrLSU、tef-1α和rbp2 4段序列联合分析,与国际真菌生命之树计划(Assembling The Fungal Tree of Life,AFTOL)中的74种子囊菌比较,进行目级归属的系统发育分析;选择ITS、nrLSU和tub2 3段序列联合分析,与GenBank数据库中格孢腔菌目Pleosporales的30种真菌比较,进行科级归属的系统发育分析.分别采用最大似然法(maximum likelihood,ML)和贝叶斯推断法(Bayesian inference,BI)构建系统发育树,结果支持了单独建立竹黄科的分类处理,且竹黄科应归于格孢腔菌目,竹黄属中可能有隐存种.

摘要： '芽黄'红瑞木炭疽病在上海普遍发生.本研究从上海迪士尼园区采集疑似炭疽病的红瑞木病叶,进行了分离培养,获得2种培养形态的炭疽菌,致病性测定证明其为致病菌.联合核糖体转录间隔区、3-磷酸甘油醛脱氢酶、钙调蛋白和β微管蛋白2多基因序列,使用最大似然法和贝叶斯分析法分别构建了多基因系统进化树.结果 显示,分离获得的2株炭疽菌菌株分别与暹罗炭疽菌Colletotrichum siamense和胶孢炭疽菌C.gloeosporioides聚集在一个分支,辅以形态学特征,鉴定引起'芽黄'红瑞木炭疽病的病原菌为暹罗炭疽菌和胶孢炭疽菌,这是国内关于红瑞木炭疽病的首次报道.

摘要： 从云南省昆明市的竹根七Disporopsis fuscopicta病害叶片上分离获得2株刺盘孢属Colletotrichum真菌.分子系统学研究发现这2个菌株属于1个种并归属于Spaethianum复合种,该种与山麦冬刺盘孢Colle-totrichum liriopes Damm,P.F.Cannon & Crous亲缘关系近.形态学比较显示所描述的种与C.liriopes相比分生孢子更宽但附着胞更短,因此将其鉴定为新种,并命名为竹根七刺盘孢,即C.disporopsis sp.nov.

摘要： 目的研究联合检测粪便中sFRP2、Vimentin和HPP1基因甲基化状态在结直肠癌早期筛查中的应用。方法将杭州市第三人民医院2017年10月-2019年10月期间收治的结直肠癌患者60例为结直肠癌组,由腺瘤性息肉患者60例及正常健康人30例组成非结直肠癌组(90例),收集清晨粪便标本,提取粪便DNA,并进行亚硫酸氢盐修饰处理,采用甲基化特异性PCR检测sFRP2、Vimentin和HPP1基因甲基化状态,分析其与结直肠癌临床病理特征的关系,比较3个基因联合检测诊断敏感度及特异度。结果在结直肠癌患者中,检测sFRP2、Vimentin和HPP1单基因甲基化敏感度分别为46.7%、43.3%、53.3%,特异度分别为73.3%、75.6%、76.7%;联合组以3个基因中任1个基因甲基化表达阳性判为阳性,联合检测诊断结直肠癌的敏感度为83.3%,特异度为46.7%,敏感度均高于sFRP2、Vimentin和HPP1单基因甲基化检测。3个基因甲基化状态与结直肠癌患者的性别、年龄、肿瘤部位、淋巴结转移及TNM分期均无关(均P>0.05)。结论在结直肠癌患者粪便DNA中sFRP2、Vimentin和HPP1基因异常甲基化发生率明显高于非结直肠癌患者,联合检测粪便多基因筛查结直肠癌优于单基因检测,在结直肠癌早期筛查应用中具有重要意义。

摘要： CRISPR/Cas9是一种新型的基因组定向编辑技术,近年来在烟草基因组的定向编辑中得到了广泛应用.CRISPR/Cas9介导的多基因编辑技术在许多物种中表现出很大的潜力,为了探索CRISPR/Cas9介导烟草多基因编辑的技术体系,本文针对烟草PCS1、HMA2、eIF4E、TOM3、TOM15个不同性状相关的基因构建了多靶点敲除的CRISPR/Cas9系统,并借助农杆菌介导的遗传转化技术转化烟草品种K326.对阳性植株的筛选、靶位点基因组的PCR扩增与测序分析表明,构建的CRISPR/Cas9多基因编辑系统成功转化到烟草中,能够同时靶向突变5个基因.5个基因同时突变的检出率为53.8％,单基因的突变检出率在76.9％ 与92.3％ 之间.进一步的脱靶检测分析显示,在所预测脱靶的候选位点上均未发生脱靶现象.本文构建的CRISPR/Cas9多基因编辑系统可将多个基因进行有效突变,为烟草基因功能研究和基于CRISPR/Cas9技术的多性状改良奠定了基础.

摘要： 研究以绿壳蛋鸡黑羽纯系和白来航鸡为亲本构建资源群体,测定亲本P1、P2和F1、F2代40周龄时的蛋壳重、蛋壳强度和蛋形指数,运用数量性状主基因+多基因混合遗传模型软件SEA-G4F2对40周龄蛋壳重、蛋壳强度和蛋形指数进行遗传分析.结果表明:40周龄蛋壳重、蛋壳强度和蛋形指数的遗传模型均为模型E,即两对加性-显性-上位性主基因+加性-显性-上位性多基因混合遗传模型,其对应的主基因遗传率分别为12.33％、13.21％和14.13％.各个性状所对应的多基因遗传力均为0.

摘要： 利用主基因+多基因混合遗传模型研究方法，对高丹草2002GZ-1和2002GB-1杂交组合的5个世代(P1、P2、F1、F1、F23)群体的产量性状进行联合分析。结果表明：单株产量的遗传受两对加性-显性-上位性主基因+加性-显性多基因(E-1)控制，性状的遗传符合两对主基因+多基因混合遗传模型，主基因对单株产量的表现起主要作用。单株产量主基因的加性和显性效应分别为12.56、5.38和9.92、-1.09，多基因分别为5.12和2.46，F2和F23的主基因遗传率分别为71.79％和85.35％。说明该性状是以主基因遗传为主，可以在早期世代进行选择。

摘要： [目的]探讨南京地区汉族人群胃癌遗传易感基因进行多基因危险度评价。[方法]采用1：1配对病例对照研究方法，收集南京市汉族人群原发性胃癌患者585例和相应非肿瘤患者为研究对象，应用分子生物学PER-RFLP和AS-PCR技术分析CYP2E1、GSTM1、GSTT1、NAT2、ALDH2、MTHFR、XRCCI、IL-1β、VDR、TNF等基因型别；以条件logistic回归模型对基因，基因间的交互作用进行分析，选出易感基因，并利用一种新的统计模型对选取出的危险因素进行多基因危险度评价。[结果]原发性胃癌遗传易感因素有8项，分别是CYP2E1(c1/c1)，NAT2表型(慢乙酰化型，MTHFRA1298C(A/C)，IL-1β(C/T)NAT2M2(A/A)，XRCC194(T/T)，NAT2M1(T/T)，VDR TaqI(T/T)等在胃癌发生的作用有统计学意义。通过对多基因危险度评价分析，可以更直观的发现多基因组合的OR值与其基因频率存在高度相关性即随易感基因的增加，易感基因组合危险度分布曲线会向更加危险的方向移动。[结论]通过基因间的交互作用分析和多基因危险度评价方法可更有效的评价多基因的危险度，以推进对易感人群的识别和保护。

摘要： 草地早熟禾、高羊茅和多年生黑麦草都是最广泛种植的冷季型草坪草种。本研究的目的是通过基因工程的方法将SOS1、SOS2、SOS3、CBL10基因转入草地早熟禾、高羊茅和多年生黑麦草，提高其耐盐、耐低温或抗旱能力。rn 实验结果表明，建立和优化了草坪草遗传转化体系，取得了比较理想的转化效果，形成了减少农杆菌污染和提高转化效率的技术，获得的转基因植株的抗旱耐盐能力较野生型对照有一定的提高。

摘要： 由于基因诊断技术的不断发展,人们从遗传学和分子生物学的水平上对骨质疏松的发病机理有了更多的了解.本文综述了骨量与遗传因素的关系、基因多态性检测的原理、骨量的多基因控制等,旨在为基础研究和临床诊断提供参考.

摘要： 本发明提供了一种多基因检测用的探针库，其包括针对与多种肿瘤治疗相关的多个基因而设计的多条捕获探针，多个基因至少包括与化疗药物相关的单核苷酸多态链所在的基因、靶向药物相关基因、以及用于免疫治疗的微卫星稳定性相关的基因和病毒基因，针对单核苷酸多态链所在的基因而设计的探针包括SEQ ID NO︰1‑SEQ ID NO︰5，针对靶向药物相关基因而设计的探针包括SEQ ID NO︰6‑SEQ ID NO︰10，针对微卫星稳定性相关的基因而设计的探针包括SEQ ID NO︰11‑SEQ ID NO︰15，针对病毒基因而设计的探针包括SEQ ID NO︰16‑SEQ ID NO︰19。根据本公开能够提供一种能够检测基因变异的多基因检测用的探针库。

摘要： 本发明公开了一种多基因组装载体系统及其多基因组装方法。该系统包括1类接受载体、2类供给载体、以及可选择使用的能发生筛选标记自删除的供给质粒。该系统利用Cre/loxP重组系统和两组突变型loxP的不可逆重组位点，在Cre酶作用下，以野生型loxP位点的重组来实现供给载体整合到接受载体中，然后其一组突变型loxP的不可逆重组自动删除供给载体的骨架，只留下目的基因在接受载体上；重复2类供给载体交替与接受载体的组装，就能实现多基因的快速组装。本发明是目前最简单高效的多基因载体系统。因此本发明对重要的、复杂生物合成途径和重要农艺性状的多基因遗传工程操作提供了可操作的技术平台，具有重要的应用价值。

摘要： 本发明公开了一种微藻多基因共表达载体，所述表达载体的开放阅读框，采用Ubi启动子、Nos启动子或Hsp70A启动子；目的基因之间以2A肽序列连接并构建在所述表达载体的一个开放阅读框中。

摘要： 本发明公开了一种热休克蛋白基因启动子和四环素基因启动子控制的多基因表达和沉默系统，同一质粒系统中热休克基因启动子HSPP与四环素基因启动子TETp互不影响，各自独立控制其下游的目的基因或shRNA的表达，既可人为控制单独一个基因或shRNA的表达，也可人为控制两个基因或shRNA共同表达。本发明为多基因特异性协调控制提供了条件，解决了目前采用多质粒共转染方法实现基因共表达所带来的表达效率低的问题，并且采取慢病毒搭载系统可以在难转染的细胞中实现选择性基因或shRNA的高效表达，满足了各种实验的需要，同时提供多基因靶点控制平台，为基因治疗提供更多的可能性。

摘要： 本发明提供了一种多基因检测用的探针库，其包括针对与多种肿瘤治疗相关的多个基因而设计的多条捕获探针，多个基因至少包括与化疗药物相关的单核苷酸多态链所在的基因、靶向药物相关基因、以及用于免疫治疗的微卫星稳定性相关的基因和病毒基因，针对单核苷酸多态链所在的基因而设计的探针包括SEQ ID NO︰1‑SEQ ID NO︰5，针对靶向药物相关基因而设计的探针包括SEQ ID NO︰6‑SEQ ID NO︰10，针对微卫星稳定性相关的基因而设计的探针包括SEQ ID NO︰11‑SEQ ID NO︰15，针对病毒基因而设计的探针包括SEQ ID NO︰16‑SEQ ID NO︰19。根据本公开能够提供一种能够检测基因变异的多基因检测用的探针库。

摘要： 本发明公开了一种多基因组装载体系统及其多基因组装方法。该系统包括1类接受载体、2类供给载体、以及可选择使用的能发生筛选标记自删除的供给质粒。该系统利用Cre/loxP重组系统和两组突变型loxP的不可逆重组位点，在Cre酶作用下，以野生型loxP位点的重组来实现供给载体整合到接受载体中，然后其一组突变型loxP的不可逆重组自动删除供给载体的骨架，只留下目的基因在接受载体上；重复2类供给载体交替与接受载体的组装，就能实现多基因的快速组装。本发明是目前最简单高效的多基因载体系统。因此本发明对重要的、复杂生物合成途径和重要农艺性状的多基因遗传工程操作提供了可操作的技术平台，具有重要的应用价值。

摘要： 本发明公开了一种微藻多基因共表达载体，所述表达载体的开放阅读框，采用Ubi启动子、Nos启动子或Hsp70A启动子；目的基因之间以2A肽序列连接并构建在所述表达载体的一个开放阅读框中。

摘要： 本发明公开了一种热休克蛋白基因启动子和四环素基因启动子控制的多基因表达和沉默系统，同一质粒系统中热休克基因启动子HSPP与四环素基因启动子TETp互不影响，各自独立控制其下游的目的基因或shRNA的表达，既可人为控制单独一个基因或shRNA的表达，也可人为控制两个基因或shRNA共同表达。本发明为多基因特异性协调控制提供了条件，解决了目前采用多质粒共转染方法实现基因共表达所带来的表达效率低的问题，并且采取慢病毒搭载系统可以在难转染的细胞中实现选择性基因或shRNA的高效表达，满足了各种实验的需要，同时提供多基因靶点控制平台，为基因治疗提供更多的可能性。

摘要： 本发明公开了植物单基因或多基因CRISPR激活技术的载体及构建方法、应用，所述载体为能表达sgRNA的TRV2载体；TRV2载体内包含表达sgRNA2.0的模块proPeBV‑BsaI‑BsaI‑sgRNA2.0，序列如SEQ ID NO.9所示；其中，两个BsaI位点为sgRNA插入位点，采用序列如SEQ ID NO.10和SEQ ID NO.11所示的引物扩增SEQ ID NO.9序列，并插入到TRV2载体多克隆位点，获得表达sgRNA2.0模块的TRV2‑SG2.0。本发明所述载体只需完成一次番茄遗传转化，获得SlAct3.0line植株后，仅需针对不同的靶标基因构建含有靶向其启动子区sgRNA的TRV2载体，并侵染SlAct3.0line植株，在3周内即可快速高效的获得不同靶基因的过表达植物材料，而通过传统的遗传转化获得基因过表达植株则需要将近1年的时间，因此该方法更加快捷高效，省时省力，极大缩短了试验周期。

摘要： 本发明提供一种多基因遗传病症风险基因和风险突变的筛选方法，包括筛选已知的遗传危险因素和筛查研究样本中的风险变异；所述风险变异基于不同的基因集制定3种不同的过滤策略，分别为过滤策略1、过滤策略2和过滤策略3；所述过滤策略1为确证与待检多基因遗传病症相关的基因的突变筛选过滤策略；所述过滤策略2为可能与待检多基因遗传病症相关的基因的突变筛选过滤策略；所述过滤策略3为其他基因的突变筛选过滤策略。本发明解决了现有技术中对多基因遗传病症风险基因和风险突变的筛选存在错筛、漏筛，精确度需进一步提升的技术问题。