数量遗传学

摘要： 方宗熙,曾当选为全国人大代表、山东省政协副主席,原山东海洋学院(中国海洋大学前身)副院长。他在细胞遗传学、数量遗传学与遗传育种学方面的一系列重要发现,为我国海洋生物遗传学的建立和发展作出卓越贡献,被誉为“中国海洋生物遗传学和育种学奠基人”。

摘要： 数量遗传学是作物遗传育种专业研究生培养的重要课程.为提高该课程的教学效果,进而提高该专业研究生的培养质量,本文通过分析数量遗传学教学现状及存在的问题,提出了相应的改革措施,探讨了提高课程教学效果的途径和方法,包括调整教学内容、改进教学方法、提高学生综合素质等.并通过一轮教学改革实践,取得了一定的效果.

摘要： 为探究动物遗传育种技术的发展历程,本文依据目前动物遗传育种的发展主线,结合畜禽育种现状,从传统育种技术到现代生物技术发展趋势进行阐述,并对各类育种技术的优缺点进行了归纳和比较,以期对从事动物遗传育种的工作人员提供一些思路和借鉴.

摘要： 《植物研究》1959年创刊是,是由东北林业大学主办,科学出版社出版的植物学专业刊物,是国内外公开发行的学术期刊。2006年变更为双月刊,后成为以植物分类、基因工程、植被生态、数量遗传学等为核心的多学科综合性学术期刊。

摘要： 首先必须跟大家讲清楚的一个概念,鸡的生长速度主要是受遗传的影响,是先天决定的,也就是父母给的,是由基因控制的。在这方面科学家们、研究人员做过一些分析,认为对鸡的生长速度,遗传因素的贡献率大概在80%左右,当然跟它的饲料营养也有关系,营养平衡、高水平的营养能保证它遗传潜力的充分发挥,否则有潜力也发挥不出来,但是根本因素还是由遗传决定。我们通过数量遗传学和分子遗传学这些现代技术或者通过传统的手段可以把优秀的基因挑选出来,把优秀的个体挑出来,这样鸡的生长速度就越来越快,完全能够达到我们现在的看到的鸡的这种生长速度。

摘要： 主持育成10多个冬小麦品种,倡导三交和复合杂交使用,推动数量遗传学发展,提倡小麦加工品质改良,进行全国小麦育种攻关,参加主编《中国小麦学》等专著……这一系列成就,离不开庄巧生的勤奋、认真和严谨、务实,他的这些品质正是我们应当汲取的精神食粮。

摘要： 《植物研究》1959年创刊,是由东北林业大学主办,科学出版社出版的植物学专业刊物,是国内外公开发行的学术期刊。2006年变更为双月刊,后成为以植物分类、基因工程、植被生态数量遗传学等为核心的多学科综合性学术期刊。其刊载内容为植物新种、分子生物学、基因工程、植物细胞学、植物化学、植物遗传学、植物生理学、群落生态学等基础理论研究方面具有创新性或较高学术水平的原始性论文。

摘要： 从多年多点配合力模型构建分析入手,得出了植物育种配合力模型与动物育种动物模型,在数量遗传学效应方面殊途同归.提出了植物育种值模型,并对如何使用模型提高植物一般配合力分析水平进行了分析探讨.

摘要： 数量遗传学是遗传学领域难度较大的课程,掌握数量遗传学基本知识,并能将其应用到科研工作中,从事相关研究,需要学生拥有较为扎实的统计学基础.但是,目前国内的统计学和数量遗传学教学尚缺乏联系.该文以数量遗传学基本概念为主要内容,较为详细的推导了数量遗传学的基本原理和公式,为学生进一步理解该学科的的基本原理提供帮助,也为该学科的进一步研究提供基础.

摘要： 植物数量遗传学具有很长的历史,被广泛地应用于特定的生物学过程,影响性状进化的重要因素的鉴别以及培育作物新品种研究.经典的植物数量性状位点遗传作图等方法也在随新技术进步而得到改进.传统的数量遗传学主要是用生物统计学方法对群体的某数量性状进行随机抽样测量,计算出性状的平均数、表型方差、遗传方差和环境方差等,并在此基础上分析表现型、基因型效应、遗传与环境互作,以及遗传力、遗传相关和遗传改良进度等遗传参数,并提出遗传改良的策略.进入到后基因组时代,现代数量遗传学研究内容和方法有了非常大的变化.本文通过植物数量遗传学最近进展分析,探讨这些重要进展对未来林木遗传育种的可能产生的深远影响和林木遗传育种研究发展方向.

摘要： 以DH系为亲本组配杂交组合为对象,采用数量遗传学方法研究DH系产量相关性状的遗传变异规律.结果表明诱导DH系的基础材料决定其诱导后代的类型.DH系的穗长、穗粗、穗行数、行粒数、百粒重等产量相关性状符合基因加性效应遗传规律.利用DH育种技术可以快速改良自交系的一般配合力,组配优良的杂交组合.

摘要： 标记辅助选择(MAS)是通过分析与目标基因紧密连锁的分子标记，直接选择目标基因型个体的一种选择方法。随着分子生物学和数量遗传学的发展，一些影响猪重要经济性状的基因和分子标记被发现，因此，利用分子标记辅助选择育种己经成为动物育种领域的热点。但是大部分经济性状都是由多基因控制的，同时不同性状间可能还存在负相关，因此研究多个基因和标记间的联系，利用多基因聚合选择有望解决这些问题。

摘要： 针对优质肉鸡育种的理论、技术和实践问题，开展了为期10年的持续研究，取得以下成果：育成了5个优质肉鸡新品系,配套系组合主要生产性能指标国际领先；创建了居国际领先水平的优质肉鸡育种规划方案，为肉鸡育种提供了精细化的数量遗传学方法；发现了6个候选基因与优质肉鸡肉质性状的关联效应，为标记辅助选择奠定了分子遗传学基础；构建了优质肉鸡育种与产业化的产学研技术创新体系，为我国畜禽育种研究与产业化开发工作提供了良好示范。

摘要： 众所周知,鉴别数量性状的主基因一直是数量遗传学领域的重要研究内容之一.近年来已经发展出了多种探测主基因的方法,其中基于混合分布理论的分离分析方法是目前最常用的主基因检测方法之一,已发展到了对多个不同遗传结构群体的主基因分析方法.然而,已有的分离分析方法均是基于单一性状进行的,忽略了性状之间的遗传和环境相关信息.本文在单个性状主基因分离分析的基础上,根据多个相关数量性状的主基因+多基因遗传模型,首次提出利用多个数量性状的相关信息进行主基因检测、主基因效应与变异估计的联合分离分析方法.该方法对分离群体任一个体在k个性状上的表型值向量建立主基因+多基因的统计遗传模型,运用联合分离分析方法求得分离群体n个独立观察值向量的联合似然函数,以EM算法实现的极大似然估计方法进行主基因的效应和变异估计,以似然比统计量进行主基因的各种遗传假设检验,包括有无主基因分离、是否一对主基因分离以及主基因是否仅控制性状1或仅控制性状2的表达.模拟研究以F2群体两个相关数量性状主基因的联合检测为例,供试因素有主基因遗传力(h2)和样本容量(n),各设置3个水平,共9个处理,每处理均重复模拟200次.本文考虑两套模拟方案:(1)某一主基因同时控制两个性状的表达.设该主基因对性状1的作用表现为超显性,对性状2的作用表现为部分显性.各性状的剩余方差根据设定的主基因遗传力以及主基因遗传方差σ28确定,剩余协方差则根据剩余相关系数以及剩余方差确定.(2)某一主基因仅控制性状2的表达.两种方案参数设置相同,其区别为该主基因对性状1无作用.此时性状1的表型变异完全由剩余变异造成,其剩余方差设定同性状2.两套方案下的9个处理均按:本文发展的多性状联合分析和单性状单独分析两种方法进行.模拟结果可以看出:(1)不论是模拟方案1还是模拟方案2,尽管随着遗传力和样本容量的增大,主基因的被发现能力随之增大,但从两者的作用效能上来看,遗传力的作用明显大于样本容量.(2)相较于单一性状的单独分析,本文的联合分析方法对主基因的发现能力有着极明显的提高.例如,在模拟方案1,即使在低遗传力和小样本容量(h2=30﹪、n=200)时,联合分析对主基因的检测功效已达100﹪,而两个性状单独分析的统计功效则仅有11﹪和7﹪.同样,方案2的结果也有同样趋势.(3)特别值得注意的是,在模拟方案2中,即使该主基因仅控制性状2的表达,但由于联合分析充分利用了性状之间的剩余相关信息,因此主基因的被发现能力相较于性状2的单独分析,仍有大幅提高.例如,在同样低遗传力(h2=30﹪)和小样本容量(n=200)下,联合分析时对该主基因的检测能力高达45.5﹪,而对性状2的单独分析,该主基因的被发现能力仅为11.5﹪.由此说明,充分利用数量性状之间的剩余相关信息,可以显著提高主基因的被发现能力,而不论该主基因是同时控制多个性状的表达、还是仅控制其中一个性状的表达.(4)从主基因效应以及剩余变异的估计值的准确度和精确度来看,无论表3还是表4均表现出一般的趋势,即:随着h2和n的增大,其准确度和精确度均随着提高.而且通常来说,只要主基因的检测功效高达50﹪以上,其相应估计值的准确度和精确度均可达到较理想水平.由此也说明,主基因分析的关键是如何提高其被发现能力.本文在模拟研究的基础上以水稻杂交组合多蘖矮×中花11的F2群体597个植株株高和分蘖数为例演示了分析程序.结果表明该组合的株高和分蘖数受同一主基因控制.该主基因对株高的加性和显性效应分别为-21.3cm和40.6cm,表现为超显性;对分蘖数的加性和显性效应则分别为22.7和-25.3,表现为接近完全显性.

摘要： 根据Sprague和Tatum(1942)提出的配合力概念,定义的两种配合力概念(即一般配合力gi和特殊配合力sij)可用统计模型xij=μ+gi+gj+sij+eij表示,不考虑eij,则sij为xij偏离μ+gi+gj之差;杨永奎(965)在其遗稿中首次提出了一种计算特殊配合力效应的简便方法(以下简称杨氏简法),杨氏定义的sij为xij偏离中亲值MP之差,即s'ij=xij-1/2((x)i·+(x)·j)=sij+1/2(gi+gj),表明杨氏所定义的特殊配合力s'ij与Sprague等所定义的特殊配合力sij之差是由于表示这两种离差的原点不同所致.根据Sprague等的定义,GCA是指一个纯育亲本在一系列杂交组合中的平均产量或其它性状表现,而SCA力则是指某一特定F1组合的实测值与其由双亲GCA得到的预测值之差,具有明确的生物学意义.因而,定义特殊配合力时所确定的原点应遵从遗传学法则.生物世代相传的是基因而非基因型,但Sprague等定义sij所依据的gi=(x)i·-μ和gj=(x)·j-μ,均属基因型值之差,相反,杨氏根据杂种优势概念(即任一杂交组合F1平均值与与双亲平均值之差)所定义的s'(ij)则是以1/2gi和1/2gj分别表示配子i和j在结合子中的一般配合力效应,结合子的特殊配合力效应则为基因的非加性效应.于是,杨氏的公式可写成xij=μ+g'i+g'j+s'ij.因为g'i=1/2gi,g'j=1/2gj,s'ij=sij+1/2(gi+gj),所以xij=μ+1/2gi+1/2gj+[sij+1/2(gi+gj)]=μ+gi+gj+sij,表明xij的总遗传效应,杨氏的与Sprague等所定义的完全相同.由于Sprague等的遗传假设不明确,所定原点不当,因而夸大了GCA而降低了SCA,不能真实地反应杂种优势.而杨氏所定义的特殊配合力与杂种优势完全一致,具有明确的的传理论基础.估算配合力效应除按照Sprague等的定义直接计算外,目前国内外广为采用的仍多为Griffing(1956)所提出的四种双列杂交方法,利用最小二乘法估计(μ)、(g)i、(g)j和(s)j.运用数量遗传学的原理和方法分析这两种计算方法与杨氏简法估算结果的异同及其相互间的代数关系,对于Griffing双列杂交试验的方法3和方法4,三种不同方法估算配合力效应值可以相互转换:g'i=1/2gi=P-2/2(P-1)(g)i,s'ij=sij+1/2(gi+gj)=(s)ij+P/2(p-1)((g)i+(g)j)gi=P-2/P-1(g)i=2g'i,sij=(s)ij+1/P-1((g)i+(g)j)=s'ij-g'i-g'j(g)i=P-1/P-2gi=2(P-1)/P-2g'i,(s)ij=sij-1/P-2(gi+gj)=s'ij-P/P-2(g'i+g'j)用两个实例采用多元回归分析和通径分析方法对各种方法配合实际资料的吻合程度进行比较,证实杨氏简法不仅具有正确的遗传理论基础,而且计算简便,切合育种实践.

摘要： QTL图谱的构建方法及其利用研究是数量遗传学在近年的新发展.为此,国内外已发展了许多QTL作图的统计方法和相应分析程序.然而这些方法均是依据双亲本杂交衍生的分离群体(如F2,BC,DH,RIL等)进行QTL作图.双亲本杂交设计的主要缺点是统计推断空间非常狭窄,QTL作图结果不能推广到其它组合.Xu率先提出的用于QTL作图的四向杂交(four-waycross)设计,即4个纯系亲本(P1、P2、P3和P4)参与杂交衍生分离群体的一种交配设计.由于该设计包括4个纯系亲本,可以同时估计和检测多个QTL效应,因此能够增加QTL检测的统计功效.实际上,利用四向杂交设计进行QTL分析相当于同时进行2个常规组合的QTL分析,只要任一杂交组合在QTL位点存在等位基因的差异或这2个组合涉及的4个亲本在QTL位点存在等位基因的差异,均有可能检测到相应的QTL.因此,可以增加发现QTL的机会.尽管国际上已经提出基于四向杂交设计的迭代重新加权最小平方(Iterativelyreweighedleastsquares,IRWLS)QTL作图方法,但由于该方法忽略了双侧标记基因型内QTL基因型的混合分布特性,因此当QTL位置和标记的位置不重合时IRWLS方法的作图精度较低.本研究根据四向杂交设计的数量遗传模型,发展出基于四向杂交设计和混合分布理论的QTL作图的极大似然估计方法.该方法首先利用染色体上所有标记基因型联合计算该染色体上任一假定位置QTL的条件概率,然后根据混合分布理论建立了基于EM算法实现的QTL作图的极大似然估计方法.该方法可同时估计和检测多个QTL效应,包括反映纯系亲本P1和P2等位基因差异的第1加性效应,反映纯系亲本P3和P4等位基因差异的第2加性效应,以及反映P1、P2和P3、P4等位基因间互作的显性效应;通过似然比测验可知染色体上某一假定QTL位点是否存在QTL,用这种方法每隔1或2个cM进行全基因组搜索,从而得到QTL的似然图谱,以之推断各染色体上是否有QTL以及QTL在染色体上的位置.以计算机模拟数据研究了QTL遗传力、样本容量和分子标记信息含量3个因素对方法的影响,结果表明:(1)在QTL的被发现能力上,标记信息不完全的四向杂交设计仅略低于信息完全时的四向杂交设计;(2)各处理在QTL位置和效应的估计上均很准确,且随着QTL遗传力、样本容量和标记信息含量的增大,QTL位置以及效应估计值的准确度和精确度逐步提高.此外,四向杂交设计还可看作是一个广义设计.例如,P1和P3亲本在QTL位点携带的等位基因以及P2和P4亲本携带的等位基因相同时,此时的FW群体相当于传统的F2群体;而当P1、P2和P3亲本或P1、P2和P4亲本携带的等位基因相同时,FW群体则相当于传统的BC群体.故F2和BC设计仅是四向杂交设计的2个特例,可以将之综合于同样的分析程序.为此,本研究用SAS宏语言编制完成一个用于FW群体QTL分析的综合程序(QTL-BY-SAS)一套,可同时用于FW群体以及F2和BC群体的QTL作图.

摘要： 由于林木具有生命周期长、生物学上大多为异交物种、所处的环境极为复杂多样等特性,其遗传连锁图谱的构建和QTL定位在技术和方法上难于其他物种,进展相对缓慢.但近十多年来,林木分子遗传学的研究已有了较大的进展.本文简述了国际林木遗传图谱和QTL定位研究最新成果的同时,介绍了国内林木遗传图谱和QTL定位研究的进展.

摘要： 由于林木具有生命周期长、生物学上大多为异交物种、所处的环境极为复杂多样等特性,其遗传连锁图谱的构建和QTL定位在技术和方法上难于其他物种,进展相对缓慢.但近十多年来,林木分子遗传学的研究已有了较大的进展.本文简述了国际林木遗传图谱和QTL定位研究最新成果的同时,介绍了国内林木遗传图谱和QTL定位研究的进展.

摘要： 由于林木具有生命周期长、生物学上大多为异交物种、所处的环境极为复杂多样等特性,其遗传连锁图谱的构建和QTL定位在技术和方法上难于其他物种,进展相对缓慢.但近十多年来,林木分子遗传学的研究已有了较大的进展.本文简述了国际林木遗传图谱和QTL定位研究最新成果的同时,介绍了国内林木遗传图谱和QTL定位研究的进展.

摘要： 本发明涉及一种光遗传学调控的动物行为学测试平台，用于对测试动物进行行为学测试，该测试平台包括中央控制系统、环境控制系统、行为学监测系统、光电检测调控系统及用于固定上述系统的壳体装置。通过将光遗传学神经调控技术和电生理、行为学测试等结合起来，建立了一套标准化和集成化的用于测试动物光遗传学调控的行为学测试平台，通过该平台可以实现在一定的环境内对测试动物进行光遗传学调控和行为学记录，有助于理解动物光遗传学调控和行为学之间的关系，满足对神经系统和精神疾病的发病机制和治疗机制研究的需求。

摘要： 本公开内容描述了一种患者注册数据系统，其可用于汇总涉及疾病发生、进展和对治疗的反应的临床、分子和免疫参数。本公开内容可允许参与者、研究者和医师基于诸如参与者人口统计数据和免疫系统数据等参数来使数据可视化。

摘要： 本公开内容描述了一种患者注册数据系统，其可用于汇总涉及疾病发生、进展和对治疗的反应的临床、分子和免疫参数。本公开内容可允许参与者、研究者和医师基于诸如参与者人口统计数据和免疫系统数据等参数来使数据可视化。

摘要： 本发明涉及一种光遗传学调控的动物行为学测试平台，用于对测试动物进行行为学测试，该测试平台包括中央控制系统、环境控制系统、行为学监测系统、光电检测调控系统及用于固定上述系统的壳体装置。通过将光遗传学神经调控技术和电生理、行为学测试等结合起来，建立了一套标准化和集成化的用于测试动物光遗传学调控的行为学测试平台，通过该平台可以实现在一定的环境内对测试动物进行光遗传学调控和行为学记录，有助于理解动物光遗传学调控和行为学之间的关系，满足对神经系统和精神疾病的发病机制和治疗机制研究的需求。

摘要： 本发明引导式多模态影像遗传学数据特征分析方法，同时考虑样本的多模态影像数据分析以及基因影像典型相关分析。采用权重分解方法将权重分为模态一致性权重和模态特异性权重，模态一致性权重表示模态之间共有的信息，模态特异性权重表示单个模态独有的信息。此外采用样本的标签这一先验信息，利用回归分析引导多模态影像数据的特征学习，同时利用机器学习中多任务学习框架将多模态数据与基因数据的典型相关分析作为多个学习任务，利用多任务学习所包含的有用信息帮助每个任务得到更准确的学习器并且找到任务之间的差别和联系。本发明公开的方法能够有效地进行特征选择和影像遗传学数据相关性分析。

摘要： 本发明提出了一种检测苯并[a]芘暴露的表观遗传学标志物，所述表观遗传学标志物包括人第6号染色体中cg02446434位点、cg08681110位点和cg18338863位点中的至少一个。本发明还提供了一种上述检测苯并[a]芘暴露的表观遗传学标志物的筛选方法和应用。本发明cg02446434位点、cg08681110位点和cg18338863位点的甲基化改变发生在疾病的早期，可实现一级预防的目的，且cg02446434位点、cg08681110位点和cg18338863位点均位于基因MARCKS上，可用于肺部疾病的发病机制研究，应用前景好；DNA甲基化分析灵敏度高、稳定性好、成本低。

摘要： 本发明涉及生物发酵领域，尤其涉及一种经表观遗传学改造提高内生真菌发酵产物4‑羟基苯乙醇产量的方法，本发明与普通内生真菌发酵产物相比，4‑羟基苯乙醇产率得到了很大提升，产率高达122mg/L，操作简单，能够进行工业化大规模生产，本发明使用丙酮酸钠为表观遗传修饰剂，原料易得，经济成本低，本发明分离提纯过程操作简单，可以有效的降低生产成本。

摘要： 本发明提供了一种胚胎植入前非整倍体遗传学检测用样本保存液及其制备方法与应用。所述胚胎植入前非整倍体遗传学检测用样本保存液组合物包括以下组分：TrisHCl；EDTA；以及KCl。本发明还提供了一种胚胎植入前非整倍体遗传学检测方法。本发明的样本保护液能够为精子和细胞样本提供一个稳定的pH值缓冲环境和盐离子平衡作用，保护生物蛋白和生物特性，尽可能地维护细胞结构的完整性，避免样本在运输过程中因反复冻融而导致的细胞核酸物质释放。

摘要： 本发明涉及表观遗传学技术领域，且公开了表观遗传学数据分析云平台，包括数据库、数据输入模块、数据处理模块、数据储存模块、数据备份模块、数据提取模块和数据分析模块，其特征在于：数据输入模块与数据库线性连接，数据库与数据处理模块线性连接，数据处理模块与储存模块线性连接，储存模块与数据备份模块线性连接，据备份模块与数据提取模块线性连接，数据提取模块与数据分析模块线性连接。该表观遗传学数据分析云平台，通过数据分析模块对数据的归整，将最终有效数据以图表的形式反馈给用户，避免了数据的杂乱无章排列，保证了数据规则的呈现，方便于用户对数据的查找，有利于用户对数据的观察及研究。

摘要： 本实用新型公开了一种胚胎植入前遗传学诊断胚胎活检装置，包括温育台、透明盖及旋转座，温育台上设有多个培养工位，每个培养工位具有一适于放置培养皿的温育槽及一适于取样管插入的取样槽；透明盖位于所述温育台上方，且所述透明盖上设有一适于显露一个培养工位的开口；旋转座设在所述温育台的底部，用以驱动所述温育台相对于所述透明盖旋转，以选择性地切换一个所述培养工位至所述开口中。根据本实用新型实施例提供的胚胎植入前遗传学诊断胚胎活检装置，可以用于活检取样，确保样本和培养皿中胚胎的关联性，降低了人为操作失误导致可能存在的风险。