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SCAR标记

SCAR标记的相关文献在1999年到2022年内共计270篇,主要集中在农作物、园艺、植物保护 等领域,其中期刊论文143篇、会议论文9篇、专利文献37872篇;相关期刊80种,包括水生生物学报、西北植物学报、农业生物技术学报等; 相关会议9种,包括2015年中国观赏园艺学术研讨会、中国园艺学会猕猴桃分会第五届研讨会、第五届全国枇杷学术研讨会等;SCAR标记的相关文献由865位作者贡献,包括彭德良、彭焕、高利等。

SCAR标记—发文量

期刊论文>

论文:143 占比:0.38%

会议论文>

论文:9 占比:0.02%

专利文献>

论文:37872 占比:99.60%

总计:38024篇

SCAR标记—发文趋势图

SCAR标记

-研究学者

  • 彭德良
  • 彭焕
  • 高利
  • 刘太国
  • 陈万权
  • 黄文坤
  • 亓晓莉
  • 刘冰江
  • 吴雄
  • 张友军
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利文献

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排序:

年份

    • 吕博雅; 张珍悦; 赵李; 李晓萍; 李家创; 白宇皓; 刁慧珊; 刘洋; 杨群慧; 刘淑会; 武军; 陈新宏
    • 摘要: 为准确快速地建立小麦-华山新麦草杂交后代的分子标记鉴定方法,利用180条长度为10 bp的随机引物R1~R180对小麦-华山新麦草全套(1Ns~7Ns)二体附加系及其亲本华山新麦草和普通小麦7182共9个材料进行了RAPD分析。结果表明,R131在华山新麦草和小麦-华山新麦草2Ns二体附加系中可以扩增出特异条带。将该特异条带回收并测序,发现其全长为1126 bp,对其进行序列比对分析后设计SCAR引物S131,然后利用S131重新对9份材料进行了SCAR分析。结果显示,S131只在华山新麦草和小麦-华山新麦草2Ns二体附加系中扩增出特异性条带,表明RAPD标记R131已成功转化为可靠、特异的SCAR标记S131。这个新的SCAR标记可用于检测普通小麦背景下华山新麦草2Ns染色体。
    • 彭华正; 金群英; 汪琳悦; 叶华琳; 朱汤军
    • 摘要: [目的]获得品种间具有多态性且稳定可靠的序列特异性标记,用于薄壳山核桃杂交育种中的分子鉴定.[方法]选取5个性状差异较大的品种Van Deman、Moore、Nacono、Davis和Pawnee,提取高质量基因组DNA,经合适的限制性内切酶酶切后分别构建文库,利用Illumina HiSeq高通量测序仪获得每种样品的简化基因组数据.再进行序列与基因库的比对和各品种间的差异片段比对,获得差异片段和位点,设计适合特异性片段扩增的PCR引物.然后通过试验筛选这些引物,并进行多个品种的多态性分析.[结果]5个品种的基因组DNA经简化基因组测序后,共获得25 963 442个reads,合计3 816.62 Mb碱基,其(A+T)/(C+G)的值约为1.63,长度质量指标Q20%大于95%,Q30%大于90%.经初步组装、精确组装和品种序列差异比对后,共获得特异序列3 916条,在差异位点上设计3 893对引物,然后进一步分析引物扩增可靠性,包括二级结构、碱基比例等,挑选其中1 133对引物,再根据理论扩增产物与核桃基因组的同源性,挑选出扩增产物同源性最高的候选引物473对,占可用引物数量的40%.利用PCR技术,测试这473对引物在23个山核桃品种中的多态性差异,最终获得能产生多态性位点的86对引物,占被筛选引物对1/5左右.将其中80对单一条带用于品种鉴定和亲缘关系分析.利用这些引物对的组合,可以将其中17个品种鉴定出来.基于这些多态性片段进行的亲缘关系分析结果表明,聚类结果与实际的亲缘关系有部分一致性,如揭示了Choctaw与Dependable、Moore与barton之间的亲缘关系.[结论]利用简化基因组测序方法可以挖掘出薄壳山核桃品种的序列特异性分子标记,运用这些标记引物的组合可以进行大量品种的鉴定.所开发的80对引物可用于山核桃杂交育种中亲本组合的选择.
    • 程琳; 张晓艳; 魏美甜; 伦尧尧; 赵静; 王晓武; 李传友
    • 摘要: 利用与番茄颈腐根腐病抗性基因Frl紧密连锁的CAPS标记C2-25,开发设计了新的SCAR标记,用于快速检测Frl抗性材料.使用C2-25引物,在25份已知表型的番茄材料中进行PCR,产物单克隆测序后发现,19份纯合抗病材料存在1条完全相同的抗病序列;4份纯合感病材料存在1条完全相同的感病序列;2份杂合抗病材料均存在前述的抗病序列和感病序列.根据抗病、感病序列SNP差异设计引物,最终筛选得到可扩增出370 bp抗病特异片段和520 bp感病特异片段的番茄颈腐根腐病连锁标记R-6F/2R、S-3F/4R.在500株F2材料中进行验证,检测到122株纯合抗病单株、257株杂合抗病单株和121株纯合感病单株.F2材料人工接种鉴定结果显示,473株单株抗性与分子鉴定结果一致,分子标记辅助鉴定的准确率达到94.6%.开发的SCAR标记准确度高、成本低、操作简便,可用于Frl基因的分子标记辅助育种.
    • 黄春琼; 张子雄; 王文强; 刘国道
    • 摘要: 本研究以圭亚那柱花草'1979'(Stylosanthes guianensis'1979',母本,花粉不育)和'热研2号'柱花草(轮回父本)的BC1F1代群体为材料,利用简单序列重复区间扩增多态性(Inter-simple Sequence Repeat,ISSR)技术,结合集群分组分析法(Bulked Segregate Analysis,BSA)构建花粉育性基因池.结果 表明:利用100条ISSR引物筛选出在不育基因池中有特异条带的引物共11条;经BC1F1群体单株验证,有8个标记仅在花粉不育个体中出现,表明其与花粉不育基因连锁;将这8个特异性片段回收、克隆、测序,并分别设计8对特异序列特异扩增区域(Sequenced Charaeterized Amplified Region,SCAR)引物,对BC1F1单株进行验证,发现这8条片段仅在不育个体中扩增出目标条带,表明8 ISSR特异片段成功转化为8个SCAR标记.本研究结果为建立柱花草稳定的雄性不育系提供新的理论基础,为柱花草杂交育种奠定基础.
    • 刘蕾; 王辉; 李文丽; 王富
    • 摘要: 利用与番茄颈腐根腐病抗病基因Frl紧密连锁的分子标记SCAR200和C2-25在已知抗病材料和感病材料中进行验证,进而结合接种鉴定方法在抗病商品品种凯文F2代群体中加以应用.结果表明,SCAR200和C2-25均为共显性标记,可以用于已知抗病和感病材料中的分子标记辅助鉴定;SCAR200和C2-25在凯文F2代群体24个单株中均检测到7个纯合抗病单株、5个感病单株和12个杂合抗病单株;接种鉴定结果显示,有1个单株与分子鉴定结果存在出入,即分子标记辅助鉴定的准确率为95.83%.
    • 叶碧欢; 陈友吾; 胡杨; 沈建军; 胡传久; 李海波
    • 摘要: 为更好地解决当前松材线虫Bursaphelenchus xylophilus检测工作中频现的假阴性问题,通过不同分子技术检测效果的比较评价,摸索出了一套可提高松材线虫检测准确性的技术体系.针对早期感病松木的低线虫量,建立了线虫的最大量分离方法和基于rDNA ITS序列的分子检测体系,该体系可高效检测出单条松材线虫,准确率达93.75%.以来自浙江省不同疫区的96份松木样品为检测材料,比较了SCAR标记和ITS序列2种分子检测技术的阳性率.结果显示,通过首次PCR,ITSⅠ和ITSⅡ序列的检测阳性率分别为52.08%和55.21%,SCAR标记的检测阳性率为30.21%;通过第二次或巢式PCR,ITSⅠ和ITSⅡ序列的检测阳性率提高到了97.92%和100.00%,SCAR标记的检测阳性率提高到了59.38%,表明基于ITS序列的检测阳性率明显高于SCAR标记,且通过第二次或巢式PCR方法可进一步提高检测灵敏度,降低假阴性率.因此,通过线虫的最大量分离并基于rDNAITS序列的分子检测可明显提高检测准确性,更适用于松材线虫的常规检测.
    • Zhou Le; WANG Ying-zhe; Tan Jing; XU An-kai; XU Bo
    • 摘要: 本研究通过已获得细胞质雄性不育系材料MS-GN-1A和保持系材料MS-GN-1B筛选与紫花苜蓿细胞质不育恢复基因高度连锁的分子标记并转化为SCAR特异标记,经鉴定分析发现该标记的重复性好,而且稳定,对紫花苜蓿"三系"配套中不育系种子生产鉴定提供研究基础.实验应用100条ISSR引物在紫花苜蓿线粒体基因组水平进行筛选,UBC842、UBS864引物在紫花苜蓿不育系及其同型保持系间显示出特异性片段,经反复验证,其差异条带均稳定出现,条带大小分别为457 bp和645 bp.对已获得的差异条带进行胶回收连接克隆载体后测序并转化为SCAR特异鉴定标记,以两对特异性引物对新培育的4组紫花苜蓿杂交种的不育系母本和同型保持系父本进行鉴定分析,发现该SCAR标记的重复性稳定.本研究通过ISSR标记对紫花苜蓿的不育系与保持系进行分析,将得到的差异片段克隆测序后转化为SCAR特异标记,该标记可以作为紫花苜蓿不育系种子纯度分析的候选标记,实际应用于不育系种子纯度的鉴定.
    • 赵伟; 高美英; 罗尧幸; 韩凯; 王静波; 杨忠义; 纪薇
    • 摘要: 为明确葡萄白粉病田间鉴定适宜条件,并筛选有效的葡萄抗白粉病分子标记探针,选取8个栽培葡萄品种(秋红宝、早黑宝、晚黑宝、无核翠宝、丽红宝、晶红宝、夏黑、克瑞森无核)与2个野生葡萄品种(北冰红和河津-1)为试材,设置不同温度梯度(4、20、24、28、32、36°C),采用针刺注射法对葡萄叶片进行白粉病菌人工活体侵染,琼脂玻片法对白粉病菌孢子进行萌发培养,观测其萌发及侵染动态,并将田间自然鉴定和苗期分子标记(葡萄抗白粉病RAPD标记OPW02-1756、SCAR标记SCO11-914)辅助选择技术相结合,对10个葡萄品种进行白粉病抗性鉴定分级及比对分析。结果表明,葡萄白粉病菌孢子萌发的较适宜温度为32°C;在各参试葡萄品种中,北冰红和河津-1为高抗品种(HR),秋红宝和晚黑宝为高感品种(HS),其他为中抗品种(MR);葡萄抗白粉病RAPD标记OPW02-1756适用于秋红宝、早黑宝、晚黑宝、晶红宝、丽红宝、无核翠宝、夏黑、克瑞森无核和河津-1的抗白粉病检测,不适用于北冰红;葡萄抗白粉病SCAR标记SCO11-914适用于北冰红和河津-1的抗白粉病检测,不适用于秋红宝、早黑宝、晚黑宝、晶红宝、丽红宝、无核翠宝、夏黑、克瑞森无核;而二者均适用于检测河津-1。本研究结果为葡萄抗白粉病育种和杂种鉴定提供了一定的材料基础和理论依据。
    • 贾梦珠; 马林; 孙九喆; 苏东赢; 杨金初; 王二彬; 许衡; 王永超; 王君婷; 孟丹丹
    • 摘要: 以12份烤烟品种为模板,针对6对SCAR引物进行引物比例和退火温度的条件优化,采用多重PCR技术,建立了12份烤烟品种的多重PCR指纹图谱和鉴别路线.结果表明,同普通PCR相比,多重PCR具有高效、快速、节约时间、成本低的优点,6对SCAR引物稳定性好、条带特异性强,能准确区分12份烤烟品种.%With 12 varieties of flue-cured tobacco as a template,the conditions for primer concentration and annealing temperature for 6 pairs of SCAR primers were optimized.Multiplex PCR fingerprints and identification routes of 12 flue-cured tobacco varieties were established by multiplex PCR.The results showed that multiplex PCR had the advantages of high efficiency, high speed, time saving and low cost compared with ordinary PCR.Six pairs of SCAR primers had good stability and specific band specificity, which could distinguish 12 flue-cured tobacco varieties accurately.
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