AFLP分析

摘要： 为研究不同大豆品种不同生育时期的根瘤菌差异,利用A FL P分子标记技术,对12份材料进行分析.结果表明:筛选出的引物组合扩增位点的平均多态性为68.86％.基于遗传相似系数,对12份材料的U PG M A聚类分析共划分为4大类,与大豆品种类型和生育期相关,第一类为黑河41苗期(V4)、绥农14苗期(V4)、黑河41盛花期(R2)、黑农40苗期(V4)、秣食豆苗期(V4)和秣食豆盛花期(R2);第二类为黑农40盛花期(R2)、黑河41鼓粒期(R6)、黑农40鼓粒期(R6)和秣食豆鼓粒期(R6);第三类为绥农14盛花期(R2);第四类为绥农14鼓粒期(R6).为进一步开展大豆根瘤菌的研究提供参考.

摘要： [目的]从分子水平揭示珠江水系都柳江小口白甲鱼种群遗传结构和多样性的特点,探讨其致危原因及机制,为开展小口白甲鱼种群保护提供科学依据.[方法]于贵州境内都柳江三都、兴华和榕江3个采样点共采集30尾小口白甲鱼,筛选8个引物组合对都柳江小口白甲鱼种群全基因组DNA进行AFLP分析,采用PopGene32进行位点总数和多态位点数统计,并计算Shannon's信息指数(I)、Nei基因多样性指数(H)、多态信息含量(PIC)、观测等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)及个体遗传距离(DA)等遗传参数.[结果]采用8个引物组合从都柳江小口白甲鱼种群中共扩增出699条扩增片段,片段长度为69～500 bp,平均每个引物组合扩增获得87.38个位点.在699个扩增位点中,有663个位点为多态位点,多态位点数占总位点数的94.85％.699个扩增位点在30尾都柳江小口白甲鱼个体中的出现频率可划分为10个区间,其中,频率区间30％～89％的扩增位点数差异不明显,而频率区间0～9％和90％～99％的扩增位点数出现峰值.都柳江小口白甲鱼种群的I、H、PIC、Na、Ne平均值分别为0.3490、0.2206、0.6404、1.9464和1.3574,个体间的DA为0.2305～0.4440,平均为0.3304;基于DA构建的都柳江小口白甲鱼种群UPGMA系统进化树显示,30尾都柳江小口白甲鱼聚成两大分支,即个体18单独聚为一个分支,而其余29尾都柳江小口白甲鱼个体聚为另一分支.[结论]都柳江小口白甲鱼种群遗传多样性丰富,但存在有效种群规模变小及有效等位基因丢失的现象,推测其为生态濒危物种,应采取相关措施对都柳江小口白甲鱼种群进行科学保护.

摘要： 为了探讨银白杨、马氏杨及银白杨×马氏杨杂交子代间的遗传多样性参数及个体聚类关系,利用8对引物对银白杨、马氏杨及银白杨×马氏杨杂交子代4个样本进行了AFLP分析.结果表明,8对引物共扩增出780条扩增谱带,其中多态性条带数为715条,多态性比例为91.65％,平均有效等位基因数为1.5017,Nei's平均遗传多样性指数为0.3065,Shannon平均信息指数为0.4679.不同杂交子代在E-AAC/M-CAG引物对上均有特异性位点,这些特异位点可用于品种鉴定.聚类研究发现,在相似系数为0.76时,试验样品分成2个AFLP群,其中马氏杨为1个AFLP群,银白杨及2个杂交子代为1个AFLP群;当相似系数为0.78时,银白杨和2个杂交子代的AFLP群又划分为2个亚群,其中杂交子代1和杂交子代2聚合为亚群1,银白杨为亚群2.本研究的结果多态性比例很高,对样品的区分率达到100％,为杨树AFLP分析检测提供了指导借鉴价值.

摘要： 本研究在对选择性扩增引物进行筛选的基础上,对银白杨、N001杨及银白杨×N001杨杂交子代共10个样本进行了AFLP试验,并利用Popgene和NTsys软件分别对遗传多样性参数及个体聚类进行分析.结果 表明:筛选出的8对选择性扩增引物,共扩增出969条谱带,多态性条带数929条,多态性比例为95.76％,平均有效等位基因数为1.432 9,Nei's平均遗传多样性指数为0.266 2,Shannon平均信息指数为0.416 1.不同杂交子代在E-ACC/M-CAC引物对上均有特异位点,这些特异位点用于申报优良品种保护.在通过NTsys软件聚类后,在遗传相似系数为0.76时,将10个试样分为2个大支,其中N001杨为1个AFLP群,银白杨及8个杂交子代为1个AFLP群;当遗传相似系数为0.79时,银白杨与8个杂交子代的AFLP群又细化为2个亚群,其中杂交子代2和杂交子代6聚合为亚群1,银白杨和其余6个杂交子代为亚群2.本研究的结果多态性比例很高,对样品的区分率达到100％,为杨树AFLP分析检测提供了较好的应用和指导借鉴价值.

摘要： 为了探索不同芍药切花品种之间的亲缘关系特征,利用荧光标记AFLP分子标记技术,采用9对Pst I/Mse I引物组合对20个芍药切花品种进行了DNA遗传多样性分析。结果表明:9对引物均显示多态性,共产生谱带733条,其中多态性条带699条,多态性位点平均为95.36%,Nei基因多样性指数为1.4163~1.5552,平均1.4740;Shannon信息指数为0.4197~0.4929,平均0.4490。经UPGMA聚类分析后,20份芍药品种的Dice相似系数0.458~0.741,在相似系数0.52处,可将供试的20个切花芍药品种分为5类。研究认为,药芍品种间的遗传差异较大,具有丰富的遗传多样性,为芍药品种分类及亲缘关系分析提供参考依据。

摘要： To identify heredity differences among 17 elite hybrid lines selected from three cross combinations of‘1867’בLongshu.7’,‘MB09 ’בLongshu.7’and ‘MB09 ’בLongshu.6 ’potatoes,we used four parent lines as controls and analyzed genetic differences using AFLP molecular markers.A total of 321 loci were am-plified using 10 AFLP primer pairs,of which 277 were polymorphic,accounting for 87.29% of all loci.The experiment established an AFLP fingerprint map of elite hybrid lines.The average polymorphism information content (PIC)from 21 samples was 0.5617;Nei’s gene diversity index was 0.3623 and the Shannon informa-tion index was 0.5407.The average genetic distance (GD)of the tested lines was 0.5281 and were classified in-to four categories based on a GD value of 0.51:‘1867’,A-10,A-12,A-21 and A-29;‘Longshu.6’,‘Long-shu.7’,A-14,A-23,A-26,B-13 and B-14;‘MB09’,B-1,B-2,B-7,B-15,B-20 and C-22,and C-2 and C-21. This study provided a basis for selection and utilization of potato hybrid parents and breeding of new hybrid va-rieties.%为明确从‘1867’ב陇薯7号’、‘MB09’ב陇薯7号’和‘MB09’ב陇薯6号’3个马铃薯杂交组合中选育出的17个杂种优良株系的遗传差异程度，用4个亲本材料作对照，利用 AFLP 分子标记技术对其进行了遗传差异分析。用筛选出的10对 AFLP 适宜引物进行 PCR 扩增共得到321个位点，多态性位点277个，多态性位点百分率87．29％。试验建立了各杂种优良株系的 AFLP 指纹图。21份马铃薯材料间的多态信息含量（PIC）平均为0．5617， Nei’s 遗传多样性指数为0．3623，Shannon 指数为0．5407。各材料间的平均遗传距离（GD）为0．5281，以 GD 值0．51为基准，21份材料分为4类：‘1867’、A-10、A-12、A-21和 A-29为一类；‘陇薯6号’、‘陇薯7号’、A-14、A-23、A-26、B-13和 B-14为一类；‘MB09’、B-1、B-2、B-7、B-15、B-20和 C-22为一类；C-2和 C-21为一类。该研究可为马铃薯杂交亲本的选择利用和杂种优良新品系的选育提供依据。

摘要： Leaves and fruits were collected from 92 Torreya grandis cv. Merrillii trees of 6 representative populations in Zhejiang and Anhui province. Phenotypic identification and amplified fragment length polymorphism (AFLP) were used to analyze the genetic diversity. The correlation coefficient between phenotypic diversity and genetic diversity of different populations by AFLP was 0.9783, which proved the consistency of the two results. It also proved that T. grandis cv. Merrillii had a high genetic diversity and the variation is mainly within populations.%选取香榧（Torreya grandis cv. Merrillii）主要分布区具有代表性的6个群体共92个个体的叶片和果实为实验材料，采用表型和分子标记（AFLP）两种不同的方法分别从不同层次来揭示香榧天然群体的遗传多样性。结果表明：表型与 DNA 水平多样性分析两种方法在揭示香榧遗传多样性水平上是一致的，相关系数为0.9783，具有较高的相关吻合性。二者均证实了香榧天然群体具有较高的遗传丰富度，且遗传变异主要集中在群体内。

摘要： A hybridization between hot pepper heat-resistant inbred line A11 and thermosensitive inbred line B22 was made for mapping heat-resistant gene(s), and the heat resistance of their F2 segregation populations was identified through high temperature stress test. With six Taq I/Ase I primers with high polymorphism screened from 123 primer combinations, AFLP (amplified fragment length polymorphism) analysis was performed on resistant and thermosensitive F 2 plants. A total of about 11 400 distinguishable bands were amplified, of which two were stable difference. Two AFLP markers relevant to heat resistance of hot pepper were obtained preliminarily. The research not only helped to improve the breeding efficiency and level of hot pepper by using marker-assisted selection of heat-resistant genes, but also laid the foundation for the separation and cloning of related heat-resistant functional genes of hot pepper.%用辣椒耐热自交系A11和热敏自交系B22配置杂交组合，通过高温胁迫处理鉴定其F2代分离群体的耐热性。从123对Taq I/Ase I引物组合中筛选出6对多态性好的引物对F2代耐热、热敏植株进行AFLP分析，共扩增出约11400条清晰条带，其中2条为稳定的差异，初步获得了2个与辣椒耐热性状相关的AFLP分子标记。研究有助于开展辣椒耐热基因的分子标记辅助选择工作，提高辣椒育种效率和水平，并为分离和克隆辣椒耐热相关功能基因奠定基础。

摘要： 本实验采用不同剂量的钻60辐射线(10, 20, 30, 50和80 Gy)对不同品种的马铃薯薯块(费乌瑞它、中薯3号、郑薯6号)分别进行辐照处理，并对其M，变异后代进行生长期、品质、产量和抗逆性等性状筛选，将筛选出具有目标农艺性状的马铃薯株系按单株进行收获，并在Mz代提取叶片DNA进行分子生物学分析，研究辐射诱变对马铃薯遗传变异的影响。通过实验证明了马铃薯辐照后代基因变异显著，采用物理诱变的方法来进行马铃薯育种是可行的。

摘要： 本实验采用不同剂量的钻60辐射线(10, 20, 30, 50和80 Gy)对不同品种的马铃薯薯块(费乌瑞它、中薯3号、郑薯6号)分别进行辐照处理，并对其M，变异后代进行生长期、品质、产量和抗逆性等性状筛选，将筛选出具有目标农艺性状的马铃薯株系按单株进行收获，并在Mz代提取叶片DNA进行分子生物学分析，研究辐射诱变对马铃薯遗传变异的影响。通过实验证明了马铃薯辐照后代基因变异显著，采用物理诱变的方法来进行马铃薯育种是可行的。

摘要： 本实验采用不同剂量的钻60辐射线(10, 20, 30, 50和80 Gy)对不同品种的马铃薯薯块(费乌瑞它、中薯3号、郑薯6号)分别进行辐照处理，并对其M，变异后代进行生长期、品质、产量和抗逆性等性状筛选，将筛选出具有目标农艺性状的马铃薯株系按单株进行收获，并在Mz代提取叶片DNA进行分子生物学分析，研究辐射诱变对马铃薯遗传变异的影响。通过实验证明了马铃薯辐照后代基因变异显著，采用物理诱变的方法来进行马铃薯育种是可行的。

摘要： 本实验采用不同剂量的钻60辐射线(10, 20, 30, 50和80 Gy)对不同品种的马铃薯薯块(费乌瑞它、中薯3号、郑薯6号)分别进行辐照处理，并对其M，变异后代进行生长期、品质、产量和抗逆性等性状筛选，将筛选出具有目标农艺性状的马铃薯株系按单株进行收获，并在Mz代提取叶片DNA进行分子生物学分析，研究辐射诱变对马铃薯遗传变异的影响。通过实验证明了马铃薯辐照后代基因变异显著，采用物理诱变的方法来进行马铃薯育种是可行的。

摘要： 利用荧光AFLP标记技术对来自秦巴山区的10个板栗野生居群共262个单株进行遗传多样性研究。10对AFLP引物共扩增出1297条谱带，其中多态性位点数1011个，多态位点百分率为77.95%：Nei’基因多样性指数为0.1439～0.2046，总体为0.2518；Shannon信息指数的变异范围在0.1972～0.2895之间，总体为0.4089；甘肃地区野板栗居群遗传多样性水平最高，陕两宝鸡居群的遗传多样性水平最低。AMOVA分析表明野板栗居群问的遗传变异占总变异的17.51%，居群内变异占69.76%。UPGMA聚类可将供试10个居群划分为3类，聚类结果表现出明显的地域性。

摘要： 利用荧光AFLP标记技术对来自秦巴山区的10个板栗野生居群共262个单株进行遗传多样性研究。10对AFLP引物共扩增出1297条谱带，其中多态性位点数1011个，多态位点百分率为77.95%：Nei’基因多样性指数为0.1439～0.2046，总体为0.2518；Shannon信息指数的变异范围在0.1972～0.2895之间，总体为0.4089；甘肃地区野板栗居群遗传多样性水平最高，陕两宝鸡居群的遗传多样性水平最低。AMOVA分析表明野板栗居群问的遗传变异占总变异的17.51%，居群内变异占69.76%。UPGMA聚类可将供试10个居群划分为3类，聚类结果表现出明显的地域性。

摘要： 利用荧光AFLP标记技术对来自秦巴山区的10个板栗野生居群共262个单株进行遗传多样性研究。10对AFLP引物共扩增出1297条谱带，其中多态性位点数1011个，多态位点百分率为77.95%：Nei’基因多样性指数为0.1439～0.2046，总体为0.2518；Shannon信息指数的变异范围在0.1972～0.2895之间，总体为0.4089；甘肃地区野板栗居群遗传多样性水平最高，陕两宝鸡居群的遗传多样性水平最低。AMOVA分析表明野板栗居群问的遗传变异占总变异的17.51%，居群内变异占69.76%。UPGMA聚类可将供试10个居群划分为3类，聚类结果表现出明显的地域性。

摘要： 利用荧光AFLP标记技术对来自秦巴山区的10个板栗野生居群共262个单株进行遗传多样性研究。10对AFLP引物共扩增出1297条谱带，其中多态性位点数1011个，多态位点百分率为77.95%：Nei’基因多样性指数为0.1439～0.2046，总体为0.2518；Shannon信息指数的变异范围在0.1972～0.2895之间，总体为0.4089；甘肃地区野板栗居群遗传多样性水平最高，陕两宝鸡居群的遗传多样性水平最低。AMOVA分析表明野板栗居群问的遗传变异占总变异的17.51%，居群内变异占69.76%。UPGMA聚类可将供试10个居群划分为3类，聚类结果表现出明显的地域性。

摘要： 采用AFLP标记对仅在云南南部及周边地区狭域分布的茶树近缘植物大理茶11个居群204个个体的遗传多样性进行了研究.分析结果表明：(1)大理茶遗传多样性水平低.在物种水平上, He=0.099,Ho=0.178;在居群水平上,He=0.083,Ho=0.137; (2)居群间的遗传分化较低.基于Nei's遗传多样性分析得出的居群间遗传分化系数Gst =0.1606; Shannon's居群分化系数为16.04％.AMOVA分析显示:大理茶的遗传变异主要存在于居群内,占总变异的80.97％,居群间的遗传变异占19.03%(3)两两居群间的Nei's遗传一致度(Ⅰ)的范围为0.971～0.997.经Mantel检测,居群间的遗传距离和地理距离之间不存在显著的正相关关系(r=0.1127,P＜0.001).推测人类活动的干扰和生境的片断化是导致大理茶濒危现状的主要因素.基于观察到的居群遗传信息,建议采取就地保护和迁地保护的保护策略.

摘要： 采用AFLP标记对仅在云南南部及周边地区狭域分布的茶树近缘植物大理茶11个居群204个个体的遗传多样性进行了研究.分析结果表明：(1)大理茶遗传多样性水平低.在物种水平上, He=0.099,Ho=0.178;在居群水平上,He=0.083,Ho=0.137; (2)居群间的遗传分化较低.基于Nei's遗传多样性分析得出的居群间遗传分化系数Gst =0.1606; Shannon's居群分化系数为16.04％.AMOVA分析显示:大理茶的遗传变异主要存在于居群内,占总变异的80.97％,居群间的遗传变异占19.03%(3)两两居群间的Nei's遗传一致度(Ⅰ)的范围为0.971～0.997.经Mantel检测,居群间的遗传距离和地理距离之间不存在显著的正相关关系(r=0.1127,P＜0.001).推测人类活动的干扰和生境的片断化是导致大理茶濒危现状的主要因素.基于观察到的居群遗传信息,建议采取就地保护和迁地保护的保护策略.

摘要： 本发明涉及使用SSR和AFLP-STS两种分子标记建立小麦DNA指纹的方法，及一组用于建立小麦DNA指纹的AFLP-STS引物；该方法包括建立品种的SSR指纹代码、STS指纹代码和汇聚上述指纹代码步骤；STS标记与SSR标记分布于小麦基因组中不同区域，用两种标记建立品种的DNA指纹，可更加全面地反应品种的遗传多样性；STS标记试验步骤与SSR相同，试验费用低廉；与SSR标记相比，由STS引物扩增的STS标记的带型简单，易于识别和记录，且可根据各引物所扩增的产物长度，将几个引物的产物在一块凝胶上电泳，节省电泳时间和试验成本，既可保持AFLP标记多态性高的优势，又克服了SSR标记记录方法繁琐缺陷。

摘要： 本发明涉及溯源检测领域，具体而言，涉及一种用于猪个体及品种鉴定的AFLP引物组合产品、试剂盒及方法。该方法使用如上所述的试剂盒对待检样本的DNA依次进行AFLP酶切与连接反应、连接产物的预扩增以及对预扩增产物的选择性扩增，并检测AFLP的选择性扩增产物。能够便利、精确地进行猪的个体及品种鉴定，进一步用于个体及品种的溯源，保证食品安全。

摘要： 本发明涉及溯源检测领域，具体而言，涉及一种用于肉牛个体及品种鉴定的AFLP引物组合产品、试剂盒及方法。该方法使用如上所述的试剂盒对待检样本的DNA依次进行AFLP酶切与连接反应、连接产物的预扩增以及对预扩增产物的选择性扩增，并检测AFLP的选择性扩增产物。能够便利、精确地进行肉牛的个体及品种鉴定，进一步用于个体及品种的溯源，保证食品安全。

摘要： 本发明属于生物工程技术领域，具体涉及一种利用AFLP‑DNA指纹图谱鉴定与评价冬虫夏草的方法，其包括以下步骤：(1)获取DNA片段：用内切酶MseI、EcoRI双酶切冬虫夏草标准品及冬虫夏草待测样品的基因组，以获取冬虫夏草标准品及冬虫夏草待测样品的基因组DNA片段；(2)建立连接体系：在DNA片段产物中加入EcoRI接头、MseI接头和T4DNA连接酶，得连接产物；(3)预扩增：将连接产物稀释5‑20倍，加入TaqDNA聚合酶、上样缓冲液、MgCl

摘要： 本发明涉及使用SSR和AFLP－STS两种分子标记建立小麦DNA指纹的方法，及一组用于建立小麦DNA指纹的AFLP－STS引物；该方法包括建立品种的SSR指纹代码、STS指纹代码和汇聚上述指纹代码步骤；STS标记与SSR标记分布于小麦基因组中不同区域，用两种标记建立品种的DNA指纹，可更加全面地反应品种的遗传多样性；STS标记试验步骤与SSR相同，试验费用低廉；与SSR标记相比，由STS引物扩增的STS标记的带型简单，易于识别和记录，且可根据各引物所扩增的产物长度，将几个引物的产物在一块凝胶上电泳，节省电泳时间和试验成本，既可保持AFLP标记多态性高的优势，又克服了SSR标记记录方法繁琐缺陷。

摘要： 本发明本发明涉及一种鉴定食品中猪源性成分的PCR‑AFLP方法，属于食品检测领域。通过对猪、牛、羊、鸡、鸭的生鲜和高压基因组DNA进行提取，然后使用AFLP试剂盒对基因组DNA进行酶切、连接、预扩增和选择性扩增，然后建立起AFLP试剂盒检测食品中猪源性成分的方法的检测方法，并对方法的灵敏度及特异性进行检测。结果表明，此方法可以有效鉴别出食品中肉制品的猪源性成分，且灵敏度达0.1％。

摘要： 本发明公开了一种引物对组合，本发明还公开了所述引物对组合在沿阶草种质鉴别或品种鉴定或AFLP分子指纹图谱库的构建中的应用。本发明还公开了一种沿阶草AFLP分子指纹图谱库的构建方法及其应用。本发明经过反复多次不懈的试验成功地筛选到能有效鉴别沿阶草不同种质的选择性扩增引物及引物组合，高质量的DNA指纹图谱，不但具有扩增位点多、带型质量好、分辨率高、条带疏密合适及分布均匀，易精准地检测出样本的细微差异，从而为构建沿阶草AFLP分子指纹图谱库奠定了技术基础；还通过提供的试剂方法九对引物组合等成功而有效的鉴别出30个不同种质沿阶草，为今后沿阶草种质鉴别、新品种登记、注册和产权保护等提供了科学依据。

摘要： 本发明公开了一种引物对组合，本发明还公开了所述引物对组合在结缕草种质鉴别或品种鉴定或AFLP分子指纹图谱库的构建中的应用。本发明还公开了一种结缕草AFLP分子指纹图谱库的构建方法及其应用。本发明经过反复多次不懈的试验成功地筛选到能有效鉴别结缕草不同种质的选择性扩增引物及引物组合，高质量的DNA指纹图谱，不但具有扩增位点多、带型质量好、分辨率高、条带疏密合适及分布均匀，易精准地检测出样本的细微差异，从而为构建结缕草AFLP分子指纹图谱库奠定了技术基础；还通过提供的试剂方法8对引物组合等成功而有效的鉴别出90个不同种质结缕草，为今后结缕草种质鉴别、新品种登记、注册和产权保护等提供了科学依据。

摘要： 本发明涉及溯源检测领域，具体而言，涉及一种用于猪个体及品种鉴定的AFLP引物组合产品、试剂盒及方法。该方法使用如上所述的试剂盒对待检样本的DNA依次进行AFLP酶切与连接反应、连接产物的预扩增以及对预扩增产物的选择性扩增，并检测AFLP的选择性扩增产物。能够便利、精确地进行猪的个体及品种鉴定，进一步用于个体及品种的溯源，保证食品安全。

摘要： 本实用新型公开了一种用于基因分析的荧光AFLP试剂盒，包括盒体、六组试剂瓶，盒体内设有瓶架，各试剂瓶放置于瓶架上；第一组试剂瓶为装有适配子的试剂瓶；第二组试剂瓶为装有属于酶切/连接反应预混合体系中的试剂的试剂瓶；第三组试剂瓶为装有PCR预混合体系中的试剂的试剂瓶；第四组试剂瓶为装有预扩增引物预混合体系中的试剂的试剂瓶；第五组试剂瓶为装有选扩增引物系列中的试剂的试剂瓶；第六组试剂瓶为装有质控DNA的试剂瓶；其中，第五组试剂瓶设有荧光物质。试剂盒使用方便、结构简单，本实用新型试剂盒能够用于基因分析，能够用于种质鉴定、亲缘关系及种质分类研究。具有数据收集自动化、定量化、灵敏性更好、速度更快、效率更高等特点。