选择压力
选择压力的相关文献在1980年到2022年内共计183篇,主要集中在畜牧、动物医学、狩猎、蚕、蜂、自动化技术、计算机技术、动物学
等领域,其中期刊论文176篇、会议论文5篇、专利文献207649篇;相关期刊137种,包括昆虫学报、生态学报、生物化学与生物物理进展等;
相关会议5种,包括中国畜牧兽医学会家禽学分会第十七次全国家禽学术研讨会、上海市药学会抗生素专业委员会首届青年学术论坛、持久性有机污染物论坛2012暨第七届持久性有机污染物全国学术研讨会等;选择压力的相关文献由559位作者贡献,包括孙哲、张国范、王成辉等。
选择压力—发文量
专利文献>
论文:207649篇
占比:99.91%
总计:207830篇
选择压力
-研究学者
- 孙哲
- 张国范
- 王成辉
- 王艇
- 申欣
- 秦泽荣
- 胡利宗
- 苏应娟
- CUI ZhiZhong
- 仲岩
- 何成兴
- 关琪
- 刘尚高
- 刘惠莉
- 刘潮
- 刘贺贺
- 卢永红
- 唐萍
- 唐首杰
- 姚学君
- 姚托
- 孙文强
- 孙欣
- 孟学平
- 宋晓军
- 张敏
- 张树敬
- 张涛
- 张艳萍
- 张菁
- 彭程
- 朱德妹
- 朱红霞
- 李亮
- 李元香
- 李冬春
- 李颜颜
- 杨帆
- 杨永平
- 林琳
- 梁旺
- 段元文
- 王博
- 王小元
- 王明贵
- 王春凤
- 王杰
- 王林林
- 王继文
- 王赟
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王伟萍;
贺刚;
吴斌
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摘要:
FSHR基因正常表达是卵巢获得促性腺激素反应能力的关键,其与哺乳动物的繁殖性状有密切的关系,且该基因不同基因型与绵羊等多胎性状相关。对33种哺乳动物的FSHR基因
选择压力进行分析,FSHR基因转录本最长ORF序列正选择位点有19个,但只有.1个位点P>95%;鲸豚类动物为前景枝,比较M0和M2,差异显著,且二者均为0
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周慧;
吴海霞;
谢伟;
王芸芸;
蒋琦辰;
李鹏
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摘要:
生物钟基因clock(Clk)和cryptochrome(Cry)参与生物内在节律调控。克氏原螯虾(Procambarus clarbii)是我国重要的水产养殖经济虾类,为探究温度、光照对克氏原螯虾生长及其生物钟基因PcClk与PcCry1节律振荡表达的影响,采用实时定量PCR技术探讨克氏原螯虾PcClk和PcCry1基因在脑、眼柄和肝胰腺组织中的mRNA表达模式,并探讨PcClk和PcCry1基因在温度和光照周期适应过程中是否发生适应性进化。荧光定量PCR检测结果显示,克氏原螯虾的PcClk基因和PcCry1基因在脑、眼柄和肝胰腺中均有表达。在不同光照周期培养下,PcClk基因和PcCry1基因在脑、眼柄中的mRNA表达有一定的振荡节律,在25°C、12 LD的培养模式下,脑中PcClk基因和PcCry1基因mRNA表达的节律性会更明显。选择压力分析显示,经PAML和Datamonkey共同筛选出的PcCLK正选择位点为71与213,PcCRY1正选择位点为63。以上结果表明,克氏原螯虾生物钟基因PcClk和PcCry1受到了选择压力,克氏原螯虾PcClk基因和PcCry1基因是内源性的节律基因。
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魏永路;
任锐;
高洁;
刘伟平;
谢琦;
朱根发;
杨凤玺
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摘要:
【目的】建兰花叶病毒(Cymbidium mosaic virus,CymMV)是最主要的兰花病毒病原之一,其广泛传播对兰花产业发展造成严重威胁。探究CymMV遗传信息和进化,为广东省兰花病毒病的监测预警和兰花抗病毒病基因工程提供重要科学依据。【方法】对采自广州地区的墨兰疑似病毒病叶片进行CymMV的RT-PCR及DA-SELISA检测鉴定,利用相关分子生物学软件对CymMV分离物进行基因组序列组装、注释、系统进化及选择压力分析。【结果】首次在广东省发现2个CymMV分离物GZV013和ZC-29,基因组全长均为6227 nt,编码5个功能蛋白;GZV013与台湾分离物M2的核苷酸序列一致性为97.03%;ZC29与南京分离物NJ-1的核苷酸序列一致性为97.11%;CymMV各分离物的全基因组序列一致性为86.85%~98.31%,且多样性种群的分化与寄主种类和地理隔离关系密切;CymMV基因组每个区域均受到负选择的影响,并符合中性进化模型;编码RdRp、TGB1和TGB2的基因在基因组中变异率最高。【结论】GZV013与台湾分离物M2的亲缘关系最近,ZC29与南京分离物NJ-1的亲缘关系最近,同属于一个分支。
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刘伟;
曾圣;
王雪;
詹会祥;
周路;
熊畔;
向燕
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摘要:
【目的】研究贵州毕节地区四川裂腹鱼(Schizothorax kozlovi)养殖群体的遗传多样性,为其选育和遗传改良工作提供理论依据。【方法】PCR扩增、DNA测序获取四川裂腹鱼养殖群体D-loop区和Cyt b基因序列,采用相关软件分析序列变异和群体遗传多样性。【结果】四川裂腹鱼养殖群体D-loop区和Cyt b基因序列分别检测到9、34个核苷酸多态位点(S),对应定义7和8种单倍型,单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(π)分别为0.765、0.842和0.00519、0.00826;中性检测和核苷酸错配分析显示四川裂腹鱼养殖群体近期历史上可能未经历群体扩张事件。【结论】毕节地区四川裂腹鱼养殖群体具有较为丰富的遗传多样性,四川裂腹鱼养殖群体选择压力主要受到负向选择的影响,当前的人工选择对其Cyt b基因进化的影响有限。
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韩利红;
贾欣楠;
陈仁欢;
刘潮
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摘要:
为了解药用真菌茯苓基因组密码子使用模式,探讨影响其密码子组成和编码特性的因素,以茯苓核基因组和线粒体基因组数据为研究对象,利用CodonW、Mega X和EMBOSS等软件对基因密码子使用偏性进行分析,根据中性绘图、奇偶偏性绘图、ENC-plot和对应性分析推测茯苓基因组密码子偏性形成的影响因素。茯苓核基因平均GC含量为57.28%,同义密码子第3位偏好G/C碱基;茯苓核基因密码子偏性主要受选择作用影响,而线粒体基因除了受选择作用影响,还受到较强的碱基突变影响;茯苓核基因部分同义密码子间RSCU值差异较大,高频密码子和最优密码子均以G/C结尾。茯苓核基因密码子偏性较强,进化过程中受到较强的环境和寄主选择作用。与酵母相比,大肠杆菌基因密码子使用模式更接近于茯苓,大肠杆菌可能更适合作为茯苓基因异源表达宿主。上述结果可为茯苓的分子进化及外源基因的转基因研究提供参考。
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仲岩;
张甜;
陈钊;
程宗明
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摘要:
[目的]本文旨在研究取自欧洲不同生态环境下的森林草莓生态型中的2个NBS-LRR抗病基因,揭示不同生态型中同一基因的遗传变异特征。[方法]选取森林草莓中具有代表性的2个NBS-LRR基因为目的基因,从不同森林草莓生态型中对其进行PCR扩增、测序并得到相应的核苷酸序列。利用ProtParam网站分析其理化性质;利用MEGA v7.0和DNAMAN v7.0对核苷酸序列以及蛋白序列进行多重比对,查找序列突变位点;利用Pfam、SMART、COILS等网站分析基因编码蛋白质的结构域组成;利用MEGA v7.0计算2个基因中不同生态型之间的K_(a)/K_(s)值、Pi值并构建系统进化树,分析其受到的选择压力及遗传进化关系。[结果]以‘Hawaii4’的序列为参照,FvH 4_5g22710和FvH4_1g15230基因在某些森林草莓生态型中发生了点突变和缺失突变。通过结构域分析可知FvH 4_5g22710基因只在Rx_N结构域区段发生了突变,而在NB-ARC结构域和LRR基序中没有发生,FvH 4_1g15230基因在其编码蛋白质的RPW8、NB-ARC结构域和LRR基序区段均发生了突变。进化树的拓扑结构显示,来自在同一国家的生态型,其目的基因更偏向于聚类在同一进化支上;2个基因的平均K_(a)/K_(s)值均小于1,说明它们均受到纯化选择的驱动。[结论]2个NBS-LRR基因在不同的森林草莓生态型中都有一定程度的变异,这提高了抗病基因的遗传变异程度,可能与提高森林草莓抗病性有一定关联。
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韩利红;
田雪莲;
刘潮;
付小林;
王远献
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摘要:
块菌又称松露,为珍稀野生药食兼用的大型真菌,具有极高的营养保健价值。密码子使用偏性分析可为块菌的遗传进化与资源开发提供理论依据。基于黑孢块菌(Tuber melanosporum)、白块菌(T.magnatum)和波氏块菌(T.borchii)的基因组数据,利用CodonW 1.4.2、Mega X软件和EMBOSS在线网站,系统分析3种块菌基因组密码子使用特征及其影响因素。结果显示,3种块菌基因组密码子使用模式高度相似,密码子第3位偏好鸟嘌呤或胞嘧啶(G/C),有效密码子数值较高,其中,黑孢块菌与波氏块菌密码子使用性相似度最高,白块菌鸟嘌呤或胞嘧啶碱基相关参数均较高。3种块菌最优密码子中G/C结尾的分别占81.8%、78.9%和61.9%,三者共有的高频密码子24个,共有的最优密码子14个,均偏好鸟嘌呤或胞嘧啶或胸腺嘧啶结尾的密码子,但总体偏好性不强。奇偶偏性、ENC-GC3s关联、中性绘图和对应性分析显示,3种块菌密码子使用偏性形成受选择压力等多种因素影响,其中黑孢块菌主要受翻译选择压力影响,白块菌主要受翻译选择外的其他因素影响,波氏块菌受选择压力影响相对较弱。研究表明,3种块菌基因组密码子使用模式相似,偏性较弱,表达潜力较低,受多种因素影响,研究结果可为块菌的物种演化研究和遗传育种提供理论基础。
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卢正祥;
姚学君;
陈国清;
李峰;
管书慧;
张红军
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摘要:
目的探索肠道病毒68型(Enterovirus D68,EV-D68)分离株VP1区序列分子流行病学特征和毒株遗传进化规律。方法应用生物信息学软件,分析EV-D68分离株密码子偏爱性、选择压力位点和氨基酸置换熵值。结果EV-D68分离株VP1区序列ENC均值为46.27,密码子偏爱A/U结尾,ENC-Plot绘图、中性绘图和奇偶规则绘图等分析显示自然选择是影响密码子使用模式的主要因素。发现2个正向选择位点和5个氨基酸易突变位点。结论EV-D68分离株密码子偏爱性较弱,毒株进化整体处于负选择压力下,以自身进化为主,受自然选择压力影响。
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陈沙;
刘焕章;
曹文宣;
俞丹
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摘要:
利用RT-PCR技术克隆了10种鲤形目Cypriniformes鱼类卵透明带蛋白(ZP2)基因的cDNA全长序列,并初步探讨了这些鱼类ZP2基因的重复结构域变异与产卵习性的相关性.序列分析表明,10种鲤形目鱼类ZP2基因cDNA序列长度差异较大(1254~1734 bp),其编码的氨基酸保守结构域集中在N端信号肽序列、三叶草结构域和ZP结构域,变异集中在N端重复结构域中,不同物种的重复单元和重复次数不同,其中产漂流性卵和产沉性卵鱼类的重复结构域不含重复单元或重复单元重复次数较少(2~5次),而产粘性卵鱼类的重复结构域中通常含有多次重复单元(7~19次).同源性分析结果显示,在鲤形目鱼类中,团头鲂Megalobrama amblycephala与鳊Parabramis pe-kinensis的相似性最高(99.7%),斑马鱼Danio rerio和鲫Carassius auratus的相似性最低(71.2%).系统进化分析显示,鲤形目鱼类的ZP2氨基酸序列聚为一个单系,其中斑马鱼单独聚为一支,位于系统树的基部位置,与其他鲤形目鱼类形成姐妹群.10种鲤形目鱼类ZP2蛋白的二级结构成分和三维结构均存在一定的差异.进化选择压力分析结果表明,ZP2基因在鲤形目鱼类中受到正向选择,可能对其功能产生影响.
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黄兴;
习金根;
陈涛;
覃旭;
谭施北;
陈河龙;
易克贤
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摘要:
剑麻是热带地区重要的纤维作物,但其分子生物学研究基础薄弱,纤维发育机制尚未明确.苯丙氨酸裂解酶(phenylalanine ammonia-lyase,PAL)是纤维重要组分木质素生物合成的起始酶,近年来转录组测序技术快速发展,使开展剑麻PAL基因相关研究更为便利.本文根据已报道转录组数据成功鉴定出2个含完整编码序列的剑麻PAL基因,其在剑麻叶片发育过程中的表达模式与前人报道的PAL在纤维发育过程中的活性变化规律一致,表明其与木质素生物合成密切相关.遗传进化分析结果显示,剑麻和番麻PAL基因进化关系更近,选择压力分析结果显示,剑麻和番麻PAL基因序列选择压力一致且高于太匮龙舌兰PAL基因,这一现象可能由剑麻和番麻纤维性状的趋同进化引起.此外,剑麻PAL基因在铜铅胁迫后差异表达不显著,其可能在重金属胁迫后受到转录后调控.值得一提的是,在烟草疫霉侵染后,剑麻PAL基因表达水平上调倍数较高,其可能同时参与苯丙烷类代谢途径中抗病相关次生代谢产物的合成和细胞壁介导的免疫机制.因此开展剑麻PAL基因功能解析可加深对剑麻纤维发育机制和抗病机制的理解,对培育高产、优质、多抗剑麻新品种具有重要意义.
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甘翔;
王继文;
刘贺贺;
李亮;
孙文强;
王郁石;
张涛;
陈达;
黄惠兰
- 《中国畜牧兽医学会家禽学分会第十七次全国家禽学术研讨会》
| 2015年
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摘要:
NF-κB1/2均隶属于NF-κB基因家族,含有RHD、IPT、ANK与DD四个结构域,在机体免疫和炎症反应中有重要的作用.NF-κB1/2在脊椎动物的各个类群中发生了功能分化,但是其功能分化的原因还未见报道.因此,本研究对NF-κB1/2基因进行序列比对,系统发育树的构建与选择压力预测等多种生物信息学技术分析旨在分析NF-κB1/2功能分化原因,定义其各个结构域在其进化历程中的地位.选择压力分析发现不同种类动物NF-κB1/2 保守结构域ω值存在差异,说明NF-κB1/2 各个结构域在不同的进化阶段存在着明显不同的进化历程。
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张树敬;
ZHANG Shu-jing;
YANG Fan;
杨帆;
GUO Bei-ning;
郭蓓宁;
GUO Qing-lan;
郭庆兰;
HU Fu-pin;
胡付品;
CHEN Yuan-cheng;
陈渊成;
LIANG Wang;
梁旺;
ZHU De-mei;
朱德妹;
张菁;
ZHANG Jing;
WANG Ming-gui;
王明贵
- 《上海市药学会抗生素专业委员会首届青年学术论坛》
| 2012年
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摘要:
目的:通过比较国际流行克隆和上海本土耐药克隆在有无抗生素选择压力下适应性差别,分析其流行的原因并推测今后可能的优势克降。方法:利用PCR方法对26株青霉素耐药肺炎链球菌进行多位点序列分型(MLST),选取Taiwan19F-14克隆ST320及ST271各1株,上海本土耐药克隆1株,通过体外PK/PD模拟绘制动态杀菌曲线,分析在有无抗生素选择压力下肺炎链球菌的适应性差异。结果:以细菌清除速率常Ke为比较指标时,500mg po q8h给药方案ST2971菌株未被抑制,而ST320的Ke(0.0677/h)<ST271(0.117/h);1000mg q8h给药方案下ST2971 (0.0418/h)<ST320(0.0872/h)<ST271 (0.0890/h).以AAC0-24h为比较指标,AAC0-24h值在两种给药方式下3株菌该指标比较结果均是:ST271>ST320>ST2971.以ABBC0-24与AAC0-24h的差值比较不加药情况下菌株的生长能力,ST320>ST2971>ST271.结论:上海本土耐药克隆株的适应性好于Taiwan19F-14克隆,在Taiwan19F-14克降中ST320适应性好于其单突变体ST271.上海本土耐药克隆极可能获得传播优势,今后应对其密切监控。
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