水平基因转移

摘要： 膜囊泡是一类由细菌释放并携带复杂蛋白质、核酸、信号分子等重要信息物质的生物纳米颗粒,参与了水平基因转移、群体感应、生物膜形成等多种生理生化活动。海洋中的细胞膜囊泡可能是除噬菌体和细菌之外的第三大生物实体,其介导的跨越物种的细胞间通讯对海洋生态系统而言有重要意义。然而,我们对膜囊泡在海洋生物圈中具体的生态角色与生物功能所知甚少。因此,本综述从细菌膜囊泡在海洋微生态、海洋共生体系中的作用及其物质流转对生态系统的影响等方面开展讨论,分析了目前细菌膜囊泡在海洋生态功能研究中尚未解决的科学问题,并对未来的研究方向进行了展望。

摘要： 采用高通量测序和实时定量PCR技术,基于室内培养法研究不同Zn浓度对土壤氨基糖苷类抗生素抗性基因(antibiotic resistance genes,ARGs)、可移动遗传元件(mobile genetic elements,MGEs)及细菌群落的影响。结果表明,Zn的浓度和处理时间对氨基糖苷类ARGs及MGEs影响不同。1000 mg·kg^(-1)Zn处理60 d时,acc、aacC1和整合子int11的相对丰度最高,分别为对照的4.1、9.7和3.7倍;800 mg·kg^(-1)Zn处理60 d时,aac(6′)-II的相对丰度最大,为对照的13.7倍。Zn处理显著提高了转座子Tp614的相对丰度,100 mg·kg^(-1)Zn处理时最高,为对照的4.6倍。Zn处理降低了细菌群落的多样性指数,提高了优势度指数,说明Zn的毒性使敏感菌群消失,抗性菌群增加。冗余分析表明Zn胁迫的时长对细菌群落结构的影响大于浓度;胁迫时长相同时,较低浓度的Zn(100~400 mg·kg^(-1))与较高浓度的Zn(800~1000 mg·kg^(-1))处理的土壤细菌群落的结构差异明显;Zn胁迫与Nocardioides、Adhaeribacter及Arthrobacter等的丰度负相关,而与Flavisolibacter、Sphingomonas及Solirubrobacter的丰度正相关。网络共存分析显示,Zn胁迫压力下,acc、aac(6′)-II、aacC1和int11、IS613连接数较高;Steroidobacter与Tp614存在连接,可能是Tp614的潜在宿主菌。研究表明,高浓度Zn污染能加速土壤ARGs传播扩散,即使低浓度的Zn长时间作用也能诱导部分ARGs和MGEs,提高水平转移的风险,值得重点关注。

摘要： 噬菌体在地球表层生态系统中的元素循环及污染物转化的微生物群落调控中发挥重要作用。相比于水生系统,土壤高度的异质性和病毒颗粒的高吸附度给土壤中噬菌体的研究带来挑战,尚未引起足够的关注。本文介绍了土壤噬菌体的形态与生命周期分类、以及噬菌体的提取和分析方法;探讨噬菌体调控土壤微生物群落结构以及碳、氮、磷、硫等生命元素循环与重(类)金属转化的科学联系;揭示其生物地球化学机制,阐明其生态功能和环境意义;并对土壤中噬菌体未来研究重点进行了展望。

摘要： 转基因微生物、转基因动植物越来越多地诞生并投入商业化生产,转基因食品已不断涌现与上市,随着人们对自身健康的重视程度与意识的不断提高,人们对转基因与转基因食品的安全性的关注度越来越高,讨论越来越多,顾虑也越来越多。其实,生物界存在着广泛而多样的转基因现象与结果,产生很多自然转基因生物与转基因食品。本文对生物界转基因类型和转基因食品进行概述,以期帮助人们全面客观地认识转基因现象与转基因食品.

摘要： 抗生素在人和动物细菌性感染疾病的预防和治疗中起着关键作用。抗生素的广泛使用导致细菌暴露在低于最低抑菌浓度(即亚抑菌浓度)的环境、人类和牲畜中,从而导致抗生素耐药性。细菌主要通过水平基因转移获得耐药性,目前,国内外均有研究报道亚抑制浓度抗生素可以影响细菌水平的基因转移。本文介绍了亚抑制浓度抗生素的定义和产生的来源;阐述了亚抑制浓度抗生素对细菌水平基因转移的影响,并通过SOS应答,ROS和群体感应这三个方面描述了亚抑制浓度抗生素介导水平基因转移的机制,对临床了解耐药基因传播及开展积极防治均具有重要意义。

摘要： 抗生素耐药性在细菌病原体中不断出现并蔓延,其遗传物质基础抗生素耐药基因(ARG)可通过基因突变或水平基因转移等方式获得,并赋予宿主对抗生素的耐药性,从而严重威胁人类的健康.人类肠道菌群作为ARG产生和传播的重要场所越来越受到重视.人类肠道菌群含众多种类的ARG,可通过水平基因转移等方式实现ARG的传播.影响肠道菌群中ARG产生和传播的因素包括抗生素、非抗生素类药物、母婴传播、食物和饮水等.肠道菌群中ARG的检测方法有抗生素耐药菌株的分离培养、定量PCR、微阵列分析、宏基因组测序、功能性宏基因组和单细胞全基因组等技术.本文对上述研究进展予以综述,以期促进对肠道ARG的认知,并为其研究提供新思路.

摘要： 水平基因转移是一种能够在物种间进行基因交流的现象,是生物迅速适应环境的主要驱动力之一.近年来,随着测序技术的进步,昆虫中的水平基因转移现象被大量报道,成为昆虫研究的热点之一.本文总结了水平基因转移研究的常用流程和手段,以及昆虫水平转移基因的供体、受体和功能,讨论水平基因转移与昆虫食性的联系以及研究方法的局限,并展望昆虫水平基因转移研究领域未来的方向.

摘要： 植物寄生线虫是农作物主要病原物之一,每年造成作物大幅度减产和严重的经济损失.植物寄生线虫基因组学研究在揭示植物线虫与寄主互作分子机制和作物抗线虫品种的培育中发挥着不可替代的作用.随着高通量测序技术的广泛应用,多种重要的植物寄生线虫的基因组被破解和报道.在此基础上,通过比较基因组学进一步揭示了植物寄生线虫的起源和进化,功能基因组学的研究也取得了一系列重要的进展.本文对目前已报道的植物寄生线虫基因组的研究进展进行总结,在各基因组的基本特征、染色体组变异、串联重复序列、基因表达调控与基因协同表达、水平基因转移、效应蛋白发现和功能研究及基因家族扩张等方面进行综述,以期为植物线虫致病分子机制研究及防控新策略制定提供参考.

摘要： 一、什么是CRE肠杆菌科细菌是人体肠道的原住民,也是引起人类感染最常见的病原菌,可导致身体各个部位的感染,如尿路感染、肺炎、腹膜炎、脑膜炎、血流感染和各种装置相关的感染。肠杆菌科细菌是社区和医院获得性感染的重要病原菌,它们很容易在人类之间传播(手推车、被污染的食物和水),并通过水平基因转移(主要由质粒和转座子介导)获得遗传物质。

摘要： 人类肠道菌群是耐药基因(antibiotic resistance genes,ARGs)的"储存库",且与人体健康密切相关.目前,抗生素的滥用严重,进一步加剧了耐药基因的传播和扩散.细菌耐药问题严重影响人体健康、食品安全和生态安全,携带耐药基因的致病菌对临床治疗造成巨大威胁.本文结合国内外研究进展,在总结人体肠道耐药基因组研究方法的基础上,探讨了肠道耐药基因的组成、来源、传播和进化,并对未来研究进行了展望,旨在促进公众对肠道耐药基因的认知,并为抗生素的合理使用提供理论支持.

摘要： 水平基因转移是不同于垂直基因转移的遗传物质的交流方式.在污染环境这一特异生镜中,降解基因的水平转移有着独特的功能与作用.研究环境中污染物降解基因在微生物间的水平转移,更深入地了解微生物种群适应污染环境的机理,对于评价污染物的环境毒理、生物可降解性以及污染环境的可修复潜力具有重要参考价值.在污染物生物修复实践中,可以通过调控降解基因的水平转移,增强污染环境中微生物的降解能力,更有效地发挥生物修复作用.本文将对环境中细菌间基因交流的机制,污染物降解基因的水平转移对微生物适应污染环境的机理、水平基因转移对代谢途径的进化及其对污染物生物修复作用的影响等方面的研究进展作一综述.

摘要： 本发明是包含控制序列以及与该控制序列可操纵连接的木瓜环斑病毒(Papaya ringspot virus，PRSV)辅助组分蛋白酶基因(HC-Pro基因)的编码序列片段的重组载体。本发明也提供重组微生物。本发明也提供一种使植物对病毒具有抗性的方法。本发明也提木瓜环斑病毒辅助组分蛋白酶的全长基因或其基因片段用于制造对病毒具有抗性的植物的用途。本发明以木瓜环斑病毒HC-Pro基因为靶来攻击病毒的策略，可瓦解木瓜环斑病毒对抗植物宿主防御反应的能力，避免因转基因被基因沉默后而消失抗性的问题，并提供转基因植物对于不同木瓜环斑病毒株系病毒的广谱抗性，使所产生的转基因植物具有跨地理区域性的应用价值。

摘要： 本发明提供了一种由促血管生成素受体Tie2介导的基因转移系统，它包括它包含(a)特异性结合于Tie2受体的配体寡肽、(b)多聚阳离子多肽和任选的(c)内吞小体释放寡肽和(d)外源DNA。所述基因转移系统能有效地在体内外将外源基因靶向性地导入肿瘤新生血管内皮细胞和表达Tie2受体的肿瘤细胞，从而抑制肿瘤的生长。

摘要： 本发明提供了一种由促血管生成素受体Tie2介导的基因转移系统，它包括它包含(a)特异性结合于Tie2受体的配体寡肽、(b)多聚阳离子多肽和任选的(c)内吞小体释放寡肽和(d)外源DNA。所述基因转移系统能有效地在体内外将外源基因靶向性地导入肿瘤新生血管内皮细胞和表达Tie2受体的肿瘤细胞，从而抑制肿瘤的生长。

摘要： 本发明公开的方法描述了一种能够以空前的效率、灵活性、实用性和速度将转基因稳定整合到淋巴细胞和其他哺乳动物细胞中的新技术。该新方法是基于使用mRNA编码的转座酶[例如睡美人(Sleeping Beauty)转座酶]与微环DNA编码的转座因子的组合。该新方法能够实现更高的基因转移速率，同时比常规方法毒性低，所述常规方法即使用质粒DNA编码的转座酶与质粒DNA编码的转座因子的组合。本发明的应用包括但不限于将编码免疫受体(例如T细胞受体或合成嵌合抗原受体)的转基因稳定整合到人T淋巴细胞中，其中免疫受体对肿瘤细胞表达的分子具有特异性。转座酶mRNA和转座子微环DNA可通过包括但不限于如电穿孔和核转染的电转移方法导入淋巴细胞中。

摘要： 转录、转移双重控制的甲胎蛋白增强型表皮生长因子受体介导的肝癌靶向性基因转移载体，属于乙肝病毒相关肝细胞肝癌基因技术领域。包括甲胎蛋白介导的外源DNA、配体寡肽、多聚阳离子多肽和内吞小体释放寡肽。配体寡肽是针对表皮生长因子受体的多肽，多聚阳离子多肽为多聚赖氨酸或多聚精氨酸，内吞小体释放寡肽是流感病毒血凝素HA氨基端的20肽，外源DNA为含肝癌特异性转录调控序列及HBV反义基因片段的真核型表达载体。本发明的甲胎蛋白增强型表皮生长因子受体介导的肝癌靶向性基因转移载体的应用于体内外抑制肝癌生长。

摘要： 本发明涉及可以通过靶向神经降压肽受体来用于基因转移和基因治疗的腺病毒复合物。本发明的复合物由于高的细胞内基因转移效率和由神经降压肽受体特异性结合产生的靶特异性从而具有优异的抗肿瘤效果，几乎没有肝毒性和免疫原性，形成稳定的复合物，具有低免疫原性，并因此即使在体内环境中在血液中也具有低的损失。因此，本发明的复合物可以有效地用于基因治疗。

摘要： 本发明是包含控制序列以及与该控制序列可操纵连接的木瓜环斑病毒(Papaya ringspot virus，PRSV)辅助组分蛋白酶基因(HC-Pro基因)的编码序列片段的重组载体。本发明也提供重组微生物。本发明也提供一种使植物对病毒具有抗性的方法。本发明也提木瓜环斑病毒辅助组分蛋白酶的全长基因或其基因片段用于制造对病毒具有抗性的植物的用途。本发明以木瓜环斑病毒HC-Pro基因为靶来攻击病毒的策略，可瓦解木瓜环斑病毒对抗植物宿主防御反应的能力，避免因转基因被基因沉默后而消失抗性的问题，并提供转基因植物对于不同木瓜环斑病毒株系病毒的广谱抗性，使所产生的转基因植物具有跨地理区域性的应用价值。

摘要： 一种用于抗性基因水平基因转移研究的实验装置及方法，主体结构以两个联通的三角培养瓶为载体，在三角培养瓶的左上设有细颈与真空泵连接，右下设有连接口以备两个培养瓶之间的连接，两个玻璃培养瓶通过法兰连接，法兰之间设有滤膜，以阻止细胞的直接接触但不妨碍其他物质交换，滤膜附在砂芯筛板中间，筛板与培养瓶管口间用硅胶垫片相隔以密封，将以上材料按顺序放入法兰外螺纹管内再用内螺纹一侧连接密封。本发明中所述的玻璃培养瓶、砂芯筛板、硅胶垫片及混合纤维滤膜均可高温灭菌，以排除杂菌污染。结构简单，实验操作方便，滤膜可随时更换，砂芯作为支持物可以起到保护滤膜的作用，既能阻止细胞直接接触又不会因为真空抽滤而损坏。

摘要： 公开的是用于减少功能蛋白的水平基因转移的方法与组合物。在一些实施方案中，通过在至少两种空间上不同的核酸序列上单独编码蛋白质的结构域来降低功能蛋白的水平基因转移的风险，其中各个体结构域单独为非功能性的，但是编码的结构域的共表达导致它们缔合以形成功能蛋白。

摘要： 公开的是用于减少功能蛋白的水平基因转移的方法与组合物。在一些实施方案中，通过在至少两种空间上不同的核酸序列上单独编码蛋白质的结构域来降低功能蛋白的水平基因转移的风险，其中各个体结构域单独为非功能性的，但是编码的结构域的共表达导致它们缔合以形成功能蛋白。