主基因

摘要： 为了探究茄子产量相关性状与基因间互作的遗传模型,为茄子高效育种提供理论依据,以绿圆茄“茄27”自交系为母本,紫长茄“茄31”自交系为父本,配制成F_(1)杂交组合,分别进行自交、回交,构建了P_(1)、P_(2)、F_(1)、F_(2)、B_(1)、B_(2)6个世代遗传群体,利用主基因、多基因混合分析法研究了茄子产量相关性状的遗传模型。结果表明:茄子单株产量受1对主基因的加性-显性遗传,单株结果数受2对加性主基因+加性-显性多基因混合遗传,单株最大单果质量受2对加性主基因+加性-显性多基因遗传;单株产量和单株结果数以非加性遗传为主,其中单株结果数以2对主基因加性效应遗传为主;单株最大果质量中B_(1)和F_(2)世代以主基因加性遗传为主,其主基因遗传率分别为50.48%和54.33%,B_(2)世代以多基因遗传为主,多基因遗传率为50.88%。综上可知,茄子产量性状受到加性和显性遗传效应的影响。

摘要： [目的]本文旨在探究高粱株型相关性状的遗传方式。[方法]以7050B×Tx2925B,01-26B×7009B,7037×矮四和LTR108×LR625为亲本构建了4个F_(2)代群体,分别测定全株叶面积,叶片数,株高,穗长,柄伸长度和穗柄长度六个株型相关性状,并利用单个分离世代分析方法研究上述性状的遗传规律。[结果]正态分布检验表明3个群体(7050B×Tx2925B,01-26B×7009B,7037×矮四)的叶面积,7037×矮四群体和LTR108×LR625群体的穗长和穗柄长度均符合正态分布。7050B×Tx2925B群体、01-26B×7009B群体和7037×矮四群体叶面积,4个群体的叶片数和柄伸长度,01-26B×7009B群体,7037×矮四群体和LTR108×LR625群体株高,7050B×Tx2925B群体和LTR108×LR625群体的穗长均受两对主基因控制。7050B×Tx2925B群体的株高则受1对主基因控制,01-26B×7009B群体和7037×矮四群体的穗长和四个群体的穗柄长度中均未检测到主基因的存在。叶片数,株高和柄伸长度等性状的主基因遗传率较大,可以在早代进行改良和选择。[结论]本研究为株型相关性状的QTL定位和基因挖掘工作提供了理论基础,对高粱理想株型育种具有重要价值和意义。

摘要： 旨在验证并丰富家蚕茧层率性状的遗传规律,为培育高茧层率的家蚕纯种提供理论依据。以高丝量品种‘菁松’‘、皓月’和中丝量品种‘芙蓉’‘、湘晖’为亲本,构建5世代遗传群体,运用多世代联合分析方法分析茧层率的遗传规律。结果表明:家蚕茧质性状具有明显的性别效应,雄性茧层率大于雌性;亲本的茧层率性状与茧层量呈显著正相关;F1代的茧层率介于两亲本之间,反交组合茧层率高于正交组合;回交群体的频数呈双峰或偏态的单峰分布;茧层率的杂种优势率在-3.82%~5.63%之间,几乎没有杂种优势。研究得出结论为茧层率高值对低值为显性,呈偏母本遗传,遗传体系中存在主基因,可能存在于性染色体上。

摘要： 以大果刺黄瓜自交系CNS5和小果刺黄瓜自交系RNS4为亲本,构建P1、F1、P2、B1、B2和F26世代群体,利用主基因+多基因混合遗传模型多世代联合分析法,对连续两季的黄瓜果刺大小的表型值(基座直径)进行遗传分析,以探究黄瓜果刺大小性状的遗传规律.结果表明,黄瓜果刺大小的遗传符合C-0模型,即加性-显性-上位性多基因混合遗传模型.多基因加性和显性效应均为正向,基因上位性效应累计为正向.2016~2017年连续两季F2群体中多基因遗传率分别是79.21%和71.25%,相对较高,环境效应分别为20.79%和28.75%,影响较小.在基因定位策略上,选择高代回交群体效果会更好.%In order to explore the genetic law of cucumbers fruit spine base size,this paper took 2 cucumber inbred lines CNS5 with large fruit spine base and RNS4 with small fruit spine base as parents to construct 6 generations:P1,F1,P2,B1,B2 and F2;and utilized the major gene + polygene mixed inheritance model to analyze the phenotypic values of cucumber fruit spine base size.The results indicated that inheritance of cucumber fruit spine base size conforms to C-0 model,namely additivity-dominance-epistasis polygene model.Multi-gene additive,dominant and epistatic effects were all positive.Additionally,the polygene inheritabilities in F2 from 2016 and 2017 were 79.21% and 71.25%,respectively,which was relatively higher.The environmental effects in F2 was 20.79% and 28.75%,respectively,which had relatively smaller influence.Therefore,this study has provided a foundation for exploring genes related to fruit spine base size.As strategy for gene mapping,selecting high generation backcross populations will have better effect.

摘要： 柞蚕茧产量是柞蚕最重要的性状之一,为了探明产量性状的遗传构成,应用数量性状基因位点(Q T L)检测体系的主-微位点组遗传分析方法,对7个亲本及其21个杂交组合进行了遗传分析.结果表明,柞蚕的产茧量是由3对主基因和微效多基因构成,其中主基因遗传率为48.52％,多基因遗传率为12.39％.遗传效应分析结果表明,主位点组杂合显性效应所占的比例远大于加性效应,说明对于柞蚕茧产量性状应多利用其杂交优势用于生产.同时筛选出了可用于生产的产量性状优良的杂交组合P1×P5、P1×P6、P2×P3和用于品种改良的杂交组合P1×P3.

摘要： 为给小麦遗传育种中产量性状改良提供参考,利用相关性分析和植物数量性状主效基因与微效多基因混合遗传模型对(宁麦9号×镇麦168)F_2代162个单株的有效穗数、株高、穗长、总小穗数、穗粒数以及单株粒重进行了联合分离分析。结果表明,该群体农艺性状均属于受多基因控制的数量性状,其中有效穗数和单株粒重仅受微效多基因调控,株高和总小穗数符合"两对加性-显性-上位性主基因"+"加性-显性多基因"混合遗传,而穗长和穗粒数则符合"两对加性主基因"+"加性-显性多基因"混合遗传。株高、穗长和总小穗数3个性状的主基因遗传力分别为64.98%、51.22%和47.12%,可能存在效应较大的QTL。

摘要： 为比较广东地方晒烟品种GDSY-1和传统抗源DB101的青枯病抗性与遗传规律,于2011—2016年在温室和大田、苗期和成株期共7次对GDSY-1、DB101和长脖黄(感病品种)等3个品种的青枯病病情进行调查,并配制组合GDSY-1×长脖黄、DB101×长脖黄和GDSY-1×DB101,对其P1、P2、F1和F2代群体的青枯病发生情况进行比较,利用主基因+多基因混合遗传模型联合分析方法进行遗传分析.结果表明,GDSY-1的青枯病抗性优于DB101;DB101的抗性遗传以加性效应为主,符合2对加性主基因+加性-显性多基因模型(E-4),主基因遗传率低;GDSY-1的抗性遗传表现为部分显性,符合2对加性-显性-上位性主基因+加性-显性-上位性多基因模型(E-0),第1对主基因的加性效应值和显性效应值分别为?2.6909和?2.6909,抗病对感病完全显性,第2对主基因的加性效应值和显性效应值分别为?1.2194和?0.2307,抗病对感病呈部分显性,2对主基因存在互作效应,主基因遗传率高,为85.02%.GDSY-1的抗性遗传显性程度高、主基因遗传率高,具有较大的育种利用价值.%In order to clarify the mode of inheritance of resistance to bacterial wilt disease, genetic analysis was performed under major gene+polygene mixed inheritance model using the P1, P2, F1 and F2 populations of three crosses among GDSY-1, DB101 and Changbohuang. GDSY-1, a Chinese domestic sun-cured cultivar, was newly identified to have high resistance to bacterial wilt caused by Ralstonia solanacearum. DB101 is a USA cultivar, carrying the polygenic resistance derived from T.I.448A. Changbohuang, a Chinese domestic flue-cured cultivar, was susceptible to bacterial wilt. The results indicated that GDSY-1 was considerably more resistant than DB101. The inheritance of DB101 resistance showed mainly additive effects, conforming to the two adding major genes plus additive-dominance polygene model (E-4). The inheritance of GDSY-1 was partially dominant, conforming to the two additive-dominance-epistatic major gene plus additive -dominance-epistatic polygene model (E-0). The additive and dominant effect values of the first major gene were -2.6909 and -2.6909, with the resistance being completely dominant. The additive and dominance effect values of the second major gene were -1.2194 and -0.2307, with the resistance being partially dominant. The heritability of major genes was 85.02%.

摘要： 为明确豇豆始花节位的遗传规律,应用数量性状的主基因+多基因遗传模型6世代联合分析方法,调查豇豆杂交组合‘Ju08-10’ב丰豇10号’的6个世代始花节位。利用南京农业大学章元明教授提供的植物主基因+多基因遗传分析软件,计算最适合的遗传模型及相应的遗传参数。结果显示,‘Ju08-10’ב丰豇10号’杂交组合的始花节位遗传符合加性-显性-上位性多基因模型,无主基因存在,F2群体多基因遗传率为71.64%,环境方差占表现型方差的比例为28.36%,说明豇豆始花节位是多基因控制的数量性状,始花节位易受环境因素的影响,早熟性(较低的始花节位)可以通过杂交后代选择实现,但定向选择会有较好的效果。

摘要： 研究以绿壳蛋鸡黑羽纯系和白来航鸡为亲本构建资源群体,测定亲本P1、P2和F1、F2代40周龄时的蛋壳重、蛋壳强度和蛋形指数,运用数量性状主基因+多基因混合遗传模型软件SEA-G4F2对40周龄蛋壳重、蛋壳强度和蛋形指数进行遗传分析.结果表明:40周龄蛋壳重、蛋壳强度和蛋形指数的遗传模型均为模型E,即两对加性-显性-上位性主基因+加性-显性-上位性多基因混合遗传模型,其对应的主基因遗传率分别为12.33％、13.21％和14.13％.各个性状所对应的多基因遗传力均为0.

摘要： 利用主基因+多基因混合遗传模型研究方法，对高丹草2002GZ-1和2002GB-1杂交组合的5个世代(P1、P2、F1、F1、F23)群体的产量性状进行联合分析。结果表明：单株产量的遗传受两对加性-显性-上位性主基因+加性-显性多基因(E-1)控制，性状的遗传符合两对主基因+多基因混合遗传模型，主基因对单株产量的表现起主要作用。单株产量主基因的加性和显性效应分别为12.56、5.38和9.92、-1.09，多基因分别为5.12和2.46，F2和F23的主基因遗传率分别为71.79％和85.35％。说明该性状是以主基因遗传为主，可以在早期世代进行选择。

摘要： 主基因是指对数量性状产生巨大效应的单个基因或位点。生长发育性状是羊的重要的经济性状，羊生长发育状况的好坏直接影响到其经济价值。随着分子生物学的发展，很多控制动物经济性状的主基因被发现。另外羊的生长发育性状如出生重、断奶重、成年体重等多是数量性状。数量性状最明显的特征是受多基因控制，并且易受环境因素的影响。因此，目前对数量性状的研究主要是从众多的基因中挑选出作用较大的主基因作为研究对象。在羊的主基因研究方面已经发现了影响羊繁殖、肉质及生长发育等经济性状的主基因。主基因被分离后，通过有力基因型的固定以及标记辅助选择，可获得大大超过常规选择的进展，使育种目标尽快得以实现，从而产生巨大的经济效益。文章仅就影响羊生长发育的几个主基因的研究进展作简要阐述，以期为育种实践提供科学的理论依据。

摘要： 众所周知,鉴别数量性状的主基因一直是数量遗传学领域的重要研究内容之一.近年来已经发展出了多种探测主基因的方法,其中基于混合分布理论的分离分析方法是目前最常用的主基因检测方法之一,已发展到了对多个不同遗传结构群体的主基因分析方法.然而,已有的分离分析方法均是基于单一性状进行的,忽略了性状之间的遗传和环境相关信息.本文在单个性状主基因分离分析的基础上,根据多个相关数量性状的主基因+多基因遗传模型,首次提出利用多个数量性状的相关信息进行主基因检测、主基因效应与变异估计的联合分离分析方法.该方法对分离群体任一个体在k个性状上的表型值向量建立主基因+多基因的统计遗传模型,运用联合分离分析方法求得分离群体n个独立观察值向量的联合似然函数,以EM算法实现的极大似然估计方法进行主基因的效应和变异估计,以似然比统计量进行主基因的各种遗传假设检验,包括有无主基因分离、是否一对主基因分离以及主基因是否仅控制性状1或仅控制性状2的表达.模拟研究以F2群体两个相关数量性状主基因的联合检测为例,供试因素有主基因遗传力(h2)和样本容量(n),各设置3个水平,共9个处理,每处理均重复模拟200次.本文考虑两套模拟方案:(1)某一主基因同时控制两个性状的表达.设该主基因对性状1的作用表现为超显性,对性状2的作用表现为部分显性.各性状的剩余方差根据设定的主基因遗传力以及主基因遗传方差σ28确定,剩余协方差则根据剩余相关系数以及剩余方差确定.(2)某一主基因仅控制性状2的表达.两种方案参数设置相同,其区别为该主基因对性状1无作用.此时性状1的表型变异完全由剩余变异造成,其剩余方差设定同性状2.两套方案下的9个处理均按:本文发展的多性状联合分析和单性状单独分析两种方法进行.模拟结果可以看出:(1)不论是模拟方案1还是模拟方案2,尽管随着遗传力和样本容量的增大,主基因的被发现能力随之增大,但从两者的作用效能上来看,遗传力的作用明显大于样本容量.(2)相较于单一性状的单独分析,本文的联合分析方法对主基因的发现能力有着极明显的提高.例如,在模拟方案1,即使在低遗传力和小样本容量(h2=30﹪、n=200)时,联合分析对主基因的检测功效已达100﹪,而两个性状单独分析的统计功效则仅有11﹪和7﹪.同样,方案2的结果也有同样趋势.(3)特别值得注意的是,在模拟方案2中,即使该主基因仅控制性状2的表达,但由于联合分析充分利用了性状之间的剩余相关信息,因此主基因的被发现能力相较于性状2的单独分析,仍有大幅提高.例如,在同样低遗传力(h2=30﹪)和小样本容量(n=200)下,联合分析时对该主基因的检测能力高达45.5﹪,而对性状2的单独分析,该主基因的被发现能力仅为11.5﹪.由此说明,充分利用数量性状之间的剩余相关信息,可以显著提高主基因的被发现能力,而不论该主基因是同时控制多个性状的表达、还是仅控制其中一个性状的表达.(4)从主基因效应以及剩余变异的估计值的准确度和精确度来看,无论表3还是表4均表现出一般的趋势,即:随着h2和n的增大,其准确度和精确度均随着提高.而且通常来说,只要主基因的检测功效高达50﹪以上,其相应估计值的准确度和精确度均可达到较理想水平.由此也说明,主基因分析的关键是如何提高其被发现能力.本文在模拟研究的基础上以水稻杂交组合多蘖矮×中花11的F2群体597个植株株高和分蘖数为例演示了分析程序.结果表明该组合的株高和分蘖数受同一主基因控制.该主基因对株高的加性和显性效应分别为-21.3cm和40.6cm,表现为超显性;对分蘖数的加性和显性效应则分别为22.7和-25.3,表现为接近完全显性.

摘要： 本文将印迹基因考虑为控制其对应性状的主基因,并分析了父系印迹与母系印迹两种情况;利用蒙特卡罗方法结合VBA编程,分别模拟了表型值选择、BLUP法选择和真实育种值法选择;按照不同的参数组合,模拟了15个世代的选择过程,用到遗传力、遗传方式、初始基因频率、公畜选留个数、印迹效应值5个参数.结果表明,表型值选择方法好于BLUP法和真实育种值法;三种方法经6个世代的选择后出现差异;BLUP法较其他两种方法更不利于控制群体近交系数.

摘要： 本发明公开了一种新颖的大规模锚定并行测序技术，其可用于分离和测序整合序列、从而鉴定宿主基因组中HBV基因整合的重复靶基因；本发明还公开了用于实施该技术的试剂盒；本发明还公开了6个新的被HBV重复整合的基因、以及相关的试剂盒。

摘要： 一种流感病毒相关宿主基因突变体的筛选方法，属于随机突变技术领域。为了筛选出与流感病毒相关的宿主基因，本发明提供了一种筛选方法：1)用CAG‑tTA质粒转染人肺癌细胞株，获得稳定表达且受四环素调控的转录激活因子的Tet‑off细胞株；将基因搜寻载体和有效表达转座酶的质粒共转染所述Tet‑off细胞株，获得全基因组肺上皮细胞基因突变文库；2)利用H1N1‑WSN流感病毒感染步骤1)获得的突变文库；3)提取步骤2)中获得的抗H1N1‑WSN流感病毒的细胞株基因组DNA，经Splinkette PCR，测序获得流感病毒相关宿主基因突变体。本发明可用于流感病毒相关宿主基因突变体的筛选。

摘要： 本发明涉及生物技术领域，具体公开了一种单细胞水平检测HIV整合位点及对应HIV‑宿主基因组相互作用的方法，包括以下步骤：透化宿主细胞的细胞膜和细胞核膜，利用限制性内切酶将细胞内DNA进行片段化；使空间上邻近的DNA片段末端和T‑linker发生邻近连接；打断、提纯DNA，构建DNA文库，使用针对HIV LTR的特异性引物进行巢式PCR，获得巢式PCR产物，富集含有LTR的互作信息；通过带有N5序列的N5_REV_LTR2引物和N7短引物对巢式PCR产物进行扩增建库，测序并分析数据，解析细胞中整合位点信息，对应整合位点上HIV LTR与宿主基因组间发生的染色质相互作用信息。

摘要： 本发明公开了一种新颖的大规模锚定并行测序技术，其可用于分离和测序整合序列、从而鉴定宿主基因组中HBV基因整合的重复靶基因；本发明还公开了用于实施该技术的试剂盒；本发明还公开了6个新的被HBV重复整合的基因、以及相关的试剂盒。

摘要： 本发明公开了一种基于CRISPR‑Cas系统组合物特异减少或去除宿主基因组DNA的宏基因组提取方法。本发明旨在提供一种在宏基因组测序中降低宿主基因组DNA背景、提高其余微生物有效测序数据的技术。所述方法中的CRSIPR‑Cas系统包括多个crRNA或crRNA/tracrRNA衍生物、以及带有生物素标记的核酸内切酶活力缺失的Cas蛋白或其变体蛋白。crRNA或crRNA/tracrRNA衍生物的序列与宿主基因组DNA中的重复序列Alu元件区域(靶序列)互补，借此引导核酸内切酶活力缺失的Cas蛋白或其变体结合在宿主基因组DNA上，再通过加入包被有链霉亲和素的磁珠捕获CRISPR‑Cas系统和其结合的宿主DNA，以此消减样品溶液中的宿主基因组DNA的浓度，并提高其他非宿主基因组DNA的核酸的丰度。

摘要： 本发明涉及生物技术领域，具体公开了一种单细胞水平检测HIV整合位点及对应HIV‑宿主基因组相互作用的方法，包括以下步骤：透化宿主细胞的细胞膜和细胞核膜，利用限制性内切酶将细胞内DNA进行片段化；使空间上邻近的DNA片段末端和T‑linker发生邻近连接；打断、提纯DNA，构建DNA文库，使用针对HIV LTR的特异性引物进行巢式PCR，获得巢式PCR产物，富集含有LTR的互作信息；通过带有N5序列的N5_REV_LTR2引物和N7短引物对巢式PCR产物进行扩增建库，测序并分析数据，解析细胞中整合位点信息，对应整合位点上HIV LTR与宿主基因组间发生的染色质相互作用信息。

摘要： 本发明属于生物技术领域，具体涉及一种用于敲除cFOS宿主基因的质粒，所述质粒为连接有sgRNA的载体，所述sgRNA包括添加有Bbsl酶切位点的sgRNA‑F和sgRNA‑R；sgRNA‑F如核苷酸序列SEQ ID NO：1所示；sgRNA‑R如核苷酸序列SEQ ID NO：2所示。此外还公开了敲除了cFOS宿主基因的人肺癌细胞系H1299及其制备方法和用途。本发明通过上述方案得到的H1299细胞系对于cFOS宿主基因的把控更为稳定，能够更确切的为cFOS基因及其调控基因的全功能研究。

摘要： 本发明提供了一种同时检测病原菌和宿主基因表达量的测序方法及在细菌性脑膜炎诊断和预后中的应用，涉及生物测序技术领域。本发明提供了一种同时检测病原菌和宿主基因表达量的测序方法，可以同时检测脑脊液中病原菌序列及宿主基因表达量，不仅能够用于检测病原体诊断细菌性脑膜炎，并得到了新的与细菌性脑膜炎预后相关的宿主基因标志物CXXC4、XPNPEP2、IGSF1和ND4L基因，同时基于宿主表达量建立了细菌性脑膜炎不良预后预测模型，经试验证实，本发明所述模型有助于临床诊断细菌性脑膜炎患者并尽早识别具有不良预后风险的细菌性脑膜炎患者，从而及时采取干预措施，改善患者预后。

摘要： 一种流感病毒相关宿主基因突变体的筛选方法，属于随机突变技术领域。为了筛选出与流感病毒相关的宿主基因，本发明提供了一种筛选方法：1)用CAG‑tTA质粒转染人肺癌细胞株，获得稳定表达且受四环素调控的转录激活因子的Tet‑off细胞株；将基因搜寻载体和有效表达转座酶的质粒共转染所述Tet‑off细胞株，获得全基因组肺上皮细胞基因突变文库；2)利用H1N1‑WSN流感病毒感染步骤1)获得的突变文库；3)提取步骤2)中获得的抗H1N1‑WSN流感病毒的细胞株基因组DNA，经Splinkette PCR，测序获得流感病毒相关宿主基因突变体。本发明可用于流感病毒相关宿主基因突变体的筛选。

摘要： 本实用新型公开了一种用于提取粪便源动物宿主基因组DNA的前处理装置，包括收集管，固定圈，过滤管和推拉活塞；固定圈可拆卸地安装于收集管侧壁顶部，并且固定圈上具有用于固定过滤管的固定部；过滤管侧壁和底部具有微米级滤孔，过滤管安装于固定部上并且架设在收集管内；推拉活塞包括依次连接的推拉部、推拉杆和活塞部，活塞部与过滤管内壁相适配。本实用新型结构简单，拆卸组装、使用方便，适用粪便样品的处理。