摘要:
目的 对2014-2018年云南省文山州手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)病例进行病原分析,并对其中分离的柯萨奇病毒A6型(coxsackievirus A6,CV-A6)进行分子流行病学分析.方法 用RD细胞和Hep-2细胞从HFMD病例粪便标本中分离病毒,提取病毒RNA,先用MD91/OL68-1引物对病毒VP4/VP2结合区基因进行RT-PCR和测序,确定病毒型别,再用各型病毒的相关引物扩增肠道病毒(enterovirus,EV)VP1区全序并测序;按参考文献下载基因库中CV-A6病毒完整VP1区基因参考序列,用MEGA5.2软件构建系统进化树,进行基因特征和分子流行病学分析.结果 5年间共从2848份标本中分离到581株EV,病毒分离率为20.40%(581/2848).581株病毒中CV-A674份,占阳性总数的12.74% (74/581),CV-A16124份,占21.34%(124/581),EV-A71374份,占64.37%(374/581).其他病毒9份,占1.55%(9/581).用MEGA5.2软件对74株CV-A6病毒的VP1基因完整序列(915 bp)作基因进化树,排除序列完全一样的序列后共对22株具有代表性的CV-A6病毒和52株参考株序列共74株病毒作基因进化分析,文山州所有22株均为D3a亚型,其中21株为分支1(cluster 1),1株为分支2(cluster 2).结论 2014-2018年云南省文山州HFMD流行以EV-A71(占64.37%)、CV-A16(占21.34%)和CV-A6(占12.74%)为主.基因特征分析表明,跟往年全国的情况一样,云南省文山州2014-2018年流行的CV-A6为D3a基因亚型,其中进化分支1(cluster 1)是主要的流行分支.