病原体检测

摘要： 目的:探讨宏基因组二代测序(mNGS)在肺部感染患者病原体检测中的应用价值。方法:回顾性分析2020年11月1日至2021年8月31日广西医科大学第一附属医院老年呼吸内科收治的肺部感染患者58例,均行传统病原学检测、血清学检测及支气管肺泡灌洗液mNGS。统计患者的病原体分布情况,比较3种检测方法在肺部感染和合并肺部基础疾病中的病原体检出率。结果:58例肺部感染患者中,共检出34种微生物,最常见的是分枝杆菌,其次为曲霉菌。mNGS检出肺部感染阳性率为72.41%,高于传统方法(24.14%)和血清学检测(25.86%)(均P0.05)。在合并支气管扩张的患者中,mNGS病原体检出率高于血清学检测(P<0.05)。结论:mNGS相比传统方法和血清学检测,其细菌检出率及对合并支气管扩张的肺部感染患者病原体检出率更高。

摘要： 目的分析外源性真菌性眼内炎特征性体征和病原体分布,探索其切实有效的治疗方案,为临床诊治提供依据。方法回顾性分析2010年1月—2018年6月唐山眼科医院治疗的外源性真菌性眼内炎患者13例(13只眼)的临床资料,从病历中采集患者性别、年龄、病程、病史、治疗方式、病原体及最佳矫正视力(BCVA)信息,录入Excel表后进行分类统计,并记录数据。由3位正高级眼科医师重新审阅患者的既往眼科检查结果,并对其特征性体征进行统计描述,同时评估其临床疗效。结果(1)一般情况:13例(13只眼)患者中男性11例(11只眼),女性2例(2只眼),平均年龄(45.42±6.85)岁。平均病程(8.12±3.45)d。均有明确的开放性眼外伤史,其中以植物刺伤者居多。所有患者都接受了新型广谱抗真菌药物(注射用伏立康唑和注射用两性霉素B)联合手术治疗。(2)特征性体征:前房均呈蛛网线样,或棉绒样,或棉团样灰白混浊。其中,伴角膜溃疡似牙膏者2只眼;伴前房积脓者11只眼;角膜灰白浸润伴伪足者11只眼;玻璃体均呈蛛网线状,或棉绒絮样,或棉团样灰白混浊;眼底多灶样黄白色、白色绒样或棉球样改变,视网膜少许出血,严重者视网膜血管白线状。(3)病原体分布:13只眼中,实验室涂片细胞学检查真菌阳性12只眼;病灶标本分离病原体培养出真菌10只眼,其中曲霉菌属5只眼,占比50.00%;镰刀菌属4只眼,占40.00%;酵母菌属1只眼,占比10.00%。(4)临床疗效及并发症:13例患者治疗后,有效10只眼,无效3只眼,有效率为76.92%,BCVA提高,与治疗前比较,差异有统计学意义(t=5.527,P=0.000),均未发生严重并发症。结论外伤史、特征性体征和实验室检查有助于明确诊断,尽早予广谱抗真菌药物联合手术治疗,可以较好地控制外源性真菌性眼内炎。

摘要： 微流控技术将样本制备、核酸提取纯化和核酸检测等操作步骤集成到微型芯片,经过自动化检测得出实验结果。近年来,特异性强、灵敏度高、检测耗时短的环介导等温扩增技术与微流控技术的结合优化了耗时费力的病原体检测,具有操作简单、对设备和人员要求不高、可实现快速检测自动化等特点。但目前建立的病原体微流控检测体系在兼容样本的核酸提取和多重扩增条件的一体化方面尚存在不足,未来还需要开展更多的研究,解决核酸检测过程中的各项技术难点,建立反应基质载体更好、检测体系更优、用时更短、操作简便且准确性更高的方法,以提高病原体快速检测的效率。

摘要： 开发快速、灵敏、特异的检测方法对于新发突发人兽共患病、动物疫病的监测及防控至关重要。规律成簇的间隔短回文重复序列及相关蛋白(CRISPR-Cas)系统以高敏感性、特异性及可扩展性的DNA和RNA识别为特点,已成为新一代的分子诊断工具,在病原体快速检测技术研发中得到广泛应用。在新型冠状病毒肺炎疫情中,基于CRISPR-Cas系统开发的新型冠状病毒(SARS-CoV-2)检测试剂盒(SHERLOCK和DETECTR)在美国相继获批,中国研发的基于CRISPR-Cas12系统的SARS-CoV-2检测试剂盒也已获批上市,这表明基于CRISPR-Cas系统的病原体检测方法在未来的应用前景非常可观。文章首先简述了CRISPR-Cas系统类型,尤其是常用于病原体检测的Cas9、Cas12和Cas13;介绍了CRISPR-Cas系统的作用机理以及广泛应用。同时分析了CRISPR-Cas检测平台研发的关键技术问题,包括靶标基因的序列保守性、靶标基因的富集与扩增、终信号不同的读取方式等,并对CRISPR-Cas系统的未来发展及应用前景进行了展望。

摘要： 目的:分析非淋菌性宫颈炎患者病原学特点,并对其临床治疗方法及效果进行探究.方法:选取所在医院妇科门诊2018年2月-2020年月3月收治的110例非淋菌性宫颈炎患者,所选病例均接受病原体检测,根据患者接受的治疗方法分组,观察组(n=55)采用多西环素、阿奇霉素联合疗法,对照组(n=55)采用多西环素进行治疗,对比2组患者临床治疗效果.结果:所选110例患者中,支原体感染54例(49.09％)、沙眼衣原体感染27例(24.55％)、混合感染29例(26.36％),其中支原体感染所占比例最高,与其他相比存在显著差异(P<0.05);观察组临床治疗总有效率(94.55％)高于对照组(78.18％),组间存在显著差异性(P<0.05).结论:非淋菌性宫颈炎发病率高,临床症状多,且病原以支原体感染为主;采用多西环素、阿奇霉素联合疗法,临床效果显著,可提高临床疗效.

摘要： 核酸测序技术的诞生是生物医药领域具有里程碑意义的重大突破.以第二代测序为支柱的核酸测序技术在历经十余年的发展与积淀之后,仍在各方面的应用中面临很多挑战.近年来,以第三代测序技术为核心的核酸检测与诊断革新已在生物医药领域崭露头角.第三代测序技术可以实现兆碱基级别超长测序以及无扩增基因组修饰检测,这一系列优势赋予其在传染性疾病的及时诊断、精准医疗、药物研发等领域广泛的应用前景.第三代测序技术可以高效完成病原体的全基因组组装,进而实现病原微生物的全面检测和准确鉴定,此特点对于应对以新型冠状病毒爆发为代表的紧急公共卫生事件至关重要.介绍第三代测序技术的发展、原理及其独特优势,重点阐述第三代测序技术在病原微生物检测以及精准医疗领域的应用以及其在未来生物学领域的价值.

摘要： 目的 探讨宏基因组测序技术在儿童急性淋巴细胞白血病化疗后感染病原体检测中的应用.方法 选取本院2018年4月至2019年12月间收治的120例急性淋巴细胞白血病化疗后进入骨髓抑制期发热的患儿,取外周血分别采用宏基因测序检测和培养法检测病原体.对比两种检测方法对病原体检出情况、检出病原体分布.结果 培养法与宏基因组测序对病原体的检出率为50.0％(60/120)和63.3％(76/120),差异具有统计学意义(P＜0.05);两种方法对细菌、真菌的检出率比较,差异均无统计学意义(均P＞0.05),但宏基因组测序技术对病毒的检出率高于培养法(P＜0.05);培养法和宏基因组测序技术检出的病原体类型完全一致,但检出的病原体分布存在差异,宏基因组测序技术测得病原体分布高于培养法,但差异无统计学意义(P＞0.05).结论 在儿童急性淋巴细胞白血病化疗后感染病原体检测中,利用宏基因组测序技术更为准确,提高了临床病原体的检出率,为制定合理的治疗方案提供信息.

摘要： 核酸测序技术的诞生是生物医药领域具有里程碑意义的重大突破。以第二代测序为支柱的核酸测序技术在历经十余年的发展与积淀之后,仍在各方面的应用中面临很多挑战。近年来,以第三代测序技术为核心的核酸检测与诊断革新已在生物医药领域崭露头角。第三代测序技术可以实现兆碱基级别超长测序以及无扩增基因组修饰检测,这一系列优势赋予其在传染性疾病的及时诊断、精准医疗、药物研发等领域广泛的应用前景。第三代测序技术可以高效完成病原体的全基因组组装,进而实现病原微生物的全面检测和准确鉴定,此特点对于应对以新型冠状病毒爆发为代表的紧急公共卫生事件至关重要。介绍第三代测序技术的发展、原理及其独特优势,重点阐述第三代测序技术在病原微生物检测以及精准医疗领域的应用以及其在未来生物学领域的价值。

摘要： 目的 评价Luminex NxTAGTM RPP对17种呼吸道病原体的检测性能.方法 通过比较Luminex NxTAGTM RPP试剂盒与一代测序检测临床标本的结果,以评价Luminex NxTAG? RPP试剂盒的检测性能.结果 与一代测序相比,Luminex NxTAGTM RPP试剂盒对流感病毒A型(FluA)、2009甲型H1N1流感病毒(HlNlpdm09)、H3N2亚型流感病毒(H3N2)、流感病毒B型(FluB)、副流感病毒2型(PIV 2)、副流感病毒3型(PIV 3)、副流感病毒4型(PIV 4)、肺炎衣原体(CP)和冠状病毒HKU1(CoV HKU1)检测具有高度一致性;对腺病毒(ADV)、冠状病毒229E(CoV 229E)、冠状病毒OC43(CoV OC43)、呼吸道合胞病毒(RSV)、鼻病毒(RV)、博卡病毒(BoV)的检测结果具有中度一致性.然而对于副流感病毒1型(PIV 1)、偏肺病毒(MPV)两种方法检测一致性较差.结论 Luminex NxTAG? RPP试剂盒本身具有检测准确、高通量与操作时间短等特点,对大多数呼吸道病原体的检测表现出良好的性能.

摘要： 目的:针对小儿急性下呼吸道感染(ALRI)病原体进行检测,然后对临床分布特征进行分析.方法:研究对象选择2019年10月到2020年9月到我院接受治疗的536例ALRI患儿,以年龄大小进行分组,包括0～1岁、1～3岁以及超过3岁三组,每组分别为343例、112例以及81例.针对三组患儿进行抽血以及采集鼻咽深部分泌物,然后对其展开病原体培养以及鉴定,检测抗原以及抗体.结果:呼吸道合胞病毒(RSV)、大肠埃希菌以及肺炎克雷伯菌0～1岁组明显更高,P<0.05,两组数据对比存在差异,具备统计学意义.同时发现随着年龄增长感染力有所下滑;肺炎支原体(MP)、嗜肺军团菌1型(LP1)以及肺炎衣原体(CPn)感染率超过3岁组明显更高.结论:小儿急性下呼吸道感染病原体分布伴随着年龄增长不断发生变化.

摘要： 目的:为了解地处中蒙边境地区的甘其毛都口岸蜱传疾病病原体携带情况,对2012-2013年在该区采集168只蜱样本进行病原体检测. 方法:采用RT-PCR法检测蜱标本中的森林脑炎病毒(Tick-borne encephalitis virus,TBE)、克里米亚-刚果出血热病毒(Crimean-Congo Hemorrhagic Fever Virus,CCHFV)、蜱传新布尼亚病毒(Novel tick-borne Bunya virus,NTB),PCR方法检测蜱标本中的伯氏疏螺旋体(Borrelia burgdorferi,B.b)、立克次体(Rickettsia)、贝氏柯克斯体(Coxiella burneti,C.b.)、土拉菌(Francisella tularensis,F.t)、巴尔通体(Bartonella)、嗜吞噬细胞无形体(Anaplasma phagocytophilum,A.p). 结果:检出蜱携带阳性数为Q热24例(14.29％)、无形体3例(1.79％)、土拉37例(22％)、立克次体5例(2.98％)、森林脑炎病毒2例(1.19％),新型布尼亚病毒、巴通体和伯氏疏螺旋体、新疆出血热病毒检测结果为阴性. 结论:甘其毛都口岸蜱样品检出携带贝氏柯克斯体、嗜吞噬细胞无形体、立克次体、新疆出血热病毒等病原体,应有针对性地加强当地蜱类和蜱传疾病的监测和防控.

摘要： 目的:T7连接酶-双信号放大技术对儿科急性呼吸道感染患者呼吸道分泌物进行甲型流感病毒、乙型流感病毒、副流感病毒、腺病毒、鼻病毒、呼吸道合胞病毒、肺炎支原体、肺炎衣原体等8种常见致病菌的核酸检测,探讨其临床应用价值.方法:收集福建省立医院2010-2012年儿科诊断为急性呼吸道感染患儿的呼吸道分泌物标本271例,行T7连接酶-双信号放大方法检测,与荧光定量PCR方法比较,分析其灵敏性和特异性.结果:T7连接酶-双信号放大方法检测时间仅需2～3h,其灵敏度和可靠性与荧光定量PCR方法相当,但其不需要昂贵的特殊设备,具有实验室前期投入少,线性范围宽,无需内参,直接定量,试剂盒价格便宜等优点.结论:T7连接酶-双信号放大方法可方便、快速检测急性呼吸道感染的常见病原体,敏感性与灵敏度荧光定量PCR方法相当.

摘要： 目的:探讨性活跃女性阴道病原体分布情况.方法:初诊确诊为性病的性活跃女性患者,免费进行相应性病监测,统计性病分布情况.结果:非淋(支原体和衣原体感染)是最多的,共有269例,占97.4％,其次为细菌性阴道病,占94.5％,淋病紧跟其后,为235例,占85.1％,排在其后的依次为尖锐湿疣、生殖器疱疹、梅毒；在生殖器疱疹患者中同时具有尖锐湿疣、淋病、生殖器疱疹者比例较大,其中比例最大的为尖锐湿疣,占56％.结论:性活跃、性伴侣多,大大增加性病感染机会,其中淋病、非淋病、BV更容易合并有其他性病.

摘要： 目的：构建蚊媒传染病预警检测体系和人工干预方案.方法：对口岸不同生态环境实施监测,鉴定种群并提取病原体加以检测.结果：建立重要蚊虫种群危害预警监测方法,明确黄岛口岸辖区蚊虫的时空动态规律和重要传染病生态因素.提出黄岛口岸辖区蚊媒病预警启动阈值,探讨重要传染病应急预案与组织实施网络构建.结论：通过日常卫生监督病原体检测,对蚊媒传染病的预防和干预起到预警指导意义.

摘要： 产气荚膜梭菌(C.perfringens)为革兰阳性厌氧粗大梭菌,广泛分布于自然界,是气性坏疽的主要病原菌.气性坏疽多见于战时或地震灾害时造成的开放性创伤且创口未及时清理的情况下,常为混合感染,多见于下肢.细菌侵入伤口能引起严重急性特异性感染,组织局部水肿、坏死,病变易扩散,伴全身中毒症状.

摘要： 产气荚膜梭菌(C.perfringens)为革兰阳性厌氧粗大梭菌,广泛分布于自然界,是气性坏疽的主要病原菌.气性坏疽多见于战时或地震灾害时造成的开放性创伤且创口未及时清理的情况下,常为混合感染,多见于下肢.细菌侵入伤口能引起严重急性特异性感染,组织局部水肿、坏死,病变易扩散,伴全身中毒症状.

摘要： 产气荚膜梭菌(C.perfringens)为革兰阳性厌氧粗大梭菌,广泛分布于自然界,是气性坏疽的主要病原菌.气性坏疽多见于战时或地震灾害时造成的开放性创伤且创口未及时清理的情况下,常为混合感染,多见于下肢.细菌侵入伤口能引起严重急性特异性感染,组织局部水肿、坏死,病变易扩散,伴全身中毒症状.

摘要： 产气荚膜梭菌(C.perfringens)为革兰阳性厌氧粗大梭菌,广泛分布于自然界,是气性坏疽的主要病原菌.气性坏疽多见于战时或地震灾害时造成的开放性创伤且创口未及时清理的情况下,常为混合感染,多见于下肢.细菌侵入伤口能引起严重急性特异性感染,组织局部水肿、坏死,病变易扩散,伴全身中毒症状.

摘要： 食源性病原体所致的食源性疾病日益增多,对人类健康构成威胁.因该类病原体种类繁多、变异迅速,传统的微生物检测技术己无法满足各种病原体的诊断和食品安全快速检测要求,故开展快速检测技术迫在眉睫.目前,应用较多的有：生物传感技术、分子生物学技术、基因检测和实时荧光核酸恒温扩增(SAT)技术等.本文对这些检测技术进行了简要的综述,并对以后的食源性病原体的快速检测方法进行了展望.

摘要： 食源性病原体所致的食源性疾病日益增多,对人类健康构成威胁.因该类病原体种类繁多、变异迅速,传统的微生物检测技术己无法满足各种病原体的诊断和食品安全快速检测要求,故开展快速检测技术迫在眉睫.目前,应用较多的有：生物传感技术、分子生物学技术、基因检测和实时荧光核酸恒温扩增(SAT)技术等.本文对这些检测技术进行了简要的综述,并对以后的食源性病原体的快速检测方法进行了展望.

摘要： 本发明涉及一种用于检测蜜蜂病原体毒力的装置及利用该装置检测病原体毒力的方法与应用，属于蜜蜂养殖技术领域。本发明提供的一种用于检测蜜蜂病原体毒力的装置，包括顶板1、侧板2、隔板3、背板4、前板5、底板6、饲喂孔7以及腔体8。本发明的装置可以评估接触方式对蜜蜂病毒毒力以及传播速度的影响。为后期蜜蜂病毒的检测提供依据。

摘要： 本发明公开了一种病原体检测系统以及采用上述的病原体检测系统的病原体的转移方法。病原体检测系统包括：工作室、第一检测仓、第一传送仓和第二检测仓；第一检测仓、第一传送仓和第二检测仓依次连接，第一检测仓和第一传送仓分别设有第一检测仓a孔和第一传送仓a门，第一传送仓a门打开时，第一检测仓和第一传送仓连通；第二检测仓和第一传送仓分别设有第二检测仓a孔和第一传送仓b门，第一传送仓b门打开时，第二检测仓和第一传送仓连通。这种病原体检测系统通过设计专门的第一传送仓用于病原体的转移，从而可以避免病原体在第一检测仓和第二检测仓之间的转移时，出现病原体的泄露。

摘要： 本发明属于病原体检测技术领域，具体的说是一种病原体检测装置及病原体检测方法，包括以下步骤：S1：由工作人员对规定范围内的被检测人群进行体液采集，在统一将采集后的体液收集在不同试管内进行保存，根据地理位置的不同进行试管的分组；S2：工作人员将试管放置到运输箱中进行固定存放，以方便携带试管至指定检测位置，通过检测设备对试管内液体进行分析，已确定病原体种类和状况；通过利用多组支撑架对密封盖的限位作用，可以在密封盖安装后减少密封盖出现晃动的情况，同时密封盖和试管顶面的接触可以配合放置孔开设，可以进一步对试管进行固定，减少外界晃动带动试管之间进行撞击，减少试管之间碰撞产生碎裂的风险。

摘要： 病原体检测装置(10)具备：取得部(11)，其计测对象者的体温，输出表示所述体温的信息；捕集部(12)，其对对象者带有的病原体或者所述对象者周围的空气中的病原体进行捕集；检测部(13)，其检测由捕集部(12)捕集到的病原体；通知部(15)，其通知检测部(13)的检测结果；以及控制部(14)，控制部(14)在取得部输出的体温超过预定阈值、且检测部(13)的检测结果为阴性的情况下，控制检测部(13)以使得对病原体进行再检测。

摘要： 一种病原体检测系统(100)，具备配置在不同的地点的多个病原体检测部(10a～10p)和控制部(20)，所述多个病原体检测部包括第1病原体检测部和第2病原体检测部，所述第1病原体检测部将作为病原体检测的结果的第1检测结果向所述控制部发送，所述第2病原体检测部将作为病原体检测的结果的第2检测结果向所述控制部发送，所述控制部在所述第1检测结果满足预定条件的情况下，使所述第2病原体检测部将与所述检测相关的模式从第1模式变更为第2模式。

摘要： 病原体检测装置(10)具备：捕集部(11)，其捕集空气中的病原体；反应部(12)，其使由捕集部(11)捕集到的病原体和标识物质进行反应；计时部(13)，其对从反应部(12)中的反应开始起的时间进行计测；检测部(14)，其对与病原体进行了反应的标识物质量进行检测；以及控制部(15)，控制部(15)基于通过计时部(13)计测出的从反应开始起的预定时间、和通过检测部(14)检测出的标识物质量来算出梯度值，基于梯度值来决定到下一次捕集部(11)进行捕集为止的时间间隔。

摘要： 本公开提供能够将设施内等的空间内很可能存在病原体的地方优先作为进行检测的对象区域的自走式病原体检测装置。本公开的自走式病原体检测装置(10)具备：壳体；检测部(16)，其检测病原体；移动机构(12)，其使壳体移动；位置取得部(13)，其取得表示空间内的壳体的当前位置的位置信息；以及控制部(14)，其基于空间内的人的动线信息决定该空间内的对象区域，并基于位置信息，控制移动机构(12)以使壳体在对象区域内移动，检测部(16)在对象区域内检测病原体。

摘要： 病原体检测装置(10)具备：取得部(11)，其取得受试者的体温；捕集部(12)，其捕集受试者携带的病原体或者受试者周围的空气中的病原体；检测部(13)，其检测由捕集部(12)捕集到的病原体；通知部(15)，其通知检测部(13)中的检测结果；以及控制部(14)，控制部(14)在由取得部(11)取得的受试者的体温超过预定的阈值的情况下，控制捕集部(12)和检测部(13)中的至少一方，以使得缩短捕集部(12)中的捕集开始到由通知部(15)对检测结果的通知为止的时间。

摘要： 本发明涉及一种用于病原体检测的转运系统，其包括多孔基板、子容器及运输容器；该多孔基板上有样品采集区及标签区且该样品采集区含有可裂解病原体的材料；当将含有病原体的样品涂在样品采集区后，病原体被裂解，无致病性，从而该转运系统可以较为快速、安全地将含有病原体的样品送至检测点。该子容器可容置该多孔基板，该运输容器可容置该子容器，该子容器及该运输容器上均设有用于直接目视查看该标签区以及多孔基板等运输容器及子容器内其他内容物的透明窗口。本发明还涉及一种用于病原体检测的方法，即通过上述转运系统将样品转运至检测点，再通过高通量并行测序和数据分析的方法判断出样品中核酸分子的来源，提供样品中可能存在的病原体信息。

摘要： 本发明公开了一种病原体检测系统以及采用上述的病原体检测系统的病原体的转移方法。病原体检测系统包括：工作室、第一检测仓、第一传送仓和第二检测仓；第一检测仓、第一传送仓和第二检测仓依次连接，第一检测仓和第一传送仓分别设有第一检测仓a孔和第一传送仓a门，第一传送仓a门打开时，第一检测仓和第一传送仓连通；第二检测仓和第一传送仓分别设有第二检测仓a孔和第一传送仓b门，第一传送仓b门打开时，第二检测仓和第一传送仓连通。这种病原体检测系统通过设计专门的第一传送仓用于病原体的转移，从而可以避免病原体在第一检测仓和第二检测仓之间的转移时，出现病原体的泄露。