rDNA-ITS

摘要： 为明确甘肃省党参根腐病病原菌种类、优势种及病原菌种群在不同区域的分布差异,采用组织分离法对甘肃省陇西、渭源、临洮、岷县和宕昌等5个党参主产县的病样进行分离纯化和柯赫氏法则验证,通过rDNA-ITS、TEF-1α序列聚类分析鉴定不同区域病原菌种类及分离频率。结果发现,引起甘肃省党参根腐病的病原菌主要为镰孢属Fusarium真菌,分离频率为72.66%,包括尖镰孢F.oxysporum、锐顶镰孢F.acuminatum、茄镰孢F.solani、木贼镰孢F.equiseti和燕麦镰孢F.avenaceum等9个种,其中尖镰孢和锐顶镰孢为优势种,分离频率分别为41.80%和16.41%。5个主产县党参根腐病病原种类及其分离频率各不相同,但优势属均为镰孢属,优势种均为尖镰孢。其中渭源县分离的病原菌种类最多,分离到镰孢属的6个种;其次为岷县,分离到镰孢属的5个种;临洮县分离的病原菌种类最少。部分镰孢菌在甘肃省党参产区为首次发现。

摘要： 凉果加工与贮藏中霉菌污染直接影响凉果的品质。为明确凉果贮藏中优势腐败霉菌的种类,该研究对在常温贮存4个月后霉变的葡萄干、话梅、杏脯中腐败霉菌进行了分离纯化,得到7种典型腐败霉菌。将分离出的腐败霉菌回接至无菌的葡萄干、话梅、杏脯表面,进行回接侵染实验,通过凉果霉变时间确定出4株菌株为优势腐败霉菌。通过菌落形态特征、菌丝和分生孢子显微结构观察,结合核糖体内转录间隔区(rDNA-ITS)序列分析,构建系统发育,鉴定优势霉菌种属。结果表明:葡萄干的优势霉菌为芽枝状枝孢霉(Cladosporium velox)和暗黄青霉(Penicillium citreonigrum),话梅的优势腐败菌为细极链格孢(Alternaria tenuissima),杏脯的优势腐败霉菌为菌核青霉(Penicillium sclerotiorum)。该研究结果可为凉果腐败霉菌的分离鉴定提供可靠的方法,也可为后续凉果杀菌方法的选择,贮藏条件的优化提供依据。

摘要： 对采集到的野生大型真菌子实体进行形态学及rDNA-ITS鉴定,并研究其小鼠急性经口毒性。结合子实体形态学特征和ITS序列分析结果,该野生子实体鉴定为粉褶白环蘑(Leucoagaricus leucothites);其鲜品和干品均为实际无毒级别。研究结果为粉褶白环蘑的快速识别及食用安全性提供了科学依据。

摘要： 华重楼灰霉病在湖北和湖南两省多有发生,己对华重楼药材生产构成了严重威胁.为明确该病菌的遗传多样性水平,本研究对分离自两省10个地区的92株华重楼灰霉病菌进行了 rDNA-ITS分子鉴定,同时采用SSR-PCR技术进行了遗传多样性分析.rDNA-ITS分子鉴定结果表明92株病原菌均为灰葡萄孢Botrytis cinerea,ITS系统发育树可初步显示其遗传多样性丰富.SSR-PCR多样性分析结果表明,应用9对SSR引物共检测出109个等位基因位点,等位基因和有效等位基因平均值分别为12和3.6589,香农指数和多态信息含量平均值分别为1.5048和0.6196.10个群体各自有效等位基因在1.622-3.971之间;香农指数在0.527-1.582之间;观测杂合度在0.148-0.593之间;期望杂合度在0.321-0.708之间.Nei遗传距离为0.15时,UPGMA聚类树可将92株病菌划分为4个类群.群体间基因流值为0.19-4.67,遗传分化值为0.047-0.638,群体遗传同一性和遗传距离范围值分别为0.1531-0.9679和0.0327-1.8766.综上所述,湖北和湖南两省华重楼灰霉病菌群体存在明显的遗传多样性,这为湖北和湖南两省区华重楼灰霉病的科学防治提供了理论依据.

摘要： 采用克隆文库技术对带叶兜兰根内真菌的ITS片段进行PCR扩增及高通量测序分析,共得到有效序列952589条,共产生1028个OTUs,共涉及6个门、21个纲、46个目、96个科、143个属、217个种及大量未分类种类.其中HJD样点根内真菌种类和数目最多,YM和LY样点根内真菌种类和数目次之,且这两个样点之间无显著区分.

摘要： 桑黄是一种具有极高药用价值的真菌,但其分类及鉴定较为混乱.本研究克隆并测定了桑黄Y1菌株的rDNA ITS序列,对该序列的碱基组成、碱基替换数及序列同源性等进行分析;用Mega7.0软件邻接法(neighbor-joining,NJ)构建了基于桑黄rDNA ITS的系统发育树.结果 表明:桑黄Y1菌株的rDNA ITS序列总长度为709 bp,rDNA ITS1和rDNA ITS2序列具有很多变异位点,存在序列多态性,其中rDNA ITS1序列的碱基替换数比rDNA ITS2的碱基替换数明显增多;系统发育分析表明木层孔菌属真菌可分为3个类群,桑黄属于鲍姆木层孔菌(Phellinus baumii),与裂蹄木层孔菌(Phellinus linteus)亲缘关系较近.研究结果可为桑黄的分类及鉴定提供一定的依据.

摘要： 通过对引起艾蒿叶斑病的病原菌进行分离和分子鉴定,并采用菌丝生长速率法研究了5种杀菌剂对艾蒿叶斑病菌的抑制作用.结果表明,分离出的艾蒿叶斑病菌属链格孢属(Alternaria alternata).室内毒力实验结果表明,抑菌率最高的药剂是50％氟吡菌酰胺·肟菌酯悬浮剂和25％戊唑醇药剂.病原菌的EC50值结果表明,艾蒿叶斑病菌对50％氟吡菌酰胺·肟菌酯和25％戊唑醇EC50值最小,分别是0.04 mg/mL和0.28 mg/mL,说明这两种药剂对艾蒿叶斑病菌的抑菌性最强,可以作为田间药效试验研究的备选农药参考.

摘要： 采用组织分离法进行病原物的分离、柯赫氏法则进行致病性测定,并利用真菌通用引物 ITS1/ITS4和蚕豆葡萄孢特异性引物 G3PDHfor/G3PDHrev进行基因组DNA扩增与序列分析,对甘肃省渭源县蚕豆赤斑病的致病菌种类进行研究.结果表明:该病原菌为蚕豆葡萄孢(Botrytis fabae ),系统发育树分析表明该病原菌与 GenBank已报道的蚕豆葡萄孢属聚为一类.生物学特性测定表明,该病原菌菌丝生长最适培养基为PDA培养基,最适碳源和氮源分别为乳糖和酵母膏,最适温度为 20 °C,最适 pH为 8,对光照不敏感.

摘要： 为了准确鉴定黑龙江省丹顶鹤体内的次睾吸虫并确定其分类地位,本试验采用形态学观察与PCR扩增ITS序列进行虫种鉴定。结果显示:试验中次睾吸虫与东方次睾吸虫形态学特点基本一致;该吸虫的ITS序列长度为1077 bp,其中ITS1、5.8S rDNA、ITS2的长度分别是629、160 bp和288 bp,与NCBI中东方次睾吸虫(序列号:MK482054)的同源性达到99.8%,与其他次睾吸虫的同源性最高可达到98.2%;进化分析显示,试验中的次睾吸虫与已发表的东方次睾处于1个小分支,与其他次睾属吸虫形成了1个大分支,表明了其亲缘关系较近。基于形态学和分子生物学的鉴定结果,本试验中的次睾吸虫为东方次睾吸虫,所获得的ITS序列可作为后睾科寄生虫分类的基因标记。

摘要： 应用核糖体rDNA-ITS区的序列分析研究13个不同地区来源的剑麻茎腐病病原菌。结果表明：测试菌株的ITS扩增区(ITS4-ITS5)约600 bp，无太大的长度变异。ITS核酸序列的聚类分析结果表明：13个测试菌株被聚为2个类群，群与群之间差异不明显，2组之间同源率为96%，通过在NCBI网站的blast比对分析，结果显示2组均为黑曲霉菌(Aspergillus niger)。

摘要： 应用核糖体rDNA-ITS区的序列分析研究13个不同地区来源的剑麻茎腐病病原菌。结果表明：测试菌株的ITS扩增区(ITS4-ITS5)约600 bp，无太大的长度变异。ITS核酸序列的聚类分析结果表明：13个测试菌株被聚为2个类群，群与群之间差异不明显，2组之间同源率为96%，通过在NCBI网站的blast比对分析，结果显示2组均为黑曲霉菌(Aspergillus niger)。

摘要： 应用核糖体rDNA-ITS区的序列分析研究13个不同地区来源的剑麻茎腐病病原菌。结果表明：测试菌株的ITS扩增区(ITS4-ITS5)约600 bp，无太大的长度变异。ITS核酸序列的聚类分析结果表明：13个测试菌株被聚为2个类群，群与群之间差异不明显，2组之间同源率为96%，通过在NCBI网站的blast比对分析，结果显示2组均为黑曲霉菌(Aspergillus niger)。

摘要： 应用核糖体rDNA-ITS区的序列分析研究13个不同地区来源的剑麻茎腐病病原菌。结果表明：测试菌株的ITS扩增区(ITS4-ITS5)约600 bp，无太大的长度变异。ITS核酸序列的聚类分析结果表明：13个测试菌株被聚为2个类群，群与群之间差异不明显，2组之间同源率为96%，通过在NCBI网站的blast比对分析，结果显示2组均为黑曲霉菌(Aspergillus niger)。