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组织特异性表达

组织特异性表达的相关文献在1990年到2022年内共计148篇,主要集中在分子生物学、农作物、水产、渔业 等领域,其中期刊论文97篇、会议论文3篇、专利文献90812篇;相关期刊72种,包括海洋与湖沼、热带亚热带植物学报、生物化学与生物物理进展等; 相关会议3种,包括第三届“模式生物与人类健康”发育遗传学全国学术研讨会、第七届世界华人虾蟹类养殖研讨会、四川省畜牧兽医学会2010年学术年会等;组织特异性表达的相关文献由499位作者贡献,包括高志民、彭镇华、李明云等。

组织特异性表达—发文量

期刊论文>

论文:97 占比:0.11%

会议论文>

论文:3 占比:0.00%

专利文献>

论文:90812 占比:99.89%

总计:90912篇

组织特异性表达—发文趋势图

组织特异性表达

-研究学者

  • 高志民
  • 彭镇华
  • 李明云
  • 蒋思文
  • 高瑞娟
  • M·A·杰曼
  • S·库马尔
  • T·科拉姆
  • T·赖特
  • 张先文
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利文献

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    • 张司雯; 邓欣; 王龙; 罗皓天; 王禹茜; 王月; 李清竹; 王红艳
    • 摘要: Dicers酶类、Argonautes蛋白以及RNA依赖的RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerases,RDRs)是RNA干扰(RNA interference,RNAi)机制中重要的核心蛋白,但在谷子(Setaria italica)中尚无系统报道.为了研究谷子中与RNA干扰相关酶类基因的特征,本研究对谷子的RNA干扰相关酶类基因家族进行了蛋白质理化性质、亚细胞定位预测、蛋白质保守基序、基因保守结构域、基因家族成员间系统发育关系以及组织特异性表达谱分析.研究共发现24个与谷子RNA干扰相关酶类基因,包括7个DCL(Dicers),13个AGO(Argonautes),4个RDRs.系统进化树分析表明,这些家族被分为3个进化支.同一家族基因成员具有共同的保守结构域.虽然大多数基因可同时在不同发育时期的叶、茎和穗中表达,但其在各时期的穗和茎中的表达量最高.本研究为详细探讨这些基因在谷子生殖和生长发育中的表观遗传修饰作用提供了理论依据.
    • 朱健强; 徐文杰; 徐文铖; 谢好婷; 石海莹; 王爱民; 田红艳; 赵雪成
    • 摘要: 为了研究克氏原螯虾LC3基因的序列及其生物信息学,分离并提取肝胰腺组织,并克隆了其LC3基因ORF全长序列.结果表明,克氏原螯虾LC3基因ORF序列片段为369 bp,编码122个氨基酸.结构分析显示,LC3基因存在2个结构域,证明了LC3基因在细胞自噬中存在多种功能.序列比对及系统进化树分析表明,克氏原螯虾与节肢动物进化关系最接近,其LC3基因序列具有节肢动物的典型特征,在进化过程中保守性较高.荧光定量PCR显示,克氏原螯虾LC3基因在肝胰腺中表达水平最高,与肠道相比有显著差异(P0.05);心脏和肌肉中LC3基因的表达量次之,但与肠道相比差异显著(P<0.05);肠道中LC3表达量最低.该研究结果可为深入研究LC3基因表达与动物营养调控提供基础依据和参考.
    • 蒋兰; 张雪艳; 王俊茵; 李静
    • 摘要: 豹猫Prionailurus bengalensis是亚洲分布最广的食肉动物之一,国家二级重点保护野生动物.本研究对豹猫6个组织(大脑、心脏、肾脏、肝脏、肺和骨骼肌)进行了转录组测序,共获得51.4 Gb的原始数据.使用Trinity进行从头组装,最终获得了369246条转录本,其平均长度为1465 bp,转录本N50长度为2660 bp,组装质量较高.注释结果显示,约42.44%(114517条)的转录本在4个公共数据库中成功获得注释,65895条转录本被分配到了386条KEGG通路中.根据转录本表达量构建各组织的表达图谱、计算组织特异性指数(TSI),39.65%的转录本为0.15≤TSI≤0.85,具有中等组织特异性,60.34%的转录本TSI>0.85,具有较高的组织特异性.统计豹猫每个组织中表达量最高的10条转录本,共39条转录本,其中26条的表达具有高组织特异性(TSI>0.85),显示大部分高表达基因都表现出高组织特异性.
    • 原新博; 程婷婷; 惠小涵; 陈章玉; 王瑞红; 柯卫东; 郭宏波
    • 摘要: [目的]以中国莲(Nelumbo nucifera Gaertn.)的多酚氧化酶家族成员之一NnPP01 (GenBank:ADC92563.1)为研究对象,筛选、验证与其互作的蛋白,为深入研究莲藕PP0的分子作用机制、精准抑制其活性奠定基础.[方法]利用酵母双杂交(Y2H)技术,验证莲藕抗氧化酶是否与NnPP01存在互作关系.通过转化酵母试验检测互作蛋白过氧化氢酶同工酶NnCAT1(GenBank: XP_010242894.1)的毒性和自激活活性.构建双分子荧光标记试验(BiFC)所用的35S-NnPP01-SPYNER173、35S-NnCAT1-SPYCEM表达载体,通过农杆菌介导法,将重组质粒转化烟草,进一步验证NnPP01与NnCAT1之间的互作关系.根据NnPP01和NnCAT1的结构域截短蛋白,寻找互作关键结构域.利用PlantCARE分析NnPP01与NnCAT1启动子相关作用元件,利用实时荧光定量PCR (qRT-PCR)分析NnPP01与NnCAT1在莲藕不同组织中的表达水平.采用同源重组的方法构建35S-NnCAT1-GFP融合蛋白表达载体,用于亚细胞定位分析.运用DNAMAN软件对NnCAT1序列和其他物种序列进行多序列比对.运用生物信息学网站对NnCAT1进行理化性质与结构分析.[结果]NnCAT1与NnPP01存在蛋白互作,且NnCAT1蛋白无自激活作用,对酵母菌株也没有毒性.在细胞膜和细胞核上观察到黄色荧光信号,进一步证实NnPP01与NnCAT1之间存在互作.NnPP01的酪氨酸酶结构域在蛋白互作中发挥主要作用.NnPP01与NnCAT1启动子序列上存在多种顺式调控元件,如光响应元件Box 4、GT1-motif、TCT-motif,逆境响应元件ARE以及激素响应元件CGTCA-motif、TGACG-motif等.NnPP01与NnCAT1的表达模式基本相同,在各组织中均有表达,均在叶中表达量最高,在茎尖中表达量最低.亚细胞定位结果显示NnCAT1定位于细胞膜和细胞核中.莲藕NnCAT1的相对分子质量约为57.0 kD,理论等电点(PI)为6.93;该蛋白为同源四聚体亲水性蛋白质;无跨膜结构和信号肽,存在叶绿体转运肽,前21 aa为转运肽区域;二级结构由27.64%的α-螺旋、15.65%延长链、6.30%β-转角和50.41%无规则卷曲构成.[结论]筛选出NnCAT1与NnPP01之间存在蛋白互作,用BiFC进一步证实两者互作的真实性,NnPP01保守的酪氨酸酶结构域在互作中发挥主要作用;NnPP01与NnCAT1的表达模式基本相同,推测NnPP01与NnCAT1协同互作导致莲藕等果蔬褐变.
    • 陈泓宇; 任宏伟; 张玉喜; 王卫青; 谭玲玲; 高婷
    • 摘要: 目的 挖掘参与北沙参(Glehniae Radix)香豆素合成的关键酶异戊烯基转移酶(Isoprenyltransferase,IPT)基因,进一步分析该基因的序列特征及表达量模式.方法 本研究摸索了一种北沙参基原植物珊瑚菜(Glehnia littoralis Fr.Schmidt ex Miq.)无菌苗制备方法,并且在珊瑚菜转录组测序数据的基础上,使用茉莉酸甲酯(MeJA)处理筛选出表达量上调的候选基因序列;利用cDNA末端快速扩增(rapid amplification of cDNA ends,RACE)技术对GlIPT1基因cDNA序列进行全长克隆;根据所得的氨基酸序列进行蛋白质理化性质、二级结构、三级结构分析;利用Clustalx及MEGA6.0构建NJ系统进化树;利用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)方法检测该基因的组织特异性表达.结果 GlIPT1基因cDNA序列全长为1296 bp,编码306个氨基酸残基,蛋白相对分子质量为34409.30 Da,等电点为5.93,属于P-loop_NTPase超家族,为亲水性蛋白.系统进化分析表明,GlIPT1与伞形科植物胡萝卜Daucus carota subsp, sativus IPT蛋白亲缘关系较近.荧光定量PCR结果显示:GlIPT1基因在珊瑚菜的花中表达量最高,其次是根,在叶中表达量较低.结论 本实验为进一步研究北沙参的分子育种和利用生物技术提高香豆素产量奠定了基础,具有重要的理论价值和良好的应用前景.
    • 刘换换; 杨立春; 张成阁; 郝自远; 李火根
    • 摘要: CPP(cystein-richpolycomb-likeproteinor Tesmin/TOS1-like)家族属于成员数目较少的一类转录因子基因家族,含有保守的富含Cystein的CRC结构域,在植物发育进程中,主要参与花发育、细胞分裂、分子进化等.为了探索CPP转录因子家族在北美鹅掌楸花发育中的作用,该文以北美鹅掌楸(Liriodendron tulipifera)为材料,采用RACE技术克隆出1个CPP-like家族基因,命名为LtTCX2,全长2866 bp.通过NCBI网站在线分析,ORF长2424 bp,编码了807个氨基酸,含2个保守的TSO1-like CXC结构域,分子量为88699.25 Da,理论等电点为5.83,不稳定系数为62.38,疏水性平均值为-0.619,预测为亲水性蛋白、非跨膜蛋白、核蛋白,不含信号肽及切割位点.氨基酸比对及系统进化分析结果显示,LtTCX2与其他物种的CPP家族TCX蛋白具有较高的同源性,与亚洲莲(Nelumbo nucifera)的NnTCX2、胡杨(Populus euphratica)的PeTCX2进化关系最近.荧光定量PCR结果显示,LtTCX2基因在叶片中表达量最高,在萼片、花瓣中几乎不表达,表达量由高至低如下:叶片、花芽、雌蕊、雄蕊、茎、根、花瓣、萼片.以上结果说明,LtTCX2属于较古老、保守的一类基因,可为从分子生物学层面研究鹅掌楸属植物系统进化提供一定的理论依据.
    • 刘丽丽; 张蓉; 王晓雯; 朱华
    • 摘要: 将体长5~7 cm的虎皮鱼饲养在30 L的养殖缸中,每缸30尾.水温自27°C起,每24 h降温4°C,第4 d再降温2°C,即各试验组的水温分别为23、19、15、13°C,对照组水温保持27°C.每组3个平行.每组水温维持24 h后,每缸随机取3尾鱼,用间氨基苯甲酸乙脂甲磺酸盐溶液麻醉后,解剖脑、鳃、肝脏和肌肉组织,液氮速冻,-80°C超低温冰箱保存备用.利用CODEHOP软件设计简并引物,PCR扩增到一段虎皮鱼硬脂酰辅酶A去饱和酶(SCD)基因(PtScd1基因)保守序列,用RACE克隆和序列拼接获得PtScd1基因cDNA序列.试验结果显示,PtScd1基因cDNA序列全长1338 bp,OR-Ffinder预测开放阅读框长度981个核苷酸,编码326个氨基酸.根据保守结构域数据库预测PtSCD1蛋白氨基酸序列含有高度保守的脂肪酸去饱和酶结构域,Swiss-Model同源建模发现蛋白质三维结构存在2个高度保守的锌离子结合位点(可能与双铁离子结合),2个配体结合位点,但是其序列保守性很差.PtSCD1蛋白可能在脂肪酸链delta9位置引入双链,催化生成单不饱和脂肪酸.实时荧光定量PCR技术检测到PtScd1转录本在虎皮鱼脑、鳃、肝脏和肌肉组织中表达,表达水平依次为肝脏>脑>肌肉>鳃;低温胁迫下虎皮鱼脑 、鳃 、肌肉和肝脏组织PtScd1转录本丰度上调,且在一定范围内脑组织PtScd1转录本相对表达水平与温度呈负相关趋势.试验结果表明,PtScd1基因在虎皮鱼组织中特异性表达,表达水平具有一定的温度依赖性,预测PtScd1基因在虎皮鱼应对低温胁迫过程中发挥重要作用.
    • 陈笛; 王鹏杰; 郑玉成; 林浥; 郑知临; 陈桂信; 叶乃兴
    • 摘要: 根据茉莉花转录组数据,采用RT-PCR技术,克隆了茉莉花甲羟戊酸焦磷酸脱羧酶(MVD)基因,命名为JsMVD(Gen-Bank登录号为MH311041.1).采用染色体步移技术分离JsMVD基因5′端上游调控序列,通过实时荧光定量PCR技术检测JsMVD基因在茉莉花植株不同组织及不同激素处理下的表达水平.测序结果表明,JsMVD基因全长cDNA序列的长度为1500 bp,包含长度为1269 bp的开放阅读框(ORF),共编码422个氨基酸,亚细胞定位预测该蛋白可能位于细胞质上.JsMVD蛋白含有GHMP激酶N-端和C-端保守结构域,具有多个保守氨基酸残基及ATP结合位点,与野生油橄榄的相似性最高,相似系数达到88%,且进化树显示两者的亲缘关系最近.JsMVD基因5′端启动子序列长度为893 bp,该调控序列包含多种植物激素响应元件和光响应元件.实时荧光定量PCR技术检测结果表明,JsMVD基因在成熟花中的表达量最高,从高到低依次为成熟花、花蕾、茎、叶、根,且受GA、IAA和ABA不同程度的诱导.
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