NA基因

摘要： 目的了解克拉玛依市甲型H3N2流感病毒HA和NA基因特征,为防控提供科学依据。方法收集2018-2020年克拉玛依市甲型H3N2流感毒株进行HA和NA基因序列测定,运用Mega软件与疫苗株进行序列比对和分析。结果 18株毒株HA基因与A/Hong Kong/4801/2014同源性高于A/Kansas/14/2017,NA基因与A/Hong Kong/4801/2014同源性低于A/Kansas/14/2017。相对疫苗株,克拉玛依市毒株已出现氨基酸同时在2个及以上抗原决定簇发生替换;HA蛋白均发生了糖基化位点的改变;未发现与耐药相关位点突变。结论 2019-2020年克拉玛依市毒株与当年度疫苗推荐株匹配度降低且HA已发生抗原漂移,可能导致本地区H3N2毒株流行,神经氨酸酶抑制剂类药物依旧能够有效治疗流感,应加强对流感病毒HA和NA基因进行监测。

摘要： 为了解上海市活禽市场H9N2亚型禽流感病毒(AIV)分离株的遗传变异情况,本研究对2018年分离的6株H9N2 AIV的8个基因片段进行PCR扩增、克隆和测序,并对获得的HA和NA基因序列进行同源性和关键位点分析.结果 显示:6个分离株的HA裂解位点均为RSSR↓GLF,符合低致病性AIV的分子特征;并对6株分离株HA基因分析了糖基化位点;受体结合位点除198位、202位和203位有变异外,其他位点均保守;226位氨基酸均为L,因此具有与哺乳动物唾液酸α2-6受体结合的特征.此外也对NA基因红细胞结合位点,活性中心以及抗原决定簇进行了分析,在红细胞结合位点403位发生突变,在活性中心(同时为抗原决定簇)143位发生突变,这6株病毒其余位点均保守.HA基因进化树显示,上述6株分离株均属于近几年在中国鸡群中流行的Y280分支.从8个基因片段组成方式分析这6个毒株属于G57基因型.以上研究为H9N2亚型AIV的防控和疫苗研制提供了科学参考.

摘要： 目的 分析2017-2019年贵州省H3N2亚型流感病毒流行特征及神经氨酸酶(Neuramini dase,NA)基因的遗传特性,为H3N2亚型流感病毒的防控提供科学依据.方法 采集2017-2019年贵州省13家国家级流感监测哨点医院的流感样病例(ILI)咽拭子标本,进行荧光定量PCR的检测,以 自然年度为监测周期进行统计分析.H3N2亚型核酸阳性的标本进行狗肾胚细胞(MDCK)分离病毒,收集培养液提取病毒RNA,进行RT-PCR特异性NA基因扩增,扩增产物纯化后进行测序,用MAGE7.0软件和Clustal W2软件进行同源性、遗传进化和耐药位点分析.结果 2017-2019年,贵州省采集ILI咽拭子标本分别为15 553、15 164和15 348份,H3N2亚型阳性率分别为5.12％(797/15 553)、0.80％(122/15 164)和7.67％(1 177/15 348),呈交替流行趋势;高峰期主要出现在1-3月和10-12月.2017-2019年H3N2亚型NA基因核苷酸同源性为97.5％～100％,在进化树上主要分成2个分支,所有毒株NA基因关键位点均未发生突变.结论 贵州省H3N2亚型流感病毒呈年度周期性流行,多发于冬春季节,为更好防控流感,应及时掌握流行趋势,需加强监测并及时分析病毒基因特征变异情况.

摘要： 黑胫病为烟草常见土传病害,当环境条件适宜时,土壤中的病原菌便会侵染烟株导致发病。为研究感染黑胫病前后烟株根际土壤、发病茎秆以及病健交界茎秆细菌群落结构与多样性,长江大学生命科学学院等单位研究人员以健康与感染黑胫病烟株根际土壤和茎秆为研究对象,通过PCR技术扩增样本中细菌16S rR NA基因的V3-V4可变区域.

摘要： H5N8亚型禽流感是传播性极强的人兽共患病,为了简便快速的检测H5N8亚型禽流感病毒,针对H5N8亚型禽流感病毒HA基因和NA基因序列分别设计合成特异性引物和探针,通过优化反应条件,建立了同一反应程序下同时扩增HA基因和NA基因的双重荧光RT-PCR检测方法.结果显示,该检测方法特异性强,不与其他亚型禽流感病毒和禽常见病原发生交叉反应,敏感性可达10 copies/μL;组内组间重复性好,平均变异系数均小于0.4％;用该方法对108份临床样品检测,结果与病毒分离鉴定方法检出率一致.综上所述,建立的H5N8亚型禽流感病毒双重荧光RT-PCR检测方法具有快速、特异、敏感、重复性好等优点,为H5N8亚型禽流感的快速诊断和疫情防控提供了一定的技术支持.

摘要： 目的 了解2011—2018年青岛市人群B型流感病毒(IBV)流行株基因进化变异趋势.方法 2011—2018年间青岛市流感样病例标本12236份,提取病毒RNA,采用IAV/IBV多重荧光RT-PCR方法鉴定流感病毒及型别,使用B/Victoria系和B/Yamagata系分型核酸检测试剂盒检测IBV两个谱系;选取IBV 182株,RT-PCR扩增血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)基因,并进行序列测定,进行系统发育分析及氨基酸位点变异分析.结果 2011—2018年青岛市几乎每年都会检出IBV,阳性率(4.99％)仅比IAV(6.21％)略低.B/Victoria和B/Yamagata分别出现了2个(2011—2012年,2015—2016年)和3个显著流行年份(2013—2014年,2014—2015年,2017—2018年).感染人群以10岁以下儿童为主,两系具有相似的年龄特征.基于HA进化,B/Victoria系分离株分属于Vic-1A和Vic-1B,B/Yamagata系分离株分属于Yam-2和Yam-3.B/Yamagata在HA上的氨基酸变异位点多于B/Victoria,表现出更大的遗传多样性.B/Yamagata系在抗原决定簇上已发生了12个氨基酸位点变异,在受体结合位点上发生了2个氨基酸位点变异;B/Victoria系则分别已发生7个和3个氨基酸位点变异.青岛市IBV基因重配频繁,系内重配26株,多发生在B/Victoria系内;系间重配23株,多发生在HA-B/Yamagata与NA-B/Victoria之间.发现了1株可能的NA抑制剂耐药株.结论 IBV在季节性流感中的地位不容忽视.氨基酸替换、插入-缺失和基因片段重配是IBV自然进化的主要策略.流感监测十分重要,流感疫苗株需要及时更新.%Objective To investigate the molecular epidemiological characteristics of hemaggluti-nin (HA) and neuraminidase (NA) of influenza B viruses (IBV) isolated in Qingdao from 2011 to 2018. Methods A total of 12236 samples of influenza-like cases in Qingdao from 2011 to 2018 were collected to extract viral RNAs. All samples were screened for influenza A viruses ( IAV) and IBV by one-step multiplex real-time RT-PCR. Lineages of IBV were identified. One hundred and eighty-two strains of IBV were select-ed to amplify HA and NA genes by RT-PCR and then analyzed by sequencing. Phylogenetic analysis and variation analysis of genes and amino acids were carried out. Results IBV was detected almost every year in Qingdao from 2011 to 2018. The positive rate was only slightly lower than that of IAV ( 4. 99％ vs 6. 21％). B/Victoria linkage had two prominent epidemic years (2011-2012, 2015-2016), while B/Yama-gata linkage had three (2013-2014, 2014-2015, 2017-2018). Most of the infected people were children un-der 10 years old, and the people infected with the two lineages had similar age characteristics. Phylogenetic analysis of HA genes showed clusters in Victoria clades of 1A and 1B and Yamagata clades of 2 and 3. IBV of Yamagata lineage had more amino acid mutation sites than those of Victoria lineage in HA genes with grea-ter genetic diversity. The B/Yamagata strains had 12 amino acid mutations and the B/Victoria strains had seven in four major epitopes. In the receptor binding sites, two amino acid mutations were detected in the B/Yamagata strains and three in the B/Victoria strains. In Qingdao, 26 strains of IBV were intra-lineage reas-sortments, mostly of the B/Victoria lineage, and 23 strains were inter-lineage reassortments, mostly between HA-B/Yamagata and NA-B/Victoria strains. A possible resistant strain to NA inhibitor was found. Conclu-sions The significance of IBV in seasonal influenza should not be neglected. Amino acid substitution, in-sertion/deletion and gene reassortment were the main strategies for the natural evolution of IBV. Influenza surveillance was of great importance and influenza vaccine strains needed to be updated in time.

摘要： 分析1株西藏H5N1亚型禽流感病毒血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)基因的遗传进化特征。利用RT-PCR法对H5亚型抗原阳性流感病毒核酸检测,并分子克隆、核苷酸测序,再利用DNASTAR、MEGA7.0软件进行同源性分析和基因遗传进化分析。经基因遗传进化分析表明,H5N1亚型禽流感病毒和2012年孟加拉国分离株亲缘关系最近,属于同一分支,HA蛋白裂解位点处有较多碱性氨基酸,从分子上表明西藏毒株H5N1是高致病性禽流感病毒。对西藏分离株H5N1亚型禽流感病毒HA和NA基因进行遗传进化分析,为西藏H5亚型禽流感病毒感染防控具有指导意义。

摘要： To develop a simple and rapid method for detection of influenza A virus subtype H7N9,three pairs of specific primers were designed according to the conserved regions on the HA sequences of influenza A virus subtype H7,the NA sequences of influenza A virus subtype N9 and the M sequences of all influenza A viruses in GenBank,respectively. A triple polymerase chain reaction (PCR) method was developed for detection of influenza A virus subtype H7N9 through optimization of triple PCR conditions,specificity test and sensitivity test. In this triple PCR,three specific fragments of the 304 bp of HA gene,the 160 bp of NA gene and the 458 bp of M gene could be amplified on the templates as influenza A virus subtype H7N9,but just one specific fragment of the 458 bp of M gene was amplifiedon the templates asthe other influenza A viruses,andthe triple PCR was negative for other viruses. Sensitivity test results showed that the detection limitof the triple PCR method was 0.6 pg of templates as H7N9 virus. Four hundred and seventy clinical samples were detected in the triple PCR,no influenza A virus subtype H7N9 was found. It was shown that the triple PCR method was rapid,sensitiveand specific,and it provided technical support for clinical test,effective prevention and control for influenza A virus subtype H7N9.%为建立简便快速检测 H7N9 亚型流感病毒的方法,根椐 GenBank 中 H7亚型流感病毒的HA基因、N9亚型流感病毒的 NA 基因和所有亚型流感病毒M基因的保守序列,分别设计了3对特异性引物,优化反应条件,并通过特异性试验、敏感性试验,建立了H7N9亚型流感病毒三重PCR检测方法.利用该法对H7N9亚型流感病毒进行扩增,可得到3条特异性条带(HA基因304 bp,NA基因160 bp,M基因458 bp),其他亚型流感病毒只出现1条特异性条带,大小为458 bp,对其他病原体的检测均无扩增条带.敏感性试验结果表明,该法最低能检测到0.6 pg H7N9 亚型流感病毒.用该法对470个样品进行检测,未发现H7N9 亚型流感病毒.该法具有快速、敏感和特异等优点,可为临床检测和疾控防控提供技术支持.

摘要： The high prevalence of influenza A virus is identified in Hunan Province because of the high density of poultry farms. To survey the variations of H9N2 subtype avian influenza virus in Hunan province, we analyzed HA and NA genes of 10 virus strains isolated from different areas of Hunan Province. All these strains belong to the Eurasian lineage, Y280-like sub-lineage. The cleavage sites in their HA genes were all RSSR↓GLT, corresponding to the feature of low pathogenic AIV. All strains had an L (Leu) at the site 234 in the HA genes, indicating the ability of binding with the SAα-2, 6 receptor. NA gene stalk deletions at aa 63-65 were also detected from all the isolates, indicating a possibility of increased virus replication in mammals. Our findings suggest that more attention should be paid to the surveillance of H9N2 influenza virus and its direction of reassortment.%我国湖南地区因水禽家禽饲养较多且密集,是流感病毒高发省份.为了监测流感病毒的变异情况,采用RT-PCR技术扩增了10株H9N2亚型流感病毒的HA和NA基因,并进行了序列测定和分析.结果显示,10株分离株均属于欧亚分支中的Y280亚系;HA碱性裂解位点序列均为RSSR↓GLT,为低致病性流感病毒特征;HA受体结合位点234位均为L,具有与人唾液酸α-2,6受体结合的特性;NA蛋白均在颈部(63-65位)出现氨基酸缺失,这种缺失能增加流感病毒在哺乳动物中的复制能力.提示H9N2亚型毒株近年有毒力和致病力趋于转强的可能性,因此,要加强对H9N2亚型禽流感病毒的监测,密切关注它的重组趋势.

摘要： 为了解2016年山东地区H9N2亚型禽流感病毒的变异情况,选取分离鉴定的10株H9N2亚型禽流感病毒分离毒株,分别对其HA和NA基因进行序列测定和分子特性分析,并应用Mega 5.0软件绘制相应的基因氨基酸进化树,进行遗传进化分析.结果表明:10株H9N2分离毒的HA裂解位点氨基酸均为RSSR/GLF,具有典型低致病性AIV HA基因的特征;其第226位氨基酸均为亮氨酸(L),因此具有结合人流感受体的分子特性.同时这10株病毒的NA基因颈部均有9个核苷酸的缺失,且NA的潜在糖基化位点均不超过8个.进化树分析表明,2016年山东地区H9N2流行毒株HA和NA基因均属A/Chicken/Beijing/1/1994亚群,并且同属于近几年在中国鸡群中流行的G57分支.

摘要： 1996年,H5N1亚型高致病性禽流感首次在中国广东省水禽中被发现.此后,H5亚型高致病性禽流感在世界多个国家和地区广泛传播,给家禽行业造成巨大的经济损失,严重威胁人类健康.从2011年开始,H5N1与H9N2、H6N6、H12N8及其他亚型流感病毒重组,产生了新重组基因型的H5亚型禽流感如H5N2、H5N6、H5N8等,部分毒株表现高致病性特征,并在全球广泛流行.目前2.3.4.4分支的H5N6及H5N8在中国大部分地区都能检测到,并且有多例人感染H5N6死亡案例.然而相同H5亚型的禽流感携带不同NA片段(H5Nx)禽流感病毒的流感特点、致病性及传播特性仍然未知.为了解NA基因对H5Nx亚型AIV(Avian influenza virus)生物学特性的影响,以一株鹅源的H5N1亚型禽流感病毒A/goose/Guangdong/SH7/2013(H5N1),简称SH7株为载体,利用反向遗传操作技术,分别替换A/chicken/Hebei/LZF/2014(H5N2)、A/duck/Guangdong/673/2014(H5N6)、A/goose/Guangdong/674/2014(H5N6,NA颈部有缺失)和A/goose/Guangdong/Js1306/2014(H5N8)等毒株NA,拯救获得亲本株rH5N1(H5N1)和4株具有不同NA的H5亚型重组AIVs,分别为rH5N2(H5N2)、rH5N6(H5N6)、△rH5N6(H5N6)和rH5N8(H5N8).测定了5株重组病毒在CEF和MDCK中的增殖情况,发现CEF中各病毒滴度差异不显著,MDCK中病毒滴度由高到低依次是N8、短茎N6、N1、长茎N6和N2.动物实验表明,替换不同NA的H5亚型禽流感病毒对小鼠和SPF鸡的致病性差异显著.

摘要： 1996年,H5N1亚型高致病性禽流感首次在中国广东省水禽中被发现.此后,H5亚型高致病性禽流感在世界多个国家和地区广泛传播,给家禽行业造成巨大的经济损失,严重威胁人类健康.从2011年开始,H5N1与H9N2、H6N6、H12N8及其他亚型流感病毒重组,产生了新重组基因型的H5亚型禽流感如H5N2、H5N6、H5N8等,部分毒株表现高致病性特征,并在全球广泛流行.目前2.3.4.4分支的H5N6及H5N8在中国大部分地区都能检测到,并且有多例人感染H5N6死亡案例.然而相同H5亚型的禽流感携带不同NA片段(H5Nx)禽流感病毒的流感特点、致病性及传播特性仍然未知.为了解NA基因对H5Nx亚型AIV(Avian influenza virus)生物学特性的影响,以一株鹅源的H5N1亚型禽流感病毒A/goose/Guangdong/SH7/2013(H5N1),简称SH7株为载体,利用反向遗传操作技术,分别替换A/chicken/Hebei/LZF/2014(H5N2)、A/duck/Guangdong/673/2014(H5N6)、A/goose/Guangdong/674/2014(H5N6,NA颈部有缺失)和A/goose/Guangdong/Js1306/2014(H5N8)等毒株NA,拯救获得亲本株rH5N1(H5N1)和4株具有不同NA的H5亚型重组AIVs,分别为rH5N2(H5N2)、rH5N6(H5N6)、△rH5N6(H5N6)和rH5N8(H5N8).测定了5株重组病毒在CEF和MDCK中的增殖情况,发现CEF中各病毒滴度差异不显著,MDCK中病毒滴度由高到低依次是N8、短茎N6、N1、长茎N6和N2.动物实验表明,替换不同NA的H5亚型禽流感病毒对小鼠和SPF鸡的致病性差异显著.

摘要： 1996年,H5N1亚型高致病性禽流感首次在中国广东省水禽中被发现.此后,H5亚型高致病性禽流感在世界多个国家和地区广泛传播,给家禽行业造成巨大的经济损失,严重威胁人类健康.从2011年开始,H5N1与H9N2、H6N6、H12N8及其他亚型流感病毒重组,产生了新重组基因型的H5亚型禽流感如H5N2、H5N6、H5N8等,部分毒株表现高致病性特征,并在全球广泛流行.目前2.3.4.4分支的H5N6及H5N8在中国大部分地区都能检测到,并且有多例人感染H5N6死亡案例.然而相同H5亚型的禽流感携带不同NA片段(H5Nx)禽流感病毒的流感特点、致病性及传播特性仍然未知.为了解NA基因对H5Nx亚型AIV(Avian influenza virus)生物学特性的影响,以一株鹅源的H5N1亚型禽流感病毒A/goose/Guangdong/SH7/2013(H5N1),简称SH7株为载体,利用反向遗传操作技术,分别替换A/chicken/Hebei/LZF/2014(H5N2)、A/duck/Guangdong/673/2014(H5N6)、A/goose/Guangdong/674/2014(H5N6,NA颈部有缺失)和A/goose/Guangdong/Js1306/2014(H5N8)等毒株NA,拯救获得亲本株rH5N1(H5N1)和4株具有不同NA的H5亚型重组AIVs,分别为rH5N2(H5N2)、rH5N6(H5N6)、△rH5N6(H5N6)和rH5N8(H5N8).测定了5株重组病毒在CEF和MDCK中的增殖情况,发现CEF中各病毒滴度差异不显著,MDCK中病毒滴度由高到低依次是N8、短茎N6、N1、长茎N6和N2.动物实验表明,替换不同NA的H5亚型禽流感病毒对小鼠和SPF鸡的致病性差异显著.

摘要： 目的：本研究主要目的是监测近期猪流感病毒的感染情况及分子特征，为猪流感病毒的监控及防治提供参考。方法：对2009年9月-2011年1月期间来自北京、河北、山东、山西、浙江等7个省市送检的673份临床发病猪的肺脏样品进行猪流感病毒M基因和NS基因的RT-PCR检测，对阳性样品进行鸡胚传代，收集尿囊液进行H1，H3, H9，N1，N2亚型鉴定及其中13个分离株的NA基因克隆测序，对获得的NA全基因序列进行Blast搜索，与Genbank数据库中的相关序列用clustalX比对，应用phylip软件做种系进化树，用MegAlign进行核普酸序列同源性分析。结果：核苷酸同源性比较结果显示，相同基因型的H1N1亚型分离株之间NA基因核苷酸同源性为94.7%-99.9%，不同基因型之间NA基因核苷酸同源性为79.8%-81.1%。结论：通过对NA基因序列分析可得，5株类禽基因型毒株之间同源性为90.1%-99.4%，其中1株与2009年墨西哥大流行流感病毒亲缘关系最近，处于同一分支，核甘酸同源性达99.0%。

摘要： 目的：本研究主要目的是监测近期猪流感病毒的感染情况及分子特征，为猪流感病毒的监控及防治提供参考。方法：对2009年9月-2011年1月期间来自北京、河北、山东、山西、浙江等7个省市送检的673份临床发病猪的肺脏样品进行猪流感病毒M基因和NS基因的RT-PCR检测，对阳性样品进行鸡胚传代，收集尿囊液进行H1，H3, H9，N1，N2亚型鉴定及其中13个分离株的NA基因克隆测序，对获得的NA全基因序列进行Blast搜索，与Genbank数据库中的相关序列用clustalX比对，应用phylip软件做种系进化树，用MegAlign进行核普酸序列同源性分析。结果：核苷酸同源性比较结果显示，相同基因型的H1N1亚型分离株之间NA基因核苷酸同源性为94.7%-99.9%，不同基因型之间NA基因核苷酸同源性为79.8%-81.1%。结论：通过对NA基因序列分析可得，5株类禽基因型毒株之间同源性为90.1%-99.4%，其中1株与2009年墨西哥大流行流感病毒亲缘关系最近，处于同一分支，核甘酸同源性达99.0%。

摘要： 目的：本研究主要目的是监测近期猪流感病毒的感染情况及分子特征，为猪流感病毒的监控及防治提供参考。方法：对2009年9月-2011年1月期间来自北京、河北、山东、山西、浙江等7个省市送检的673份临床发病猪的肺脏样品进行猪流感病毒M基因和NS基因的RT-PCR检测，对阳性样品进行鸡胚传代，收集尿囊液进行H1，H3, H9，N1，N2亚型鉴定及其中13个分离株的NA基因克隆测序，对获得的NA全基因序列进行Blast搜索，与Genbank数据库中的相关序列用clustalX比对，应用phylip软件做种系进化树，用MegAlign进行核普酸序列同源性分析。结果：核苷酸同源性比较结果显示，相同基因型的H1N1亚型分离株之间NA基因核苷酸同源性为94.7%-99.9%，不同基因型之间NA基因核苷酸同源性为79.8%-81.1%。结论：通过对NA基因序列分析可得，5株类禽基因型毒株之间同源性为90.1%-99.4%，其中1株与2009年墨西哥大流行流感病毒亲缘关系最近，处于同一分支，核甘酸同源性达99.0%。

摘要： 目的：本研究主要目的是监测近期猪流感病毒的感染情况及分子特征，为猪流感病毒的监控及防治提供参考。方法：对2009年9月-2011年1月期间来自北京、河北、山东、山西、浙江等7个省市送检的673份临床发病猪的肺脏样品进行猪流感病毒M基因和NS基因的RT-PCR检测，对阳性样品进行鸡胚传代，收集尿囊液进行H1，H3, H9，N1，N2亚型鉴定及其中13个分离株的NA基因克隆测序，对获得的NA全基因序列进行Blast搜索，与Genbank数据库中的相关序列用clustalX比对，应用phylip软件做种系进化树，用MegAlign进行核普酸序列同源性分析。结果：核苷酸同源性比较结果显示，相同基因型的H1N1亚型分离株之间NA基因核苷酸同源性为94.7%-99.9%，不同基因型之间NA基因核苷酸同源性为79.8%-81.1%。结论：通过对NA基因序列分析可得，5株类禽基因型毒株之间同源性为90.1%-99.4%，其中1株与2009年墨西哥大流行流感病毒亲缘关系最近，处于同一分支，核甘酸同源性达99.0%。

摘要： 目的：本研究主要目的是监测近期猪流感病毒的感染情况及分子特征，为猪流感病毒的监控及防治提供参考。方法：对2009年9月-2011年1月期间来自北京、河北、山东、山西、浙江等7个省市送检的673份临床发病猪的肺脏样品进行猪流感病毒M基因和NS基因的RT-PCR检测，对阳性样品进行鸡胚传代，收集尿囊液进行H1，H3, H9，N1，N2亚型鉴定及其中13个分离株的NA基因克隆测序，对获得的NA全基因序列进行Blast搜索，与Genbank数据库中的相关序列用clustalX比对，应用phylip软件做种系进化树，用MegAlign进行核普酸序列同源性分析。结果：核苷酸同源性比较结果显示，相同基因型的H1N1亚型分离株之间NA基因核苷酸同源性为94.7%-99.9%，不同基因型之间NA基因核苷酸同源性为79.8%-81.1%。结论：通过对NA基因序列分析可得，5株类禽基因型毒株之间同源性为90.1%-99.4%，其中1株与2009年墨西哥大流行流感病毒亲缘关系最近，处于同一分支，核甘酸同源性达99.0%。

摘要： H9N2亚型禽流感病毒是危害我国养禽业的重要病原，并威胁人类健康。近年来，该亚型病毒持续在我国鸡群中流行，为了解其分子演化规律，我们进行了2009～2011年H9N2禽流感病毒分离株的分子遗传进化分析。研究发现，H9N2流感病毒HA及NA基因持续进化，表现出时间相关性，但是部分毒株的HA基因形成了一个独立的小进化分支。内部基因中，F/98分支源基因占优势；分离株中出现了水禽源(DK)内部基因，暗示可能发生了水禽与鸡群毒株之间的基因重组。关键氨基酸位点分析发现，分离株的裂解位点序列主要为P-S-R-S-S-R和P-A-R-S-S-R两种模式，仍然符合低致病性禽流感病毒的特征；大部分分离株具有7～8个糖基化位点；在受体结合位点，分离株的190位氨基酸发生了由A/T到V的变异，这与2008年以后分离株的特点相似；值得注意的是，在抗原决定簇区域，分离株多发生了由S到R的变异，这是2009～2011年分离株所呈现出的新特性，可能影响病毒的抗原性等生物学活性。该研究揭示了2009～2011年H9N2流感病毒的分子遗传进化规律，为我国H9N2亚型流感的科学防控提供了理论依据。

摘要： H9N2亚型禽流感病毒是危害我国养禽业的重要病原，并威胁人类健康。近年来，该亚型病毒持续在我国鸡群中流行，为了解其分子演化规律，我们进行了2009～2011年H9N2禽流感病毒分离株的分子遗传进化分析。研究发现，H9N2流感病毒HA及NA基因持续进化，表现出时间相关性，但是部分毒株的HA基因形成了一个独立的小进化分支。内部基因中，F/98分支源基因占优势；分离株中出现了水禽源(DK)内部基因，暗示可能发生了水禽与鸡群毒株之间的基因重组。关键氨基酸位点分析发现，分离株的裂解位点序列主要为P-S-R-S-S-R和P-A-R-S-S-R两种模式，仍然符合低致病性禽流感病毒的特征；大部分分离株具有7～8个糖基化位点；在受体结合位点，分离株的190位氨基酸发生了由A/T到V的变异，这与2008年以后分离株的特点相似；值得注意的是，在抗原决定簇区域，分离株多发生了由S到R的变异，这是2009～2011年分离株所呈现出的新特性，可能影响病毒的抗原性等生物学活性。该研究揭示了2009～2011年H9N2流感病毒的分子遗传进化规律，为我国H9N2亚型流感的科学防控提供了理论依据。

摘要： 本发明涉及重组修饰的安卡拉痘苗病毒，其包含插入所述MVA基因组的基因间区内的异源DNA序列，其中，所述的IGR位于该MVA基因组的两个相邻开放阅读框之间或所述的IGR位于该MVA基因组的两个相邻开放阅读框的侧面，并且其中所述ORF对应于保守基因，并且其中所述的两个相邻ORF以示例性方式或其相应方式选自由（使用CDC/阿卡姆贝斯的命名法则）其它痘苗病毒毒株中的044-045、049-050、050-051、058-059、064-065、065-066、069-070、070-071、071-072、072-073、073-074、074-075、075-076、076-077、077-078、078-079、081-082、085-086、086-087、089-090、092-093、093-094、095-096、097-098、100-101、101-102、102-103、104-105、108-109、113-114、114-115、118-119、121-122、122-123、123-124、127-128、128-129、129-130、130-131、131-132、132-133、133-134、134-135、135-136、141-142和142-143所组成的组。

摘要： 本发明属于基因表达分析技术领域，公开了CmEF1α基因和CmRAN基因在分析甜瓜果实的基因表达时作为内参基因的应用，所述CmEF1α基因的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，所述CmRAN基因的核苷酸序列如SEQ ID NO：2所示。本发明还公开了一种采用实时荧光定量PCR分析甜瓜果实基因表达的方法，它是将CmEF1α基因和CmRAN基因组合的几何平均数作为甜瓜果实基因表达分析中的内参基因。CmEF1α基因和CmRAN基因在不同坐果方式的甜瓜果实的不同发育阶段均能稳定表达，是甜瓜果实发育过程中利用实时荧光定量PCR技术检测基因表达分析的可靠内参基因组合。

摘要： 本发明涉及转基因植物检测领域，具体涉及同时鉴定转甘露聚糖酶基因、葡聚糖酶基因、木聚糖酶基因和半乳糖苷酶基因植物的方法。本发明中设计的针对转入的半乳糖苷酶、葡聚糖酶、甘露聚糖酶及木聚糖酶的外源基因的引物可以同时鉴定转基因玉米饲料中的该四种外源基因，这为今后饲用酶转基因玉米原料成分的快速鉴定检测提供了方法。

摘要： 本发明涉及用于整合外源序列至痘苗病毒基因组的基因间区(IGR)内的新插入位点，其中所述的IGR位于该痘苗病毒基因组的两个相邻开放阅读框(ORF)之间或所述的IGR位于该痘苗病毒基因组的两个相邻开放阅读框的侧面，并且其中所述ORF对应于保守基因，并涉及用来插入外源DNA至痘苗病基因组内的相关质粒载体，并且还涉及作为药物或疫苗的含有插入所述新插入位点内的外源序列的重组痘苗病毒。

摘要： 本发明的目的在于能够在加密的状态下进行基因信息的检索。加密装置(200)对存储装置存储的基因信息即对象基因进行加密来生成加密基因，并将作为预定的基因信息的基准基因与对象基因进行比较，生成差异信息，生成嵌入了所生成的差异信息并加密而得到的加密标签。数据中心(400)使加密基因和加密标签相关联地存储在存储装置中。检索装置(300)将差异信息作为检索关键字，生成嵌入差异信息并进行加密而得到的检索查询，将所生成的检索查询发送到数据中心(400)。数据中心(400)确定包含检索查询中指定的差异信息的加密标签，提取相关联的加密基因并发送到检索装置(300)。

摘要： 提供作为副作用的细胞毒性少且MEX3B基因的表达抑制能力提高的核酸、含有上述核酸的MEX3B基因表达抑制剂、抑制MEX3B基因表达的方法及起因于MEX3B基因表达的疾病的预防或治疗剂。核酸为下述(1)～(3)中的任一者：(1)由序列表的序列号1或2中记载的碱基序列组成的寡核苷酸；(2)由在序列表的序列号1或2中记载的碱基序列中缺失、取代及/或添加1个或2个碱基而得的碱基序列组成、且抑制MEX3B基因的表达的反义寡核苷酸；(3)包含序列表的序列号3中记载的碱基序列、且抑制MEX3B基因的表达的反义寡核苷酸。

摘要： 本发明提供作为副作用的细胞毒性低且能够抑制MEX3B基因的表达的核酸、包含上述核酸的MEX3B基因表达抑制试剂、抑制MEX3B基因表达的方法及由MEX3B基因表达所引起的疾病的预防或治疗剂。抑制MEX3B基因的表达的核酸，所述核酸为：反义寡核苷酸，所述反义寡核苷酸具有与MEX3B基因的外显子中的非翻译区中的包含至少10个连续核苷酸的寡核苷酸互补的序列；或者双链RNA或编码上述双链RNA的DNA，所述双链RNA包含上述非翻译区中的至少20个连续核苷酸。

摘要： 本发明属于基因表达分析技术领域，具体涉及ClCAC基因和ClSAND基因在西瓜果实发育过程中用作为基因表达分析的内参基因的应用。本发明为ClCAC和ClSAND基因设计了特异引物，该引物跨基因上相邻的2个外显子的接头位点，以基因组DNA为模板时无扩增产物，以cDNA为模板是可以扩增出目标片段，所述引物的核苷酸序列如SEQ ID No.1-4所示。通过实时荧光定量PCR技术检测表明，ClCAC基因和ClSAND基因在不同基因型、不同坐果方式的西瓜果实的不同发育阶段均能稳定表达，是西瓜果实发育过程中利用实时荧光定量PCR技术检测基因表达分析的可靠内参基因组合。该内参基因组合具有表达稳定性好、不受cDNA样品中是否存在基因组DNA污染影响等优点。

摘要： 本发明属于基因表达分析技术领域，公开了CmEF1α基因和CmRAN基因在分析甜瓜果实的基因表达时作为内参基因的应用，所述CmEF1α基因的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，所述CmRAN基因的核苷酸序列如SEQ ID NO：2所示。本发明还公开了一种采用实时荧光定量PCR分析甜瓜果实基因表达的方法，它是将CmEF1α基因和CmRAN基因组合的几何平均数作为甜瓜果实基因表达分析中的内参基因。CmEF1α基因和CmRAN基因在不同坐果方式的甜瓜果实的不同发育阶段均能稳定表达，是甜瓜果实发育过程中利用实时荧光定量PCR技术检测基因表达分析的可靠内参基因组合。

摘要： 本发明的目的在于，提供一种在癌症中鉴定能够成为预测药剂的治疗有效性的指标的基因、以该基因为目标预测药剂的治疗有效性的新型的方法，并进行了肺腺癌的全转录组测序。其结果，鉴定了KIF5B基因和RET基因的框内融合转录产物。另外，该KIF5B-RET基因融合在日本人肺腺癌的6/319（2%）、美国人肺腺癌的1/80（1%）中被检测出。而且发现，该7例均不显示EGFR、KRAS、ALK癌基因这样的公知的活化突变，因此，判明该基因融合为癌化中的责任突变（驱动突变）。该基因融合被认为是导致RET酪氨酸激酶蛋白的稳定活化的因素，因此，对于检测出该基因融合的患者，以RET酪氨酸激酶抑制剂进行的治疗是有效的。